刺客信条系列剧情
刺客信条兄弟会剧情攻略
多玩《刺客信条：兄弟会》中文网|游戏讨论区作者：Xbox Life /Darker剧情攻略指南：第一篇| 第二篇| 第三篇| 第四篇| 第五篇| 第六篇| 第七篇| 第八篇（完结）Sequence 1前情提要结束后，玩家／Desmond进入Ezio的一段记忆（Sequence 9），但内容异常混乱。
接下来，Ezio的记忆跳回1499年12月的梵蒂冈（《刺客信条2》的尾声），与“女神”Minerva于西斯汀教堂地窖的相遇。
Minerva留下了谜语般的一句话“接下来靠你了...Desmond”后便消失无踪，满腹狐疑的Ezio步出地窖，发现先前倒地的教宗亚历山大六世／Rodrigo Borgia已逃之夭夭，他的权杖也自动封入地底。
这时Ezio的叔叔Mario正好赶来，待Ezio爬出地窖（按住Y键不放打开Eagle Vision 可看到攀爬点）后，两人一同离开梵蒂冈。
来到河畔，Ezio不知是否该把依甸残片之一的苹果丢入河里，犹豫许久后，Mario要Ezio先把苹果交给他，之后再处理。
两人回到Monteriggioni庄园（二代的基地），受到众人的欢迎。
Ezio的妹妹Claudia 出来迎接，并问起敌人的状况，Ezio要她召集阿萨辛的成员在今晚会面。
玩家在Monteriggioni 庄园里跟随地图上代表任务的惊叹号与导航点完成三个简单的事件（拾取东西并跟随NPC／骑马／使用大炮）、熟悉游戏的流程后，就能回到别墅门口，与Caterina Sponosa碰面并与阿萨辛同志会谈。
然而，会谈中众人对于Ezio留了Rodrigo Borgia一命皆感惊讶，马基维利（Niccolo Machiavelli）认为Ezio此举后患无穷，还因此而气冲冲地离去。
回到卧房，Ezio与Caterina一夜春宵，醒来时却发现庄园遭人突袭。
Ezio套上外衣就赶紧从炮击留下的缺口一跃而出，发现整座城池遭到Borgia一族的猛烈攻击。
Mario叔叔率兵从正门迎敌，Ezio则骑马朝城墙赶去，操作大炮阻挡敌人攻势、为镇民争取避难的时间。
刺客信条 故事
《刺客信条：兄弟会》故事背景紧接前作《刺客信条II》 ，酒保戴斯蒙德·迈尔斯（Desmond Miles）与其余三名现代刺客露西·斯提尔曼（Lucy Stillman）, 肖恩·黑斯廷斯（Shaun Hastings）瑞贝卡·科瑞尔 （Rebecca Crane）逃离跨国制药公司Abstergo（现代圣殿骑士团）的追击后到达意大利城市蒙特里久尼。以已荒废的Auditore庄园地下室作为新的藏身之所，Desmond再次使用基因记忆追溯机器“Animus 2.0”，再度进入其刺客祖先Ezio Auditore de Firenze的记忆。 1499年12月文艺复兴时期，40岁的Ezio于放弃刺杀教宗亚历山大六世Rodrigo Borgia（圣殿骑士团之首）后回到蒙特里久尼。1500年1月，教宗之子凯萨·波吉耳一天晚上领兵对城市发动攻击。凯萨于城破之时夺回Ezio伯父Mario Auditore保管之古代遗物“伊甸碎片”、将之枪杀及命士兵枪伤Ezio。Ezio负伤带领佣兵及家人逃走后独自前往意大利首都罗马，并发现波吉耳家族已几乎完全控制了整个罗马市，市区百业萧条，市民被剥削而生活困苦。