实战利用SPSS进行生存分析
生存分析SPSS
生存分析SPSS生存分析是一种统计分析方法，用于研究个体在其中一种特定事件发生之前的生存时间或其持续时间。
生存数据通常是从健康、病理学或其他研究中收集到的，常见的应用有医学领域的生存率研究、产品的寿命分析等。
SPSS（Statistical Package for the Social Sciences）是一种常用的统计分析软件，它提供了强大的功能和易于使用的界面，可以进行生存分析和其他统计分析。
生存分析的目的是探讨事件发生的概率和时间。
与传统的统计分析方法不同，生存分析考虑了数据中的故障时间，即个体的生存时间。
生存时间可以是不同个体之间的差异，也可以是同一个体在不同时间点的变化。
在SPSS中进行生存分析，首先需要准备生存数据集。
生存数据集通常包括以下几个要素：个体的生存时间，事件是否发生，个体的特征变量等。
个体的生存时间可以是连续的，也可以是离散的。
事件是否发生通常用0表示未发生，1表示发生。
个体的特征变量可以是性别、年龄、治疗方式等。
在SPSS中进行生存分析，主要采用的方法是Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险模型。
Kaplan-Meier生存曲线是一种非参数方法，用于估计生存时间和生存概率。
它将个体的生存时间按照事件是否发生进行分类，并计算每个时间点上的生存概率。
SPSS中可以通过选择“Analyze”菜单下的“Survival”子菜单中的“Nonparametric Tests”来进行Kaplan-Meier 生存曲线分析。
Cox比例风险模型是一种半参数方法，用于估计生存时间和危险因素对生存的影响。
它可以考虑多个危险因素，并通过估计每个危险因素的风险比来评估其对生存的影响。
SPSS中可以通过选择“Analyze”菜单下的“Survival”子菜单中的“Cox Regression”来进行Cox比例风险模型分析。
除了Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险模型，SPSS还提供了其他生存分析方法，如Log-rank检验、Proportional Hazard模型等。
医学统计学SPSS生存分析实例
将生存时间按从小到大顺序排列如下：
表1 BCG治疗组生存情况
*死亡=1；删失=0
表2 药物和BCG结合治疗组生存情况
*死亡=1；删失=0
按上述二表将数据输入SPSS软件，其中数据编号为i，列（1）即时间为t，列（3）即生存结局为status，表1为group1，表2为group2。
选择Analyze中的Survival里的Kaplan-Meier分析，将Time，Status，Factor依次选定，option和Compare Factor依次设定完成后，得到输出结果，结果分析如下：
Survival Table中：
1为BCG治疗组患者生存率（Estimate）及其标准误（Std. Error）的计算结果。
2为药物与BCG结合治疗组患者生存率（Estimate）及其标准误（Std. Error）的计算结果。
Overall Comparisons
Test of equality of survival distributions for the different levels of group.
两组生存率的log-rank检验
H0：两种疗法患者生存率相同
H1：两种疗法患者的生存率不同
α=0.05
采用SPSS软件对两组生存率进行检验，得到上面Overall Comparisons表，其中第一行为LogRank检验结果。
即X2=0.057，P=0.811。
按α=0.05水准，不拒绝H0，还不能认为用BCG疗法和用药物与BCG结合疗法治疗黑色素瘤患者的生存率有差别。
生存曲线如上图所示，其中生存时间为横轴，生存率为纵轴。
SPSS生存分析
SPSS生存分析生存分析（Survival Analysis）是一种统计方法，用于研究时间到达一些特定事件的概率。
该方法适用于各种学科领域，包括医学、社会科学、工程等，可以分析个体在不同时间点发生一些事件的风险。
生存分析的基本概念是生存函数和生存时间。
生存函数描述了在给定时间点之前没有发生事件的个体比例。
生存时间是指个体从起始时间点到达特定事件的时间。
生存分析的目标是估计生存函数，并比较不同因素对生存时间的影响。
SPSS（Statistical Package for the Social Sciences）是一种常用的统计分析软件，它提供了进行生存分析的功能。
以下将以SPSS进行生存分析为例，介绍生存分析的具体步骤。
