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pUC18+和+pUC19质粒图谱

pUC18+和+pUC19质粒图谱

pUC18 和pUC19质粒图谱pUC18 和pUC19 大小只有2686bp ,是最常用的质粒载体,其结构组成紧凑,几乎不含多余的DNA 片段,GenBank注册号为L08752(pUC18)和X02514(pUC19)。

由pBR322 改造而来,其中lacZ(MSC)来自M13mp18/19 图3-4 是其质粒图谱。

这两个质粒的结构几乎是完全一样的,只是多克隆位点的排列方向相反。

这些质粒缺乏控制拷贝数的rop基因,因此其拷贝数达500-700 。

pUC 系列载体含有一段lacZ蛋白氨基末端的部分编码序列,在特定的受体细胞中可表现α-互补作用。

因此在多克隆位点中插入了外源片段后,可通过α-互补作用形成的蓝色和白色菌落筛选重组质粒。

特征序列区位:pBR322_origin1471 - 852Ampicillin2486 - 1626lac_promoter543 - 514AmpR_promoter2556 - 2528M13_pUC_rev_primer500 - 478M13_reverse_primer479 - 461M13_forward20_primer379 - 395M13_pUC_fwd_primer364 - 386lacZ_a398 - 250pGEX_3_primer51 - 29Orf22486 - 1626NOS terminator sequence:ggatccatcgttcaaac atttggcaataaagtttcttaagattgaatcctgttgccggtcttgcgatgattatcatataattt ctgttgaattacgttaagcatgtaataattaacatgtaatgcatgacgttgtttatgagatgggtttttatgattagagtccc gcaattatacatttaatacacgatagaaaacaaaatatagcgcgcaaactaggataaattatcgcgcgcggtgtcat ctatgt tactagtaatcgat设计引物:Forward primer: 5’ ggaGGATCC ggatccatcgttcaaac 3’(含Bam H I 位点GGATCC及三个保护碱基)Reverse primer: 5’ atcGAATTC ATCGATTACTAGTAACATAG 3’(含Eco R I 位点GAATTC及三个保护碱基)请查一下NOS终止子序列内有没有这两个酶切点。

pUC18 和 pUC19质粒图谱

pUC18 和 pUC19质粒图谱

wowenwenpUC18 和pUC19质粒图谱pUC18 和pUC19 大小只有2686bp ,是最常用的质粒载体,其结构组成紧凑,几乎不含多余的DNA 片段,GenBank注册号为L08752(pUC18)和X02514(pUC19)。

由pBR322 改造而来,其中lacZ(MSC)来自M13mp18/19 图3-4 是其质粒图谱。

这两个质粒的结构几乎是完全一样的,只是多克隆位点的排列方向相反。

这些质粒缺乏控制拷贝数的rop基因,因此其拷贝数达500-700 。

pUC 系列载体含有一段lacZ蛋白氨基末端的部分编码序列,在特定的受体细胞中可表现α-互补作用。

因此在多克隆位点中插入了外源片段后,可通过α-互补作用形成的蓝色和白色菌落筛选重组质粒。

特征序列区位:pBR322_origin1471 - 852Ampicillin2486 - 1626lac_promoter543 - 514AmpR_promoter2556 - 2528M13_pUC_rev_primer500 - 478M13_reverse_primer479 - 461M13_forward20_primer379 - 395M13_pUC_fwd_primer364 - 386lacZ_a398 - 250pGEX_3_primer51 - 29Orf22486 - 1626NOS terminator sequence:ggatccatcgttcaaac atttggcaataaagtttcttaagattgaatcctgttgccggtcttgcgatgattatcatataattt ctgttgaattacgttaagcatgtaataattaacatgtaatgcatgacgttgtttatgagatgggtttttatgattagagtccc gcaattatacatttaatacacgatagaaaacaaaatatagcgcgcaaactaggataaattatcgcgcgcggtgtcat ctatgt tactagtaatcgat设计引物:Forward primer: 5’ ggaGGATCC ggatccatcgttcaaac 3’(含Bam H I 位点GGATCC及三个保护碱基)Reverse primer: 5’ atcGAATTC ATCGATTACTAGTAACATAG 3’(含Eco R I 位点GAATTC及三个保护碱基)请查一下NOS终止子序列内有没有这两个酶切点。