以市内台伯河上的小岛台伯岛为基地，Ezio联结市内妓女、盗贼及佣兵势力，以及招揽反抗的市民加入其刺客兄弟会以解放在教宗势力控制下的罗马。于各方协助下，Ezio得知凯萨的财政由其兄长胡安·波古耳负责，而凯萨则欲借助法国瓦卢瓦公爵路易十二的军事力量以及发明家达芬奇之战争机器以征服意大利。 在把凯萨的财源和军队瓦解以及把达芬奇的战争机器毁灭后，Ezio于1503年潜进梵蒂冈圣天使城堡欲与教宗对质时得知“伊甸碎片”已落入教宗手上，而教宗因不满其子无穷的野心（包括对蒙特里久尼发动攻击）而对凯萨下毒。凯萨得知后把教宗杀死并到圣彼得大教堂夺回碎片但被Ezio先行夺得。同年12月教宗儒略二世即位并下令拘捕凯萨。1507年3月Ezio前往西班牙维亚纳并于围城战中与凯萨进行最后决斗，Ezio把凯萨击败后将其从城墙投下，最后把碎片藏在罗马斗兽场附近一密室内。 Desmond等四人于猜出密室密码后前往正进行工程的斗兽场，并从地下通道进入天坛圣母堂。在启动教堂内机关后Desmond四人成功进入位于教堂地底之朱诺神殿（也是伊甸碎片所在地），但在Desmond触及伊甸碎片一刻，被称为朱诺（Juno）的立体影像（与《刺客信条II》中出现的弥涅耳瓦（Minerva）同属远古时期“第一文明”种族）控制了其身体使其对Lucy腹部刺了一刀。 Desmond等人事迹将在后继刺客信条系列作品中继有叙述
刺客信条系列剧情
刚刚玩通启示录感慨很多我就不一部部说了给你一个大概的全局故事记住该系列主角不是艾吉奥不是阿泰尔而是戴斯蒙首先讲这个很神棍的世界观神：该游戏认为这些现代人们说的“神”其实是地球上的上一个文明很强大科技水准远远地高过了现代后来来了自然大灾难文明摧毁仅存活几万人这就是现代人类的“祖先”们后来他们的后代代代相传才把他们说成了“神”。
而他们用高科技留下种种信息给了这些刺客最后要传达给戴斯蒙还要注意骑士团与刺客因为目的所以他们是永远的敌对组织骑士团想用神器统治全人类而刺客信仰自由想解放人民在现代酒保戴斯蒙被一个组织抓走那就是圣殿骑士团他们是为了用记忆读取器读取其祖先的记忆来找到神器完成他们的邪恶的计划（统一全人类）而戴斯蒙是刺客组织老大的儿子（可是却没受过训练）在被抓的时候戴斯蒙认识了骑士团博士的助手露西（也是刺客组织的最终她帮助戴斯蒙）在骑士团里，戴斯蒙被迫进入记忆读取器里读取了阿泰尔的记忆这记忆角色的故事我就一起说了阿泰尔十字军东征时期的人是刺客中最强的弟子仅次于首领可是他自大是他曲解刺客教条使其在“所罗门”失败并失去了一位兄弟按教规他应该被剥夺官职且杀死的但首领给了他赎罪的机会让他找出叛徒并杀死圣殿骑士团的“九骑士”而他成功了聆听了他们的遗言后阿泰尔逐渐改变了自己作风并找到了以后的妻子后来因为神器“金苹果”夺去了首领的理智并且会杀死所有在场的人阿泰尔没有办法只好杀了他的师父其后他成为了首领。
在随后的四十几年之间他在金苹果上学了不少知识改变了刺客的生活方式发明装备有新式的双袖剑（即不用切手指的）轻而坚固的“阿泰尔铠甲”他训练两个儿子为刺客大儿子被叛徒杀死当他要找个说法时妻子反而被杀死。
