ABI3730xl型测序仪日常维护标准操作规程(SOP)
3730测序流程

能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;
蛋白质与染色体DNA不复性而呈絮状,通过离心可
沉淀下来
碱裂法提取质粒操作步骤
菌体的培养
(挑单克隆或加少量菌液在含抗生素的培养基中,37℃震荡过夜培养
菌体的收集
(13000rpm离心1min,使菌体充分沉淀,弃上清)
质粒提取步骤一: 加入200ul I液 ,充分振荡,直到管底无沉菌为止 • 溶液I的组分:1.0M Tris-HCl / 0.5M EDTA, pH8.0,用前按比例加入RNase酶 • 溶液I的作用:菌体悬浮 • EDTA是在溶液I中主要起抑制DNase的作用 。 • 如果缺了溶液I,我们也可以用等体积的水或 LB培养基来悬浮菌体。 • 特别注意:菌体一定要悬浮均匀,不能有结 块。
五 上机操作
ABI 3730xl 自动测序仪外观图
胶泵
废液槽 POP7胶瓶 阳极缓冲液瓶 CCD检测窗口 缓冲液槽 水槽
96个样品自动进样及一体化16板自动进样样品架
已跑完板子放这 待上机样品放这
六 测序结果的分析处理
3730xl Sequence Map
测序结果峰图文件
Thanks!
ABI BigDye 3.1的组成成分
• • • • • • 测序酶 脱氧的dNTP 双脱氧的dNTP(荧光标记) Mg2+ ddH2O buffter
DNA测序模板用量
PCR产物
100-200 bp 200-500 bp 500-1000 bp 1000-2000 bp 2000 bp 1- 3 ng 3-10 ng 5-20 ng 10-40 ng 20-50 ng
RNase酶未加或失活
质粒提取步骤二: 加入300ul II液, 轻柔颠倒5~10次。 • 溶液II的组分: 0.4 N NaOH / 2% SDS; 两种溶 液等体积混合后使用 ,必须现用现配 • 溶液II的作用:裂解作用 • 溶液II在天气冷时会产生絮状沉淀,可温水预热 至沉淀消除。 • SDS是离子型表面活性剂。它主要作用是: a.溶解细胞膜上的脂质与蛋 白,从而破坏细胞膜。 b.解聚细胞中的核蛋白。 c.能使蛋白质变性而沉淀下来。
仪器设备维护规程

仪器设备维护规程一、设备保养1.1 定期检查设备使用情况,如发现异常情况应及时通知维修人员进行处理。
1.2 定期清洁设备表面,避免灰尘或杂物进入设备内部影响正常运行。
1.3 对设备的润滑部分进行定期保养,确保设备运转顺畅。
1.4 处于闲置状态的设备应定期开机运行,以避免长时间不使用导致设备故障。
二、设备维修2.1 当发现设备出现故障时,应立即停止使用,并通知维修人员进行检修处理。
2.2 维修人员应及时进行维修,并在维修完成后进行设备运行测试,确保设备正常。
2.3 对于更换零部件的情况,应选择符合要求的原厂零部件进行更换,保证设备的质量和性能。
2.4 维修后应定期对设备进行检查,确保设备运行正常。
三、设备保管3.1 设备使用完成后,应对设备进行清洁、整理,并存放在指定的场所。
3.2 设备存放时应避免受潮或受热,确保设备的正常使用。
3.3 对于易损耗易损件,应进行分类存放并标记使用寿命,及时更换。
3.4 设备在使用过程中应避免撞击或摔落,保证设备的完好性和安全性。
以上为仪器设备维护规程,希望全体员工能认真执行,保证设备的正常使用。
仪器设备是生产和工作中不可或缺的重要工具,对于设备的维护和保养,是保证设备稳定运行和延长设备寿命的关键。
因此,我们需要严格执行仪器设备维护规程,并进行相关管理和监督。
下面将继续探讨更多的维护内容以确保设备的稳定运行。
四、设备保养记录4.1 设备保养记录应当详细记录设备的维护情况,包括保养时间、内容、维修人员的签字等信息,并进行存档备查。
4.2 所有设备的保养记录应当进行分类归档管理,确保资料完整、准确、可查询。
4.3 对于定期维护和检查,应当在设备维护记录中注明具体的维护日期和维护内容,并进行定期审核和更新。
五、设备安全管理5.1 所有员工在使用设备前应接受相关的安全培训,了解设备的操作要点、安全注意事项和应急处理措施。
5.2 设备维护人员应了解设备的安全操作规程,并保持设备的安全性能,及时排除设备的安全隐患。
ABI测序仪简易使用20100106

