密码子表及简并碱基
遗传密码表以及氨基酸详表

遗传密码表以及氨基酸详
表
Prepared on 24 November 2020
密码子反表
除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]
以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
•
(Ala/A)
•
(Arg/R)
•
(Asn/N)
•
(Asp/D)
•
(Cys/C)
•
(Glu/E)
•
(Gln/Q)
•
(Gly/G)
•
(His/H)
•
(Ile/I)
•
(Leu/L)
•
(Lys/K)
•(Met/M)
•
(Phe/F)
•
(Pro/P)
•
(Ser/S)
•
(Thr/T)
•
(Trp/W)
•
(Tyr/Y)
•
(Val/V)
•
(Sec/U)
•
(Pyl/O)
主要化学性质[]
以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]
以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
小结遗传密码性质及应用

小结遗传密码性质及应用本文结合一些高考题或冲刺题,浅谈遗传密码子的有关性质,以便师生对遗传密码表引起足够重视以及对遗传密码子有关性质的应用。
1、审察人教版高中《生物》第二册表6-1的遗传密码,可以看出如下特点:(1)简并性:除色氨酸和甲硫氨酸只有1个密码子外,其它18种氨基酸均有1个以上的密码子,其中有2至4个密码子的氨基酸密码子分布在同一方框内,即第一和第二个碱基相同,只有第三个碱基不同;有6个密码子的氨基酸(如亮氨酸、丝氨酸)密码子分别在不同方框内,它们的第一或第一和第二碱基不同。
密码子的简并性,特别是第三位的C和U或G和A的简并性常常等同,这说明为什么在不同生物的DNA中的AT/GC比率会有很大的变异,而其蛋白质的氨基酸相对比例却没有很大的变化。
换句话说,只改变一个碱基(称为点突变),并不一定编码“错误”氨基酸。
(2)通用性:除某些线粒体、叶绿体和原生生物外(如Barrell等在1979年发现人的线粒体中,通用的密码子AUA却是编码甲硫氨酸,而不是异亮氨酸,UGA 不是作为终止密码子,而是编码色氨酸),所有生物的遗传密码都是相同的。
这也是基因工程得以实现的重要理论基础之一。
如1993年,中国农业科学院的科学家成功地将苏云金孢杆菌的抗虫基因转入棉植株,培育成了能产生毒蛋白来抵抗棉铃虫的转基因抗虫棉。
(3)起始密码子兼职性:64个密码子中,其中3个并不编码氨基酸的却起着终止肽链合成作用的密码子,称为无义密码子(又称终止密码子);另61个是编码各种氨基酸的密码子,称为有义密码子,在61个有义密码子中,编码氨基酸同时兼职于启动蛋白质形成的两个密码子(AUG和GUG),称为起始密码子。
(4)非重叠性:在mRNA模板上的密码子是连续的,在前一个密码子与后一个密码子之间没有间隔,即没有一个间断的信号。
因此,在进行翻译时,解读的框架决定于起始的碱基。
如果核糖体在mRNA链上移动时,偶然跳越了1个核苷酸,便会生成“不完全”蛋白质,原因是mRNA上密码子中增加或减少一个碱基将引起后续密码子的改变。
遗传密码的组成

遗传密码的组成
遗传密码指的是在生物学中编码蛋白质合成的基因信息。
这个密码是由DNA 分子中的碱基序列组成的。
DNA(脱氧核糖核酸)是生物体遗传信息的携带者,由四种碱基组成,它们以特定的方式组合,形成基因,从而决定了生物体的遗传特征。
DNA的四种碱基分别是:
1. 腺嘌呤(Adenine,简写为A)
2. 鸟嘌呤(Guanine,简写为G)
3. 胸腺嘧啶(Thymine,简写为T)
4. 胞嘧啶(Cytosine,简写为C)
这些碱基以配对的方式连接在一起,形成DNA的双螺旋结构。
配对规则如下:
-腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)之间形成一对。
-鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)之间形成一对。
这种基对的规律性允许DNA 在复制过程中将信息传递给新合成的DNA 分子,同时也提供了一种机制,使DNA 能够被转录成RNA,从而进一步被翻译成蛋白质。
基因是DNA 中的特定序列,它包含了编码蛋白质所需的信息。
基因的编码信息是由这些碱基的序列决定的。
每三个连续的碱基组成一个密码子(codon),每个密码子对应着一种氨基酸或终止信号。
这样的三碱基密码子的组合形成了遗传密码。
总的来说,遗传密码的组成是基因中的DNA 序列,这个序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)这四种碱基组成的,通过特定的规律性形成了密码子,进而决定了蛋白质的合成。
这一过程涉及到DNA 复制、转录和翻译等生物学过程。
密码子表及简并碱基

