高通量测序在生物学的应用
高通量测序技术在微生物遗传学中的应用
高通量测序技术在微生物遗传学中的应用随着科技的发展，高通量测序技术已经成为了最为普遍的基因分析技术之一。
而这项技术不仅适用于人类基因组，也被广泛应用于微生物遗传学领域。
一、高通量测序技术在微生物分类学中的应用传统的微生物分类学方法主要是通过形态、生理特征、生物化学反应等手段来对微生物进行分类。
但是这种方法需要大量的实验室工作和时间，且效率较低。
而高通量测序技术能够检测到微生物DNA中的所有基因信息，从而更准确地进行分类。
这一技术可以将物种鉴定的灵敏度提高到了基因水平，同时可以大幅缩短分类时间。
二、高通量测序技术在微生物进化学中的应用微生物的进化是微生物遗传学中的一个重要领域。
通过高通量测序技术，可以在微生物基因组中发现大量的基因变化和基因演化趋势。
同时，这项技术还可以确定微生物基因组内的单核苷酸多态性（SNP），从而研究微生物种群结构和演化路径。
这对于对新的疾病和传染病进行防治具有重要意义。
三、高通量测序技术在微生物生态学中的应用微生物在环境生态中扮演着至关重要的角色。
而高通量测序技术可以从一个生态系统中检测到大量的微生物群体的DNA信息，进而对其进行分类和生态位分析。
这项技术还可以帮助研究微生物的生长过程，以及在环境中的适应和反应情况。
这对于环境保护和生态修复方面都有着重要的意义。
四、高通量测序技术在微生物致病学中的应用微生物致病学是微生物遗传学中的核心领域之一。
而高通量测序技术可以通过分析微生物的基因表达和序列，来识别微生物的致病因素，并探究其生理过程。
此外，这项技术还可以检测和标记微生物的毒素基因和抗生素抗性基因，帮助医生更好地选择对应的治疗方案。
五、高通量测序技术在微生物基因工程中的应用微生物基因工程是微生物遗传学中的前沿技术之一。
通过高通量测序技术，可以对微生物基因组进行全面的分析和比较，从而选择合适的基因和目标细胞进行基因转移以执行特定功能。
现代医学和工程学对于微生物的利用越来越多，高通量测序技术在这个领域也将会有更多的应用。
高通量测序技术在生物学和医学中的应用
高通量测序技术在生物学和医学中的应用随着科技的发展，高通量测序技术已经在生物学和医学领域中得到广泛应用。
通过这种技术可以对DNA、RNA和蛋白质的序列进行高效、准确、快速的检测和分析。
本文将从以下几个方面阐述高通量测序技术在生物学和医学领域中的应用。
一、基因组测序在生物学领域中，高通量测序技术可以用于基因组测序。
基因组测序是一个非常庞大的项目，需要同时测定数百万个DNA片段的序列。
高通量测序技术可以极大地加快这一过程。
科学家可以通过高通量测序技术来解析不同物种基因组的序列信息，以了解物种的演化历史、生物学特征以及基因功能等。
同时，高通量测序技术还可以用于寻找一些罕见基因和基因变异，对于疾病遗传学的研究也非常重要。
二、转录组测序高通量测序技术还可以用于转录组测序。
转录组是指一个细胞或组织中的所有基因的RNA表达情况。
通过测定转录组测序，可以了解不同基因的表达模式以及不同条件下基因表达的变化情况，从而深入了解基因的功能。
而高通量测序技术可以对海量的RNA进行测序，并生成海量的数据，从而更准确地了解基因表达的情况。
三、蛋白质组学蛋白质组学是研究蛋白质结构、功能和相互作用的学科，它也可以得到高通量测序技术的应用。
通过高通量测序技术，可以检测海量的蛋白质样品，进而确定一些重要的蛋白质互作网络并发现不同的蛋白质组合，为研究蛋白质组学提供了良好的平台。
四、临床医学在临床医学中，高通量测序技术也具有广泛的应用前景。
高通量测序技术可以用于检测不同类型的基因突变，从而进行个性化治疗。
