SciFinder离线结构编辑器使用说明
SciFinder离线结构编辑器使用说明
如果已经成功安装了Java后还是不能正常使用,您也可以下载SciFinder离线结构编辑器,该编辑器具有强大的绘图功能,并允许用户创建离线导入到SciFinder 的结构查询。
下面是详细的使用说明,请参考:
Using the CAS Structure Editor
•运行CAS结构编辑器,如果您想立即将结构导入scifinder中并进行检索,可以同时登陆scifinder
•使用独立编辑器绘制结构,就像你使用SciFinder中基于Java的编辑器一样(注意:独立结构编辑器不支持SMILES,InChl,和CAS号转换功能。
独立结构编辑器中也不包括分子式和分子量的状态栏)。
•如果需要,在Preferences首选项中启动化合价检测功能(独立结构编辑器不支持其他任何验证)
•当您画完结构后,点击Export,将结构保存成cxf文件
进入SciFinder后,点击Explore Substances -> Chemical Structure,点击Browse预览功能导入您保存过的cxf文件,选择您想要的结构检索类型,点击search;对于反应检索也一样,点击go to Explore Reactions -> Reaction Structure,导入您需要检索的结构进行查询
•检索结果呈现形式与通过scifinder中的在线结构编辑面板检索一样,您可以进一步对结果集进行查看和分析
•如果您需要对结构进行修改或限定,您需要返回到CAS 结构编辑器中再进行编辑,将修改后的结构保存成cxf后,继续在scifinder中进行后处理。
SciFinder使用指南(图示讲解)
A
35
反应物中没有硫 醇的缩硫醛化反 应共330个
A
36
A
37
A
38
对1,4,5,8-萘四酰二亚胺的修饰
物质的盐,同位素,混合物,聚合物 查询物质是目标物质的一部分
环锁定工具
结构与查询物质相似,但不相同
原子锁定工具,被锁定的原子不允许接取代基
A代表氮原子链接除氢原子外的任何基团
A
39
符合检索条件的物质共有2013个
反应结构式 反应产率 反应步数 反应类别
A
31
重复基团工具,乙基的数目可以为1-5个,扩大硫醇范围
A
32
获取所有反应物 中有硫醇的反应
如果要用到 combine功 能一定要存 储为sfr格式
A
33
退回到所有缩硫 醛化反应的界面
A
34
两次结果之和
两次结果重合的部分 结果A去除结果B的部分 结果B去除结果A的部分
A
46
例二 得到具备一定条件的结构信息
问题: ➢存在多少种环结构 ➢X= F,Cl, Br,I 分别有多少种物质 ➢R1=H,OH,X分别有多少物质
R1= H,OH,X R2= O,S
A
47
检索物质的途径
主题检索 Explore
Research Topic
文献链接物质。Get Related
按化学结构 检索化学反应
A
8
用介词of, with, by, beyond 连接关键词,不要使用布 尔逻辑符
选择有“Concept”和“closely associated”字样的检索结果
A
9
选择框
检索结果数目
A
SciFinder使用说明
第三章 物质检索 ......................... 29
3.1 物质检索概览及物质结果界面 .............................................................................................................. 29 3.1.1 物质检索(Explore Substances)........................................................................................... 29 3.1.2 物质检索答案集的界面 .............................................................................................................. 29 3.2 物质标识符检索(Explore Substances by Substance Identifier) ........................................... 31 3.2.1 概览 .............................................................................................................................................. 32 3.2.2 检索举例 ...................................................................................................................................... 32 3.2.3 物质详情 ...................................................................................................................................... 33 3.2.4 物质标准菜单 .............................................................................................................................. 