质粒提取原理和方法
提取质粒的主要步骤原理

提取质粒的主要步骤原理提取质粒是一种分离和纯化质粒DNA的常见实验技术。
质粒是细菌细胞内环状的DNA分子,通常用于基因克隆、转化、表达和基因组编辑等研究。
下面将详细介绍质粒提取的主要步骤原理。
1. 细菌培养:首先,选择含有目标质粒的细菌菌株进行培养。
通常使用大肠杆菌等常用实验菌株。
将细菌接种到含有适当营养物质(如LB培养基)的培养物中,并在适当条件下培养,如37摄氏度、220 rpm振荡培养。
2. 收获细菌:将培养至适当生长期的细菌用离心机离心,收集菌体沉淀。
通常使用1500×g离心10分钟,得到一个细菌菌体的沉淀。
3. 质粒裂解:利用物理或化学方法将细菌菌体裂解,释放内部的质粒DNA。
物理方法包括超声波处理和冻融法,而化学方法则涉及使用碱性裂解液(如SDS 和NaOH)。
该步骤破坏了细胞壁和细胞膜,以及核酸酶等酶的活性。
4. 蛋白质沉淀:为了去除细菌染色体DNA和蛋白质,可通过蛋白质沉淀步骤使质粒DNA纯化。
一种常用的方法是加入混合溶液,其中包含非离子性洗涤剂(如SDS)和蛋白酶K。
SDS具有溶解细菌膜和蛋白质的作用,而蛋白酶K能够降解杂质蛋白质。
该反应可以在高温条件下进行,如50-60摄氏度,以增加SDS和蛋白酶K的活性。
5. DNA沉淀:通过加入盐和酒精,可以使DNA溶液中的质粒DNA沉淀。
正常情况下,添加等体积的冷异丙醇,再加入适量的盐溶液。
因为质粒DNA在冷异丙醇和高盐浓度下更容易沉淀。
经过离心,沉淀的DNA可被分离出来。
6. 洗涤和溶解:将DNA沉淀洗涤一两次,以去除盐和其他杂质。
通常使用70%乙醇洗涤,再次离心以分离DNA沉淀,然后去除液体,使其干燥。
最后,用适当的缓冲液(如TE缓冲液)溶解质粒DNA,以得到高纯度的DNA溶液。
以上步骤提取质粒的主要原理如下:在收获细菌步骤中,细菌通过离心过程被分离出来,得到菌体沉淀。
在质粒裂解步骤中,通过物理或化学方法破坏细胞结构,释放质粒DNA。
质粒提取 原理及步骤

质粒提取原理及步骤质粒提取是分子生物学中的一项重要实验技术,被广泛应用于基因克隆、基因转染、基因表达等方面。
本文将重点介绍质粒提取的原理及步骤。
一、原理质粒提取的原理基于质粒和细胞的生化学性质差异。
质粒是一种独立复制的DNA分子,可以自主复制并传递给细胞的子代。
而在真核细胞中,大多数DNA都位于细胞核中,很难获得足够的DNA量进行实验。
质粒提取利用了这一差异,将大量的质粒从细胞中提取出来。
质粒提取的主要步骤如下:二、步骤1. 细胞培养首先需要选择适当的细胞类型并在培养基中培养,使细胞处于最佳生长状态。
对于大多数细胞类型,建议在对数生长期时采集,因为此时细胞数量最多且代谢活跃,可以有效提高质粒提取的DNA量和质量。
同时,还需注意避免细胞因为过于密集而形成聚集体或凝胶。
2. 细胞收获收获细胞的方法取决于细胞类型和实验的目的。
常见的方法包括用PBS或细胞培养液将细胞冲洗下来,或者用胶体离心等方法进行细胞收获。
收获的细胞量需要根据实验需求进行调整,一般建议在0.1-1g的范围内收获细胞。
3. 细胞裂解细胞裂解是质粒提取过程中最关键的步骤之一,它能有效破坏细胞膜和核膜,释放细胞内的DNA。
常用的细胞裂解剂包括SDS、Triton X-100和Tween-20等,同时还需要将细胞裂解液加入蛋白酶抑制剂和DNA酶切酶,以避免核酸降解和一些酶促反应的发生。
细胞裂解后,将细胞裂解液转移到离心管中,并进行离心分离,将细胞碎片等大分子杂质通过离心将其剔除。
4. DNA纯化DNA纯化是质粒提取的最后一步,目的是将提取得到的DNA从其他杂质中纯化出来。
不同的实验需求需要不同级别的DNA纯化,从而需要使用不同种类的DNA纯化试剂盒。
目前常用的DNA纯化试剂盒包括酚/氯仿提取法、离子交换柱纯化法、硅胶膜纯化法等。
在DNA纯化后,通过分析电泳和UV测定等方法进行检测,以确保提取的DNA质量和浓度满足实验需求。
总结质粒提取是分子生物学中非常基础和常用的实验技术,其所涉及的步骤包括细胞培养、细胞收获、细胞裂解和DNA纯化等步骤。
质粒提取步骤及原理

