糖多孢菌属的多相分类
微生物分类章名词解释
一、名词解释1. 微生物分类学microbial taxonomy 研究微生物分类理论和技术方法的学科称为微生物分类学。
2. 分类classification 分类是根据一定的原则（表型特征相似性或系统发育相关性）对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。
3. 命名nomenclature 命名是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称。
4. 鉴定identification 指借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、新发现的或未明确分类地位微生物所应归属分类群的过程。
5. 分类单元taxon, 复数taxa 是指具体的分类群，如原核生物界（Procaryotae）、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）、枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）等都分别代表一个分类单元。
6. 种species 种是生物分类中基本的分类单元和分类等级。
微生物的种可以看作是：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其他类群的菌株有很明显的区别。
7. 属genus 是介于种（或亚种）与科之间的分类等级，也是生物分类中的基本分类单元。
通常是把具有某些共同特征或密切相关的种归为一个高一级的分类单元，称之属。
8. 居群population 是指一定空间中同种个体的总和。
每一个物种早自然界中的存在，都有一定的空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元，这些群体单元就称居群。
9. 亚种subspecies, subsp., ssp. 当某一工人种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元称为亚种。
亚种是正式分类单元中地位最低的分类等级。
10. 变种variety 变种是亚种的同义词。
在《国际细菌命名法规》（1976年修订本）发表以前，变种是种的亚等级，因“变种”一词易引起词义上的混淆，1976年后，细菌种的亚等级一律采用亚种，而不再使用变种。
PCR技术在乳酸菌分类鉴定中的应用
PCR技术在乳酸菌分类鉴定中的应用王庭柱，高学军，杨振宇东北农业大学教育部乳品科学重点实验室（150030）E-mail：wangtingzhu1980@摘要：近年来，随着分子生物学和生物信息学的迅速发展，特别是作为生物技术里程碑的PCR技术以及核酸测序和电泳技术的不断改进与完善，产生了许多新的分类学方法，如RAPD、PCR-RFLP、T-RFLP、ARDRA、PCR-SSCP、PCR-DGGE、PCR-TGGE、AFLP、REP-PCR、S-PCR、LCR、LH-PCR、SBCS以及小卫星序列多态性和序列同源性分析等。
本文即论述了这些技术在乳酸菌分类鉴定中的应用及其优势和局限性。
关键词：乳酸菌，PCR，分类，鉴定，分子生物学1. 引言乳酸菌（lactic acid bacteria, LAB）是一大类缺乏细胞色素、糖代谢主要以乳酸为终产物的革兰氏阳性非芽孢细菌，其过氧化氢酶反应为阴性、耐氧耐酸、营养要求复杂并且严格发酵。
LAB这个名称就细菌分类学而言实属一个非正式、非规范的名称。
目前从自然界中已发现的这类细菌在分类学上至少可划分为23个属，涉及到的有关菌种则更多，其代表性的菌属有乳杆菌属、乳球菌属、链球菌属、双歧杆菌属、肠球菌属、明串珠菌属、气球菌属、肉杆菌属、酒球菌属、足球菌属、四体球菌属和漫游球菌属等[1,2]。
传统的LAB鉴定方法主要依赖于表型分析，包括形态学观察、生长需要及特性、发酵图谱、细胞壁蛋白分析、血清学以及脂肪酸甲基酯分析等，其中有些技术已被证明适用于某些LAB的鉴定，但是也普遍意识到表型分析的一些缺点，如重现率及辨识能力低、相似的表型特性并不等同于相似的或者关系密切的基因型[3]。
表型试验可能的固有问题是，不是每一给定种内的所有菌株都有一个共同的性状，而且即使是同一菌株也可能呈现出一定的生化变异性。
此外，实验操作的一点改变也可能产生错误的结果。
因此基于表型试验的常规技术并不能对菌株做出明确的鉴定[4]。
环境工程微生物题库有答案
