内参基因βActin简介
关于内参基因的选择

关于内参基因的选择展开全文关于内参基因的选择实验内参,即是在检测细胞内分子表达变化时选择的参照物,其在细胞内的表达相对恒定,在处理因素作用条件下不会发生表达改变的基因。
内参同样可以校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
1、管家基因最普通的内参是内源性参照基因,也就是管家基因(持家基因,house keeping gene)。
管家基因是一类始终保持着低水平的甲基化并且一直处于活性转录状态的基因,高度保守并且在大多数情况下持续表达。
其表达水平受环境因素影响较小,而且是在个体各个生长阶段的大多数,或几乎全部组织中持续表达,或变化很小,因此常存在于生物细胞核的常染色质中。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因维持细胞最低限度功能所不可少的基因, 如编码组蛋白基因、编码核糖体蛋白基因、线粒体蛋白基因、糖酵解酶的基因等。
这类基因在所有类型的细胞中都进行表达,因为这些基因的产物对于维持细胞的基本结构和代谢功能是必不可少的。
部分人类管家基因列表2、内参基因选择的条件1、不存在假基因,以免基因组DNA的扩增;2、高度或中度表达,避免太高或太低的丰度;3、稳定表达于不同类型的细胞和组织中,表达量无明显差异;4、表达水平与细胞周期、活化等无关;5、不受外源性或内源性因素的影响。
3、不同管家基因在选择管家基因作为内参时,首先要按不同类型的分子选择正确的内参。
曾看到有人用检测miRNA时选择了GAPDH作为内参呢。
a、检测mRNA时的内参通常使用的是GAPDH、beta-actin、tubulin•GAPHDGAPDHGAPDH是糖酵解反应中的一个酶,由4个30-40kDa的亚基组成,分子量146kDa。
该酶基因为管家(house keeping)基因,几乎在所有组织中都高水平表达,在同种细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的,且不受含有的部分识别位点、佛波脂等的诱导物质的影响而保持恒定,故被广泛用作抽提total RNA,poly(A)+ RNA,Western blot等实验操作的标准化的内参。
内参Beta-actin和GAPDH使用的局限性

内参Beta-actin和GAPDH使用的局限性大部分科研新手接触到的第一个实验就是蛋白免疫印迹(Westernblot e Immunoblotting)。
做这个实验最基本的步骤就是内参的选择,但是各位小伙伴有没有想过你为什么要用Beta-actin,又或者是GAPDH。
我相信你一定听师兄师姐说过“都一样”,“哪个能和目的蛋白分开就用哪个”、要么就是“以前一直用的哪个所以就用哪个”。
那么小伙伴你们觉得,真的是这么随意选择的吗?今天我就跟大家一起探讨一下两大内参 Beta-actin 和 GAPDH 使用的局限性。
Beta-actin: 脊椎动物 actin 分为α、β 和γ 三种类型,α 型主要表达于心肌和横纹肌细胞中,β 及γ 型主要表达于非肌细胞中 (这句来自百度百科)。
那么Beta-actin 的局限性具体体现在哪里呢?Angela Dittmer 等人通过使用不同抗体配比浓度 Beta-actin (1:1000, 1:2000, or 1:4000, Cell Signaling #4967) 以及不同的总蛋白质量(3.8 μg、7.5 μg、15 μg)进行实验,结果发现:1:1000 稀释时,三种总蛋白浓度的条带区别不大;而当1:4000 稀释时,才能看到Beta-actin蛋白表达会随着总蛋白质量的升高而变化(Figure 1)。
之后作者采用不同蛋白质量(0.06 μg、0.12 μg、0.23 μg、0.47μg、0.94 μg、1.88 μg、3.75 μg、7.5 μg)继续进行实验,结果显示,当总蛋白超过一定质量时,Beta-actin 条带的灰度值将不会再随着总蛋白质量的升高而升高。
换而言之,你一个样品的总蛋白质量是1.88 μg,另一个样本的总蛋白质量是7.5 μg,结果两个样本的Beta-actin 条带一摸一样(Figure 2)[1]。
怎么样,意不意外,惊不惊喜。
β-Actin抗体-β-Actin内参抗体