例如，在肿瘤治疗中，科学家可以通过高通量测序技术检测肿瘤细胞的基因组和转录组特征，进而定制个性化治疗方案。
总之，高通量测序技术已经成为生物学和医学领域中的一个重要工具。
它为科学家们提供了一种高效、准确、快速的任务处理方式，为我们了解生物世界和解决一些临床疑难病症提供了帮助。
我相信，在不久的将来，高通量测序技术将在生命科学领域发挥越来越重要的作用。
高通量测序技术在生物学中的应用
高通量测序技术在生物学中的应用随着DNA测序技术的不断发展，高通量测序技术已经成为了目前最主要的测序技术。
高通量测序技术具有测序速度快、数据量大、准确度高等优势，因此在生物学中得到了广泛的应用。
本文将从生物学角度出发，探讨高通量测序技术在生物学中的应用。
一、基因组学1. 组装完整基因组高通量测序技术可以在短时间内获取大量基因组序列，这使得组装完整基因组变得相对容易。
可以利用高通量测序技术对某个物种的全基因组进行测序，然后将碎片对齐组装成一条完整的染色体或者基因组序列。
这种方法可以为后续研究提供大量基础数据。
2. 鉴定基因组变异基因组中存在大量的单核苷酸多态性（SNP）和结构变异。
高通量测序技术可以通过对多个个体的基因组进行测序，快速鉴定基因组中的变异。
这种方法可以为后续研究基因组变异与个体表型相关性提供依据。
3. 种间基因组比较高通量测序技术可以获取多个物种的基因组序列，从而可以进行物种间基因组比较。
这种比较可以揭示不同物种基因组之间的相似性和差异性，进一步理解生命起源和进化历程。
二、转录组学高通量测序技术可以快速地测定转录物的表达量，寻找差异表达基因，揭示生物在不同环境和条件下的基因表达变化情况，为后续研究揭示转录调控机制提供依据。
目前，单细胞RNA测序技术的出现，更是使得我们可以在单个细胞水平上揭示基因的表达规律，这为微生物调控机制的研究提供了新思路。
三、表观组学表观遗传学研究的是基因组不同区域在基因调控中所起的作用，是基本生物过程的重要内容。
高通量测序技术可以精确获得高分辨率的基因组组蛋白修饰、DNA甲基化和基因变异等大量信息。
这些基因表观遗传信息的丰富获取，使得我们可以更加深入地探讨基因表观调控机制对生物的影响。
四、蛋白质组学蛋白质组学研究的是基于基因组水平的蛋白质表达情况，如何发掘蛋白质组数据是蛋白质组学发展的关键。
高通量测序技术的出现为蛋白质组学的发展提供了无限可能。
比如利用RNA甲基化信号分析方法，通过研究m6A甲基化调控下的转录后mRNA的翻译，对蛋白质的翻译转录模型进行深入研究。
高通量测序技术在生物学中的应用
高通量测序技术在生物学中的应用随着科学技术的迅猛发展，人类对生命科学的研究不断深入。
其中，高通量测序技术因其快速、高效、灵敏的特点而在生物学领域中得到了广泛的应用。
本文将从高通量测序技术的基本原理、应用范围以及未来发展进行阐述。
一、高通量测序技术的基本原理高通量测序技术通常采用Illumina测序平台，其基本原理是通过将DNA片段复制数倍，将其附着到芯片上进行测序。
其具体步骤如下：1. DNA片段制备：将DNA自然复制或选择性扩增，制备成片段。
2. 文库构建：将DNA片段连接到文库接头上，连接成带有DNA接头的文库。
3. 片段富集：通过PCR反应、聚焦PCR等技术，富集含有DNA接头的DNA片段。
这样可以更多地获得DNA片段，提高测序深度。
4. 片段绑定和桥式PCR：将DNA片段绑定到芯片上的接头上，通过桥式PCR反应扩增。
5. 测序：在适当的条件下，通过测序仪获取连续的碱基信号，并将其转化为数字信号。
最后将数字信号进行处理，得出序列结果。
上述流程有利于提高DNA片段的复制倍数，增加文库中DNA片段的数量，并利用PCR过程准确锁定DNA接头，避免单个DNA分子的序列测序误差问题。