A Ala Alanine M Met Methionine G Gly GlycineS Ser Serine C Cys Cysteine N Asn Asparagine H His Histidine T Thr Threonine D Asp Aspartic Acid P Pro Proline I Ile IsoleTcine V Val Valine E Glu Glutamic AcidQ Gln GlTtamine K Lys Lysine W Trp Tryptophan F PhePhenylalanineRArg ArginineL Leu LeucineYTyr TyrosineBAsx Aspartic Acid or AsparagineZGlx Glutamic Acid or Glutamine简并碱基符号对应表逆密码子表氨基酸缩写密码子氨基酸缩写密码子Ala A GCU, GCC, GCA, GCG Leu L UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUGArg R CGU, CGC, CGA, CGG,AGA, AGGLys K AAA, AAGAsn N AAU, AAC Met M AUGAsp D GAU, GAC Phe F UUU, UUCCys C UGU, UGC Pro P CCU, CCC, CCA, CCGGln Q CAA, CAG Ser S UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGCGlu E GAA, GAG Thr T ACU, ACC, ACA, ACG Gly G GGU, GGC, GGA, GGG Trp W UGGHis H CAU, CAC Tyr Y UAU, UACIle I AUU, AUC, AUA Val V GUU, GUC, GUA, GUG 起始AUG 终止UAG, UGA, UAA此表列出了和20种氨基酸和密码子的标准配对。
密码子的简并性名词解释

密码子的简并性名词解释密码子简并性名词解释:密码子的简并性( density of nucleotide codes)生物学密码子的复制是以简并方式进行的。
用以产生同一密码子不同氨基酸之间碱基配对概率的最小参数为简并度,其值为复制一个氨基酸所需的密码子数目减去原始密码子数目的平均值。
密码子是生物遗传信息存在的基本单位,每种生物都有独特的密码子。
同种生物密码子的个数、顺序和各种密码子的不同组合形成不同的密码子表达式。
由于不同种生物DNA中的密码子具有独特性,因此对同种生物不同组织或细胞的DNA进行比较时,就要用到密码子的简并性。
对动植物而言,生活条件与环境不同,决定了动植物DNA中密码子的差异性,因此常以简并度表示密码子的简并程度。
一般说来,密码子的简并度越高,密码子之间的差别就越大,生物的亲缘关系也就越远。
例如,人类的遗传信息中就包含有50万个密码子,这些密码子的碱基配对概率非常低,不同种族之间,人类与人类之间的遗传信息的密码子个数只相差几千个。
但对果蝇而言,它们遗传信息的密码子个数则有100万个之多,由此可见生物的亲缘关系还是很近的。
不同的密码子有着不同的功能,根据其对蛋白质结构的影响,生物体内密码子可分为5类:即A类、 B类、 C类、 D类和E类密码子。
各类密码子主要功能见下表:密码子的简并性为多肽链的结构和功能的研究提供了新的工具。
一些密码子不仅在数量上很少,而且在空间上分布很广,甚至还存在简并现象,因此能被较大的密码子编码区域简单地识别,如苯丙氨酸及其受体、谷氨酸、天冬氨酸、赖氨酸、酪氨酸、苏氨酸等。
这类密码子称为“稀有密码子”。
在蛋白质中已发现有500多个稀有密码子。
这些稀有密码子,如果被识别,往往会导致翻译错误,造成生物功能紊乱。
例如,不正确识别苏氨酸残基的RNA聚合酶就将N-羟基-L-丝氨酸甲酯转变成N-羟基-L-精氨酸甲酯,从而降低了细胞内能量生成,干扰蛋白质正确折叠成为异常折叠,影响细胞分裂等生理过程。
20种氨基酸的密码子

