一篇文章让你看懂STR技术
第五章 STR自动分型
D8S1179
(12 alleles)
D21S11
(24 alleles)
D7S820
(10 alleles)
CSF1PO
(10 alleles)
Blue panel
D3S1358
(8 alleles)
TH01
(10 alleles)
D13S317
(8 alleles)
D16S539
(9 alleles)
D8S1179
(12 alleles)
D21S11
(24 alleles)
D7S820
(10 alleles)
CSF1PO
(10 alleles)
Blue panel
D3S1358
(8 alleles)
TH01
(10 alleles)
D13S317
(8 alleles)
D16S539
(9 alleles)
Red panel
FGA high
(9 alleles)
100 bp
150 bp 139bp 160 bp
200 bp
250 bp*
300 bp
Orange panel 340 bp 350 bp
LIZ-labeled GS500 DNA sizing standard Figure 5.6, J.M. Butler (2005) Forensic DNA Typing, 2nd Edition © 2005 Elsevier Academic Press
DNA 分型
• 电泳对荧光颜色不同的DNA片断的峰 进行长度检测，并对应不同的颜色。 DNA片断与内标比较后确定长度。
• 最后与以同样方式确定的等位基因 Ladder比较，得到未知样本的PCR产 物片断分型。
java字符串str方法
java字符串str方法Java字符串（String）是一个非常重要的数据类型，用于存储和操作文本数据。
它提供了一系列的方法（str方法），可以用于处理字符串的各种操作。
本文将以Java字符串的str方法为主题，一步一步详细解释并举例说明它们的使用。
让我们一起来探索吧。
第一步：字符串的创建与赋值在Java中，我们可以使用以下三种方式来创建字符串对象：1. 直接赋值：String str1 = "Hello World!";这种方式最简单，只需用双引号将字符串括起来即可。
2. 使用构造函数：String str2 = new String("Hello World!");这种方式创建了一个新的字符串对象。
3. 使用字符串连接符：String str3 = "Hello" + " " + "World!";这种方式将多个字符串通过连接符+连接起来。
第二步：字符串的长度Java字符串提供了一个长度（length）方法，用于获取字符串的字符个数。
例如：String str = "Hello World!";int len = str.length();System.out.println("字符串的长度为：" + len);输出结果为：字符串的长度为：12第三步：字符串的比较Java字符串提供了两种比较方法，分别为equals()和equalsIgnoreCase()。
equals()方法用于比较字符串的内容是否相等，而equalsIgnoreCase()方法则不区分大小写。
例如：String str1 = "hello";String str2 = "Hello";boolean result1 = str1.equals(str2);boolean result2 = str1.equalsIgnoreCase(str2);System.out.println("equals()方法的比较结果为：" + result1); System.out.println("equalsIgnoreCase()方法的比较结果为：" + result2);输出结果为：equals()方法的比较结果为：falseequalsIgnoreCase()方法的比较结果为：true第四步：字符串的查找Java字符串提供了几种查找方法，其中常用的有indexOf()和lastIndexOf()。
小知识 什么是STR
小知识什么是STR？STR（Suspend To RAM）的意思是“挂起到内存”，它是一种瞬间开机技术（On Now）。
当系统进入“挂起”状态时，系统的当前状态信息会保存到内存中。
