生物信息学实习四报告

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生物信息学专业实习总结范文

生物信息学专业实习总结范文

生物信息学专业实习总结范文《浙江大学优秀实习总结汇编》生物信息学岗位工作实习期总结转眼之间,两个月的实习期即将结束,回顾这两个月的实习工作,感触很深,收获颇丰。

这两个月,在领导和同事们的悉心关怀和指导下,通过我自身的不懈努力,我学到了人生难得的工作经验和社会见识。

我将从以下几个方面总结生物信息学岗位工作实习这段时间自己体会和心得:一、努力学习,理论结合实践,不断提高自身工作能力。

在生物信息学岗位工作的实习过程中,我始终把学习作为获得新知识、掌握方法、提高能力、解决问题的一条重要途径和方法,切实做到用理论武装头脑、指导实践、推动工作。

思想上积极进取,积极的把自己现有的知识用于社会实践中,在实践中也才能检验知识的有用性。

在这两个月的实习工作中给我最大的感触就是:我们在学校学到了很多的理论知识,但很少用于社会实践中,这样理论和实践就大大的脱节了,以至于在以后的学习和生活中找不到方向,无法学以致用。

同时,在工作中不断的学习也是弥补自己的不足的有效方式。

信息时代,瞬息万变,社会在变化,人也在变化,所以你一天不学习,你就会落伍。

通过这两个月的实习,并结合生物信息学岗位工作的实际情况,认真学习的生物信息学岗位工作各项政策制度、管理制度和工作条例,使工作中的困难有了最有力地解决武器。

通过这些工作条例的学习使我进一步加深了对各项工作的理解,可以求真务实的开展各项工作。

二、围绕工作,突出重点,尽心尽力履行职责。

在生物信息学岗位工作中我都本着认真负责的态度去对待每项工作。

虽然开始由于经验不足和认识不够,觉得在生物信息学岗位工作中找不到事情做,不能得到锻炼的目的,但我迅速从自身出发寻找原因,和同事交流,认识到自己的不足,以至于迅速的转变自己的角色和工作定位。

为使自己尽快熟悉工作,进入角色,我一方面抓紧时间查看相关资料,熟悉自己的工作职责,另一方面我虚心向领导、同事请教使自己对生物信息学岗位工作的情况有了一个比较系统、全面的认知和了解。