于是带着儿子逃出了城他编写了自传和一些奇怪的圆环（其实是钥匙）后来传给尼克罗（波罗家族）他和中老年是的儿子来到布置好的地宫儿子以后来到意大利以奥迪托雷之名建立蒙特尼久庄园放入了“金苹果”后来阿泰尔把自己也关在里面了（因为他知道他为时不多了）享年92 岁只玩过第二部和兄弟会的一定会有疑问：那以后艾吉奥怎么有金苹果呢？难道有人会穿墙？不过不要惊讶因为金苹果其实有两个。
刺客信条叛变剧情
刺客信条叛变剧情《刺客信条：叛变》剧情简介《刺客信条：叛变》是由育碧公司开发并发行的一款动作冒险游戏，是刺客信条系列的第四部正统作品。
游戏于2012年10月30日在北美地区首次发售，并于短时间内赢得了全球玩家的热情追捧。
本作的剧情故事充满了刺激的行动、复杂的世界体系和角色发展，并为整个系列打下了扎实的基础。
故事背景设定在18世纪的美国革命时期，玩家将扮演主人公康纳·肯维，在这个充满混乱和权力争斗的时期进行探索和战斗。
康纳作为一名混血儿，在尼库拉瓦山脉的印第安部落长大，并汲取了刺客与印第安文化的智慧。
他的故事注定与弗朗西斯·马尔科姆乔治·西米斯、乔治华盛顿等历史人物产生冲突和牵连。
故事开始时，康纳是一名年轻的刺客实习生，他的村庄被来自欧洲的入侵者破坏。
为了复仇和拯救他的家族，康纳加入到了美国独立战争中，在旗帜鲜明的刺客和圣殿骑士之间展开了激烈的斗争。
在游戏中，玩家将参与多个关键事件，如波士顿茶叶事件、独立宣言和约克镇战役等历史大事，亲历历史的真实场景，并与历史人物展开对话和交互。
游戏中的刺客成员艾希·伊甸也会不时出现，他将为康纳提供帮助和指导。
除了主线剧情，游戏还提供了大量的支线任务和任务，以扩展游戏的可玩性和内容深度。
玩家可以在康纳的庄园建造和升级设施，建立自己的贸易帝国，探索庞大的开放世界地图，解锁新装备和技能。
康纳的叛变之旅不仅仅是一场战斗，也是一段寻找真相和自我成长的旅程。
在与众多政治家、暴徒和华盛顿等强大势力的战斗中，康纳逐渐明白了自己的使命和责任，并逐渐理解了刺客与圣殿骑士之间的复杂纷争。
《刺客信条：叛变》充满了紧张刺激的战斗和充满挑战的任务，同时也通过康纳的成长和变化，传达了关于自由、正义和责任的深刻思考。
同时，游戏还通过庞大的游戏世界、精美的画面和沉浸式的音乐营造了一个真实而令人惊叹的游戏体验。
总之，《刺客信条：叛变》不仅仅是一款游戏，更是一部扣人心弦的史诗故事。
刺客信条全系列顺序
刺客信条1→刺客信条2→刺客信条兄弟会→刺客信条启示录→刺客信条3→刺客信条解放→刺客信条4黑旗→刺客信条叛变→刺客信条大革命→刺客信条枭雄→刺客信条起源→刺客信条奥德赛。
刺客信条第一代的主角是阿泰尔，也是该系列的灵魂人物，往后的续作2代、兄弟会、启示录都和阿泰尔有一定联系，其他的自成一个故事。
2代的背景是1代300年后的文艺复兴时期，主角艾吉奥，是一个经历家族被背叛，父亲弟弟都死于非命的贵族青年，为了复仇而踏上了刺客的道路，同时渐渐揭露了传奇刺客阿泰尔留下的秘密，其中兄弟会、启示录的主角都是艾吉奥。
刺客信条3代剧情设定在1753年至1783年间的美国，主角是康纳，因为历史背景设定的原因会有很多名人出现，比如华盛顿等，主线还是圣殿骑士和刺客的斗争。
4代的主角是3代的爷爷爱德华，故事背景设定在1715年的加勒比海，叛变是4代的续作，不过主角是圣殿骑士谢伊，要知道刺客信条系列圣殿骑士是最大的反派，所以这部才叫叛变吗?