判断题1.微生物系统分类单元从高到低依次为界、门、纲、目、科、属、种×最高为域2.株是微生物分类最小单位×种是微生物分类最小单位3.溶原性噬菌体的DNA整合在宿主DNA上,不能独立进行繁殖√4.放线菌属于真核微生物×放线菌是原核微生物5.大多数放线菌属革兰氏阴性菌×除枝动菌属外,其余放线菌均为革兰氏阳性菌6.放线菌的菌体由纤细的长短不一的菌丝组成,在固体培养基上呈辐射状,菌丝分支,为单细胞√7.霉菌的菌落疏松,菌丝细小,与培养基结合紧密,不易用接种环挑取×霉菌菌落形态较大8.菌苔是细菌在固体培养基上的培养特征之一×菌落是细菌在固体培养基上的培养特征之一9.大肠杆菌属于单细胞微生物,金黄色葡萄球菌属于多细胞微生物×细菌都是单细胞10.大肠杆菌是革兰氏阴性菌,金黄色葡萄球菌是革兰氏阳性菌√11.碱性染料能与细胞中带正电的组分结合,常用于细菌染色×碱性染料是和细胞中带负电的组分结合12.革兰氏阳性菌细胞壁的脂肪含量比革兰氏阴性菌高×低13.红螺菌的同化作用类型为光能异养型√14.渗透酶属于诱导酶,其他酶属于结构酶×渗透酶是载体蛋白15.一切厌氧微生物都含有超氧化物歧化酶×耐氧厌氧微生物含超氧化物歧化酶,一切厌氧微生物都不具有过氧化氢酶16.分子氧对专性厌氧微生物的抑制和杀死作用是因为这些微生物缺乏过氧化氢酶√17.主动运输需要载体和能量,促进扩散不需要载体和能量×促进扩散要载体不要能量18.大多数微生物可以合成自身所需的生长因子,不必从外界摄取√19.核糖体的功能是合成蛋白质√20.明胶是最常用的凝固剂×琼脂最常用的凝固剂21.浓乳糖蛋白胨培养基是合成培养基×是天然培养基22.豆芽汁培养基是合成培养基×是天然培养基23.分批培养时,细菌首先经历一个适应期,此时细胞处于代谢活动低潮,细胞数目不增加√24.恒化培养与恒浊培养的区别是前者菌体始终处于对数期×区别前者保持细菌浓度不变,后者保持营养成分浓度不变25.乳糖操纵子是由结构基因、操纵基因、调节基因组成√26.操纵子的结构基因通过转录、翻译控制蛋白质的合成,操纵基因和调节基因通过转录、翻译控制结构基因的表达√27.细菌所有遗传信息都储存在细菌染色体上×细菌为原核微生物,无染色体,基因还可以存在质粒上28.遗传型相同的个体在不同环境下会有不同的表现型√29.低剂量的紫外线照射,对微生物没有影响,但超过某一阈值的紫外线照射,则会导致微生物基因突变×低剂量紫外线照射导致基因突变30.导致牛得疯牛病的朊病毒的遗传物质是DNA×是蛋白质31.HgCl2的杀菌机理是与微生物酶的-SH基结合,使酶失去活性,或与菌体蛋白质结合,使之变性或沉淀√32.反消化作用是在好氧条件下进行的×在厌氧条件下进行33.好氧活性污泥法处理废水过程中,去除的有机污染物全部转化为二氧化碳和水×大部分转化为微生物自身组成34.活性污泥法处理废水,易产生污泥膨胀问题√35.用霉菌、酵母菌处理有机废水时,有时会出现活性污泥丝状膨胀,这时可以通过修改工艺来解决√36.对厌氧消化-甲烷发酵,污水pH一般保持在之间√37.自然界中产甲烷菌有很多种,有些是好氧的,有些是厌氧的,有些是兼性厌氧的×甲烷菌都是厌氧的38.导致水体富营养化的生物主要是硅藻×是蓝藻39.水体中有机物浓度越高,微生物代谢作用消耗的溶解氧越多√40.任何土质中微生物种类都按细菌、真菌、放线菌、原生动物、藻类的顺序由多到少排列×任何土质中微生物种类都按细菌、放线菌、真菌、原生动物、藻类的顺序由多到少排列填空题1.微生物和其他类型微生物相比具有个体极小、分布广种类多、繁殖快、易变异特点;2.病毒的繁殖过程可分为吸附、侵入、复制与聚集、裂解与释放;3.细菌的基本形态有球状、杆状、螺旋状、丝状;4.细菌细胞的一般结构为细胞壁、细胞膜、细胞质及内含物、拟核;5.细菌细胞的特殊结构为芽孢、鞭毛、荚膜、粘液层、菌胶团、衣鞘、光合作用层片等;6.细菌原生质体由细胞膜、细胞质及内含物、拟核组成;7.细菌芽胞的特点有芽胞含水率低、芽胞壁厚而致密、芽胞中2,4-吡啶二羧酸DPA含量高、芽胞含有耐热性酶;8.细菌荚膜的功能有具有荚膜的S型肺炎链球菌毒力强,有助于肺炎链球菌侵入人体；荚膜保护致病菌免受宿主吞噬细胞的吞噬,保护细菌免受干燥的影响；当营养缺乏时,荚膜可被用作碳源和能源,有的荚膜还可用作氮源；废水生物处理中的细菌荚膜有生物吸附作用,将废水中的有机物、无机物及胶体吸附在细菌体表面上;9.在pH为的溶液中,细菌带正电荷；在pH为的溶液中,细菌带负电荷;10.放线菌的菌丝由于形态和功能不同,可分为营养菌丝、气生菌丝、孢子菌丝;11.原生动物的营养类型有全动性营养、植物性营养、腐生性营养;12.原生动物可分为孢子纲、鞭毛纲、肉足纲、纤毛纲,眼虫属于鞭毛纲,草履虫属于纤毛纲,钟虫属于纤毛纲;13.革兰氏染色的步骤是草酸铵结晶紫初染、碘-碘化钾媒染、乙醇脱色、番红复染;其中最关键的一步是脱色;大肠杆菌经革兰氏染色后为红色,为革兰氏阴性菌;14.微生物生长量的测定方法有测定微生物总数、测定活细菌数、计算生长量;15.活细菌数的测定方法有载玻片薄琼脂层培养计数、平板菌落计数、液体稀释培养计数、薄膜过滤计数;16.根据培养基的物理状态,培养基可分为液体培养基、半固体培养基、固体培养基;最常用的固体培养基凝固剂为琼脂;17.根据实验目的和用途不同,培养基可分为基础培养基、选择培养基、鉴别培养基、加富培养基;18.根据组成物的性质,培养基可分为合成培养基、天然培养基、复合培养基;19.