亲和层析技术在生物科学中的应用及发展
免疫亲和层析 洗脱
免疫亲和层析洗脱免疫亲和层析洗脱（Immunoprecipitation Wash）免疫亲和层析洗脱是一种广泛应用于生物化学和分子生物学研究的技术，用于从复杂的混合物中富集和纯化感兴趣的蛋白质。
该方法基于抗体与特定抗原之间的高亲和力，能够高效地富集目标蛋白质，并去除其他非特异性结合的蛋白质。
一、原理免疫亲和层析洗脱的原理是通过结合目标蛋白质的抗体与具有亲和结合能力的固定基质相互作用，实现目标蛋白质的选择性富集。
免疫亲和层析的固定基质通常是具有高亲和力的抗体。
当样品中的目标蛋白质与固定在固定基质上的抗体结合时，非特异性蛋白质将被洗脱剂迅速冲洗掉，从而使目标蛋白质得到纯化。
二、实验步骤1. 制备固定基质：选择特异性的抗体，将抗体偶联在亲和基质上。
亲和基质可以是蛋白A/G，蛋白A/G结合的琼脂糖或其他具有高亲和力的基质。
2. 准备样品：样品可以是细胞裂解液、组织提取液、血清等含有目标蛋白质的混合物。
3. 加入固定基质：将制备好的固定基质与样品混合，使抗体与目标蛋白质结合。
4. 洗涤：用洗脱缓冲液反复洗涤固定基质，以去除非特异性结合的蛋白质和其他杂质。
5. 洗脱：用洗脱缓冲液洗脱目标蛋白质与抗体的结合，使目标蛋白质从固定基质上解离。
6. 分析：将洗脱得到的样品用于下游分析，如免疫印迹、质谱分析等。
三、优点和应用免疫亲和层析洗脱具有以下优点：1. 高亲和性：基于抗体与抗原之间的高亲和力，使得目标蛋白质能够高效结合和富集。
2. 特异性：通过选择性的抗体结合，能够将目标蛋白质从复杂的混合物中纯化，去除非特异性的蛋白质。
3. 灵活性：可以根据实验需求选择不同的抗体和固定基质，适应各种不同类型的目标蛋白质。
免疫亲和层析洗脱在生物化学和分子生物学研究中得到了广泛的应用，如：1. 蛋白质纯化：可用于从复杂的样品中富集纯化目标蛋白质，用于后续的研究和分析。
2. 蛋白质-蛋白质相互作用研究：通过免疫亲和层析洗脱的技术，可以富集与目标蛋白质相互作用的蛋白质，进一步研究蛋白质间的相互作用机制。
亲和层析的原理和应用
亲和层析的原理和应用1. 什么是亲和层析亲和层析（Affinity Chromatography）是一种分离和纯化生物分子的方法，利用分子间的亲和性相互作用进行分离。
亲和性相互作用是指生物分子之间的特定相互作用，如抗原与抗体、受体与配体、酶与底物等。
亲和层析常用于蛋白质、核酸和其他生物分子的富集、纯化和研究中。
2. 亲和层析的原理亲和层析的原理基于生物分子之间的亲和性相互作用。
在亲和层析中，通常将目标分子与具有亲和基团的小分子（称为配体）结合，然后将该配体固定在固定相上。
通过将样品溶液通过固定相，目标分子与配体之间的亲和性相互作用被利用，使目标分子与配体结合并留下，其他分子则通过固定相进行洗脱。
亲和层析的固定相可以选择多种形式，如亲和基团被共价结合在聚合物基质上，或者将亲和基团直接结合在固定相表面。
这样一来，亲和基团上的特定化学团可以与目标分子中的互补化学结构相互作用，从而实现目标分子的选择性捕获。
3. 亲和层析的应用3.1 蛋白质分离和纯化亲和层析广泛应用于蛋白质的富集和纯化过程。
通过将特定亲和基团固定在固定相上，可以实现特定蛋白质的选择性捕获。
例如，可以使用具有亲和基团的树脂对特定的酶、抗体或标签蛋白进行富集和纯化。