后面几部的剧情：
后面的几部都是自成一个故事的，主角分别是大革命的亚诺、枭雄的雅各·弗莱和伊薇·弗莱、起源的巴耶克。
其实刺客信条系列在玩家心中最经典的还是1、2、3代。
《刺客信条：枭雄》序列5主线剧情图文攻略
《刺客信条：枭雄》序列5主线剧情图⽂攻略 序列5-商业风险 处理完兰贝斯区的假镇痛药⽔问题，弗莱双胞胎开始注意到史塔瑞意图控制整个伦敦的交通⽹。
雅各布于是打算与史塔瑞的竞争对⼿珀尔‧艾德威接触，伊薇择则要依靠上次在肯威⼤宅的线索继续寻找圣物。
序列5-突发新闻 雅各布与伊薇再度拜访贝尔，并因此知道史塔瑞依然在利⽤他所掌物的媒体对⼤众散步错误讯息，甚⾄想出⾼价想买下贝尔建构的新闻社，逼得贝尔只能多开发些特殊武器来保护⾃⼰。
双胞胎提议要摧毁史塔瑞的电报机，但贝尔却觉得⾃⼰新开发的炸弹还有待效能测试。
这时两名暴徒帮的⽖⽛又上门来骚扰贝尔，就刚好成了新武器的实验品… 抵达屋顶 移动到⼆楼，从窗户移动到屋顶上，再前往指⽰的横柱上⽅ 等候贝尔的信号 以电击弹让恶棍触电 贝尔和暴徒帮会开始对话，玩家可以先瞄准好进⼊预备姿势。
虽然贝尔说等他提到⽔果的名字就可以丢出炸弹，但丢得太早将会导致失去同步，建议等左上⽅的指⽰改变后再掷出炸弹。
等候贝尔的信号 以电击弹让恶棍触电%{p a g e-b r e a k|序列5-商业风险、突发新闻（1）|p a g e-b r e a k}% 炸弹命中⽬标后，贝尔和两名恶棍会开始移动，玩家也需移动⾄能投掷炸弹的位置。
要注意移动时不要靠太近，避免被恶棍发现⽽导致失去同步。
这时玩家⾝上的电击弹应该已经⽤完了，可前往屋顶打开宝箱来进⾏补充。
等候贝尔的信号 以电击弹让恶棍触电 与前两次相同，等待指⽰改变后再扔出即可 歼灭恶棍 指⽰改变后就可冲上去歼灭敌⼈，由于受电击弹影响，两名敌⼈原则上没有任何威胁性 跟随贝尔 跟着贝尔回到⼤马路上 驾驶贝尔的马车 抵达电报站 再度使⽤贝尔的马车，跟随地图指⽰前往史塔瑞的电报站 歼灭恶棍 以电击弹让恶棍触电 电报站⼊⼜前守着两名暴徒帮成员，使⽤电击弹后就能直接冲上去刺杀 保护贝尔%{p a g e-b r e a k|序列5-突发新闻（2）|p a g e-b r e a k}% 贝尔会⾃⾏移动到电报站内部进⾏破坏，这时会有敌⼈从右上图右侧的⼊⼜侵⼊，由于贝尔相当脆弱，建议先⾏截击。
刺客信条：叛变全剧情流程图文攻略
刺客信条：叛变-全剧情流程图⽂攻略 《刺客信条：叛变》的故事发⽣在18世纪中叶七年战争时期，玩家除了在美洲⼤地上探索之外，还将到达北⼤西洋极地⽔域、阿帕拉契⼭脉荒野河⾕以及纽约。
游戏主⾓谢伊·派崔克·寇马可曾经是⼀名刺客，后来遭遇了兄弟会的背叛之后变成了⼀名“刺客猎⼈”，游戏的最终⽬标是摧毁刺客兄弟会。
海战系统在本作回归，《刺客教条：叛变》将衔接系列作品《刺客教条3》与《刺客教条4：⿊旗》迅速将玩家带⼊了康纳的记忆)。
也补完了《刺客教条4：⿊旗》中爱德华·肯威的后⽣以及海森的童年，同时构成完整的北美刺客传奇篇章以及衰落。
