《分子生物学》实验指导(2015-2016)

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分子生物学实验步骤总结超全

分子生物学实验步骤总结超全

一目的基因的获得细菌基因组DNA的提取(一)仪器1)台式高速离心机2)恒温水浴箱3)枪式移液器4)灭菌的EP管和Tip头(二)试剂1)溶液1:25%蔗糖50mmol/LTris-Hcl,pH8.050mmol/LEDTA,pH8.0500ug/ml溶菌酶(现用现配)100ug/mlRNase2)溶液Ⅱ:100mmol/LTris-Hcl,pH8.01%SDS400ug/ml蛋白酶K3)酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)4)氯仿:异戊醇(24:1)5)3mol/LNaAc(pH5.2)6)异丙醇或无水乙醇7)70%乙醇8)TE缓冲液:10mmol/LTris-Hcl,pH8.01mmol/LEDTA,pH8.0(三)实验步骤1)5mL细菌过夜培养,5000rpm离心10分钟,去上清液。

2)将菌体细胞悬于250uL溶液1中,37°C水浴保温过夜。

3)加250uL溶液Ⅱ,55°C水浴保温4小时。

4)加0.9倍体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),轻轻混匀,于14000rpm离心10分钟,转移水相至新的Ep管,重复步骤4一次。

5)向转移的水相中加入0,9倍体积的氯仿/异戊醇(24:1),轻轻混匀,于14000rpm离心10分钟,转移水相至新的Ep管,重复步骤5一次。

6)向转移的水相中加入0.1倍体积的3mol/LNaAc和0.7倍体积的异丙醇(或2.5倍体积的无水乙醇),冰上放置30分钟。

7)14000rpm离心20分钟,弃上清,用0.5mL70%乙醇洗涤沉淀一次,弃上清,沉淀于室温干燥。

8)将DNA沉淀溶解于15ulTE缓冲液中,-20°C保存。

9)进行DNA含量和纯度检测,琼脂糖凝胶电泳鉴定。

植物DNA的SDS提取法:(一)试验试剂:1)研磨缓冲液:称取59.63gNaCl,13.25g柠檬酸三钠,37.2gEDTA-Na分别溶解后合并为一,用0.2mol/L的NaOH调至pH7.0,并定容至1000ml。

分子生物学实验技术全攻略

分子生物学实验技术全攻略

分子生物学实验技术目录实验一细菌的培养 2实验二质粒DNA的提取 3实验三紫外吸收法测定核酸浓度与纯度 4实验四水平式琼脂糖凝胶电泳法检测DNA 5实验五质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定 7实验六植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析 8实验七聚合酶链反应(PCR)技术体外扩增DNA 9实验八 RNA提取与纯化 11实验九 RT-PCR扩增目的基因cDNA 13实验十质粒载体和外源DNA的连接反应 15实验十一感受态细胞的制备及转化 16实验十二克隆的筛选和快速鉴定 18实验十三 DNA分析——Southern杂交 19一基本操作实验一、细菌培养实验二、质粒DNA提取实验三、紫外吸收法测定核酸浓度与纯度实验四、水平式琼脂糖凝胶电泳法检测DNA实验五、质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定实验六、植物基因组DNA提取、定量、酶切及电泳分析实验八、植物RNA提取及纯化二、目的基因获取实验七、聚合酶链式反应(PCR)技术体外扩增DNA实验九、RT-PCR扩增目的基因cDNA三、目的基因的克隆和表达实验十、质粒载体和外源DNA的连接反应实验十一、感受态细胞的制备及转化实验十二、克隆的筛选和快速鉴定实验十三、DNA分析——Southern杂交实验一细菌的培养一、目的学习细菌的培养方法及培养基的配置。