二、高通量测序技术的应用范围1. 分子生物学：高通量测序技术可以用于快速测序基因、测序基因组、大规模测序转录组等。
由于高通量测序技术的快速性和高效性，可以更快地发现具有重要结构和功能的基因，从而推进基因治疗和生物工程的研究发展。
2. 生态学：高通量测序技术可以用来研究生态系统的物种多样性和互动关系。
通过对环境样本进行测序，可以得到环境中存在的细菌、真菌、古菌，以及一些双歧杆菌等微生物数据，有助于深入了解微生物的分布、多样性和生态功能。
3. 医学：高通量测序技术可以对人体DNA进行快速准确的测序。
可以利用病人基因进行相关健康问题的研究，为疾病的研究和患者治疗提供更准确的基础。
4. 植物学：高通量测序技术可以帮助科学家更快地了解和识别植物基因和代谢途径的生物学。
高通量测序在生物学研究中的应用
高通量测序在生物学研究中的应用高通量测序（High-throughput sequencing）是一种基于高速计算、高通量成像、高效加工的DNA测序技术，具有快速、准确、高效的特征，可以对整个基因组进行大规模的测序。
随着技术的不断升级和普及，高通量测序已经成为现代生物学研究的重要手段之一。
一、什么是高通量测序技术？高通量测序技术是一种利用大规模并行的方式对基因组进行测序的方法。
这种技术的出现，彻底改变了过去人们对基因组进行研究的方式。
在传统的Sanger测序技术中，只能进行单个序列的测序。
而高通量测序技术使用的Illumina、Roche 454和ABI SOLiD等平台可以一次性测序多达数百万个DNA片段，大大加快了测序的速度。
二、高通量测序技术的优势1.快速高通量测序技术可以在短时间内对大量的DNA信息进行分析和解读。
这对于生物学研究来说意义重大，因为它可以帮助科学家更快地获得关键数据，进而加快研究进程。
2.准确高通量测序技术是基于荧光成像或电化学检测技术，可以实现很高的准确度。
未经标记的DNA测序准确率达到99%以上，此外，通过并行测序可以减少测序偏差的影响。
3.高通量高通量测序技术可以一次性测序上百万组序列，这使得科学家可以进行更大规模、更广泛区域的基因组测序和比对分析。
4.低成本高通量测序技术能够在同等水平上降低了基因测序的成本。
这降低了研究人员的经济负担，提高了科研的效率。
5.低样本要求高通量测序技术能够使用非常少的DNA样本进行测序。
这使得科研人员可以使用少量样本进行测序，充分利用稀缺的样本资源，提高研究的效率和质量。
三、高通量测序技术在生物学研究中的应用大规模测序和基因组测序在生物学研究中的应用日益广泛，这得益于高通量测序技术的出现。
高通量测序技术在生物学研究中的应用越来越广泛，可以用于多样性研究、功能基因组学、进化生物学、疾病研究、人类基因组学等领域。
1.多样性研究高通量测序技术在多样性研究中得到了广泛的应用。
高通量测序技术及其在生物医学研究中的应用
高通量测序技术及其在生物医学研究中的应用随着生命科学的迅速发展，高通量测序技术成为生物医学研究中一项重要的技术手段。
本文将对高通量测序技术进行介绍，并探讨其在生物医学研究中的应用。
1. 高通量测序技术的概述高通量测序技术（Next-Generation Sequencing，简称NGS）是指一种通过并行测序多个DNA片段的技术。
相比传统的Sanger测序方法，高通量测序技术具有高通量、高效率、低成本等诸多优势，已经成为当前最主流的测序技术。
2. 高通量测序技术的原理与流程高通量测序技术主要包括DNA/RNA样品准备、文库构建、测序和数据分析等步骤。
