《基因组学》课程教学大纲
基因组学 教学大纲
基因组学一、课程说明课程编号：280311Z10课程名称：基因组学/Genomics课程类别：专业教育课程学时/学分：32/2先修课程：细胞生物学、生物化学、分子生物学适应专业：生物科学教材、教学参考书：1. 杨金水主编．基因组学（第三版）．北京：高等教育出版社．2013；2. 宋方洲主编．基因组学．北京：军事医学科学出版社．2011；3. 胡维新主编．医学分子生物学（第二版）．北京：科学出版社．2014．二、课程设置的目的意义基因组学是在基因组水平上研究基因组结构和功能的科学，是当代生命科学发展最为迅速的学科之一。
本课程的主要任务是使学生掌握基因组学的基本理论和基本知识，熟悉基因组学在医学中的应用，了解基因组学的主要新进展。
三、课程的基本要求基本理论和基本知识：1. 掌握基因组学的概念。
熟悉研究基因组学的意义；人类基因组计划。
了解基因组学的历史发展阶段；后基因组学。
2. 掌握遗传图与物理图的概念；遗传作图标记；连锁分析。
熟悉人类遗传图。
了解水稻遗传图。
3. 掌握辐射杂种作图。
熟悉限制性作图；基于克隆的基因组作图；原位染色体连锁图。
了解基因组整合图。
4. 掌握第二代和第三代DNA测序的原理；基因组测序的策略；作图法测序与序列组装；人类基因组测序与组装。
熟悉鸟枪法测序与序列组装；不同测序路线与序列组装策略的比较；基因组测序的其他路线。
5. 掌握根据基因结构特征搜寻基因；同源基因查询；实验确认基因；计算机预测基因功能。
熟悉蛋白质结构域在功能预测中的意义；根据协同进化注释基因功能；基因功能检测；高通量基因功能的研究方法。
了解基因的命名与分类；功能基因组学。
6. 掌握基因组的起源；基因与基因组加倍；外显子洗牌；DNA水平转移。
熟悉重复基因的命运；非编码序列的扩张。
了解比较基因组学。
7. 掌握分子系统发生学的概念；DNA系统发生树。
熟悉分子系统发生学与生物进化。
了解基因组与生物多样性。
8. 掌握疾病基因组研究策略。
遗传学课程教学大纲
遗传学课程教学大纲课程名称：遗传学（Genetics）课程编号：1313070215课程类别：专业课总学时数：56 课内实验时数：学分：3.5开课单位：生命科学学院生物综合教研室适用专业：生物技术适用对象：本科（四年）一、课程的性质、类型、目的和任务遗传学课程是高等学校理科生物技术专业学生必修的一门重要专业课。
该课程所教授的基本概念、基本理论和基本方法是构成该专业学生学科基础的重要组成部分，是该专业学生必备的知识与技能。
遗传学课程在为学生系统地打好必要的专业基础，培养学生具备专业的素质与技能，增强学生分析问题和解决问题的能力，培养学生的探索精神和创新意识等方面，起到独特而重要的作用。
遗传学课程是现代生物学中发展最迅速，与其他自然科学、社会科学以及技术科学交叉最多的学科之一，是新技术革命的动力学科。
通过本门课程的学习，可使学生在有限的时间内，系统地理解遗传学的基本知识，掌握基本理论和基本技能，触摸到本学科发展动态的前沿，认识到遗传学在生物领域中的重要位置，在遗传学课程的各个教学环节中，都应在传授知识的同时，注重学生分析问题和解决问题能力的培养，注重学生探索精神和创新意识的培养，努力实现学生知识、能力、素质的协调发展，为将来适应本专业教学及科研的需求奠定坚实的基础。
二、本课程与其它课程的联系与分工遗传学与生物化学、微生物学、植物生理学以及动、植物学、细胞生物学、胚胎学、细胞生物学、分子生物学课程均有联系，特别是与生物化学、微生物学以及细胞生物学的联系更为密切。
所以要求学生有扎实的上述课程基础。
故本课程宜从三年级第一学期开始，以确保学生学习本课程具有所需要的先修课程基础。
