Western Blot 原理和操作方法(详细)资料
WesternBlot原理和操作方法(全)讲解

Western Blot 原理和操作方法(全)Western Blot工作原理蛋白质的电泳分离是重要的生物化学分离纯化技术之一,电泳是指带电粒子在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象.根据所采用的支持物不同,有琼脂糖凝胶电泳,淀粉凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳等.其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)由于无电渗作用,样品用量少(1-100μg),分辨率高,可检出10-9-10-12mol 的样品,凝胶机械强度大,重复性好以及可以通过调节单体浓度或单体与交联剂的比例而得到孔径不同的凝胶等优点而受到广旱挠τ?SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量.PAGE能有效的分离蛋白质,主要依据其分子量和电荷的差异,而SDS-PAGE(SDS 变性不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳)的分离原理则仅根据蛋白质的分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液是在要跑电泳的样品中假如含有SDS和巯基乙醇(2-ME)或二巯基赤藓醇(DTT),其可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键,破坏蛋白质的四级结构,SDS是一种阴离子表面活性剂即去污剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级及三级结构,并与蛋白质的疏水部分相结合,破坏其折叠结构,电泳样品假如样品缓冲液后,要在沸水中煮3-5分钟使SDS与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,SDS-蛋白质复合物在强还原剂巯基乙醇存在时,蛋白质分子内的二硫键被打开而不被氧化,蛋白质也完全变性和解聚,并形成榛状结构,稳定的存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,平均每两个氨基酸残基结合一个SDS分子,这时各种蛋白质分子本身的电荷完全被SDS掩盖,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基. 样品处理液中通常加入溴酚蓝染料, 溴酚蓝指示剂是一个较小的分子,可以自由通过凝胶孔径,所以它显示着电泳的前沿位置,当指示剂到达凝胶底部时,即可停止电泳.另外样品处理液中也可加入适量的甘油或蔗糖以增大溶液密度,使加样时样品溶液可以沉入样品加样槽底部.重要参数①聚丙烯酰胺凝胶(PAG)制备原则:由于孔径的大小取决于单体和双体丙烯酰胺在凝胶中的总浓度(T)以及双体占总浓度的百分含量即交联度(C)决定的,因而制胶之前必须首先知道这两个参数.一般可以由下述公式计算:T%=(a+b)/m*100%; 和C%=a/(a+b)*100%其中: a=双体(bis)的重量;b=单体(arc)的重量;m=溶液的体积(ml)②当分析一个未知样品时,常常先用7.5%的标准凝胶制成4-10的梯度凝胶进行试验,以便选择理想的胶浓度.如果蛋白质的分子量已知,可参考下表选择所需凝胶浓度:蛋白质分子量范围(Da) 适宜的凝胶浓度(%)<104 20-301×104-4×104 15-204×104-1×105 10-151×105-5×105 5-10>5×105 2-5③分离胶:电泳凝胶浓度试剂10% 12% 15% 10% 12% 15%H2O(ml) 4.0 3.3 2.3 5.9 4.9 3.430%丙烯酰胺(T: 30%,C: 3%(ml) 3.3 4.0 5.0 5.0 6.0 7.51.5mol/lTris.cl(PH8.8) (ml)2.5 2.5 2.53.8 3.8 3.810%SDS(ml) 0.1 0.1 0.1 0.15 0.15 0.1510%AP(ml) 