AlgaeC型浮游生物(藻类,浮游动物)智能鉴定计数仪
显微图像处理在藻类分类计数中的应用

THE APPLICATIoN oF DIGITAL M ICRoI GE PRoCESSING IN ALGAE CLASSIFYING AND CoUNT G
系统构 成 为 Olympus B202双 目显 微镜 ,CCD摄 像头 ,真彩 色 图像 采 集 卡 和 采用 Microsoft Visual c” 6.0 Professional版本 自行 开发 的显微 图像 处 理 软件 ,操作系统为 Windows2000。
对图像进行直方图均衡处理就是为了使原 图像 变成 了一幅具有均匀灰度概率分布 的新 图像 ,增加 图像的对 比度 ,改善视觉效果。鉴 于篇 幅有关直方 图均衡处理 的基本原理可参阅有关资料 ,此处从略。 经 直 方 图均 衡处 理后 的图像 见 图 2。
L/Jin-zhong,WU Yan-you,QIN Song,ZHAO Yu-guo (The Institute of Agricultural Engineering,Jiangsu University,Zhenjiang,Jiangsu,212013,China)
ABSTRACT Th ere ̄a close relation between algae in water body and water quality,SO we ca n assess the latter ac。 cording to the algae general index and bio—diver sit y index.Traditional algae inspection is to take statistics of alga spe— cies and number in water body through professional S naked eye under microscope.This paper puts forward another new
水生生物

绪论Plankton (浮游生物): 源于希腊字planktos, 指被动地漂浮于水层中的生物群。
该类群通常个体很小,须借助于显微镜或解剖镜才能看清楚其构造,但也包括一些大型的动物如水母类、甲壳类的被囊类等。
其共同的特点是缺乏发达的运动器官,只能随波逐流。
Nekton: 游泳生物Benthos: 底栖生物Planktonology(浮游生物学):研究浮游生物的生命现象规律的科学,称为浮游生物学。
浮游生物学包括:Morphology: 形态学; taxonomy:分类学;ecology: 生态学;physiology: 生理学;biochemistry:生物化学Marine Biology: 海洋生物学是研究海洋中生命现象、过程及其规律的科学,是海洋科学的一个主要学科,也是生命科学的一个重要分支。
主要研究海洋里生命的起源和演化,生物的分类和分布、发育和生长、生理、生化和遗传,特别是海洋生态。
Biological Oceanography:生物海洋学是一门研究海洋生物种群在时间和空间分布状态,以及各生物群落之间和环境间相互作用的学科。
不难看出,生物海洋学主要涉及的领域是生物分类学和生态学。
Biology: 生物学Oceaography:海洋学Aquaculture: 水产养殖Fishery: 渔业Meterology: 气象学Environmental Science: 环境科学Marine Sedimentology (Marine Geology): 海洋沉积学(海洋地质学)Medusa:水母3.1营养类型浮游植物:自养型,包括细菌和单细胞藻(硅藻、甲藻、绿藻、蓝藻、金藻、黄藻、隐藻和裸藻)浮游动物:异养型,包括原生动物、水母、轮虫、甲壳为、毛颚类、远洋软体动物、被囊类、无脊椎动物弹性体和低等脊索动物硅藻门(Bacillariophyta):有11,000多种,可分为2纲中心硅藻纲和羽纹硅藻纲。
实时浮游生物图像目标智能识别系统设计

H24 - 6  ̄ q s Lnx iu
I块 圆模l 圆模l ln 筛 I 块 —el 选 传 t 输 存块 储r 模 w o k
I........ J ......... ........__ ........
