药物基因组学中的VIPs和CYP2C19介绍

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CYP2C19基因多态性(SNP)检测

CYP2C19基因多态性(SNP)检测
2005年3月,在完全堵塞的右冠状动脉又植入了两个支架 (3.0mmX23mm,3.0mmX13mm);
2005年12月,病人感到胸痛,但冠脉造影未发现血管狭 窄;
2007年11月,病人出现了持续性的胸痛和非ST段抬高的 心梗。冠脉造影发现在弯曲的支架处出现血栓,只好更换 新的药物缓释支架(2.75mmX18mm);
3、为什么要检测CYP2C19基因多态性?
多中心,随机对照,双盲试验,研究增加剂量(up to 300mg)对CYP2C19突 变患者血小板聚集抑制的改善情况。
*1/*1
*1/*2
*2/*2
结论:CYP2C19 *1/*2型患者,维持剂量增加至225mg,其对血小板活性的抑 制程度方可达到*1/*1型患者的水平。而对于*2/*2型患者,即使维持剂量增加 至300mg,仍然难以达到相当的血小板抑制水平。
2009年7月,病人在打曲棍球时,又发生胸痛,并在弯曲 的支架处再次发生血栓,入院进行球囊扩张,重新安放支 架 (2.25mmX12mm);
2009年8月对病人进行了CYP2C19基因型检测,结果为 *2/*2型,这提示他是个氯吡格雷的慢代谢患者。因此停 用氯吡格雷,改用普拉格雷;
2011年6月接受心脏造影,一切正常。
• 换用新药替格瑞洛(已在国内上市); • 联用西洛他唑(cilostazol),两联改为
三联抗血小板治疗; • PCI效果不佳者,可考虑改做搭桥手术。
病例一:慢代谢患者使用5个支架后换用普拉格雷
2005年2月,医生为他进行经皮冠脉介入手术,植入一个 药物缓释支架 (2.75mmX16mm),并开始服用氯吡格雷;
伏立康唑 Nelfinavir 那非那韦 Proguanil
氯胍
Thank you!

CYP2C19基因多态性.

CYP2C19基因多态性.
CYP2C19基因多态性(SNP)检测
(PCR-溶解曲线法)
1、什么是CYP2C19基因? 2、如何检测CYP2C19基因多态性? 3、为什么要检测CYP2C19基因多态性?
1、什么是CYP2C19基因?
CYP2C19是细胞色素P450酶第二亚家族中的 一员,存在于肝脏当中,是人体主要的药物代谢酶。 比如氯吡格雷、尿激酶等药物代谢都与之相关。
• 换用新药替格瑞洛(已在国内上市); • 联用西洛他唑(cilostazol),两联改为
三联抗血小板治疗; • PCI效果不佳者,可考虑改做搭桥手术。
病例一:慢代谢患者使用5个支架后换用普拉格雷
2005年2月,医生为他进行经皮冠脉介入手术,植入一个 药物缓释支架 (2.75mmX16mm),并开始服用氯吡格雷;
3、为什么要检测CYP2C19基因多态性?
多中心,随机对照,双盲试验,研究增加剂量(up to 300mg)对CYP2C19突 变患者血小板聚集抑制的改善情况。
*1/*1
*1/*2
*2/*2
结论:CYP2C19 *1/*2型患者,维持剂量增加至225mg,其对血小板活性的抑 制程度方可达到*1/*1型患者的水平。而对于*2/*2型患者,即使维持剂量增加 至300mg,仍然难以达到相当的血小板抑制水平。
同年9月进行了CYP2C19的基因型检测,结果发现病人为 *2/*2型,意味着他是氯吡格雷的慢代谢患者。因此对该 患者选择了冠状动脉搭桥手术,手术很成功,术后一直服 用阿司匹林,一切正常。
CYP2C19参与约20多种药物的代谢
质子泵抑制剂
抗抑郁药
抗癫痫类
其他
Omeprazeol Fluoxetine
IM