0.1 0.1 0.1 0.15 0.15 0.15TEMED(μl) 4 4 4 6 6 6总体积(ml) 10 15④浓缩胶试剂浓度(5%)H2O(ml) 4 230%丙烯酰胺(T: 30%,C: 3%(ml) 1 0.51.0mol/lTris.cl(PH8.8) (ml) 1 0.510%SDS(μl) 80 4010%AP(μl) 60 30TEMED(μl) 8 4总体积(ml) 6 3蛋白质的样品制备:蛋白质的样品制备是Western Blotting的第一步,样品制备是关键步骤,要求尽可能的获得所有蛋白质,应注意以下问题:1:在合适的盐浓度下,应保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。
westernblot电泳原理及步骤

westernblot电泳原理及步骤一、概述西方印迹(w es te rnb l ot)是一种重要的蛋白质分析技术,广泛应用于分子生物学和生物化学研究中。
它通过将待检蛋白质进行SD S-P AG E电泳分离,再转移到聚合物膜上,利用特异性抗原与抗体结合的原理,检测目标蛋白质的存在与表达水平。
二、原理1.SD S-PA GE电泳分离-准备样品:将待检蛋白质样品加入去离子水、蛋白质缓冲液和还原剂混合,使蛋白质变性和解聚。
-加载样品:将样品加入聚丙烯酰胺凝胶(p ol ya cr yl am id eg e l)孔上。
-电泳分离:将准备好的凝胶置于电泳槽中,通电使蛋白质在凝胶中由负极向正极运动分离。
2.转膜-准备转膜装置:将P V DF或N C膜与吸水性纸张浸泡后,叠放在转膜装置中,并按压缩成一整体。
-预处理转膜:将转膜装置放入转渍缓冲液中浸泡,使其湿润。
-转移:将电泳完的凝胶与转膜装置层叠,加上固定层叠板,施加压力进行转膜。
3.免疫检测-封闭:将转膜后的膜置于封闭液中,阻断非特异性结合位点,减少背景信号。
-孵育:将膜与目标蛋白对应的一抗抗体孵育,使其与目标蛋白特异性结合。
-洗涤:用洗涤缓冲液洗去非特异性结合的抗体。
-二抗检测:将膜与与一抗相应的辣根过氧化物酶标记的二抗孵育,二抗与一抗结合形成复合物。
-显示:加入发色底物,与酶催化反应,生成可视化的蛋白质带谱。
三、操作步骤1.准备样品-将待检蛋白质样品加入适量去离子水、蛋白质缓冲液和还原剂混合。
-完全溶解样品,可加热至95°C处理。
2.SD S-PA GE电泳分离-准备分离凝胶:根据目标蛋白质的分子量选择合适浓度的凝胶。
-加载样品:用自动吸管或微量注射器将样品均匀地加载到聚丙烯酰胺凝胶孔上。
-启动电泳:将准备好的凝胶放入电泳槽中,加入电泳缓冲液,通电进行电泳。
3.转膜-准备转膜装置:按照转膜装置的说明书操作,准备好转膜膜和膜瓶。
-预处理转膜:将PVD F或N C膜与吸水性纸张浸泡,并放入转膜缓冲液中浸泡片刻。
Western_blot的原理、操作及注意事项

Western_blot的原理、操作及注意事项Western blot的原理、操作及注意事项原理:通过电泳区分不同的组分,并转移⾄固相⽀持物,通过特异性试剂(抗体)作为探针,对靶物质进⾏检测,蛋⽩质的Western 印迹技术结合了凝胶电泳的⾼分辨率和固相免疫测定的特异敏感等多种特点,可检测到低⾄1~5ng(最低可到10-100pg)中等⼤⼩的靶蛋⽩。
⼀、抗原的选择和制备A:样品的制备1 组织:组织的处理⽅法:组织洗涤后加⼊3倍体积预冷的PBS,0℃研磨,加⼊5×STOP buffer,180W,6mins,0℃超声波破碎,5000rpm,5mins 离⼼,取上清。
加⼊β-ME(9.5ml加⼊0.5ml),溴酚蓝(9.5ml加⼊0.5ml)煮沸10min,分装后于-20℃保存,⽤时取出,直接溶解上样。
2 细胞:细胞的处理⽅法:离⼼收集细胞或者直接往细胞培养瓶内加⼊5×STOP buffer,收集,180W,6mins,0℃超声波破碎,5000rpm,5mins 离⼼,取上清。
加⼊β-ME(9.5ml加⼊0.5ml),溴酚蓝(9.5ml加⼊0.5ml)煮沸10min,分装后于-20℃保存,⽤时取出,直接溶解上样。
3 分泌蛋⽩的提取(特例):直接收集分泌液,加⼊β-ME、溴酚蓝制样。
B:蛋⽩的定量⽅法及影响蛋⽩定量原因1.双缩脲法:双缩脲法是第⼀个⽤⽐⾊法测定蛋⽩质浓度的⽅法。