20种氨基酸的密码子(原创版)目录1.密码子的概念与分类2.氨基酸与密码子的关系3.20 种氨基酸的密码子详解4.密码子的特性与应用正文一、密码子的概念与分类密码子是指在生物体中,三个核苷酸(碱基)的序列,它们位于信使RNA(mRNA)上,用来编码一个特定的氨基酸。
密码子是生物体内遗传信息转录和翻译的关键环节,它们决定了生物体合成蛋白质的过程中氨基酸的顺序。
密码子分为 64 种,其中有 61 种能决定氨基酸,剩下的 3 种是终止密码子,它们不参与氨基酸的编码。
二、氨基酸与密码子的关系氨基酸是蛋白质的基本组成单位,而密码子则是决定氨基酸顺序的编码。
一个密码子对应一个氨基酸,但一个氨基酸可能对应多个密码子。
这种对应关系并不是一一对应,而是存在一定的冗余和多样性。
密码子的存在保证了生物体在遗传信息传递和蛋白质合成过程中的稳定性和可靠性。
三、20 种氨基酸的密码子详解生物体内共有 20 种氨基酸,它们分别由不同的密码子编码。
以下是20 种氨基酸对应的密码子列表:1.丙氨酸:GCA, GCG, GCC, GCD, GCE, GCG, GCA, GCG, GCC, GCD2.赖氨酸:AAA, AAG3.精氨酸:AGG4.天冬氨酸:GAC, GAA, GAG, GAT5.天冬酰胺:AAC, ACA, ACG, AGA, AGG, AGR, AAA, AAG6.半胱氨酸:GUU, GUC, GCC, GCD, GCE, GCG, GUA, GUG7.胱氨酸:GAA, GAG8.缬氨酸:GUC, GUA, GUG9.亮氨酸:CUU, CUC, CCG, CCD, CCE, CCG, CUA, CUG10.甲硫氨酸:AUG11.苯丙氨酸:TTT, TTC12.脯氨酸:CCU, CCC, CCD, CCE, CCU, CCG, CCA, CCG, CCD, CCE13.丝氨酸:UCU, UCC, UCG, UCD, UCE, UCG, UUA, UUG14.苏氨酸:ACU, ACC, ACG, ACD, ACE, ACG, AUA, AUG15.色氨酸:TGT, TGC16.酪氨酸:TTY, TYN17.谷氨酰胺:Gln, Gly18.谷氨酸:GAA, GAG19.谷氨酰酸:GAC, GAA, GAG, GAT20.组氨酸:Codon for histidine, Codon for asparagine四、密码子的特性与应用密码子具有以下特性:1.通用性:密码子在不同生物体之间具有通用性,但存在一定的差异。
密码子表及简并碱基

F
UUU, UUC
Cys
C
UGU, UGC
Pro
P
CCU, CCC, CCA, CCG
Gln
Q
CAA, CAG
Ser
S
UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC
Glu
E
GAA, GAG
Thr
T
ACU, ACC, ACA, ACG
Gly
G
GGU, GGC, GGA, GGG
Trp
W
TGA: Ter *
TTC: LeTL
TCG: Ser S
TAG: Ter *
TGG: Trp W
C
CTT: LeTL
CCT: Pro P
CAT: His H
CGT: Arg R
T
C
A
G
CTC: LeTL
CCC: Pro P
CAC: His H
CGA: Arg R
CTA: LeTL
CCA: Pro P
T
C
A
G
T
苯丙氨酸
丝氨酸
酪氨酸
半胱氨酸
T
C
A
GБайду номын сангаас
苯丙氨酸
丝氨酸
酪氨酸
半胱氨酸
亮氨酸
丝氨酸
终止密码子
终止密码子
亮氨酸
丝氨酸
终止密码子
色氨酸
C
亮氨酸
脯氨酸
组氨酸
精氨酸
T
C
A
G
亮氨酸
脯氨酸
组氨酸
精氨酸
亮氨酸
脯氨酸
谷氨酰胺
精氨酸
亮氨酸
分子生物学密码子

