常用基因诊断技术

合集下载

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:临床常用基因突变及融合基因检查方法随着基因组学和分子生物学的发展,基因检测技术在临床诊断中的应用日益广泛。

基因突变和融合基因是许多疾病的发生和发展的关键因素,因此对其检测越来越受到重视。

本文将介绍一些临床常用的基因突变及融合基因检查方法,希望能够帮助读者更深入了解这一领域的知识。

1. PCR技术PCR技术是一种常用的基因检测方法,通过扩增特定基因片段,可以检测到基因的突变。

PCR技术具有高灵敏度和高特异性的优点,可以快速、准确地检测基因突变。

在临床诊断中,PCR技术经常用于检测与疾病相关的基因突变,如遗传性疾病、肿瘤等。

2. 高通量测序技术高通量测序技术是目前最流行的基因检测技术之一,可以同时测序大量基因,并快速高效地识别突变。

高通量测序技术具有高灵敏度、高准确性和高通量的优点,可以帮助医生更准确地诊断疾病,并指导个体化治疗方案的制定。

3. 质谱技术质谱技术是一种基于质量-电荷比的物质分析技术,可以用于检测DNA、RNA等生物分子。

质谱技术具有高灵敏度、高分辨率和高准确性的优点,可以用于检测基因突变、基因表达水平等,对于肿瘤的早期诊断和治疗、药物敏感性的评估等方面具有重要的意义。

1. FISH技术FISH技术是一种常用的融合基因检测方法,通过用荧光染料标记特定基因,可以直接观察到基因的融合情况。

FISH技术具有高分辨率、高灵敏度和高特异性的优点,可以帮助医生准确诊断某些特定的融合基因相关的疾病,如慢性髓性白血病、胃肠道间质瘤等。

在临床实践中,基因突变和融合基因的检测对于疾病诊断、治疗和预后评估具有重要的意义。

随着基因检测技术的不断发展和完善,相信在未来会有更多更高效、更精准的检测方法出现,为临床诊断和治疗带来更多的帮助和改善。

希望本文能为读者对基因突变及融合基因检查方法有更深入的了解和认识。

第二篇示例:临床常用基因突变及融合基因检查方法基因突变是指基因组中的某个基因发生了突变,使其序列发生了改变,导致基因的功能发生变化或失去功能。

几种常见的基因测序技术的优缺点及应用

几种常见的基因测序技术的优缺点及应用

几种常见的基因测序技术的优缺点及应用发布时间:2014-07-19 来源:毕业论文网随着人类基因组计划的完成,人类对自身遗传信息的了解和掌握有了前所未有的进步。

与此同时,分子水平的基因检测技术平台不断发展和完善,使得基因检测技术得到了迅猛发展,基因检测效率不断提高。

从最初第一代以 Sanger 测序为代表的直接检测技术和以连锁分析为代表的间接测序技术,到 2005 年,以 Illumina 公司的 Solexa技术和 ABI 公司的 SOLiD 技术为标志的新一代测序 (next-generation sequencing,NGS) 的相继出现,测序效率明显提升,时间明显缩短,费用明显降低,基因检测手段有了革命性的变化。

其技术正向着大规模、工业化的方向发展,极大地提高了基因检测的检出率,并扩展了疾病在基因水平的研究范围。

2009 年 3 月,约翰霍普金斯大学的研究人员在《Science》杂志上发表了通过 NGS外显子测序技术,发现了一个新的遗传性胰腺癌的致病基因 PALB2,标志着 NGS 测序技术成功应用于致病基因的鉴定研究。

