氨基酸三联密码子表+SNP类型
氨基酸密码子表
Phe
F
Phenylalanine
苯丙氨酸
Arg
R
arginine
精氨酸
Gly
G
glycine
甘氨酸
Ser
S
serine
丝氨酸
His
H
Histidine
组氨酸
Thr
T
threonine
苏氨酸
Ile
I
Isoleucine
异亮氨酸
Val
V
valine
纈氨酸
Lys
K
lysine
赖氨酸
Trp
W
tryptophan
色氨酸
Leu
L
leucine
亮氨酸
Tyr
Y
tyrosine
酪氨酸
第一个
核苷酸5′
第二个核苷酸
第三个
核苷酸3′
U
C
A
G
U苯丙Βιβλιοθήκη 酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸
U
苯丙氨酸
丝氨酸
酪氨酸
半胱氨酸
C
亮氨酸
丝氨酸
终止密码子
终止密码子
A
亮氨酸
丝氨酸
终止密码子
色氨酸
G
C
亮氨酸
脯氨酸
组氨酸
精氨酸
U
亮氨酸
脯氨酸
组氨酸
精氨酸
C
亮氨酸
表14-3氨基酸缩写符号
缩写
氨基酸
缩写
氨基酸
Ala
A
alamine
丙氨酸
Met
M
methionine
甲硫氨酸
Cys
C
密码子表及对应氨基酸英文缩写
Leucine/Leu/L 亮氨酸
Proline/Pro/P 脯氨酸
Arginine/Arg/R 精氨酸
Isoleucine/Ile/I 异亮氨酸 Methionine/Met/M 甲硫氨酸(Start)
ACC ACA ACG GCU GCC GCA GCG
Threonine/Thr/T 苏氨酸
Serine/Ser/S 丝氨酸 Arginine/Arg/R 精氨酸
G UGU UGC UGA UGG CGU CGC CGA CGG AGU AGC AGA AGG GGU GGC GGA GGG
Cysteine/Cys/C Trp/W 色氨酸
U C A G U C A G Third Base U C A G U C A G
Second Base A UAU
Serine/Ser/S 丝氨酸
UAC UAA UAG CAU CAC CAA CAG AAU AAC AAA AAG GAU GAC GAA GAG
Tyrosine/Tyr/Y 酪氨酸 stop codon stop codon Histidine/His/H 组氨酸 Glutamine/Gln/Q 谷氨酰胺 Asparagine/Asn/N 天冬酰胺 Lysine/Lys/K 赖氨酸 Aspartic acid/Asp/D 天冬氨酸 Glutamic acid/Glu/E 谷氨酸
U UUU U UUC UUA UUG CUU C First Base A CUC CUA CUG AUU AUC AUA AUG GUU G GUC GUA GUG
Phenylalanine/Phe/F 苯丙氨酸 Leucine/Leu/L 亮氨酸
C UCU UCC UCA UCG CCU CCC CCA CCG ACU
氨基酸中英文对照及缩写和密码子表
147.116
HOOC-(CH 2 ) 2 -
酸性氨基酸类
甘氨酸
Glycine
G或Gly
75.052
H-
脂肪族类
组氨酸
Histidine
H或His
155.141
N=CH-NH-CH=C-CH 2 -
|__________|
碱性氨基酸类
异亮氨酸
Isoleucine
I或Ile
131.160
CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )-
天冬氨酸
Aspartic acid
D或Asp
133.089
HOOC-CH 2 -
酸性氨基酸类
半胱氨酸
Cysteine
C或Cys
121.145
HS-CH 2 -
含硫类
谷氨酰胺
Glutamine
Q或Gln
146.131
H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
酰胺类
谷氨酸
Glutamic acid
E或Glu
F或Phe
165.177
Phenyl-CH 2 -
芳香族类
脯氨酸
Proline
P或Pro
115.117
-N-(CH 2 ) 3 -CH-
|_________|
亚氨基酸
丝氨酸
Serine
S或Ser
105.078
HO-CH 2 -
羟基类
苏氨酸
Threonine
T或Thr
119.105
CH 3 -CH(OH)-
脂肪族类
亮氨酸
Leucine
L或Leu
131.160
氨基酸
