分子生物学实验报告

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分子生物学试验报告

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分⼦⽣物学试验报告分⼦⽣物学实验报告实验⼀真核基因组DNA的制备与分析⼀、实验步骤1、材料处理(1)取0.5cm的⽼⿏尾巴组织块,⽤⽣理盐⽔洗净,剪碎⾄糜状。

(2)将上述组织碎末加⼊盛有500uL裂解液的2mL离⼼管中,37℃⽔浴1h。

2、⽤蛋⽩酶K和苯酚处理细胞裂解液(1)加50uL蛋⽩酶K,温和的将酶混⼊粘滞的溶液中。

(2)将裂解细胞的悬浮液置于55℃⽔浴3h,不时的温和旋动该粘滞溶液,⾄看不到明显的组织块为⽌。

(3)将溶液冷却⾄室温,加500uL的Tris平衡酚,缓慢的来回颠倒离⼼管⾄两相混合形成乳浊液,于室温以5000g离⼼10min,使两相分开。

(4)⽤⼤⼝径移液管将上层粘稠的⽔相移到⼀洁净的离⼼管中,⽤酚重复抽提2次。

(5)第三次酚抽提后,将⽔相移⾄另⼀离⼼管中,于室温加100uL的10M⼄酸铵和1000uL 的⼄醇,转动离⼼管使溶液充分混合,DNA⽴即形成沉淀,通常可⽤吸管将沉淀从⼄醇溶液中移除。

如果DNA沉淀为碎⽚,则与室温离⼼收集。

(6)DNA沉淀⽤70%的⼄醇洗涤,离⼼收集。

将离⼼管于室温下放置实验台上,直⾄⼄醇挥发殆尽。

不要使DNA沉淀完全⼲燥,否则极难溶解。

(7)待沉淀将近透明后加适量的TE溶解DNA,通常需要12-24⼩时使DNA完全溶解,将DNA 溶液存于4℃.3、DNA琼脂糖凝胶电泳检测(1)制备0.6%的琼脂糖凝胶。

(2)取适量DNA样品,与凝胶上样缓冲液混合,加⾄上述凝胶上样孔内。

(3)取适量标准DNA溶液同样加⾄凝胶上样孔内。

(4)电泳,电压为1V/cm,距离以阳极⾄阴极为准。

(5)电泳结束后,将凝胶放⼊含溴化⼄锭(0.5ug/mL)的⽔中室温浸染10min,⽤紫外灯观察凝胶和照相。

⼆、实验结果如上图所⽰,基因组DNA在0.6%琼脂糖凝胶上跑出30kb左右的单⼀条带(λDNA/Hin d III Marker),但有个别组的样没有明显的条带出现。

三、结果分析提取的基因组DNA⽚段只有30kb左右,偏⼩。

分子生物学综合实验报告

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分子生物学综合试验报告综合实验Ⅰ.Southern杂交(质粒DNA提取、PCR技术体外扩增DNA、质粒载体和外源DNA的连接反应、地高辛标记的Southern杂交)一.实验目的1.学习Southern杂交的原理及操作方法。

2.学习碱裂解法提取质粒的原理。

3.学习PCR反应的基本原理和实验技术;了解引物设计的一般要求。

4.掌握DNA体外连接的基本技能,了解连接反应的注意事项。

二.实验原理利用染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离的目的。

在碱变性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋解开而变性,质粒DNA氢键也大部分断裂,双螺旋也有部分解开,但共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当pH=的乙酸钠将其pH调到中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的碱裂解法提取质粒的主要原理是:利用染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而构型,而染色体DNA不能复性,形成缠绕的致密网状结构,离心后,由于浮力密度不同,染色体DNA与大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

聚合酶链反应(PCR)是体外酶促合成DNA片段的一种技术,PCR进行的基本条件:DNA模板(在RT-PCR中模板是RNA)、引物、dNTP(dATP、dTTP、dGTP、dCTP)、Taq DNA聚合酶、反应缓冲体系。