同年,《Nature》发表了采用 NGS 技术发现罕见弗里曼谢尔登综合征MYH3 致病基因突变和《Nat Genet》发表了遗传疾病米勒综合征致病基因。

此后,通过 NGS 技术,与遗传相关的致病基因不断被发现,NGS 技术已成为里程碑式的进步。

2010 年,《Science》杂志将这一技术评选为当年“十大科学进展”。

近两年,基因检测成为临床诊断和科学研究的热点,得到了突飞猛进和日新月异的发展,越来越多的临床和科研成果不断涌现出来。

同时,基因检测已经从单一的遗传疾病专业范畴扩展到复杂疾病和个体化应用更加广阔的领域,其临床检测范围包括高危疾病的新生儿筛查、遗传疾病的诊断和基因携带的检测以及基因药物检测用于指导个体化用药剂量、选择和药物反应等诸多方面的研究。

目前,基因检测在临床诊断和医学研究的应用正越来越受到医生的普遍重视和引起研究人员的极大的兴趣。

基因诊断

基因诊断

RFLP分析法 限制酶酶切图谱直接分析法 RFLP间接分析法
(1)限制酶酶切图谱直接分析法
① 限制酶酶切—Southern印迹杂交。 ② PCR—限制酶酶切
应用RFLP诊断镰刀状红细胞性贫血
正常人珠蛋白基因
正常人珠蛋白mRNA 6 CTC GAG Glu 6 CAC
正常人珠蛋白肽链
HbS的珠蛋白基因
HbS的珠蛋白mRNA
HbS的珠蛋白肽链
GUG Val
MstⅡ酶切位点 CCTNAGG A T替换
MstⅡ酶 CCTNTGG
HbA ---------CCT GAG GAG-------
MstⅡ 1.1kb
HbS
MstⅡMstⅡ 0.2kb
---------CCT GTG GAG-------
• 2、聚合酶链反应的发明 • 直到1985年,美国PE-Cetus公司的人类遗传研究室 Mullis等人才发明了具有划时代意义的聚合酶链反应 (Polymerase Chain Reaction, PCR), 使人们梦寐以求的体外 无限扩增核酸片段的愿望成为现实。其原理类似于DNA 的体内 复制,只是在试管中给DNA的体外合成提供一种 合适条件。开始是使用大肠杆菌 DNA聚合酶Klenow片段 来扩增人基因组中的特异片段。由于该酶不耐热,因此, 每次 加热变性DNA后都要重新补加Klenow酶。在操作多 份标本时,这一过程耗时,费力, 且易出错。耐热DNA 聚合酶的应用使得PCR反应更易于自动化,继而PE-Cetus 公司推 出了第一台PCR热循环仪,使该技术的自动化成 为现实。Mullis等因此项技术于1993年 获得诺贝尔奖金。
第一节
基因诊断 的技术方法
一、基因诊断中常用的分子生物 学技术 (一)核酸分子杂交 (二)聚合酶链反应(PCR) (三)单链构象多态性检测 (四)限制酶酶谱分析 (五)DNA序列测定 (六)DNA芯片技术

基因检测方法汇总

基因检测方法汇总

基因检测方法汇总全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:基因检测方法是一种用来检测个体基因组中特定基因的技术手段,它可以帮助人们了解自己的遗传信息,预防遗传疾病,选择适合自己的生活方式和药物治疗方案。

随着基因检测技术的不断发展和普及,越来越多的人开始关注和使用基因检测服务。

本文将介绍一些常见的基因检测方法,帮助读者了解各种基因检测技术的原理和应用。

1. PCR技术PCR全称为聚合酶链式反应,是一种用于扩增特定DNA片段的技术。

PCR技术通过双链DNA模板的热变性、引物的特异性结合和DNA聚合酶的链式合成,扩增目标DNA序列。

PCR技术广泛应用于基因检测、基因克隆、DNA测序等领域,是基因检测中常用的方法之一。

2. 基因测序技术基因测序是指对DNA序列进行测定和分析的技术。

目前常用的基因测序技术包括Sanger测序和高通量测序。

Sanger测序是第一代测序技术,通过DNA聚合酶合成互补链和标记测序,实现DNA序列的测定。

高通量测序技术包括Illumina测序、Ion Torrent测序、PacBio测序等,具有快速、高通量、低成本等优势,广泛应用于基因鉴定、癌症基因检测、遗传病诊断等领域。