亲和层析可以通过调节洗脱条件来实现蛋白质的纯化，从而得到高纯度的蛋白质样品。
3.2 生物分子相互作用研究亲和层析可以用于研究生物分子之间的相互作用。
例如，可以使用亲和层析技术来探索蛋白质与配体之间的互作用机制，或者使用具有亲和基团的固定相来研究蛋白质与DNA或RNA之间的结合方式。
通过研究生物分子之间的相互作用，可以深入理解生物体内各种生物过程的机制。
3.3 药物筛选和研发亲和层析在药物筛选和研发过程中也有广泛应用。
通过使用亲和层析技术，可以筛选出与目标蛋白质特异性结合的小分子药物。
这种选择性结合可以用于评估药物与目标蛋白质之间的亲和性，从而帮助选择更有效的潜在药物候选物。
3.4 DNA/RNA纯化亲和层析也可以应用于DNA/RNA的纯化。
司美格鲁肽 亲和层析-概述说明以及解释
司美格鲁肽亲和层析-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述司美格鲁肽（simeprevir）是一种新型的直接作用抗病毒药物，属于NS3/4A蛋白酶抑制剂。
它在治疗丙型肝炎（HCV）感染方面具有很高的疗效，并已被许多国家批准用于临床使用。
随着丙型肝炎感染者人数的不断增加，司美格鲁肽作为一种治疗选择变得越来越重要。
本文将着重介绍司美格鲁肽的定义和特点，以及它在丙型肝炎治疗中的应用领域。
首先，将介绍司美格鲁肽的化学结构和作用机制，通过对其特点的分析，我们能够更好地理解它在病毒感染中的作用方式。
接着，我们将详细探讨司美格鲁肽在丙型肝炎治疗中的应用领域，包括其疗效评估、治疗方案以及与其他抗病毒药物的联合应用等方面。
最后，我们将总结司美格鲁肽的重要性，并展望其未来的发展前景。
通过本文的阅读，读者将对司美格鲁肽有一个全面的了解，包括其定义、特点和应用领域。
同时，我们也将探讨其在丙型肝炎治疗中的地位和作用，为临床医生提供一种有效的治疗选择。
与此同时，本文还将展望司美格鲁肽的未来发展，为科研人员和制药公司提供一些思路和启示。
相信通过对司美格鲁肽的深入研究，我们能够更好地理解和应用这一新型抗病毒药物，为丙型肝炎患者的治疗提供更好的选择和希望。
1.2文章结构文章结构部分的内容可以按照以下方式编写：在本文中，我们将按照以下结构展开论述。
首先，在引言部分，我们将对司美格鲁肽的概述进行介绍，并阐述文章的目的。
接下来，我们将在正文部分分为两个主要章节，分别是司美格鲁肽的定义和特点以及其在应用领域中的作用。
在定义和特点部分，我们将详细介绍司美格鲁肽的定义、结构和特性，并探讨其在生物医学领域中的重要性。
在应用领域部分，我们将探讨司美格鲁肽在治疗、研究和临床应用中的广泛应用。
最后，在结论部分，我们将总结司美格鲁肽的重要性和未来发展的前景。
通过这样的结构安排，我们希望全面而系统地介绍司美格鲁肽的亲和层析方法及其在科研和医学领域的应用。
亲和层析原理和方法
亲和层析原理和方法亲和层析是一种分析方法，通过利用物质之间的亲和性来分离和分析目标物质。
它基于物质之间的特异性亲和作用，通过将目标物质与具有亲和性的固相材料结合，实现目标物质的富集和分离。
亲和层析的原理是基于生物分子之间的亲和性。
在生物体内，许多分子之间存在着特定的亲和性相互作用。
例如，抗体与抗原之间的结合就是一种典型的亲和性相互作用。
利用这种亲和性原理，可以将含有特定抗原的样品与具有相应抗体的固相材料结合，然后通过洗脱的方式将目标物质从固相材料上分离出来。