生物信息学实训报告范文

生物信息学实训报告范文

一、实训背景随着生物科学和信息技术的发展,生物信息学作为一门新兴交叉学科,已成为生物科学研究的重要组成部分。

为了提高学生对生物信息学理论与实践的结合能力,我们学院特开设了生物信息学实训课程。

本次实训旨在通过实际操作,让学生深入了解生物信息学的基本原理、常用工具和数据分析方法,培养学生的实验技能和科研思维。

二、实训目标1. 理解生物信息学的基本概念、研究内容和应用领域。

2. 掌握生物信息学常用工具的使用方法,如BLAST、Clustal Omega、MEGA等。

3. 学会利用生物信息学方法进行基因序列分析、蛋白质结构预测和功能注释。

4. 提高实验操作技能和科研思维能力。

三、实训内容本次实训共分为三个部分:理论学习、实验操作和项目实践。

(一)理论学习1. 生物信息学基础:介绍生物信息学的定义、发展历程、研究内容和方法。

2. 生物序列分析:讲解基因序列、蛋白质序列的基本概念,以及序列比对、序列聚类等分析方法。

3. 蛋白质结构预测:介绍蛋白质结构预测的基本原理和方法,如同源建模、折叠识别等。

4. 功能注释:讲解基因和蛋白质的功能注释方法,如基于序列的注释、基于结构的注释等。

(二)实验操作1. 序列比对:使用BLAST工具进行序列比对,分析序列的同源性。

2. 序列聚类:使用Clustal Omega工具进行序列聚类,分析序列的进化关系。

3. 蛋白质结构预测:使用MEGA工具进行蛋白质结构预测,分析蛋白质的三维结构。

4. 功能注释:使用Gene Ontology(GO)数据库进行基因和蛋白质的功能注释。

(三)项目实践1. 基因组注释:以某物种基因组为研究对象,进行基因预测和功能注释。

2. 蛋白质相互作用网络构建:以某物种蛋白质组为研究对象,构建蛋白质相互作用网络,分析蛋白质之间的相互作用关系。

四、实训过程1. 准备阶段:学生通过查阅资料、阅读文献,了解实训内容,并提前学习相关软件的使用方法。

2. 实验阶段:在教师的指导下,学生进行实验操作,完成实训任务。

生物信息实训报告总结

生物信息实训报告总结

摘要:随着生物科学的快速发展,生物信息学作为一门新兴交叉学科,日益受到广泛关注。

为了提高自身在生物信息学领域的实践能力,我参加了为期两周的生物信息实训。

本次实训旨在通过实际操作,加深对生物信息学基本原理和方法的了解,提高数据处理和分析能力。

以下是对本次实训的总结。

一、实训目的1. 熟悉生物信息学的基本概念和原理;2. 掌握生物信息学常用工具和软件的使用;3. 提高生物信息数据分析能力;4. 培养团队协作精神和沟通能力。

二、实训内容1. 生物信息学基础知识学习:通过查阅相关资料,学习生物信息学的基本概念、原理和方法。

2. 工具和软件学习:学习并熟练使用生物信息学常用工具和软件,如BLAST、Clustal Omega、MEGA等。

3. 数据处理和分析:对实际生物信息学数据进行分析,如基因序列比对、进化树构建、基因表达分析等。

4. 项目实践:分组进行生物信息学项目实践,完成一个完整的生物信息学分析流程。

三、实训过程1. 第一周:学习生物信息学基础知识,了解生物信息学的研究领域和发展趋势。

2. 第二周:学习生物信息学常用工具和软件,进行数据处理和分析。

3. 第三周:分组进行项目实践,完成一个完整的生物信息学分析流程。

4. 第四周:撰写实训报告,总结实训过程中的收获和不足。

四、实训收获1. 理论知识方面:通过实训,我对生物信息学的基本概念、原理和方法有了更深入的了解,为今后从事生物信息学研究奠定了基础。

2. 工具和软件方面:熟练掌握了BLAST、Clustal Omega、MEGA等生物信息学常用工具和软件,提高了数据处理和分析能力。

3. 实践能力方面:通过项目实践,我学会了如何运用所学知识解决实际问题,提高了自己的实践能力。

4. 团队协作和沟通能力方面:在实训过程中,与团队成员共同完成项目,提高了团队协作和沟通能力。

五、不足与改进1. 实训过程中,对部分生物信息学工具和软件的使用还不够熟练,需要加强学习和实践。

2024年生物类实习报告5篇

2024年生物类实习报告5篇

2024年生物类实习报告5篇生物类实习报告篇1作为一名生物科学本科大学生,我还是有一定得自信的,毕竟像考入好的本科大学还是有一定得难度的,生物科学专业实习报告。

可是虽然我现在已经是本科生了,但是我却一点也没有自豪和骄傲的资本。

现在的大学生就业难已经成了社会问题了,我毕业后怎么样还不好说呢。

正因为如此,为了毕业后找个好工作,多出去实习一下,增加自己的实践操作能力,把自己的能力和知识面提高到一定得高度,那才是我所想要的。

找到了实习的地方了,我的实习报告有下:实习目的:观察了解动物的分布属性、生活习性;认识环境对动物生存的影响;加深理解动物形态结构与功能相统一的意义;学会识别与分类动物。

实习时间:200__年7月3日至200__年7月15日实习地点:__海洋大学水生生物博物馆、__硇洲岛、__森林公园、__香江野生动物世界、__长隆夜间动物世界。

实习内容:观察认识水生生物、陆生生物,以小组为单位进行动物标本采集和制作;搞清本地动物的分布类型与特点,进行实习记录并总结。

实习生:生化院生物科学200__级本科班__x[一]总体概况:7月3日至7月15日,我们200__级生物本科进行了为期两周的动物实习,实习报告《生物科学专业实习报告》。

在本次的实习中,我们进行了__海洋大学水生生物博物馆的参观与学习、__的水生生物标本的采集、森林公园的陆生动物标本的采集、__香江野生动物世界、__长隆夜间动物世界的参观与考察。

其中,__由于处于南亚热带和北亚热带的交界地区,且三面临海,气候条件优越,动物资源特别是海洋动物资源丰富,故我们选取了__作为水生生物的重点实习地;__的两大动物园,更是集中了大量野生动物,特别是具代表的珍贵动物品种不少,对我们的实习具有重要意义而成为了我们观察陆生动物的首选。