二、原理在基因工程实验和分子生物学实验中,细菌是不可缺少的实验材料。

质粒的保存、增殖和转化;基因文库的建立等都离不开细菌。

特别是常用的大肠杆菌。

大肠杆菌是含有长约3000kb的环状染色体的棒状细胞。

它能在仅含碳水化合物和提供氮、磷和微量元素的无机盐的培养基上快速生长。

当大肠杆菌在培养基中培养时,其开始裂殖前,先进入一个滞后期。

然后进入对数生长期,以20~30min复制一代的速度增殖。

最后,当培养基中的营养成分和氧耗尽或当培养基中废物的含量达到抑制细菌的快速生长的浓度时,菌体密度就达到一个比较恒定的值,这一时期叫做细菌生长的饱和期。

分子生物学实验方法与步骤【可编辑全文】

分子生物学实验方法与步骤【可编辑全文】

可编辑修改精选全文完整版分子生物学实验方法与步骤表达蛋白的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析一、原理细菌体中含有大量蛋白质,具有不同的电荷和分子量。

强阴离子去污剂SDS与某一还原剂并用,通过加热使蛋白质解离,大量的SDS 结合蛋白质,使其带相同密度的负电荷,在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)上,不同蛋白质的迁移率仅取决于分子量。

采用考马斯亮兰快速染色,可及时观察电泳分离效果。

因而根据预计表达蛋白的分子量,可筛选阳性表达的重组体。

二、试剂准备1、30%储备胶溶液:丙烯酰胺(Acr)29.0g,亚甲双丙烯酰胺(Bis)1.0g,混匀后加ddH2O,37O C溶解,定容至100ml, 棕色瓶存于室温。

2、1.5M Tris-HCl(pH 8.0:Tris 18.17g加ddH2O溶解, 浓盐酸调pH至8.0,定容至100ml。

3、1M Tris-HCl(pH 6.8:Tris 12.11 g加ddH2O溶解, 浓盐酸调pH至6.8,定容至100ml。

4、10% SDS:电泳级SDS 10.0 g加ddH2O 68℃助溶,浓盐酸调至pH 7.2,定容至100ml。

5、10电泳缓冲液(pH 8.3:Tris 3.02 g,甘氨酸18.8 g,10% SDS 10ml加ddH2O溶解, 定容至100ml。

6、10%过硫酸铵(AP): 1gAP加ddH2O至10ml。

7、2SDS电泳上样缓冲液:1M Tris-HCl (pH 6.82.5ml,-巯基乙醇1.0ml,SDS 0.6 g,甘油2.0ml,0.1%溴酚兰1.0ml,ddH2O 3.5ml。

8、考马斯亮兰染色液:考马斯亮兰0.25 g,甲醇225ml,冰醋酸 46ml,ddH2O 225ml。

9、脱色液:甲醇、冰醋酸、ddH2O以3∶1∶6配制而成。

二、操作步骤采用垂直式电泳槽装置(一)聚丙烯酰胺凝胶的配制1、分离胶(10%的配制:ddH2O 4.0ml30%储备胶 3.3ml1.5M Tris-HCl2.5ml10% SDS 0.1ml10% AP 0.1ml取1ml上述混合液,加TEMED(N,N,N’,N’-四甲基乙二胺10μl 封底,余加TEMED4μl ,混匀后灌入玻璃板间,以水封顶,注意使液面平。

分子生物学实验技术实验操作指南

分子生物学实验技术实验操作指南

《分子生物学实验技术实验操作指南》目录1 植物基因序列分析 (3)2 引物设计的原则 (4)3 试剂的配置和灭菌 (5)4 植物基因组DNA的提取 (6)5 DNA的定量 (8)6 DNA的电泳 (9)8 PCR产物的回收 (12)9 PCR产物连接T载体和感受态细胞的转化 (14)10 菌落(液)PCR (17)11 质粒DNA的提取 (19)12 质粒DNA的酶切 (21)1 植物基因序列分析1.基因组DNA(genomic DNA, gDNA):功能基因包括三个基本序列:5’上游区,转录区和3’下游区。

2.5’上游区和3’下游区:转录起始位点上游和转录终止位点下游的序列,主要起到基因表达调控作用。

3.转录区:转录起始位点和转录终止位点之间的序列,经核不均一RNA最终被加工为成熟的mRNA。

4.信使RNA(messenger RNA, mRNA):由DNA的一条链作为模板转录而来的,携带遗传信息的能指导蛋白合成的一类单链核糖核酸。

由编码区、上游的5’非编码区和下游3’非编码区组成,5’端带有7-甲基鸟苷-三磷酸帽子结构,3’端有多腺苷酸尾巴。

5.互补DNA(complementary DNA, cDNA):具有与某mRNA链呈互补的碱基序列的单链DNA。

6.蛋白质编码区(sequence coding for amino acids in protein, CDS):与蛋白质序列一一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列。