分子生物学密码子
分子生物学中的密码子(codon)是指信使RNA(mRNA)分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸的规律。
信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。
信使RNA分子中的四种核苷酸(碱基)的序列能决定蛋白质分子中的20种氨基酸的序列。
而在信使RNA分子上的三个碱基能决定一个氨基酸。
密码子有以下特点:
1. 每个密码子三联体(triplet)决定一种氨基酸。
一个氨基酸若有几个不同的密码子,大多前面两个核苷酸相同,只是第3个核苷酸有差异。
它除了能降低突变所造成的损害外,还可减少所需的tRNA种类。
2. 理化性质相近的氨基酸的密码子排列较近,有利于在基因突变时。
3. mRNA上的密码子是连续的,两个密码子之间没有任何成分分割,即无间断讯号。
4. 起始密码子和终止密码子:肽链合成的第一个氨基酸都是Met(蛋氨酸或fMet)。
AUG(真核生物有时候也用CUG)是起始密码子,也是Met的密码子,具有兼职性。
密码子UAA,UAG,UGA是肽链成的终止密码,不代表任何氨基酸,也称无意义密码子(UAA终止效率最高,UAG最低)。
以上信息仅供参考,建议查阅生物专业书籍或者咨询专业人士获取更全面和准确的信息。
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异亮氨酸
苏氨酸
赖氨酸
精氨酸
蛋氨酸
苏氨酸
赖氨酸
精氨酸
G
缬氨酸
丙氨酸
天冬氨酸
甘氨酸
T
C
A
G
缬氨酸
丙氨酸
天冬氨酸
甘氨酸
缬氨酸
丙氨酸
谷氨酸
甘氨酸
缬氨酸
丙氨酸
谷氨酸
甘氨酸
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TGA: Ter *
TTC: LeTL
TCG: Ser S
TAG: Ter *
TGG: Trp W
C
CTT: LeTL
CCT: Pro P
CAT: His H
CGT: Arg R
T
C
A
G
CTC: LeTL
CCC: Pro P
CAC: His H
CGA: Arg R
CTA: LeTL
CCA: Pro P
ACA: Thr T
AAA: L M
ACG: Thr T
AAG: Lys K
AGG: Arg R
G
GTT: Val V
GCT: Ala A
GAT: Asp D
GGT: Gly G
T
C
A
G
GTC: Val V
GCC: Ala A
GAC: Asp D
GGC: Gly G
Phe
F
UUU, UUC
Cys
C
UGU, UGC
Pro
P
CCU, CCC, CCA, CCG
Gln
Q
CAA, CAG
Ser
S
UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC
Glu
E
GAA, GAG
Thr
T
ACU, ACC, ACA, ACG
Gly
G
GGU, GGC, GGA, GGG
Trp
W
CAA: Gln Q
CGC: Arg R
CTG: LeTL
CCG: Pro P
CAG: Gln Q
CGG: Arg R
A
ATT: Ile I
ACT: Thr T
AAT: Asn N
AGT: Ser S
T
C
A
G
ATC: Ile I
ACC: Thr T
AAC: Asn N
AGC: Ser S
ATA: Ile I
A/T/C/G
逆密码子表
氨基酸
缩写
密码子
氨基酸
缩写
密码子
Ala
A
GCU, GCC, GCA, GCG
Leu
L
UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG
Arg
R
CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG
Lys
K
AAA, AAG
Asn
N
AAU, AAC
Met
M
AUG
Asp
D
GAU, GAC
HHisHistidine
TThrThreonine
DAspAspartic Acid
PProProline
IIleIsoleTcine
VValValine
EGluGlutamic Acid
QGlnGlTtamine
KLysLysine
WTrpTryptophan
FPhePhenylalanine
RArgArginine
GTA: Val V
GCA: Ala A
GAA: GlTE
GGA: Gly G
GTG: Val V
GCG: Ala A
GAG: GlTE
GGG: Gly G
AAlaAlanine
MMetMethionine
GGlyGlycine
SSerSerine
CCysCysteine
NAsnAsparagine
密码子的第一位(5 ’端)
密码子的第二位
密码子的第三位( 3 ’端)
T
C
A
G
T
TTT: Phe F
TCT: Ser S
TAT: Tyr Y
TGT: Cys C
T
C
A
G
TTC: Phe F
TCC: Ser S
TAC: Tyr Y
TGC: Cys C
TTC: LeTL
TCA: Ser S
TAA: Ter *
T
C
A
G
T
苯丙氨酸
丝氨酸
酪氨酸
半胱氨酸
T
C
A
G
苯丙氨酸
丝氨酸
酪氨酸
半胱氨酸
亮氨酸
丝氨酸
终止密码子
终止密码子
亮氨酸
丝氨酸
终止密码子
色氨酸
C
亮氨酸
脯氨酸
组氨酸
精氨酸
T
C
A
G
亮氨酸
脯氨酸
组氨酸
精氨酸
亮氨酸
脯氨酸
谷氨酰胺
精氨酸
亮氨酸
脯氨酸
谷氨酰胺
精氨酸
A
异亮氨酸
苏氨酸
天冬酰胺
丝氨酸
T
C
A
G
异亮氨酸
苏氨酸
天冬酰胺
UGG
His
H
CAU, CAC
Tyr
Y
UAU, UAC
Ile
I
AUU, AUC, AUA
Val
V
GUU, GUC, GUA, GUG
起始
AUG
终止
UAG, UGA, UAA
此表列出了和20种氨基酸和密码子的标准配对。
密 码 子 的 第 一 位 (5 ’端 )
密码子的第二位
密 码 子 的 第 三 位 ( 3 ’端 )
LLeuLeucine
YTyrTyrosine
BAsxAspartic Acid or Asparagine
ZGlxGlutamic Acid or Glutamine
简并碱基符号对应表
简并碱基
正常碱基
R
A/G
Y
C/T
M
A/C
K
G/T
S
G/C
W
A/T
H
A/T/C
B
G/T/C
V
G/A/C
D
G/A/T
N