*1/*3 单突变杂合

cyp2c19基因突变

cyp2c19基因突变

cyp2c19基因突变CYP2C19基因突变是指在CYP2C19基因中存在一种或多种突变,导致CYP2C19酶的活性发生改变。

CYP2C19是一种细胞色素P450酶家族的成员,主要参与药物的代谢和解毒过程。

这篇文章将探讨CYP2C19基因突变对药物代谢的影响,以及相关的临床意义。

1. CYP2C19基因突变的分类CYP2C19基因突变可以分为三类:正常代谢活性(野生型)、降低代谢活性和无代谢活性。

正常代谢活性是指没有突变的CYP2C19基因,能够正常代谢药物。

降低代谢活性是指存在一种或多种突变的CYP2C19基因,导致CYP2C19酶的代谢活性降低。

无代谢活性是指存在特定的突变型CYP2C19基因,完全失去代谢药物的能力。

2. CYP2C19基因突变与药物代谢CYP2C19酶参与代谢多种临床常用药物,如氯磺丙脲、氯吡格雷、奥美拉唑等。

CYP2C19基因突变导致酶活性改变,进而影响药物的代谢速度。

降低代谢活性突变的患者,药物代谢速度减慢,血药浓度升高,可能增加药物的不良反应风险。

而无代谢活性突变的患者,则无法代谢某些药物,使其在体内蓄积,可能导致严重的药物毒性。

3. 临床意义CYP2C19基因突变与药物治疗的个体差异密切相关。

根据患者的CYP2C19基因型,可以进行个体化药物治疗,避免不良反应的发生,提高治疗效果。

对于使用氯吡格雷治疗的患者,根据CYP2C19基因分型可将患者分为快速代谢者、中等代谢者和慢速代谢者,快速代谢者使用标准剂量,而中等代谢者和慢速代谢者使用调整剂量,以保证药物的疗效和安全性。

4. CYP2C19基因突变的检测检测CYP2C19基因突变可以通过基因测序或聚合酶链式反应(PCR)等方法进行。

在临床上,常常利用基因芯片或快速PCR方法进行筛查。

通过检测CYP2C19基因突变,可以指导个体化的药物治疗,并提高药物治疗的安全性和疗效。

总结:CYP2C19基因突变是一种影响药物代谢的遗传变异,导致CYP2C19酶活性发生改变,进而影响药物的代谢速度。

cyp2c19基因型分型

cyp2c19基因型分型

cyp2c19基因型分型【最新版4篇】目录(篇1)1.CYP2C19 基因的功能和作用2.CYP2C19 基因的多态性3.CYP2C19 基因型分型的重要性4.CYP2C19 基因型分型的方法5.CYP2C19 基因型分型的应用正文(篇1)CYP2C19 基因是肝脏细胞内一种重要的药物代谢酶,主要负责许多临床药物的代谢,例如,抗肿瘤药物、抗癫痫药物、抗抑郁药物等。

因此,CYP2C19 基因的功能和作用对人体药物代谢具有极大的影响。

CYP2C19 基因存在着多态性,即在不同个体中,CYP2C19 基因的序列存在差异。

这种多态性导致了 CYP2C19 酶活性的不同,进而影响了药物在体内的代谢速度和浓度。

因此,CYP2C19 基因型的分型对于个体化用药具有重要的指导意义。

CYP2C19 基因型分型的重要性体现在其能够帮助临床医生根据患者的基因型,选择最适合的药物和剂量,以达到最佳治疗效果,同时减少药物不良反应的发生。

目前,CYP2C19 基因型分型的方法主要有两种:一种是基于聚合酶链反应(PCR)的技术,另一种是基于基因芯片的技术。

这两种方法各有优缺点,但都能够准确地进行 CYP2C19 基因型的分型。

CYP2C19 基因型分型的应用广泛,除了在个体化用药中的应用外,还在药物研发、药物基因组学、疾病诊断等领域发挥重要作用。

例如,通过CYP2C19 基因型分型,可以预测患者对某种药物的反应,从而指导药物的研发和改进。

目录(篇2)1.CYP2C19 基因的功能和重要性2.CYP2C19 基因的多态性3.CYP2C19 基因型分型的方法4.CYP2C19 基因型分型的临床应用5.CYP2C19 基因型分型的未来展望正文(篇2)CYP2C19 基因是肝脏细胞内最重要的药物代谢酶之一,它对许多临床常用药物的代谢起到关键作用。