网
图 1 本文 系统架杓
系统 的识别对象为生物 目标 ,而现场实时采集的图像帧 序列 中容易存在没有 生物 目标的 “ 空白”帧 。本文在传统的
逐 帧 图像 处 理 过 程 中 ,引 入 目标 帧 筛选 算 法 ,快 速 过 滤\ / 完整性分 析
二
合并 1 4标
s se o l n t n tr e t i h r c g i o ae Thi p p r a q ie e lt ma e wi y t m fp a k o a g twi h g e o n t n r t . h i s a e c u r s r a —i me i g t CCD e s r d v l p a g tfa e e to n t e h s n o , e e o st r e me s l c in i h l p o e sn f fa s r c s i g o r me .A a t s g e t t n b s d o a k r u d s b r c i n i s e d o a i o a t r to s p o o e .F s i e r c a s fe t f s e m n a i a e n b c g o n u ta t n ta ft d t n lie a i n i r p s d a tl a ls i r wi o o r i n i h
2 系统架构
系 统 总体 功能 结 构 如 图 1 示 。 所
AOA 在线藻类分类检测仪使用手册

生物学、生物物理学与工程学bbeMoldaenke bbe Moldaenke股份有限公司Wildrosenweg 3D - 24119 Kiel-Kronshagen电话:+49 (0)431/380 400传真:+49 (0)431/380 4010电子信箱:bbe@bbe-moldaenke.de藻类在线分析仪用户手册版本2.5 E12007年9月目录新特性软件版本1.4:软件版本1.5:黄色物质探测模拟输出软件版本1.6:支持测量样品温度模拟输出湿度探测器软件版本1.7:批模式开始显示宏软件版本1.7.3:校准USB端口软件版本1.9校准出厂出置清洁:数据库中的X检验法软件版本1.97重新匹配可选传感器身份软件版本1.98文本输出软件版本2.0增强重新匹配可选格式改变匹配外部计算机的模拟输出软件版本2.3警报生成特性增强测量程序增强清洁程序继电器输出支持bbe试管荧光计软件版本2.4模拟输出信息面板内的藻类颜色显示软件版本2.5模拟输出的校准通过叶绿素浓度计算并显示藻类细胞浓度安全建议仪器的构成与功能性藻类在线分析仪的使用bbe藻类在线分析仪藻类分类测量藻类活性测量更多值的测量及其计算概述透光率传感器信号透光率计算通过透光率补偿叶绿素浓度传感器的温度温度补偿计算发光二级管的亮度藻类在线分析仪带清洁器的传感器装置操作管子的加载调整泵压头测量程序测量顺序测量结果环境条件电路连接(带机架)电源连接数据接口用内置计算机(可选)进行的模拟输出(4-20mA)用外置个人计算机(可选)进行的模拟输出(4-20mA)连接外部模拟输出装置安装RS485适配器的USB驱动程序继电器输出可选连接继电器输出装置外置个人计算机的附加连接电路连接(壁装式)液压连接样水带内置取样泵带取样泵排水测量开始短指令软件软件的安装软件的结构数据结构软件更新X轴刻度自由选择导航帮助菜单文件开关输出文本输出打印打印预览打印机设置1. 2. 3. 4.