[二]分述:一、__海洋大学水生生物博物馆:200__年7月4日,我们参观了__海洋大学水生生物博物馆。

一是认识水生生物的形态结构特征;二是为水生生物标本的采集制作做准备。

生物信息学实习报告

生物信息学实习报告

一、实习背景随着生物科学的快速发展,生物信息学作为一门新兴交叉学科,日益受到广泛关注。

为了更好地将理论知识与实践相结合,提升自身综合素质,我于今年暑假期间,在XXX生物科技有限公司开展了为期一个月的生物信息学实习。

二、实习单位简介XXX生物科技有限公司是一家专注于生物信息学研究的科技型企业,主要从事基因组学、转录组学、蛋白质组学等领域的研究与开发。

公司拥有一支经验丰富的研发团队,为我国生物信息学领域的发展做出了积极贡献。

三、实习内容1. 基因组数据分析在实习期间,我主要参与了基因组数据分析项目。

具体工作如下:(1)学习并掌握了基因组数据分析的基本流程,包括数据预处理、比对、注释、统计等。

(2)熟练运用多种生物信息学软件,如SAMtools、BAMSurgeon、Picard等,对基因组数据进行处理和分析。

(3)通过分析基因组数据,发现基因变异、转录本结构变异等生物学特征,为后续研究提供依据。

2. 转录组数据分析除了基因组数据分析,我还参与了转录组数据分析项目。

具体工作如下:(1)学习并掌握了转录组数据分析的基本流程,包括数据预处理、比对、差异表达分析等。

(2)熟练运用多种生物信息学软件,如TopHat、Cufflinks、DESeq2等,对转录组数据进行处理和分析。

(3)通过分析转录组数据,发现差异表达基因、miRNA等生物学特征,为后续研究提供依据。

3. 蛋白质组数据分析此外,我还参与了蛋白质组数据分析项目。

具体工作如下:(1)学习并掌握了蛋白质组数据分析的基本流程,包括蛋白质提取、质谱分析、数据预处理等。

(2)熟练运用多种生物信息学软件,如Proteome Discoverer、Mascot等,对蛋白质组数据进行处理和分析。

(3)通过分析蛋白质组数据,发现蛋白质相互作用、信号通路等生物学特征,为后续研究提供依据。

四、实习收获1. 理论与实践相结合通过实习,我深刻体会到理论知识与实践操作的重要性。

生物工程专业生物信息学实习报告

生物工程专业生物信息学实习报告

生物工程专业生物信息学实习报告1. 引言生物信息学是生物工程专业中一门重要的学科,通过应用计算机和统计学方法研究生物学信息,对生物系统进行分析和解释。

本次实习旨在提供实际生物信息学应用的机会,进一步加深我对生物信息学的理解和实践能力。

2. 实习背景与目的本次实习在xxx公司进行,公司拥有世界一流的生物信息学研发团队,并与许多国际知名大学合作开展相关项目。

实习的目的是深入了解生物信息学在生物工程领域的应用,提高在生物信息学方面的研究和实践能力。

3. 实习内容3.1 数据获取与清洗在实习初期,我与团队成员一起从公共数据库中获取生物学实验数据,并使用相应的软件对原始数据进行处理和清洗,保证数据的准确性和可信度。