再次开机时，立即从内存读取数据恢复到系统挂起前的状态，因此使开机速度只有几秒钟。
STR功能是高级配置电源接口ACPI（Advanced Config Power Interface）的一部分，它的实现要求外围芯片组和BIOS都支持ACPI，各个扩展卡都支持STR，还要求采用ATX电源。
STR要求采用支持ACPI的操作系统，如Windows 98/Me/2000/XP等，还要求各个硬件的驱动程序和各个应用软件都支持ACPI。
关于STR的实现现在的新型主板大多都支持STR-挂起到内存技术。
它的实现原理是把结束时电脑的工作状态保存到内存，然后再关闭电源。
在这个时候，主板只供给内存少量的电，这样，我们只要轻轻晃动手中的鼠标，在开机时就可以不经过其自检过程，从而实现快速开机！一般其开机时间不超过10秒。
这样还有一个好处，就是可以节省电能。
怎么样，很酷吧？那么怎样实现STR呢？看下面：一、硬件设置1.首先你的电源要支持STR。
大家可以看看你机箱内的电源是否支持ATX2 v2.01规则，能够提供720毫安的5v STAND-BY电流，这些指标在电源上会有标识，大家注意一下就可以找到。
一般的A TX机箱应该都支持。
2.内存的规格，现在的pc-100以上的内存一般都支持STR，如果不能实现STR，很大可能就是你的内存规格太老了。
3.还有显卡的支持，大多的TNT2以上的新型显卡都支持STR。
4.上面的都满足后，就要做最重要的一步了：调整主板的跳线设置（就算您的主板为免跳线，也要进行手工设置）。
以华硕CULS2-C为例，需要在主板上将CUSL2-C USB Device Wake Up跳线由[1-2]（disable）手工调整为[2-3]（enable）。
STR是什么
有人说我们干吗需要ＳＴＲ，用休眠功能不也更好的吗？实际上休眠功能的实现有一定的限制，比如说进行磁盘整理时无法执行休眠功能，系统回提示“当前程序未关闭”。ＳＴＲ不仅省电，不管什么情况都能立即执行！尤其是那些想把电脑当作留言电话、传真机的人就更是如此了。看来ＳＴＲ的确有起实际用途。
原来，操作系统再哦正式工作前需要把大量的文件从硬盘调入内存，类似的，在休眠的时候也把需要的系统文件保存在硬盘上，由于目前一般的系统所使用的都（Ｓｕｓｐｅｎｄ Ｔｏ Ｄｉｓｋ）模式，就是说，把重新启动所需要的文件都存储在硬盘里，需要的时候从硬盘读如内存，所以速度特别慢。
为了解决这个问题，让个人电脑在使用上如同家电产品般方便，快捷，英特尔、微软和东芝共同制定了ＡＣＰＩ（Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｃｏｎｆｉｇｕｒａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｏｗｅｒ Ｉｎｔｅｒｆａｃｅ）“高级电源管理接口”，其中特别定义了一中ＳＴＲ标准。ＳＴＲ是Ｓｕｓｐｅｎｄ ｔｏ ＲＡＭ的缩写，所谓的“悬挂与内存”意思是指系统关机或进入省电模式后，将重新启动所需的文件数据都存储在内存里，如此一来，硬盘的速度瓶颈被大大隔离开，系统的启动操作将主要在内存里闪电般地完成而不必频繁地度曲慢速的硬盘，使用ＳＴＲ模式，系统恢复时间将比ＳＴＤ快许多，广告上甚至宣称７秒便可搞掂！
在使用ＳＴＲ功能以后，千万不可随意插拔内存，因为此时ＡＴＸ电源即使在关闭以后还要继续给内存供电以保证数据不丢失，所以千万不要象以前那样习惯性的关了电就插拔内存，如果一定要 幕埃氚眩玻玻埃值牡缭床逋钒蔚簦沟锥系纾幻嬖斐赡诖娴纳栈倩蛳低乘阑？br> ＳＴＲ的效果如何呢？做个试验吧，在一台支持ＳＴＲ的电脑上，从ＷＩＮ９８打开两个窗口，一个是接龙游戏，另一个用ＰＯＷＥＲＰＯＩＮＴ进行演示。接下来将系统暂停，这时ＳＴＲ就开始起作用了，把电源开关啪地一关，再一开，嘿，换了以前啊，肯定是先进行内存自测，硬盘自检，再进入ＷＩＮ９８，起码一分多钟，保不准两个窗口的内容可能丢了。但现在只听到硬盘一阵乱响，约莫十秒钟左右，屏幕由暗转亮，一切恢复的原状！这个速度比不上广告上说的７秒，但考虑到开了两个窗口的缘故是要慢几秒钟，而比起原先ＳＴＤ模式的一分钟可就快得太多太多啦！
python str方法的用法
python str方法的用法Python字符串（str）是一种表示文本数据的数据类型。
在Python中，字符串是不可变的序列，存储了一个或多个字符。