实验室常用的有机氮源有牛肉膏和蛋白胨,无机氮源有硝酸钠和硝酸铵;20.在微生物学奠基时代,公认的代表人物为巴斯德和柯赫,前者的主要业绩有巴斯德消毒法,后者的主要业绩有微生物纯种培养法;21.根据酶作用的位置,酶可分为胞外酶、胞内酶、表面酶;22.根据酶的组成,酶可分为单成分酶、全酶;23.酶的催化特性有加快反应速度、专一性、条件温和、对环境敏感、催化效率极高;24.酶蛋白的结构可分为一级结构、二级结构、三级结构、四级结构;25.酶各成分的功能是,酶蛋白起加速生化反应的作用；辅基和辅酶起传递电子和化学基团的作用,金属离子起传递电子和激活剂的作用;26.根据微生物和氧的关系,微生物可分为好氧微生物、厌氧微生物、兼性厌氧微生物;27.根据所需能源和碳源不同,微生物可分为光能自养微生物、光能异养微生物、化能自养微生物、化能异养微生物;28.微生物所需的营养包括水、碳源和能源、氮源、无机盐、生长因子;营养物质进入细胞的方式有单纯扩散、促进扩散、主动运输、基团转位;29.根据最终电子受体不同,微生物的呼吸类型可分为发酵、好氧呼吸、无氧呼吸;30.根据细菌的生长情况,可将细菌的生长曲线分为停滞期、对数期、静止期、衰亡期;31.影响停滞期长短的因素有菌种、接种群体菌龄、接种量、培养基成分;32.影响微生物世代时间的因素有菌种、营养成分、营养物浓度、温度;33.微生物之间的关系可分为竞争关系、互生关系、共生关系、偏害关系、捕食关系、寄生关系;34.细菌纯种分离的方法有稀释平板法、平板划线分离法、涂布法;35.菌种保藏方法有定期移植法、干燥法、隔绝空气法、蒸馏水悬浮法、综合法;综合法是目前最好的菌种保藏法;36.衡量水体自净的指标有P/H指数、氧浓度昼夜变化幅度和氧垂曲线;37.1mol葡萄糖,经糖酵解净产生2molATP,经好氧呼吸净产生38molATP;38.紫外线诱变的机理是使DNA结构变化;其中起主要作用的是胸腺嘧啶二聚体的产生;39.由于紫外线的特殊性质,其作用有空气消毒、表面消毒、诱变育种;40.一般化学杀菌剂的杀菌能力与其浓度成正比,乙醇则不然,以70%的乙醇杀菌能力最强;41.用氯和氯化物对饮用水消毒时,起主要杀菌作用的是HClO,而其在水中的浓度主要由pH控制;42.重金属的杀菌机理是与酶的—SH基结合,使酶失去活性；或与菌体蛋白结合,使之变性或沉淀;43.空气微生物卫生标准的指标有浮游细菌数、降落细菌数;44.进行灭菌的方法有干热灭菌法、湿热灭菌法、化学药品灭菌法;干热灭菌的最高温度不超过170°C;45.根据突变的条件和原因,突变可分为自发突变、诱发突变;46.根据基因的功能,基因可分为结构基因、操纵基因、调节基因;47.生态系统的四个基本组成为环境、生产者、消费者、分解者;48.生态系统是自然界的基本功能单元,其功能主要表现在生物生产、能量流动、物质循环、信息传递;49.根据污水处理中微生物的存在状态,可分为活性污泥法、生物膜法;50.活性污泥的结构与功能中心是菌胶团;51.水体污化系统将受有机物污染的河段分为多污带、α-中污带、β-中污带、寡污带;52.废水处理中,原生动物的作用为指示作用、净化作用、促进絮凝和沉淀作用;53.废水处理中,常见的原生动物有鞭毛虫、肉足虫、游泳型纤毛虫、固着型纤毛虫;54.废水处理中,好氧微生物群体,要求BOD5:N:P=100:5:1；厌氧微生物群体,要求BOD5:N:P=100:6:1;55.废水处理中,对进水水质应考虑的因素有供氧量、pH、温度、有毒物质、营养物质等;56.废水处理中,常用的絮凝剂有有机高分子絮凝剂、无机絮凝剂、微生物絮凝剂;57.厌氧消化三段理论为水解阶段、产酸阶段、产甲烷阶段;58.我国现行的饮水卫生标准规定,自来水中细菌总数不超过100个/ml,大肠菌群数不超过3个/L;59.普通滤池内生物膜微生物群落为生物膜生物、生物膜面生物、滤池扫除生物;前者以菌胶团为主要组成,起净化和稳定水质功能；中者为固着型纤毛虫和游泳型纤毛虫,起促进滤池净化速度,提高滤池整体处理效率功能；后者为轮虫、线虫等,起去除滤池内污泥、防止污泥积累和堵塞功能;60.土壤微生物的水平分布取决于土壤中的碳源;名词解释1.病毒：没有细胞结构,专性活细胞寄生的一类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的超显微非细胞生物2.噬菌体：是感染细菌、真菌、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称3.温和性噬菌体：噬菌体侵入宿主细胞后,其核酸附着并整合在宿主染色体上,和宿主的核酸同步复制,宿主细胞不裂解而继续生长4.溶原性：病毒感染细菌后,其基因组整合到宿主的染色体中,在宿主内进行复制并且引起细菌细胞的裂解5.质粒：是核以外的遗传物质,能自我复制,把所携带的生物形状传给子代6.芽孢：某些细菌在其生活史的某个生长阶段或某些细菌在遇到不良环境时,在细胞质内生成的内生孢子7.