PCR循环由三个步骤组成:变性、退火、延伸。

每一个循环的产物可作为下一个循环的模板,通过30个左右循环后,目的片段的扩增可达106倍。

DNA片段之间的连接是通过DNA连接酶的催化实现的。

DNA连接酶催化具有平末端或互补粘性末端的DNA片段间相邻碱基通过3’,5’磷酸二酯键连接起来。

最常用的来源于T4噬菌体的T4DNA连接酶。

对于平末端或互补的粘性末端可直接进行连接反应。

一个片段是平末端,另一片段为粘性末端或两个片段都是粘性末端但不配对,则需要通过各种方式使其可一匹配或通过平末端进行连接。

通常采用末端补平、加同聚物尾、加接头等方式是目的片段之间能够匹配。

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实验目的:
通过本次实验,我们旨在探究DNA复制、基因表达和蛋白质合成等分子生物学的基本原理,加深对分子水平生物学过程的理解,培养实验操作技能和科学思维能力。

实验材料与方法:
1. 实验材料:大肠杆菌(E. coli)细菌菌斑、DNA提取试剂盒、PCR试剂盒、琼脂糖、琼脂糖电泳试剂、PCR扩增仪、电泳仪等。

2. 实验步骤:
a. DNA提取:取一支含E. coli细菌菌斑的移液管,用DNA提取试剂盒提取DNA。

b. PCR扩增:将提取的DNA加入PCR试剂盒中进行PCR扩增反应。

c. 原核表达:将扩增后的DNA片段转入大肠杆菌进行原核表达。

d. SDS-PAGE电泳:将蛋白质样品加入琼脂糖凝胶,通过电泳进行蛋白质分子量的分离。

实验结果与分析:
1. DNA提取:成功提取到E. coli细菌的DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳观察到DNA的带型。

2. PCR扩增:成功扩增出目标DNA片段,并经过验证测序结果正确。

3. 原核表达:大肠杆菌成功表达了目标蛋白质,通过SDS-PAGE电泳观察到目标蛋白质的条带。

4. SDS-PAGE电泳:观察到蛋白质的分子量差异,验证了蛋白质的分离效果。

结论与讨论:
通过本次实验,我们成功实现了DNA提取、PCR扩增、原核表达和蛋白质分离等分子生物学实验步骤,从而全面了解了分子生物学过程的基本原理。

实验结果表明,实验操作规范,结果可靠,为今后的科研工作和实验基础奠定了坚实的基础。

同时,也发现了实验中的一些不足之处,提出了改进的建议,为进一步的研究工作提供了参考。

参考文献:
无。

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分子生物学实验报告重组质粒的pcr验证(目的基因的pcr扩增)姓名:xxx学号:xxx专业:xxx界别:xxx同组者:xxxx一.实验目的(1)自学掌控pcr反应的基本原理和实验技术。

(2)了解引物设计的基本要求。

1.pcr基本原理聚合酶链式反应(polymerasechainreaction),简称pcr,是一种分子生物学技术,用于在体外快速扩增dna,类似dna的细胞内复制过程:由一对引物介导,通过温度的调节,使双链dna变性为单链dna、单链dna能与引物复性(退火)成为引物-dna单链复合物、以及在dntps存在下dna聚合酶能使引物沿单链模板延伸成为双链dna(引物的延伸);这种热变性-复性-延伸的过程,就是一个pcr循环;一般通过20-30个循环之后,就可获得大量的要扩增的dna片段。

pcr技术的基本原理类似dna的天然激活过程,其特异性依赖与靶序列两端优势互补的寡核苷酸引物。

pcr由变性--淬火--延展三个基本反应步骤形成:①模板dna的变性:模板dna经加热至90~95℃左右一定时间后,使模板dna双链或经pcr扩增形成的双链dna解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板dna与引物的淬火(复性):模板dna经冷却变性成单链后,温度降到55℃左右,引物与模板dna单链的优势互补序列接合融合;③引物的延伸:dna模板--引物结合物在taqdna聚合酶的作用下,以dntp为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板dna链互补的复制链。

经过“变性—淬火—延展”三个过程就可以赢得代莱dna分子,而且这种崭新dna分子又可以沦为下次循环的模板。

因此,变性、淬火和延展循环反复25~30次后,即可从少量的模板dna中扩充出来大量的目的产物。

pcr引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板dna序列,因此,引物的优劣直接关系到pcr的特异性与成功与否。

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PCR扩增HBV-S1.实验原理1.1采用PCR扩增出HBV-S基因。