在需要快速,但不很准确的测定中,常⽤此法。
硫铵不⼲扰显⾊,这对蛋⽩质提纯的早期阶段是⾮常有利的。
双缩脲法的原理是Cu2+与蛋⽩质的肽键,以及酪氨酸残基络合,形成紫蓝⾊络合物,此物在540nm波长处有最⼤吸收。
双缩脲法常⽤于0.5g/L~10g/L含量的蛋⽩质溶液测定。
⼲扰物有硫醇,以及具有肽性质缓冲液,如Tris、Good缓冲液等。
可⽤沉淀法除去⼲扰物,即⽤等体积10%冷的三氯醋酸沉淀蛋⽩质,然后弃去上清液,再⽤已知体积的1m NaOH溶解沉淀的蛋⽩质进⾏定量测定。
(完整版)westernblot原理及操作

Joule Heating
Q=W=PT=UIT=
非纯电阻电路:Q<W
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
resistance Heat
inconsistent field strength and transfer lose its buffering capacity
cause the gel to melt/ stick to the membrane/条带出现波浪状
4. Determination of protein concentration
变性
➢解聚/氧化还原 ➢暴露抗原表位(表位可能位于3D构象的内部)
5. Preparation of samples for loading into gels ➢ Loading buffer ➢ Volume ➢ Amount: 30-50ug 过犹不及,内参粘连,荧光灼烧式淬灭
Electrophoresis
➢ 显微电泳 ➢ 自由界面电泳 ➢ 区带电泳
1.支持物的物理性状: (1)纸电泳 (2)粉末电泳 (3)凝胶电泳 (4)缘线电泳 2.支持物的装置形式: (1)平板式电泳 (2)垂直板电泳 (3)柱状(管状)电泳: 3.pH的连续性: (1)连续pH电泳 (2)非连续pH电泳
B.Electrophoresis
交联剂
催化剂 助凝剂
使每个蛋白的起跑线相同,提高解析度
Acry Pore size 高浓度胶 小分子量 低浓度胶 大分子量
液封 :沿玻板流下,避免产生气泡;动作轻慢 0.5-1h凝胶
Clean thoroughly
缓冲液的离子强度 Check the pH; it should be around 8.3
➢ 阳性对照 ➢ Marker
westernblot原理及步骤

一、western blot 的定义:即蛋白免疫印迹( Western Blot) 是将电泳分离后的细胞或组织总蛋白质从凝胶转移到固相支持物NC膜或PVDF 膜上,然后用特异性抗体检测某特定抗原的一种蛋白质检测技术,现已广泛应用于基因在蛋白水平的表达研究、抗体活性检测和疾病早期诊断等多个方面。
二、western blot 的原理先制备蛋白质样品,再利用SDS-PAGE原理,分离不同的蛋白质,再将分离的蛋白质进行转膜,以便固定在新膜上进行抗原-抗体结合。
用固定在膜上的蛋白质作为抗原与对应的非标记抗体(一抗)结合。
由于此过程中,可能有未结合到抗原的抗体遗留,故需要清洗,以便保存特异性结合的抗原-抗体结合物。
抗原抗体结合物暴露出一个Fc片段,相应的二抗可以结合到这个片段上,形成抗原-一抗-二抗结合物,再用相应的过氧化物酶或碱性磷酸酯酶标记到二抗上,由于加入的标记物相对质量分子很大,可以用离心作用将其沉淀下来,如果抗原与抗体结合,便可以一起沉淀下来,最后通过显色反应或放射自显影法便可检测凝胶中的蛋白成分了。
三、Westernblot法操作步骤是:Westernblot第一步将被分析的蛋白样品做SDS—PAGE凝胶电泳,使样品中的蛋白质按分子量大小在凝胶中分成条带。
Westernblot法第二步把凝胶中的蛋白转移到膜上(所谓印迹),其中用得最多的材料是硝酸纤维素膜(NC膜)和PVDF膜。
蛋白转移的方法多采用电转移,也有用吸印法转移的(原理与Southern blotting类似)电转移又有半干法和湿法之分,本实验采用后者。
bio-rad专家还提到Westernblot法最后一步是用特异性的抗体检测,看印迹膜上是否存在相应抗原。
免疫检测的方法可以是直接或间接的,现在一般都是采用间接免疫配标的方法。