β-Actin抗体推荐—高效价的Beta-Actin内参抗体Actin即肌动蛋白,是细胞的一种重要骨架蛋白。
Actin大致可分为六种,其中四种是不同肌肉组织特异性的,其余两种广泛分布于各种组织中,包括β-actin和γ-non-muscle actin。
β-actin作为内参是得到了公认的,这是针对大多数组织和细胞来说的,它广泛分布于细胞浆内,表达量非常丰富,其含量占所有细胞总蛋白的50%。
但是在一些少量特殊的情况下,如脂肪组织或细胞内,β-Actin的表达量就很少。
β-actin由375个氨基酸组成,分子量大小为42-43kDa左右。
如何选择合适的β-Actin抗体?内参抗体虽然选择较多,但是也需要遵循一定的原则,并契合实际的应用要求。
首先,我们需要考虑目的蛋白的大小,我们推荐内参要与检测的目的蛋白的分子量最好相差5KD以上,因此你需要根据你目的检测蛋白的分子量来选择合适的内参,由于β-Actin的检测分子量大约在42kD,因此该内参抗体不是很适合用于检测38kD-48kD大小目标蛋白的WB实验中。
另外,虽然β-Actin是最合适的内参抗体之一,但是在某些条件下,一些因素也会导致样品间β-Actin含量的变化。
特别需要注意的是,在脂肪组织里,β-Actin的表达量非常低,不适合作为内参。
很耐用,质量也很稳定,购买后放了一年了,拿出来用效价还是很高,后来买了他们大包装的,直接定制的5ml,很推荐。
——北京工业大学生命科学与生物工程学院一客户另外,我们还需要考虑自己的需要,特别是实验应用上的需要。
一般来说,应用类型越多,在使用过程中的选择余地就越大,而小鼠源的单克隆抗体一般在特异性、稳定性以及效价都要优于多克隆抗体。
另外,抗体的效价也是考察该抗体性价比的重要方面,也即相当于实际应用时的稀释比率。
一个效价高的100μl β-Actin抗体(假如其WB检测的稀释比率是1:5000,最终使用液相当于500ml),要比效价低的1ml的β-Actin抗体(假如WB检测的稀释比率是1:200,最终使用液相当于2ml)性价比更高。
β-actin内参蛋白的cas号

β-actin内参蛋白的cas号β-actin蛋白(CAS号:60-19-5)是一种高度保守的细胞骨架蛋白,广泛存在于多种细胞中。
作为一种内参蛋白,β-actin蛋白在细胞中起着重要的结构和功能作用。
β-actin蛋白属于肌动蛋白家族,是细胞骨架中的主要成分之一。
细胞骨架是维持细胞形态的重要支架结构,同时参与细胞的运动、分裂、黏附等生命活动。
β-actin蛋白通过与其他蛋白相互作用,组装成肌动蛋白丝,进而形成细胞质中的肌动蛋白束和微丝网络。
这些肌动蛋白丝和微丝网络不仅决定了细胞的形状,还参与了细胞的运动和分裂过程。
作为内参蛋白,β-actin蛋白在生物学研究中具有重要的应用价值。
由于其广泛存在于多种细胞中且表达稳定,β-actin蛋白常被用作实验中的参照物,用于校正样品中的目标蛋白表达水平。
在基因表达研究中,通过比较目标基因与β-actin基因的相对表达水平,可以得出目标基因在不同条件下的表达变化情况。
此外,β-actin蛋白还在细胞迁移、细胞黏附、细胞凋亡等研究中扮演重要角色。
β-actin蛋白的表达水平可以通过多种方法进行检测。
常用的方法包括免疫印迹(Western blotting)、定量PCR(qPCR)、免疫组化等。
其中,免疫印迹是最常用的方法之一。
通过将细胞裂解提取蛋白,经过电泳分离后,使用特异性的抗β-actin抗体与蛋白结合,再通过二抗识别结合的抗体,最终通过染色反应可检测到β-actin蛋白的表达水平。
定量PCR也可以用来检测β-actin基因的表达水平,通过比较β-actin基因的PCR产物与目标基因PCR产物的相对表达水平,可以得到目标基因的表达变化情况。
除了作为内参蛋白,在一些疾病研究中,β-actin蛋白的异常表达也引起了科学家的关注。
研究发现,在某些肿瘤细胞中,β-actin 蛋白的表达水平发生了改变,这与肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移等生物学行为密切相关。
因此,β-actin蛋白的异常表达可能成为某些肿瘤的标志物,有望为肿瘤的早期诊断和治疗提供新的线索。
β-actin内参蛋白的cas号