评估定位结果: 各道的信号高度应该相差不大,间隔均一 96道毛细管一般为5或6,允许范围为4~8 48道毛细管为9~11) 确认所有毛细管都有信号
光谱校正
• 从图可以看到,四(或五)色荧光检 测系统的本质是检测四(或五)种荧 光素在其中心发射波长处的信号。由 于每一种荧光素的发射光谱不是锐线 光谱,而是 一种有一定宽度分布的光 谱带。所以一个纯荧光除在它自己光 谱的中心波长处能采 集到信号N1外, 在其他荧光信号光谱的中心波长处亦 能检测到信号而产生信号重叠。为了 校准信号重叠,需知道一种荧光信号 在其他荧光信号处产生的重叠系数。 所以,我们用四(或五)条不同长度 的DNA片断分别标记上不同的荧光 素来计算这些系数。
建立新的Analysis Protocol
Plate Manager:如何建立新的上样板
样品准备与上机
运行上样板
如何控制运行的程序
开始运行一个Run的程序
停止当前运行的板号 和 停止Run Scheduled中其他等待运行的板号 完成当前运行的板号 和 停止Run Scheduled中其他等待运行的板号 停止当前运行的板号 和 继续运行Run Scheduled中其他等待运行的板号
ABI公司 DNA测序仪器的应用
仪器硬件构造 3730XL
各部件功能
电源开关 打开或关闭仪器电源
照明灯开关
进样器按钮 阳极缓冲液杯
打开或关闭仪器内部的照明灯
使进样器抓取缓冲液槽到毛细管针端(或相反) 内装67毫升1X缓冲液,电泳时作为阳极介质 装1X缓冲液,电泳时作为阴极介质 装双蒸水,清洗毛细管用 装双蒸水,灌胶时盛放废胶 泵入胶并将其灌入毛细管 上装有阳极,阳极缓冲液杯装在此处 保证毛细管束的温度均一性和稳定性
测序仪安全操作及保养规程

测序仪安全操作及保养规程测序仪是生物医学研究中必不可少的仪器之一,它可以对生物样本进行多种测序分析,因此必须做好安全操作及保养工作,避免仪器的损坏和人员伤害。
下面将介绍测序仪安全操作及保养规程。
1. 安全操作1.1. 空气净化器测序仪需要在洁净的环境下运行,因此必须使用空气净化器。
安装空气净化器时,必须确保其在运行时没有噪声和振动,并且滤网及时更换。
1.2. 防护手套在操作测序仪时,必须戴防护手套,以避免手部受到样本和试剂的污染或有害物质的触碰。
1.3. 稳定电压测序仪需要稳定的电压才能正常运行。
建议使用稳定电源,避免电压突变导致仪器损坏。
1.4. 合理摆放测序仪应该放置在防潮、通风、干燥的地方,避免阳光直射。
同时,仪器周围应该保持干净整洁,避免灰尘进入机内。
1.5. 规范操作在使用测序仪前,必须确保操作人员已经接受过必要的培训,掌握了正确的操作流程和技术要领。
操作人员必须严格按照操作流程操作,避免操作失误导致仪器损坏或出现安全事故。
2. 保养规程2.1. 定期检查定期检查测序仪可以及时发现故障和磨损现象,避免损坏愈加严重,影响测序质量。
建议每周对仪器进行检查,包括传动部件、管路、散热器、滤网等。
2.2. 定期清洗测序仪的外壳和内部零件必须定期清洗。
渍液等污垢的积累不仅会影响测序质量,还会刺激操作人员的呼吸道和皮肤。
建议每季度对仪器进行全面的清洗,包括内部管路、面板、键盘等。
2.3. 及时更换耗材使用测序仪时,需要使用一些耗材,如滤芯、反应管、注射器等。
这些耗材通常有一定的使用寿命,必须及时更换。
建议根据实际使用情况,合理安排耗材更换时间。
2.4. 动物种类选择在进行测序操作前,必须选择适合的动物种类,避免使用有毒或易感染人的物种。
同时,在收集样本时必须遵守动物保护法律规定,避免非法采集。
3. 总结对于测序仪来说,安全操作和保养工作都至关重要。
仪器的损坏或人员伤害都会对实验产生很大影响,甚至会导致实验的失败。
基因测序仪仪器安全操作及保养规程