X B O X360⼿柄操作键位表 1：⼀般控制 S t a r t：暂停选单 B a c k：地图选单 2：地⾯控制 L(左摇杆)：移动 R(右摇杆)：摄影机视⾓ A：快速⾏⾛/跳跃/破除防御 B：互动/反击 X：刺杀/使⽤近战武器 Y：使⽤⼯具或远程武器 L(按下左摇杆)：鹰眼视觉 LT：⼿动瞄准 RT：奔跑/⼿动瞄准时射击 L B：装弹 R B：地点资讯⾯板 ⼗字键：物品栏 3：游泳控制 按住B：潜⽔ 按住L：鹰眼视觉 RT：快速游泳 ⼗字键：物品栏 4：船舰控制 A：加速/旅⾏速度 B：放慢 按住B：放开轮舵(船舰停⽌时)/登船(接近瘫痪的船舰) 按住X：蹲低闪避 按住Y：船后视⾓ 按住LT：⼿动瞄准 RT：射击(⼿动瞄准时) RT+视⾓在船左或右侧：发射侧舷炮 RT+视⾓朝船⾸：发射船头卡龙炮 RT+视⾓朝船后：放出燃油 按住L B：迫击炮 按住R B：发射转轮炮;射击时⽤R来瞄准 按住⼗字键：望远镜 5：现代控制 S t a r t：暂停选单 B a c k：A b s t e r g o E n t e r t a i n m e n t地图 L(左摇杆)：移动 R(右摇杆)：摄影机视⾓ A：打开/关闭平板电脑 B：与平板电脑互动 X：使⽤我的档案%{p a g e-b r e a k|简介&操作键位|p a g e-b r e a k}% 系统教程 1：⾼调与低调的概念 谢伊的动作有强度的区分，在默认情况下是低调⾏事的，低调⾏动使谢伊看起来毫不起眼，容易被社会所接受。
刺客信条系列剧情
刚刚玩通启示录感慨很多我就不一部部说了给你一个大概的全局故事记住该系列主角不是艾吉奥不是阿泰尔而是戴斯蒙首先讲这个很神棍的世界观神：该游戏认为这些现代人们说的“神”其实是地球上的上一个文明很强大科技水准远远地高过了现代后来来了自然大灾难文明摧毁仅存活几万人这就是现代人类的“祖先”们后来他们的后代代代相传才把他们说成了“神”。
而他们用高科技留下种种信息给了这些刺客最后要传达给戴斯蒙还要注意骑士团与刺客因为目的所以他们是永远的敌对组织骑士团想用神器统治全人类而刺客信仰自由想解放人民在现代酒保戴斯蒙被一个组织抓走那就是圣殿骑士团他们是为了用记忆读取器读取其祖先的记忆来找到神器完成他们的邪恶的计划（统一全人类）而戴斯蒙是刺客组织老大的儿子（可是却没受过训练）在被抓的时候戴斯蒙认识了骑士团博士的助手露西（也是刺客组织的最终她帮助戴斯蒙）在骑士团里，戴斯蒙被迫进入记忆读取器里读取了阿泰尔的记忆这记忆角色的故事我就一起说了阿泰尔十字军东征时期的人是刺客中最强的弟子仅次于首领可是他自大是他曲解刺客教条使其在“所罗门”失败并失去了一位兄弟按教规他应该被剥夺官职且杀死的但首领给了他赎罪的机会让他找出叛徒并杀死圣殿骑士团的“九骑士”而他成功了聆听了他们的遗言后阿泰尔逐渐改变了自己作风并找到了以后的妻子后来因为神器“金苹果”夺去了首领的理智并且会杀死所有在场的人阿泰尔没有办法只好杀了他的师父其后他成为了首领。
在随后的四十几年之间他在金苹果上学了不少知识改变了刺客的生活方式发明装备有新式的双袖剑（即不用切手指的）轻而坚固的“阿泰尔铠甲”他训练两个儿子为刺客大儿子被叛徒杀死当他要找个说法时妻子反而被杀死。
于是带着儿子逃出了城他编写了自传和一些奇怪的圆环（其实是钥匙）后来传给尼克罗（波罗家族）他和中老年是的儿子来到布置好的地宫儿子以后来到意大利以奥迪托雷之名建立蒙特尼久庄园放入了“金苹果”后来阿泰尔把自己也关在里面了（因为他知道他为时不多了）享年92岁只玩过第二部和兄弟会的一定会有疑问：那以后艾吉奥怎么有金苹果呢？难道有人会穿墙？不过不要惊讶因为金苹果其实有两个。