β-actin内参蛋白的cas号β-actin是一种参与细胞骨架形成和细胞运动的蛋白质,其CAS号为60-19-5。
在细胞内,β-actin通过参与细胞骨架的组装与重塑,维持细胞的形状和结构稳定性,并参与细胞的运动、分裂和内质网的运输等重要生物学过程。
β-actin蛋白是肌动蛋白家族中的一员,肌动蛋白家族是一类在动物和植物细胞中广泛存在的蛋白质。
它们通过聚合形成肌动蛋白丝,参与细胞骨架的组装与重塑,并调节细胞形态的变化。
β-actin是肌动蛋白家族中的一种重要成员,其在细胞内广泛分布并参与多种生物学过程。
因此,β-actin通常被用作内参蛋白,在实验中用来校正不同样本之间的蛋白质含量差异。
β-actin的CAS号为60-19-5,是根据化学物质的特征分配的唯一编号。
通过CAS号可以准确地识别和区分不同的化学物质。
β-actin的CAS号为60-19-5是由国际化学纯合物编号系统(CAS号)分配的,它具有唯一性和全球通用性,可以确保在科学研究和实验中对β-actin的准确识别和应用。
在科学研究中,β-actin常被用作内参蛋白,用来校正实验中目标蛋白的表达水平。
内参蛋白是指在不同样本中表达水平相对稳定的蛋白质,它的表达量不受处理条件和实验误差的影响。
通过选择合适的内参蛋白,可以对实验结果进行可靠的比较和分析。
β-actin 由于其在细胞内广泛存在且表达量相对稳定,被广泛应用于基础研究和生物医学领域。
然而,在使用β-actin作为内参蛋白时,仍需要注意一些问题。
首先,β-actin的表达水平可能会受到某些因素的影响,如细胞状态、组织类型和实验条件等。
因此,在选择β-actin作为内参蛋白时,需要根据具体实验条件和研究对象的特点谨慎选择。
其次,由于β-actin广泛存在于细胞中,其表达量可能会受到其他因素的影响,如细胞增殖和细胞凋亡等。
因此,在使用β-actin作为内参蛋白时,需要结合其他内参蛋白或合适的标准曲线方法进行校正,以提高实验结果的准确性和可靠性。
小鼠常用内参基因

小鼠常用内参基因
小鼠常用内参基因是进行实验研究时非常重要的工具,内参基因是一种用于标准化实验结果的参照基因,用于减少实验中因样本差异和反应效率的影响。
在小鼠实验中,常用的内参基因包括GAPDH、β-actin和18S rRNA等。
GAPDH(糖酵解酶)是一种广泛存在于细胞中的酶,参与细胞内的糖酵解代谢过程,同时也是常用的内参基因。
在小鼠实验中,GAPDH 的mRNA水平是相对稳定的,因此可以作为实验中的内参基因使用。
另一个常用的内参基因是β-actin(β-肌动蛋白),β-actin
是构成细胞骨架的主要成分之一,也是一种常用的内参基因。
在小鼠实验中,β-actin的mRNA水平也是相对稳定的,因此可以用来进行实验结果的标准化。
18S rRNA是小鼠细胞中的核糖体RNA,也是常用的内参基因之一。
18S rRNA的mRNA水平在细胞中是相对稳定的,因此可以用来进行实验结果的标准化。
除了上述几种常用的内参基因外,还有许多其他的内参基因可以用于小鼠实验中。
但无论选择哪种内参基因,都需要进行验证,确保其在实验条件下的稳定性和可靠性。
只有选择合适的内参基因,才能保证实验结果的准确性和可靠性。
- 1 -。
β-actin基因名称
β-actin基因名称β-actin基因是一种编码肌动蛋白的基因,也称为ACTB基因。
肌动蛋白是细胞骨架的组成部分之一,参与细胞的形态维持、细胞运动以及肌肉收缩等重要生理过程。
β-actin基因在多种生物体中都存在,包括人类、大鼠等。
β-actin基因位于人类基因组中第7号染色体上的q22.1区域。
它的序列长度约为2.3千碱基对,编码一个由375个氨基酸组成的蛋白质。
β-actin蛋白具有高度保守性,不仅在不同物种中高度保持一致,而且在同一物种的不同组织和发育阶段中也保持高度相似。
β-actin基因的启动子区域含有多个转录因子结合位点,这些转录因子能够调控基因的表达。
例如,转录因子如SRF (serum response factor)和MEF2 (myocyte enhancer factor 2)可以结合在β-actin基因启动子区域上,促进基因的转录和表达。
此外,其他转录因子如NF-κB (nuclear factor-kappa B)、Sp1 (specificity protein 1)和AP-1 (activator protein 1)等也可能与β-actin基因的转录调控相关。