亲和层析的方法包括亲和层析柱和亲和层析片。
亲和层析柱是将具有亲和性的固相材料填充在柱子中，样品通过柱子时，目标物质会与固相材料结合，非目标物质则通过柱子。
然后可以通过洗脱的方式将目标物质从固相材料上分离出来。
亲和层析片则是将具有亲和性的固相材料固定在薄膜上，样品与薄膜接触时，目标物质会与固相材料结合，非目标物质则被排除。
然后可以通过洗脱的方式将目标物质从薄膜上分离出来。
亲和层析方法具有许多优点。
首先，亲和层析可以选择性地富集目标物质，从而降低了样品中其他干扰物质的影响。
其次，亲和层析具有高灵敏度和高分辨率的特点，可以检测到低浓度的目标物质。
此外，亲和层析还具有快速、简单和可重复性的优点，适用于大规模的样品分析。
亲和层析在许多领域中得到了广泛的应用。
在生物医学领域，亲和层析可以用于分离和富集特定蛋白质或生物分子，以便进行后续的分析和研究。
在药物研发中，亲和层析可以用于筛选和分离具有特定药物靶点亲和性的化合物。
在环境监测和食品安全领域，亲和层析可以用于检测和分离目标污染物或有害物质。
亲和层析是一种基于亲和性相互作用的分析方法，通过选择性地富集和分离目标物质，实现了样品的准确分析。
亲和层析方法具有许多优点，并在各个领域中得到了广泛应用。
未来随着技术的不断发展，亲和层析方法将进一步完善和应用于更多的领域，为科学研究和工业生产提供更多的可能性。
亲和层析常用介质
亲和层析常用介质1. 概述亲和层析（Affinity Chromatography）是一种基于生物分子之间特异性相互作用原理的色谱技术。
在亲和层析过程中，通过将目标分子与具有特定亲和性的固定相结合，实现目标分子的富集、纯化和分离。
常用介质是亲和层析技术成功应用的关键之一。
本文将介绍亲和层析常用介质的分类、原理、特点以及应用领域等内容。
2. 分类根据固定相的类型，亲和层析常用介质可以分为以下几类：2.1 亲和配体固定相亲和配体固定相是最常见的一类介质，其原理是通过共价或非共价结合将具有特异性与目标分子结合的配体固定在固定相上。
常见的亲和配体包括抗体、蛋白质、核酸等。
这类介质广泛应用于生物大分子（如蛋白质）的纯化与富集。
2.2 金属离子螯合固定相金属离子螯合固定相是利用金属离子与目标分子之间的特异性配位作用实现分离纯化的介质。
常见的金属离子包括镍、铜、锌等。
这类介质在蛋白质纯化和金属离子富集等领域有着广泛应用。
2.3 亲和剂固定相亲和剂固定相是通过共价或非共价结合将具有特异性与目标分子结合的化合物固定在固定相上。
常见的亲和剂包括染料、亲和标记物等。
这类介质在小分子化合物富集与分离纯化中具有重要应用价值。
3. 原理与特点亲和层析介质的选择应根据目标分子的性质、亲和性以及实验条件等因素进行综合考虑。
不同类型的介质具有不同的原理和特点，下面将对常见的亲和层析介质进行简要介绍：3.1 亲和配体固定相•原理：通过共价或非共价结合将具有特异性与目标分子结合的配体固定在固定相上，实现目标分子的选择性富集和纯化。
•特点：具有较高的选择性和专一性，适用于蛋白质等大分子的富集与纯化。
3.2 金属离子螯合固定相•原理：利用金属离子与目标分子之间的特异性配位作用实现分离纯化，通过调节金属离子的种类和浓度可以实现对目标分子的选择性结合。
•特点：具有较高的亲和性和选择性，适用于金属离子富集和蛋白质等大分子的纯化。