在用特异性的第一抗体染色后,再用酶标的第二抗体(辣根过氧化物酶(HRP)或碱性磷酸酶(AP)标记的抗第一抗体的抗体)染色,再加酶的底物显色,通过膜上显现出的颜色或经化学发光在x光底片上出现的曙光条带来显示抗原的存在。
Western-Blot-原理和操作方法(全)要点

Western Blot 原理和操作方法(全)工作原理蛋白质的电泳分离是重要的生物化学分离纯化技术之一,电泳是指带电粒子在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象.根据所采用的支持物不同,有琼脂糖凝胶电泳,淀粉凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳等.其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)由于无电渗作用,样品用量少(1-100μg),分辨率高,可检出10-9-10-12mol的样品,凝胶机械强度大,重复性好以及可以通过调节单体浓度或单体与交联剂的比例而得到孔径不同的凝胶等优点而受到广泛的应用.SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量.PAGE能有效的分离蛋白质,主要依据其分子量和电荷的差异,而SDS-PAGE(SDS变性不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳)的分离原理则仅根据蛋白质的分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液是在要跑电泳的样品中假如含有SDS和巯基乙醇(2-ME)或二巯基赤藓醇(DTT),其可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键,破坏蛋白质的四级结构,SDS是一种阴离子表面活性剂即去污剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级及三级结构,并与蛋白质的疏水部分相结合,破坏其折叠结构,电泳样品假如样品缓冲液后,要在沸水中煮3-5分钟使SDS 与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,SDS-蛋白质复合物在强还原剂巯基乙醇存在时,蛋白质分子内的二硫键被打开而不被氧化,蛋白质也完全变性和解聚,并形成榛状结构,稳定的存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,平均每两个氨基酸残基结合一个SDS分子,这时各种蛋白质分子本身的电荷完全被SDS掩盖,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基.样品处理液中通常加入溴酚蓝染料, 溴酚蓝指示剂是一个较小的分子,可以自由通过凝胶孔径,所以它显示着电泳的前沿位置,当指示剂到达凝胶底部时,即可停止电泳.另外样品处理液中也可加入适量的甘油或蔗糖以增大溶液密度,使加样时样品溶液可以沉入样品加样槽底部.重要参数①聚丙烯酰胺凝胶(PAG)制备原则:由于孔径的大小取决于单体和双体丙烯酰胺在凝胶中的总浓度(T)以及双体占总浓度的百分含量即交联度(C)决定的,因而制胶之前必须首先知道这两个参数.一般可以由下述公式计算:T%=(a+b)/m*100%; 和C%=a/(a+b)*100%其中: a=双体(bis)的重量;b=单体(arc)的重量;m=溶液的体积(ml)②当分析一个未知样品时,常常先用7.5%的标准凝胶制成4-10的梯度凝胶进行试验,以便选择理想的胶浓度.如果蛋白质的分子量已知,可参考下表选择所需凝胶浓度:蛋白质分子量范围(Da) 适宜的凝胶浓度(%)<10420-301×104-4×10415-204×104-1×10510-151×105-5×1055-10>5×1052-5蛋白分子量 (kDa)凝胶浓度 (%)4-40 20 12-45 15 10-70 12.5 15-100 10 25-2008③分离胶(5ml 体积):5%的积层胶的配置:蛋白质的样品制备:蛋白质的样品制备是Western Blotting 的第一步,样品制备是关键步骤,要求尽可能的获得所有蛋白质,应注意以下问题:1:在合适的盐浓度下,应保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。