36 3.3 结构编辑器(Structure Editor)....................................................................................................... 37 3.3.1 启动结构编辑器的方法 .............................................................................................................. 37 3.3.2 结构编辑器的构成 ...................................................................................................................... 39 3.4 结构检索 .................................................................................................................................................. 63 3.4.1 概览 .............................................................................................................................................. 63 3.4.2 精确结构检索(Exact research)............................................................................................... 63 3.4.3 亚结构检索(Substructure Search)..................................................................................... 70 3.4.4 相似结构检索 .............................................................................................................................. 89 3.5 Markush 检索 .......................................................................................................................................... 96 3.5.1 概览 .............................................................................................................................................. 96 3.5.2 检索方法举例 .............................................................................................................................. 97 3.6 分子式检索(Molecular Formula)..................................................................................................... 98 3.6.1 分子式输入规则: ...................................................................................................................... 98 3.6.2 分子式检索举例 .......................................................................................................................... 99
scifinder介绍及使用教程
Scifinder 的功能和特点
检索功能
Scifinder 支持关键词、化合 物结构、反应式等多种检索 方式,方便用户快速找到所 需信息。
结构绘图
Scifinder 内置了强大的化学 结构绘图功能,用户可以方 便地绘制和修改化学结构。
数据筛选
Scifinder 支持对检索结果进 行筛选,用户可以根据需要 选择符合特定条件的文献和 数据。
如何正确使用相似结构检索功能
总结词
理解相似结构的概念
详细描述
相似结构检索是指通过输入一个化学结构或分子式,在 Scifinder 中查找与之相似的其他分子或化合物。在使用 此功能之前,需要先了解相似结构的定义和判断标准。
总结词
选择合适的相似度阈值
详细描述
在相似结构检索中,需要选择一个合适的相似度阈值来限 定相似度的范围。不同的阈值会导致不同的检索结果,用 户可以根据实际需求选择合适的阈值。