3.3 亲和剂固定相•原理：通过共价或非共价结合将具有特异性与目标分子结合的化合物固定在固定相上，实现对目标分子的选择性富集。
亲和层析的原理及应用
亲和层析的原理及应用1. 什么是亲和层析？亲和层析是一种分离和纯化生物分子的技术方法。
它基于生物分子之间的特异性相互作用，例如抗原与抗体的结合。
亲和层析通过利用这种特异性相互作用，将目标分子从混合物中有效地分离出来。
亲和层析可以用于纯化蛋白质、分离细胞、筛选药物等多种应用。
2. 亲和层析的原理亲和层析的原理基于生物分子之间的相互作用。
在亲和层析中，通常使用的是一对具有特定相互作用的分子，例如抗原与抗体、配体与受体等。
这对分子中的一个部分被固定在固相介质上，而另一个部分则与目标分子发生特异性相互作用。
亲和层析的步骤包括：•预处理：选择适当的固相介质，并将其与特异性相互作用的分子配对。
固相介质可以是固定在柱子或颗粒上的化学物质。
•样品加载：将待分离的混合物样品加到预处理后的固相介质上。
目标分子与固相介质上的特异性配对分子发生结合。
•洗涤：用缓冲液将非特异性结合的物质洗掉，以减少背景噪音。
•洗脱：用特定的洗脱液冲洗固相介质，破坏特异性相互作用，使目标分子从固相介质上解离出来。
•收集纯化物：通过收集洗脱液中的目标分子来获取纯化物。
3. 亲和层析的应用亲和层析在生物科学研究和工业领域中得到了广泛的应用。
以下是亲和层析的一些常见应用：3.1 蛋白质纯化亲和层析可以用于纯化蛋白质。
通过将特异性配对的分子与待分离蛋白质结合，然后用洗脱液洗脱，可以将目标蛋白质从混合物中高效地纯化出来。
亲和层析在蛋白质研究和生物制药等领域具有重要的应用价值。
3.2 细胞分离亲和层析可以用于分离特定种类的细胞。
通过将细胞与特异性配对的分子结合，然后用洗脱液洗脱，可以将目标细胞从混合物中分离出来。
这在细胞学研究和细胞治疗等领域具有重要的应用价值。
3.3 药物筛选亲和层析可以用于筛选药物候选物。
通过将潜在药物分子与特异性配对的分子结合，然后用洗脱液洗脱，可以筛选出具有特定相互作用的药物候选物。
这在药物研发过程中有着重要的应用价值。
3.4 DNA/RNA纯化亲和层析也可以用于DNA/RNA的纯化。
亲和层析原理
亲和层析原理亲和层析原理是一种分子生物学技术，它可以通过结合蛋白质或其他大分子来识别、分离和分析样本中的分子。
亲和层析原理最初由罗伯特·霍夫曼开发，在20世纪70年代末和80年代初受到关注，并开始被广泛应用于生命科学研究。
它可以使用多种不同的技术，如普通吸附、替代吸附、抗原-抗体交互作用等，以提取样本中的蛋白质或其他大分子，从而为识别、分离和分析提供帮助。
亲和层析是一种十分有效的分离和分析技术，它的基本原理是利用亲和性来将目标分子从其他杂质分离出来，也就是说，它可以利用亲和性来增强分子之间的结合。
这一技术的基本步骤是将目标分子与一种能够与之结合的叫做“亲和剂”的物质结合起来，然后将其放置在一种叫做“层析介质”的专用介质中。
当亲和剂与目标分子结合时，所有其他不能与亲和剂结合的分子都会被隔离出来，而只留下与亲和剂结合的分子。
层析介质可以由具有亲和性的物质组成，以及能够提供分离支持的物质。
其中一种常用的层析介质是硅胶，它具有很强的亲和性，可以将目标分子从样品中分离出来。
亲和层析技术除了可以用来分离和分析样品中的特定分子外，还可以用来对样品进行浓缩、纯化和重新构建，以便进一步研究。
