Rietveld结构精修与常见问题解析
Rietveld 结构精修原理与应用

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1 4 选择峰型函数类型,根据CMPR修改各个 峰型参数
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这是按下“powpref”的画面,跑 完后按任意键继续
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再按一下“genles”开始计算最小平方
循环递回次数
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红色x为实验值,绿色实线为拟合值, 紫色实线为实验值与拟合值的差,这一 个图形窗口我们可以留着不要关掉,他 会随着我们的精算一路更新。
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精算峰型函数
精修所有原子的坐标,热振动,占位
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当精算的到的最佳的時候,如上图,紫色的差值几乎成为一直线。 χ2与R-factor都到达最佳后,我们可以把结果給输出。
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⑦ 精修结果的判定 • 差值线尽量平直 • Rwp ,Rp尽可能的低,低到15%认为可以接受,低到10%以下,认为精修结果能令人满意。 • χ2拟合度因子应趋近等于1 • 化学键长键角应该在合理的范围内
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(2)粉末衍射技术: 三维空间数据被压缩成一维,数据太少,无法得到电子云 密度图,因此很难解出结构。 缺点:方法很复杂
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1966年,荷兰科学家Hugo M Rietveld 采用拟合整个衍射图谱 (峰位、强度、线形等)来精修晶体结构,最初用于中子粉末衍 射。
某衍射峰(hkl)的衍射净强度: Yhkl=Ghkl*Ihkl
Xj , Yj , Zj是原子j的原子坐标;hkl是产生衍射的晶面指数;fj是j原子的散射因子。
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2锂电前沿:Rietveld精修-Jade

操作步骤示例
1 物相检索,确定晶体结构模型 模型选择为PDF卡片,称为“非结构相”,模型选择为晶体结构( Cif文件),称为“结构相”。 Jade通过选择“计算卡片”来读入“结构相”模型。
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操作步骤示例
2 进入精修窗口 选择“Options | WPF Refine”命令,进入全谱拟合窗口。 图中显示4个物相被引入。
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结构模型
Jade特色
精修模式
测量数据
非结构模型
基本参数精修
基本参数精修
晶胞参数精修
晶胞参数精修
峰形参数精修
峰形参数精修
结构参数精修
峰强参数精修
结构精修
结果模型
全图拟合
5
Jade特色
精修指标
Jade设计了两个参数E和R: E 100 (N P)
I (o,i)
R 100
(w(i) (I (o,i) I (c,i))2 w(i) (I (o,i) I (b,i))2
2
Jade特色
1 Jade有两种精修模式:结构精修和全图拟合。 结构精修:以物相的晶体结构为模型进行精修,是一个标准的Rietveld精 修程序。可以用于计算晶胞参数,物相定量和微结构。而且可以修正晶 体结构。 全图拟合:以PDF卡片(衍射峰位置和衍射峰相对强度)为模型进行精修, 它仅是一个全图拟合程序。可以用于计算晶胞参数,物相定量和微结构。
3个层次进行精修,按照 精修的目的选择精修的 程度。
与仪器、整体谱图相关的参数
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操作界面
精修步骤按照:
1)全局变量 2)相参数 3)原子结构 3个层次进行精修,按照 精修的目的选择精修的 程度。
与仪器、整体谱 图相关的参数
XRD讲稿-6-Rietveld方法解析

后者又称为“利用粉 末 衍射数据的从头结构测 定”。这种从头结构测 定 第一步是进行衍射线条 的指标化。完成结构全 分析的过程可以由左图 进行形象化的表示。
结构修正或测定所用的辐射源包括通常的X射线、 同步辐射和中子源。特别是同步辐射源具有高强度、 高分辨率的特长,其衍射峰的半高宽要比普通X射线 衍射仪所收集的衍射峰窄得多,可将重叠峰减至最 少;收据的衍射数目又较多,峰形对称,符合高斯 函数分布,这些优点使多晶体的从头结构测定更易 于实现。
Rietveld方法及其在结构分析、 定量相分析中的应用
H.M. Rietveld, J. Appl. Cryst., (1969)65 多晶衍射数据的局限性:
* 衍射峰的严重重叠,丧失了大量有效信息 * 难以得到精确的衍射强度值 长期以来,多晶粉末衍射数据无法用于结构分析
X-射线多晶粉末衍射技术作为物相的定性与 定量分析、多晶材料的粒度测定、固溶体研究及 新相的结晶学表征等有效手段,早已被广泛应用 于工业部门和科学技术的许多领域中。由于X-射 线多晶衍射图中衍射线的重叠及分辨率低,欲利 用它的布拉格反射的强度数据,提供有关晶体结 构的准确数据,往往是困难甚至是无效的。因此, 长期以来,为获得晶体结构的信息,几乎唯一依 靠单晶的各种衍射方法。
1977年开始,图形拟合修正结构的方法应用于 X射线衍射也获得成功,相继发表了将 Rietveld方 法应用于X-射线多晶衍射的结果.