菌胶团：细菌之间按一定排列方式互相粘结在一起,被一个公共荚膜包围形成的细菌集团8.菌落：一个细菌在固体培养基上迅速生长繁殖形成的一个由无数细菌组成的具有一定形态特征的细菌集团9.酶：由细胞产生的,能在体内或体外起催化作用的一类具有活性中心和特殊构象的生物大分子10.酶的活性中心：酶蛋白分子中与底物结合,并起催化作用的小部分氨基酸微区11.酶的竞争性抑制：有些抑制剂的结构与底物结构类似,影响底物和酶的结合,使反应速率下降12.新陈代谢：生物从外界环境不断摄取营养物质,经过一系列生物化学反应,转变成细胞的组成,同时产生废物并排除体外13.内源呼吸：外界没有供给能源,利用自身内部贮存的能源物质进行呼吸14.EMP途径糖酵解：在无氧条件下,1mol葡萄糖逐步分解产生2mol丙酮酸、2molNADH+H+、2molATP的过程15.TCA循环三羧酸循环：丙酮酸有氧氧化过程的一系列步骤的总称;由丙酮酸开始,先经氧化脱羧作用,并乙酰化形成乙酰辅酶A和1molNADH+H+,乙酰辅酶A进入三羧酸循环,并最终氧化为CO2和H2O16.底物水平磷酸化：微生物在基质氧化过程中,可形成多种含高自由能的中间产物,这些中间产物将高能键交给ADP,使ADP磷酸化生成ATP 17.氧化磷酸化：微生物在好氧呼吸和无氧呼吸时,通过电子传递体系产生ATP18.光合磷酸化：光引起叶绿素、菌绿素或菌紫素逐出电子,通过电子传递体系产生ATP19.分批培养：将一定量的微生物接种在一个封闭的、盛有一定体积液体培养基的容器内,保持一定的温度、pH和溶解氧量,微生物在其中生长繁殖20.恒浊连续培养：使细菌培养液的浓度恒定,以浊度为控制指标的培养方式21.恒化连续培养：维持进水中的营养成分恒定,以恒定流速进水,以相同流速流出代谢产物,使细菌处于最高生长速率状态下生长的培养方式22.灭菌：通过超高温或其他物理化学方法将所有微生物的营养细胞和芽孢或孢子全部杀死23.消毒：通过物理化学方法致病菌或所有营养细胞和一部分芽孢24.光复活现象：经紫外辐射照射的菌体或孢子悬液,随即暴露于蓝色区域可见光下,有一部分受损伤的细胞可恢复其活力25.抗生素：微生物在代谢过程中产生的、能杀死其他微生物或抑制其他微生物的生长的化学物质26.生长限制因子：处于较低浓度范围内,可影响生长速率和菌体产量的营养物27.竞争关系：不同的微生物种群在同一环境中,对食物等营养、溶解氧、空间和其他共同要求的物质互相竞争,互相受到不利影响28.互生关系：两种可以单独生活的生物共存于同一环境中,相互提供营养及其他生活条件,双方互为有利,相互受益29.共生关系：两种不能单独生活的微生物共同生活于同一环境中,各自执行优势的生理功能,在营养上互为有利而所组成的共生体30.拮抗关系：共存于同一环境的两种微生物,一种微生物在代谢过程中产生一些代谢产物,其中有些产物对一种或一类微生物生长不利、抑制或者杀死对方31.捕食关系：微生物不是通过代谢产物对抗对方,而是吞食对方32.寄生关系：一种生物需要在另一种生物体内生活,从中摄取营养才得以生长繁殖33.转录：以DNA为模板合成mRNA的过程34.逆转录：以mRNA为模板合成DNA的过程35.三联子密码：遗传密码是存在于mRNA链上,由相邻的3个相邻的核苷酸组成,代表一个氨基酸的核苷酸序列36.DNA半保留复制：首先是DNA分子中的两条多核苷酸链之间的氢键断裂,彼此分开成两条单链;然后各自以原有的多核苷酸链为模板,根据碱基配对的原则吸收细胞中游离的核苷酸,按照原有链上的碱基排列顺序,各自合成出一条新的互补的多核苷酸链,新合成的一条多核苷酸链和原有的多核苷酸链又以氢键连接成新的双螺旋结构37.tRNA的翻译：DNA转录成mRNA后,mRNA链上的核苷酸碱基序列需要被翻译成相应的氨基酸序列,还要被转运到核糖体上,才能合成具有不同生理特性的功能蛋白38.蛋白质的合成：通过tRNA两端的识别作用,把特定的氨基酸转送到核糖体上,使不同的氨基酸按照mRNA上的碱基序列连接起来,在多肽合成酶的作用下合成多肽链,多肽链通过高度折叠成特定的蛋白质结构,最终合成具有不能生理特性的功能蛋白39.基因：生物体内储存遗传信息的、有自我复制能力的遗传功能单位40.质粒：原核微生物体内的一种较小的、携带少量遗传基因的环状DNA分子41.诱发突变：利用物理或化学的方法处理微生物群体,促使少数细胞的DNA分子结构发生改变,在基因内部碱基配对发生差错,引起微生物的遗传性状发生突变42.基因重组：两个不同性状个体细胞的DNA融合,使基因重新组合,从而发生遗传变异,产生新品种43.PCR技术DNA聚合酶链反应：DNA不需通过克隆而在体外扩增,短时间内合成大量DNA片段的技术44.好氧活性污泥：由多种多样的好氧微生物和兼性厌氧微生物与污水中的有机和无机固体物混凝交织在一起,形成的絮状体或绒粒45.好氧生物膜：由多种多样的好样微生物和兼性厌氧微生物黏附在生物滤池滤料上或黏附在生物转盘盘片上的一层黏性、薄膜状的微生物混合群体46.生物圈：地球上所有生物及其周围环境组成的最大的生态系统47.