3. 基因芯片技术基因芯片是一种高通量的基因检测技术,通过固定在芯片上的成千上万的核苷酸序列探针,检测样本中的基因表达水平、基因型和基因变异信息。

基因芯片技术广泛应用于基因表达谱分析、芯片杂交、基因组关联研究等领域,是一种快速、高通量、高效的基因检测方法。

4. 基因组学技术基因组学是研究生命体基因组结构、功能和演化的学科领域,包括基因组测序、基因组比较、基因组映射等技术。

基因组学技术广泛应用于基因组编辑、蛋白质组学、疾病基因探索等领域,为基因检测提供了更深入的理解和解决方案。

5. 单细胞技术单细胞技术是一种用于检测单个细胞基因表达水平、基因型和细胞功能的技术。

单细胞技术包括单细胞测序、单细胞小分子检测、单细胞蛋白质检测等,能够深入了解细胞异质性、突变信息和细胞功能等特性,为个体化医疗和疾病诊断提供了更精准的信息。

常用遗传病诊断的基本方法

常用遗传病诊断的基本方法

常用遗传病诊断的基本方法
1. 家族病史调查:了解患者家族中是否有同样的疾病或先天畸形的病例。

家族病史调查可以帮助确定疾病是否具有遗传性以及可能的遗传模式。

2. 临床表型分析:通过对患者的症状、体格检查以及其他相关实验室检测结果的分析,确定患者的临床表型特征。

临床表型分析可以帮助确定疾病的具体类型。

3. 分子遗传学检测:通过对患者的DNA进行分子遗传学检测,寻找可能存在的基因突变或有关的DNA变异。

分子遗传学检
测包括常见的PCR、Sanger测序以及新兴的基因组测序技术。

4. 染色体分析:对患者的染色体进行分析,检测是否存在染色体结构异常、染色体数目异常或染色体颗粒等异常情况。

染色体分析可用于检测染色体遗传性疾病,例如唐氏综合征等。

5. 蛋白质功能分析:通过对患者RNA和蛋白质水平的检测,
分析基因突变对蛋白质功能的影响。

蛋白质功能分析可以进一步确定基因突变对疾病的影响机制。

6. 基因组学研究:利用高通量测序技术对患者整个基因组的序列进行测定,并进行相关的生物信息学分析,寻找可能存在的致病突变。

基因组学研究可用于对罕见遗传病的诊断和研究。

综上所述,通过家族病史调查、临床表型分析、分子遗传学检
测、染色体分析、蛋白质功能分析和基因组学研究等多种方法的综合应用,可以帮助医生进行遗传病的诊断和鉴定。

与pcr技术相关的基因诊断的方法

与pcr技术相关的基因诊断的方法

与pcr技术相关的基因诊断的方法
基因诊断中使用的PCR技术主要有以下几种:
1. 聚合酶链式反应(PCR):以所需扩增的基因组DNA为模板,进行PCR 反应。

经扩增的DNA片段,通过电泳分离和染色后,可直接在所显示的带谱上进行诊断。

2. 逆转录PCR:用提取的mRNA或总RNA(含mRNA)为模板,逆转录成cDNA后,再扩增cDNA。

3. 原位PCR:不需提取DNA/RNA,直接用组织切片和细胞进行PCR或RT-PCR反应。

4. 多重PCR:在一次PCR反应中加入多对引物,同时扩增DNA链上的不同序列段。

扩增产物经琼脂糖电泳和染色,即可直接在所显示的带谱上进行诊断。

5. 荧光定量PCR:一种实时监控核酸扩增的技术,在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的变化对PCR过程进行实时监控,以此实现对初始模板的定量分析。