首先，将DNA/RNA样品进行提取、纯化和检测，然后将DNA/RNA片段构建成文库，接着进行高通量测序，最后根据测序读数进行数据分析和解读。
3. 高通量测序技术在基因组测序中的应用高通量测序技术在基因组测序方面的应用非常广泛。
通过对整个基因组的测序，可以快速获得个体的遗传信息，并帮助发现与遗传性疾病相关的突变位点。
同时，高通量测序技术还能够检测基因组中的结构变异、复杂遗传变异等，为研究人类疾病提供了重要的信息。
4. 高通量测序技术在转录组学研究中的应用转录组学研究是对特定组织或细胞中所有RNA分子进行测序和分析的过程。
高通量测序技术的高通量性质使之成为转录组学研究的理想工具。
通过分析转录组数据，可以深入了解基因的表达模式、调控机制及与疾病的关联。
此外，高通量测序还可以帮助发现新的非编码RNA和RNA修饰等重要生物信息。
5. 高通量测序技术在表观遗传学研究中的应用高通量测序技术广泛应用于表观遗传学研究领域。
通过对DNA甲基化和组蛋白修饰等的测序，可以深入了解这些表观遗传标记在基因调控、发育和疾病中的作用机制。
高通量测序技术还可以帮助鉴定表观遗传标记的组合模式，从而更好地理解表观遗传调控网络的复杂性。
6. 高通量测序技术在单细胞测序中的应用传统的测序技术通常需要大量的细胞来获得足够的DNA或RNA。
高通量测序技术在生物信息学中的应用
高通量测序技术在生物信息学中的应用随着生物学的不断进步和发展，人们对生命本质属性的认识也在不断地深入，其中生物信息学作为一个崭新的学科，成为了这个领域内不可或缺的一环。
随着高通量测序技术的出现，人们对生物信息学的理解和应用又迈上了一个新的台阶。
本文将阐述高通量测序技术在生物信息学中的应用。
什么是高通量测序技术？首先，让我们来了解什么是高通量测序技术。
高通量测序是一种通过获得大量DNA或RNA序列来分析生物体遗传信息的技术。
它可以同时分析一大批DNA或RNA序列，将这些序列完全或部分地测序并比对到一个或多个参考序列上。
这种技术被广泛应用于整个生命科学领域，如基因组学、转录组学、表观基因组学和蛋白质组学等。
高通量测序技术的工作原理高通量测序技术的工作原理可以简单地分为以下步骤：第一步：准备样本。
样本可以是DNA或RNA，也可以是PCR 产物、文库等。
第二步：文库准备。
样本处理后，需要制备成文库。
这个过程可以是二代高通量测序技术所使用的序列文库制备方法，也可以是三代单分子测序技术所使用的直接测序法。
第三步：样本测序。
样本经过文库制备后，就可以进入样本测序的阶段。
二代高通量测序技术使用的是Illumina和ABI SOLiD 平台，而三代单分子测序技术使用的是Pacific Biosciences和Oxford Nanopore Technologies。
这些平台在数据生产、数据速度、数据量和数据质量等方面都有不同的特征。
第四步：数据分析。
样本的测序数据经过数据生产后，就需要将数据进行分析解读。
这个过程包括数据质控、比对、注释、变异分析等步骤。
高通量测序技术在生物信息学领域中有着广泛的应用。
下面将从不同的方面详细阐述它的应用：1.基因组学高通量测序技术的应用为生物学家们提供了一个更全面、更准确地研究基因组的方法。
通过对基因组中所有基因的测序和注释，可以深入了解基因与疾病的关系。
全基因组测序和重测序技术在短时间内完成了大量不同物种的DNA测序，包括人类、小鼠、大麦、酵母、病毒等等，这种技术得以更好的研究基因组变异、遗传最优性、表达及下调、基因本体、选择压力已经遗传漂变等等。
高通量测序技术在微生物学中的应用
高通量测序技术在微生物学中的应用随着生物技术的不断发展和进步，人们对微生物学的认识也愈发深刻。
微生物是构成生态系统中基本组成部分之一，其作用在医学、工业、环境等诸多领域都是至关重要的。