退出测量菜单开始停止选项常规信息页基本操作模式视图选项串行端口(仅限在线模式)操作(仅限在线模式)自动启动:泵模式(可选):数据库(仅限在线模式)视图菜单工具栏状态栏信息板分批面板试管板开始数据返回前进结束数据6小时1天1周重新调节X和Y重新调节X重新调节Y放大/缩小注释颜色自动缩放Y类型样品中的叶绿素样本透光率活性样本温度菜单窗口图形窗口消息窗口数据窗口显示测量结果X检验法的显示RS232窗口新复制层叠平铺显示重排图标隐藏标题数据窗口创建新宏3水平/叶绿素/开始1. 2. 3. 4.参数菜单测量次数发光二极管亮度F-适应F-测量透光率取消活性检测发光二极管亮度降低Fo-适应Fm-测量Fm-积分时间测量程序匹配的参数测量的参数发光二极管(维修技术员)透光率透光率系数(维修技术员)最低有效F-浓度综合校正系数荧光传感器温度补偿表(维修技术员)报警配置模拟输出(可选)继电器输出(可选)更换的传感器标准偏差规范化传感器身份计数方式测试菜单清洁泵校准菜单传感器透光率偏移(超过滤的/去离子的)指纹图谱校正系数指纹图谱的校正工具栏图形图形中的前后关系菜单输入注释观察参数重新匹配数据恢复原始值调整轴线面板信息板分批面板操作测量程序最初测量程序偏移低叶绿素浓度测量程序背景荧光清洁测量时间沉淀样品制备校准程序概论:偏移的校准:藻类指纹图谱的校准:黄色物质的校准:根据系数进行的校准:用后来的湿法化学分析进行的指纹图谱校准:批模式操作数据评价保养周保养:必须进行的保养工作:月保养必须进行的保养工作:半年保养必须进行的保养工作:1年半保养必须进行的检修工作:保养指示软管系统的清洁更换泵的软管软管直径与型号清洁测量试管必须进行的检修工作:更换传感器更换保险丝故障排除藻类在线分析仪不响应计算机(仅外置个人计算机)藻类在线分析仪不启动计算机(仅内置计算机)泵不运行无藻类浓度显示活性结果为零结果太低结果太低或太高传感器内探测的湿度数据与表格串行数据交换技术数据(计算机版)如果它不工作...... 索引注新特性软件版本1.4:拷贝:将数据或者图形拷贝到其它程序的内置可选。
水源水库中藻类生长及分布特征

绿藻中的星球藻 、纤维藻 ,硅藻中的直链藻 、舟形藻 为主 ;夏季水温较高 、光照强烈时 ,藻种以蓝藻中的 微囊藻 、棒条藻 ,绿藻中的栅列藻 、卵囊藻为主 。
图 1 南郊水厂 2007年 3—5月原水含藻量 Fig. 1 A lgae of raw water from M arch to M ay
( 1. Key L abora tory of N orthw est W a ter R esou rce, Environm en t and Ecology, MO E, X i’an U n iversity of A rch itectu re & Technology, X i’an 710055, Ch ina; 2. W a ter
发 。大中型城市附近的水库污染普遍较为严重 ,优 势种多为耐有机污染的微囊藻等蓝藻类 [ 2 ] 。
黑河水库是西安市主要的供水水库 ,供水量为 60 ×104 m3 / d。近年来黑河水库水的 TN、TP等营养 盐浓度逐年增加 ,导致藻类数量显著增加 ,对以黑河 水库为主体的地表水源开展藻类监测已刻不容缓 。 笔者对西安市饮用水原水中的藻类进行了检测 ,并 结合水质特征对其分布规律进行了分析 。
2 12 藻类生长与原水水质的关系 21211 水温 、光照对藻类生长的影响
水温是影响湖泊富营养化的主要因素 ,水温在 9 ℃以上 ,硅藻繁殖活跃 , 10 ~17 ℃是硅藻生长最 为适宜 的 温 度 , 高 于 17 ℃以 上 , 其 繁 殖 速 度 减 慢 [ 4 ] ,而蓝藻形成的适宜温度在 25 ℃左右 。温度 对藻类生命活动的影响主要表现为通过控制光合作 用的酶促反应或呼吸作用强度 ,直接影响藻类的增 殖 ,并且可通过控制水体中的各类营养物的溶解度 、 离解度 或 分 解 率 等 理 化 过 程 间 接 影 响 藻 类 的 生 长 [ 5 ] 。藻类数量随水温的变化如图 3、图 4所示 。