质粒图谱查询方法

质粒图谱查询方法

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0099--pGE-1—Stratagene--RNAi载体 0100--pSUPER.p53—OligoEngine--RNAi载体 0101--palter-ex1--promega 0102--pACYCDuet-1--NOVAGEN 0103--pEX lox(+) Vector—NOVAGEN--原核表达 0104--质粒名称:pBACgus-8 Transfer Plasmid—NOVAGEN--CHUANSUO 0105--pSCREEN?-1b(+) Vector Map—novagen--筛选 0106--PGEX-2T--BD Co--pDsRed2--Clontech 0107--pbgal-Basic—Clontech--mammalian reporter vector 0108—pBI—Clontech--express two genes of interest from a bidirectional tet-responsive promoter 0109--质粒名称:pbgal-Control—Clontech--mammalian reporter vector 0110-- pGEX-5X-1--原核表达 0111--pBI-EGFP—Clontech--pBI-EGFP-- coexpress 0112--pBI-G—Clontech--pBI-G--express b-galactosidase 0113--pBI-GL—Clontech--pBI-GL --express luciferase and b-galactosidase 0114--pCMS-EGFP—Clontech--mammalian expression vector 0115--pd2EYFP-1—Clontech--启动子测定 0116--质粒名称--pd2EYFP-N1—Clontech--融合表达 0117--pd4EGFP-Bid—Clontech--融合表达 Bid 0118--pDNR-CMV—Clontech--pDNR-CMV 0119--pDNR-EGFP Vector—Clontech 0120--pDNR-LacZ –Clontech 0121--pECFP-Endo—Clontech--真核表达0122--pECFP-ER—Clontech--真核表达0123--pEGFP-Actin—Clontech--真核表达0124--pGAD GH--Clontech--酵母表达 0125--pGADT7-Rec –Clontech--酵母表达 0126--pGADT7-RecAB—Clontech--酵母表达 0127--pGADT7-Rec2—Clontech--酵母表达 0128--pGBKT7—Clontech--酵母表达 0129--pHAT 10/11/12—Clontech 0130--pHAT20—Clontech 0131—pHygEGFP—Clontech 0132—pLacZi—Clontech 0133—pM—Clontech--pM is used to generate a fusion of the GAL4 DNA-BD 0134--pPKCa-EGFP—Clontech 0135--pPKCb-EGFP—Clontec 0136--pSIREN-DNR Vector—Clontech--RNAi 0137--pSIREN-DNR-DsRed-Express Vector—Clontech--RNAi 0138--pSIREN-RetroQ—Clontech--RNAi 0139--pIRES-EYFP—Clontech--RNAi 0140--pSRE-Luc—Clontech--RNAi 0141--pTK-neo—novagen--原核表达 0142--pZsGreen Vector—Clontech--pZsGreen is a pUC19-derived prokaryotic expression vector 0143--pTandem-1—novagen--原核表达 0144--pZsGreen1-C1Vector—Clontech----真核表达 0145--质粒名称:M13mp18—novagen--原核表达 0146--pZsGreen1-DR Vector—Clontech--真核表达 0147--PZsGreen1-N1 Vector—Clontech --真核表达 0148--T7Select415-1b—novagen----真核表达 0149--pZsYellow Vector—Clontech --真核表达 0150—pTimer—Clontech --真核表达 0151--pTA-Luc—Clontech --真核表达 0152--pTAL-Luc—Clontech --真核表达 0153--pTA-SEAP—Clontech --真核表达 0154--pTAL-SEAP—Clontech --真核表达 0155--pTet-On—Clontech --真核表达 0156--pTet-Off—Clontech --真核表达 0157--pTet-ATF—Clontech --真核表达 0158--pTet-CREB—Clontech --真核表达

质粒图谱查询方法

质粒图谱查询方法

3.google scholar: / 有些质粒是经过改造的,所以通过上述方法不能查询到相应信息。这时,可以在google scholar中输入质粒名称,可以直观地看哪些学者在何文章中使用了该质粒,从而可了解到质粒的来源;或者籍此向作者咨询或索取。 4.尝试从各大生物公司,例如invitrogen网站查询. 5. 这个网站收录了大量图谱: http://www.embl-hamburg.de/~geerlof/webPP/vectordb/bact_vectors/table.html
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file:///D|/中科院/Selective Serotonin Transporter/质粒信息/质粒图谱查询方法.txt
file:///D|/中科院/Selective Serotonin Transporter/质粒信息/质粒图谱查询方法.txt(第 2/6 页)[2011/8/4 18:39:52]
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pPICZαA质粒图谱