3.2 数据分析与建模在数据清洗后,我开始进行数据分析和建模。

其中,我学习了常用的生物信息学软件和工具,如BLAST、ClustalX等,对DNA和蛋白质序列进行比对和序列相似性分析,并利用分析结果进行生物信息学建模。

3.3 基因组学研究在实习的后期,我参与了公司的基因组学研究项目。

通过利用大规模测序技术获取的数据,我学会了基因组序列的拼接与组装,并进行了基因预测和功能注释,进一步深入了解了基因组学的研究方法和技术。

4. 实习总结与收获通过本次实习,我对于生物信息学在生物工程领域的应用有了更深入的理解和实践经验。

我不仅学到了许多常用的生物信息学软件和工具,还掌握了生物学实验数据的处理和分析方法。

同时,实习还让我更好地理解了基因组学的研究过程和技术,提高了自己的研究能力和科学素养。

5. 对未来发展的展望通过本次实习,我深刻认识到生物信息学在生物工程领域的巨大潜力和重要性。

未来,我将进一步深化对生物信息学的学习和研究,不断提高自己的技能和能力,为生物科学的发展和进步做出贡献。

6. 结语通过这次实习,我对生物信息学的理论与实践以及其在生物工程领域的应用有了更深入的认识。

我将用所学知识和经验为进一步推动生物信息学研究和应用做出努力。

生物信息学实习报告

生物信息学实习报告

实习报告一、实习背景与目的随着生物信息学在生物科学、医学、农业等领域的广泛应用,我意识到掌握生物信息学技能对于我未来的职业发展至关重要。

因此,我参加了为期两周的生物信息学实习,以提高我的生物信息学技能并深入了解该领域的实际应用。

二、实习内容与过程在实习的第一周,我主要学习了生物信息学的基础知识,包括生物信息学的基本概念、生物数据库的使用、序列比对和分子进化分析等。

通过查阅资料和参与讨论,我了解了生物信息学在基因组学、蛋白质学和代谢组学等领域的应用,并掌握了相关软件和工具的使用方法。

在实习的第二周,我参与了一个实际项目,对某个基因家族进行进化分析。

首先,我使用序列比对工具对基因家族的成员进行比对,识别出保守区域和变异区域。

然后,我使用分子进化分析工具对序列进行 phylogenetic 分析,构建进化树并分析基因家族的进化关系。

最后,我使用代谢组学数据分析工具对实验数据进行分析,识别出与基因家族进化相关的代谢物。

三、实习成果与反思通过这次实习,我不仅掌握了生物信息学的基本知识和技能,还了解了生物信息学在实际研究中的应用。

我能够独立完成基因家族的进化分析,并能够使用相关软件和工具进行数据分析。

然而,我也意识到生物信息学是一个不断发展的领域,需要不断学习和更新知识。

在实习过程中,我遇到了一些挑战,例如数据分析工具的使用困难和生物信息学概念的理解。

这使我意识到理论与实践之间的差距,并激发了我进一步学习的动力。

四、实习总结通过这次生物信息学实习,我对生物信息学有了更深入的了解,并提高了我的实际操作能力。

我认识到生物信息学在现代生物学研究中的重要性,并决心在未来的学习和工作中不断努力,成为一名优秀的生物信息学专家。

生物信息实践的实习报告

生物信息实践的实习报告

一、实习背景随着生物信息学领域的快速发展,生物信息学人才的需求日益增加。

为了更好地将所学理论知识与实践相结合,提高自己的实践能力,我于20xx年x月x日至20xx 年x月x日在某生物信息学研究所进行了为期一个月的实习。

二、实习目的1. 熟悉生物信息学的基本概念、研究方法和应用领域;2. 掌握生物信息学相关软件和数据库的使用;3. 学习生物信息学实验设计、数据分析和结果解读;4. 提高自己的团队协作和沟通能力。

三、实习内容1. 实习初期,我参加了研究所的生物信息学基础培训,了解了生物信息学的发展历程、研究内容和常用方法。

培训内容包括基因序列分析、蛋白质结构预测、生物信息学数据库等。

2. 在实习过程中,我参与了以下项目:(1)基因表达分析:通过高通量测序技术获取某物种基因表达数据,运用生物信息学软件进行数据分析,绘制基因表达热图,分析基因表达模式。

(2)蛋白质功能预测:针对某物种的蛋白质序列,运用生物信息学软件进行功能预测,分析蛋白质可能的功能和作用。

(3)生物信息学数据库构建:参与构建某物种的生物信息学数据库,包括基因、蛋白质、代谢通路等信息的整理和录入。

3. 实习期间,我还学习了以下技能:(1)熟练使用Linux操作系统和生物信息学相关软件,如Blast、ClustalW、MEME等;(2)掌握生物信息学数据库的使用,如NCBI、Uniprot、KEGG等;(3)了解生物信息学实验设计、数据分析和结果解读方法。

四、实习心得1. 理论与实践相结合:通过实习,我深刻体会到理论知识的重要性。

在实习过程中,我将所学知识应用于实际问题,加深了对生物信息学理论的理解。

2. 团队协作与沟通:实习期间,我学会了与团队成员共同完成任务,提高了自己的团队协作和沟通能力。

在遇到问题时,我们互相讨论、共同解决,形成了良好的学习氛围。

3. 持续学习:生物信息学领域发展迅速,新方法、新技术层出不穷。

在实习过程中,我认识到持续学习的重要性,不断提高自己的专业素养。

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实习 4 :系统发育分析-PHYLIP, MEGA, MrBayes
实验目的:
1. 学会使用PHYLIP,MEGA 和MrBayes 构建系统发育树
2. 学会分析建树结果,体会各种方法差异
实验内容:
(一)PHYLIP(二)MEGA(三)MrBayes
作业:
1,用NCBI搜索dehydrin不同物种的序列,找到以下物种。