它还可以用来将蛋白质分解成单个活性部件，以及用于诊断、毒性学研究和其他科学研究。
亲和层析技术的最大优势在于它的精确性和效率。
它可以很快地将样品中的特定分子分离出来，而且可以获得比传统方法更高的精度。
它也可以省时、省力，因为它可以在较短的时间内获得更多的结果。
亲和层析技术的应用非常广泛，在医学研究、制药、食品安全检测、环境监测等领域都有应用。
它可以用来快速检测样品中的抗原，并鉴定出特定的抗体，以帮助识别某种疾病或其他特定情况。
亲和层析技术也可以用来研究病毒感染的机制，以及研究细胞内的分子机制，以帮助了解疾病的发展和治疗方法。
总之，亲和层析技术是一种非常有效的分子生物学技术，可以用来快速准确地分离、分析和浓缩样品中的分子，从而为研究和治疗疾病提供重要的信息。
ge亲和层析原理和方法
ge亲和层析原理和方法引言ge亲和层析（GE Affinity Chromatography）是一种常用的生物分离和纯化技术，广泛应用于蛋白质纯化和分析等领域。
本文将介绍ge亲和层析的原理和方法，并探讨其在生物科学研究中的应用。
一、ge亲和层析原理ge亲和层析原理基于生物分子之间的特异性相互作用，利用目标分子与特定配体之间的亲和力实现分离。
亲和层析的核心在于选择合适的配体，使其与目标分子具有高度的亲和力。
常用的配体包括抗体、金属离子、亲和标签等。
二、ge亲和层析方法1. 列层析法列层析法是ge亲和层析的常用方法之一。
将配体固定在层析柱上，将混合物（包括目标分子和其他杂质）加入柱上，通过洗脱等步骤实现目标分子的分离和纯化。
此方法操作简单、适用于大规模制备。
2. 批次层析法批次层析法是ge亲和层析的另一种常用方法。
将配体固定在固相材料上，将混合物与固相材料混合搅拌，通过洗脱等步骤实现目标分子的分离和纯化。
此方法适用于小规模制备和快速分离。
三、ge亲和层析的应用1. 蛋白质纯化ge亲和层析广泛应用于蛋白质的纯化。
通过选择合适的配体，可以实现对目标蛋白质的高效分离和纯化，提高纯化效率和纯度。
2. 抗体结合分析ge亲和层析可用于抗体结合分析，通过配体选择性地捕获目标抗体，实现对抗体结合特性的研究。
这对于药物研发和免疫学研究具有重要意义。
3. 蛋白质相互作用研究ge亲和层析还可用于研究蛋白质的相互作用。
通过将不同的配体固定在柱上，可以捕获目标蛋白质的结合伴侣，进一步揭示蛋白质相互作用网络。
4. 基因工程和生物药物制备ge亲和层析在基因工程和生物药物制备中有广泛应用。
通过选择合适的配体，可以实现对表达蛋白质的纯化和分离，提高生物药物的纯度和质量。
结论ge亲和层析是一种重要的生物分离和纯化技术，通过选择合适的配体和方法，可以实现对目标分子的高效分离和纯化。
它在蛋白质纯化、抗体结合分析、蛋白质相互作用研究以及基因工程和生物药物制备等领域具有广泛的应用前景。
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亲和层析技术在生物科学中的应用及发展摘要：近几十年来，亲和层析技术发展十分迅速，广泛应用于生物分子(如结合蛋白、酶、抑制剂、抗原、抗体、激素、激素受体、糖蛋白、核酸及多糖类等)及组织(如细胞、细胞器、病毒等)的分离和纯化，是蛋白质组学研究中重要的技术之一。
介绍了亲和层析的基本类型及配体合成的研究进展，概述了亲和层析技术在蛋白质组学以及在其他方面的应用和发展动态。