总结词
结合其他检索条件使用
详细描述
在使用相似结构检索功能时,可以结合其他检索条件如关 键词、分子属性等进行综合检索,以获得更精确的结果。
THANKS
03
还可以设置Scifinder的个性化推送和提醒功能,以便更好 地使用Scifinder。
03 Scifinder 检索功能
基本检索
简单易用
Scifinder的基本检索功能为用户提供了一个简单易用的界面,用户只需输入关键词,即可快速检索到相关的科研文献、专利 和化学物质信息。
高级检索
高级筛选
如何解决检索结果为空的问题
总结词
无效的检索条件
详细描述
当检索结果为空时,可能是由于输入的检索条件无效或过 于宽泛所致。请检查检索条件是否正确,并尝试缩小检索 范围或使用更具体的关键词进行检索。
scifinder化学结构式检索
scifinder化学结构式检索Scifinder是一种化学结构式检索工具,被广泛应用于化学领域的研究和学习中。
它可以帮助研究人员快速搜索和获取化合物的相关信息,如化学结构、物理性质、合成方法、毒性数据等。
本文将介绍Scifinder的基本功能和使用方法,帮助读者更好地利用这一工具进行化学研究。
我们需要了解Scifinder的主要功能。
Scifinder可以通过输入化合物的化学结构式、名称、化学式等关键词来进行检索。
它可以提供相关化合物的详细信息,包括化学结构、分子量、密度、熔点、沸点、溶解度等物理性质。
此外,Scifinder还可以提供该化合物的合成方法、合成路线,以及相关文献的引用信息。
这些功能使得研究人员可以快速获取化合物的相关信息,为科学研究提供有力支持。
接下来,我们将介绍Scifinder的使用方法。
首先,我们需要打开Scifinder的网页,然后输入所需检索的化合物关键词。
在输入关键词后,Scifinder会自动进行匹配,并列出相关化合物的列表。
我们可以根据需要选择其中的某个化合物进行详细查看。
在详细信息页面,我们可以看到该化合物的化学结构式、物理性质、合成方法等详细信息。
同时,Scifinder还会显示与该化合物相关的文献引用信息,方便研究人员进一步了解其研究背景和应用领域。
除了基本的化学结构式检索,Scifinder还提供了一些高级功能。
例如,它可以通过输入两个或多个化合物的化学结构式,进行化学反应的检索和预测。
这对于有机合成化学研究非常有用,可以帮助研究人员找到合适的反应条件和合成路线。
此外,Scifinder还可以根据化合物的物理性质和毒性数据等进行筛选和排序,帮助研究人员选择合适的化合物进行实验或应用。
Scifinder是一种非常有用的化学结构式检索工具,可以帮助研究人员快速获取化合物的相关信息。
它的功能强大,使用方便,适用于化学研究的不同阶段和领域。
通过合理利用Scifinder,研究人员可以更加高效地进行科学研究,促进化学领域的发展和进步。
scifinder使用手册
研发工具Scifinder《使用说明书》第一章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统支持的检索方式:主题检索、物质名称检索、分子式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与二次检索。
作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统:Scifinder不仅仅包含有分子式、反应式和结构式(包括亚结构检索)等多种检索功能,而且在得到初步检索结果的基础上还可以进一步利用超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。
它已经超越了检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。
包含的信息量:大于2600万条文章记录;3000多万个有机无机物质,5800多万生物序列,1100多万条单步多步反应。
信息时效:1907年-至今1.1.2 原文下载系统Scifinder具有强大的期刊和专利链接,收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发行机构的专利文献中公布的研究成果,占全球化工信息的98%。
其中能直接链接原文的化工类核心期刊1365种,约占全球英文版电子化工类期刊总数的90%,几乎包含了所有高影响因子期刊。
1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上,Scifinder数据库囊括了自20世纪以来所有与化学相关的资料,以及大量生命科学及及其它科学学科方面的信息。
1.2.1 生命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋白质组学、实验内科学、生物化学、生物技术学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、药理学等能够保证将9大主要专利组织2日内发布的与生物加工方法、蛋白质组技术、新遗传学工艺,及其它对现代药品开发至关重要的课题等相关的专利收录进来;通过Scifinder访问遗传学、酶学、生物化学、生物技术学及更多科学信息。
用户可查找:摘自细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。
1.2.2 传统化学领域有机化学高分子——聚合物、塑料、纺织、橡胶粘合剂等应用化学和化学工程——加工、工业化学、金属/合金、陶瓷、环境等物理化学、无机化学和分析化学1.3 Scifinder检索路径汇总第二章 Scifinder 检索界面2.1 Scifinder检索界面登录Scifinder 后出现一下界面(默认为新任务窗口):2.2 Scifinder 主检索界面点击新任务(New Task)按钮,出现Scifinder 主检索界面,这是各个检索路径的共同起点,是进入检索的入口。