β-actin基因表达在细胞中具有广泛的分布,是许多实验中常用的内参基因或控制基因。
在细胞培养和研究中,人们通常使用β-actin基因来校正目标基因的表达水平,以减小实验误差。
与此同时,β-actin基因也作为一个控制基因,用于验证实验中的蛋白质定位和拷贝数等情况。
然而,近年来有研究表明,在某些条件下,β-actin 基因的表达水平也可能发生变化,因此在实验中使用β-actin基因作为内参应谨慎处理。
β-actin基因的功能不仅仅局限于细胞的形态维持和运动调节。
研究显示,β-actin基因的异常表达与多种疾病的发生发展相关。
例如,在肿瘤细胞中,β-actin基因的过表达或丢失可能与肿瘤的侵袭和转移有关。
此外,β-actin基因也与神经系统疾病的发生相关,如阿尔茨海默病和帕金森氏症。
β-actin mouse primer 序列
β-actin mouse primer 序列β-actin(β-肌动蛋白)是一种高度保守的紧张蛋白,在多种细胞类型中广泛表达,具有重要的细胞骨架结构和功能。
由于其表达水平稳定且在多种实验研究中被广泛应用,β-actin的引物序列和扩增方法成为了常用的内参控制方法之一。
以下是β-actin鼠引物的序列:前向引物:5'-AGCCATGTACGTAGCCATCC-3'逆向引物:5'-GACTCCATCACAATGCCAGT-3'β-actin的引物序列具有较高的特异性和敏感性,可以在小样本量和低表达水平中成功扩增目标DNA片段。
这些引物通常用于构建基因克隆、全长基因测序以及实时定量PCR等实验技术中。
β-actin引物序列的设计遵循以下原则:首先,引物的长度通常在18-30个核苷酸之间,以确保DNA片段的特异性扩增;其次,前向引物和逆向引物的碱基组成应具有互补性,以促进引物与靶标DNA的结合;最后,引物的序列应尽量避免重复序列和二聚体形成,以减少非特异性扩增的可能性。
在实验中,提取的小鼠组织或细胞总RNA可以用于合成cDNA,作为β-actin的模板。
通常情况下,β-actin的扩增条件为:95℃预变性3分钟,接着是30个循环,每个循环包括94℃变性30秒、55℃退火30秒和72℃延伸60秒。
最后,在72℃下延伸10分钟,保存于4℃。
对于β-actin鼠引物的扩增产物,可以通过琼脂糖凝胶电泳分离和可视化,也可以通过实时定量PCR技术进行定量分析。
实时定量PCR 是一种精确测定标靶分子水平的技术,可以根据扩增曲线的剩余荧光信号量测出样品中目标分子的初始浓度。
综上所述,β-actin鼠引物在基因克隆、全长基因测序以及实时定量PCR等实验中具有重要的应用价值。
它可以作为内参控制方法,用于校正样品差异,提高实验结果的准确性和可比性。
同时,这些引物序列的广泛应用也为相关研究提供了便利和参考。
β-actin mouse primer 序列 -回复
β-actin mouse primer 序列-回复什么是β-actin小鼠引物序列?该序列的重要性是什么?如何设计并评估这些引物?这些问题将在下面的文章中依次回答。
Beta-actin(β-actin)是一种细胞骨架蛋白质,在细胞的结构和功能中起着重要作用。
β-actin在多个细胞类型中广泛表达,并且其表达水平相对稳定。
因此,β-actin常用作实时定量PCR(qPCR)或RT-qPCR的内参基因,来校正不同样本之间的变异。
要使用β-actin小鼠引物序列进行PCR实验,首先需要设计适当的引物。
设计引物时,需要考虑引物的特异性和扩增效率。
特异性是指引物只与β-actin基因的特定区域互补配对,而不与其他基因或序列结合。
为了确保特异性,可以使用生物信息学工具来搜索引物序列,以保证没有与其他基因相关的目标序列。
此外,需要确保引物对β-actin的亲和性较高,以确保扩增效率。
设计合适的β-actin小鼠引物还需要考虑引物的长度、GC含量和熔解温度(Tm)。
引物长度通常在18-25个碱基对之间,过短的引物可能导致扩增效率低下,而过长的引物可能导致扩增特异性下降。
引物的GC含量通常应在40-60之间,以确保引物的稳定性和特异性。
此外,引物的Tm也是设计引物时需要考虑的因素之一。
引物的Tm应在50-65C之间,以确保引物与目标序列的特异性结合。
一旦设计好了β-actin小鼠引物序列,就需要对其进行评估。