华侨城湿地浮游生物调查

针簇多肢轮虫
0
3
前节晶囊轮虫
0
0
黑斑索轮虫
2
0
发头裸腹溞
301
369
四刺窄腹剑水蚤
20
37
单尾猛水蚤
1
0
无节幼体
21
95
桡足幼体
0
76
溞幼体
20
64
线虫
1
0
摇蚊幼虫
0
0
合计
487
944
ind./L
2 号栈道 369 23 15 8 6
3 号栈道 201 52 9 0 1
营养化级别,水质类别为 V 类水。 心岛(1.66),可能是由于沿岸带及
2.2 浮游动物组成
浮床植物在一定程度上可以优化群
共鉴定出浮游动物 3 个动物门 落结构,促进其健康发展。但沿岸
的 12 种动物,其中线虫动物门的 带优势种为耐污、耐低溶氧的壶状
线虫 1 种;轮虫动物门 8 种;节肢 臂尾轮虫,说明湖水水质并不是太
1.15 ~ 1.39)。
2.363,Margalef 丰富度指数分别
各样点叶绿素 a 含量见表 2。 为 0.90、1.01、1.12 和 0.88。 沿
对应国际叶绿素含量分级 ( 高阳俊 岸 带 浮 游 动 物 的 Shannon 多 样 性
等 ,2011), 华 侨 城 湿 地 属 于 重 富 指数为 2.36 ~ 2.46,显著高于湖
参考文献 陈光荣 , 钟萍 , 张修峰 , 等 .2008. 惠州
西湖浮游动物及其与水质的关系 [J]. 湖泊科学 , 20(3):351-356 高阳俊 , 曹勇 , 赵振 , 等 .2011. 基于叶 绿素 a 分级的东部湖区富营养化标准 研究 [J], 环境科学与技术 ,34(12H): 218-220 林鹏 .1984. 红树林[M]. 北京:海洋出 版社 王雨 , 卢昌义 , 谭凤仪 , 等 .2010. 深圳 红树林水体浮游植物多样性与营养状 态评价 [J]. 海洋环境科学 ,29(1):1721,26 徐桂红 , 张小英 , 徐昇 , 等 .2015. 华侨 城湿地鸟类多样性调查研究 [J]. 湿地 科学与管理 ,11(2):59-61 昝启杰 , 许会敏 , 谭凤仪 , 等 .2013a. 深 圳华侨城湿地物种多样性及其保护研 究 [J]. 湿地科学与管理 ,9(3):56-60 昝启杰 , 谭凤仪 , 李喻春 .2013b. 滨海湿 地生态系统修复技术研究 : 以深圳湾 为例 [M]. 北京 : 海洋出版社
Bbe藻类分类野外现场分析仪-Fluoroprobe

Bbe 野外便携藻类分类分析仪(Fluoroprobe)设备主要适用范围:该设备适合于在线监测、移动检测、也实用于实验室取样检测。
在野外检测不同水深的叶绿素浓度时,将设备浸入水中,设备检测浓度的同时,检测水深。
加配一套特别检测杯,可以取样放入检测杯后进行检测。
FluoroProbe 能快速检测最深100 米水深处的叶绿素浓度,检测数据可以通过串口在线显示或者存储在设备中等待后续分析。
除检测叶绿素的量之外,仪器还可以检测到藻的存在,并将藻按光谱法分类(蓝藻/青蓝菌藻, 绿藻, 硅藻/甲藻, 隐藻).这样,仪器可以现场分析藻的存在以及分布而不必要到实验室去做。
湖泊、池塘、大海水体经常出现分层特性,用FluoroProbe检测可以发现有趣的浮游生物分布特性。
主要用在湖泊、河流、海洋不同水深叶绿素浓度分布检测。
设备工作原理:用可见光激励藻产生的荧光(在700nm 波长附近)主要取决于叶绿素a,叶绿素a 是植物里一种常见的色素。
对于不同的藻,还会有其他特征色素出现,这些色素与叶绿素a 相互作用,对不同的藻将产生不同的分类激励特征谱。