SciFinder使用指南(图示讲解)
SCIFinder提供了丰富的可视化工具,如化学结构绘图和3D分子模 型,帮助用户更好地理解化学结构和分子间的相互作用。
02
SCIFinder基本操作
登录与注册
01
打开SCIFinder软件或网页界面。
02 点击“注册”按钮,填写个人信息并设置密码, 完成注册。
03 已注册用户可直接输入用户名和密码进行登录。
合物名称检索中,用户可以选择精确匹配,输入完整的化合物名称以获取精确结果。
化学性质分析
总结词
对检索得到的化合物进行化学性质分析,包括物 理性质、化学性质和光谱数据等。
总结词
支持自定义属性筛选,用户可以根据需要选择特 定的属性进行分析。
详细描述
SCIFinder可以对检索得到的化合物进行全面的化 学性质分析,提供各种物理性质、化学性质和光 谱数据,帮助用户深入了解化合物的性质。
化合物属性分析
SCIFinder提供了一系列化合物属 性,如分子量、熔点、沸点等, 帮助用户了解化合物的物理性质。
SCIFinder的特点
权威数据来源
SCIFinder的数据库来源于权威的学术和工业界数据,确保数据的 准确性和可靠性。
高级搜索功能
SCIFinder提供了多种搜索选项和过滤器,使用户能够精确地找到 所需信息。
04
SCIFinder图示讲解
检索流程图示讲解
总结词
详细展示SCIFinder的检索流程,包括关键词输入、检索选项选择、检索结果展示等步 骤。
详细描述
SCIFinder的检索流程非常直观,用户可以通过关键词输入框输入化学物质名称、分子 式、结构等关键词进行检索。同时,用户还可以通过选择不同的检索选项,如化合物类 型、来源等,进一步缩小检索范围。检索结果会以列表形式展示,包括化合物的名称、
scifinder使用手册
研发工具Scifinder《使用说明书》第一章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统支持的检索方式:主题检索、物质名称检索、分子式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与二次检索。
作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统:Scifinder不仅仅包含有分子式、反应式和结构式(包括亚结构检索)等多种检索功能,而且在得到初步检索结果的基础上还可以进一步利用超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。
它已经超越了检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。
包含的信息量:大于2600万条文章记录;3000多万个有机无机物质,5800多万生物序列,1100多万条单步多步反应。
信息时效:1907年-至今1.1.2 原文下载系统Scifinder具有强大的期刊和专利链接,收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发行机构的专利文献中公布的研究成果,占全球化工信息的98%。
其中能直接链接原文的化工类核心期刊1365种,约占全球英文版电子化工类期刊总数的90%,几乎包含了所有高影响因子期刊。
1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上,Scifinder数据库囊括了自20世纪以来所有与化学相关的资料,以及大量生命科学及及其它科学学科方面的信息。
1.2.1 生命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋白质组学、实验内科学、生物化学、生物技术学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、药理学等能够保证将9大主要专利组织2日内发布的与生物加工方法、蛋白质组技术、新遗传学工艺,及其它对现代药品开发至关重要的课题等相关的专利收录进来;通过Scifinder访问遗传学、酶学、生物化学、生物技术学及更多科学信息。
用户可查找:摘自细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。
1.2.2 传统化学领域有机化学高分子——聚合物、塑料、纺织、橡胶粘合剂等应用化学和化学工程——加工、工业化学、金属/合金、陶瓷、环境等物理化学、无机化学和分析化学1.3 Scifinder检索路径汇总第二章 Scifinder 检索界面2.1 Scifinder检索界面登录Scifinder 后出现一下界面(默认为新任务窗口):2.2 Scifinder 主检索界面点击新任务(New Task)按钮,出现Scifinder 主检索界面,这是各个检索路径的共同起点,是进入检索的入口。
scifinder使用指南
scifinder使⽤指南概述SciFinder Scholar是美国化学学会(ACS)旗下的化学⽂摘服务社CAS (Chemical Abstract Service)所出版的《Chemical Abstract》化学⽂摘的在线版数据库学术版,除可查询每⽇更新的CA数据回溯⾄ 1907年外,更提供读者⾃⾏以图形结构式检索。
它是全世界最⼤、最全⾯的化学和科学信息数据库。
