微生物的分类
生物小课堂微生物分为哪三型八大类(一)2024
生物小课堂微生物分为哪三型八大类（一）引言概述：微生物是一类非常特殊且重要的生物，它们广泛存在于我们周围的环境中，对环境和生态系统起着重要的作用。
微生物可以分为三型八大类，每一类都具有独特的特征和功能。
本文将详细介绍微生物的分类及各个分类的特点。
正文：一、原核细菌（细菌）类1. 革兰氏阳性菌- 特点：细胞壁由厚重的革兰氏阳性结构构成，呈紫色或深蓝色。
- 代表性菌种：葡萄球菌、链球菌等。
2. 革兰氏阴性菌- 特点：细胞壁较薄，显示为红色或粉红色。
- 代表性菌种：大肠杆菌、沙门氏菌等。
3. 放线菌- 特点：具有复杂的分支结构，形态类似细胞链。
- 代表性菌种：链霉菌、产霉菌等。
4. 厌氧菌- 特点：在无氧环境下生长繁殖。
- 代表性菌种：产气荚膜梭菌、泰特菌等。
5. 细菌类囊体病毒- 特点：是一种寄生在细菌上的病毒。
- 代表性病毒：噬菌体、灵芝病毒等。
二、酵母菌类1. 酿酒酵母- 特点：产酒精和二氧化碳，广泛应用于酿酒业。
- 代表性菌种：啤酒酵母、葡萄酒酵母等。
2. 乳酸菌- 特点：产生乳酸，对食品发酵和保质期起着重要作用。
- 代表性菌种：乳酸杆菌、乳酸链球菌等。
3. 青霉菌- 特点：可以产生青霉素等抗生素。
- 代表性菌种：青霉菌、黄曲霉菌等。
4. 酵母菌- 特点：广泛存在于自然环境中，参与食物发酵。
- 代表性菌种：面包酵母、快速酵母等。
5. 黏质菌- 特点：具有黏稠的胞质，通过孢子状体传播。
- 代表性菌种：纤维黏菌、皮黏菌等。
三、真菌类1. 子囊菌- 特点：子囊菌的孢子壁形成一个囊囊，胞子形成在囊内。
- 代表性菌种：小麦赤霉菌、秋季菌等。
2. 担子菌- 特点：担子菌的孢子形成在担子上，通过风吹散播。
- 代表性菌种：蘑菇、鸡腿菌等。
3. 无性菌- 特点：无性菌无性繁殖，没有真正的孢子形成。
- 代表性菌种：黑曲霉、霉菌等。
4. 梭菌- 特点：形状呈梭状，广泛存在于自然环境中。
- 代表性菌种：枯草芽孢杆菌、肠炎梭菌等。
微生物的分类
型（Type）：亚种以下的细分。当同种或同亚
种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚 种时，可细分为不同的型。如血清型、噬菌型、 致病型、生物型、形态型等。
菌株（Strain）：从自然界中分离得到的任何
一种微生物的纯培养物。又叫品系。 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体
培养物：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物，如 微生物的斜面培养物、摇瓶培养物。
群（Group）：
指微生物的一个种在生长繁殖过程中，可 能变异形成另外的种及一些过渡类型的变 种，把这些亲缘关系比较近的菌种，统称 为群。如大肠菌群。
属（Genus）：
具有某些共同特征或密切相关的种归为一 个高一级的分类单元，称之属。以此类推 归为科、目、纲、门、界。
由于微生物分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一
GC% 、核酸分子杂交、 rRNA序列相似 DNA遗传特征 性、微生物全基因组序列
（1） GC含量分析
DNA碱基对的序列、数量和比例是稳定的。 (G+C) mol% = （G+C）/（A+T+ G+C ）× 100% 分类学上，用G+C占全部碱基的克分子百分数来表 示各类生物的DNA碱基组成特征。
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
葡萄球菌属 金黄色 人名 时间
（3）三名法
有亚种或变种时，学名由“三名法”构成 学名=属名 + 种名加词 + subsp. 或 var. + 亚种或变种的加词 斜 体 正体（可省略） 斜体（不可省略）
Alcaligenes
属名
denitrificans
标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成 的混乱，微生物系统分类也采用“模式概念”
《微生物学》微生物的分类
PART THREE
第三节 微生物分类单元与分类等级
PART THREE 微生物分类单元与分类等级
分类单元（taxa）是指具体的分类群，如细菌域（Bacteira）、放
1 线菌目（Actinomycetales）、红球菌属（Rhodococcus）等就分 别代表一个分类单元。
分类等级，按照域(domain)、界(kingdom)、门(division/phylum)、
PART FIVE 原核微生物的分类
图5-2 BIOLOG GenⅢ鉴定板 （关统伟，2016） a, 实验内容；b，结果判读
PART FIVE 原核微生物的分类
图5-3 BIOLOG鉴定系统操作过程 （关统伟，2016）
PART FIVE 原核微生物的分类
二、 化学分类
细胞脂肪酸 组分测定
全细胞水解 糖组分分析
PART FOUR 微生物的命名
二、 三名法
• 当 某 一 种 微 生 物 是 一 个 亚 种 (subspecies, “subsp”) ， 或 是 一 个 变 种 (variety, “var”，亚种的同义词)时，使用三名法。
• 三名法(trinominal nomenclature)命名的学名原则：
PART FIVE 原核微生物的分类
a.