质粒提取是分子生物学中常用的实验技术,其目的是从细菌中提取出质粒DNA,用于后续的基因操作和分析。
下面是质粒提取的主要步骤和原理的详细解释。
一、质粒提取原理
质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。
作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外,质粒DNA上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。
在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。
从宿主细胞中提取质粒DNA,是DNA重组技术中最基础的实验技能。
二、质粒提取步骤
培养细菌使质粒扩增:将含有目标质粒的细菌接种在适当的培养基上,提供适当的条件(如温度、湿度和营养)使细菌生长和繁殖,从而使质粒得到扩增。
收集和裂解细菌:通过离心等方法收集培养好的细菌,然后使用适当的裂解液裂解细菌,使细菌的细胞壁和细胞膜破裂,释放出内部的质粒DNA。
分离和纯化质粒DNA:通过离心、过滤或层析等方法,将裂解液中的蛋白质、细胞碎片等杂质去除,得到相对纯净的质粒DNA。
这个过程中可能需要使用一些特殊的试剂或柱子来提高分离和纯化的效率。
通过以上步骤,我们可以从细菌中提取出高质量的质粒DNA,用于后续的基因操作和分析。
碱裂解法提取质粒DNA的实验原理和操作步骤

碱裂解法提取质粒DNA的实验原理和操作步骤碱裂解法是一种常用的方法,用于提取质粒DNA(plasmid DNA)纯化。
以下是具体的实验原理和操作步骤。
实验原理:碱裂解法利用碱性溶液将细菌细胞的细胞壁和细胞膜溶解,使细菌细胞内的质粒DNA被释放出来。
接着,使用中性化剂中和碱性溶液,使DNA带正电荷,而细胞中的蛋白质则带负电荷,从而能够通过离心将DNA与蛋白质分离。
最后,通过浓缩、洗涤和纯化,得到高质量的质粒DNA。
操作步骤:1.培养细菌:选取含有质粒DNA的细菌菌株,如大肠杆菌。
在含有适当抗生素的培养基中培养细菌菌株。
2.收获细菌:当菌液呈现较稠的浑浊状态时,收取细菌培养物。
使用离心机将菌液离心,分离菌体沉淀和上清液。
将上清液倒掉,保留菌体沉淀。
3.碱裂解:将菌体沉淀溶解于碱性溶液中,如盐酸和十二烷基硫酸钠(SDS)溶液。
轻轻混合并将溶液放入水浴中加热,使细菌细胞壁和细胞膜被溶解。
4.中和:使用中性化剂,如醋酸,使溶液中的酸性物质中和。
这样可以确保DNA带正电荷,而蛋白质和其他污染物则带负电荷。
5.离心:将溶液离心,在离心过程中,DNA会与细胞内其他分子分离,形成一个DNA沉淀。
上清液中含有蛋白质和其他污染物。
6.洗涤:使用洗涤缓冲液,如乙酸盐缓冲液,洗涤DNA沉淀,去除残留的污染物。
7.纯化:用去离子水溶解DNA沉淀,使其溶解在水中。
将溶解的DNA沉淀通过滤纸等过滤装置过滤掉残余杂质。
8.浓缩:通过酒精沉淀法或其他方法,将DNA溶液浓缩到所需的浓度。
9.检测:使用紫外分光光度计等方法,测定提取的质粒DNA的纯度和浓度。
注意事项:1.在实验过程中保持操作环境和仪器无菌。
2.碱裂解法中使用的溶液需准备新鲜,并避免受到污染。
3.操作过程中需要低温处理和离心操作,以保护DNA的完整性。
4.质粒DNA的提取可以根据实验目的进行进一步的扩增、测序或转染等应用。
总结:通过碱裂解法,可以从细菌中提取纯化的质粒DNA。
质粒DNA的提取实验报告

质粒DNA的提取一、实验方法碱裂解法抽提质粒DNA二、实验原理基于质粒DNA与染色体DNA变性与复性的差异。
三、实验步骤1)质粒提取1. 10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。
2. 加入100μl溶液1,振荡至彻底悬浮。
3. 加入200μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管6次,使菌体充分裂解,随后将离心管冰上放置3分钟4. 加入150μl溶液3,立即温和颠倒离心管数次,冰上放置3分钟,10,000g离心10min。