westernblot原理及步骤

westernblot原理及步骤一、配胶原理:30% acrylamide mix:产生凝胶的基本物质1.5M Tris(ph 8.8) :使分离胶PH为8.8(与甘氨酸的pka接近,从而使不同分子量的蛋白产生不同的电泳速度,从而使不同分子量的蛋白分开)1.0MTris(ph 6.8):使浓缩胶PH为6.8(可以通过甘氨酸和氯离子的作用产生压缩,从而使蛋白条带压细)10% SDS阴离子去污剂:断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质二三级结构,消除蛋白质在迁移过程中结构的影响。
与蛋白质形成SDS-蛋白质复合物,由于SDS带有大量负电荷,蛋白质本身的电荷被掩盖,从而消除蛋白质迁移过程中自身电荷的差异造成的影响。
同时能够助溶,蛋白质变为亲水,容易在水相中迁移。
每克多肽可以与1.4g 去污剂结合,当分子量在15kd-200kd之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,logMW(分子量)=K-bx(迁移率)AP:提供acr丙烯酰胺和bis亚甲丙烯酰胺聚合的氧自由基,是acr 和bis聚合的引发剂TEMED:催化AP释放氧自由基,是反应的催化剂1、清洗干净1.5mm或1mm玻璃板,检漏(有豁口和字的朝上)2、倒掉水,配10ml 10%的分离胶(1.5mm板需要7ml,1mm 板需要4.5ml)10%方案如下:H2O 4.0ml30% acrylamide mix 3.3ml1.5M Tris(ph 8.8)2.5ml10% SDS 0.1ml10% ammonium persulfate 0.1mlTEMED 0.004ml3、混合后上下摇晃,注意不要放在手中配(否则温度太高凝固的快),静置15s后用1ml枪二档吸一档打(在一角加即可,不用来回加,否则容易出气泡。
不过出气泡了也没事,加水压一下就浮上来了)4、加进玻璃板中,随后均匀来回加水到满5、等待20分钟6、倒掉水,将架子倒置过来让水排干,用纸巾擦拭斜角(一定要擦干净所有的水!否则两层胶之间出现水层就废了),同时配浓缩胶4ml H2O 2.7ml30% acrylamide mix 0.67ml1.0M Tris(ph 6.8) 0.5ml10% SDS 0.04ml10% ammonium persulfate 0.04ml TEMED 0.004ml7、加满分离胶后插入1.5mm或1mm的梳子,注意不要有气泡,等待20min二、测定蛋白浓度原理:A液是质量浓度为0.1g/mL氢氧化钠溶液(20ul protein assayS+1ml protein assay A),B液是质量浓度为0.01g/mL硫酸铜溶液。
蛋白质免疫印迹(Western Blot )实验步骤和原理及注意事项

蛋白质免疫印迹(Western Blot )实验步骤和原理及注意事项1.收集蛋白样品(Protein sample preparation)可以使用适当的裂解液。
收集完蛋白样品后,为确保每个蛋白样品的上样量一致,需要测定每个蛋白样品的蛋白浓度。
根据所使用的裂解液的不同,需要采用适当的蛋白浓度测定方法。
因为不同的蛋白浓度测定方法对于一些去垢剂和还原剂等的兼容性差别很大。
BCA法。
2. 电泳(Electrophoresis)(1) SDS-PAGE凝胶配制(2) 样品处理在收集的蛋白样品中加入适量浓缩的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。
例如2X或5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。
使用5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液可以减小上样体积,在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋白样品。