基因测序仪仪器安全操作及保养规程基因测序仪是一种非常重要的实验仪器,用于对DNA样本进行测序,是生物科学领域中的关键设备。
为保证实验过程的安全和设备的维护,本文将阐述基因测序仪的安全操作和保养规程。
安全操作规程1.1 实验前在开始实验前,必须检查仪器是否处于正常工作状态,如仪器有损坏或异常状况,则不得进行任何实验操作。
此外,还应该检查下列事项:•样品是否已经准备好,是否已经标注和保存好;•地面是否干燥,工作面是否平整;•是否有足够的试剂和耗材,如:RNA/DNA提取试剂、载玻片、PCR试剂盒等。
1.2 装置和操作在进行实验操作时,一定要遵守以下规定:•严格遵守安全操作规程;•穿着实验室制服和必要的个人保护用品,如手套、口罩、护目镜、实验室鞋等;•实验操作时,应该正确设置仪器参数,如温度、转速、体积等等;•仪器运行时,不要随意接近,保持安全距离;•禁止使用未经确认的试剂和耗材;•实验使用完毕后,应加入清洗操作。
1.3 废弃物管理实验过程产生的废弃物,需按照生物废弃物管理原则严格处理。
回收所有可回收的废弃物, 并将有害垃圾和血液等材料封装好,放置到指定位置等待生物废弃物处理。
2. 仪器维护规程不良维护和保养,会降低仪器性能、加快仪器的老化。
为使基因测序仪保持良好的工作状态,确保数据质量和可靠性,应定期进行维护保养:2.1 外部维护每个实验结束后,应进行以下维护:•清洁仪器表面,使用湿布和无刺激性清洁剂进行清洁;•清洁和更换样品仓的胶垫,防止仪器污染或失灵。
2.2 内部维护周期性的内部维护将保证基因测序仪的顺利运行,达到更优异的性能和更长寿命:•定期对反应试管仓进行清洗和消毒,以及更换零部件;•对滤光镜、标准灯和光源进行检查和清洁;•对光路的校正周期性进行检查,保证实验数据的准确性和重现性;•自动贴标纸需要定期清理,避免堆积拖慢系统运行效率;•在雾度过高的情况下,定期清洗纳米硅片,避免污染现象。
3. 仪器保养基因测序仪是非常重要的生物实验设备,为保证其长期稳定运行,我们应该按照以下要求进行保养:•对仪器进行外观检查,检查仪器表面是否有损坏;•定期更换压力表,避免强行使出现故障;•定期进行内部清洁,保证仪器的高性能和长寿命;•定期校准光路,保证实验数据的准确性和重现性;•在非实验时使用防尘罩,保持仪器的清洁和整洁。
3730XL基因分析仪的日常维护

• DELL维修电话:8008580950,8008582437
2011年6月24日星期五
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19
Thank you !
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15
每半年或一年要做的事情
• 更换毛细管或根据需要更换。 • 根据需要(如spatial信号变低等)可联系
工程师对机器进行保养
峰的左右不对称,后拖
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电脑的维护和保养
• • • • • •
每周进行一次重新启动 碎片整理 不装第三方软件 注意防病毒 定期备份数据,清理硬盘空间 清理数据库文件:cleanupDB.bat,cleanup processed plate
基因分析仪的日常维护
提
要
DNA测序仪的开机顺序与关机顺序 测序仪的日常维护和保养 测序仪所配电脑的日常维护和保养 测序仪常见故障及其处理方法
2011年6月24日星期五
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2
开机与关机
2011年6月24日星期五
——好的开头等于成功了一半
2011年6月24日星期五
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测序仪高通量基因分析安全操作及保养规程

测序仪高通量基因分析安全操作及保养规程1. 引言测序仪是一种用于高通量基因分析的重要设备,能够快速、准确地测序DNA或RNA样本。
为了确保测序仪的正常运行,保障实验室安全以及减少设备的故障率,本文档将介绍测序仪的安全操作规程以及保养维护规程。
2. 测序仪的安全操作规程为了确保实验室人员的安全以及设备的正常运行,需要遵守以下操作规程:2.1 实验室安全准备在使用测序仪前,必须确保实验室具备以下安全条件:•实验室空间应符合相关规定,并具备良好的通风系统;•实验室内应设置紧急停止按钮,并确保实验人员熟悉其位置和使用方法;•实验人员应佩戴适当的个人防护装备,如实验手套、护目镜等;•实验人员应接受相关安全操作培训,熟悉相关的应急处理措施。
2.2 测序仪操作步骤在操作测序仪时,应按照以下步骤进行:1.打开测序仪前,确保电源已经接好,且地线连接良好;2.检查设备外观,确保没有损坏或异物进入;3.打开设备电源,并按照设备说明书的要求进行初始化设置;4.准备样品,并按照测序仪的要求装载样品;5.设置测序参数,包括测序模式、测序深度等;6.启动测序仪,并耐心等待测序结束;7.测序结束后,关闭测序仪电源,并进行必要的数据处理和分析。
2.3 测序仪日常维护为延长测序仪的使用寿命,减少故障发生率,需要进行日常的维护工作:•定期清洁测序仪外壳和内部各个部件,注意避免使用含有腐蚀性或破坏性的溶剂;•定期检查和更换测序仪的滤芯和过滤器,确保流体系统正常运行;•定期校准测序仪的温度、湿度等参数,确保测序结果的准确性;•定期备份重要数据,并妥善存放以防丢失。
3. 结论本文档介绍了测序仪高通量基因分析的安全操作规程和保养维护规程。
通过遵守这些规程,可以保障实验室人员的安全,减少设备的故障发生率,提高测序结果的准确性和可靠性。
实验室人员在使用测序仪时必须严格遵守相关规程,确保实验的顺利进行。
3730XL 测序仪器操作指南说明书