5. 将步骤4的上清转移至新的离心管(尽量去除杂质),加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇混合均匀10,000g离心5min。
6. 将步骤5的上清转移至新的离心管,加入2倍体积的无水乙醇,室温放置5-10min,沉降DNA7. 10,000g离心10分钟,弃乙醇,保留沉淀,加入1ml 70%的乙醇洗涤沉淀,10,000g离心5分钟8. 倒掉乙醇溶液,用吸水纸吸净管壁上的水珠,室温蒸发痕量乙醇9. 加入适量含RNase的TE或灭菌双蒸水溶解质粒DNA2)质粒鉴定→琼脂糖凝胶电泳灌胶:胶中加入荧光染料(SYBR Green I)加样:质粒+上样缓冲液→混匀电泳结果观察:UV灯下四、实验结果五、实验分析裂解细胞中除含有质粒DNA外,还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂类等物质,因此用碱裂解法除去杂质1、防止DNA裂解:Solution 11)、所含糖增加溶液黏度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切作用降解2)、所含EDTA抑制酶活性2、溶解与变性:Solution21)强碱使质粒DNA和染色体DNA变性2)离子型表面活性剂SDS可溶解膜蛋白3、沉降与复性:Solution31)质粒DNA复性2)在钾盐中,染色体DNA形成缠连的不溶性网状结构,和不稳定的大分子RNA以及变性的蛋白质和细菌碎片等一起沉淀预期结果为剩余质粒DNA4、琼脂糖凝胶电泳1)荧光染色染料分子可嵌入双链DNA分子配对碱基之间2)琼脂糖可起到电泳和分子筛的作用,因所带电荷、分子量大小和构型不同,泳动速度不同六、误差分析实验失败,本组实验出现4条带,3明1暗,明亮处应为DNA分子数最多的,为质粒DNA,质粒DNA前有较暗的两条带,推测其中一条为未复性质粒DNA,可能Solution2处变性过长,不易复性,或Solution3处时间过短,复性不充分。
碱裂解法提取质粒原理

碱裂解法提取质粒原理
碱裂解法是一种常用的提取质粒的方法,其原理是利用碱性溶液将细菌细胞膜溶解,从而释放出质粒。
具体步骤如下:
1. 首先,培养含有目标质粒的细菌菌株,并收集足够数量的细菌细胞。
2. 将细菌细胞离心沉淀,去除上清液。
3. 使用含有碱性成分的溶液,如含有氢氧化钠和EDTA的碱
裂解液,将细菌细胞重悬。
4. 碱性溶液中的氢氧化钠会破坏细菌细胞膜的完整性,并且EDTA会螯合钙离子,进一步增强细菌细胞膜的脆弱性。
5. 经过一定时间的碱裂解作用,细菌细胞膜将被溶解,质粒被释放出来。
6. 使用中性化溶液,如盐酸或磷酸,可以调整溶液的酸碱度,使其接近中性,从而停止碱裂解的作用。
7. 利用离心的方法,将碱裂解液中的细菌残渣和其他杂质分离,得到含有质粒的上清液。
8. 最后,可通过柱层析等方法对上清液进行纯化,以获取纯净的质粒。
这种碱裂解法提取质粒的原理是利用碱性溶液破坏细菌细胞膜,从而释放出质粒。
与其他提取方法相比,这种方法简单易行,成本低廉,并且适用于大规模提取质粒。
质 粒 提 取 原理及步骤

质粒提取原理及步骤一、导论已经提出过许多方法用于从细菌中提纯质粒DNA,这些方法都含有以下3个步骤:1. 细菌培养物的生长。
2. 细菌的收获和裂解3. 质粒DNA的纯化。
(一)细菌培养物的生长从琼脂平板上挑取一个单菌落,接种到培养物中(有含有行当抗生素的液体培养基中生长),然后从中纯化质粒,质粒的提纯几乎总是如此。
现在使用的许多质粒载体(如pUC系列)都能复制到很高的拷贝数,惟致只要将培养物放在标准LB 培养基中生长到对数晚期,就可以大量提纯质粒。
此时,不必造反性地扩增质粒DNA。
然而,较长一代的载体(如pB R322)由于不能如此自由地复制,所以需要在得到部分生长的细菌培养物中加入氯霉素继续培养若干小时,以便对质粒进行性扩增。
氯霉素可抑制宿主的蛋白质合成,结果阻止了细菌染色体的复制,然而,松弛型质粒仍可继续复制,在若干小时内,其拷贝数持续递增。
这样,像pBR322-类的质粒,从经氯霉素处理和未经处理的培养物中提取质粒的产量迥然不同,前者大为增高。