100℃或沸水浴加热3-5分钟,以充分变性蛋白(根据蛋白分子的大小,煮沸时间可适当变化,一般不低于5min。
煮沸只是变性蛋白,而不是分解,一般加了抑制酶不会分解。
煮沸对于SDS-PAGE凝胶电泳是必须的,只有煮沸,才能消除蛋白质的立体二级结构,伸展为一维线性结构,所以一般来讲二聚体都会解体,才能完全按照分子量跑电泳,加的蛋白Marker才有指示分子量的意义。
蛋白样品变性后与SDS充分结合,SDS使每个氨基酸带相同的电荷,使整个蛋白呈线性结构. 抗体因为要是线性表位结合的,100度煮10min 后13000,离心5分钟,取上清电泳,因为沉淀会导致拖尾.也可以取上清到另一管,4度可以放一周备再次电泳)。
(3)电泳i.清洗玻璃板:一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。
两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。
ii.灌胶与上样(1)玻璃板对齐后放入夹中卡紧。
然后垂直卡在架子上准备灌胶。
(操作时要使两玻璃对齐,以免漏胶。
)(2)配10%分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
灌胶时,可用10 ml枪吸取5 ml胶沿玻璃放出,待胶面升到绿带中间线高度时即可。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
Western Blot 原理和操作方法(详细)工作原理蛋白质的电泳分离是重要的生物化学分离纯化技术之一,电泳是指带电粒子在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象.根据所采用的支持物不同,有琼脂糖凝胶电泳,淀粉凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳等.其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)由于无电渗作用,样品用量少(1-100μg),分辨率高,可检出10-9-10-12mol的样品,凝胶机械强度大,重复性好以及可以通过调节单体浓度或单体与交联剂的比例而得到孔径不同的凝胶等优点而受到广泛的应用. SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量.PAGE能有效的分离蛋白质,主要依据其分子量和电荷的差异,而SDS-PAGE(SDS变性不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳)的分离原理则仅根据蛋白质的分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液是在要跑电泳的样品中假如含有SDS和巯基乙醇(2-ME)或二巯基赤藓醇(DTT),其可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键,破坏蛋白质的四级结构,SDS是一种阴离子表面活性剂即去污剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级及三级结构,并与蛋白质的疏水部分相结合,破坏其折叠结构,电泳样品假如样品缓冲液后,要在沸水中煮3-5分钟使SDS与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,SDS-蛋白质复合物在强还原剂巯基乙醇存在时,蛋白质分子内的二硫键被打开而不被氧化,蛋白质也完全变性和解聚,并形成榛状结构,稳定的存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,平均每两个氨基酸残基结合一个SDS分子,这时各种蛋白质分子本身的电荷完全被SDS掩盖,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基.样品处理液中通常加入溴酚蓝染料, 溴酚蓝指示剂是一个较小的分子,可以自由通过凝胶孔径,所以它显示着电泳的前沿位置,当指示剂到达凝胶底部时,即可停止电泳.另外样品处理液中也可加入适量的甘油或蔗糖以增大溶液密度,使加样时样品溶液可以沉入样品加样槽底部.