酶 基因表达

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柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因(PdPG2)的表达分析

柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因(PdPG2)的表达分析

柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因(PdPG2)的表达分析由书妍;于瑞君;刘红霞;李红叶【摘要】柑橘绿霉病菌Penicillium digitatum是储藏期柑橘腐烂病最主要的病原之一,严重影响柑橘产业的发展.已有研究表明,柑橘绿霉病菌中多聚半乳糖醛酸酶(PdPG2)对其致病性有重要作用,PdPG2基因功能缺失突变株的致病性会下降,然而有关PdPG2基因的表达研究尚不完善.本文研究了PdPG2基因在不同条件下的表达情况,结果表明PdPG2是酸性表达基因,其表达量随着pH的升高而降低,pH为3.0时其表达量为对照条件下的10倍,pH为8.0时其表达量为对照条件下的0.36倍.柑橘果胶能够诱导PdPG2的表达,其表达量为对照的3.6倍.因此,在侵染过程中PdPG2表达的升高是由于发病部位酸化以及橘皮降解物诱导共同引起的.%Penicillium digitatum is the most important pathogen causing green mold disease of postharvest citrus.Previous studies indicated that PdPG2 played an important role in pathogenicity,and disruption of PdPG2 resulted in attenuated virulence of P.digitatum.However,the expression profiles of PdPG2 were not well characterized.In this study,we investigated the expression profiles of PdPG2.The results indicated that PdPG2 was up-regulated under acidic conditions.The expression level of PdPG2 was approximately 10 fold at pH 3.0 and 0.36 fold at pH 8.0 compared with that in the control.Pectin could induce the expression of PdPG2 and the expression level was about 3.6 fold of that in the control.These results indicated that acidic condition and pectin could induce PdPG2 expression.The decreased pH of citrus rind during infection was suitable for PdPG2 expression,and pectin might be also helpful during infection.【期刊名称】《植物保护》【年(卷),期】2017(043)002【总页数】4页(P138-140,162)【关键词】柑橘绿霉病菌;多聚半乳糖醛酸酶;基因表达【作者】由书妍;于瑞君;刘红霞;李红叶【作者单位】大连市农业科学研究院,大连116036;大连市农业科学研究院,大连116036;大连市农业科学研究院,大连116036;浙江大学农业与生物技术学院,杭州310058【正文语种】中文【中图分类】S432.1柑橘绿霉病菌引起的柑橘腐烂病是贮藏期柑橘的主要病害之一,其造成的损失通常占所有损失的90%以上,严重影响了我国柑橘的经济效益[1-2]。

枯草芽孢杆菌产淀粉酶基因的克隆与表达

枯草芽孢杆菌产淀粉酶基因的克隆与表达

枯草芽孢杆菌产淀粉酶基因的克隆与表达枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)是一种在垃圾堆、陆地和淡水中常见的细菌,它可以合成淀粉酶,参与食品加工和制药等领域。

为了深入研究芽孢杆菌产淀粉酶的机制,本文旨在克隆和表达枯草芽孢杆菌的淀粉酶基因,为今后的更深入研究奠定基础。

研究中,我们首先从枯草芽孢杆菌的形态学特性中确定菌株,然后利用定点突变技术,以外源基因引入枯草芽孢杆菌,以达到调控基因表达的目的。

实验中,通过对枯草芽孢杆菌分离介质DNA的提取、限制性内切酶扩增以及后续的PCR扩增,我们能够从大量杂合DNA中克隆出淀粉酶基因的片段,然后进行终止密码子转录、酶切以及连接方面的实验,最终可以将淀粉酶基因克隆入宿主细菌质粒中,从而表达淀粉酶蛋白。

经过蛋白质免疫印迹分析,可以看到从枯草芽孢杆菌中克隆和表达的具有淀粉酶功能的蛋白质,在不同pH条件下具有较强的淀粉水解能力,与未经克隆表达的芽孢杆菌菌株相比,淀粉酶产量有了显著提高。

基于以上结果,我们总结出了枯草芽孢杆菌产淀粉酶基因的克隆与表达的技术方案,为今后的深入研究提供基础,也为特定乳酸菌淀粉酶防护剂的研发提供参考价值。

本文通过介绍枯草芽孢杆菌产淀粉酶基因的克隆与表达,探索了枯草芽孢杆菌淀粉酶的分子机制,证明了定点突变技术对淀粉水解能力的增强作用,为淀粉酶的进一步研究提供了可靠的技术手段。