多年来,加入足以完全抑制蛋白质合成的氯霉素μg/ml)已成为标准的操作、用该方法提取的质粒DNA量,对于分子克隆中几乎所有想象到的工作任务。
(二)细菌的收获和裂解细菌的收获可通过离心来进行,而细菌的裂解则可以采用多种方法中的任意一种,这些方法包括用非离子型或离子型去污剂、有机溶剂或碱进行处理及用加热处理等。
选择哪一种方法取决于3个因素:质粒的大小、小肠杆菌菌株及裂解后用于纯化质粒DNA的技术。
尽管针对质粒和宿主的每一种组合分别提出精确的裂解条件不切实际,但仍可据下述一般准则来选择适当方法,以取得满意的结果。
1)大质粒(大于15kb)容易受损,故应采用漫和裂解法从细胞中释放出来。
将细菌悬于蔗糖等渗溶液中,然后用溶菌酶和EDTA进生处理,破坏细胞壁和细胞外膜,再加入SDS一类去污剂溶解球形体。
这种方法最大限度地减小了从具有正压的细菌内部把质粒释放出来所需要的作用力。
去内毒素质粒提取原理

去内毒素质粒提取原理
内毒素质粒提取是一种常用的实验方法,用于从细菌中提取纯化内毒素质粒。
内毒素质粒是一种含有内毒素基因的质粒,可以通过将其转化到宿主细菌中,利用宿主细菌合成内毒素,从而得到内毒素的高产物。
内毒素质粒提取的原理是基于以下步骤进行的:
1. 提取细菌:首先,从含有内毒素质粒的宿主细菌中提取细菌。
这可以通过培养液基样或者固体培养基上的细菌混悬液得到。
2. 细菌破碎:将提取的细菌进行破碎,使得内毒素质粒释放到溶液中。
破碎细菌的方法有多种,包括超声波破碎法、高压破碎法等。
3. 除去胞外物质:通过高速离心将破碎细菌溶液进行离心,将胞外物质与内毒素质粒分离。
离心后,胞外物质会沉淀在管底,而内毒素质粒则分散在上清中。
4. 滤过纯化:通过滤膜将上清进行滤过,除去残留的固体颗粒和细菌等杂质,得到较为纯净的内毒素质粒溶液。
5. 纯化内毒素质粒:最后,可以采用各种柱层析等方法对内毒素质粒进行纯化。
常用的纯化方法包括亲和层析、离子交换层析等,以获得高纯度的内毒素质粒溶液。
总结而言,内毒素质粒提取的原理利用细菌破碎和纯化方法,
从宿主细菌中提取纯化内毒素质粒。
这种方法可以应用于研究内毒素的性质、制备高纯度内毒素样品等实验需求。
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质粒DNA提取的原理及方法
碱裂解法质粒DNA提取原理
质粒DNA提取主要包括以下几个方面:如何将细胞裂解释放质粒DNA,如何将质粒DNA和基因组DNA分离开来,如何去除RNA污染,如何去除蛋白质和其它杂质。
质粒提取方法中,最常用的方法是碱裂解法,它具有得率高,适用面广,快速,纯度高等特点。
其原理是:
强碱性条件下,质粒DNA和基因组DNA同时从细胞中释放出来,并发生变性。
在pH中性,并有高盐浓度存在的条件下,质粒DNA会迅速发生复性,仍为可溶性状态,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构,在去垢剂SDS作用下,染色体DNA与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,通过离心去除沉淀后,再用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA,用异丙醇或乙醇沉淀可将之纯化出来。
BIOMIGA公司质粒DNA纯化系列试剂盒,采用碱裂解法质粒提取原理,在高盐环境下,采用硅胶膜特异性的吸附质粒DNA,而蛋白质不被吸附,最后用低盐洗脱液将DNA从膜上洗脱下来,方法简单,快速,质量好,收获量高。
影响质粒提取的因素
影响质粒提取的因素有很多种,如质粒拷贝数,宿主菌株的种类,细菌的培养时间、培养基种类、培养条件等等。
质粒拷贝数
质粒DNA最终收获量取决于质粒的拷贝数和质粒的大小。
BIOMIGA 公司质粒DNA提取系列试剂盒,操作步骤适用于高拷贝数质粒的纯化,对于低拷贝质粒纯化提取,应加大起始菌液量的体积,并且相应地增加各种缓冲液的用量。
下表给出一些常用质粒载体的拷贝数:
质粒种类
复制起点
拷贝数
1 mL菌液质粒DNA收获量(µg)