只有外显子,不含内含子。

7.5’非翻译区(5’-untranslated region, 5’UTR):mRNA位于基因转录起始位点至编码区翻译起始密码子之间顺序。

8.3’非翻译区(3’-untranslated region, 3’UTR):mRNA位于编码区翻译终止密码子下游一段不被翻译的序列。

2 引物设计的原则1.引物长度:一般为20-25bp。

若产物长度等于或小于500bp,可选用16-18bp的引物;若产物长达5kb,则需要用更长的引物。

分子生物学实验教案

分子生物学实验教案
本台操作压为垂直层流压,因此出风面与操作位置不应放置多余的物品,以免妨 碍气流的正常流动,影响洁净度,台面板上的孔作为通风孔,使用时避免有液体或其 他物品漏入空中,以免影响内部构件。风速可调。 使用:75%乙醇消毒 2-3 次,摆放好实验用品。插上电源,紫外消毒 30 分钟,启动风
机 5m 后关灯,关灯后 10 分钟打开照明灯,即可使用。 11. 电泳系统:
期保存在超低温环境下,就需要一个液氮罐(-196℃)具有经济、省力和较好地保 持细胞生物学特性的优点。 3.培养箱:37℃恒温箱用于细菌的固体培养和细胞培养。
CO2培养箱适用于培养各种细胞,可恒定地提供一定量的CO2(通常 5%),用来维 持培养液的酸度(pH值)。 37℃恒温空气摇床可进行液体细菌的培养。 4. 水浴锅:用于保温。 25-100℃水浴摇床可用于分子杂交试验,各种生物化学酶反应等试验的保温。 25-100℃水浴箱用于常规试验。 5. 烘箱:主用于烘干实验器皿,有些需要温度高些,有些需要温度低些。用于 RNA 方面 的实验用具,需要在 250℃烤箱中烘干,有些塑料用具只能在 42-45℃的烤箱中进行 烘干。 (二)水的净化装置:随着分子生物学的飞速发展,许多实验对水纯度的要求越来越高。 1. 蒸馏水皿:单蒸水常难以满足实验要求。双蒸水、三蒸水配液,许多实验要去离子水。
3
1. 真空加热干燥箱:核酸在硝酸纤维素膜和尼龙膜上固定,用于杂交实验。 2. 电泳凝胶干燥箱:电泳后的凝胶进行脱水干燥的仪器,一般可将凝胶干燥到一些玻
璃纸上,干燥后的凝胶易于保存。 3. 液氮冷冻干燥:适用于活性蛋白质样品的干燥与结晶。 4. 真空泵:许多实验都需要抽真空。如:乙醇沉淀后核酸样品的干燥,电泳凝胶的干
主用于核酸样品琼脂糖凝胶和 PCR 电泳结果的紫外观察和照像。 8. PCR 仪:PTC-200 基因扩增仪

分子生物学实验指导

分子生物学实验指导

实验一RT-PCR法钓取小鼠肝脏GAPDH基因一、TRlzol试剂提取小鼠肝脏总RNATRIzol RNA提取试剂盒是由GIBCOBRL公司推出的产品,其操作方法简捷、方便,lh之内即可完成,所制备的RNA可用于cDNA合成及Northern blot等。

【试剂】TRlZOL试剂氯仿异丙醇75%乙醇(DEPC水配制)无RNase水【操作方法】(1)收获细胞1~5×106;或50-100mg组织,加TRlzol试剂lml匀浆。