这种荧光特征谱被称为“指纹”,被用到bbe 的仪器中来确定不同类藻的量。
激励光源就是不同波长的激光二极管,一般都是可见光。
四类藻以及黄色物质的“指纹”已经存储在设备中,用户定义的“指纹”也可以加入,并用来分析水中的藻的量。
也可以检测细菌叶绿素(联乙烯叶绿素divinyl chloropgyl)以及硫磺菌荧光(sulphur bacteria)。
藻的强度指藻的存活强度,对于任何同类藻,浓度并不能反映藻的大小分布。
实际上,如果两个藻属同类,大个的藻对环境的影响更大,这只能用强度反映出来。
该设备加配了透明度检测器、温度检测器和压力(水深)检测器。
软件:bbe FluoroProbe 软件用于详细数据分析,所有的检测数据可以以数字形式或图形形式显示。
使用缩放功能可以记录和打印部分数据片段,数据也可以导出到报表软件(如Excel)。
水生生物

绪论Plankton (浮游生物): 源于希腊字planktos, 指被动地漂浮于水层中的生物群。
该类群通常个体很小,须借助于显微镜或解剖镜才能看清楚其构造,但也包括一些大型的动物如水母类、甲壳类的被囊类等。
其共同的特点是缺乏发达的运动器官,只能随波逐流。
Nekton: 游泳生物Benthos: 底栖生物Planktonology(浮游生物学):研究浮游生物的生命现象规律的科学,称为浮游生物学。
浮游生物学包括:Morphology: 形态学; taxonomy:分类学;ecology: 生态学;physiology: 生理学;biochemistry:生物化学Marine Biology: 海洋生物学是研究海洋中生命现象、过程及其规律的科学,是海洋科学的一个主要学科,也是生命科学的一个重要分支。
主要研究海洋里生命的起源和演化,生物的分类和分布、发育和生长、生理、生化和遗传,特别是海洋生态。
Biological Oceanography:生物海洋学是一门研究海洋生物种群在时间和空间分布状态,以及各生物群落之间和环境间相互作用的学科。
不难看出,生物海洋学主要涉及的领域是生物分类学和生态学。
Biology: 生物学Oceaography:海洋学Aquaculture: 水产养殖Fishery: 渔业Meterology: 气象学Environmental Science: 环境科学Marine Sedimentology (Marine Geology): 海洋沉积学(海洋地质学)Medusa:水母3.1营养类型浮游植物:自养型,包括细菌和单细胞藻(硅藻、甲藻、绿藻、蓝藻、金藻、黄藻、隐藻和裸藻)浮游动物:异养型,包括原生动物、水母、轮虫、甲壳为、毛颚类、远洋软体动物、被囊类、无脊椎动物弹性体和低等脊索动物硅藻门(Bacillariophyta):有11,000多种,可分为2纲中心硅藻纲和羽纹硅藻纲。
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国家高新技术企业——杭州万深检测科技有限公司
一、用途:
浮游生物(浮游植物、浮游动物)的快速计数、辅助鉴定,以及显微分析等,用于水质等的一体化监测评价。
二、主要配置:
1)、专业级2000万像素彩色CMOS相机(索尼1”大芯片)、三目显微镜标准C接口
2)、AlgaeCTM浮游生物计数分析智能鉴定系统软件(含显微分析软件) 1套3)、品牌电脑(酷睿i5 CPU/4G内存/500G硬盘/19.5"彩显/无线网卡,专业版Windows 7或10操作系统下使用)1台
三、主要性能指标:
1)显微成像:实现手动与自动拍摄。
可人工控制显微图片的观察、拍摄、存储并自动拍摄多达200张图片;在自动模式下可实现连续自动等间隔图片拍摄。
★具有实时预览饱和警告、自动背景矫正特性。