字符串对象有许多内置的方法，可以用于操作和处理字符串。
本文将详细介绍Python字符串的一些常用方法及其用法。
1. len()函数len()函数用于获取字符串的长度，即包含的字符数。
它是一个内置函数，不需要通过导入模块来使用。
下面是一个示例：pythonstring = "Hello, World!"print(len(string)) # 输出：132. 字符串索引和切片字符串支持使用索引和切片操作来访问和提取其中的字符或子串。
2.1 字符串索引字符串索引从0开始，可以使用索引来访问特定位置的字符。
例如，要获取字符串中的第一个字符，可以使用索引0，请看以下示例：pythonstring = "Hello, World!"print(string[0]) # 输出：H2.2 字符串切片字符串切片用于提取字符串中的子串。
它通过指定起始索引和结束索引的方式来确定要提取的子串范围，其中起始索引的字符包含在结果中，而结束索引的字符则不包含在结果中。
例如，我们可以使用切片操作获取字符串中的前五个字符和后五个字符，请看以下示例：pythonstring = "Hello, World!"print(string[0:5]) # 输出：Helloprint(string[-5:]) # 输出：World!3. lower()和upper()方法lower()方法用于将字符串中的所有字符转换为小写形式，而upper()方法则将字符串中的所有字符转换为大写形式。
例如：pythonstring = "Hello, World!"print(string.lower()) # 输出：hello, world!print(string.upper()) # 输出：HELLO, WORLD!4. strip()方法strip()方法用于去除字符串前后的空白字符（包括空格、制表符和换行符）。
Sturts的工作原理
浅析Struts 体系结构与工作原理(图)基本概念Struts是Apache 基金会Jakarta 项目组的一个Open Source 项目，它采用MVC模式，能够很好地帮助java 开发者利用J2EE开发Web应用。
和其他的java架构一样，Struts 也是面向对象设计，将MVC模式"分离显示逻辑和业务逻辑"的能力发挥得淋漓尽致。
Structs 框架的核心是一个弹性的控制层，基于如Java Servlets，Java Beans，ResourceBundles 与XML等标准技术，以及 Jakarta Commons 的一些类库。
Struts有一组相互协作的类（组件）、Serlvet以及jsp tag lib组成。
基于struts构架的web应用程序基本上符合JSP Model2的设计标准，可以说是一个传统 MVC设计模式的一种变化类型。
Struts有其自己的控制器（Controller），同时整合了其他的一些技术去实现模型层（Model）和视图层（View）。
在模型层，Struts可以很容易的与数据访问技术相结合，如 JDBC / EJB ，以及其它第三方类库，如 Hibernate / iBATIS ，或者 Object Relational Bridge(对象关系桥)。
在视图层，Struts能够与JSP，包括 JSTL 与 JSF，以及 Velocity 模板，XSLT 与其它表示层技术。
Struts 为每个专业的 Web 应用程序做背后的支撑，帮助为你的应用创建一个扩展的开发环境。
Struts的体系结构与工作原理MVC即Model-View-Controller的缩写，是一种常用的设计模式。
MVC 减弱了业务逻辑接口和数据接口之间的耦合，以及让视图层更富于变化。
MVC的工作原理,如下图1所示：图1Struts 是MVC的一种实现，它将 Servlet和 JSP 标记（属于 J2EE 规范）用作实现的一部分。
Python字符串（Str）详解
Python字符串（Str）详解字符串是 Python 中最常⽤的数据类型。
我们可以使⽤引号('或")来创建字符串。