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而他们用高科技留下种种信息给了这些刺客最后要传达给戴斯蒙还要注意骑士团与刺客因为目的所以他们是永远的敌对组织骑士团想用神器统治全人类而刺客信仰自由想解放人民在现代酒保戴斯蒙被一个组织抓走那就是圣殿骑士团他们是为了用记忆读取器读取其祖先的记忆来找到神器完成他们的邪恶的计划（统一全人类）而戴斯蒙是刺客组织老大的儿子（可是却没受过训练）在被抓的时候戴斯蒙认识了骑士团博士的助手露西（也是刺客组织的最终她帮助戴斯蒙）在骑士团里，戴斯蒙被迫进入记忆读取器里读取了阿泰尔的记忆这记忆角色的故事我就一起说了阿泰尔十字军东征时期的人是刺客中最强的弟子仅次于首领可是他自大是他曲解刺客教条使其在“所罗门”失败并失去了一位兄弟按教规他应该被剥夺官职且杀死的但首领给了他赎罪的机会让他找出叛徒并杀死圣殿骑士团的“九骑士”而他成功了聆听了他们的遗言后阿泰尔逐渐改变了自己作风并找到了以后的妻子后来因为神器“金苹果”夺去了首领的理智并且会杀死所有在场的人阿泰尔没有办法只好杀了他的师父其后他成为了首领。
在随后的四十几年之间他在金苹果上学了不少知识改变了刺客的生活方式发明装备有新式的双袖剑（即不用切手指的）轻而坚固的“阿泰尔铠甲”他训练两个儿子为刺客大儿子被叛徒杀死当他要找个说法时妻子反而被杀死。
于是带着儿子逃出了城他编写了自传和一些奇怪的圆环（其实是钥匙）后来传给尼克罗（波罗家族）他和中老年是的儿子来到布置好的地宫儿子以后来到意大利以奥迪托雷之名建立蒙特尼久庄园放入了“金苹果”后来阿泰尔把自己也关在里面了（因为他知道他为时不多了）享年92岁只玩过第二部和兄弟会的一定会有疑问：那以后艾吉奥怎么有金苹果呢？难道有人会穿墙？不过不要惊讶因为金苹果其实有两个。
随着阿泰尔得到神器后该记忆结束转回戴斯蒙在露西的帮助下戴斯蒙逃了出来随露西来到临时的基地把他训练成刺客与查找金苹果的下落当然用新版的读取器这一次就是该系列最受人欢迎的角色—文艺复兴时期的艾吉奥.奥迪托雷从出生和青年17岁父亲（当时刺客老大）被出卖哥哥弟弟和父亲都死在了神殿骑士团的诡计下他在妓女老板宝拉（也是刺客）的帮助下带着妹妹与母亲来到了蒙特尼久庄园投靠叔叔马里奥（有名的雇佣兵兼刺客）接受训练刺杀了一个个圣殿骑士的阴谋团成员并找到金苹果在众多基友的引导与帮助下他成了刺客大师。
最终看到了世界的真相（关于神的那段）在生死关头放过了大反派阴谋的幕后老大——亚历山大六世教皇（罗德里苟.波奇亚）此时，戴斯蒙醒来学会了艾吉奥的技术打败了发现他们的骑士团随后他们来到蒙特尼久庄园继续工作转到艾吉奥（这段时间戴斯蒙眼睛已经出现了幻觉玩游戏玩多了。
）教皇之子泽希尔.波奇亚领兵冲破蒙特尼久枪杀马里奥艾吉奥受了重伤骑马奔向罗马以对抗骑士团在罗马他联合了三大势力打击了骑士团逼得泽希尔现身最后在一场有名的战争中终于杀了他他把财产全部分给了好友达芬奇藏好金苹果后只身前往奥古斯丁需求启示。
戴斯蒙和露西一行人来到了艾吉奥藏金苹果的地方找到了它但是戴斯蒙却被控制杀死了露西自己也进入昏迷其实自己的精神留在了读取器里只有继续着艾吉奥的记忆才可以修复记忆回到现实来。
在奥古斯丁帮助了未来的国王成功抗争骑士团后艾吉奥随着阿泰尔的影子与记忆在未来妻子索菲亚的帮助下他最终得到前面说的阿泰尔的自传书和钥匙打开了地宫密室发现了另一个金苹果看到了“雅典娜”留下的话他想通了自已其实只是一个“承上启下的管子”他便和像个几个世纪的后代戴斯蒙对话。