关键词：亲和层析；基本原理；类型；应用亲和层析(amnitychromaloSraphy)是利用偶联亲和配体的亲和吸附介质为固定相亲和吸附目标产物，使目标产物得到分离纯化的液相层析法，近几十年来，亲和层析技术发展十分迅速，并在生物技术产品、生物分子及组织的分离和纯化领域取得令人瞩目的成就。
现已广泛用于分离纯化蛋白质、肽、酶及其底物和抑制剂、抗体及抗原、核酸及其特异性作用物、激素及受体、细胞及细胞表面物等等”。
基于此，本文针对亲和层析的基本类型，配体的选择和亲和层析在生物学特别是蛋白质组学中的应用等方面作一介绍。
1 亲和层析的类型亲和层析柱中被固定的配体是决定亲和层析成功的关键因素。
根据配体与生物大分子之间相互作用体系不同，可以把亲和层析分为以下4种类型。
1．1 生物亲和层析(BAFC)生物亲和层析是利用自然界中存在的生物特异性相互作用物质对的亲和层析。
通常具有高的选择性。
典型的物质对有酶-底物、酶-抑制剂、激素—受体等。
1．2 免疫亲和层析(1AFC)利用抗原抗体中的一方为配体，亲和吸附另一方的分离系统，称免疫亲和层析，免疫亲和层析应用相当广泛，许多典型的亲和层析纯化蛋白质的过程已经使用了单克隆抗体作为亲和配体，目前，利用抗体－抗原模式，有可能得到每一种目标蛋白的单抗，然后以单抗为配基，通过亲和层析技术分离纯化目标蛋白质。
此种方法的纯化倍数活性回收率非常高。
蛋白A和蛋白C作为抗体结合蛋白已被应用于免疫亲和层析技术，是分析人类免疫球蛋白，特别是IgG—类抗体的很好的免疫亲和层析的配体。
用免疫层析柱进行各种类型的免疫检测被称为免疫检测法，特别适用于检测含量低微的样品。
免疫检测法利用被标记的抗体或模拟分析物来进行间接的被分析物的分析。
常用标记如酶标记、荧光标记、化学荧光等。
1.3 金属离子亲和层析(IMAC）金属离子亲和层析是利用金属离子的络合物或形成整合物的能力吸附蛋白质的分离系统。
目的蛋白质表面暴露的供电子氨基酸残基，如组氨酸的咪唑基，半胱氨酸的巯基和色氨酸的吲哚基，十分有利于蛋白质与固定化金属离子结合，这是IMAC用于蛋白质分离纯化的根据。
金属离子如锌和铜，已发现能很好地与组氨酸的咪唑基及半胱氨酸的巯基结合。
含有不同数量的这些基团的蛋白质可以通过金属离子亲和层析得到分离。
1.4 拟生物亲和层析(BiomimeticAFC)拟生物亲和层析是利用部分分子相互作用，模拟生物分子结构或某特定部位。
以人工合成的配基为固定相吸附目的蛋白质的亲和层析，如以染料亲和层析(DAFC)和氨基酸(包括多肽亲和层析(AALA)。
染料配基，例如三嗪(triazine)或三苯甲烷化合物，能通过共价键牢固地结合到亲和载体上，染料配体与很多蛋白以及酶的活性位点相互作用，以模仿这些生物分子的底物、辅助因子或结合剂的形式进行。
2 亲和层析配体的设计以及应用组合方法筛选配体亲和层析是一种非常有效的大规模纯化生物技术产品的分级分离技术并已广泛应用于蛋白质组学和其他领域的研究。
尽管其具有很大潜力，但针对每个目标是否能得到适当的配体，亲和层析方法的利用是受到限制的。
近年来发展的利用分子模型对配体进行设计和组合化学相结合已经成为一种为特定生物技术需求产生新颖而特异性强的配体的创新方法。
2．1 亲和层析配体的设计依据蛋白结构设计配体：理性设计配体的策略包括从合适的数据库获取关于目标蛋白结构信息并确定蛋白上可能的结合位点。