生态系统：在一定时间和空间范围内由生物与它们的生存环境通过能量流动和物质循环所组成的一个自然体;48.水体自净作用：水体接纳一定量的污染物质后,在物理化学和微生物等因素的综合作用下得到净化,水质恢复到污染前水平49.自净容量：在水体正常生物循环中能够净化有机污染物的最大数量50.水污染指示生物：在一定水质下,对水体环境质量的变化反应敏感,用来监测和评价水体污染状况的水生生物51.水体富营养化：在人类活动影响下,氮、磷等营养物质大量进入湖泊、海洋,引起藻类及其他浮游生物迅速繁殖,溶解氧下降,水质恶化,鱼类和其他生物大量死亡的现象52.P/H指数：P代表光能自养型微生物,H代表异养型微生物,两者的比值53.AGP藻类潜在生产能力：把特定藻类接种在天然水体或污水中,在一定的光照和温度条件下培养,使藻类生长到稳定期为止,通过测干重或细胞数来测其增长量54.氧垂曲线：在河流受到大量有机物污染时,有机物的氧化分解使水体中溶解氧发生变化,随污染源到河流下游一定距离内,溶解氧由高到低再回到原来的水平,绘制的溶解氧变化曲线55.污泥驯化：在废水生物处理中,用含有某种污染物的废水筛选、培养来自其他废水的菌种,使他们适应该种废水,并具有高效降解其中污染物的能力的方法56.菌落总数：1ml水样在营养琼脂培养基中,于37℃培养24h后所生长出来的细菌菌落总数57.总大肠菌群：又称大肠杆菌群,他们是一群兼性厌氧的、无芽孢的革兰氏阴性杆菌58.大肠菌群指数：单位体积水中所含的大肠杆菌群落数目59.硝化作用：氨基酸脱下的氨,在有氧的条件下,经亚硝化细菌和硝化细菌的作用下转化为硝酸60.反硝化作用：植物、藻类及其他微生物把硝酸盐作为氮源,吸收硝酸盐,通过硝酸还原酶将硝酸还原成氨,由氨合成为氨基酸、蛋白质及其他含氮物质,兼性厌氧的硝酸盐还原细菌将硝酸盐还原为氮气61.固氮作用：通过固氮微生物的固氮酶催化作用,把分子N2转化为NH3,进而合成有机氮化合物62.硫化作用：在有氧条件下,硫化细菌把H2S氢氧化为单质硫,进而氧化成硫酸63.反硫化作用：土壤淹水、河流、湖泊等水体处于缺氧状态时,硫酸盐、亚硫酸盐、硫代硫酸盐、次亚硫酸盐在微生物的还原作用下形成H2S 64.生化需氧量BOD：表示在有氧条件下,好氧微生物氧化分解单位体积水中有机物所消耗的游离氧的数量,常用单位为mg／L,这是一种间接表示水被有机污染物污染程度的指标65.化学需氧量COD：用强氧化剂——重铬酸钾,在酸性条件下能够将有机物氧化为H2O和CO2,此时所测出的耗氧量称为化学需氧量COD66.总需氧量TOD：有机物主要是由碳C、氢H、氮N、硫S等元素所组成;当有机物完全被氧化时,C、H、N、S分别被氧化为CO2、H2O、NO和SO2,此时的需氧量称为总需氧量TOD67.溶解氧：空气中的分子态氧溶解在水中称为溶解氧68.巴斯德效应：在厌氧条件下,向高速发酵的培养基中通入氧气,则葡萄糖消耗减少,抑制发酵产物积累69.堆肥化：在人工控制的条件下,依靠自然界中广泛分布的细菌、放线菌、真菌等微生物,人为促进有机质向稳定腐殖质转化的过程70.固定化酶：从筛选、培育获得的优良菌种体中提取活性极高的酶,再用包埋法交联法、载体结合法、逆胶束酶反应系统等方法将酶固定在载体上,制成不溶于水的固态酶简答题1.原核微生物和真核微生物的区别有哪些原核微生物的核很原始,发育不全,只有DNA链高度折叠形成的一个核区,没有核膜,核质裸露,与细胞质没有明显界限,称为拟核;原核微生物没有细胞器,只有由细胞膜内陷形成的不规则的泡沫体系,也不进行有丝分裂;原核微生物包括古菌、细菌、放线菌、蓝细菌、立克次氏体、支原体、衣原体;真核微生物有发育完好的细胞核,核内有核仁和染色质;由核膜将细胞核和细胞质分开,两者有明显的界限;有高度分化的细胞器,如线粒体、中心体、高尔基体、内质网、溶酶体和叶绿体等;进行有丝分裂;真核微生物包括除蓝藻以外的藻类、酵母菌、霉菌、原生动物、微型后生动物;2.革兰氏染色的步骤和原理是什么革兰氏染色的步骤：①涂片,固定；②初染：滴加草酸铵结晶紫染色1-2min,水洗；③媒染：滴加革兰氏碘液碘-碘化钾溶液染色1-2min,水洗；④脱色：滴加体积分数为95%的乙醇,约45s 后水洗；⑤复染：滴加番红染液染色2-3min,水洗并使之干燥；⑥镜检：革兰氏阳性菌呈紫色,革兰氏阴性菌呈红色;革兰氏染色的原理：①革兰氏染色与细菌等电点有关系：革兰氏阳性菌的等电点比革兰氏阴性菌低,因而革兰氏阳性菌带负电荷比革兰氏阴性菌多,它与草酸铵结晶紫的结合力大,用碘-碘化钾媒染后,两者等电位均降低,但革兰氏阳性菌等电位降低得多,故与草酸铵结晶紫结合得更牢固,对乙醇脱色的抵抗力强,草酸铵结晶紫、碘-碘化钾复合物不被乙醇提取,菌体呈紫色,而革兰氏阴性菌则相反,菌体呈红色;②革兰氏染色与细菌细胞壁有关：革兰氏阳性菌的脂质含量很低,肽聚糖含量高,革兰氏阴性菌则相反,因此用乙醇脱色时,革兰氏阴性菌的脂质被乙醇溶解,增加细菌细胞壁的孔径及其通透性,乙醇容易进入细胞内将草酸铵结晶紫、碘-碘化钾复合物提取出来,使菌体呈无色,革兰氏阳性菌由于脂质含量极低,而肽聚糖含量高,乙醇既是脱色剂又是脱水剂,使肽聚糖脱水缩小细胞壁的孔径,降低细胞壁的通透性,阻止乙醇。