因此,对 CYP2C19 基因型的研究具有重要的临床意义。

CYP2C19 基因具有多态性,目前已知有多种等位基因,其中最常见为CYP2C19*1 和 CYP2C19*2。

CYP2C19基因检测指导临床个性化用药

CYP2C19基因检测指导临床个性化用药
可催化体内包括氧化还原作用环氧作用n脱羟作用o脱羟基作用s氧化和羟基化作用的多种反应
CYP2C19基因检测指导临床个性化用药
CYP2C19是一种药物代谢酶,主要存在于肝脏微粒体内。可催化体内包括氧化-还原作用,环氧作用,N-脱羟基作用,O-脱羟基作用,S-氧化和羟基化作用的多种反应。CYP2C19基因多态性是引起同一药物在不同个体间和种族间表现出不同代谢能力的主要原因之一。中国人群中较常见的等位基因型是*2、*3、*17,其中*2、*3可引起CYP2C19酶活降低;中国人群中的弱代谢者99%为*2、*3型等位基因;*17可引起CYP2C19酶活增强。

cyp2c19基因检测报告单解读

cyp2c19基因检测报告单解读

cyp2c19基因检测报告单解读
摘要:
I.基因检测概述
- 基因检测的定义
- 基因检测的作用
II.CYP2C19基因检测
- CYP2C19基因的作用
- CYP2C19基因检测的应用
III.CYP2C19基因检测报告单解读
- 报告单的内容
- 报告单的解读
IV.CYP2C19基因检测的意义
- 对个体化用药的指导作用
- 对疾病治疗的帮助
正文:
基因检测是一种通过检测基因序列来了解个体基因信息的技术。

随着基因检测技术的发展,越来越多的基因被研究发现与人类疾病密切相关。

其中,CYP2C19基因就是其中一个重要的基因。

CYP2C19基因是CYP450酶第二亚家族中的重要成员,是人体重要的药物代谢酶,在肝脏中有很多表达。

它参与了多种药物的代谢过程,包括氯吡格雷的代谢。

氯吡格雷是一种常用的抗血小板药物,用于治疗急性冠状动脉综合
征和经皮冠状动脉介入治疗后的患者。

但是,不同个体对氯吡格雷的反应差异很大,这与CYP2C19基因的变异有关。

因此,进行CYP2C19基因检测可以帮助医生了解患者对氯吡格雷的代谢能力,从而为患者制定更加个性化的治疗方案。

CYP2C19基因检测报告单通常包括基因型、酶活性等信息,通过解读这些信息,医生可以更好地指导患者的用药。

总的来说,CYP2C19基因检测对于个体化用药具有重要的指导作用。

通过基因检测,可以为患者制定更加适合其个体情况的治疗方案,从而提高治疗效果,减少不良反应。

药物基因组学中的VIPs和CYP2D6基因介绍

药物基因组学中的VIPs和CYP2D6基因介绍
个功能正常和一个无功能等位基因
携带*10和另一个功能降低的等位基因
携带一个功能降低(不含*10)和一个无功能的等 位基因;或携带2个*10等位基因
携带*10和一个无功能的等位基因
PTGS2, SCN5A, SLC22A1, SULT1A1, VDR
癌症基因 组
9 ABL1, ALK, BCR, BRAF, EGFR, ERBB2, KIT, KRAS, NRAS
https:///vips#tier0
CYP2D6酶简介
⚫ CYP2D6是细胞色素P450系的重要成员(细胞色素P450,家族2,亚家族D, 多肽6),是参与I相代谢和消除许多内源性底物和多种药物的酶。
CYP2D 6抑制

• •

他汀类 抗抑郁药(氯丙嗪、氟伏沙明、氟西丁、舍曲林、文拉法辛等)对CYP2D6 均有不同程度的抑制作用 奎尼丁,其中奎尼丁是CYP2D6 最强的抑制剂
CYP2D6基因简介
⚫ CYP2D6基因位于22号常染色体长臂1区3带1亚带上(22q.13.1),含有9个外 显子和8个内含子,总长达7kb,编码区有1521个碱基。
⚫ CYP2D6具有高度的多态性且存在种族差异,截止2020年5月30日更新的数据显 示,已知有超过139种等位基因变体,其中包括:
✓ 功能增强型等位基因(*1xN( N≥2 )、*2xN( N≥2 )…) ✓ 功能性(功能正常型)等位基因(*1、*2、*9×2、*33、*34、*35…) ✓ 功能降低型等位基因(*9、*10、*41…) ✓ 无功能型等位基因(*3、*4、*5、*6、*7、*8、*11、*21…) ✓ 功能不确定的等位基因和功能未知的等位基因(*58、*61、*63~*65…)
一级