(2),移入1.5ml Ep管中,室温静置5min。

(3)每1ml TRIZOL中加氯仿0.2m1,摇振15s,置室温2~3min。

(4)4℃离心,12,000g×15min。

(5)仔细吸取上层水相,移至另一Ep管中。

(6)加0.5ml异丙醇,混匀,置室温10min。

(7)4℃离心,12,000g×10min。

(8)弃上清,加75%乙醇1m1,轻轻摇振,充分洗涤沉淀,4℃离心,7500g×5min。

(9)弃上清,真空干燥后,沉淀重悬于50μl无RNase水中。

一70℃保存备用。

二、核酸的定量(1)分光光度法测定核酸浓度。

组成核酸分子的碱基,均具有一定的吸收紫外线特性,最大吸收波长为250~270nm之间。

例如腺嘌呤的最大紫外线吸收值在260.5nm,胞嘧啶:267nm 鸟嘌呤:276nM胸腺嘧啶:264.5 nm尿嘧啶259nm。

这些碱基与戊糖、磷酸形成核苷酸后,其最大吸收峰不会改变,但核苷酸最大吸收波长是260nm,吸收低谷在230nm,这个物理特性为紫外分光光度法测定核酸溶液浓度提供了基础。

在波长260nm紫外线下,1OD值的光密度相当于双链DNA浓度为50ug/ ml;单链DNA或RNA为40ug/ml;单链寡核苷酸为20ug/ml。

另外,还可以通过测定260nm和280nm的紫外线吸收值,然后根据其比值来估计核酸的纯度。

DNA样品的比值为1.8,RNA样品的比值为2.0。

分子生物学检验完整版

分子生物学检验完整版

1病原生物基因组在医学上有何应用?详见书P3a菌种鉴定b确定病毒感染和病毒载量c病毒分析d细菌耐药监测和分子流行病学调查2什么是原癌基因,原癌基因有什么特性,原癌基因可以分为哪些种类以及原癌基因常见的激活机制有哪些?原癌基因是指人类或其他动物细胞(以及致癌病毒)固有的一类基因,能诱导细胞正常转化并使之获得新生物特征的基因总称。

特性:进化上高度保守,负责调控正常细胞生命活动,可以转化为癌基因。

功能分类:生长因子,生长因子受体,信号转导蛋白,核调节蛋白,细胞周期调节蛋白,抑制凋亡蛋白激活机制:插入激活,基因重排,基因点突变,基因扩增,基因转录改变3试述Down综合征(21三体综合征)的主要临床特征及核型。

临床特征:生长发育障碍,智力低。

呆滞面容,又称伸舌样痴呆。

40%患者有先天性心脏畸形。

肌张力低,50%患者有贯通手,男患者无生育能力,女患者少数有生育能力,遗传风险高。

核型:92.5%患者游离型:核型为47,XX(XY),+212.5%患者为嵌合型:46,XX(XY)/47,XX(XY),+215%患者为易位型:46,XX(XY),-14,+t(14q21q)4简述淋球菌感染的主要传统实验室诊断方法及其主要特点,对比分析分子生物学方法的优势1直接涂片染镜检:敏感度和特异性差,不能用于确诊。

2分离培养法:诊断NG感染的金标准,但是其对标本和培养及营养要求高,培养周期长,出报告慢,难以满足临床要求。

3免疫学法:分泌物标本中的非特异性反应严重以及抗体法间的稳定性和条件限制,推广受限。

分子生物学的优点:敏感,特异,可直接从了临床标本中检出含量很低的病原菌,适应于快速检测5、在单基因遗传病的分子生物学检验中,点突变检测常用方法有哪些?1异源双链分析法(HA)2突变体富集PCR法3变性梯度凝胶电泳法4化学切割错配法5等位基因特异性寡核苷酸分析法6DNA芯片技术7连接酶链反应8等位基因特异性扩增法9RNA酶A切割法10染色体原位杂交11荧光原位杂交技术6、简述白假丝酵母菌的分子生物学检验方法白假丝酵母菌分子生物学检验主要包括白假丝酵母菌特异性核酸(DNA RNA)的检测、基因分型和耐药基因分析等。