真菌【33页】
假菌丝和厚膜孢子
31
2、致病性
（1）入侵原因 ➢ 机体抵抗力下降（AIDS） ➢ 大量、长期使用抗菌药物，激素和免疫抑制剂。 （2）入侵部位 ➢ 皮肤粘膜感染：以鹅口疮、阴道炎最多见。 ➢ 内脏感染：有肺炎、肠胃炎、心内膜炎等，偶
而也可发生败血症。 ➢ 中枢神经感染：脑膜炎、脑炎。
32
霉菌性口腔炎
真 菌 学 mycology
1
概念
❖ 真菌（fungi）是一类真核细胞型微生物。有典 型的细胞核和完善的细胞器。
❖ 真菌广泛分布于自然界，种类繁多，有10余万种。 大多对人无害，只有少数可引起人类疾病。
2
一、生物学性状
1. 形态与结构
（1） 单细胞真菌 形态呈圆形或椭圆形，常见于酵母菌或类酵母 菌。它们以芽生方式繁殖产生子代。
主引起的超敏反应。
23
5、 致病性
➢特点：一种皮肤癣菌可在不同部位引起病 变，相同部位的病变也可由不同的皮肤 癣菌引起。
➢临床疾病：各种癣症。
24
6、 微生物学检查法
1.标本：根据病变部位取材 2.直接镜检：观察菌丝和孢子结构
浅部感染真菌的病变标本如毛发、皮屑、甲屑置玻片 上，滴加10%KOH，加盖玻片微热熔化角质层，再将玻片 压紧，用吸水纸吸去周围多余碱液，在显微镜下观察，见 皮屑、甲屑中有菌丝，或毛发内部或外部有成串孢子，即 可初步诊断为癣菌感染，但不能确定菌种。
12
多细胞真菌菌落
13
有些真菌在不同寄生环境和培养条件下出现 两种形态，称二相性真菌(dimorphic fungi)，即 在机体内或含血培养中37℃孵育，呈现酵母型菌 落，而在沙保培养基上室温孵育，则形成丝状菌 落。如荚膜组织胞浆菌、皮炎芽生菌等。
第十一章微生物的分类
3．相似度系数的计算
相似度系数是被比较的OTU对偶间整体相似程度的量 度．最简单的方法是计算OTU对偶间相似性状的数目。其 计算公式如下： NS S％=—-------— NS+ND 式中的NS表示比较的OTU对偶有相同性状的数目．ND 表示被比较的OTU对偶有不同性状的数目。算出的相似度 以百分数或比例表示。
(二)生理生化特征
1．对营养或生长基质的要求 包括所能利用的碳源、能源、氮源、无机盐以及生长因子等。 2．生理生化反应 水解大分子的能力．如淀粉水解、油脂水解、明胶液化和酪素水 解等试验：糖或醇类发酵试验、甲基红试验、V．P．试验；吲哚 试验和H2S试验；硝酸盐还原试验、柠檬酸盐或丙酸盐利用试验 和丙二酸盐利用试验等；用作分类特征的酶如氧化酶、过氧化氢 酶、凝固酶、脲酶、氨基酸脱羧酶、精氨酸双水解酶、苯丙氨酸 脱氨酶以及B一半乳糖苷酶等；产色素、抗生素等次级代谢产物也 常是某些微生物的分类依据。 3．抗逆性 对噬菌体、抗生素、染料和化学药品等抗微生物因子 (antimicrobial agent)的反应等。
第一节微生物的分类单元
分类单元(taxon。复数taxa)是指某一个具体的 分类群，如原核生物界，大肠埃希氏菌属和枯 草杆菌等分别代表一个分类单元： 与其他生物一样，微生物分类的基本单元也是 种(species) 微生物种是显示高度相似性、亲缘关系极其接 近、与其他种有明显差异的一群菌株的总称。 在每个种中都有一个菌株被指定为模式菌株 (type strain)，它是这个种名称的代表．是这 个种的永久的标准标本。
四、细菌分类和伯杰氏手册
《伯杰氏手册》最初由美国宾夕法尼亚大学 的细菌学教授伯杰(D．Bergey)(1860—1937) 及其同事为细菌的鉴定而编写的名为《伯杰氏 鉴定细菌学手册》沿用至今。
细菌分类学
当泛指某一属细菌而不特指该属中的某一个种(或 种名未
定)时，可在属名后加sp.或spp.(分别代表 species缩写的 单数和复数形式)
例如 Bacillus sp.(一种芽孢杆菌） Bacillus spp.(一些芽孢杆菌）
在发表新的分类单元名称时，要再新名称后面加上
弧菌属。
1838年，德国生物学家Eheneberg对微生物分类做 了修改，把细菌列为纤毛虫纲，分为2科。
1857年，德国植物学家Nagali在《植物学杂志》上发表
文章指出，这些微生物具有细胞壁，应归属于植物界，
并独立设一纲，取名裂殖菌纲。
1872年，德国植物学家Cohn发表新的细菌分类系统， 吧细菌分为4个族，每个族由一个或几个属组成。 1909年，Jensen发表了一种新的分类法，该方法在采用
微生物分物分类学(microbial taxonomy):研究微生物 分类理论和技术方法的学科 分类(classification)：
根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关 性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列