scifinder图标“化学⽂摘”是化学和⽣命科学研究领域中不可或缺的参考和研究⼯具,也是资料量最⼤,最具权威的出版物。
⽹络版化学⽂摘SciFinder Scholar,更整合了Medline医学数据库、欧洲和美国等近50家专利机构的全⽂专利资料、以及化学⽂摘1907年⾄今的所有内容。
它涵盖的学科包括应⽤化学、化学⼯程、普通化学、物理、⽣物学、⽣命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、⾷品科学和农学等诸多领域。
它可以透过⽹络直接查看“化学⽂摘”1907年以来的所有期刊⽂献和专利摘要;以及四千多万的化学物质记录和CAS注册号。
编辑本段检索数据库CAPLUSSM(>2150万条参考书⽬记录,每天更新3000条以上,始⾃1907年)CAS REGISTRYSM(>2000万条物质记录,每天更新约4000条,每种化学物质有唯⼀对应的CAS注册号,始⾃1957年)CASREACT®(>570万条反应记录,每周更新约600-1300条,始⾃1974年)CHEMCATS®(>390万条商业化学物质记录,来⾃655家供应商的766种⽬录)CHMLIST®(>22.7万种化合物的详细清单,来⾃13个国家和国际性组织)MEDLINE(National Library of Medicine数据库,>1200万参考书⽬记录,来⾃3900多种期刊,始⾃1958年)编辑本段检索⽅式它有多种先进的检索⽅式,⽐如化学结构式(其中的亚结构模组对研发⼯作极具帮助)和化学反应式检索等,这些功能是CA 光盘中所没有的。
scifinder介绍及使用教程
A division of the American Chemical Society
SciFinder Scholar
SciFinder 数据库与CACD/Print区别
CA print
包含文献起始日期 得到最新信息的延迟 主题检索 普通物质名称检索 分子式检索 结构式检索 亚结构式检索 相似结构式检索 1907 几个月 √ × √ × × ×
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Locate 与 Browse
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A division of the American Chemical Society
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Locate
Part of The Process TM
输入苯的名称benzene
结构式 分子式
反应检索
反应式
A division of the American Chemical Society
SciFinder Scholar
Part of The Process TM
主题检索
A division of the American Chemical Society
SciFinder Scholar
CAS 的宗旨是创建世界上最大最好 的搜索、获取、分析并连接到化学 和相关科学信息的数字环境
A division of the American Chemical Society
SciFinder Scholar
SciFinder Scholar 历史进展
纸本
Part of The Process TM
1907年
SciFindern
SciFinder n®快速入门指南SciFinder n®——最全面的化学及相关学科信息资源,加速实现科学突破SciFinder n®是一个研发应用平台,由美国化学会(American Chemical Society,简称“ACS”)旗下的美国化学文摘社(Chemical Abstracts Service, 简称”CAS”)出品,提供全球最大、最权威的化学及相关学科文献、物质和反应信息。
SciFinder n涵盖了化学及相关领域如生物医药、工程、材料科学、农业科学等多学科、跨学科的科技信息。
SciFinder n 收录的文献类型包括期刊、专利、会议论文、学位论文、图书、技术报告、评论和网络资源等。
SciFinder n收录所有已经公开披露、高质量且来自可靠信息源的信息,由CAS科学家分析文献的每一个细节并加以标引,您无需担心遗漏任何关键信息。
目录登陆进入SCIFINDER N (4)开始检索 (4)ALL检索结果展示 (5)文献检索 (5)文献检索结果展示 (6)文献详情 (8)专利文献的获取——PATENTPAK的使用 (9)分析实验详情的获取——METHODSNOW的使用 (11)物质检索 (13)结构编辑器的使用 (13)物质结果界面 (14)物质详情界面 (16)物质MARKUSH结构检索 (17)物质MARKUSH结构检索结果展示 (17)反应检索 (18)反应检索结果展示 (18)反应详情 (19)供应商检索 (21)供应商检索结果展示 (21)保存的结果 (22)检索历史 (23)登陆进入SciFinder n(https://)1.输入用户名2.输入密码3.点击Log In登陆开始检索SciFinder n具有全新的简洁界面。
1.选择需要的检索选项:选择All,进行全面的检索(包括物质,反应,文献和供应商)2.输入检索信息:关键词,CAS登记号,专利号等3.点击Draw,绘制检索结构4.点击放大镜,开始检索All检索结果展示1.显示检索的结果集:物质,反应,文献,供应商及对应的结果数,点击任何一项即可进入对应的结果界面2.点击Substances,即可进入物质结果集界面3.点击Reactions,即可进入反应结果集界面文献检索文献检索使用了全球最高级的化学智能算法。