三、教学内容及教学基本要求[1]表示“了解”；[2]表示“理解”或“熟悉”；[3]表示“掌握”；△表示自学内容；○表示略讲内容；绪论遗传学的概念、内容、任务[3]；遗传学的产生与发展[1]；遗传学的分支[1]；遗传学研究的意义[3]；重点：遗传学的概念、内容、任务；遗传学研究的意义难点：遗传学的产生与发展；遗传学的分支教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法作业：预习第一章思考题：学好遗传学对本专业学习的意义第一章遗传的细胞学基础第一节细胞△细胞结构[2]；△原核细胞与真核细胞[2]；重点：原核细胞与真核细胞的区别难点：原核细胞与真核细胞的区别教学手段：多媒体教学教学方法：启发教学法第二节染色体染色体的形态结构[3]；染色体的数目和大小[2]；特殊染色体[3]；染色体组型[2]；重点：染色体的形态结构；特殊染色体难点：染色体超微结构；染色体组型教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第三节细胞分裂○原核细胞的无丝分裂[1]；○真核细胞的有丝分裂[3]；○细胞的减数分裂[3]；重点：有丝分裂与减数分裂中遗传物质的分配难点：有丝分裂与减数分裂的生物学意义教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第四节配子的发生及染色体周史△高等动物配子发生及生活史[2]；△高等植物配子发生及生活史[2]；△真菌类的生活史[2]；重点：生活史过程中遗传物质的分配与传递难点：生活史过程中遗传物质的分配与传递教学手段：多媒体教学教学方法：启发教学法作业：为什么称果蝇的唾腺染色体为巨大染色体，研究它有何意义？第二章孟德尔定律第一节分离规律○分离现象[1]；○分离现象的解释及其实质[3]；○分离现象的验证[2]；分离比实现的条件[3]；重点：分离现象的解释及其实质；分离比实现的条件难点：分离现象的解释及其实质教学手段：多媒体教学教学方法：启发教学法；讲授法第二节自由组合规律○自由组合的遗传现象[1]；○自由组合现象的解释及实质[3]；○自由组合规律的验证[2]；多基因杂种及其后代的遗传分析[3]；重点：自由组合现象的解释及实质；多基因杂种及其后代的遗传分析难点：自由组合现象的解释及实质教学手段：多媒体教学教学方法：启发教学法；讲授法第三节统计学原理在遗传学中的应用概率的应用[3]；二项式的展开及应用[3]；卡方测验[3]；重点：概率的应用；二项式的展开及应用；卡方测验难点：二项式的展开及应用教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法作业：假定性别比是1：1，一个6个孩子的家庭，在下列组成情况下，其出现概率如何？（1）3个男孩，3个女孩（2）以1男孩，1女孩，1男孩，1女孩的顺序出现（3）全部是女孩（4）全部是同性别的（5）至少有1个女孩第三章基因的作用及其与环境的关系第一节环境的影响和基因的表型效应环境与基因作用的关系[2]；基因表达的变异[2]；显隐性关系的相对性[2]；表型模写[2]；重点：基因表达的变异；显隐性关系的相对性；表型模写难点：基因表达的变异；显隐性关系的相对性教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第二节致死基因致死作用的类型[1]；显性致死与隐性致死[2]；重点：显性致死与隐性致死难点：显性致死与隐性致死教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法作业：预习下节内容第三节复等位现象ABO血型[3]；Rh血型与母子间不相容[2]；重点：ABO血型及输血原则难点：ABO血型；Rh血型与母子间不相容教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第四节非等位基因之间的相互作用互补和累加类型[3]；相互抑制的类型[3]；性状的多基因决定[2]；基因的多效性[2]；重点：非等位基因间相互作用的机理与比例；性状的多基因决定；基因的多效性；难点：非等位基因间相互作用的机理与比例；性状的多基因决定；基因的多效性；教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法作业：什么叫表型模写，研究表型模写有什么意义？