CYP2C19-基因检测对药物的个体化治疗 ppt课件

CYP2C19-基因检测对药物的个体化治疗  ppt课件
2007年国家卫生部也已明确将个体化用药基因检测项目(包括本检 测项目)列入临床检测目录,国家食品药品监督管理局也明确将基因 检测诊断试剂产品归为Ⅲ类体外诊断试剂管理。
用于病毒、细菌用药指导的基因检测
1、 拉米夫定用药指导的基因检测 2、结核病用药指导的基因检测 3、肠球菌耐万古霉素用药指导的基因 检测
泮托拉唑 pantoprazole
雷贝拉唑 rabeprazole
埃索美拉唑 Esomeprazol e
20
ppt课件
Eur J Clin Pharmacol (2009)65:55–64
2.神经类药物
癫痫和抑郁症
相关精神科药
物,包括:
氟西汀 丙咪嗪 安定 西酞普兰 苯妥英 苯巴比妥 氯米帕明 丙戊酸等
b.CYP2C19* x /*17 型中Cmax最低
4.抗血小板聚集药物
氯吡格雷是一种新型噻吩吡啶类衍生物,口服后,经十二指肠部位 吸收。多重耐药基因MDRI(mutidurgre-sistance)或三磷酸腺苷 结合盒蛋白B家族成员I(ABCBI)编码的P-糖蛋白(P-gp)是氯吡 格雷吸收过程中的主要屏障。
用于化学药物用药指导的基因检测 P450家族代谢酶基因的基因突变检测
1、 硝酸甘油用药指导的基因检测 2、5-氟尿嘧啶用药指导的基因检测
包括CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、 CYP3A4基因的突变检测等
9
ppt课件
4.用药指导的分子生物学检验 • 化学药物用药指导的基因检测 • CYP2C19基因多态性检测 • CYP2C9和VKORC1基因多态性检测 10 • ppMt课T件HFR(C677T)基因检测
4
ppt课件
药物安全与个体化医疗
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VIPs名单
非常重要的药物基因(VIPs)分级及名单(2020年6月)
分级 一级
数量
基因
ABCB1, ABCG2, ACE, ADRB1, ADRB2, CACNA1S, CFTR,
COMT, CYP2A6, CYP2B6, CYP1C19, CYP2C8, CYP2C9,
34
CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, CYP4F2, DPYD, DRD2, F5, G6PD, GSTP1, HLA-B, MTHFR, MT-RNR1, NAT2, NUDT15,
⚫ rs4986893 CYP2C19 rs4986893(c.636G> A)是CYP2C19 * 3等位基因(先前称为 CYP2C19m2)的定义多态性,是外显子4中的G>A变异,导致在212氨基 酸处提前终止密码子(p. W212X)。在大多数人群中,CYP2C19 * 3等位 基因频率低于1%,但在亚洲人中更为普遍(2-9%)。
0.5436 0.2699 0.0157 0.1708
East Asian
0.5956 0.2835 0.0725 0.0205 0.0199
https:///guidelines/guideline-for-clopidogrel-and-cyp2c19/
CYP2C19*2、*3、*17变体介绍
PTGS2, SCN5A, SLC22A1, SULT1A1, VDR
癌症基因 组
9 ABL1, ALK, BCR, BRAF, EGFR, ERBB2, KIT, KRAS, NRAS
https:///vips#tier0
CYP2C19简介
⚫ CYP2C19基因编码细胞色素P450家族2亚家族C多肽19(CYP2C19)酶, 位于10q23.33染色体上的细胞色素P450基因簇(Centromere-CYP2C18CYP2C19-CYP2C9-CYP2C8-Telomere)中。
2. 到2020年6月,PharmGKB根据多个来源维护了一份VIPs名单,包括美 国食品和药物管理局(FDA)的生物标志物名单、临床药物遗传实施联盟 (CPIC)和药物基因组学研究网络(PGRN) 的名单。
3. 随着时间的推移,很明显,支持这些VIPs的证据有了很大的变化。2020 年6月,PharmGKB对其进行了证据评估,将VIP名单分为三级:
功能 Normal function No function Decreased function Uncertain function Increased function
等位基因功能及在东亚人群中的分布频率
频率(东亚) 0.6169 0.3603 0.0006 0.0017 0.0205
等位基因 *1、*11、*13、*15、*18、*28、*38 *2~*8、*22、*24、*35~*37、 *9、*10、*16、*19、*25、*26 *12、*14、*23、*29~*34 *17
药物基因组学中的VIPs
(Very Important Pharmacogenes, VIP)