6. PCR-SSCP:不同的单链DNA有不同的空间构象,即单链构象多态性。

这种不同构象的单链DNA在中性聚丙烯酰胺凝胶电泳中的迁移率不同,突变所引起的DNA构象差异将表现为电泳带位置的差异,从而可据之作出诊断。

以上是基因诊断中与PCR技术相关的部分方法,如需获取更多信息,建议咨询专业人士或查阅相关文献资料。

基因诊断的基本技术

基因诊断的基本技术

基因诊断的基本技术
基因诊断是通过检测个体的遗传物质(DNA或RNA)来确定其患有某种疾病或携带某种遗传变异的技术。

以下是基因诊断的一些基本技术:
1. 多态性分析:多态性是指人群中存在的基因序列差异,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失多态性等。

通过多态性分析,可以检测个体是否携带特定基因变异,并与相关疾病进行关联分析。

2. 基因测序:基因测序技术可以准确地测定个体的基因组序列。

通过对比个体基因序列与已知疾病相关基因序列的差异,可以确定患者是否存在致病突变。

3. 荧光原位杂交(FISH):FISH是一种常用的细胞遗传学技术,可以检测染色体结构异常和染色体数目异常。

该技术利用特定标记的探针与目标序列结合,通过荧光显微镜观察来确定是否存在染色体异常。

4. 聚合酶链反应(PCR):PCR是一种快速扩增特定DNA片段的技术。

在基因诊断中,PCR可以用于扩增患者样本中的特定基因区域,以便进行后续分析,如测序或突变检测。

5. 基因芯片(Microarray):基因芯片是一种高通量平行分析技术,可以同时检测数千个基因的表达水平或基因组变异。

通过与正常样本对比,可以发现与疾病相关的基因表达异常或拷贝数变异。

这些技术在基因诊断中起着重要作用,能够帮助医生和研究人员准确地确定个体的遗传状态和与疾病相关的遗传变异。

1。

第九章基因功能研究常用方法

第九章基因功能研究常用方法

第九章基因功能研究常用方法基因功能研究是生物学研究中的重要部分,通过研究基因的功能和表达方式,可以揭示基因在生物体发育、生长和疾病发生等方面的关键作用。

为了实现对基因功能的深入了解,科学家们发展了各种基因功能研究的方法。

以下将介绍一些常用的基因功能研究方法。

1. 基因敲除(Knockout):这是一种研究基因功能的重要方法。

通过CRISPR/Cas9等技术将目标基因的部分或全部序列剔除,使其无法表达,观察敲除后的生物体表现出的表型变化。

这种方法可用于验证基因的功能,发现其在生物体中的作用。

2. 基因突变(Mutation):通过诱发基因突变或筛选已有基因突变体,研究基因的功能和表达方式。

其中,随机突变(例如化学物质诱变)和目标突变方法(例如诱导突变)是常用的策略。

研究基因突变体可以揭示基因对于生物体正常发育和功能的影响。

3. 基因过表达(Gene Overexpression):通过将目标基因插入表达载体并导入生物体,使基因在生物体中过度表达。

观察过度表达基因后生物体的表型变化,可以了解基因过度表达对生物体的影响。

此外,过度表达基因还可用于验证一些基因在特定条件下的功能和路径。

4. 基因沉默(Gene Silencing):通过RNA干扰(RNAi)或转座子的反义RNA,使目标基因的转录或翻译过程受到阻碍。

基因沉默可用来研究基因造成的表型变化以及调控基因的功能。

5. 基因共表达(Gene Co-expression):通过分析大规模基因表达数据,探索基因间的共表达关系。

通过比较共表达基因的功能和通路,可以发现基因的相互关联及其在生物体中的功能。

6. 基因互作(Gene Interaction):通过分析基因间的物理相互作用和遗传相互作用关系,了解基因在调控和相互影响方面的作用。

这种方法对于揭示基因网络调控和疾病发生机制很有帮助。

7. 基因转移(Gene Transfer):将外源基因导入目标细胞或生物体,以研究基因功能和转录调控。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