PCR是一种体外由引物介导的特定DNA序列的酶促扩增技术。

其前提是一对人工合成的15-20bp的寡核苷酸引物,其序列与待扩增的DNA两侧的碱基序列互补。

PCR包括下列三个基本步骤:变性、复性、延伸。

经过上述变性、退火、延伸步骤的25-35次循环,导致特异的靶序列的2n指数扩增。

1.2此次扩增的目的基因用于后续的表达,为了保证碱基不发生错配,不采用无矫正功能的Taq酶,而用高保真酶。

1.3为了使目的基因能和载体正确连接,本次实验选择在目的基因末端加尾(A)的方法。

2.实验目的获得HBV-S基因,为后续克隆做准备。

3.实验材料3.1模板3.2 PCR扩增引物3.3二甲基亚砜3.410×PCR 缓冲液(含Tris-HCl 100mmol/L; MgCl2 15mmol/L 、KCl 500mmol/L, pH8.3,0.1%明胶)3.5脱氧核苷三磷酸dNTPs:配成10mM- dATP,dTTP,dGTP,dCTP各10mM,用NaOH溶液调节至pH8.3。

)3.6水:要求不含DNA聚合酶抑制剂,不含离子,一般为去离子二蒸水(ddH2O), 灭菌以后即可使用。

4.实验仪器4.1PCR仪Thermo Hybaid4.2水平式琼脂糖凝胶电泳槽4.3恒压电泳仪Bio-Rad4.4凝胶成像仪JY04S—3C北京君毅东方4.5垂直流超净工作台上海智域分析仪器制造有限公司4.6微量加样器5.1获得模板5.1.1取100ul血清,加入50ul裂解液,颠倒混匀,100℃金属浴10min;5.1.2 12000rpm的转速下离心5min;取2ul作为模板。

5.2扩增HBV-S基因(PCR)5.2.1PCR体系材料体积5*buffer 2.5mMdNTP Phire模板HBV-S1 HBV-S2 ddH2O总体积4ul 1.6ul 0.4ul 2ul 1 ul 1 ul 10ul 20 ul5.2.2 PCR设置参数1)98℃预变性30s;2)98℃变性5s、60℃复性5s、72℃延伸10s,循环30次;3)72℃终延伸1min.6.琼脂糖凝胶电泳6.1量取100ml5×TBE电泳缓冲液加蒸馏水至1000ml,配置成0.5×TBE电泳缓冲液;6.2称取琼脂糖3g,加入0.5×TBE电泳缓冲液200ml,加热熔化,当凝胶冷却至60℃左右时,加入溴化乙锭溶液5ul,充分混匀;6.3先用透明胶带封固胶托边缘,放好梳子,然后再倒入凝胶(凝胶厚度在5~10mm左右);6.4在凝胶完全凝固后,小心移去透明胶带,将凝胶放入电泳槽中,加入电泳缓冲液,再小心取出梳子;6.5取已制备好的DNA样品10ul,加入染料2ul,充分混匀后用移液器将样取加入点样孔,在另一点样孔中,加入maker10ul;6.6盖上电泳槽,打开电源,电泳40~60分钟;(注意:DNA样品从负极向正极泳动);6.7将凝胶置于紫外仪下观察;将剩余的10ul保存于4℃扩增的HBV-S基因片段长度为750bp框内所标识的条带为本组实验结果(从左置右,前两管的引物体积为1ul,后两管的引物体积为0.5ul)。