目标位点可能是一活性位点、裸露于溶剂的区域或是参与同一中性互补配体相结合的部位。
依据蛋白结构设计配体要考虑两个重要因素：第一，正确地预计被设计的配体构像的能力；第二，正确预计配体的亲和力的能力。
一些成功地利用蛋白设计配体的方法已报道。
例如，针对L-乳酸脱氢酶而设计的蒽醌模仿生物的染料—配体。
依据蛋白功能设计配体：当目标蛋白的三维结构未知的时候，可依据蛋白的功能对配体进行设计，并依赖于考虑配体一定的结构特征。
归纳如下：1)符合一定要求的分子的形状。
例如，线形带负电荷的分子肝磷脂对于纯化DNA－结合酶是一种常规方法，另外纯化核苷酸结合酶的配体三嗪染料CibacronBlue 3GAca具备能与一些酶的核苷酸结合位点形成合适的相互作用所需的几何结构以及离子和疏水性的基团。
2)配体具特异功能团。
例如苯甲脒作为胰蛋白酶类蛋白酶的配体，羟氨基酸作为与金属结合的蛋白的配体。
3)两个或数个已知的底物、抑制剂、效应体或辅助因子这样的结构模体的结合体衍生的结构模型。
例如酮—羧基仿生物嵌合染料-配体被设计作为纯化识别(酮)羧基的酶的配体。
2.2 组合方法筛选配体应用组合化学的方法建立多肽文库，然后利用多肽文库来筛选与目的蛋白特异性结合的多肽配基，这一观点的提出大大促进了亲和层析筛选及合成配基技术的发展。
过去的十几年中已出现了允许产生多达10种不同的蛋白，肽链或核酸文库的方法。
这样的大文库使选择高亲和性和特异性的分子成为可能。
在寻找配体时可应用两个策略。
首先，筛选能与各种类型大文库中的生物分子相结合的目标物，然后引进一个设计的方法来缩小被引导的文库的大小规模。
这个被采纳的方法主要取决于一开始时我们有什么信息，如果有被分析物的结构的信息，设计配体就有可能；然而如果没有这样的信息，组合方法来筛选配体可能是唯一的途径，从第一代文库获得的结合分子能被用做母体支架产生另外的新文库，从这种新的文库中可筛选出更高活性的结合物配体。
已有报道从(多)肽，多核苷酸以及替代的三嗪类化合物文库中筛选亲和配体的组合方法的应用。
2．2，1 合成的肽文库合成的肽文库是随机肽分子的集合体，包含给定肽链长度所有可能的顺序。
用固相肽合成方法化学合成肽分子。
合成好的肽可从可溶性的肽文库断裂开或者保留在一个小珠一种结构的肽文库的树脂上。
一个基本的体外筛选组合化学文库方法是让文库中的混合物流经一待测定蛋白已被固定在其表面的通路。
具备与固定在表面的蛋白分子有亲和性的配体是那些在它们通道上受到阻力的肽，它们通常是亲和层析配体很好的候选物。
用这样的方法，具备F-L-L-V-P-L顺序的肽配体己被合成并用于人类纤维蛋白原的纯化。
2.2.2 噬菌体展示(phagedisplay)噬菌体展示已经迅速成熟并演变成为亲和层析发现高亲和性配体的工具。
这一技术是在一称为生物淘洗的筛选过程中依据利用噬菌体展示文库来快速鉴定高选择性的配体，以噬菌体展示得出的肽用亲和方法选择可用两种方式进行。
文库可直接用被固定的目标培养或者在被固定到固体支撑物以前用目标预培养，如同亲和层析一样，相互作用的肽或蛋白特异地或非特异地洗脱出。
这些相互作用的噬菌体可用细菌感染来放大以增加它们的拷贝数。
这个筛选／放大过程可多次重复以获得较高亲和性的噬菌体展示肽。
期望的顺序可通过对被分离出的噬菌体DNA顺序测序获得。