第四章连锁与交换规律第一节连锁与交换连锁与交换的遗传现象[1]；交叉与交换的关系[2]；交换值及其测定[3]；重点：交叉与交换的关系；交换值及其测定难点：交叉与交换的关系；交换值及其测定教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第二节基因定位和连锁遗传图基因定位概念[2]；基因定位方法[3]；遗传干涉[3]；连锁群和连锁图[2]；重点：三点测交法基因定位；遗传干涉难点：三点测交法基因定位教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第三节真菌类的遗传学分析链孢霉生活史[1]；四分子分析[3]；着丝粒作图[3]；重点：四分子分析；着丝粒作图难点：四分子分析教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法第四节人类连锁分析和细胞学图○人类基因组计划[1]；○人类基因定位[1]；重点：人类基因定位常用方法难点：人类基因定位方法教学手段：多媒体教学教学方法：讲授法作业：在+++/abc×abc/abc后代中获得如下结果（a、b、c顺序未定）：a+c/abc 23; +bc/abc 75; abc/abc 396; a++/abc 73; ab+/abc 1; +++/abc 406;+b+/abc 25; ++c/abc 1. 总数为1000。
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《基因工程》课程教学大纲课程类别：专业课课程性质：必修英文名称：Gene Engineering总学时：48 讲授学时：48学分：3先修课程：生物化学、分子生物学、微生物学、细胞生物学适用专业：生物工程、生物技术开课单位：医学院生物化学与分子生物学教研室一、课程简介本课程是生物工程专业必修的专业主干课程，它是生物工程（包括基因工程、细胞工程、酶工程、发酵工程）中最重要的课程之一，它是以分子遗传学理论为基础，以分子生物学和微生物学的现代方法为手段而建立起来的一门技术学科。
基因工程就是在生物体外，通过对DNA分子进行人工剪切和拼接，对生物的基因进行改造和重新组合，然后导入受体细胞内进行无性繁殖，使重组基因在受体细胞内表达，产生出人类所需要的基因产物或定向的创造生物的新性状，使之稳定地遗传给子代。
要求学生掌握基因工程中的基础知识和基本理论，掌握基因工程中的基本研究手段和实验方法，了解基因工程中的最新研究进展和动态，能够灵活运用基因工程的基本理论知识和实验方法，对整个生物工程有一个更新的认识，使学生受到基本科学思维和科学实验能力训练，同时使学生学会学习，具有自我开拓可获得知识和利用信息的能力，以达到融知识传授、能力培养和素质提高于一体的教学目的。
二、教学内容及基本要求（一）绪论（2学时）教学内容：基因工程概况；基因工程研究内容；基因工程展望。
教学要求：1.掌握基因工程的概念。
2.了解基因工程的主要研究内容、发展简史。
3.了解当前基因工程研究的总趋势与重点领域。
授课方式：讲授、自学（-）分子克隆工具酶（6学时）教学内容：限制性内切酶；甲基化酶；DNA聚合酶；依赖于DNA的RNA聚合酶；连接酶；T4多核昔酸激酶；碱性磷酸酶；核酸酶。
教学要求：1.掌握限制性核酸内切酶的概念、功能、影响酶活性的因素及操作注意事项、限制性核酸内切酶的星活性概念及产生的原因。
2.掌握同裂酶和同尾酶的概念。
3.掌握DNA连接酶、DNA聚合酶、反转录酶和碱性磷酸酶的功能。
《生物化学与分子生物学》教学大纲全文
可编辑修改精选全文完整版《生物化学与分子生物学》教学大纲《生物化学与分子生物学》I 前言生物化学与分子生物学是研究生命化学的科学，它在分子水平探讨生命的本质，即研究生物体的分子结构与功能、物质代谢与调节、及其在生命活动中的作用。