重要参数①聚丙烯酰胺凝胶(PAG)制备原则:由于孔径的大小取决于单体和双体丙烯酰胺在凝胶中的总浓度(T)以及双体占总浓度的百分含量即交联度(C)决定的,因而制胶之前必须首先知道这两个参数.一般可以由下述公式计算:T%=(a+b)/m*100%; 和 C%=a/(a+b)*100%其中: a=双体(bis)的重量 ;b=单体(arc)的重量 ;m=溶液的体积(ml)②当分析一个未知样品时,常常先用7.5%的标准凝胶制成4-10的梯度凝胶进行试验,以便选择理想的胶浓度.如果蛋白质的分子量已知,可参考下表选择所需凝胶浓度:蛋白质分子量范围(Da) 适宜的凝胶浓度(%)<104 20-301×104-4×104 15-204×104-1×105 10-151×105-5×105 5-10>5×105 2-5③分离胶:电泳凝胶浓度试剂 10% 12% 15% 10% 12% 15%H2O(ml) 4.0 3.3 2.3 5.9 4.9 3.430%丙烯酰胺(T: 30%,C: 3%(ml) 3.3 4.0 5.0 5.0 6.0 7.51.5mol/lTris.cl(PH8.8) (ml)2.5 2.5 2.53.8 3.8 3.810%SDS(ml) 0.1 0.1 0.1 0.15 0.15 0.1510%AP(ml) 0.1 0.1 0.1 0.15 0.15 0.15TEMED(μl) 4 4 4 6 6 6总体积(ml) 10 15④浓缩胶试剂浓度(5%)H2O(ml) 4 230%丙烯酰胺(T: 30%,C: 3%(ml) 1 0.51.0mol/lTris.cl(PH8.8) (ml) 1 0.510%SDS(μl) 80 4010%AP(μl) 60 30TEMED(μl) 8 4总体积(ml) 6 3蛋白质的样品制备:蛋白质的样品制备是Western Blotting的第一步,样品制备是关键步骤,要求尽可能的获得所有蛋白质,应注意以下问题:1:在合适的盐浓度下,应保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。
2:选择合适的表面活性剂和还原剂,破坏所有非共价结合的蛋白质复合物和共价键二硫键,使其形成一个各自多肽的溶液。
3:尽量去除核酸,多糖,脂类等干扰分子。
4:防止蛋白质在样品处理过程中的人为的修饰,制备过程应在低温下进行,以避免细胞破碎释放出的各种酶类的修饰(建议加入合适的蛋白酶抑制剂)5:样品建议分装成合适的量,然后冷冻干燥或直接以液体状态置-80℃中保存,但要注意不要反复冻融。
一:准备工作:一个水浴箱,一台超声装置,组织匀浆器二:需要的溶液:裂解液 Laemmli样品缓冲液三:操作步骤:1)培养细胞蛋白质样品的制备:1:胰酶酶解后裂解:细胞培养至80%左右密度时,以含0.05%胰蛋白酶消化,细胞经预冷的PBS漂洗3次,离心收集在离心管中,加入450μl裂解液反复吹打。
2:皿上直接裂解:细胞培养至80%左右密度时,细胞经预冷的PBS漂洗3次,加入450μl裂解液,细胞刮刀收集,用移液器转移至离心管中,反复吹打。
以上所得的样品最终用超声细胞破碎仪超声处理,超声时为5S,间歇时间为10S,功率为100-120W至溶液清澈无粘稠为止,处理过程在水浴中进行,后4℃25000g离心1小时取上清或以最大强度超声4次,每次15-30S,在每次超声步骤之间将样品转置水浴中15S,加入Laemmli 样品缓冲液(视蛋白样品浓度,以1:1或1:2的比例混合),强力混匀,样品置100℃水浴箱里水浴加热3-5分钟,10000g离心10分钟,取出清液,将其移入另一洁净试管中,至此,电泳样品已准备就绪。
(样品可立即使用也可以分装冻存,-20℃存放的样品可稳定保持数月)2)组织样品的制备:手术切除的组织块迅速置于预冷的0.95生理盐水中,漂洗数次,以清洁表面的血迹,将组织称量后切成几个较小的组织块放入机戒组织匀浆器中,按组织净重,裂解液=1:10的比例,加入相应体积的裂解液进行匀浆,离心收集上清(如有粘稠物可超声处理,具体方法见细胞培养的样品制备,也可以冷冻干燥降解核酸后,将冻干的蛋白质样品溶解在适当的上样buffer中,混匀后静置3小时使样品中的蛋白质充分的溶解,有5分钟即可,4度离心收集。