首先，需要准备数据。
数据应包括个体的起始时间点和观察时间（或终止时间），以及是否发生特定事件的信息。
数据应按照个体的起始时间点排序。
在SPSS中，选择"Analyze"菜单下的"Survival"子菜单，然后选择"Kaplan-Meier"。
在弹出的窗口中，将起始时间点和观察时间字段分别拖放到"Time"和"Censored Time"框中，将事件发生与否的字段拖放到"Censoring Variable"框中。
点击"OK"按钮运行分析。
SPSS将输出生存函数曲线图和表格。
生存函数曲线图显示了在不同时间点的生存概率，曲线下降表示生存概率下降，即事件发生的风险增加。
生存函数表格列出了不同时间点的生存概率和标准误差。
通过观察曲线和表格，可以初步了解生存情况和影响生存的因素。
如果需要进一步比较不同因素对生存时间的影响，可以使用SPSS的"Analyze"菜单下的"Survival"子菜单中的其他功能，比如"Log-rank"检验、Cox回归模型等。
如何用SPSS做生存分析（TCGA数据举例）
如何用SPSS做生存分析（TCGA数据举例）生存分析是评价疾病预后的一个重要分析方法，尤其是在肿瘤研究中。
之前我们介绍过好几个肿瘤生存分析的在线工具，比如KM plotter，Onclnc，GEPIA等等（生存分析，这个网站还不错！，懒人怎么做肿瘤病人的生存分析？）。
有童鞋反映说这几个工具分析出来的结果咋不一样呢？原因主要有：1、在线工具的数据样本来源不同，大致上是KM plotter（TCGA 数据+GEO数据）>GEPIA（TCGA数据）>Onlnc（部分TCGA数据）2、分析时样本剔除的标准有所不同。
此外，在线工具分析的结果你无法得到入选分析样本的临床数据，也无法得到下图这样分类更加详细的生存分析结果。
（硕士论文：浙江省常见恶性肿瘤生存分析）所以有的时候还是得自己亲自动手做不做生存分析，今天就给大家介绍一下如何用SPSS分析对TCGA数据库中的肿瘤（肺腺癌）数据进行生存分析。
（SPSS版本是16.0的，还是英文的，从一个留学的同学那拷来的，一直没换，大家将就着看吧）首先是下载TCGA的临床数据和测序数据（FPKM数据），这一步可以用简易TCGA下载工具这个小工具来处理（这么好用的TCGA 数据下载工具？！）。
得到临床数据后，我们需要得到Over survival（OS）的数据，如果病人死亡了，OS就等于days to death，如果还活着，那就等于days to last followup。
而没有数据的病例就是我们需要剔除的条目了。
得到OS的数据之后，我们可以选择不同的临床信息进行生存分析，比如TNM分级，吸烟与否，治疗方式等等。
我们以抽烟为例，Not Availale为不抽烟病例，其他为抽烟的病例。
根据存活与否排序，得到OS的数据，再根据OS排序，删除没有生存信息的数据再看下吸烟情况，不吸烟的人似乎有点少，看来得肺腺癌的还是吸烟的多啊。
考虑到“节目效果”，这里把吸烟史=1的也归到不吸烟组。
生存分析SPSS过程（SPSSofSurvivalAnalysis）
生存分析SPSS过程（SPSS of Survival Analysis）Company name生存分析SPSS过程（SPSS of Survival Analysis）邹莉玲预防医学教研室Company Logo1. 何为生存分析？生存分析（survival analysis）是将事件的结果（终点事件）和出现结果经历的时间结合起来分析的一种统计分析方法。
2. 生存分析的目的：描述生存过程：估计不同时间的总体生存率，计算中位生存期，绘制生存函数曲线。
统计方法包括Kaplan-Meier（K-M）法、寿命表法。
比较：比较不同处理组的生存率，如比较不同疗法治疗脑瘤的生存率，以了解哪种治疗方案较优。
统计方法log-rank检验等。
影响因素分析：研究某个或某些因素对生存率或生存时间的影响作用。
如为改善脑瘤病人的预后，应了解影响病人预后的主要因素，包括病人的年龄、性别、病程、肿瘤分期、治疗方案等。
统计方法cox比例风险回归模型等。
预测：建立cox回归预测模型。
生存分析的理论复习Company Logo生存分析(Survival Analysis)菜单Company Logo寿命表（Life Tables）过程Life tables 过程用于（小样本和大样本资料）：估计某生存时间的生存率，以及中位生存时间。
绘制各种曲线：如生存函数、风险函数曲线等。
对某一研究因素不同水平的生存时间分布的比较。
控制另一个因素后对研究因素不同水平的生存时间分布的比较。
对多组生存时间分布进行两两比较。