pPICZαA质粒图谱

pPICZaa载体基本信息出品公司: InvitrogenpPICZalpha A, pPICZαA, pPICZalphaA, pPICZαA, pPICZaA, 载体名称:pPICZa-A质粒类型: 毕赤酵母蛋白表达载体表达水平: 高拷贝启动子: AOX1克隆方法: 多克隆位点,限制性内切酶载体大小: 3593 bp5' 测序引物及序列: 5´AOX1:5´-GACTGGTTCCAATTGACAAGC-3´3' 测序引物及序列: 3´AOX1:5´-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3´载体标签: C-Myc, C-His载体抗性: Zeocin 博来霉素筛选标记: HIS4备注: 插入基因是必需包含起始密码子ATG。

产品目录号: V195-20稳定性: 稳定Stable组成型: 组成型Constitutive病毒/非病毒: 非病毒pPICZaa载体质粒图谱和多克隆位点信息pPICZaa载体简介pPICZαA,B和C是3.6 kb的毕赤酵母蛋白分泌表达载体。

表达的重组蛋白是融合蛋白,含有一个N-端多肽,编码酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)α-因子分泌信号。

载体能够在毕赤酵母中利用甲醇诱导的高水平的表达目的蛋白,并且可以用在任何毕赤酵母中,包括X33,GS115菌株,SMD1168H,KM71H。

pPICZαA,B和C系列载体包含以下元素:•5'端含有AOX1启动子的严格调控,利用甲醇诱导表达任何感兴趣的基因(Ellis等,1985; Koutz 等人,1989;tschopp等人,1987A)。

•α-因子分泌信号能够分泌性表达目的蛋白。

•Zeocin抗性基因在大肠杆菌(Escherichia coli)和毕赤酵母都能用于筛选(Baron等人,1992; Drocourt等人,1990)。

质粒图谱

质粒图谱

)质粒图谱登记号:00012)质粒名称:pIRES3)来源:BD Co4)用途:真核双表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:7)联系方式:PM)质粒图谱登记号:00022)质粒名称:pECFP-C13)来源:BD Co4)用途:检测真核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:7)联系方式:pm1)质粒图谱登记号:00032)质粒名称:pShuttle3)来源:4)用途:5)是否可以提供更详细资料:6)是否可以共享:7)联系方式:2)pShuttle MCS很多人用pEGFP-C1,我也来发一个)质粒图谱登记号:00042)质粒名称:pSBR322、pUC183)来源:4)用途:5)是否可以提供更详细资料:6)是否可以共享:7)联系方式:1)质粒图谱登记号:00052)质粒名称:pcDNA3.1(+)/CAT3)来源:invitrogen4)用途:真核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:无偿7)联系方式:PM1)质粒图谱登记号:00062)质粒名称:pQEx3)来源:Qiagen4)用途:原核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM2)1)质粒图谱登记号:00072)质粒名称:pIVEX2.33)来源:Rocho4)用途:体外转录翻译5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM质粒图谱登记号:0008质粒名称:pIRES-EGFP来源:用途:是否可以提供更详细资料:是否可以共享:否联系方式:1)质粒图谱登记号:00092)质粒名称:pET-28a(+)3)来源:Novagen4)用途:原核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM1)质粒图谱登记号:00112)质粒名称:pET-32a(+)3)来源:novagen4)用途:原核表达5)是否可以提供更详细资料:6)是否可以共享:7)联系方式:pm1)质粒图谱登记号:00132)质粒名称:pcDNA3.1/Zeo (+)3)来源:invitrogen4)用途:原核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM)质粒图谱登记号:00132)质粒名称:pEGFP-N33)来源:clontech4)用途:真核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM)质粒图谱登记号:00142)质粒名称:pcDNA33)来源:invitrogen4)用途:真核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM)质粒图谱登记号:00152)质粒名称:pfastbac13)来源:invitrogene4)用途:昆虫表达5)是否可以提供更详细资料:不可以6)是否可以共享:不可以7)联系方式:PM)质粒图谱登记号:00162)质粒名称:pEGFP-C33)来源:clontech4)用途:真核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PMwangjun2002274 edited on 2004-06-22 00:041)质粒图谱登记号:00172)质粒名称:pSecTag23)来源:Invitrogen4)用途:真核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM)1质粒图谱登记号:00192)质粒名称:pET20b3)来源:NOVAGEN4)用途:原核表达5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM1)质粒图谱登记号:00222)质粒名称:pThioHisA3)来源:invitrogen4)用途:原核表达5)是否可以提供更详细资料:4.365kb , HP-thioredoxin fusion proteinexpressionvector, trc promoter, Ampr, a EK cleavage site lies between HP-thioredoxin and MCS宿主菌TOP10(基因型为:F-mcrA △(mrr-hsd RMS-mcrBC)Ф80 lacZ M15 △lacX74 deoR recAl araD139 △(ara-leu)7697 galU galK rpsL endAl nupG6)是否可以共享:交换或其它7)联系方式:PM2)3)1)质粒图谱登记号:00242)质粒名称:pcDNA3.1-Myc-His-A-3)来源:invitrogen4)用途:真核核表达4))质粒图谱登记号:00252)质粒名称:pSUPER.neo3)来源:4)用途:siRNA5)是否可以提供更详细资料:可以6)是否可以共享:交换7)联系方式:PM)质粒图谱登记号:00312)质粒名称:pSilencer1.0-siRNA3)来源:Ambion4)用途:RNAi5)是否可以提供更详细资料:/techlib/Documents.html?fkResSxn=7&fkSub Sxn=236)是否可以共享:实验结束后,可提供含shRNA模板的质粒7)联系方式:pm5) )质粒图谱登记号:00322)质粒名称:pSilencer2.0-U6siRNA 3)来源:Ambion4)用途:RNAi ,与1.0相比,可以建立稳转株5)更详细资料:/techlib/prot/fm_7209.pdf 6)是否可以共享:交换 7)联系方式:pm6)会员名:mlluoE-mail:*************可提供试验资源名称和简要介绍:pSilencer 3.1-H1 neo Vector,是Ambion公司目前最高版本的shRNA 载体,为扩增此载体我已插入目的片段,如有战友需要,将此片段双酶切再连上自己的片段即可。