分别用Guinier-Hägg相机(严格单色化的Cu Kα1 辐射)及衍射仪阶梯扫描方式(Cu Kα1, Kα2或Cu Kβ 辐射)收集强度数据,对α-Bi2O3,磷灰石 Ca10(PO4)6F2和La0.75Sr0.25CrO3按峰形分析方法修 正结构,将所得结果与同种试样的单晶或中子衍射 的修正进行比较,除有个别原子位置参数的偏离超 过标准偏差(σ)的3倍外,均吻合较好。这标志着X射线多晶衍射技术中Rietveld方法的形成。
X射线晶体学 第13章 Rietveld全谱拟合精修 图文

比较好的精修方法是逐步放开参数,开始先修正一两 个线性或稳定的参数,然后再逐步放开其他参数一起修 正,最后一轮的修正应放开所有参数。
在修正的过程中,应经常利用图形软件显示修正结果, 从中可获得一些有关参数的重要信息,以便进行进一步 精修,直到得到很好的结果。
(4) Rietveld精修软件
从1979年R. A. Young等人发表第一个用于Rietveld分析 的计算软件DBWS以来,已有很多类似的软件问世,但 目前广泛被采用的主要有GSAS、FULL-PROF、BGMN、 JANA2000、DBWS等。 由于Rietveld分析方法的优化参数众多,而且是一个迭 代过程,使得上述各程序都具有难于书写控制文件的缺 点。
X射线晶体学
12. Rietveld全谱拟合精修
提纲
1. Rietveld结构精修方法 2. 全谱拟合精修过程举例 3. 物相的添加 4. 全局变量精修 5. 物相参数精修 6. 物相原子参数精修 7. 精修控制 8. 精修显示与结果输出 9. 全谱拟合精修应用实例
1. Rietveld结构精修方法
Rietveld方法是荷兰晶体学家H. M. Rietveld在1969年提 出的,是一种由中子粉末衍射图阶梯扫描测得的峰型 强度数据对晶体结构进行修正的方法。
1979年,R.A.Young 等人将Rietveld方法应用于X射线 衍射领域,并对属于15种空间群的近30种化合物的结 构成功地进行了修正。
FULLPROF是一个非常优秀的Rietveld分析软件,对于 初 学者来说,此软件的操作毕竟不是一件容易的事情。
Rietveld方法原理

目录
• Rietveld方法的简介 • Rietveld方法的原理 • Rietveld方法的实施步骤 • Rietveld方法的优势和局限性 • Rietveld方法的应用领域 • Rietveld方法的未来发展
01
Rietveld方法的简介
Rietveld方法的定义
析。
B
C
D
对实验条件要求严格
Rietveld方法需要严格的实验条件,如温 度、湿度、压力等,以确保实验结果的准 确性和可靠性。
仪器设备昂贵
进行Rietveld分析需要高精度的X射线衍 射仪等昂贵的仪器设备,因此成本较高。
05
Rietveld方法的应用领域
矿物学
确定矿物成分
通过Rietveld方法分析矿物衍射数据 ,可以精确测定矿物的化学成分,包 括微量杂质和固溶体。
Rietveld方法是一种用于分析晶体结 构的方法,通过分析X射线或中子衍 射数据,推断出晶体中原子的位置和 取向。
该方法基于晶体学原理,利用衍射数 据中的强度和角度信息,通过数学模 型和计算,确定晶体的晶格参数、原 子坐标、取向等结构参数。
Rietveld方法的重要性
Rietveld方法是研究晶体结构的重要手段之一,广泛应用于材料科学、化学、生 物学等领域。
实验操作
对样品进行适当的处理和安装,确保样品的稳定性和 代表性。
数据记录
记录实验过程中收集到的X射线衍射数据,包括衍射 峰的位置、强度和宽度等信息。
晶体结构解析
峰形拟合
结构验证
对每个衍射峰进行峰形拟合,提取出 衍射峰的位置、强度和宽度等参数。
通过计算模拟的衍射图与实验数据对 比,验证晶体结构模型的准确性。
Rietveld 结构精修原理与应用

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汇报人:
应用效果:提高了核磁共振实验的精度和准确性为样品的结构分析提供 了有力的支持。
05
Rietveld 结构精修的 未来发展
Rietveld 结构精修技术的改进与创新
提高计算效率:通 过优化算法和并行 计算技术提高精修 速度
提高精度:通过引 入更高精度的测量 技术和更精确的模 型提高精修精度
扩展应用领域:将 Rietveld结构精修 技术应用于更多领 域如生物大分子、 纳米材料等
Rietveld 结构精修的算法流程
输入:X射线衍射数据、晶体结构模型 计算:根据输入数据计算结构因子 拟合:将计算结果与实验数据进行拟合 优化:根据拟合结果调整晶体结构模型 输出:优化后的晶体结构模型
Rietveld 结构精修的优缺点
优点:精确测定晶体结构适用于多种晶体材料 缺点:需要大量数据计算量大需要专业软件支持
添加 标题
案例目的:通过 Rietveld 结构精修可以获 得更精确的晶体结构信息从而更好地理解晶 体的物理和化学性质。
添加 标题
案例结果:通过 Rietveld 结构精修可以获 得更精确的晶体结构信息从而更好地理解晶 体的物理和化学性质。
Rietveld 结构精修在粉末 X 射线衍射中的应用案例
Rietveld 结构精修在单晶 X 射线衍射中的应用案例
添加 标题
案例背景:单晶 X 射线衍射是一种常用的 结构分析方法Rietveld 结构精修是其中一 种重要的数据处理方法。
添加 标题
案例方法:首先通过单晶 X 射线衍射实验 获得衍射数据;然后使用 Rietveld 结构精 修方法对数据进行处理和分析;最后得到更 精确的晶体结构信息。
药物设计:利用 Rietveld结构精 修技术进行药物 设计提高药物研 发效率
2锂电前沿:Rietveld精修-Jade

Jade特色
1 Jade有两种精修模式:结构精修和全图拟合。 结构精修:以物相的晶体结构为模型进行精修,是一个标准的Rietveld精 修程序。可以用于计算晶胞参数,物相定量和微结构。而且可以修正晶 体结构。 全图拟合:以PDF卡片(衍射峰位置和衍射峰相对强度)为模型进行精修, 它仅是一个全图拟合程序。可以用于计算晶胞参数,物相定量和微结构。
1. 对于结构相,按下 进入到晶体结构修正窗口。 2. 在这里可以修正各个原子的位置(x,y,z),占位率(n)和与结构因子相
关的B或U因子。 3. 按下“All”,则表示修正该结构中所有允许修正的因子。 4. 或者按类选择或手动选择只修正其中的某些因子。
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8. 结果观察
操作步骤示例
显示精修状态
这些参数根据选择不同,有些参数受限不能修正。 对于结构相,还可以修正结构参数(原子位置等)。 如果样品中存在多个物相,则必须针对每一个物相都做这些精修。 并不一定每个参数都要修正,重要的参数才需要精修。 并不一定每个物相都要精修,应当先精修主要的或重要的物相。
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操作步骤示例
7 “晶体结构参数”精修
2 有自己独立的精修核心算法,评价标准不同于其它标准精修软件。
3 Jade有自己的晶体结构数据库,可以直接读取晶体结构模型。
4 所有精修步骤已经由软件安排,操作图形化,简单易学。
3
Jade特色
建立模型
非结构相:非结构模型以PDF卡片上的数据为模型,对所测衍射谱 进行分峰,可用于物相定量,晶胞参数修正,晶粒尺寸与微观应变计 算,不可以反映晶体内部的原子位置变化和原子占位率的变化 结构相:以晶体学数据库中的物相晶体学结构为模型对测量谱进 行拟合,可反映晶体内部的原子位置变化和原子占位率的变化。 结构相也可以直接使用CIF文件。
Rietveld精修原理全文

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2