第一节氨基酸没有密码子：①鸟氨酸、瓜氨酸、同型半胱氨酸→不组成蛋白质②胱氨酸、羟脯氨酸、羟赖氨酸→组成人体蛋白质（蛋白质合成后加工修饰） R 基是H1. 没有旋光性，α螺旋不稳定，β转角常存在2. 肌酸：合成原料：甘氨酸、精氨酸、SAM（S-腺苷甲硫氨酸）⭐记○：赶紧SM3. 磷酸肌酸：高能化合物骨骼肌中，为肌肉收缩提供能量↳还有无氧氧化4. 卟啉：合成原料：甘氨酸、琥珀酰CoA ⭐记○：不干活血红素的合成关键酶：ALA 合酶辅助因子：磷酸吡哆醛部位：起始终末：线粒体；中间：胞浆⭐记○：始终在线5. 嘌呤：甘氨酸参与嘌呤组成，不参与嘧啶组成6. 一碳单位一个碳原子的有机基团生成一碳单位的氨基酸：丝、色、组、甘⭐记○：施舍竹竿一碳单位的载体：四氢叶酸作用：参与核苷酸合成7. 胆汁酸→游离↳结合：甘氨酸+牛磺酸1. 亚氨基酸⭐记○：葡萄牙2. α螺旋不稳定，β转角常存在容易让肽链形成转角3. 非极性脂肪族氨基酸⭐记○：携一两饼干赴宴缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸、脯氨酸极性→水溶性芳香族氨基酸：苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸1. 含硫氨基酸：胱氨酸、半胱氨酸、同型半胱氨酸、甲硫氨酸（蛋氨酸）2. 极性氨基酸极性最强3. 半必需氨基酸⭐记○：捞光租金苯丙（必需）→酪氨酸甲硫（必需）→半胱氨酸组氨酸、精氨酸（体内合成不能满足需要）4. 硒半胱氨酸 UGA 编码终止密码子UAA、UAG、UGA（不编码氨基酸，有特例）5. 牛磺酸：结合性胆汁酸半胱氨酸→牛磺酸6. PAPS 3-磷酸腺苷-5-磷酸硫酸是SO4-的一种活化形式。
非营养物质→（排走）尿、粪便（胆汁有关）→与水有关→提高非营养物质的水溶性。
生物转化：一些非营养物质在体内的代谢转变过程称为生物转化部位：肝（主要）、肾、肺、皮肤过程：一相和/或二相第一相反应：氧化、还原、水解反应第二相反应：结合反应eg:游离胆红素（UCB）结合UDPGA→结合胆红素（OB）只经过第二相反应第二相反应会结合的物质有：UDPGA（最常见，尿苷二磷酸葡萄糖醛酸）、PAPS、甲基、乙酰基、Gly（甘氨酸）、GSH（谷胱甘肽）7. GSH（谷胱甘肽）谷-半胱-甘三肽，两个肽键①还原性：防氧化②嗜核性：保肝药③维稳性：RBC1. 必需氨基酸⭐记○：写一两本淡色书来必需脂肪酸：亚油酸，亚麻酸，花生四烯酸。
氨基酸密码子
氨基酸密码子氨基酸密码子是生物学领域中一种重要的研究对象，它指的是一对对应的核苷酸和氨基酸的映射关系。
生物体内的基因上的信息是一个连续的核苷酸序列(a.k.a DNA或mRNA)，它们有不同类型的碱基，并以特定的方式排列在一起。
每一个DNA或mRNA序列所表示的蛋白质或调节分子又是这些序列组成的氨基酸。
上述从核苷酸到氨基酸的转换就是“氨基酸密码子”，它指的是一对对应的核苷酸和氨基酸的映射关系。
目前可以确定的氨基酸密码子有四种：标准密码子(Standard Code)、变异密码子(Variant Codes)、宿主密码子(host codes)以及内部信息密码子(Internal Message Codes)。
标准密码子是最古老的密码子，它包含的是人类用来识别核苷酸和氨基酸的基本映射关系。
它指的是特定的核苷酸(1-3bp)对应特定的氨基酸，具体而言，它将基因组中的各个核苷酸组成序列与蛋白质中特定氨基酸组成序列进行映射。
变异密码子是指在某些特殊环境下，在个体内可能存在的第三类核苷酸结构，即第三类核苷酸的密码子非常少见，数量也不多，但可以加强或加快某些反应的氨基酸。
宿主密码子是一类特殊的变异密码子，它指的是宿主物种的基因上的特殊特性，它们也可以改变氨基酸结构，同时也可以由更高级的信息编码形式，如抗性基因、匹配基因等，来满足不同类型特定环境对编码和表达的特定需求。
最后，内部信息密码子是指根据调控机制而构造的序列，它们控制诸如转录水平、蛋白质翻译水平以及细胞信号转导等，从而改变蛋白质生理功能，或影响基因组结构。
氨基酸密码子在生命科学中的应用也很广泛，大部分的基因表达研究都需要依赖于氨基酸密码子来进行，它不仅用于推断功能基因的结构和进化关系，还可以用于基因的表达调控、蛋白质的翻译以及调节分子的结构形成等等工作。
氨基酸密码子还可以用于研究物种差异，主要意义在于通过比较密码子以及密码子相关物种中表达水平较高的基因，可以推断某一基因的生物学功能。
分子生物学第十章 遗传密码
码子之间无间隔。
密码的变偶性（1）
密码的变偶性（2）
密码的几乎通用性与变异性
密码具有一定的防错功能Biblioteka mRNA是蛋白质合成的直接模板
第十章 遗传密码
一、遗传密码
遗传密码的概念：mRNA 上的核苷酸顺序与蛋白质中的氨基 酸之间的对应关系称为遗传密码。mRNA上每三个连续核苷酸 对应一个氨基酸，这三个核苷酸就称为一个密码子，或三联体 密码（triplet codons）。 Nirenberg、Khorana因遗传密码的破译而与另一位科学家 （霍利）分享了1968年诺贝尔生理学奖。
遗传密码表(阅读方向为5‘→3’)
二、遗传密码的特点：
1、同一个氨基酸有多个密码子编码，此现象称密码子的简并性，
除Met外，Trp仅有一个密码子。
2、编码Met的密码子AUG同时是起始密码。 3、UAA，UGA，UAG 不编码任何氨基酸，为终止密码子，其作 用是终止肽链的合成 ，其中UAA---赭石型密码 （Ochre）， UAG---- 琥 珀 型 密 码 子 (Amber) ， UGA------- 乳 白 型 密 码 子 （Opal） 4、性质相近的氨基酸的密码子分布在相近的位置。 5、在mRNA模板上的密码子是连续的，前一个密码子与后一个密