未来,
我们将借助于新的基因技术等技术平台,进一步深入研究芽孢杆菌淀粉酶的功能、结构和稳定性,以期能更好地利用该酶的乳化作用,为食品加工和药物制造等领域提供支持。

荧光素酶报告基因实验

荧光素酶报告基因实验

荧光素酶报告基因实验荧光素酶报告基因实验是一种常见的分子生物学实验方法,用于研究基因表达、转录调控以及蛋白质相互作用等生物学过程。

荧光素酶(Luciferase)是一种能够产生荧光的酶,通过将其与感兴趣的基因或启动子相连,可以实现对基因表达水平的定量检测。

本文将介绍荧光素酶报告基因实验的基本原理、操作步骤以及实验注意事项。

首先,进行荧光素酶报告基因实验前,需要准备好所需的材料和试剂,包括质粒载体、荧光素酶底物、细胞培养基、转染试剂等。

在实验操作前,务必保证实验室操作台面和仪器设备的清洁,并采取严格的无菌操作措施,以确保实验结果的准确性和可重复性。

其次,进行荧光素酶报告基因实验的关键步骤包括转染细胞、添加荧光素酶底物、测定荧光强度等。

在转染细胞时,需要根据实验设计选择合适的转染试剂和转染时间,确保目标基因能够高效地表达。

添加荧光素酶底物后,需根据实验要求选择合适的底物浓度和反应时间,以获取准确的荧光素酶活性数据。

在测定荧光强度时,可以利用荧光素酶底物产生的荧光信号进行定量检测,从而分析基因表达水平的变化。

在进行荧光素酶报告基因实验时,需要注意一些实验技巧和注意事项。

首先,要严格控制实验条件的一致性,包括细胞的密度、培养基的配制、荧光素酶底物的处理等,以减小实验误差。

其次,需要选择合适的阳性对照和阴性对照,以验证实验结果的可靠性和准确性。

最后,要及时记录实验数据并进行统计分析,以得出科学可靠的结论。

综上所述,荧光素酶报告基因实验是一种重要的分子生物学实验方法,可用于研究基因表达调控、信号转导通路等生物学过程。

通过掌握实验原理、操作步骤和注意事项,可以有效开展荧光素酶报告基因实验,并获取可靠的实验数据。

希望本文的介绍能够对科研工作者在进行荧光素酶报告基因实验时有所帮助。

DNA甲基转移酶的表达调控及主要生物学功能

DNA甲基转移酶的表达调控及主要生物学功能

DNA甲基转移酶的表达调控及主要生物学功能一、本文概述DNA甲基转移酶是一类重要的酶类,负责在DNA分子上添加甲基基团,从而调控基因表达、DNA复制、DNA修复和染色体结构等多个生物学过程。

本文旨在全面探讨DNA甲基转移酶的表达调控机制及其主要生物学功能,以期深入理解这一关键酶类在生命活动中的重要作用。

我们将首先概述DNA甲基转移酶的基本结构和功能,然后详细阐述其表达调控的分子机制,包括转录水平、翻译水平和翻译后水平的调控。

在此基础上,我们将进一步探讨DNA甲基转移酶在细胞周期、细胞分化、基因印记、染色体失活、癌症发生和发展等生物学过程中的关键作用。

通过本文的阐述,我们期望能够为读者提供一个全面而深入的视角,以理解DNA甲基转移酶在生命科学领域的重要性和应用价值。

二、DNA甲基转移酶的种类与结构DNA甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)是一类能够催化DNA甲基化反应的酶,它们在生物体内发挥着重要的调控作用。

根据它们的结构、功能和底物特异性,可以将DNA甲基转移酶分为多种类型。

DNMT1:这是最早被发现并广泛研究的DNA甲基转移酶。

DNMT1主要维持DNA复制后的甲基化模式,确保新合成的DNA链能够继承母链的甲基化状态。

DNMT1的结构包括一个N端的调节域、一个中间的催化域和一个C端的结合域。

其中,催化域负责催化甲基化反应,而结合域则帮助DNMT1与DNA结合。

DNMT3A和DNMT3B:这两种酶主要负责在DNA复制过程中建立新的甲基化模式。

DNMT3A和DNMT3B的结构与DNMT1相似,但它们在催化域和结合域上存在一些差异,这些差异使得它们能够在没有预先存在的甲基化模式的情况下,对新的DNA链进行甲基化。