噬菌体展示文库已经成功应用于抗原决定基定位，发展疫苗，鉴定蛋白激酶底物，具生物活性的肽以及非肽配体的肽模拟，并且很适合作为色谱分析的亲和配体来源。
蛋白A的免疫球蛋白结合的结构域已被展示在噬菌体的表面，使筛选具改进的特异性或温和的洗脱条件的蛋白A 变异体亲和层析条件成为可能。
Gaskin等人描述了利用展示在细丝状噬菌体M13表面的7氨基酸肽文库作为根毛霉脂肪酶(Rhizomucormiehei lipase)可能的亲和配体来源。
2．2．3 核糖体展示和SELEX进行的亲和选择核糖体展示特别适合于扫描和筛选折叠的蛋白，原理总结如下：首先一DNA文库被转录成mRNA，该mRNA在体外被翻译，由于缺乏一休止符，阻止了mRNA和肽从核糖体中释放出来，在适当的条件下形成一稳定的三元体复合物。
该复合物然后暴露于固定在一表面的目标分子。
如果肽与目标以充分的亲和力相结合，复合物就保留了，低亲和性的肽被洗脱掉，粘附着的核糖体三元复合物可被EDTA解离，mRNA再反转录成cDNA并可由PCR扩增强度．指数浓缩法系统发展配体(SELEX)被广泛应用于筛选核酸配体，体外筛选已被用来针对目标确定核酸配体，这些目标覆盖广泛的体积大小，并包含简单离子，肽链，蛋白，细胞器官，病毒，甚至整个细胞。
合成的化学配体在蛋白层析中的作用在过去的几十年的应用中已经非常实在，离子交换，疏水性的和金属螯合的吸附剂一起构成一种固定在基质骨架上的确定的、超级稳定和没有毒性的人工合成功能体，并与蛋白表面带电荷、非极性或金属结合的群体发生亲和作用。
例如，组合化学技术正开始对发现和设计新的融合肽金属配体发生较大影响。
2．3 从头设计配体由于能将X射线晶体学，NMR或同源结构的知识与限定的或组合化学合成以及先进的计算机技术相结合，合理设计亲和配体变得更切实可行，有效，符合逻辑且更快，这种方法依赖于利用目标蛋白的结构信息有目的地集中引导配体的合成并使合成的努力限定朝向已经过实验评价能结合到被检测目标或预计能结合到目标的方向。
该方法包括以下的步骤：选择目标蛋白上合适的位点，设计与该位点的三维结构相配伍的配体，合成一个结构上相关联的固相的组合配体文库，并针对目标蛋白扫描这个文库。
针对IgG的非肽仿生物配体已经建立，它是依据蛋白A的B结构域和lgG的Fc片段组成的复合物的X射线晶体学结构获得的。
利用计算机协助的分子模型，一系列围绕蛋白A双肽Phel32-Tyrl33的仿生物分子被设计出。
其中一个这样的配体能与人类IgG结合，该配体在三嗪环上带有3－氨基苯酚和4－氨基-l-萘酚部分，当这个仿生物配体被固定到琼脂糖上被成功地用于纯化人类血浆的IgG。
为重组胰岛素前体M131以及重组人类凝固因子Vllar351等而设计的仿生物学配体的类似方法也已建立。
3 亲和层析的应用3．1 亲和层析在蛋白质组学中的应用蛋白质组学最常用的实验技术是用于分离蛋白的双相电泳(2—DE)和用于鉴定被分离蛋白的质谱(MS)技术。
然而亲和层析也是起很大作用的分离方法．蛋白被2-DE分离之前，亲和层析主要被用作选择性地预先浓缩和预处理样品。
其应用包括去除一种或一类会干扰2—DE的分辨率的蛋白，一个典型的例子是血清及脑脊髓液样品的白蛋白和免疫球蛋白IgG的去除，是通过吸附在亲和树脂上的方法进行的，这样可显著提高2-DE胶上蛋白斑点的分辨率，另外，亲和层析可浓缩低丰度的蛋白，这样它们就可在2-DE胶上被看到；还可将所有蛋白分类成两组或几组以便进一步分析。