然而，传统的微生物学研究方法受到限制，比如对微生物种类、数量、生态学特征等方面的探究存在困难。
近年来，高通量测序技术在微生物学的研究中得以广泛应用，为微生物学的进一步发展带来了新的空间和机遇。
高通量测序技术是针对基因组和生物体中DNA/RNA序列的快速测序技术，其操作过程主要包括：文库构建、测序仪检测、数据分析和注释等环节。
此技术除了可以扩大检测范围外，还可以在数据分析和注释阶段提供更全面的生物信息学分析结果，如微生物的系统发育学分类、群落组成、基因功能等等。
与传统的微生物学研究方法相比，高通量测序技术可以同时对多个样品进行测序分析，得到更多的微生物种类、数量等生态学特征信息。
例如，科学家可以通过DNA/ RNA样品的测序，对微生物群落结构和组成进行分析，探寻生态系统中微生物间的相互作用关系。
同时，高通量测序技术的应用还可以针对某些特定的微生物分子机制或病原体进行相关研究，如蛋白结构分析、病毒进化分析等。
高通量测序技术在微生物学中的应用还可以用于进化学、生态学等方向的探究。
科学家可以通过转录组等数据，探究微生物的进化机制、适应性进化和种间差异等方面的内容，也可以利用遗传弱点区域等信息，研究微生物的遗传、发育等生物学特征。
同时，科学家也可以通过该技术，对微生物在环境中的行为及多样性进行研究和监测，从而为环境生态学的研究及环境污染控制提供有用信息和数据支持。
除了在研究领域中的应用，高通量测序技术在生物医学上的研究也有广泛的应用场景。
比如，医学检测、疾病诊断及治疗等方面的研究，一直是高通量测序技术应用的一大重点领域。
利用高通量测序技术，科学家们可以快速、准确地检测出多种微生物污染、合并感染等现象，为临床医学提供准确诊断提供了支持。
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Small RNA测序及其应用
多种技术平台联合应用完成火鸡基因组从头测序
454技术完成5倍测序深度；
GAII技术完成20倍测序深度；
Sanger技术完成6倍覆盖度
（Dalloul et al. PLoS Biol (2010)8:e1000475）
测序数据统计
火鸡基因组从头测序
结果：覆盖火鸡基因组 90%（0.92 /1.1Gb），发现6M SNP，预测 16K个基因。
第一次使用RNA-seq分析葡萄浆果发育过程中的基因转录差 异
应用RNA-seq分析葡萄浆果发育转录组
分析92,051剪切点，大约 0.8%剪切点参与385个基因 的可变剪切
与葡萄参考基因组（Pinot Noir 40024 ）比较，检测 到85870个eSNP
分析基因的可变剪切
应用RNA-seq分析葡萄浆果发育转录组
表明遗传上复杂的肿瘤可能包含很多部分冗余的突变，而且要识别 复发性致癌“驱动突变”（driver mutation），将需要对很多尚未 测序的样本进行测序。这些癌基因的发现对于未来研究肺癌靶向治 疗，以及基因突变具有重要的意义
MAPK信号通路中多个基因的突变的作用模式
应用全基因组测序技术在家系中分析遗传力
1
图像获得和处理
TGCT…
簇序列读取反应
2
3
TTTT…
4
高通量测序技术
TGCTACGAT…
1 2 3 4 5 6 7 8 9
TTTTTTTGT…
主要测序技术平台
Metzker, Nature Reviews Genetics (2010) 11:31
主要报告内容
高通量测序简介
从头测序及其应用 重测序及其应用 转录组测序及其80×以上
得到框架图或更高覆盖度
从头测序的数据分析和产出
从头测序的覆盖度指标