b.
API Staph细菌鉴定系统
c.
图5-1 API Staph鉴定试条 （关统伟，2016） a. 实验内容；b，操作步骤；c，结果判读
PART FIVE 原核微生物的分类
Biolog全自动微生物鉴定系统
Biolog全自动微生物鉴定系统是美国安普科技中心（ATC US）研发的一套 系统。此系统适用于动、植物检疫，临床和兽医的检验、食品、饮水卫生的 监控，药物生产，环境保护，发酵过程控制，生物工程研究，以及土壤学、 生态学和其它研究工作等。此系统的商品化，开创了细菌鉴定史上新的一页。 特点是自动化、快速（4 ~ 24h）、高效和应用范围广。
简述我国病原微生物分类情况
简述我国病原微生物分类情况我国病原微生物按照不同的分类方法可以分为多个大类，包括细菌、病毒、真菌、寄生虫和原生动物等。
下面将对每种分类进行详细介绍。
1.细菌：细菌是一类微小的单细胞生物，可以存在于自然界的空气、水、土壤、植物和动物体内等各种环境中。
它们可以被分为五个主要类别：革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、厚壁菌、拟杆菌和放线菌。
在我国，一些常见的病原细菌包括大肠杆菌、沙门氏菌、鼠疫杆菌等，它们可以引起人们常见的细菌性疾病，如肺炎、腹泻等。
2.病毒：病毒是一种非细胞的微生物，只能寄生于细胞内进行繁殖。
根据病毒的核酸类型，病毒可以分为RNA病毒和DNA病毒两大类。
在我国，常见的病毒有流感病毒、乙肝病毒、艾滋病病毒等，它们可以引起人们各种呼吸道、消化道、性传播等疾病。
3.真菌：真菌是一类真核微生物，广泛存在于空气、土壤和水中。
根据真菌的生活形态，真菌可以分为酵母菌和菌丝菌两大类。
在我国，常见的病原真菌包括白色念珠菌、皮肤癣菌等，它们可以引起人们的真菌感染，如白色念珠菌感染和皮肤癣等。
4.寄生虫：寄生虫是一类依靠其他生物寄生而生活的生物。
它们可以寄生在人体的不同器官中，如肠道、肝脏、血液等。
在我国，一些常见的病原寄生虫包括蛔虫、钩虫、血吸虫等，它们可以引起人们的寄生虫病，如蛔虫病、钩虫病和血吸虫病等。
5.原生动物：原生动物是一类单细胞的生物，广泛存在于自然界的水体和土壤中。
根据原生动物的生活方式和细胞结构，原生动物可以分为滑动型和胞内型两大类。
在我国，一些常见的病原原生动物包括阿米巴原虫、银屑病虫等，它们可以引起人们的原虫病。
总体而言，我国的病原微生物种类繁多，包含细菌、病毒、真菌、寄生虫和原生动物等。
这些病原微生物可以通过不同的途径侵入人体，并引起各种不同的感染和疾病。
因此，在预防和控制疾病的过程中，对病原微生物的分类和了解是非常重要的。
微生物分类
原生动物（Protozoan ）是原生生物界中较为接近动物的一类真核单细胞生物青霉 黑曲霉生物的分类一、微生物分类1、无细胞结构的生物：--------病毒（主要由蛋白质和核酸组成）①病毒②亚病毒：类病毒、拟病毒、朊病毒（特点：与病毒相比结构不完整，仅由核酸或者蛋白质构成生命体，如引起疯牛病的阮病毒就是蛋白质构成的机体）按照宿主细胞将病毒分类：①动物病毒： RNA类（SARS病毒、禽流感病毒、H1N1、腮腺炎病毒、流感病毒、艾滋病病毒、口蹄疫病毒、脑膜炎病毒、脊髓灰质炎病毒、狂犬病毒、麻疹病毒、）DNA类（痘病毒、腺病毒、疱疹病毒、虹彩病毒、乙肝病毒）②植物病毒：RNA类（烟草花叶病毒、马铃薯X病毒、黄瓜花叶病毒、大麦黄化病毒等）③细菌病毒：噬菌体（DNA）2、有细胞结构的生物：<1>真核生物：①动物：高等动物（人等）；低等动物：疟原虫、变形虫、草履虫等②植物：高等植物（玉米等）；低等植物：黑藻、团藻、小球藻、水绵等③真菌 a、酵母菌；b、霉菌（毛霉、根霉、曲霉、青霉、赤霉菌、白僵菌、脉胞菌、木霉等）c、食用菌：（香菌、蘑菇、平菇、金针菇等<2>原核生物：（具细胞结构，但细胞内无核膜和核仁的分化，也无复杂的细胞器）①细菌：名字中含有杆、酸、球、螺、线、弧等的细菌）②蓝藻（包括蓝球藻、颤藻、念珠藻、鱼腥藻）③支原体、衣原体、立细菌克次氏体、螺旋体。