质粒图谱大全

质粒图谱大全

(转载)一. 九种表达载体Pllp-OmpA, pllp-STII, pMBP-P, pMBP-C,pET-GST, pET-Trx, pET-His, pET-CKS, pET-DsbA二. 克隆载体pTZ19RDNApUC57DNAPMD18TPQE30pUC18pUC19pTrcHisApTrxFuspRSET-ApRSET-BpVAX1PBR322pbv220pBluescriptIIKS( )L4440pCAMBIA-1301pMAL-p2XpGD926三.PET 系列表达载体ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETDsbFusionSystems39band40b ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETExpressionSystem33b ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETExpressionSystems ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETExpressionSystemsplusCompetentCells ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETGSTFusionSystems41and42 ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETNusAFusionSystems43.1and44 ProteinExpression?ProkaryoticExpression?pETVectorDNAProteinPurification?PurificationSystems?Strep?TactinResinsandPurificationKits四.PGEX 系列表达载体TEcoR?pGEX-1I/BAPpGEX-2TpGEX-2TKpGEX-3XpGEX-4T-1pGEX-4T-2pGEX-4T-3pGEX-5X-1pGEX-5X-2pGEX-5X-3pGEX-6P-1pGEX-6P-2pGEX-6P-3五.PTYBsystemPTYB1PTYB2PTYB11PTYB12六. 真核表达载体pCDNA3.1(-)pCDNA3.1( )pPICZalphaApGAPZα APYES2.0pBI121pEGFP-N1pEGFP-C1pPIC9KpPIC3.5K如何阅读分析质粒图谱载体主要有病毒和非病毒两大类, 其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。

质粒

质粒

pCMV-C-Flag质粒图谱pCMV-C-Flag质粒图谱pCMV-C-Flag的MCS:XmaI PstISacI Small BamHI HindIII651 GAGCTCCACC GCGGTGGCGG CCGCTCTAGC CCGGGCGGAT CCAAGCTTCTCTCGAGGTGG CGCCACCGCC GGCGAGATCG GGCCCGCCTA GGTTCGAAGAFlagEcoRI EcoRV SacI BglII XhoI XbaI D Y K D701 GCAGGAATTC GATATCGTCG ACAGATCTCT CGAGTCTAGA GATTACAAGGCGTCCTTAAG CTATAGCAGC TGTCTAGAGA GCTCAGATCT CTAATGTTCCtagD D D K ApaI751 ATGACGACGA TAAGTAAGGG CCCGGTACCT TAATTAATTA AGGTACCAGGTACTGCTGCT ATTCATTCCC GGGCCATGGA ATTAATTAAT TCCATGGTCC说明:1.该质粒的大小为4317bp2. Ori控制复制起始的位点,该质粒有两个复制位点,分别是:pUCori f1ori,是真核质粒。