指标 框架图 精细图 覆盖基因组常染色体区域90%，覆盖基因区域95%，contig N50达到5Kb， scaffold N50达到20Kb，单碱基错误率在万分之一以下 覆盖基因组常染色体区域95%，覆盖基因区域98%， contig N50达到20Kb， scaffold N50达到300Kb，单碱基错误率在万分之一以下 完整的基因组序列，单碱基错误率在十万分之一以下
RNA是遗传信息的载体
应用RNA-seq分析葡萄浆果发育过程中转录组
有参考序列
意大利维罗纳大学
Vitis vinifera（葡萄）浆果发育三个阶段中（开花后5周、10 周和15周，即着果期、转色期和成熟期三种发育阶段中）的 转录组研究
数据量超过59M的36至44bp读长 ，82%的测序序列能够比对 到基因组上
(Lee et al. Nature (2010) 465:473)
测序数据统计
肺癌组织比较基因组研究
发现了超过5万个基因点突变，其中530个得到确认，它们 当中392个在编码区域，包括以前已知的变异，如KRAS“原 致癌基因”突变和放大
体细胞单核苷酸突变趋势和模式统计
肺癌组织比较基因组研究
Coach et al., Science (2010) 328 (597):636 – 639
应用全基因组测序技术在家系中分析遗传力
父母和子女的测序覆盖度分 别达到91%、85%、92%和 91% 与参考序列相比，96%序列 至少在一个家系成员中被检 测到，81%序列在家系四个 成员中都检测到
个人基因组计划（PGP）
/
哈佛医学院计算遗传中心主任George Church提出 PGP目标是创建一个包含100,000人、 公众可以公开访问的在线基因库，帮助 科学家了解基因之间的联系和遗传特征 现已公布了1000人的基因组序列 个人基因组测序是个性化医疗保健的基 础
犹他大学（University of utah），Complete Genomics公司， 华盛顿大学等 对一对夫妻和他们的两个孩子进行了全基因组测序。这家 的两个孩子都患有米勒综合征和原发性纤毛运动障碍，这 两种疾病都是常染色体隐性遗传病 测序深度分别为父亲 88倍，母亲51 倍，儿子52 倍，女儿 54 倍
火鸡和家鸡测序拼接结果
火鸡基因组从头测序
发现了数千个禽类特有的基因，尤其是性染色体基因研究令 人兴奋。
禽类中的特有基因
火鸡基因组从头测序
为研究者提供火鸡质量和数量生产性状和抗病候选基因， 加速了火鸡育种进展。
三种鸟类基因比对结果
与家鸡基因组比较火鸡基因组中20种基因家族的分布情况
四种禽类不同氨基酸含量情况
中科院上海生命科学院、北京基因组所 等六家科研机构 对150个水稻RIL系进行测序
利用Illumina GA，每16个样一个道，以3个碱基为标签， 测序读长为36碱基，每个样的测序深度约0.02倍
第一次利用全基因组重测序筛选SNP位点，对群体进行表 型分析
利用全基因组重测序分析表型差异
肺癌组织的比较基因组学研究
Genetech公司（已被罗氏制药收购）生物信息学与计算机生物学部， 与Complete Genomics公司合作 对一名烟龄超过15年，平均每天吸烟25根的原发性肺部肿瘤患者进行 分析，将这名患者的癌细胞和相邻正常组织的基因组进行测序 对癌细胞完成了60倍的测序深度，相邻正常组织完成了46倍的测序深 度。
Li et al., Nature (2009) 463：311-317
大熊猫基因组从头测序和组装
利用9个Sanger测序的BAC序 列评价测序的质量，表明98% 的BAC序列可以比对到 scaffold上
预测大熊猫约有21001个基因
大熊猫与人、狗和鼠的基因进化分析
测序数据与BAC序列比较