3、高中三本书中所涉及的所有细菌的种类：《代谢类型》：乳酸菌、硝化细菌、红螺菌、光合细菌、铁细菌、硫细菌、《遗传的物质基础》：肺炎双球菌S型、R；《免疫》: 结核杆菌、麻风杆菌、酿浓球菌、结核杆菌《生物固氮》: 根瘤菌、圆褐固氮菌；反硝化细菌（氮循环）《基因工程》: 大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌（为提供运载体，也可作为基因工程的受体细胞）；苏云金芽孢杆菌（为抗虫棉提供抗虫基因）；假单孢杆菌（分解石油的超级细菌）《微生物》: 甲基营养细菌、谷氨酸棒状杆菌、黄色短杆菌、链球菌（一般厌氧型）；产甲烷杆菌（严格厌氧型）、放线菌、金黄色葡萄球菌其他常考细菌：绿脓杆菌、猪链球菌、乳酸菌、炭疽芽胞杆菌、破伤风杆菌、大肠杆菌灭菌：指杀死一定环境中所有微生物的细胞、芽孢和孢子。
微生物的分类与鉴定
高通量鉴定技术的展望
01 基因测序技术
高通量测序技术能够快速获取微生物全基因组信 息，为微生物分类与鉴定提供了新的手段。
02 自动化鉴定系统
开发自动化鉴定系统，能够快速、准确地鉴定大 量微生物样本，提高鉴定效率。
03 标准化与数据库建设
建立标准化的微生物分类与鉴定数据库，为高通 量鉴定技术的广泛应用提供支持。
THANKS
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微生物的分类与鉴定
汇报人：
202X-12-24
目录
• 微生物的分类 • 微生物的鉴定方法 • 微生物的鉴定技术 • 微生物鉴定的应用 • 微生物分类与鉴定的挑战与展望
01
微生物的分类
细菌
革兰氏阳性菌
具有厚重的细胞壁，对青霉素敏感。
厌氧菌
在缺氧环境中生长繁殖。
革兰氏阴性菌
具有较薄的细胞壁，对青霉素不敏感。
详细描述
分子生物学鉴定是通过分析微生物的基因序列、蛋白质表达等分子特征来进行分类和鉴定的方法。这种方法具有 很高的准确性和灵敏度，可以用于鉴定难以通过形态和生理生化特征鉴别的微生物。例如，PCR技术和基因测序 技术可以用于检测和鉴定特定的微生物。
03
微生物的鉴定技术
基因测序技术
基因测序技术是利用现代生物技术对微生物基因组进行 测序，通过比对已知基因库，确定微生物的种属和基因 型。
微生物分类与鉴定的挑战与
05
展望
微生物多样性的挑战
微生物种类繁多
微生物种类数量庞大，形态多样，给分类与鉴定带来很大挑战。
鉴定方法有限
传统的微生物鉴定方法依赖于形态、生理生化特征等，对于某些特 殊或稀有微生物可能难以准确鉴定。
微生物生态学研究需求
微生物分类与特征
微生物分类与特征微生物是一类直径小于0.1毫米的生物体，包括细菌、真菌和病毒等。
它们广泛存在于自然环境中，如土壤、水体、空气甚至人体内部，对生态环境和人类健康发挥着重要的作用。
微生物的分类主要包括形态分类、生理分类和遗传分类等，下面将详细介绍微生物的分类与特征。
一、细菌细菌是一类无细胞核的原核生物，形态多样，可根据细胞形态和结构进行分类。
按细胞形态可分为球菌、杆菌和螺旋菌等。
1.1球菌球菌是一类呈球状的细菌，如葡萄球菌、链球菌等。
球菌的特点是细胞形态规则，细胞分裂后常以群体形式存在于空气、水体和地表等环境中。
1.2杆菌杆菌是一类形态为细长杆状的细菌，如大肠杆菌、炭疽杆菌等。
杆菌的特点是细胞大小均匀，可进行旋转运动，广泛存在于土壤和水体等环境中。
1.3螺旋菌螺旋菌是一类形态为螺旋状的细菌，如螺旋体、珠螺菌等。
螺旋菌的特点是细胞弯曲呈螺旋形，可进行蠕动运动，多分布于水体和土壤等环境中。
除了形态分类，细菌还可根据生理特征进行分类，如革兰氏染色反应、需氧性等。
革兰氏染色反应可将细菌分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌，主要根据菌体结构的差异进行区分。
需氧性可将细菌分为需氧菌、厌氧菌和嗜氧菌等，主要根据细菌对氧气需求的多少进行区分。
二、真菌真菌是一类多细胞有细胞核的生物体，如霉菌、酵母菌等。
真菌的特点是具有菌丝体结构，可通过孢子繁殖。
2.1霉菌霉菌是一类多支链菌丝构成的真菌，如黑曲霉、白曲霉等。
霉菌的特点是菌丝体生长迅速，可以分泌大量酶类，广泛存在于土壤和植物体表面等环境中。
2.2酵母菌酵母菌是一类单细胞真菌，是由一个或多个细胞组成的。
酵母菌的特点是细胞独立，可进行有性和无性繁殖，广泛存在于空气和发酵食品等环境中。
三、病毒病毒是一类具有遗传物质但无完整细胞结构的微生物，只能寄生于其他细胞内进行繁殖。
病毒的特点是核酸核心和蛋白质外壳，寄生于宿主细胞内进行复制。
病毒可依据它们的核酸类型来分类，主要有DNA病毒和RNA病毒两大类，这主要取决于病毒遗传物质的类型。
微生物的分类方法