分子生物学实验指导

分子生物学实验指导

北京化工大学分子生物学实验指导实验一 少量质粒DNA的制备一、实验目的(1)了解质粒的特性及其在分子生物学研究中的作用。

(2)掌握质粒DNA分离、纯化的原理。

(3)学习碱裂解法分离质粒DNA的方法。

二、实验原理质粒(plasmid)是一种双链的共价闭环状的DNA分子,它是染色体外能够稳定遗传得因子。

质粒具有复制和控制机构,能够在细胞质中独立自主地进行自身复制,并使子代细胞保持它们恒定的拷贝数。

从细胞生存来看,没有质粒存在,基本上不妨碍细胞的存活,因此质粒是寄生性的复制子。

根据质粒的这种特性,通常采用DNA体外重组技术和微生物转化等基因工程的技术和方法,使重组到质粒的某种基因(如干扰素基因)带进受体细胞(如具有一定特性的大肠杆菌细胞等)表达它的遗传性质,改变或修饰寄主细胞原有的代谢产物,或产生新的物质(如干扰素)。

目前,质粒已广泛地用作基因工程中的DNA分子无性繁殖的运载体,同时它也是研究DNA结构与功能的较好模型。

在细菌细胞中,质粒DNA通常为染色体DNA的2%左右,但是细菌质粒DNA的含量与其复制类型有关。

质粒在细胞内的复制,一般分为两种类型:严密控制(stringent control)复制型和松弛控制型(relaxed control)复制型。

严密控制复制型的质粒只在细胞周期的一定阶段进行复制,染色体不复制时,质粒也不复制。

每个细胞内只含1个或几个质粒分子(即有1个或几个拷贝)。

松弛控制复制型的质粒在整个细胞周期中随时可以复制,当染色体复制已经停止时,该质粒仍然能够继续复制。

该质粒在一个细胞内有许多拷贝,一般在20个以上,例如col E1 质粒(含有产生大肠杆菌素E1 基因)及其衍生质粒,在每个细胞内约有20多个拷贝。

所有分离质粒DNA的方法都包括3个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细菌;分离和纯化质粒DNA。

目前应用于质体DNA的纯化或抽取的方法众多,例如碱溶裂法(alkaline lysis)、热裂解法(boiling method)、氯化铯(CsCl)纯化法,及市售柱层析套管法等。

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《分子生物学》实验指导实验1 总DNA提取生物总DNA的提取是分子生物学实验的一个重要内容。

由于不同的生物材料细胞壁的结构和组成不同,而细胞壁结构的破坏是提取总DNA的关键步骤。

同时细胞内的物质也根据生物种类的不同而有差异,因此不同生物采用的提取方法也不同,一般要根据具体的情况来设计实验方法。

本实验介绍采用CTAB法提取植物总DNA的技术。

[实验目的]学习和掌握学习CTAB法提取植物总DNA的基本原理和实验技术。

学习和掌握紫外光吸收法鉴定DNA的纯度和浓度。

[实验原理]植物叶片经液氮研磨,可使细胞壁破裂,加入去污剂(如CTAB),可使核蛋白体解析,然后使蛋白和多糖杂质沉淀,DNA进入水相,再用酚、氯仿抽提纯化。

本实验采用CTAB法,其主要作用是破膜。

CTAB 是一种非离子去污剂,能溶解膜蛋白与脂肪,也可解聚核蛋白。

植物材料在CTAB的处理下,结合65℃水浴使细胞裂解、蛋白质变性、DNA 被释放出来。

CTAB与核酸形成复合物,此复合物在高盐(>0.7mM)浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度(0.1-0.5mM NaCl)下CTAB-核酸复合物就因溶解度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。

经过氯仿/ 异戊醇(24:1) 抽提去除蛋白质、多糖、色素等来纯化DNA,最后经异丙醇或乙醇等沉淀剂将DNA沉淀分离出来。

由于核酸、蛋白质、多糖在特定的紫外波长都有特征吸收。

核酸及其衍生物的紫外吸收高峰在260nm。

纯的DNA样品A260/280≈1.8,纯的RNA样品A260/280≈2.0,并且1μg/ml DNA 溶液A260=0.020。

[实验器材]1、高压灭菌锅2、冰箱3、恒温水浴锅4、高速冷冻离心机5、紫外分光光度计6、剪刀7、陶瓷研钵和杵子8、磨口锥形瓶(50ml)9、滴管10、细玻棒11、小烧杯(50ml)12、离心管(50ml)13、植物材料[实验试剂]1、3×CTAB buffer(pH8.0)100mM Tris25mM EDTA1.5M NaCl3% CTAB2% β-巯基乙醇2、TE缓冲液(pH8.0)10mmol/L Tris·HCl1mmol/L EDTA3、氯仿-异戊醇混合液(24:1,V/V)4、95%乙醇5、液氮[实验步骤]1、称取2g新鲜的植物叶片,用蒸馏水冲洗叶面,滤纸吸干水分。