（启示录中艾吉奥的内容结束，以下是动画《余烬》披露的）他与索菲亚结婚生了个女儿在佛伦萨当农民过上了平凡而快乐的日子可是不久后死在了家乡佛伦萨。
戴斯蒙完成了记忆修复并与宙斯交谈了解这些事情的意义戴斯蒙醒来见到了他的爸爸，并说“我知道现在我们需要升么了。
”这就是说还有下一部并为下一部留下了伏笔看最后的结局等3代出来剧情补完刺客秘闻第一作故事纵览在《刺客信条》的世界中，圣殿骑士（Templars）和刺客一族（Assassin's Brotherhood）之间的战争随着人类历史的推进一直持续着，圣殿骑士寻找一种剥夺人类自由的方法，而刺客则努力阻止他的阴谋。
故事一直由两条线平行发展，其一，也就是从2012年开始，现代的圣殿骑士重建了Abstergo实验室（拉丁语意为肃清），这个高科技组织研制了一种名为Animus（拉丁语意为灵魂）的机器，通过它可以让生命体经历蕴藏在自己DNA中的祖先的记忆。
但是Animus无法直接采集所有的记忆，必须让生命体在记忆中生活数日，以现实的时间经历过那些重要的记忆片段才可以采集信息。
Desmond表面是个酒吧酒保，其实他是现代的刺客，不过他于16岁逃离了刺客的秘密训练场所，试图过一种隐居的生活，于是他远离一切科技，一直以来他隐藏的很好，直到他犯了一次错误——获得摩托车执照，这让他的照片和指纹传出，被Abstergo的首领Vidic在女科学家Lucy Stillman的帮助下通过了Animus回到Desmond的DNA中阿泰尔（Aitair，刺客）的年代，通过收集信息寻找可以控制人类精神的伊甸碎片的下落，最终的目的是通过一颗卫星将伊甸碎片的效果传到全世界的每一个角落，从而达到控制人类的目的。
数日的试验中，Desmond了解了更多事实，Lucy向Desmond透露自己也是一名刺客，她被派遣来渗入到现代圣堂武士之中。
通过采集Desmond记忆中的阿泰尔刺杀Al Mualim的信息，圣堂武士得到了伊甸碎片的位置，并找到了另外6个拥有刺客祖先记忆的男性，Vidic认为Desmond没有用途了，决定处死他，而Lucy及时说服了Vidic，两人离开Desmond。
Desmond看着两人的背影，因为Bleeding Effect（祖先的记忆融入生命体的身体中），他体内的潜能被激活，发动了鹰眼，Vidic是红色的敌人，Lucy是蓝色的友人，同时他看到了墙壁和天花板上都印满了奇特的文字，下面就是《刺客信条2》的故事了。
第一文明《刺客信条2》结局全息影像中女人Minerva是第一文明（First Civilization）的最后一名生存者，她身上肩负着巨大的使命。
可以确定的是，她很早以前便已死亡，即使是在Ezio生活的年代。
Minerva还以更多的身份存在过，可以得知的是，人类所信奉的神和女神，都是第一文明的成员。
Minerva通过Ezio直接对Desmond讲话，因为第一文明可以预知未来（perceive time "differently"——通过“不一样”的方法认识时间），他知道刺客和圣殿会重新研发第一文明的科技——Animus就是如此研发出来的，她知道Desmond一定会通过Ezio看到这段全息影像，而Ezio也就是剧情中所说的“先知”了。
Minerva警示地球会遇到最终的浩劫，数千年前也曾发生过同样的浩劫——摧毁第一文明。