pSC101
pSC101
5
pACYC
P15A
10-12
pSuperCos
pMB1
10-20
pBR322
pMB1
15-20
pGEMR
Muted pMB1
300-400
6-7
pBluescriptR
ColE1
300-500
6-8
pUC
Muted pMB1
500-700
8-12
宿主菌株
宿主菌株的种类将会影响质粒的收获量。
含内源核酸酶的宿主菌株,如JM101, JM110, HB101, TG1以及它们的衍生菌株,通常因为内源核酸酶的存在,或者在提取过程中释放出来的核酸酶的作用下,将会显著影响最终收获量,或者纯化到的质粒容易降解,推荐客户将质粒转化至不含内源核酸酶的宿主菌株中,如Top10, DH5a进行质粒纯化。
如果从含内源核酸酶的宿主菌株中纯化质粒DNA,请用试剂盒附送的核酸酶去除溶液,去除核酸酶的污染。
或选用HP系列试剂盒进行质粒的纯化。
下表给出一些常用的宿主菌株种类:
EndA- Strains of E. Coli
DH5α
DH1
DH21
JM106
JM109
SK2267
SRB
XLO
TOP10
DH10B
JM103
JM107
SK1590
MM294
Stbl2™
XL1-Blue
BJ5182
DH20
JM105
JM108
SK1592
Select96™
Stbl4™
XL10-Gold
EndA+ Strains of E. Coli C600
JM110
RR1
ABLE® C
CJ236
KW251
P2392
BL21(DE3)
HB101
TG1
TB1
ABLE® K
DH12S™
LE392
PR700
BL21(DE3) pLysS
JM101
JM83
TKB1
HMS174
ES1301
M1061
Q358
BMH 71-18
All NM strains
All Y strains
菌液培养
BIOMIGA 公司质粒DNA提取系列试剂盒,标准操作适用于在LB培养基中培养12~16小时,OD600在~的菌液质粒DNA的提取。
如果使用丰富培养基,如TB,2 x YT培养基,请保证OD600不超过。
菌液过量,将会影响最终的收获量和纯度。
培养方式
如果用于质粒小提,请从固体培养基平板上挑取新鲜单菌落,接种到加入筛选抗生素的培养基中,震荡培养12~16小时。
如果用于中提、大提或超大提,请按照以下方式制备菌液:
挑取单克隆,接种到1~5mL培养基中,进行初摇,然后按照1:1000的比例进行放大培养,培养瓶中培养基的体积最好不要超过培养瓶的1/4体积。
抗生素浓度的选择
对含有抗性的质粒载体,在进行筛选或培养时应加入相应的抗生素。
各种抗生素的工作浓度请参照下表:
抗生素
溶解性
保存条件
严紧型质粒
松弛型质粒
氨苄青霉素
50 mg/mL(溶于水)
-20℃
20 µg/mL
60 µg/mL
羧苄青霉素
50 mg/mL溶于水
-20℃
20 µg/mL
60 µg/mL
氯霉素
34 mg/mL溶于无水乙醇
-20℃
25 µg/mL
170 µg/mL
卡那霉素
10 mg/mL溶于水
-20℃
10 µg/mL
50 µg/mL
链霉素
10 mg/mL溶于水
-20℃
10 µg/mL
50 µg/mL
四环素
5 mg/mL溶于无水乙醇
-20℃
10 µg/mL
50 µg/mL
质粒质量鉴定
纯化到的质粒DNA一般可以通过以下三种方式进行质量鉴定。
琼脂糖凝胶电泳检测
理想条件下,经碱裂解法纯化到的质粒DNA,应该只出现超螺旋一条带。
但在质粒提取过程中机械力,强碱溶液的作用等原因,纯化到的质粒常常会出现三条带,甚至有时候会出现四条带(变性超螺旋),不管是哪种形式的超螺旋,经单酶切后,呈现一条带,则说明提取结果正常,没有基因组污染。
酶切鉴定
纯化到的质粒,进行进一步的酶切操作,鉴定质粒的大小。
紫外分光光度计检测
纯化到的质粒,稀释一定的倍数,通过测定OD280,OD260,OD230,计算收获量和纯度。
OD260/OD280在~之间,说明质粒纯度较好。
如果洗脱时用去离子水洗脱,测光吸收时,pH 值和离子浓度会影响光吸收值,比值会偏低,但并不表示纯度低。