（比较总体生存时间分布采用wilcoxon检验）Company LogoCompany Logo实例分析例1：为了比较不同手术方法治疗肾上腺肿瘤的疗效，某研究者随机将43例病人分成两组，甲组23例、乙组20例的生存时间（月）如下所示：其中有“+”者是删失数据，表示病人仍生存或失访，括号内为死亡人数。
（1）计算甲、乙两法术后10月的生存率和标准误。
利用spss做生存分析课程设计
利用spss做生存分析课程设计一、教学目标本课程的目标是使学生掌握生存分析的基本概念、方法和应用，能够熟练使用SPSS软件进行生存分析，并能够对生存数据分析结果进行解释和报告。
具体的学习目标包括：1.理解生存分析的基本概念，包括生存时间、事件发生时间和风险比等。
2.掌握生存分析的基本方法，包括Kaplan-Meier法、Cox比例风险模型等。
3.熟悉SPSS软件中进行生存分析的操作方法和步骤。
4.能够使用SPSS软件进行生存时间的收集和整理。
5.能够使用SPSS软件进行生存分析，包括Kaplan-Meier法和Cox比例风险模型。
6.能够对生存分析结果进行解释和报告，包括生存曲线、风险比、显著性检验等。
情感态度价值观目标：1.培养学生对生存数据分析的兴趣和主动性，提高学生对数据分析的敏感性和判断力。
2.培养学生对数据的尊重和诚实的态度，要求学生在数据分析中严谨、客观、公正。
二、教学内容本课程的教学内容主要包括生存分析的基本概念、方法和SPSS软件的应用。
具体的教学大纲如下：1.生存分析概述：介绍生存分析的基本概念、定义和应用领域。
2.Kaplan-Meier法：介绍Kaplan-Meier生存曲线及其计算方法，包括生存时间和事件发生时间的收集和整理。
3.Cox比例风险模型：介绍Cox比例风险模型的基本原理和计算方法，包括风险比、显著性检验等。
4.SPSS软件操作：介绍SPSS软件中进行生存分析的操作方法和步骤，包括数据输入、生存分析命令和结果输出。
三、教学方法本课程的教学方法采用讲授法、案例分析法和实验法相结合的方式。
具体方法如下：1.讲授法：通过教师的讲解和演示，向学生传授生存分析的基本概念、方法和SPSS软件的操作技巧。
2.案例分析法：通过分析具体的生存分析案例，使学生能够将理论知识与实际应用相结合，提高学生的分析能力和判断力。
3.实验法：通过实验操作，使学生能够亲自动手进行生存分析，培养学生的实践能力和操作技能。
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
Ln_yesno是類別型的自變項，需要 加以定義參考族群
在此定義編碼為 first category者為參考族群 （分母）。
記得按了change鍵才算完成。
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
HR=1→分子與分母的風險相等 HR<1→分子風險比分母低 HR>1→分子風險比分母高
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
定義存活時間的區 間與間隔
選製存活曲線
利用SPSS作存活分析II
• Life table • Survival Curve
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
利用SPSS作存活分析II
Independent factors: Histologic grade, Pathologic tumor size, Lymph node(+/-), Estrogen receptor(+/-), Progesteron receptor(+/-)
利用SPSS作存活分析II来自利用SPSS作存活分析II
• PH assumption – PH: proportional hazard – 累積風險函數H(t)在各時間點的比值固定 – lnH(t)的在各時間點呈等差
H(t)累積風險函數＝ -ln S(t)
用log minus log圖來檢查PH假說
符合前提假設： 曲線在各時間點始終等差。 （因為已取log）
eb1 HR
SPSS生存分析过程
SPSS Survival(生存分析)菜单SPSS Survival菜单包括Life Tables过程、Kaplan-Meier过程、Cox Regression过程、Cox w/Time-Dep Cov过程。
这里只介绍Life Tables过程和Kaplan-Meier过程。
Life Tables过程Life Tables过程用于：1、估计某生存时间的生存率。