由于生物化学与分子生物学越来越多地成为生命科学的共同语言，当今生物化学与分子生物学已成为生命科学领域的前沿学科。
生物化学与分子生物学的教学任务主要是介绍生物化学与分子生物学的基本知识，以及某些与医学相关的生物化学进展，包括生物大分子的结构与功能（蛋白质、核酸、酶），物质代谢及其调节（糖、脂、氨基酸、核苷酸代谢、物质代谢的联系与调节）；基因信息的传递（DNA复制、RNA转录、蛋白质生物合成、基因表达调控、重组DNA与基因工程）；相关的专题知识（细胞信息转导，血液的生物化学，肝的生物化学，维生素与微量元素，常用分子生物学技术的原理及其应用，基因组学与医学）。
本大纲适合于五年制临床医学、口腔、医学检验、影像、麻醉等专业使用，现将大纲使用中有关问题说明如下：一本大纲配套使用的教材为全国高等医学院校规划教材《生物化学》（案例版）第1版（刘新光主编）。
二本大纲内容按“掌握、熟悉、了解”三级要求学习及掌握。
其中，考试内容中“掌握”占70%左右；“熟悉、了解”的内容占30%左右。
“掌握”部分要求理解透彻，包括有关概念及其研究进展等内容细节，并能运用其理论及概念于相关学科的学习及今后的临床及科研工作；“熟悉”部分要求能熟知其相关内容的概念及有关理论，并能适当应用；“了解”部分要求能对其中的概念有一定认识，对相关内容有所了解。
三总教学参考学时为125学时，理论与实验比值约为2:1，即讲授理论学时为85学时（第一部分为生物化学部分，48学时；第二部分为分子生物学部分，37学时），实验学时为40学时。
II 正文第一部分生物化学第1章绪论熟悉“生物化学”的概念及其与“分子生物学”的关系。
了解生物化学的发展简史、当代生物化学研究的主要内容及生物化学与医学的紧密联系。
大学《基因工程学》教学大纲
《基因工程学》课程教学大纲（Genetic Engineering）一、课程说明课程编码：02200200课程总学时（理论总学时/实践总学时）：48（48/0）周学时（理论学时/实践学时）：4（4/0）学分：31．课程性质：专业必修课。
2．适用专业与学时分配：适用生物技术专业。
教学内容与学时分配3．课程教学目的与要求：本课程的授课对象是生物技术专业的本科生。
课程简介：《基因工程》是生物技术专业的专业必修课程。
其以分子遗传学理论为基础，以分子生物学和微生物学的现代方法为手段而建立起来的一门技术学科。
基因工程兴起于20世纪70年代初，它的问世带动了生物技术的兴起和发展，是现代生物技术的核心内容。
基因工程课程的主要内容包括基因的分离、基因的克隆、基因的表达、植物基因工程、动物基因工程、药物基因工程和基因治疗等。
它是生命科学学院生物技术专业本科生的主干专业课程之一，它是生物工程（包括基因工程、细胞工程、酶工程、发酵工程）中最重要的课程，其它三大工程是建立在基因工程基础之上的，同时也为生物技术制药等后继学科奠定了重要的理论基础。
课程目标：设置本课程是为了让生物技术专业的学生理解和掌握基因工程的技术原理，通过本课程学习，掌握基因操作的工具酶，基因克隆常用载体，目的基因的分离与合成，重组体的构建，重组体向宿主细胞的导入，重组体克隆的筛选与鉴定以及克隆基因的表达，同时了解基因工程在生物学领域中的应用与发展前景。
对学生达到毕业要求贡献如下：1）了解基因工程学的历史、发展和前沿知识。
2）掌握基因工程学的基础理论、基本知识和基本技能；教学要求：学完基因工程学后，学生将具备以下能力：1）具有良好的自学能力；2）综合运用所掌握的基因工程学理论知识和技能、从事生物科学及其相关领域科学研究的能力。
4．本门课程与其它课程关系：先修课程为生物化学、微生物学、分子生物学、细胞学等，具备基础理论知识及实验能力是基因工程学课程的基础。
本科遗传学教学大纲
本科遗传学教学大纲本科遗传学教学大纲遗传学是生物学的重要分支领域，研究基因在遗传传递中的作用和规律。
本科遗传学教学大纲旨在为学生提供系统的遗传学知识，培养学生的科学思维和实践能力，为他们未来的科研和职业发展奠定基础。