3.该质粒图谱上的抗生素抗性基因有: Neor r/kanr4.该质粒的多克隆位点是MCS Flag tag,克隆携带外源基因片段。

5.该质粒有启动子pSV40,p bla,pCMV,可以使目的基因在增殖的细胞中稳定表达。

6.该质粒TkpA、SV40pA信号是加polyA信号,可以起到稳定mRNA的作用。

综上所述,该质粒有质粒所需的组成元素,是一个合格的质粒。

基因工程技术流程图。

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质粒图谱信息
一.九种表达载体
Pllp-OmpA, pllp-STII, pMBP-P, pMBP-C,
pET-GST, pET-Trx, pET-His, pET-CKS, pET-DsbA
二.克隆载体
pTZ19R DNA
pUC57 DNA
PMD18T
PQE30
pUC18
pUC19
pTrcHisA
pTrxFus
pRSET-A
pRSET-B
pV AX1
PBR322
pbv220
pBluescript II KS (+)
L4440
pCAMBIA-1301
pMAL-p2X
pGD926
三.PET系列表达载体
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pETDsb Fusion Systems 39b and 40b Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET Expression System 33b
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET Expression Systems
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET Expression Systems plus Competent Cells Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET GST Fusion Systems 41 and 42
Protein Expression » Prokaryotic Expression » pETNusA Fusion Systems 43.1 and 44 Protein Expression » Prokaryotic Expression » pET Vector DNA
Protein Purification » Purification Systems » Strep•Tactin Resins and Purification Kits
四.PGEX系列表达载体
T EcoR pGEX-1 I/BAP
pGEX-2T
pGEX-2TK
pGEX-3X
pGEX-4T-1
pGEX-4T-2
pGEX-4T-3
pGEX-5X-1
pGEX-5X-2
pGEX-5X-3
pGEX-6P-1
pGEX-6P-2
pGEX-6P-3
五.PTYB system
PTYB1
PTYB2
PTYB11
PTYB12
六.真核表达载体
pCDNA3.1(-)
pCDNA3.1(+)
pPICZ alpha A
pGAPZαA
PYES2.0
pBI121
pEGFP-N1
pEGFP-C1
pPIC9K
pPIC3.5K
如何阅读分析质粒图谱
载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种非病毒转基因载体。

一、质粒的组成要素
复制起始位点Ori:即控制复制起始的位点。

原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。

而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。

抗生素抗性基因:可以便于加以检测,如Amp+,Kan+
多克隆位点MCS:克隆携带外源基因片段
P/E:启动子/增强子
Terms:终止信号
加poly(A)信号:可以起到稳定mRNA作用
二、如何阅读质粒图谱
第一步:首先看Ori的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒)
第二步:再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。

(1)Ampr水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。

(2)tetr可以阻止四环素进入细胞。

(3)camr生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。

(4)neor(kanr)氨基糖苷磷酸转移酶使G418(长那霉素衍生物)失活
(5)hygr使潮霉素β失活。

第三步:看多克隆位点(MCS)。

它具有多个限制酶的单一切点。

便于外源基因的插入。

如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。

决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。

第四步:再看外源DNA插入片段大小。

质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。

一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。

第五步:是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。

这是用来区别克隆载体与表达载体。

克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。

选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。

启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号
启动子-促进DNA转录的DNA顺序,这个DNA区域常在基因或操纵子编码顺序的上游,是DNA分子上可以与RNApol特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。

λ
增强子/沉默子-为真核λ基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。

其作用与增强子所在的位置或方向无关。

即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。

/沉默子-负增强子,负调控序列。

核糖体结合位点/起始密码/SD序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是AUG(起始密码)和SD序列。

λ
转录终止顺序(终止子)/翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA 的保守序列,此位点down-stream有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。

结构基因的最后一个外显子中有一个AA TAAA的保守序列,此位点down-stream 有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。

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