➢ 其他参数 ④ 晶粒形状
默认球形 可选:
椭球形 其他形状
计算谱的构成
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2
计算谱的构成
➢ 其他参数 ⑤ 织构函数
Pk
exp(
G
2 k
)
Pk
exp[G( 2
k )2]
Pk
3 2
(G2 cos2 k
sin2 k
G
)
其中G为择优取向修正参数,k为择优取向晶面与衍射面的夹角。
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2
➢ 其他参数 ⑥ 应力及其它因素
物相的晶体结构通过查找各种晶体结构数据库而获得。
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2
➢ 其他参数 峰形函数G
计算谱的构成
衍射峰的形状以一个函数来拟合
Gaussian函数
I 2
I ek (2 2 p )2 p
峰形对称,适合于中子衍射
Cauchy函数 Cauchy平方函数
I
2
1
k
I
(2
p
2
p
)
2
I2
Ip
1 k(2 2 p )2
物相的晶体结构通过查找各种晶体结构数据库而获得。
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计算谱的构成
➢ 晶体结构
ICSD——无机晶体结构数据库(The Inorganic Crystal Structure Database,简 称ICSD)由德国的The Gmelin Institute (Frankfurt)和FIZ(Fach informations zentrum Karlsruhe)合办。https://icsd.fiz-karlsruhe.de/search/。 CSDS——剑桥结构数据库系统(The Cambridge Structural Database System,简 写为CSDS)。 ICDD——国际衍射数据中心(The International Centre for Diffraction Data,ICDD)。 NIST——NIST Crystal Data:Http:///srd/3.h也包含有23000条 晶体结构。 COD——Crystallography Open Database,晶体学开放数据库(COD)。通过网站访 问,其中包含较多的晶体结构数据。 当然,通过文献,查找一些最新发表的结构,也是前沿研究必要的工作之一。
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Rietveld结构精修与常见问题解析1引言Rietveld精修现在已经是很常用的技术,主要目的是从粉末衍射数据得到比较准确的晶体结构参数,如原子坐标、占有率和温度因子等,当然,也可用于物相定量分析等方面。
Rietveld方法的历史•1967年, H.M.Rietveld 在粉末中子衍射结构分析中,提出了粉末衍射全谱最小•二乘拟合结构修正法。
•1977年, Young等人把这方法引入多晶X射线衍射分析。
Rietveld全谱拟合精修晶体结构的方法,利用全谱衍射数据,充分利用衍射谱图的全部信息。
在假设晶体结构模型和结构参数基础上,结合某种峰形函数来计算多晶衍射谱,调整结构参数与峰形参数使计算出的衍射谱与实验谱相符合,从而确定结构参数与峰值参数的方法,这一逐步逼近的拟合过程称全谱拟合。
•开拓了对粉末衍射数据处理的根本变革时代,Rietveld 分析方法的研究及其应•用迅速发展。
Rietveld 结构精修能得到什么信息?· 晶胞参数、晶胞体积·原子位置· 原子占有率· 温度因子· 晶粒尺寸· 微观应变· 定量相分析· 结构因子· 结构解析· 磁结构2基本原理Rietveld使用整个衍射图谱数据进行分析,而一张多晶衍射图谱可以看成是由一系列等间距的2θ-yoi数据列组成。