成系统，并 对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未
三、细菌的分类系统
（一）克里希里尼科夫分类系统
植物界原生动物门下分为裂殖藻类和裂殖菌类，细菌归为裂 殖菌类，下分四纲，分别为放线菌纲、真细菌纲、粘细菌纲、 和螺旋体纲。
（二）普雷沃分类系统 把细菌归为原核生物界，下分四个门8个纲，即真细菌门（无 芽孢菌纲、芽孢菌纲）、分枝杆菌纲（放线菌纲、粘细菌纲、 固氮细菌纲）、藻杆菌纲（铁杆菌纲、硫杆菌纲）和原生动
菌物学
菌物学前言一、本课的目的和任务菌物学是森林保护专业的重要专业基础课。
本课程的目的和任务是引导和帮助学生系统地掌握菌物学的基本概念和相关原理，掌握各类菌物的形态特征和分类系统，了解菌物学的基本研究方法和技术，以便学生能独立地识别各类菌物和了解各类菌物的研究与应用价值，以及为进一步的深造和研究工作奠定坚实的理论基础，为正确地诊断有关菌物和林木真菌病害打下坚实的基础。
林木真菌病害的诊断就是采用必要的真菌鉴定技术方法，运用真菌分类学和病理学的知识，确定林木真菌病害的病名和病原。
这是林病防治之前必须正确解决的问题，是防治林木病害的首要环节。
只有正确地诊断病害，才能―对症下药‖，有效地开展防治工作。
诊断病害可分为：1症状诊断。
2病原诊断。
前者方法简单，不准确；后者方法复杂，较准确。
病原诊断在植物病理学专业有的单设植物病害诊断学-植物病原学（病原生物学），其中重点介绍病原真菌分类的知识（或植物病原真菌学），可见真菌分类在本专业上的重要性。
二、本课与其他课程的联系和分工我们所讲的菌物学一大部分是植物病原真菌学，它研究植物病原真菌的形态、分类、习性、致病特点及其鉴定的技术方法，是植物病害诊断学的重要组成部分。
与本课程有密切联系的课程是普通植物病理学和森林病理学，普通植物病理学中对林木病原真菌的一般特点和分类―纲‖的知识对了介绍，为学习本课程打下一定的基础。
森林病理学对引起林木病害的主要病原真菌种的形态、生理学、生物学、致病性等作介绍。
与普通植物病理学和森林病理学有关的真菌分类学则是系统地介绍真菌分类的基础知识，以培养学生诊断林木真菌病害的能力。
另外，菌物学还要涉及一些重要的有经济价值的有益真菌，包括食用菌、药用菌、菌根菌、生物防治菌、抗生素产生菌、化学工业真菌、产生毒素的真菌、引起人类和动物病害的真菌等。
三、本课的基本要求1、真菌分类学的基础知识：包括真菌的形态、生物学习性、生活史、分类、命名及其有关的基本概念。
双相型真菌介绍及说明
双相型真菌介绍及说明双相型真菌（Dimorphicfungi）在医学真菌学领域是专指那些在组织内或37℃培养时呈酵母相，于室温中培养时则呈菌丝相的致病真菌，包括申克孢子丝菌、马尔尼菲青霉、荚膜组织胞浆菌、粗球孢子菌、巴西副球孢子菌和皮炎芽生菌等。
这些菌的共同特点是除有上述特征外，还有较严格的地域分布（仅申克孢子丝菌此点不突出）；对人体致病力较强（有较大的侵袭性），患者不一定在感染前有免疫受损。
一、申克孢子丝菌（一）菌属分类特征申克孢子丝菌（Sporothrixschenckii）属于真菌界，真菌门，半知菌亚门，丝孢菌纲，丝孢菌目，丛梗孢科，侧孢霉属。
（二）致病性申克孢子丝菌广泛存在于自然界，为土壤、植物、木材等的腐生菌，引起人和动物孢子丝菌病（sporothricosis），是一种较为常见的皮下组织真菌病。
该病在世界范围内广泛分布，有时呈暴发流行，我国的吉林、黑龙江、四川及广东等地曾发生过小范围的地方性流行。
多由外伤植入申克孢子丝菌而引起皮肤及皮下组织感染，常沿淋巴管移行。
吸入分生孢子可导致肺部感染，也可播散至骨骼、眼、中枢神经系统和内脏，但较少见。
（三）生物学特性1.菌落特征（1）菌丝相：在25℃，SDA培养，3～5天可见菌落生长，初为乳白色湿润、光滑、膜样菌落，逐渐变成深褐色至黑色，中央凹陷，周边隆起，有放射状皱褶的绒毛样菌落。
多次转种后，菌落颜色可以变淡甚至白色，但常有一小部分仍保持褐色；表面光滑，气生菌丝少见。
（2）酵母相：在37℃，脑心浸汁葡萄糖血琼脂等富含营养的培养基上培养，可见白色或灰白色酵母样菌落。
2.显微镜特征（1）菌丝相：可见细长分枝分隔的菌丝，直径1～2μm。
分生孢子梗由菌丝两侧呈锐角长出，纤细而长，顶端变尖。
分生孢子为单细胞，有两种类型，一种无色，球形或梨形，直径（2～3）μm×（3～5）μm，3～5个簇集排列在分生孢子梗顶端如花朵样。
另一种分生孢子较大呈黑色，球形或圆锥形，合轴排列于菌丝四周，称为套袖状分生孢子。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
重要 的作 用。糖 多孢茵是寻找新的生物活性物 质的重要 茵源 ， 某些种能产生重要的生物 活性物 质 ， 如抗 生素、
酶类、 维生素、 藻类促 生长因子 、 纤维素 降解促进 因子 、 疫抑 制剂等。 免