2)★中文、拉丁文双语显示的浮游生物专家图库:a、浮游藻类类群:蓝藻、绿藻、硅藻、裸藻、黄藻、褐藻、甲藻、隐藻、金藻、红藻、轮藻、灰色藻、定鞭藻、原绿藻、针胞藻共15个门、1588个属、14107个种的藻类;b、浮游动物类群:原生动物鞭毛虫类、原生动物肉足虫类、原生动物纤毛虫类、轮虫类、枝角类、桡足类、腔肠动物、被囊动物、毛颚动物等共24大类、1933个属、9423个种的浮游动物。
内
国家高新技术企业——杭州万深检测科技有限公司容包括浮游生物形态文字介绍、手绘图、显微照片。
各图库属种和内容可自行扩充(已有有效图片量已达24.3687万张)。
3)★浮游生物计数:a、浮游生物分类标记:采用不同颜色、不同大小的色圈标
记各种浮游生物,并对200张所拍摄图片内的各种浮游生物,按类点击、自动累积计
数(可合并不同倍率计数结果、多个样品计数结果);b、优势种自动排序、按门(类)排序、优势群落组成百分比分析;c、可自动计算香农-威纳指数、均匀性指数、藻密
度自动换算、浮游动物丰度自动换算;d、按大量形状模型来辅助计算浮游生物的生物量(内置34种几何模型,通过测量少量参数即可计算个体/细胞体积)。
内置常见淡
水藻、常见海洋藻等计数表,并可自行编辑、导出、导入计数表。
数据管理:自动保
存每批显微照片、统计标识和统计数据;提供报告编写模板、文本输入、打印预览。
微囊藻分析模块能自动学习与分析团状微囊藻群体含细胞数,实现颗粒或单细胞
微藻自动计数。
4)★藻类、浮游动物智能鉴定:具有按相似度自动比对浮游生物图像的图像式智能搜索特性。
通过形态学搜索、关键词搜索、常见浮游生物搜索、分类学搜索,经图像、文字对比,快速鉴定浮游生物。
能自动索引浮游生物的用户计数表成所在流域小
图库,使【以图搜图】更快捷。
5)浮游生物形态测量功能:a、视野面积、藻群体面积、浮游动物个体面积测量;
b、细胞直径、藻丝、鞭毛长度、浮游动物体长及触角测量;
c、枝角分枝角度测量等。
国家高新技术企业——杭州万深检测科技有限公司6)★超强的景深扩展的多聚焦融合3D高清晰成像。
多视野图像的自动拼接、剪
裁编辑修正特性。
有藻类、浮游动物的颜色、形状自动学习分类特性,可监视修正转
换藻类、浮游动物类别,并二次学习和保存分类特征。
具有在线自主升级特性。
7)★按形状特征搜索、模糊关键词搜索、常见藻及浮游动物搜索、分类学搜索,快速获取与显微观察中未知藻形态相似的所有藻类、浮游动物,经图像、文字对比,
快速鉴定其分类学归属。
其中的一级形态搜索有:单细胞、多细胞群体、管状体、丝
状体、链状体、膜状体、网状体;二级形态搜索有:群体形态(不定型群体、球形/椭球形、平板片状、放射状/带状、盘状/星状、栅格/扇状、桃形/心形/多角形、囊状)、子细胞排列(有规律、无规律)、子细胞形态(球形、长形、其它形状)等。
其还包
含了对常见有毒藻、水华藻等的搜索特性。
具有浮游生物细胞的自动抠图特性,可快速提取其主边缘特征图像。
可自动测量
分析藻类色素的RGB构成;具有对模糊、重叠的浮游生物图像的清晰化处理特性。
8)各类统计分析数据可导出到EXCEL表,图像可保存。
注:本技术标书中打★款项必须响应,否则为重大偏离
建议选配:奥林巴斯BX53以上档次的三目生物显微镜来成像。
国家高新技术企业——杭州万深检测科技有限公司
杭州万深检测科技有限公司生产及销售自动考种仪,根系分析仪,浮游生物(藻类、浮游动物)智能鉴定计数仪,大米外观品质检测仪,自动菌落计数仪,抑菌圈测量仪,抗生素效价测定仪,叶面积仪,冠层仪,线序检测仪等仪器设备,更多详情请拨打联系电话或登录官网咨询。
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