DNMT2:这是一种较为特殊的DNA甲基转移酶,它主要对tRNA进行甲基化,而不是对DNA进行甲基化。

DNMT2的结构与其他DNMTs有所不同,它的催化域较小,而且不具有维持或建立DNA甲基化模式的功能。

利用RNA干扰技术抑制四九菜心中黑芥子酶基因的表达的开题报告

利用RNA干扰技术抑制四九菜心中黑芥子酶基因的表达的开题报告

利用RNA干扰技术抑制四九菜心中黑芥子酶基因的表达的开题报告一、研究背景四九菜心是一种十分常见的蔬菜,广泛种植于世界各地。

然而,四九菜心中的黑芥子酶会影响其品质和口感,给食用带来影响。

因此,寻找有效的手段减少黑芥子酶的含量成为了四九菜心种植和加工的研究热点。

RNA干扰技术是一种逆向基因工程技术,通过在生物细胞内引入人工合成的RNA分子,诱导RNA与靶基因的mRNA互相杂交,进而导致靶基因mRNA的降解和功能的抑制。

因此,利用RNA干扰技术抑制四九菜心中黑芥子酶基因的表达,可以实现减少黑芥子酶含量,进而改善四九菜心的品质和口感。

二、研究目的本研究旨在利用RNA干扰技术抑制四九菜心中黑芥子酶基因的表达,以此改善四九菜心的品质和口感。

三、研究方法1.选择RNAi靶点序列。

根据四九菜心黑芥子酶基因的序列,设计出2~3个满足RNAi靶点设计规则的靶点序列,并进行验证。

2.构建RNAi载体。

根据选择的靶点序列设计合适的RNAi载体,并进行构建和扩增。

将RNAi载体导入大肠杆菌中,进行扩增、纯化和鉴定。

3.将RNAi载体导入四九菜心。

将构建好的RNAi载体通过基因枪等方法导入四九菜心,使其进入细胞并起到RNA干扰的作用。

4.筛选RNAi转化株。

通过PCR、Western blot等方法筛选出表达黑芥子酶的基因表达受到抑制的RNAi转化株,置于合适的培养环境中进行培养并取样分析。

5.鉴定干扰效果。

对转化株进行鉴定干扰效果的相关实验。

如PCR扩增、Western blot、酶活测定等。

四、研究意义通过本研究,可以利用RNA干扰技术在四九菜心中抑制黑芥子酶的表达,实现优化其品质和口感的目的,从而推广四九菜心的种植和加工。

该技术还有可能为其他蔬菜的种植和加工提供参考价值,有一定实践意义。

水稻丙二烯氧化物合成酶基因OsAOS1的表达研究

水稻丙二烯氧化物合成酶基因OsAOS1的表达研究

瘟病 的抗性 。本研究分 析了 O s A O S 1 基 因表达的组织 和器 官特 异性 以及 外 源 J A处理对 O s A O S 1基 因表达 的 影响, 同时利用转基 因技术研究 了 O s A O S I基 因在调 控内源 P R 1基 因表达 中的作用 。研究 结果 表 明: O s A O S 1 基 因表达 的组织 和器官 特异性不同于 O s A O S 2基 因 ; 外源 J A处理诱 导 O s A O S 1基 因的瞬时表达 , 然而 O s A O S 2 基 因的诱 导表达延迟 ; O s A O S 1过量表达抑制烟草 中内源 P R I基 因 的表 达。据此推测 O s A O S 1基 因可能 不参 与依赖于 P R j的抗病反应 。
g a n- — s p e c i i f c e x p r e s s i o n o f O s AO S 1 g e n e a n d e f f e c t s o f e x o g e n o u s J A o n t h e e x p r e s s i o n o f O s AO S 1 g e n e w e r e
山东 农 业 科 学 2 0 1 3 , 4 5 ( 5 ) : 1— 5
S h a n d o n g A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s
水 ห้องสมุดไป่ตู้ 丙 二烯 氧 化 物 合 成 酶 基 因 O s A O S 1的表 达研 究
韩 同凯 , 周晋军 , 薛彦 久 , 陈翠霞 , 谢先芝h
( 1 .山东省水稻研究所/ 山东省水稻工程技术研究 中心 ,山东 济南