)加入Laemmli样品缓冲液(视蛋白样品浓度,以1:1或1:2的比例混合)强力混匀,样品置100度的水浴箱水浴加热3-5分钟,10000g离心10分钟,取上清液,将其转入另一洁净的试管中,至此,电泳样品已准备就绪(样品即可立即使用也可也可以分装冻存,-20℃存放的样品可稳定保持数月。
)蛋白质的样品制备:蛋白质的样品制备是Western Blotting的第一步,样品制备是关键步骤,要求尽可能的获得所有蛋白质,应注意以下问题:1:在合适的盐浓度下,应保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。
2:选择合适的表面活性剂和还原剂,破坏所有非共价结合的蛋白质复合物和共价键二硫键,使其形成一个各自多肽的溶液。
3:尽量去除核酸,多糖,脂类等干扰分子。
4:防止蛋白质在样品处理过程中的人为的修饰,制备过程应在低温下进行,以避免细胞破碎释放出的各种酶类的修饰(建议加入合适的蛋白酶抑制剂)5:样品建议分装成合适的量,然后冷冻干燥或直接以液体状态置-80℃中保存,但要注意不要反复冻融。
一:准备工作:一个水浴箱,一台超声装置,组织匀浆器二:需要的溶液:裂解液 Laemmli样品缓冲液三:操作步骤:1)培养细胞蛋白质样品的制备:1:胰酶酶解后裂解:细胞培养至80%左右密度时,以含0.05%胰蛋白酶消化,细胞经预冷的PBS漂洗3次,离心收集在离心管中,加入450μl裂解液反复吹打。
2:皿上直接裂解:细胞培养至80%左右密度时,细胞经预冷的PBS漂洗3次,加入450μl裂解液,细胞刮刀收集,用移液器转移至离心管中,反复吹打。
以上所得的样品最终用超声细胞破碎仪超声处理,超声时为5S,间歇时间为10S,功率为100-120W至溶液清澈无粘稠为止,处理过程在水浴中进行,后4℃25000g离心1小时取上清或以最大强度超声4次,每次15-30S,在每次超声步骤之间将样品转置水浴中15S,加入Laemmli 样品缓冲液(视蛋白样品浓度,以1:1或1:2的比例混合),强力混匀,样品置100℃水浴箱里水浴加热3-5分钟,10000g离心10分钟,取出清液,将其移入另一洁净试管中,至此,电泳样品已准备就绪。
(样品可立即使用也可以分装冻存,-20℃存放的样品可稳定保持数月)2)组织样品的制备:手术切除的组织块迅速置于预冷的0.95生理盐水中,漂洗数次,以清洁表面的血迹,将组织称量后切成几个较小的组织块放入机戒组织匀浆器中,按组织净重,裂解液=1:10的比例,加入相应体积的裂解液进行匀浆,离心收集上清(如有粘稠物可超声处理,具体方法见细胞培养的样品制备,也可以冷冻干燥降解核酸后,将冻干的蛋白质样品溶解在适当的上样buffer中,混匀后静置3小时使样品中的蛋白质充分的溶解,有5分钟即可,4度离心收集。
)加入Laemmli样品缓冲液(视蛋白样品浓度,以1:1或1:2的比例混合)强力混匀,样品置100度的水浴箱水浴加热3-5分钟,10000g离心10分钟,取上清液,将其转入另一洁净的试管中,至此,电泳样品已准备就绪(样品即可立即使用也可也可以分装冻存,-20℃存放的样品可稳定保持数月。
)附:一:裂解液的制备:组织裂解液(全细胞蛋提取):1:Tris-HCL 50mmoL/L PH 7.42: Nacl 150 mmoL/L3: 去氧胆酸钠 0.25%4:NP-40或Triton-x-100 1%5: EDTA 1 mmoL/L6: PMSF 1 mmoL/L7:Aprotinin 1μg/ml8: leupeptin 1μg/ml9: pepstain 1μg/ml其中:7,8,9作用不持久,要使用前加入。
细胞裂解液:1:NP-40裂解体系:150 mmoL/L Nacl1.0%NP-40或Triton-x-10050 mmoL/L Tris(PH8.0)2:RIPA裂解体系:150 mmoL/L Nacl1.0%NP-40或Triton-x-1000.5%脱氧胆酸钠0.1%SDS50 mmoL/L Tris( ph8.0)二:Laemmli 样品缓冲液配置(1*SDS样品缓冲液)50 mmoL/L Tris-HCL (PH8.0)100 mmoL/L DTT2% SDS0.1% 溴酚蓝10% 甘油此液可以配置成不同的储存液,根据蛋白浓度而定,40C长期保存,用时临时与蛋白液按比例混合,其中DTT应临时加入,以防降解。