五、单链构象多态性诊断法
链构象多态性(signle strand conformation polymorphism,SSCP)是指单链DNA由于碱基序列的不同 可引起构象差异,这种差异将造成相同或相近长度的单 链DNA电泳迁移率不同,从而可用于DNA中单个碱基 的替代、微小的缺失或手稿的检测。用SSCP法检查基 因突变时,通常在疑有突变的DNA片段附近设计一对引 物进行PCR扩增,然后将扩增物用甲酰胺等变性,并在 聚丙烯酰胺凝胶中电泳,突变所引起的DNA构象差异将 表现为电泳带位置的差异,从而可据之作出诊断。 PCR-SSCP法具有能快速、灵敏地检测有无点突变或多 态性的优点,但如欲阐明突变的碱基性质,则需作序列 分析
四、等位基因的特异寡核苷酸 探针诊断法

当基因的突变部位和性质已完全明了时,可以合成等基因特异的 寡核苷酸探针(allele-specific oligonucleotide,ASO)用同位素或非同 位素标记进行诊断。探针通常为长20bp左右的核苷酸。用于探测 点突变时一般需要合成两种探针,一种与正常基因序列完全一致, 能与之稳定地杂交,但不能与突变基因序列杂交;另一种与突变 基因序列一致,能与突变基因序列稳定杂交,但不能与正常基因 序列稳定杂交,这样,就可以把只有一个碱基发生了突变的基因 区别开来. PCR可结合ASO,即PCR-ASO技术,即先将含有突变点的基因有 关片段进行体外扩增,然后再与ASO探针作点杂交,这样大大简 化了方法,节约了时间,而且只要极少量的基因组DNA就可进行。
图13-6 Southern印迹杂交示意图
二、聚合酶反应

首先应按照欲检测的DNA的5’和3’端的碱基顺序各合成一段长约 17-20余个碱基的寡核苷酸作为引物(primer),其次是将待检测的 DNA变性后,加入四种单核苷酸(dNTP)、引物和耐热聚合酶。在 较低的温度,引物将与待扩增的DNA链复性结合,然后的聚合酶 的作用下,利用溶液中的核苷酸原料,不断延伸合成新互补链, 这样,一条DNA双链就变成了两条双链。若继续按照变性(9295℃)→复性(40-60℃)→引物延伸(65-72℃)的顺序循环20至40个 周期,就可以得到大量的DNA片段。理论上循环20周期可使 DNA扩增2n,即100余万倍。PCR反应特异性强,灵敏度高,极 微量的DNA即可作为扩增的模板得到大量的扩增片段。毛发、血 痕,甚至单个细胞的DNA即可供PCR扩增之用。因此它用于病原 体DNA的检查、肿瘤残留细胞的检出、罪犯或个体遗传物质的鉴 定以及遗传病的基因诊断等。

常用基因诊断技术
一、Southern印迹法 (Southern blot)

基本原理是:硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强, 当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压 上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的 单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置 保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的DNA,将原位地固定于 膜上。当含有特定基因片段已原位转移到膜上后,即可与同位素 标记了的探针进行杂交,并将杂交的信号显示出来。杂交通常在 塑料袋中进行,袋内放置上述杂交滤膜,加入含有变性后探针的 杂交溶液后,在一定温度下让单链探针DNA与固定于膜上的单链 基因DNA分子按碱基到互补原理充分结合。结合是特异的,例如 只有β珠蛋白基因DNA才能结合上β珠蛋白的探针。杂交后,洗去 膜上的未组合的探针,将Ⅹ线胶片覆于膜上,在暗盒中日光进行 放射自显影。结合了同位素标记探针的DNA片段所在部位将显示 黑色的杂交带,基因的缺失或突变则可能导致带的缺失或位置改 变。
三、扩增片段长度多态性

小卫星DNA和微卫星DNA的长度多态性 可以通过PCR扩增后电泳来检出,并用 于致病基因的连锁分析,这种诊断方法 称为扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,Amp-FLP) 连锁分析法。PCR扩增后,产物即等位 片段之间的差别有时只有几个核苷酸, 故需用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离鉴定。 此法多用于突变性质不明的连锁分析.
相关文档
最新文档