分子生物学实验报告

分子生物学实验报告

分子生物学实验报告实验目的:探究基因在DNA复制过程中的作用及其表达机制。

实验材料与方法:材料:1. DNA模板:提取自大肠杆菌细胞中的质粒DNA。

2. DNA聚合酶:用于合成新的DNA链。

3. 引物:用于DNA聚合酶的引导和定向合成DNA。

4. dNTPs:脱氧核苷酸三磷酸盐,提供新的核苷酸单位供DNA聚合酶使用。

方法:1. DNA复制反应:将DNA模板、DNA聚合酶、引物和dNTPs混合在一起,加入适量缓冲液和镁离子,并在适温条件下进行DNA复制反应。

2. DNA扩增:通过PCR技术,利用引物的特异性,从DNA模板中扩增目标序列。

3. 聚丙烯酰胺凝胶电泳:用于分离和检测PCR产物,通过电泳迁移率差异判断扩增产物的大小。

实验结果:1. DNA复制反应成功进行,获得了新的DNA链。

2. PCR反应成功扩增目标序列,观察到明显的放大带。

3. 聚丙烯酰胺凝胶电泳显示PCR产物的大小符合预期。

实验分析与讨论:本实验通过模拟DNA的复制过程,成功合成了新的DNA链,并通过PCR技术扩增了目标序列。

这一结果验证了基因在DNA复制过程中的作用。

在DNA复制过程中,DNA聚合酶是关键的酶类。

DNA聚合酶能够识别DNA的模板链,并根据模板链的信息合成新的互补链。

在实验中,添加了引物和dNTPs,引物可以定向和引导DNA聚合酶的合成,dNTPs则提供了能量和碱基单位,支持DNA聚合酶的复制活动。

PCR技术是一种重要的生物分子技术,其通过引物的特异性识别和引导,扩增目标序列。

实验中,选择了适当的引物序列,使其能够与目标序列特异性地结合,并保证扩增反应的特异性和选择性。

PCR反应可以在短时间内扩增大量的目标DNA序列,为后续的分析和研究提供了足够的样品。

聚丙烯酰胺凝胶电泳是一种常用的分析方法,通过电场驱动DNA分子在凝胶中迁移,根据分子大小的差异来判断扩增产物的大小。

在实验中,聚丙烯酰胺凝胶电泳结果显示出明显的PCR产物带,与预期的目标序列大小相符,说明PCR扩增反应成功,目标序列得到了扩增。

分子生物学实验总结报告

分子生物学实验总结报告

实验总结报告摘要1、通过PCR 扩增,琼脂糖凝胶电泳回收得到外源基因parb,进行BglⅡ和Xba I 双酶切;抽提质粒pIJ86601,进行BamH I和Xba I 双酶切;将两者的酶切产物通过连接转化,培养后抽提质粒进行电泳,测序,检测重组质粒是否构建成功。

测序结果显示未构建成功。

2、用相同的方法构建表达载体PGEX-sco3330,由于时间问题尚未完成。

3、诱导蛋白表达,蛋白纯化,蛋白脱盐,bradford法进行蛋白含量测定以及SDS-PAGE电泳和免疫印迹试验(Western Blotting)。

实验内容:一、构建质粒pIJ86601-parb(一)获取外源基因parb1.PCR扩增PCR体系:200µl体系中,高保真pfuDNA聚合酶10X buffer,40 µl;10mM Mixed dNTP,5 µl;PrimerA,5 µl;PrimerB,5 µl;高保真pfu酶,2 µl;DMSO,20 µl;双蒸水,120 µl;模板1μl。

PCR程序设定Temp[℃] Time next turns Gradient[℃]1: 98.0 10min2: 98.0 30S3: 60.0 30S 30.04: 72.0 30S 2 3 45: 72.0 10min6:16.0 1h2.琼脂糖凝胶电泳切胶回收目的DNA1)通过电泳将目的片段与其他DNA尽可能分开,然后用干净的手术刀割下含需回收DNA的琼脂块,放入1.5ml离心管中。

2)按每300µl/100mg的比例加入Binding Buffer,置于50-60℃水浴中10分钟,使胶彻底融化。

加热融胶时,每2分钟混匀一次。

3)将融化的胶溶液转移到套放在2ml收集管内的UNIQ-10柱中,12,000rpm室温离心2 min。

4)取下UNIQ-10柱,倒废液,将柱放回同一收集管, 加入500µl WashSolution,12,000 rpm室温离心30秒。

分子生物学综合大实验实验报告

分子生物学综合大实验实验报告

分子生物学综合大实验实验报告外源基因SOC1的扩增和重组载体的构建与筛选班级姓名学号实验目的通过PCR技术克隆外援基因SOC1的目的片段。

通过质粒提取,酶切和连接技术,把SOC1基因重组进TA克隆载体并完成筛选。

实验用品材料:植物叶片,TA克隆载体试剂:DNA提取液(1L)TE缓冲液;琼脂糖;核酸染料;;DNAmarker;6×上样缓冲液(0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯青FF、30%甘油)、DNA聚合酶、dNTP、上下游引物器材:研钵,恒温水浴,离心机,离心管,PCR仪、生化培养箱、电泳仪、电泳槽、凝胶成像系统,去离子水、超净工作台,低温台式离心机,分光光度计,水浴锅,高压灭菌锅,酒精灯等。

实验原理通过配制DNA提取液,利用研磨法获得DNA模板,然后采用PCR技术扩增基SOC1基因获得目的片段,然后通过酶切和连接方法把SOC1基因连接到TA载体上。

大肠杆菌感受态细胞中加入质粒,则质粒DNA与Ca2+形成的复合物粘附于细胞表面,经过42℃短暂的热激处理后,DNA与Ca2+形成的复合物进入大肠杆菌细胞,在不含抗生素的培养基中短暂培养,使转入大肠杆菌质粒上的抗生素抗性基因表达,在含相应抗生素的选择培养基上可将转化菌(含质粒)与未转化细菌分开,转化细菌经过不断分裂增殖形成菌落,而未转化的细菌则不能。