测序数据与NCBI参考基因组序列比较分析
测序数据统计
应用全基因组测序技术在家系中分析遗传力
通过比较两代之间的基因组序列，科学家 们对儿童基因组描绘出精确的重组图谱。 这让他们校正了70%的测序错误，使测序准 确率达99.999% 。使研究人员精确确定了 重组位点和稀有的单核苷酸多态性。 在他们最终的分析中，只保留了四个候选 基因的突变，包括已知在纤毛运动障碍中 突变的基因以及导致米勒综合征的变异体
基因组从头测40×以上
基因组杂合度达到60×以上
基因杂合度＞5%， 同时启动BAC-to-BAC测序
覆盖基因区估计
鉴定了浆果发育过程中的17324个 基因，其中的6695的基因是以时期 特异性方式表达的 分析浆果发育过程中的marker基因， 表明RNA-seq分析的准确性
运用RNA-seq对水稻转录组进行功能注释
高通量测序技术 在生物学中的应用
主要报告内容
高通量测序简介
从头测序及其应用 重测序及其应用 转录组测序及其应用
Small RNA测序及其应用
人类基因组从头测序分析
HGP项目：20世纪90年代美国能源部 资助启动人类基因组计划，六个国家 的科学家耗资4.37亿，于2000年完成 人类基因组工作草图。 方法和结果：应用分层shotgun+Sanger 测序法，结果预测了31,000个基因， 证明基因组的95%是非编码序列。 意义：人类基因组测序的完成标志着 分子医学时代的到来；此项目也催生 了高通量测序技术。
完成图
从头测序主要数据分析
覆盖度、深度评价 基因注释
原始数据
比对
组装结果统计
比较基因组 及进化分析
基因和基因组进化
蓝藻 ~1 Mb
线虫 ~100 Mb
果蝇>100 Mb
人 ~3,000 Mb
小鼠 ~3,000 Mb
生物进化谱系树
大鼠、小鼠 、狗、大熊猫、牛„„ 家鸡、火鸡„„ 拟南芥、水稻、杨树、 酿酒葡萄、短柄草、 黄瓜、高粱、玉米„„
分析两个亲本的基因组 差异发现个RILs发现了 1,493,461 SNP位点，即1 SNP/40kb
实验设计
利用全基因组重测序分析表型差异
与以前的该RILs的重组图谱比较分析，在150个RILs中鉴 定出2334个重组框，平均每个框的大小约164 kb 利用sliding window方法分析SNP位点与表型间的关系与 重组位点
大熊猫基因组从头测序和组装
意义：第一个完全运用高通量测序技术模式 完成的动物基因组 500 bp、2 kb、 5 kb 和10 kb不同插入片段，测序深度达73倍， 覆盖94%的基因组区域；获得2.7M SNP位点， 证明大熊猫仍然具备很高的杂合率和较高的遗 传多态性；
主要报告内容
高通量测序简介
从头测序及其应用 重测序及其应用 转录组测序及其应用
Small RNA测序及其应用
通过全基因组重测序分析鸡驯养过程中的位点选择
瑞士和美国科学家
对8个家鸡品系和1个野生品系进 行测序
该研究可以用于动物育种及提高 家鸡在生物医药研究模式动物中 的应用
缺失影响编码区的基因
测序数据统计
通过全基因组重测序分析鸡驯养过程中的位点选择
筛选到两个基因GHR（以 前验证）和SH3RF2在育种 中具有功能 在400个F8群体中分析 SH3RF2的缺失对鸡体重的 影响 表明SH3RF2是筛选不同鸡 品系的一个重要指标
分析SH3RF2基因
利用全基因组重测序分析表型差异
George Church 和他的研究团队
重测序意义
在个体或群体水平进行差异性分析
辅助分子育种，能够快速的进行种质资源普查筛 选 遗传进化分析及重要性状候选基因预测 遗传疾病分析
主要报告内容
高通量测序简介
从头测序及其应用 重测序及其应用 转录组测序及其应用
Small RNA测序及其应用