2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。
3、对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较，控制另一因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较，包括从总体上比较和不同水平之间进行两两比较。
一、建立数据文件定义两个列变量：时间变量：取名“time”，label标上“survival time(week)”。
生存状态变量：取名“status”，并赋值：0=“删失”，1=“死亡”。
二、操作过程从菜单选择1、Analyze==>Survival ==>Life Tables2、Time框：选入time3、Display Time Intervals框：在by前面的框内填入生存时间上限，本例填入20（此区间必须包括生存时间的最大值）；在by后面的框内填入生存时间的组距，本例填入5，以保证结果列出“15-”的组段。
4、Status框：选入status；击define events钮,在single value框右边的空格中输入15、单击Option按钮，弹出对话框：●Life Table(s) 输出寿命表，系统默认● Plots: 选Survival（累积生存函数曲线）击Continue6、单击OK钮附：界面说明图1 寿命表主对话框【Time】框选入生存时间变量。
【Display Time Intervals】框欲输出生存时间范围及组距。
在by前面的框内填入生存时间上限，本例填入200（此区间必须包括生存时间的最大值）；在by后面的框内填入生存时间的组距，本例填入20，以保证结果列出“100-”的组段。
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实战利用SPSS进行生存分析
生存分析（Survival Analysis）是一种用于分析个体在一定时间内
发生其中一事件的概率的统计方法。
生存分析可以用于疾病的生存时间分析、产品寿命分析、客户流失分析等。
SPSS是一种常用的统计分析软件，可以进行生存分析的实证研究。
生存分析的基本概念包括：生存时间（Survival Time）、生存率（Survival Rate）、累积风险（Cumulative Hazard）以及生存函数（Survival Function）等。
生存时间是指个体从其中一起始点到发生其
中一事件所经过的时间。
生存率是指个体在其中一时间点存活下来的概率，也称为存活函数。
累积风险是指个体在其中一时刻前发生其中一事件的风
险累积值。
进行生存分析的步骤包括：导入数据、设置生存时间和事件变量、选
择合适的生存分析方法、进行分析和结果解释。
首先，在SPSS中导入数据。
可以将数据以Excel格式保存，然后在SPSS中选择File->Open->Data，选择相应的文件导入。
选择合适的生存分析方法。
SPSS提供了多种生存分析方法，如
Kaplan-Meier生存曲线、Cox回归模型等。
选择合适的方法可以根据研究
目的和数据特点来确定。
例如，如果想了解不同因素对生存时间的影响，
可以选择Cox回归模型。
在SPSS中，可以使用Analyze->Survival-
>Survival，然后选择合适的方法进行分析。
进行生存分析。
根据选择的方法，SPSS会输出相应的结果。
例如，
对于Kaplan-Meier生存曲线分析，SPSS会生成生存曲线和相应的生存率
表格；对于Cox回归模型，SPSS会输出回归系数、风险比率等统计结果。
可以通过点击Results窗口中的相应选项来查看结果。
结果解释。
根据生存分析结果，可以解读生存曲线、计算生存率、比
较不同组别间的生存差异等。
对于Kaplan-Meier生存曲线，可以通过图
形来比较不同组别的生存率；对于Cox回归模型，可以根据回归系数和风
险比率来解释不同因素对生存时间的影响。
在进行生存分析时，需要考虑一些注意事项。
首先，要确保数据的质
量和完整性，避免缺失数据和异常值对结果的影响。
其次，要根据数据特
点选择合适的分析方法，避免方法选择不当导致结果的错误或失真。
此外，生存分析中的数据假设通常包括独立、比例风险、线性关系等，需要根据
具体情况进行验证。
综上所述，SPSS是一种进行生存分析的常用工具。
通过导入数据、
设置生存时间和事件变量、选择合适的生存分析方法、进行分析和结果解
释等步骤，可以实施生存分析并得到相应的结果。
在实际应用中，还需要
根据具体问题和数据特点进行进一步的检验和解释，以得到更可靠和准确
的结论。