一、引言遗传学的起源可以追溯到19世纪末的格雷戈尔·孟德尔的豌豆杂交实验。
通过孟德尔的实验，我们了解到基因的存在和遗传规律。
遗传学的发展经历了多个重要里程碑，如克隆技术的发明、人类基因组计划的启动等。
本科遗传学教学大纲将帮助学生了解这些里程碑，认识到遗传学对人类社会的重要性。
二、基础遗传学1. 遗传学的基本概念介绍遗传学的基本概念，包括基因、染色体、基因型和表型等。
通过案例分析和实验，让学生理解基因在遗传传递中的作用。
2. 孟德尔遗传学详细介绍孟德尔的豌豆杂交实验，解释孟德尔定律的含义和遗传规律。
通过实验，让学生亲自进行杂交实验，体验遗传规律的发现过程。
3. 分子遗传学介绍DNA的结构和功能，讲解基因的复制、转录和翻译过程。
通过实验，让学生了解分子遗传学的实验方法和技术。
三、进阶遗传学1. 遗传变异和突变介绍遗传变异和突变的概念，讲解突变的类型和机制。
通过案例分析，让学生了解突变在遗传变异中的作用。
2. 遗传连锁和基因图谱详细介绍遗传连锁和基因图谱的概念和原理。
通过实验，让学生学会构建基因图谱和解读遗传连锁。
3. 遗传学与人类健康讲解遗传学在人类健康中的应用，如遗传性疾病的诊断和治疗。
通过案例分析，让学生了解遗传疾病的发生机制和预防措施。
四、前沿遗传学1. 基因组学介绍基因组学的概念和发展，讲解基因组测序和基因组编辑技术。
通过案例分析，让学生了解基因组学在科学研究和医学领域的应用。
2. 表观遗传学讲解表观遗传学的概念和研究内容，解释表观遗传调控的机制。
通过实验，让学生了解表观遗传学的实验方法和技术。
3. 生物技术与遗传工程介绍生物技术和遗传工程的概念和应用。
通过案例分析，让学生了解生物技术和遗传工程在农业、医学和环境保护等领域的应用。
基因组学与蛋白质组学
《基因组学与蛋白质组学》课程教学大纲学时：40学分：2.5理论学时：40实验学时：0面向专业：生物科学、生物技术课程代码：B7700005先开课程：生物化学、分子生物学课程性质：必修/选修执笔人：朱新产审定人：第一部分：理论教学部分一、课程的性质、目的和任务《基因组学与蛋白质组学》是随着生物化学、分子生物学、结构生物学、晶体学和计算机技术等的迅猛发展而诞生的，是融合了生物信息学、计算机辅助设计等多学科而发展起来的新兴研究领域。
是当今生命科学研究的热点与前沿领域。
由于基因组学与蛋白质组学学科的边缘性，所以本课程在介绍基因组学与蛋白质组学基本基本技术和原理的同时，兼顾学科发展动向，讲授基因组与蛋白组学中的热点和最新进展，旨在使学生了解现代基因组学与蛋白质组学理论的新进展并为相关学科提供知识和技术。
二、课程的目的与教学要求通过本课程的学习，使学生掌握基因组学与蛋白质组学的基本理论、基础知识、主要研究方法和技术以及生物信息学和现代生物技术在基因组学与蛋白质组学上的应用及典型研究实例，熟悉从事基因组学与蛋白质组学的重要方法和途径。
努力培养学生具有科学思维方式、启发学生科学思维能力和勇于探索，善于思考、分析问题的能力，激发学生的学习热情，并通过学习提高自学能力、独立思考能力以及科研实践能力，为将来从事蛋白质的研究奠定坚实的理论和实践基础。
三、教学内容与课时分配第一篇基因组学第一章绪论（1学时）第一节基因组学的研究对象与任务；第二节基因组学发展的历程；第三节基因组学的分子基础；第四节基因组学的应用前景。
本章重点：1. 基因组学的概念及主要任务；2. 基因组学的研究对象。
本章难点：1.基因组学的应用及发展趋势；2.基因组学与生物的遗传改良、人类健康及生物进化。
建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：查阅有关资料，了解基因组学的应用发展。
第二章人类基因组计划（1学时）第一节人类基因组计划的诞生；第二节人类基因组研究的竞赛；第三节人类基因组测序存在的缺口；第四节人类基因组中的非编码成分；第五节人类基因组的概观；第六节人类基因组多样性计划。
基因工程教学大纲