创建字符串很简单，只要为变量分配⼀个值即可字符串的格式b = "hello "# 或者b = 'hello '双引号或者单引号中的数据，就是字符串字符串连接的⽅法直接通过加号(+)操作符连接a = "str1"b = "str2"c = a + bprint("a：%s" % a) # a：str1print("b:%s" % b) # b:str2print("c:%s" % c) # c=a+b:str1str2join⽅法join()：连接字符串数组。
将字符串、元组、列表中的元素以指定的字符(分隔符)连接⽣成⼀个新的字符串'sep'.join(seq)参数说明sep：分隔符。
可以为空seq：要连接的元素序列、字符串、元组、字典上⾯的语法即：以sep作为分隔符，将seq所有的元素合并成⼀个新的字符串返回值：返回⼀个以分隔符sep连接各个元素后⽣成的字符串listStr = ['python', 'tab', '.com', 'wqetab', '']print(listStr)website = '++'.join(listStr)print(website) # python++tab++.com替换例⼦：a = "str1"b = "str2"e = "===%s===" % (a + b)print("a：%s" % a) # a：str1print("b:%s" % b) # b:str2print("e:%s"%e) # e:===str1str2===总结下⾯再来说⼀下三种⽅法的不同⽅法1，使⽤简单直接，但是⽹上不少⼈说这种⽅法效率低 之所以说python 中使⽤ + 进⾏字符串连接的操作效率低下，是因为python中字符串是不可变的类型，使⽤ + 连接两个字符串时会⽣成⼀个新的字符串，⽣成新的字符串就需要重新申请内存，当连续相加的字符串很多时(a+b+c+d+e+f+...) ，效率低下就是必然的了⽅法2，使⽤略复杂，但对多个字符进⾏连接时效率⾼，只会有⼀次内存的申请。
str坚定原理
str坚定原理嘿呀，你知道吗？这坚定原理啊，可就像是咱们生活里的定海神针一样呢。
原理这东西，就像是一些隐藏在生活背后的小秘密。
比如说，你看到太阳每天东升西落，这就是一种原理在起作用啦。
可是呢，坚定原理可不是那么简单就做到的。
就像我小时候，我妈告诉我要早睡早起身体好，这就是个健康生活的原理。
可是我呢，总是被晚上那些好玩的动画片吸引，就不想早睡。
那时候啊，我就没有坚定这个早睡早起的原理。
结果呢，第二天上学就没精神，像个小迷糊虫一样。
在学习上也是一样的。
我们都知道，知识是一点点积累起来的，这就是个学习的原理。
可是啊，很多时候我们就想走捷径。
我记得我学数学的时候，那些公式定理看着就头疼。
我就想啊，要是我能不背这些公式就能算出答案那该多好。
于是我就乱做一通，根本没有坚定知识积累这个原理。
后来考试成绩一出来，那叫一个惨不忍睹啊。
我就明白了，这些原理就像游戏里的规则一样，你要是不遵守，不坚定地按照它来，你就没法通关。
再说说交朋友吧。
真诚待人是交朋友的一个很重要的原理。
我有个朋友，他刚开始和大家相处的时候，就想着怎么从别人那里得到好处，对人也不真诚。
结果呢，大家慢慢地都不喜欢和他一起玩了。
他就很苦恼，跑来问我。
我就跟他说，你得坚定真诚待人这个原理啊。
你不能只想着自己，要真心地去关心别人。
后来他听了我的话，慢慢地改变了自己的态度，现在他的朋友也越来越多了。
在工作上更是如此。
努力就会有回报，这也是个原理。
我有个同事，他总是抱怨自己的工作怎么怎么不好，工资怎么怎么低。
可是呢，他在工作的时候总是偷懒，能少干一点就少干一点。
我就跟他说，你都没有坚定努力工作这个原理，怎么能期待有好的回报呢？你看那些努力工作的人，他们不断地提升自己的能力，慢慢地就升职加薪了。
他听了之后，虽然还是会偶尔犯懒，但是也开始慢慢努力起来了。
坚定原理啊，就像是在大海里航行的时候紧紧握住船舵一样。
有时候会有风浪，会有诱惑，让我们想要偏离这个原理。
就像你在减肥的时候，看到那些美味的蛋糕，你心里就会想，就吃一点点应该没关系吧。
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一篇文章让你看懂什么是STR技术
STR分型是常用的分子生物学技术之一，广泛应用在我们生活的方方面面，如农业生产、食品加工、亲子鉴定和生命科学研究等领域，可谓是多面手。
再加上NIH、ATCC等权威机构多次呼吁细胞鉴定的呼吁，生命科学研究就更离不开它了。
下面，让我们来深入了解一下什么是STR，以及它在科学研究中的应用都有哪些。