如果晶体的结构已知,那么就可以使用晶体结构参数以及峰形参数计算出每一个2θ下对应的理论强度yci,再采用最小二乘法使其与实测强度yoi进行比较,并不断的调整各种参数,使差值M达到最小,即为全谱拟合。
差值M计算公式:w i为权重因子,y oi为实测强度,y ci为理论计算强度。
理论计算强度可以通过积分强度和峰形函数来进行计算,则衍射图上某点的2θ的理论计算强度y ci可以表示为:y ci=G ihkl I hkl+y bi其中G ihkl为峰形函数,在X射线衍射中,最常用的为Pseudo-Voigt和PearsonⅦ函数,其实质为高斯函数和洛伦兹函数的组合;I hkl可以通过晶体结构和原子组成等计算出;y bi为背景强度。
积分强度计算公式为:I hkl=S M hkl L hkl︱F hkl︱2S为标度因子或比例因子,M hkl为多重性因子,L hkl为洛伦兹因子,︱F hkl︱为结构振幅。
经过发展,Rietveld方法还可以用来进行物相定量分析,其计算公式为:其中, S i,M i和V i分别是标度因子,晶胞质量和晶胞体积。
如果混合物中含有非晶物质时,则需要加入内标,非晶相含量计算公式为:X s为已知的内标含量,X sc为计算得到的内标含量。
3常见问题解析(1)衍射数据如何采集?衍射数据最好要用步进扫描的方式采集:衍射峰最高峰的强度计数最好要达到数万,中等强度的衍射峰计数要达到1万左右。
一般步进扫描的步长要根据衍射峰的半高宽来决定,最好要小于半高宽的5分之一;用于精修的衍射数据其扫描范围一般要到120度。
经常看到有的人用连续扫描得到的、噪声很大的数据,最高峰强度计数也不到5千就进行精修,这样做不会得到可靠的结果。
(2)背景如何扣除?Ruetveld精修程序大都是用各种函数(如多项式)来拟合背景;有的程序(如Fullprof)也可以通过手工选定若干背景点,程序再根据这些选定的背景点拟合出整个背景。
一开始精修不知道背景参数,可以先精修少数背景参数,且设它们的初值为零。
背景比较平整的数据,可以估计出背景函数中常数项的大概数值人工输入。
(3)如何进行两相或多相精修?两相精修中含量较少的相因为衍射强度很低,造成统计误差大,很容易发散。
所以最好减少少量相的精修参数个数。
先固定其它参数,只修标度因子等最主要的参数,然后逐步尝试精修其余的参数为好。
如在两相外,还发现有另外的杂相,要仔细进行物相分析确定另外的相,有时需要通过对其它组成相近、但杂相更多的样品进行物相分析来确定杂相(最可能)是哪些化合物。
(4)轻原子的含量和位置参数误差较大怎么办?有的原子如H、Li等的散射能力有限,用X射线方法也很难准确测定其含量。
可以考虑依靠其它方法准确测定单相样品中的Li含量,当然,也可以考虑使用中子衍射的方法。
(5)Fullprof中的原子占有率怎么算?Fullprof中的原子占有率定义是该原子所占的特殊等效点位置个数除以一般等效点系位置个数,所以特殊等效点系的占有率都是小于1的。
以下是程序手册中的英文原文:the correct occupation numbers in the crystallographic part (=multiplicity of special position/general multiplicity)。
(6)Rietveld精修可以使用哪些软件?Rieteld精修软件现在可以在网上免费下载的就有很多种,常用的是GSAS、Fullprof、Rietan2000等。
这些程序的功能都大同小异,它们的优缺点和差别不能在此处一一列举。
你可以根据自己的喜好进行选择。
(7)精修后Rwp多少为合适?一般Rietveld精修程序中都用最小二乘法求算Rwp的极小值,其余的量都是根据相关定义按照公式计算(梁敬魁的粉末衍射法测定晶体结构一书下册798页有各种R因子的定义)。
一般Rwp要修到10%左右,没有很绝对的界限。
15%以下可以接受,10%以下就不错,越小越好。
一般认为Rwp算到接近Rep就很好了(一般都是Rwp略大于Rep)。