首先,可以使用生物信息学软件来预测引物的二级结构和互补性,以确保引物没有形成不稳定的结构或与其他互补序列结合。
其次,可以进行体外PCR验证,通过扩增出特定长度的DNA片段来确认引物的特异性和扩增效率。
此外,还可以进行序列比对和BLAST分析,将扩增产物的序列与已知的β-actin小鼠引物序列进行比较,以确保扩增产物与目标序列一致。
在实验中使用β-actin小鼠引物序列进行PCR可以提供一种准确测量基因表达水平的方法。
常见内参基因
常见ห้องสมุดไป่ตู้参基因
精心整理β-Actin Actin即“肌动蛋白”,是细胞的一种重要骨架蛋白。同时Actin在细胞分泌、吞噬、 β-Actin
GAPDH结构图 常用的内参有,ACTB(β-actin、β-肌动蛋白)、GAPDH或18S等。目的是在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反 应体系中扩增效率不均一、各孔间的温差等所造成的误差、这些都是管家基因,在各个组织中的表达量相对稳定,其中18S同 整个基因谱有关(负责装配),它在总RNA中占的比例最高。 转染了GAPDHsiRNA.jpg 转染了GAPDHsiRNA的Hela细胞 转染了GAPDH相关siRNA的HeLa细胞在转染后48小时后不断增殖。红:被标记的siRNA;蓝:被染色的细 精心整理
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
日期:2012-05-03来源:未知作者:周慕云点击:次
相关专题
PCR内参:选还是不选?
β-Actin
内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。常用的PCR内参有GAPDH、β-actin、18sRNA、28sRNA、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等。
β-actin的蛋白水平通常不会发生改变,因此被广泛用于Western时上样量是否一致的参照,也常被用于免疫染色观察细胞的微丝结构。在用作Western的参照时,Actin抗体和Tubulin抗体的主要不同之处在于两者所识别蛋白的分子量不同,这样可以选择合适的参照在同一块胶同一张膜上实现同时检测目标蛋白和参照蛋白。
β-Actin用途
β-Actin是PCR常用的内参,β-Actin抗体是WesternBlot很好的内参指数。内参即是内部参照(InternalControl),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白。它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。常用的蛋白质内参有细胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulin和GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase)等。因此β-Actin抗体、β-Tubulin抗体以及GAPDH抗体成为最常见的三个动物细胞内参抗体。β-Actin作为内参是得到了公认的,这是针对大多数组织和细胞来说的,它广泛分布于细胞浆内,表达量非常丰富。Beta-actin由375个氨基酸组成,分子量大小为42-43kDa左右。
β-Actin简介
Actin即“肌动蛋白”,是细胞的一种重要骨架蛋白。同时Actin在细胞分泌、吞噬、移tin在不同物种之间高度保守,以至于很难获得较好的针对actin的抗血清。Actin大致可分为六种,其中四种是不同肌肉组织特异性的,包括α-skeletalmuscleactin,α-cardiacmuscleactin,α-smoothmuscleactin,和γ-smoothmuscleactin;其余两种广泛分布于各种组织中,包括β-actin(β-non-muscle)和γ-non-muscleactin。不同的actin之间同源性大于90%,但在N-terminal同源性仅50%-60%,因此N-terminal常被用作actin的抗原。β-Actin是横纹肌肌纤维中的一种主要蛋白质成分,也是肌肉细丝及细胞骨架微丝的主要成分。具有收缩功能,分布广泛。