2、将叶片剪成1cm长,置预冷的研钵中,倒入液氮,尽快研磨成粉末。

3、待液氮蒸发完后,加入15mL预热(60℃)的CTAB提取缓冲液,转入一磨口锥形瓶中,置于65℃水浴保温0.5h,不时地轻轻摇动混匀。

4、加等体积的氯仿/异戊醇,盖上瓶塞,温和摇动,使成乳状液。

5、将锥形瓶中的液体倒入50ml离心管中,在4℃下8000rpm离心10min。

6、离心管中出现3层,用滴管小心地将上层清液吸入另一干净的离心管中,弃去中间层的细胞碎片和变性蛋白以及下层的氯仿。

(根据需要,上清液可用氯仿/异戊醇反复提取多次。

)7、收集上层清液,并将其倒入小烧杯。

沿烧杯壁慢慢加入2倍体积预冷的95%乙醇。

边加边用细玻棒沿同一方向搅动,可看到纤维状的沉淀(主要为DNA)迅速缠绕在玻棒上。

8、小心取下这些纤维状沉淀,加1~2 mL 70%乙醇冲洗沉淀,轻摇几分钟,除去乙醇,即为DNA粗制品。

9、将粗制品溶于TE缓冲液。

10、在分光光度计上测定该溶液在260nm/280nm紫外光波长下的光密度值。

[注意事项]1、液氮研磨时,小心操作,以免冻伤。

2、所有操作均需温和,避免剧烈震荡。

[思考题]CTAB、EDTA、巯基乙醇的作用分别是什么?液氮研磨的原理是什么?实验二质粒DNA的提取质粒DNA是分子生物学实验中广泛应用的载体分子。

质粒是细菌独立于染色体外的遗传物质,是环状的双链DNA分子。

由于质粒比较小,并且能进行独立的自我复制,常常被改造为克隆和表达的载体分子。

[实验目的]通过本实验掌握碱裂解法提取质粒的基本原理,掌握碱裂解小量提取质粒的实验技术。

[实验原理]碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。

在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭合环状质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。

当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

[实验器材]1、恒温培养箱2、恒温摇床3、台式离心机4、高压灭菌锅5、Tip头、Eppendorg管6、含有目的质粒的E.coli菌株[实验试剂]1、溶液I50mmol/L 葡萄糖5 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl10mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0)2、溶液II0.4mol/L NaOH , 2% SDS ,用前等体积混合3、溶液III5mol/L乙酸钾60mL冰乙酸11.5mL水28.5mL4、TE缓冲液10mmol/L Tris·HCl1mmol/L EDTA(pH8.0)5、70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回)6、EcoRI 及其缓冲液7、HindIII及其缓冲液[实验步骤]1、将含有目的质粒的E.coli菌株接种于LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜。