4实例分析(1)晶体结构精修本文以硕士期间所在课题组-中国地质大学(北京)晶体结构实验室李国武教授精修的新矿物罗布莎矿为例进行简要说明。
罗布莎矿物产于西藏雅鲁藏布江蛇绿岩带的罗布莎豆荚状铬铁矿床中,该矿床含有丰富的地幔矿物群,因此一直倍受地质学者的关注。
由于人工挑选出来的样品量极少,因此采用传统的广角X射线粉末衍射仪几乎不可能获得合格的粉末衍射图谱进行物相分析,嵌晶集合体也无法进行单晶衍射分析。
图2 罗布莎粉晶衍射图研究利用SMART APEX-CCD单晶衍射 (M o, Kα, λ=0.071073nm)上开发的单晶德拜衍射新方法解决了微量矿物的X射线粉晶衍射数据收集问题。
粉晶衍射结果显示罗布莎矿与人工合成的β相FeSi2(ICDD71-642)衍射图谱基本相同,但天然成因的β相硅铁合金为首次在自然界中发现。
因为无法获得单晶衍射数据,因此利用微量衍射方法得到的粉晶衍射数据和Rietveld 全谱拟合方法精修。
图3 罗布莎矿精修结果图使用PowderCell for Windows V2.4,初始结构模型引用了人工合成的β相FeSi2,在精修过程中,选用Pseudo-Voigt峰形函数,共精修了包括点阵常数、背底函数、半峰宽、择优取向因子、原子坐标、占位度等37个参数。
精修结果R p = 5.35%, R wp = 6.90%, R exp = 0.23. 经精修后得到的晶胞参数为a =0.98362 nm,b =0.78301nm,c =0.78655 nm,z =16。
原子在bc平面方向呈层状分布,Si 堆积层较紧密,而Fe堆积层存在空隙,相对于α相的FeSi2,罗布沙矿的晶体结构中存在较多的空隙。
这种空隙表现为: 电子探针分析结果显示Fe 成分不足,其分子式可以写作Fe0. 82Si2。
为了研究Fe的占位问题,结构精修中完全放开了Fe的占位度。
精修结果表明:Fe 的占位主要表现在Fe2 的位置上,Fe1 位置的占位度在整个精修过程中几乎没有任何变化,Fe2 占位度的多少对(200)(002)(112)等衍射峰的强度影响最大,在占位度为1 时,理论衍射峰的强度较大,与实测衍射峰强度比可达50 %,随着占位度的降低,该衍射峰的强度拟合到较理想的水平,表明结构中Fe的占位不足只表现在Fe2 位置上。
最后罗布莎矿得到国际新矿物和新矿物命名委员会批准,经投票同意为新矿物的为23票,0票反对或弃权,新矿物编号:2005~052a。
图4 罗布莎矿晶体结构图(a. 球棍图,沿ac平面;b. 多面体结构图,沿ac平面)(2)物相定量分析Rietveld物相定量分析(RQPA)的基本理论与传统的定量方法(K值法和绝热法等)是一致的,所不同的是RQPA使用的不是少数的几个衍射峰,而是采用了整个衍射图谱数据。
这样做的好处有,很好的解决了衍射峰叠加问题,减弱了择优取向,无需纯标样,同时还进行了零点校正、样品偏心校正、择优取向校正等,因此具有较高的精确度。
美国科学家Bish在这方面做了大量的工作,他曾采用Al2O3、SiO2、Cr2O3以及硅粉配制出系列混合物,用来检查RQPA的准确度和精密度。
从表2和表3可以看出,未加入硅标RQPA结果与理论值具有很好的一致性,绝对误差小于1%,而加入硅内标误差大部分在3%以内,这有可能是与加入的硅粉颗粒较大,产生了初级消光以及择优取向有关。
XRD定量分析长期一直只能达到半定量的效果,Moore和Reynolds(XRD定量分析大牛)认为XRD进行定量分析,主要成分含量误差在±10%以内,含量少于20%的成分误差在±20%,都可以认为分析结果良好。
从这一点可以看出RQPA定量分析是具有较高的精确度的,但需要强调的是认真制样是基础,分析经验是关键。
目前,RQPA在水泥、陶瓷、纳米材料、金属材料、土壤、岩石、矿石、尾砂、药物等物质的定量分析上都有了大量的应用。
围绕精确度的提高和评价、以及拓展新的应用领域是当前研究的热点,相信RQPA会为XRD定量分析带来一个质的跳跃。