1)、Microplitis demolitor dehydrin COR47-like, mRNA372 bp
2)、Quercus petraea dhn3 gene for dehydrin, 620 bp
3)、Alternaria brassicicola dehydrin-like protein (DHN2) gene, complete cds, alternatively spliced1,473 bp linear DNA
4. Columba livia dehydrin DHN4-like mRNA 648 bp linear mRNA 5)、Escherichia coli dehydrin (dhnA) gene, complete cds2,322 bp PHYLIP法:把5个序列用clustal x进行比对,以phylip格式输出,再把phylip 粘贴到phy\phylip-3.695\exe文件夹,然后分别用不同方法建树。

双击SEQBOOT 子程序,输入phylip运行得到outfile,改名为seqb。

最大简约法:打开DNAPARS,将刚才生成的seqb 文件名输入,修改参数运行后得到的outtree用treeview打开如图1所示
(图1最大简约法)(图2 NJ法)
距离法建树:首先利用DNADIST软件计算两两序列的距离,得到距离矩阵用
于下一步分析。

将刚才生成的seqb文件输入,更改M参数为分析多个数据,运行后生成文件outfile,改名为dnadist。

1)NJ方法:执行NEIGHBOR 软件,将上一步生成的dnadist输入,利用NJ 方法建树,更改M 参数为分析多个数据,生成两个文件outfile和outtree,outtree用treeview打开如图2所示
2)UPGMA方法:操作同上,得到如图3
(图3UPGMA方法)(图4 FM方法)
3)FM方法:执行FITCH 软件,将dnadist输入,更改M 参数为分析多个数据,生成两个文件outfile和outtree,outtree用treeview打开如图4所示最大似然法建树:打开DNAML 软件。

将刚才生成的seqb 文件输入,更改M 参数为分析多个数据,生成两个文件outfile和outtree。

outtree用treeview 打开如图5所示
图5 最大似然法
MEGA法:把5个序列保存为一个txt文件,改为fas格式。

打开MEGA,点击
Align-Edit/Build a Alignment ,选择create anew alignment 。

选择 DNA,出现新窗口 Alignment Explorer,点主菜单 Data-open-retrieve sequences from file.打开之前的fas 文件,选全部序列进行比对。

然后点击Data-Export Alignment-MEGA Format ,保存比对结果。

关闭窗口。

点击主菜单 File-Open a File/session,选择刚保存的 meg 文件,进行不同方法建树。

M i c r o
p l i t i s
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80
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(UPGMA 法)
x nxs.nex 文件,粘贴到
极大似然法
NJ 法
mrbayes-3.1.2文件夹,运行MrBayes,读入nex文件,在>控制符后输入exe nxs.nex,点击回车,在控制符后输入mcmc ngen=10000 samplefreq=10,点击回车。

在控制符后输入sump burnin=250点击回车。

在控制符后输入sumt burnin=250,点击回车。

最后得到的树用treeview打开如图所示
贝叶斯法NCBI common tree
总结:每个树都存在差异,因为NCBI common tree是按照整个物种构建的进化树,由于在物种进化过程中基因会发生趋异或趋同进化,所以其他建树法构建的进化树与NCBI common tree不同,此外,每个建树方法的算法不一样,所以不同方法构建的发育树存在差异。

二.在NCBI中搜索固氮酶蛋白限定为RefSeq,选择一个序列,进行Blastp。

下载20种序列,使用MEGA分别通过最大简约法和极大似然法构建树,并于NCBI上的标准物种树比较。

首先,可以发现构建的进化树与NCBI上的物种树有很大的差异。

如Halothece sp. PCC 7418(在标准物种树与ML中标注*号),在物种树中与Cyanothece sp. PCC 7822近邻,然而在ML法树形结构中分距很远。

此外,我们可以看出,虽然在物种树里面的各节点分别代表31个不同的物种,但属名相同的物种往往近邻或成簇。

据上所述,物种树与蛋白序列树显现出了较明显的不一致性,推测这是由分子进化事件(即基因重复或丢失)产生的。

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