微生物的分类方法微生物是指肉眼无法看到的微小生物，主要包括原核生物和真核生物两大类。
原核生物主要包括细菌和蓝藻，真核生物则包括真菌、原生动物和微藻等。
对于微生物的分类，科学家们采用了多种方法，其中最常用的是基于形态学、生理学、生态学和分子生物学的分类方法。
下面将介绍这些分类方法的主要内容。
1.形态学分类：这是最早也是最基础的分类方法，主要根据微生物的形态特征进行分类。
例如，根据细菌的形状，可以将其分为球形细菌（如链球菌）、杆状细菌（如大肠杆菌）和螺旋细菌（如梅毒螺旋体）等。
此外，还可以根据真核微生物的细胞结构和生殖特征进行分类。
3.生态学分类：这种分类方法是根据微生物在自然界中的生活习性和分布情况进行分类。
例如，根据微生物生活的环境，可以将其分为土壤微生物（如放线菌）、水体微生物（如蓝藻）和肠道微生物（如乳酸菌）等。
此外，还可以根据微生物在生态系统中的作用，将其分为分解者、产生者和共生微生物等。
4.分子生物学分类：这种分类方法是根据微生物的基因组序列和分子结构进行分类。
利用分子生物学技术，可以通过测定微生物的DNA序列，比较不同微生物之间的遗传关系和相似性，从而将其分类到不同的系统发生树分支上。
此外，还可以利用分子标记的方法，如PCR和基因测序，快速鉴定微生物的种类。
除了以上分类方法外，还有一些更细致和专业的分类方法，比如对特定微生物群体进行研究的分类方法。
例如，对细菌进行分类可以使用质谱分析技术，对真菌进行分类可以使用菌株的生长特性和生殖结构等特征。
总的来说，微生物的分类方法是一个不断发展和完善的过程。
随着技术的进步和对微生物世界的深入了解，我们对微生物的分类将更加准确和精细，为微生物相关领域的研究和应用提供更好的支持。
微生物的分类方法
微生物的分类方法微生物是一类微小的生物体，包括细菌、真菌、原生动物和病毒等多种类型。
为了便于研究和分类微生物，科学家们使用了多种分类方法。
下面将介绍一些常见的微生物分类方法。
一、分类方法的发展概述微生物分类方法的发展可以追溯到17世纪的拉特内尔系统。
他通过观察和描述微生物的形态特征，将微生物分为三个大类：细菌、真菌和原生动物。
之后，人们发现微生物还包括病毒等特殊类型，为了更准确地分类微生物，不断有新的分类方法被提出。
基于形态特征的分类方法是最早也是最常用的分类方法之一、细菌可以根据形状（球形、杆状、螺旋形）、大小、颜色等特征进行分类。
真菌可以根据菌丝形态、子实体的形状、颜色等特征进行分类。
原生动物可以根据鞭毛、纤毛、假足、鳞片等结构特征进行分类。
这种方法的优势是直观、简单，但有时不够准确，因为不同种类的微生物可能存在相似的形态特征。
生物化学分类方法利用微生物在生化反应上的差异进行分类。
细菌可以根据其对不同营养源的利用能力、产气能力、氧需求、酶活性等生化特征进行分类。
真菌可以根据其对碳源和氮源的利用能力、酶的产生能力等生化特征进行分类。
利用生化方法可以确定微生物的代谢途径、生态位、对环境的适应能力等，有助于更深入地了解微生物的功能和特性。
随着遗传学的发展，基于遗传特征的分类方法被广泛应用于微生物分类。
该方法利用微生物的基因组DNA序列进行分类。
通过序列比对和构建系统发育树，可以确定不同微生物之间的亲缘关系和进化关系。
常用的是16SrRNA基因，这个基因片段在细菌和原生动物中普遍存在。
利用这一方法，可以准确地确定一些微生物属于哪个科、属和种。
利用微生物的免疫学特性进行分类也是一种常见的方法。
通过检测微生物产生的抗原和体液抗体的相互作用关系，可以将微生物分成不同的免疫血清型，进而进行分类。
这种方法被广泛应用于病原微生物的分类和诊断。
例如，人们常用血清学方法来鉴别细菌和病毒等病原微生物种类。
总结起来，微生物的分类方法有形态特征、生物化学特征、遗传特征和免疫学特征等。
简述微生物分类
简述微生物分类
微生物是一类微小的生物体，包括细菌、真菌、藻类和病毒等。
根据其形态、生活方式、代谢特点和遗传特征等不同方面，微生物可以被分类为以下几类：
1. 细菌（Bacteria）：细菌是一类单细胞的微生物，其形态多样，可以是球形、杆状、螺旋形等。
细菌具有细胞壁，其中一部分细菌有荚膜。
细菌可以根据它们的形态、染色性质、代谢特征和生活环境等进行分类。
2. 真菌（Fungi）：真菌是一类多细胞或单细胞的生物，包括了酵母菌和菌丝菌等。
真菌的细胞壁主要由纤维素构成，具有细胞核和细胞质。
真菌可以通过孢子传播，具有吸收性营养。