基因工程教学大纲引言：基因工程是近年来迅速发展的学科领域，它对人类社会的发展产生了重要影响。
为了适应时代的需求，设计一份全面而系统的基因工程教学大纲是至关重要的。
本文将按照科学规范和教学需求，为基因工程课程设计一份教学大纲。
一、课程概述1.1 课程名称：基因工程1.2 学分：3学分1.3 先修课程：生物学、遗传学1.4 课程性质：必修课程二、课程目标2.1 理论目标：2.1.1 了解基因工程的发展历程和主要研究领域。
2.1.2 理解重要基因工程技术的原理和应用。
2.1.3 掌握基因工程实验技术和数据分析方法。
2.2 实践目标：2.2.1 培养科学研究和实验操作的能力。
2.2.2 提高信息搜索与科学写作的能力。
2.2.3 培养团队合作和项目管理能力。
三、教学内容和安排3.1 基因工程概述3.1.1 定义和发展历程3.1.2 基因工程在农业、医学和环境领域中的应用3.1.3 基因工程伦理与法律问题3.1.4 基因工程与社会发展3.2 DNA重组技术3.2.1 DNA结构与功能3.2.2 基因克隆技术3.2.3 DNA测序和合成技术3.2.4 基因组编辑技术3.3 基因工程应用3.3.1 转基因植物和转基因动物3.3.2 基因治疗和基因诊断3.3.3 基因工程在环境修复中的应用3.3.4 基因工程在能源生产中的应用3.4 基因工程实验技术3.4.1 DNA提取和纯化技术3.4.2 PCR技术3.4.3 DNA凝胶电泳3.4.4 基因组分析技术3.5 数据分析与文献检索3.5.1 基因数据分析软件的使用与比对3.5.2 基因数据库检索与利用3.5.3 资料整理与科学写作方法四、教学方法4.1 理论授课4.1.1 知识点讲解与示范4.1.2 案例分析与讨论4.1.3 学生主动学习与互动交流4.2 实验操作和实践训练4.2.1 实验指导与操作规范4.2.2 实验数据分析与报告撰写4.2.3 团队合作与交流4.3 课堂讨论与辩论4.3.1 学生主题报告4.3.2 学术论文讨论与评论4.3.3 伦理与法律问题辩论五、评价方式5.1 学生的平时表现（占总评成绩的30%）5.2 实验报告与成果展示（占总评成绩的30%）5.3 期末考试（占总评成绩的40%）六、教材和参考资源6.1 教材：-《基因工程导论》-《基因工程与生物技术实验教程》-《基因工程实验指导与操作手册》6.2 参考资源：-学术期刊论文-基因工程相关网站-教学实验室设备和工具书籍结语：通过本教学大纲的实施，学生将全面了解基因工程的理论与实践，掌握基础的实验技术和科学研究方法。
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《基因组学》课程教学大纲一、课程基本信息课程代码：0235204课程名称：基因组学英文名称：Genomics课程类别：选修课学时：28学分：1.5适用对象:生物技术等相关专业考核方式：N+2。
笔记10%，考试成绩占40%，平时成绩N占50%。
先修课程：生物化学、遗传学、基因工程、分子生物学。
二、课程简介基因组学是生物学科的基础课程，主要讲授基因组学的相关生物学基础、基因组学的基本原理与方法、理论与应用，介绍基因组学的发展动态。
三、课程性质与教学目的本课程为选修课。
要求学生一般掌握基因组学的基本原理与方法、理论与应用，了解基因组学的发展动态。
四、教学内容及要求第一章基因组学基础（3学时）（一）教学内容1、细胞组织与结构功能；细胞分裂。
2、DNA的分子生物学。
3、基因组顺序。
4、基因组学的应用前景。
5、染色体；染色体的带型；基因组。
6、细胞分裂。
（二）基本概念和知识点1、细胞分裂类型及过程。
2、人类染色体的带型分析。
3、原核生物和真核生物基因组。
（三）问题与应用（能力要求）1、细胞的结构与功能。
2、原核生物和真核生物基因组的差异。
（四）课后练习查阅有关资料，了解细胞的结构与功能。
（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。