CYP2C19基因
VIP简介
非常重要的药物基因(Very Important Pharmacogenes, VIP)
1. 通常VIP要么在许多药物的代谢中发挥作用(如CYP2D6),要么包含可能 导致严重药物反应的变异(如HLA-B)。
⚫ rs4244285 CYP2C19 rs4244285(c.681G> A)是CYP2C19 * 2等位基因(以前称为 CYP2C19m1)的定义多态性,是外显子5中的G> A变异,可产生异常的剪 接位点。这种改变改变了mRNA的阅读框架,从而导致截短的无功能蛋白。 CYP2C19 * 2是最常见的CYP2C19功能丧失等位基因,其在白种人中的等 位基因频率约为12%,在非洲裔美国人中为 15%,在亚洲人中为29-35%。
⚫ rs12248560 CYP2C19 rs12248560(c.-806C> T)是CYP2C19 * 17等位基因的定义多 态性,是启动子中的C>T变异,为GATA转录因子家族建立了一个共有结合 位点,导致CYP2C19的表达和活性增加。CYP2C19 * 17等位基因频率在高 加索人中约为21%,在非洲裔美国人中为 16%,在亚洲人中为3%。
⚫ CYP2C19 * 1等位基因的定义是指不存在其他变体。因此,不能查询和分析基因 所有变体基因型时,可能会误分类某些个体。如果对所有常见变体(即等位基因 频率> 1%)进行基因分型,则分类错误将很小。
代谢类型 NM
(正常代谢)
IM (中间代谢)
PM (弱代谢)
UM (超快代谢)
定义及举例说明
CYP2C19 * 1等位基因的纯合子(即*1/*1),其与功能性CYP2C19 介导的代谢有关。
IM个体由一种野生型等位基因和一个编码酶功能降低或酶功能缺失的 变异等位基因组成(例如* 1 / * 2,* 1 / * 3),从而导致CYP2C19 活性降低。
PM个体具有两个功能丧失的等位基因(例如,* 2 / * 2,* 2 / * 3, * 3 / * 3),导致CYP2C19活性显着降低或缺失。
CYP2C19 allele *1 *2 *3 *17 *18
东亚人群中频率≥1%的等位基因
AfricanAmerican/Afro-
Caribbean 0.5468 0.1815 0.0028 0.2072
American Central/South Asian
0.7922 0.1214 0.0004 0.0861
RYR1, SLC19A1, SLCO1B1, TPMT, TYMS, UGT1A1,
VKORC1
二级
ADH1A, ADH1B, ADH1C, AHR, ALDH1A1, ALOX5, BRCA1,
25
CYP1A2, CYP2A13, CYP2E1, CYP2J2, GSTT1, HMGCR, KCNH2, KCNJ11, NQO1, NR1I2, P2RY1, P2RY12, PTGIS,
在大多数文献中,携带一个或两个* 17功能获得等位基因(例如* 1 / * 17,* 17 / * 17)的个体已归为UM。
https:///vip/PA166169770
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一级
二级 癌症基因组
有大量证据支持其在药物基因组学中的重要性的基因。当一个新基 因与CPIC临床指南的建议相关联时,它们将被添加到一级VIPs中。
在药物基因组学中支持其重要性的证据有限的基因。
肿瘤药物基因组学中重要的基因。随着新的证据和癌症治疗手段的 出现,新的基因可能会被添加到癌症基因组列表中。
https:///vips#tier0
⚫ CYP2C19酶有助于许多临床相关药物和药物类别的代谢,例如抗抑郁药, 苯二氮卓,甲苯妥英,质子泵抑制剂(PPI)和抗血小板前药氯吡格雷。
分类
CYP2C19抑制剂 (降低酶活性)
CYP2C19诱导剂 (增加酶活性)
经CYPБайду номын сангаасC19代谢
CYP2C19酶与药物的关系
药物 氯霉素、西咪替丁、埃索美拉唑、奥美拉唑、兰索拉唑、泮托 拉唑、异烟肼、氟伏沙明、伏立康唑、非尔氨酯、吲哚美辛、 莫达非尼、噻氯匹定、托吡酯等
卡马西平、炔诺酮、强的松、利福平等
质子泵抑制剂、氯吡格雷、抗抑郁药、苯二氮卓衍生物、甲苯 妥英等
应用举例:在使用氯吡格雷时,应尽可能避免与CYP2C19抑制剂同时使用, 否则氯吡格雷活性代谢物生产减少,影响疗效。
CYP2C19等位基因
目前已知CYP2C19 等位基因有*1、*2、*3……*38共38种,频率呈现种族差异。
https:///vip/PA166169770
CYP2C19*2、*3、*17变体与代谢类型
⚫ 根据代谢CYP2C19底物的能力,可将个体分为超快速(UM),广泛(EM), 中间(IM)或弱代谢(PM)。通过CPIC术语标准化项目(2017年),术语 “广泛代谢”已更新为“正常代谢”(NM)。
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