3. 藻类（Algae）：藻类是一类单细胞或多细胞的微生物，具有类似植物的特征，可以进行光合作用。
藻类可以根据其细胞结构和营养方式进行分类。
4. 病毒（Virus）：病毒是一类非细胞结构的微生物，具有遗传物质（DNA或RNA）包裹在蛋白质的壳中。
病毒依赖于宿主细胞进行复制，感染宿主并引起疾病。
此外，还有其他一些微生物的分类，如原生动物、古菌等。
这些微生物根据其形态、生活方式和遗传特征等不同特点而被归为不同的类别。
微生物分类的研究有助于了解微生物的特征和功能，进而对其进行研究和利用。
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Bacillus subtilis（Ehrenberg）Cohn 1872
由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，
细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”
种和亚种指定模式菌株（type strain）； 亚属和属指定模式种（type species）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）； 模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。
第二节 微生物在生物界的地位
一、生物的界级分类学说
两界系统
三界系统
四界系统
五界系统
六界系统
二、三域学说及其发展
选用16SrRNA进行研究的主要原因是：
1.16SrRNA普遍存在于原核生物和真核生物细胞中， 故可用以比较它们在进化上的相互联系； 2.16SrRNA有重要且恒定的生理功能； 3.在细胞中含有较大量的易于提取的rRNA； 4.rRNA的基因在细胞中不像质粒DNA那样会转移，而 是稳定的；
微生物分类学（microbial taxonomy） 是一门按微生物的亲缘关系把它们安排 成条理清楚的各种分类单元或分类群（ taxon）的科学
它的具体任务有三即 分类（classification） 鉴定（ification） 命名（nomenclature）
生物分类的二种基本原则：
a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种
古细菌(archaebacteria) 真细菌(Eubacteria) 真核生物(Eukaryotes)
系统分类单元、种的概念、学名、亚种
第二节 微生物在生物界的地位
生物界级分类学说、五界系统、三域学说及其发展、 ※微生物的进化
第三节 各大类微生物的分类系统纲要
原核微生物分类系统纲要、※真菌的分类系统纲要
第四节 微生物的鉴定
经典分类鉴定方法、现代分类鉴定方法。
第一节 通用分类单元
分类(classification)：根据一定的原则对微生物进行分群归类， 根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征 进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定； 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个 专有的名称；
4）种（species）： 物种，生物分类中基本的分类单元
高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准
微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其
他类群的菌株有很明显的区别。
二、微生物的命名
双名法，由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成，
一般用斜体表示
属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写
表型分类重在应用，不涉及生物进化或不以反映生 物亲缘关系为目标。 b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标 是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系 统发育的分类系统。