第二章分子标记（3学时）（一）教学内容1、遗传标记的类型与特征；DNA标记的优势。
2、RFLP (Restriction fragment length polymorphism)，限制性片段长度多态性；RFLP 基本操作步骤。
3、PCR (polymerase chain reaction)即多聚酶链式反应；DNA复制的原理；PCR技术；影响PCR的因素；引物设计的原则；PCR产物的检测和多态性分析。
4、RAPD (Random amplified polymorphic DNA)随机扩增多态DNA，RAPD与一般PCR 的主要差异；RAPD的检测5、AFLP(Amplified fragment length polymorphism)扩增性片段长度多态性；限制性片段的产生；限制性片段扩增；选择性扩增产物的检测。
6、SSLP (simple sequence length polymorphism) 即简单序列长度多态性；微卫星DNA；微卫星标记的发展。
7、几种分子标记特点的比较。
（二）基本概念和知识点1、遗传标记的概念及类型与特征。
2、PCR技术。
3、几种分子标记特点。
（三）问题与应用（能力要求）1、DNA标记的优势与应用。
2、几种分子标记的应用。
（四）课后练习查阅有关资料，了解分子标记的应用发展。
（五）教学方法与手段讲授，实验演示，课堂讨论。
第三章遗传作图（3学时）（一）教学内容1、传统遗传图；连锁分析；2、图谱构建；作图群体；作图群体的基本要求；各类作图群体的特点。
3、分子标记分析；亲本分析；作图群体的分析；4、遗传图谱的构建；连锁作图的基本原理；Mapmaker软件的利用；图谱分析。
5、亲本分析；亲本间的亲缘距离与多态性程度的关系；亲本间多态性的分析；作图群体的分析。
6、作图群体的分子标记分析、数据库的建立。
（二）基本概念和知识点1、传统遗传图；连锁分析；各类作图群体的特点。
2、连锁作图的基本原理。
3、亲本间的亲缘距离与多态性程度的关系。
4、数据库的建立。
（三）问题与应用（能力要求）1、Mapmaker软件的利用；图谱分析。
2、亲本间多态性的分析。
3、作图群体的分子标记分析。
（四）课后练习查阅有关资料，了解遗传作图的应用发展。
（五）教学方法与手段讲授，Mapmaker软件的实验演示，课堂讨论。
第四章基因定位（3学时）（一）教学内容1、基因的鉴定；基因的概念；主效基因和微效基因、遗传分析、等位性测定。
2、主基因定位；基因定位的原理；表型分析；分子标记的分析；遗传作图。
3、QTL定位单标记方差分析法 QTL定位的新策略 QTL分析的发展方向：把复杂性状变为简单性状；把多基因分解为单基因（单一孟德尔因子）；把数量性状变成质量性状。
4、分子标记辅助选择分子标记辅助选择(Marker-assisted selection，MAS)概念、基本的原理和条件；标记与基因的关系、MAS在育种上利用；以PCR为基础的MAS 基因定位与MAS一体化；基因聚合；单性状多个基因的聚合、多个性状基因的聚合。
（二）基本概念和知识点1、基因的概念主效基因和微效基因、遗传分析、等位性测定。
2、QTL定位；单标记方差分析法；分子标记辅助选择；基因聚合。
3、分子标记辅助选择基本的原理。
4、基因定位的原理。
（三）问题与应用（能力要求）1、QTL定位的新策略 QTL分析的发展方向。
2、基因定位的分子标记分析与遗传作图。
（四）课后练习查阅有关资料，了解基因定位的应用发展。
（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。
第五章物理作图（3学时）（一）教学内容1、物理作图与遗传作图的主要差异。
2、大片段DNA的分离；PFGE的基本原理、垂直交变电场电泳。