2、取1ml培养物倒入Eppendorf管中,12000r/min离心30sec。

3、吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。

4、将细菌沉淀悬浮于100μL冰预冷的溶液I中,剧烈振荡。

5、加200μL溶液II(新鲜配制),盖紧管皿,快速颠倒5次,混匀内容物,将Eppendorf 管放在冰上。

6、加入150μL溶液III(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀,冰上放置5min。

7、12000r/min,离心5min,将上清液转至另一Eppendorf管中。

8、向上清液加入等体积的饱和酚,混匀。

9、12000r/min,离心5min,将上清液转至另一Eppendorf管中。

10、向上清液加入2倍体积乙醇,混匀后,室温放置5~10min。

12000r/min离心5min。

倒去上清液,把Eppendorf管倒扣在吸水纸上,吸干液体。

11、1ml 70%乙醇洗涤质粒DNA沉淀,振荡并离心,倒去上清液,真空抽干或空气中干燥。

12、20μL TE缓冲液,使DNA完全溶解,-20℃保存。

[注意事项]操作时,避免剧烈震荡。

[思考题]1、实验操作中,饱和酚的作用是什么?2、SDS和NaOH的作用是什么?[参考文献]《精编分子生物学实验指南》(第四版)[美] F M奥斯伯,R E 金斯顿等主编科学出版社2005实验三总RNA提取【目的和要求】1.掌握样品中总RNA的提取的原理和方法。

2.熟悉RNA纯度及浓度检测方法。

3.了解RNA提取过程中的注意事项。

【实验原理】RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。

对RNA进行操作在分子生物学中占有重要地位。

获得高纯度和完整的RNA是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。

由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。

再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。

在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase活性,保护RNA分子不被降解。

因此提取必须在无RNase的环境中进行。

可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。

提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性,并有助于除去非核酸成分。

【教学内容】1.总RNA提取的基本原理和常用方法介绍2.进行动物组织或血液样品总RNA提取。

3.对提取的RNA的进行纯度和浓度检测。

【实验器材和试剂】超净工作台、高速冷冻离心机、电泳仪、紫外分光光度计、凝胶成像系统、振荡器、移液器、吸头、Ep管、玻璃匀浆器、试管。

玻璃器皿洗净后置180℃烘烤8h;不耐高温的器皿(如塑料制品)应用0.1% DEPC浸泡2h,70~80℃烘烤干燥,120℃高压20min,再70~80℃烘烤干燥方可使用。

细胞裂解液:异硫氰酸胍4mol/L;柠檬酸钠(pH7.0)25mmol/L;十二烷基肌氨酸钠0.5%;β-巯基乙醇0.1mol/L(称取柠檬酸钠0.64g,十二烷基肌氨酸钠0.415g,吸取β-巯基乙醇0.7ml,用无Rnase的蒸馏水溶解,定容至50ml。

然后取以上配制的溶液(CBS液)33ml,异硫氰酸胍25g,混合,完全溶解后4℃保存备用)TRIzol RNA抽提试剂、2mol醋酸钠、0.1% DEPC、平衡酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)、氯仿、无水乙醇、异丙醇、75%乙醇(用RNase-free水配制)、RNase-free的水。

【实验方法】(一)异硫氰酸胍法(PLT)1.取新鲜动物组织0.1~0.2g置于组织匀浆器中,加入预冷的细胞裂解液1ml,在冰浴中迅速匀浆15~30s,以充分研碎组织。

然后将细胞悬浮液吸入另一试管中。

2.加入2mol醋酸钠(pH4.0)120μl,充分混匀。

3.加入1.2ml酚:氯仿:异戊醇,充分混匀摇振10s,冰浴15min。

4.将混合物转移至1.5ml Ep管中,4℃,离心10 000r/min,20min.5.移取上层水相至另一Ep管中,加入等体积的异丙醇,静置-20℃,30min沉淀RNA.6.4℃,离心12 000r/min,15min.7.弃上清液,加入70%乙醇400μl,洗涤RNA沉淀物;如果RNA沉淀物被悬浮,则4℃离心10 000r/min,10min。

8.弃上清液,自然干燥,但应避免沉淀完全干燥,否则RNA难以溶解。

9.加入100μl无RNase水重悬RNA,或加1ml无水乙醇和1/10体积3mol醋酸钠(pH4.0),-70℃保存。

(二)Trizol Reagent/总RNA提取试剂TRIzol是从细胞和组织中提取总RNA的即用型试剂,在样品裂解或匀浆过程中,TRIzol能保持RNA完整性。

加入氯仿后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。

取出水相,用异丙醇可沉淀回收RNA。

下面介绍由上海美季生物技术有限公司总RNA提取试剂推荐的操作步骤:1. 匀浆处理(Homogenization)(1)组织中提取总RNA①植物组织:植物叶片直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨成粉末,每50-100mg 植物叶片加入1ml TRIzol。

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