从进化论诞生以来，已经成生物学家普遍接受的分类原则 生物系统学(systematics)
章节内容
第一节 通用分类单元
3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同
亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以
细分为不同的型。
例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的 不同分为不同的噬菌型等 菌株与型的区别： 菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学
依据，
不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型 必需有分类学依据。
科（Family）
属（Genus）
种（Species）
常用的细菌分类学术语：
1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长
物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。
2）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯
培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法(如通过诱变 ) 所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌 株，以便与原来的菌株相区别。
5. 16SrRNA分子中的某些碱基顺序非常保守，以 致在30多亿年的进化中仍保持着原初的状态， 而不像另一些顺序那样变化很大，因此可用作 探索自古至今生物的主要进化历程；
6. 16SrRNA的分子量适中，在核糖体所含的三种 rRNA中，其核苷酸数分别约为2900、1540和 120个，其中的16SrRNA不但核苷酸数适中，而 且信息量较大且易于分析，故是理想的研究材 料。
种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写 若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp.来表示，
例如 Bacillus sp. spp. 复数
例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌） Escherichia coli（Migula）Castellani et Chalmers 1919 例2：枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌）
特征序列有助于迅速确定某种微生物的 分类归属，或建立新的分类单位。
3. 系统发育树(phylogenetic tree)
通过比较生物大分子序列差异的数值构
建的系统树称为分子系统树，其特点是用一
种树状分枝的图型来概括各种(类)生物之间
的亲缘关系。
1）生命的第三种形式——古生菌
动物界和植物界
原核生物和真核生物（20世纪60年代）
三、rRNA和系统发育树
1. rRNA的序列和进化
培养微生物
提取并纯化rRNA
rRNA序列测定
分析比较
微生物之间的系统发育关系
2. 特征序列或序列印记（signature sequence）
通过对r RNA全序列资料的分析比较（特别是 采用计算机）发现的在不同种群水平上的特 异特征性寡核苷酸序列，或在某些特定的序 列位点上出现的单碱基印记。
鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物
分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未 明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。
一、分类单元及其等级
界 （Kingdom） 门 （Phylum） 纲（Class） 目（Order） 根据Carl Woese的 理论，现在还在界 之上使用域(domain) （把全部生物先分为 古生菌域、细菌域和 真核生物域， 域下面再分界。）