关键词 糖 多孢茵属 ； 多相分类 ； 生物 活性物质 Ｑ９ ９ １ ３．３ 文献标识码 Ａ 文章编号 １ Ｏ —７ ２ （０ ７ ０ 一Ｏ５ 一Ｏ Ｏ ５ ０ １ ２０ ） １ Ｏ ５ ４ 中图分类号
糖 多孢 菌属 的 多 相分 类
吴冬冬 ，张建 丽
（ 北京理工大学 生命科学与技术学院 ， 北京 １０ ８ ） ００ １
摘பைடு நூலகம்
要
在糖 多孢 茵属 的分类 学研究 中， 最初是根据 形态特征 、 培养特征 及 生理 生化特征 等表观分 类 学指征
进行研 究。随着“ 多相 分类” 方法的广泛应 用， 学分类和分子分类在糖 多孢茵属的分类 学研 究 中起 到越来越 化
Ｐ ｌｐ ａ ｉ ａ ｏ ｏ ｆＳ ｃ ｈ ｒ ｐ ｌ ｓ ｒ ｏ ｙ ｈ ｓｃ Ｔ ｘ ｎ ｍｙ ｏ ａ ｃ ａ ｏ ｏ ｙ ｐｏ ａ
Ｗ Ｕ ｏ ｇｄ ｎ ， ＨＡＮ Ｊａ － Ｄ ｎ －ｏ ｇ Ｚ Ｇ ｉｎｌ ｉ
（ ｃ ．ｏ ｉｅＳ ｉ ＆ Ｔ ｃ ｎ１ Ｓ ｈ ｆＬ ｆ ｃ． ｅｈ ｏ ．Ｂｅ ｎ ｎｔ ｆＴ ｃｎ １ ｅｊｎ ０ ０ １ ｒｉｇＩ ｓ．ｏ ｅｈ ｏ．Ｂ ｉｉｇ １０ ８ ）
ｐ ｏｏ ｉａ，ｃ ｌｕ ａ，ａ ｄｐ ｙ ｉｌｇｃ ｌ ｎ ｉｃ ｅ ｃ ｌ ｈ ｒｃｅ ｓｉｓ Ｈｏ ｖ ｒ ｈ ｌｇｃ ｌ ｕｔｒ ｌ ｎ ｈ ｓｏｏ ｉ ｄｂｏ ｈ ｍｉａ ａ ａ ｔｒ ｔｃ． ａ ａ ｃ ｉ ｗｅ ｅ ，ｗｉｈｔ ｅｗ ｄ ｐ ｌ ａ ｉｎ ｆ ｔ ｈ ｅａ ｐｉ ｔ ｓｏ ｉ ｃ ｏ ｐ ｌｐ ａ ｉ ａ ｏ ｏ ｃ ｌ ｅｈ ｄ，ｔ ｅｆｎ ｔ ｎ ｆｃ ｅ ｃ ｌ ａ ｏ ｏ ｎ ｌｃ ｌｒｔｘ ｎ ｍｙｈ ｖ ｅｏ ｅｍｏ ｅ ｏｙ ｈ ｓｃｔｘ ｎ ｍｉａ ｔ ｏ ｍ ｈ ｕ ｃｉ ｓｏ ｈ ｍｉａ ｘ ｎ ｍｙａ ｄｍｏｅ ｕａ ａ ｏ ｏ ａ ｅｂ ｃｍ ｒ ｏ ｔ
ａ ｄ ｍｏ ｅｉ ｐ ｒ ａ ｔｉ ｈ ａ ｏ ｏ ｙ ｏ ａ ｃ ａ ｏ ｏ ｙ ｐｏ ａ Ｉ ｎ ｆｔ ｅ ｍｏ ｔｉ ｏ ｔ ｔｓ ｕ ｃ ｓｉ ｉｃ ｖ － ｎ ｒ ｍ ｏ ｔ ｎ ｎ ｔ ｅ ｔ ｘ ｎ ｍ ｆＳ ｃ ｈ ｒ ｐ ｌ ｓ ｒ ． ｔｉ ｏ ｅｏ ｈ ｓ ｓ ｍｐ ｒａ ｏ ｒ ｅ ｄ ｓ ｏ ｅ ｎ ｎ
Ｋｅｗｏ ｄ Ｓ ｃｈ ｒ ｐ ｌ ｓ ｏ ａ； ｏｙ ｈ ｓｃｔｘ ｎ ｍｙ； ｉａ ｔ ｅｃ ｍｐ ｕ ｄ ｙ ｒｓ ａ ｃ ａ ｏ ｏｙ ｐ ｒ ｐ ｌｐ ａ ｉ ａ ｏ ｏ ｂｏ ｃｉ ｏ ｏ ｎ ｓ ｖ
糖 多孢 菌 属 （ ａｃａｏ ｏｙｐ ｒ ） 分 类 学 了一 种好 氧 、 抗 酸 、 丝 断 裂 、 丝 断 裂 成包 在 Ｓ ｃｈ ｒｐ ｌｓｏａ 在 不 基 气 上属 于细菌域 ， 放线 菌 门 ， 放线 菌纲 ， 线 菌 目， 放 假 鞘 内的孢 子 、 细胞 壁 Ｉ 型 的革 兰 氏 阳性 菌 ， 名 Ｖ 命 诺卡 氏菌科 中 的一类 形 态相 似 的微 生物 ［ 。它主 为披 发 糖 多 孢 菌 （ ａｃａｏ ｏｙｐ ｒ ｉｓｔ） １ ３ Ｓ ｃｈ ｒｐ ｌｓｏａｈｒｕａ 。 要分 布在土 壤 中 ， 河 流 和 湖泊 中也 有 分 布 。糖 他 们发 现从 甘蔗渣 中得 到 的这 类 菌 和与之 对照 的 在 多孢 菌属 放线 菌是一 类安 全 的生 物资 源菌 。该 属 诺卡氏菌属 、 分枝杆菌属等诺卡氏菌型放线菌的 的许 多成员都 能产生 重要 的生 物 活性 物质 。 目前 形 态相 比有着 明显 的区 别 ， 以他 们 认 为有 必 要 所
批注本地保存成功开通会员云端永久保存去开通
维普资讯
微 生物学杂志 ２０年１ 第２卷 期 ＪＵ Ｎ ＬＯ Ｃ Ｏ ＩＬ Ｇ ｒ ２ ７ ｏ２ Ｎ． ０７ 月 ７ 第１ Ｏ Ｒ Ａ Ｆ Ｒ Ｂ Ｏ ＹＪＬ ０ １ ７ ｏ１ ５ ＭＩ Ｏ ａ ０ Ｖ ． ５
ｉ ｅ ｂｏ ｃｉ ｏ ｏ ｎ ｓ ｏ ｆｔ ｅ ｃ ｕｄ ｙｅｄｉ ｏ ｔｎ ｏ ｏ ｎ ｓ ｕ ｈａ ｉ ｏ ｉｓ ｎ ｙ ｓ ｒ ｇｎ ｗ ｉａ ｔ ｅｃ ｍｐ ｕ ｄ ． Ｓ ｍｅｏ ｈ ｍ ｏ ｌ ｉｌ ｐ ｒａ ｔｃｍ ｐ ｕ ｄ ，ｓ ｃ ｓａ ｔ ｉｔｃ ，ｅ ｚ ｍｅ ， ｎ ｖ ｍ ｎ ｂ
Ａｂ ｔａ ｔ Ｉ ｈ ａ ｏ ｏ ｃ ｌｓ ｕ ｙ ｏ ａ ｃ ａ ｏ ｏ ｙ ｐｏ ａ ｓｒ ｃ ｎ ｔ ｅ ｔ ｘ ｎ ｍｉａ ｔ ｄ ｆ Ｓ ｃ ｈ ｒ ｐ ｌ ｓ ｒ ，ｐ ｅ ｉ ｎ ｒｌ ｔｗａ ａ ｒｅ ｕ ｃ ｏ ｄｎ Ｏ ｍｏ － ｒｌ ｍｉ ａ ｙ ｉ ｉ ｓ ｃ ｒｉ ｄ ｏ ｔａ ｃ ｒ ｉ ｇ ｔ ｔ
该属成员不多， 但仍有较大潜在 的理论 和实际研 建 立一 个新 属Ｌ 。 ２ Ｊ
究意 义。
１ 糖 多孢菌属 的建立及研 究现状
自 １７ 年建属至今 ， 从 ９５ 已经有 效发表 了 １ Ｏ 个 种［ ］结 果如 表 １ 示 。模式种 为披 发糖 多 孢 ２ ， 所 菌 。这个属的特点是基丝生长发育 良好 ， 分枝， 菌