3730XL 测序仪器操作指南开机:(1)打开显示器和电脑的电源开关,按键Ctrl+Alt+Delete ,输入密码125;(2)打开仪器电源开关,仪器初始化过程中电源旁指示灯由黄色闪烁20秒变为绿色;(3)双击打开桌面上Data Collection 软件,等待Service Console 窗口中的指示灯全部变成绿色后,DC 软件打开弹出。
关机:(1)与开机顺序相反,先点击Service Console 窗口上Stop ALL 按钮,等4个绿色小方框都变为红色圆圈时即可点击“X ”,关闭Run 3730 Data Collection 软件;(2)关闭仪器电源;(3)关闭电脑主机。
测序模板导入:(1) 当Data Collection 软件打开后,点击GA Instruments 3730, 点开“+”号;(2) 然后点击plate manager ,点击import 导入已经编辑好的模板(E:/plate manager ),最后点击open 就ok 了。
E: Plate manger (如何编辑模板)A. Copy 上一个编辑好的模板,按当天日期修改文件名(如20150630)B. 双击点击“是”(激活窗口点“关闭”)C. 将打开的EXCEL 表格中Container Name 和ID Plate 改为文件名(20150630)D. 将Sample Name 先修改为blankE.按列的顺序依次输入A1H1……A2H2,以此类推,空白孔不改,仍为blankF.点击左上角保存,点击是,跳出窗口G.点击右上角“X”关闭,跳出的窗口点击“不保存”运行程序:(1)打开Data Collection软件中的run schedule search advanced plate ID start with(例如20150630找到相应的测序表)点击add Done;(2)当软件左上方三角星由灰色变为绿色时,点击ok就开始运行程序,大约测序反应需要2.5小时,微卫星分析需要1小时。
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检查胶瓶中的胶以确认有足够的胶完成实验
每天或每次实验前
检查泵胶块和下胶块以确认其未松动
每天
清洁仪器表面、实验台表面
每天
检查毛细管旋钮,连接管螺帽和阀门以防止泄露
每天
每星期
维护工作
频率
使用Change Polymer向导换胶
每星期或需要时
检查旧毛细管的储存条件
每星期
使用注射器抽取20ml去离子水,清洗泵头的密封圈
每次实验前
更换溶液槽中的Buffer和水,确认槽的外围是干燥的
每48小时或每20个runs
更换water和waste溶液槽中的水,确认槽的外围是干燥的
每天或每20个runs
检查泵上下block、连接管、胶管和各通道中是否有气泡,使用Bubble Remove向导除去气泡
每天或每次实验前
检查毛细管的取样末端以确认其未损坏
每星期
使用去离子水浸泡胶垫,用自来水冲洗后再用去离子水洗一遍
每星期或需要时
每月
维护工作
频率
运行Water Wash向导,不管有无气泡,冲洗毛细管端口
每月或需要时
检查旧毛细管的储存条件
每月或需要时
每年
维护工作
频率
对机器内部进行除尘清洁,光路校正等整体保养
每年或需要时
需要时
维工作
频率
清洁漏液托盘
需要时
更换毛细管
需要时
去除毛细管末端已经干掉的胶,使用双蒸水湿润的无纤维布
需要时
使用无屑的棉球沾上无水乙醇轻轻擦拭毛细管检查窗口两端
每季度或空间、光谱校正时
ABI3730xl型测序仪日常维护标准操作规程(SOP)
每天
维护工作
频率
确认溶液槽中有足够的缓冲液和水
每次实验前
确认样品板被正确组装
重要!固定器和橡胶垫的孔必须对齐,否则会损坏毛细管
每次实验前
确认样品板牢靠平整地固定在托架上
重要!永远不要使用弯曲的样品板
每次实验前
检查阳极缓冲液杯中缓冲液的量,确认其溢液孔畅通且面朝仪器前方