STR分型广泛应用于发酵食品。
什么是STR
首先，我们要清楚什么是STR？STR（short tandem repeats），即短串联重复序列，其概念等同于简单重复序列（Simple Repeats Sequence，SRS）和微卫星（Microsatellites）：以2～6个碱基为单元在基因组中串联重复的序列，约占真核生物基因组的5%，例如“CGG CGG CGG……CGG CGG”。
STR位点容易发生“复制滑移”：DNA复制时，如果新链从模板上脱落，当再退火时就可能在STR位点发生滑移错配现象。
重新开始复制时，出现重复复制或者跳跃复制的现象，使得子代DNA链在STR位点部分重复或缺失。
STR位点复制滑移的发生频率受到多种因素的影响，变异很大，但有一个共同特征：发生概率小，但足以在种群内部产生差异。
种群遗传学
根据STR位点两侧50～500 bp距离的保守序列设计引物，可以用PCR的方式有效地扩增STR序列，这种方式可以得到任何我们想要的STR序列。
由于人类的常染色体一条来自于父亲，一条来自于母亲，因此可能得到一份或者两份不同序列长度的PCR结果。
长度的差异是由于STR重复次数的差异造成的。
STR位点的重复次数通常为5～30，如果重复单位为三碱基，那么可能造成同源染色体的STR长度最多有75个碱基差异。
因此，STR的一个重要应用是作为种群遗传学的分子标记。
STR位点，如D1S80或者其附近的TPOX基因（含有STR序列）都是常用的分子标记，可以用于亲子鉴定和遗传多态性分析等。
DNA指纹图谱（DNA fingerprint）
通过PCR的方式获得单个STR扩增序列后，可以通过毛细管电泳分析仪读取序列长度，精确到核苷酸。
PCR结果可能包含一个或两个序列长度。
如果两个样本的结果不同，那么我们可以认定这两个样本来自不同的个体。
如果两个样本的结果相同，我们不能判定这两个样本来自同一个个体，因为不同的个体可能含有相同的分型结果。
.
四个STR标记（A、B、C和D）的毛细管电泳分型结果。
Sample1、2、3分别代表三个不同来源的样本。
单峰表示纯合子，双峰表示杂合子。
同时鉴定的STR位点越多，两个来自不同个体的STR分型结果相似度就越低，因此，若是鉴定足够量的STR位点，每个个体都有自己独特的STR分型结果，又称为STR指纹图谱，可用于亲子鉴定。
通常，16个STR位点（15个位于常染色体和一个位于性染色体）足以鉴定个体，两个个体含有相同STR分型结果的可能性低至1/1.8×1017，后者几乎是整个地球的人类总数。
DNA指纹图谱可用于法医鉴定和犯罪鉴定等。
STR“指纹图谱”方法简单可操作，还有成熟的试剂盒供选择，可在分子病理学实验室中实现，用以追踪或者辨别样本。
分子病理学实验室经常会将很多潜在肿瘤的活组织切片嵌入到一个FFPE（福尔马林固定和石蜡包埋）块中，如果免疫组化实验显示大多数组织切片是非癌的，而只有一个切片显示癌变，那么我们就应当考虑是否这些组织来源于同一个组织，或者不小心掺入了别的组织。
无论实验再怎么小心谨慎，这些情况难免会发生。
因此STR 分型就派上用场了，将这些组织块的STR分型结果与原始组织的STR结果一对比，亲缘关系就一目了然了。
亲缘关系
除了确定或者否决两个样本的相同来源，STR鉴定技术还能用来研究亲缘关系。
我们一半的STR位点来源于母亲，另一半来源于父亲。
根据孟德尔遗传定律可知，子代之间应该有四分之一的STR相似性。
因此，STR可以用来研究两个样本间的亲缘关系。
实际情况下存在前面提到的复制错配或者实验误差，但是这不影响剩余的其他STR位点做出正确的判断。
性别连锁的STR
STR还可能特异地位于性染色体上。
牙釉蛋白基因不是典型的STR，因为其重复单元的重复次数变异很大，研究显示，牙釉蛋白在X染色体上的拷贝（AMELX）与在Y染色体上的拷贝（AMELY）的长度不完全相等，差异在于AMELY的内含子部分在AMELX的内含子相同位点插入了6个碱基。
因此，雌性个体具有两份AMELX，雄性个体具有一份AMELX和一份AMELY，这就产生了性别差异。
用PCR的方法扩增这个包含这个区段的序列就可以对雌雄进行鉴别了。
最常用的引物在雌性和雄性中分别得到106 bp和106/112 bp的产物。
这个位点已经是STR分型常用的位点之一。