3、作图文库；YAC (Yeast artificial chromosome)，BAC (Bacterial artificial chromosome)；TAC Transformation-competent artificial chromosome)4、作图方法原位杂交法（in situ hybridization ）·限制性作图法（r e s t r i c t i o n m a p p i n g）·分子标记锚定法（ DNA marker anchoring）·克隆指纹法（ clone fingerprinting ）（二）基本概念和知识点1、物理作图；原位杂交法；限制性作图法；分子标记锚定法克隆指纹法。
2、大片段DNA的分离 PFGE的基本原理。
（三）问题与应用（能力要求）1、主要作图方法的应用。
（四）课后练习查阅有关资料，了解物理作图方法的应用发展。
（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。
第六章 DNA测序（3学时）（一）教学内容1、DNA测序的两种方法：化学降解法（chemical degradation method）、链终止法（the chain termination method）；DNA 序列分析的自动化2、DNA顺序的组装：鸟枪法（ shotgun ）；克隆重叠群法（clone contig）；引导鸟枪法（ directed shotgun ）（二）基本概念和知识点1、DNA测序的两种方法化学降解法；链终止法。
2、DNA顺序的组装方法鸟枪法；克隆重叠群法；引导鸟枪法。
（三）问题与应用（能力要求）1、DNA 序列分析的自动化。
（四）课后练习查阅有关资料，了解DNA 序列分析的自动化。
（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。
第七章基因解读（3学时）（一）教学内容1、开放阅读框。
2、原核生物的基因解读。
3、真核生物的基因解读。
4、真核生物的核基因解读。
5、拟南芥的基因解读。
（二）基本概念和知识点1、开放阅读框。
2、启动子；终止子；外显子；内含子。
3、密码子偏爱；外显子-内含子边界；上游控制序列。
4、同源查询。
（三）问题与应用（能力要求）最小基因组推测。
（四）课后练习了解常见生物的基因解读概况。
（五）教学方法与手段讲授，示例讲解，课堂讨论。
第八章基因克隆（3学时）（一）教学内容1、 cDNA 克隆。
克隆载体， cDNA 分子的合成，cDNA文库的建立。
2、基于mRNA 水平的克隆。
差别杂交，DDRT-PCR DDRT-PCR、DDRT-PCR；mRNA差异显示PCR；抑制性扣除杂交（Suppression Subtractive Hybridization, SSH）技术。
3、基于遗传图的基因克隆。
基因组遗传图，基因组物理图，互补测试，指示基因鉴别。
（二）基本概念和知识点1、cDNA文库。
2、DDRT-PCR DDRT-PCR、DDRT-PCR。
3、差别杂交的技术基础；mRNA差异显示PCR。
4、抑制性扣除杂交（Suppression Subtractive Hybridization, SSH）技术。
（三）问题与应用（能力要求）1、cDNA文库的构建。
2、差别杂交的技术基础。
（四）课后练习了解基因克隆的发展概况。
（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。
第九章基因组功能（4学时）（一）教学内容1、概况。
2、转录序列标签, or ESTs From cDNA to ESTs。
3、RNA干涉；T-DNA 插入；Ac/Ds 系统。
DNA芯片。
（二）基本概念和知识点1、SAGE技术的主要理论依据。
2、转座子突变库及其构建。
3、RNA干涉现象。
4、DNA芯片。
（三）问题与应用生物芯片进行DNA测序。
（四）课后练习展望生物芯片的发展。
（五）教学方法与手段讲授，课堂讨论。
五、推荐教材和教学参考资源使用教材基因组学自编教材参考教材基因组学杨金水主编北京：高等教育出版社 2000年版执笔人：阚劲松教研室：系主任审核签名：。