她说第一文明现在已经找到了一种阻止浩劫发生的方法，他们即将完成的成果隐藏在世界各地的秘密地点（Vault），Desmond和现代的刺客一族要找到它们，完成它们研究成果。
而浩劫到底是什么还有待进一步考察，一种解释是16号研究对象留下的“实情”（请看后文），另一种解释是Lucy诉说的地磁反转（Geomagnetic Revesal），其中谈到的太阳耀斑指日冕物质抛射（Coeonal Mass Ejections，简称CMEs），是可以摧毁所有生命的射线。
圣殿骑士的真实企图从Al Mualim到Rodrigo Borgia，再到现在的Abstergo，他们的目标非常明确：寻找伊甸碎片，找到第一文明，毁灭它们，取得他们的科技，控制所有人，消灭所有不是控制的人，借此获得世界范围的和平和安全。
但是这种和平是否是人类所向往的呢？16号研究对象16号研究对象（SUBJECT 16）是Abstergo在Desmond之前的研究对象，Lucy说他因为Animus的Bleeding Effect最终让他结束了自己的生命。
不过在其生命的最后阶段，他用自己的鲜血在Abstergo实验室的各个角落涂上了很多符号和信息。
在Desmond来之前，Abstergo的人已经将所有血迹都擦掉了，但是有了鹰眼能力的Desmond能看到这些曾经存在过的印记，在前作中玩家可以在实验室内查看它们，第二作开始时玩家也会看到自己卧室中（应该也是16号的卧室）的密集符号，其中，前作中的英文需要从右下角开始一列列反向读取。
16号通过这些信息诉说了他所知的实情，包括2012年12月21日的大毁灭（哈哈，电影2012！），可能就是圣殿骑士将伊甸碎片通过卫星发射升天控制人类的计划日。
16号留下的视频我们能在城市的角落里发现20个隐秘的象形文字（Glyph），破解它们后可以得到几秒钟的视频，20个连起来成一整段视频（SUBJECT 16'S THE TRUTH VIDED）。
它们是16号在精神彻底崩溃前在实验室离开房间时通过骇客Animus试验台留下的，他假想Lucy会在离开时带走记忆核心（Core）并安装到新的Animus试验台（新作中的Animus2.0）中。
其实，这并非一段视频，而是一段记忆，影像中的两人非常明显的是亚当和夏娃，而16号应该就是亚当的后裔，因此才能从DNA中得到这段影像。
亚当和夏娃偷出伊甸碎片——金苹果，这是Minerva描述的“人类的第一次反抗”。
金苹果是第一文明的产物，当人类意识到金苹果的超高科技，人类的“清白”便就此消失，“两个物种”间的战争——第一文明和人类——开始了。
为什么“金苹果”可以用来控制人类？伊甸碎片——金苹果，法杖是第一文明向人类拖力的工具，到底是他们创造出伊甸碎片来控制人类，还是他们在创造人类时就将人类设定成被伊甸碎片控制已经不是问题的关键。
尽管如此，我们知道有一些人可以抗拒这种控制力。
在解开16号留下的20个谜题时，我们得知人类历史上的著名人物和关键事件都是受到伊甸碎片影响的，是伊甸碎片促成了很多事情的发生。
第一文明的后裔？通过16号的视频，我们可以看到亚当和夏娃的敏捷身手，由此我们能联想到什么？16号研究对象的第14号谜题中这样写道：The seeds were planted at two worlds became one.Behold,the assassins,the chidren of two worlds!（两个世界合二为一时种子被种下。