并通过氨苄抗性筛选获得重组子实验方法步骤1、植物基因组DNA的小量提取(1)剪取新鲜幼嫩的植物叶片1~2片于1.5 mL离心管中.(2)先加入少量的DNA提取液100 μL,用研磨棒充分研磨尽量避免提取液溅出。

(3)再加入600 μL的DNA提取液,使DNA提取液的总体积为700 μL,上下颠倒混合均匀。

(4)放入高速离心机4 ℃条件下12 000 rpm离心15 min。

(5)取上层水相,移入标有相应序号的新的离心管中,加入600 μL的异丙醇(与加入DNA 提取液的总体积相同),上下颠倒混匀。

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分子生物学实验报告
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引言
分子生物学是一门研究生物大分子结构、功能和相互作用的学科,通过实验手
段揭示生命现象的分子机理。

本实验旨在探究DNA复制过程中的关键步骤,以及RNA转录和蛋白质翻译的基本原理。

实验一:DNA复制
DNA复制是细胞分裂过程中必不可少的步骤,它保证了遗传信息的传递和维持。

本实验通过模拟DNA复制过程,研究DNA复制酶的作用和复制的准确性。

材料:
- DNA模板
- DNA聚合酶
- 引物
- dNTPs
- 缓冲液
方法:
1. 准备反应体系,包括DNA模板、DNA聚合酶、引物、dNTPs和缓冲液。

2. 在适当的温度下,将反应体系放入PCR仪中进行反应。

3. 取样并进行凝胶电泳分析,观察DNA复制产物。

结果:
通过凝胶电泳分析,我们观察到DNA复制产物的出现。

这表明DNA聚合酶能
够在模板DNA上合成新的DNA链,并且复制的过程较为准确。

讨论:
DNA复制的准确性是生命传递遗传信息的基础。

DNA聚合酶具有校正功能,能够识别和修复错误的碱基配对。

这种精确性保证了基因组的稳定性和可靠性。

实验二:RNA转录
RNA转录是将DNA信息转录成RNA的过程,它是基因表达的第一步。

本实验旨在研究RNA转录的机制和调控。

材料:
- DNA模板
- RNA聚合酶
- 引物
- NTPs
- 缓冲液
方法:
1. 准备反应体系,包括DNA模板、RNA聚合酶、引物、NTPs和缓冲液。

2. 在适当的温度下,将反应体系放入PCR仪中进行反应。

3. 取样并进行凝胶电泳分析,观察转录产物。

结果:
凝胶电泳分析显示出RNA转录产物的出现。

这表明RNA聚合酶能够在DNA模板上合成RNA链。

讨论:
RNA转录是基因表达的第一步,它决定了细胞内特定基因的表达水平。

RNA聚合酶通过与DNA模板的互作用,选择性地合成特定的RNA链。

这种选择性转
录是基因调控的关键。

实验三:蛋白质翻译
蛋白质翻译是将RNA信息翻译成蛋白质的过程,它是生物体内蛋白质合成的关
键步骤。

本实验旨在研究蛋白质翻译的机制和调控。

材料:
- mRNA
- 核糖体
- tRNA
- 氨基酸
- GTP
方法:
1. 准备反应体系,包括mRNA、核糖体、tRNA、氨基酸和GTP。

2. 在适当的温度下,将反应体系放入PCR仪中进行反应。

3. 取样并进行凝胶电泳分析,观察蛋白质合成产物。

结果:
凝胶电泳分析显示出蛋白质合成产物的出现。

这表明核糖体能够根据mRNA上
的密码子序列,选择性地合成特定的氨基酸链。

讨论:
蛋白质翻译是生物体内蛋白质合成的关键步骤。

核糖体通过与mRNA的互作用,将mRNA上的信息翻译成氨基酸序列,从而合成特定的蛋白质。

这种选择性翻
译是维持细胞内蛋白质组成和功能的基础。

结论
通过本实验,我们深入了解了DNA复制、RNA转录和蛋白质翻译的基本原理和调控机制。

这些实验结果对我们进一步理解生命的分子机理具有重要意义,也为分子生物学的研究提供了基础。

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