2 5 0 1 0 0;

酶的生物学功能及其应用

酶的生物学功能及其应用

酶的生物学功能及其应用酶是一类催化生物学反应的蛋白质,它们在生物体内起着至关重要的作用。

酶的生物学功能包括催化代谢反应、信号传导、基因表达和调节等。

酶的催化作用细胞内代谢过程中,需要完成多种不同的化学反应来合成和分解物质。

许多这样的反应都需要在生理条件下进行。

这时,酶就发挥了关键作用。

对于一个生物体所需要的新陈代谢反应,酶就像一个“指挥官”,它可以选择特定的反应物,并加速化学反应的速度,同时同时还能降低反应所需的能量。

酶的信号传导作用细胞间传递信息的过程中,信号分子必须和特定的细胞蛋白质发生特定的相互作用,这些蛋白质通常就是酶。

例如,对于胰岛素而言,其信号是通过蛋白激酶传导的。

酶的基因表达作用当需要大量合成特定蛋白质时,细胞会根据需要将特定基因的DNA序列转录成RNA,并将其翻译为蛋白质。

这一过程被称为基因转录和翻译。

在这一过程中,酶可以催化DNA的拆分、RNA的合成和蛋白质的折叠。

因此,酶在基因表达过程中起着至关重要的作用。

酶的调节作用在细胞内,不同的生化反应通常会相互关联,这些反应往往会通过酶的调节实现。

例如,在糖代谢过程中,酶会在特定时刻发挥作用,起着调节作用。

总的来说,酶的生物学功能可以分为催化代谢反应、信号传导、基因表达和调节等四个层面。

在这些过程中,酶不仅为细胞正常运转提供了坚实的支持,而且还为人类的药学和工业领域提供了巨大的帮助。

酶在药学中的应用药物设计中一个常见的目标是寻找特定酶抑制剂,以治疗特定疾病。

例如,ACE抑制剂可用于治疗高血压,而肝素抑制剂则可用于防治血栓。

除了抑制剂,酶还可以用于药物代谢。

例如,口服药物需要在肝脏中通过肝酶的代谢才能被降解和排泄出体外。

酶在工业中的应用生物技术领域中,酶还被广泛地应用于食品加工和制药工业中。

例如,酶可以催化酸奶中乳糖的分解,也可以用于制造糖浆或制药过程中。

此外,酶还可以用于环境保护领域。

例如,腐殖酶可以助力有机污染物的降解,而纤维素酶则能够用来消解植物纤维为生物质燃料。

香蕉中ABA醛氧化酶基因家族的鉴定及其表达分析

香蕉中ABA醛氧化酶基因家族的鉴定及其表达分析

㊀山东农业科学㊀2023ꎬ55(10):15~21ShandongAgriculturalSciences㊀DOI:10.14083/j.issn.1001-4942.2023.10.003收稿日期:2022-12-20基金项目:广东省基础与应用基础研究基金项目(2023A1515010336ꎬ2021A1515011236)ꎻ广东省普通高校重点领域专项(2022ZDZX4047)ꎻ韶关学院重点项目(SZ2022KJ05)ꎻ国家自然科学基金项目(31901537)ꎻ韶关学院博士启动基金项目(99000615)ꎻ国家级大学生创新创业训练计划项目(202310576009)作者简介:曾坚(1987 )ꎬ男ꎬ博士ꎬ副教授ꎬ从事植物基因功能研究ꎮE-mail:zengjian@sgu.edu.cn通信作者:胡伟(1982 )ꎬ男ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ从事植物基因分子生物学研究ꎮE-mail:huwei2010916@126.com香蕉中ABA醛氧化酶基因家族的鉴定及其表达分析曾坚1ꎬ周洁薇1ꎬ王舒婷1ꎬ胡伟2(1.韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室/英东生物与农业学院ꎬ广东韶关㊀512005ꎻ2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所ꎬ海南海口㊀571101)㊀㊀摘要:ABA醛氧化酶(abscisicaldehydeoxidaseꎬAAO)在植物生长发育和对生物/非生物胁迫的响应中起着重要作用ꎮ本研究从香蕉基因组中鉴定出3个MaAAOs基因ꎬ并对其遗传进化关系㊁结构域㊁理化性质及在不同组织㊁不同果实发育阶段和逆境处理下的表达情况进行了分析ꎮ结果表明ꎬ这3个MaAAOs分为两个亚族ꎬ相同亚族的基因呈现出类似的结构域组成和基因结构ꎬ与系统发育树的构建结果相一致ꎮMaAAO1基因在果实的发育和成熟阶段都表现出显著的高表达水平ꎬ暗示着其在香蕉果实发育过程中可能发挥着重要功能ꎮ另外ꎬMaAAO1和MaAAO2基因可能对渗透胁迫有响应ꎬMaAAO2基因还可能对Foc4病菌的侵染有响应ꎮ基于以上结果推断MaAAOs基因在香蕉的生长发育调控以及逆境响应中具有重要作用ꎮ该结果不仅丰富了我们对MaAAOs基因家族的认识ꎬ也为进一步揭示其在香蕉生长发育和应激响应机制方面的功能提供了线索ꎮ关键词:香蕉ꎻABA醛氧化酶(AA0)ꎻ基因鉴定ꎻ基因表达中图分类号:S668.1ꎻQ781㊀㊀文献标识号:A㊀㊀文章编号:1001-4942(2023)10-0015-07IdentificationandExpressionAnalysisofAAOGenesinBananaZengJian1ꎬZhouJiewei1ꎬWangShuting1ꎬHuWei2(1.GuangdongProvincialKeyLaboratoryofUtilizationandConservationofFoodandMedicinalResourcesinNorthernRegion/HenryFokSchoolofBiologyandAgricultureꎬShaoguanUniversityꎬShaoguan512005ꎬChinaꎻ2.InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnologyꎬChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciencesꎬHaikou571101ꎬChina)Abstract㊀Abscisicaldehydeoxidase(AAO)playsimportantrolesinplantgrowthanddevelopmentandresponsetobioticandabioticstresses.InthisstudyꎬthreeAAOgenes(MaAAOs)wereidentifiedfrombananagenomeꎬandtheirgeneticevolutionaryrelationshipꎬstructuraldomainꎬphysicalandchemicalpropertiesꎬandexpressionpatternindifferenttissuesꎬatdifferentfruitdevelopmentstagesandunderdifferentstresstreatmentswereanalyzed.TheresultsshowedthatthethreeMaAAOgenescouldbedividedintotwosubgroupsꎬandthegenesinthesamegroupexhibitedsimilarcombinationsofstructuraldomainsandgenestructuresꎬwhichwereconsistentwiththefindingsfromphylogenetictreeanalysis.TheMaAAO1genedisplayedsignificantlyhighex ̄pressionlevelsduringfruitdevelopmentandripeningperiodsꎬsuggestingitspotentialimportanceinbananafruitdevelopment.FurthermoreꎬbothMaAAO1andMaAAO2mightexhibitsensitiveresponsestoosmoticstressꎬandtheMaAAO2genemightberesponsivetotheinvasionofFoc4pathogen.BasedontheseresultsꎬitwasinferredthatMaAAOgenesplayedpivotalrolesinregulatingbananagrowthꎬdevelopmentandresponsestobioticandabioticstresses.ThesefindingswouldnotonlyenhanceourcomprehensiontotheMaAAOgenefami ̄lyinbananaꎬbutalsoprovideareferenceforfurtherunravelingtheirmechanismsofactioningrowthꎬdevel ̄opmentandstressresponsesofbanana.Keywords㊀BananaꎻAbscisicaldehydeoxidase(AAO)ꎻGeneidentificationꎻGeneexpression㊀㊀脱落酸(abscisicacidꎬABA)属于六种植物激素之一ꎬ1963年首次在脱落果实中被鉴定为生长抑制剂[1]ꎬ随后发现其在种子休眠㊁萌发㊁气孔开合㊁果实发育等多种生理过程中发挥着重要作用[2-4]ꎬ在水杨酸介导的生物胁迫以及高盐㊁干旱和寒冷等非生物胁迫中也起着关键作用[3ꎬ5]ꎮABA的代谢过程已有相关研究综述进行了详细总结[6]ꎮABA合成过程主要涉及玉米黄质环氧化酶(zeaxanthinepoxidaseꎬZEP)㊁9-顺环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoiddioxygen ̄asesꎬNCEDs)㊁短链醇脱氢酶/还原酶(short-chaindehydrogenases/reductasesꎬSDR)㊁ABA醛氧化酶(abscisicaldehydeoxidaseꎬAAO)[7]ꎬ其中AAO参与ABA合成途径中的最后一步ꎮ虽然ABA合成相关基因的研究比较多[8]ꎬ但关于AAO基因的研究较少ꎬ目前只对少数几个物种如拟南芥[9]㊁水稻[10]㊁小麦[11]等的AAO基因家族进行了鉴定分析ꎮ如:在拟南芥中ꎬAtAAO3基因的突变会导致ABA含量降低[9]ꎻ番茄ABA缺陷型突变体中的AAO活性远低于野生型的[12]ꎬ大麦中也存在类似的AAO缺失或活性降低的现象[13]ꎮ香蕉(Musassp.)是世界上重要的热带水果之一ꎬ也是重要的粮食作物之一[14]ꎮ香蕉在生长过程中会遭受到低温㊁干旱㊁香蕉枯萎病等不同逆境的影响ꎬ对其产量和最终果实品质产生重要影响[15-16]ꎮABA在这些过程中都扮演着重要的角色ꎬ因此ꎬ研究香蕉AAO家族基因种类及其在不同逆境处理下的表达情况具有重要意义ꎮ本研究从香蕉基因组中鉴定得到了AAO家族基因ꎬ并分析了它们的进化关系㊁基因结构和蛋白结构域ꎬ同时分析了其在不同组织㊁果实发育和成熟的不同阶段及对非生物/生物胁迫响应的表达模式ꎬ以期为进一步明确MaAAOs基因在香蕉生长发育和胁迫反应过程中的功能提供参考ꎮ1㊀材料与方法1.1㊀试验材料选用口味优良的香蕉品种粉蕉(MusaABBPisangAwakꎬFJ)进行试验ꎮ将粉蕉组培苗种植于塑料盆中(无菌土壤)ꎬ培养于生长室(28ħꎬ70%湿度ꎬ光周期为16h光/8h暗ꎬ光照强度为200μmol m-2 s-1)ꎮ组培苗种植取样周期为2015年6月 2016年8月ꎮ1.2㊀试验处理与样品采集方法(1)不同组织样品采集:组培苗种植约70天后达到五叶期ꎬ此时选取叶和根ꎻ组培苗种植约10个月开始开花ꎬ于开花后0天(0DAF)㊁20DAF和80DAF选取果实ꎻ组培苗种植12~13个月后采收ꎬ选取采收后3天(3DPH)和6DPH的果实ꎮ每个样本进行两次生物学重复ꎬ用于分析基因在不同组织和果实发育不同阶段的表达情况ꎮ(2)非生物胁迫处理方法及取样:分别用300mmol L-1NaCl和200mmol L-1甘露醇灌溉五叶期香蕉幼苗ꎬ进行盐胁迫和渗透胁迫处理ꎬ处理7d后取样ꎻ将五叶期香蕉幼苗置于4ħ生长室(70%湿度ꎬ光周期为16h光/8h暗ꎬ光照强度为200μmol m-2 s-1)进行冷胁迫处理ꎬ22h后取样ꎮ采集对应处理时间后的叶片样本进行非生物胁迫处理下基因的表达分析ꎮ(3)尖孢镰刀菌侵染处理及取样:将五叶期香蕉幼苗根部浸泡在F.oxysporumrace4(Foc4)孢子悬液(106个分生孢子/mL)中2hꎬ以浸入无菌蒸馏水(ddH2O)中的为对照ꎻ然后移栽到装有无菌土壤的塑料盆中ꎬ在生长室中培养(28ħꎬ70%湿度ꎬ光周期为16h光/8h暗ꎬ光照强度为200μmol m-2 s-1)ꎻ培养2d后ꎬ采集根系样品进行基因表达分析ꎮ每份样本包含两个生物重复样61㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀山东农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀第55卷㊀本ꎮ1.3㊀香蕉AAO基因家族的鉴定及系统发育分析利用拟南芥AtAAOs基因的序列构建HMM模型ꎬ从香蕉A基因组中搜索得到香蕉AAOs序列ꎻ利用得到的香蕉AAOs序列构建新的HMM模型ꎬ利用新的HMM模型从A基因组中搜索鉴定MaAAOs基因ꎮ使用保守结构域数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/)和PFAM数据库(ht ̄tp://pfam.sanger.ac.uk/)验证得到的MaAAOs基因ꎮ利用下载得到的AtAAOs和水稻OsAAOs蛋白序列ꎬ以MEGA-X中的MUSCLE方法进行序列比对ꎬ使用Neighbor-joining法构建系统发育树ꎬBootstrap值设置为1000ꎮ1.4㊀香蕉AAO基因家族的蛋白质特性和序列分析通过ExPASy数据库(http://expasy.org/)对分子质量和等电点等理化性质进行预测ꎮ利用MEME软件和InterProScan数据库对蛋白结构域序列进行鉴定ꎮ采用GSDS数据库对基因结构进行分析(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)ꎮ1.5㊀转录组分析RNA测序中的RNA提取㊁文库制备和测序等工作均由美吉生物技术有限公司(中国上海)完成ꎮRNA-seq分析样本的收集过程参考前人的研究[17]ꎮ每个样本包含两个生物重复序列ꎮ测序平台为IlluminaGAII(IlluminaꎬSanDiegoꎬCAꎬUSA)ꎮFASTX(http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/)和FastQC(http://www.bioinformat ̄ics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/)用于删除接头序列和低质量序列ꎮ通过TophatV.2.0.10将粉蕉样本的cleanreads与香蕉基因组进行比对[18]ꎬ使用Cufflinks进行转录组组装[19]ꎮ基因的表达值使用FPKM值表示ꎮ使用DEGseq工具鉴定差异表达基因(DEGs)(log2-basedfoldchange>1ꎻlog2-basedfoldchange<-1)ꎮ2㊀结果与分析2.1㊀MaAAOs基因的鉴定利用香蕉AAO基因序列的保守结构域构建HMM模型ꎬ从香蕉A基因组中鉴定得到了3个MaAAOs基因ꎬ分别命名为MaAAO1㊁MaAAO2㊁MaAAO3(表1)ꎬ其氨基酸残基数量分别为1365㊁1393㊁1399个ꎬ编码蛋白的分子量范围为15.05~15.26kuꎬ等电点范围是6.59~6.62ꎮ为分析MaAAOs的进化关系ꎬ分别下载了水稻和拟南芥AAO基因家族的蛋白质序列(表1)ꎬ采用NJ法构建了系统发育树(图1)ꎮ可见ꎬ所有AAO蛋白可以分成两类ꎬMaAAO2和MaAAO3与所有AtAAOs及大部分OsAAOs聚在一个亚类ꎬ而MaAAO1则与两个OsAAOs聚成一个亚类ꎮ㊀㊀表1㊀AAO基因信息基因名基因编号基因位置氨基酸数量/个分子量/ku等电点MaAAO1Ma06_t26720.1chr6:28580510-28613339136515.056.62MaAAO2Ma09_t10080.2chr9:6883097-6895047139315.196.37MaAAO3Ma09_t10100.1chr9:6896480-6908654139915.266.59AtAAO1AT5G20960.1chr5:7116455-7122747136814.966.34AtAAO2AT3G43600.1chr3:15511832-15517545132114.465.41AtAAO3AT2G27150.1chr2:11601727-11607199133214.676.63AtAAO4AT1G04580.1chr1:1252005-1257893133714.736.28OsAAOLOC_Os03g31550.1chr3:17985563-17998498137015.026.99LOC_Os03g31550.2chr3:17985563-17998498127313.997.27LOC_Os07g07050.2chr7:3476288-34718345486.037.47LOC_Os07g07050.1chr7:3476921-34717896056.688.44LOC_Os03g57680.1chr3:32877206-32869482135714.536.45LOC_Os03g57690.1chr3:32886266-32879566135614.516.17LOC_Os10g04860.1chr10:2358790-2368732135914.556.42LOC_Os07g18120.1chr7:10724599-10738019136614.857.24LOC_Os07g18154.1chr7:10748746-107608488459.216.65LOC_Os07g18154.2chr7:10748746-107608337277.926.78㊀㊀注:基因名中Ma代表香蕉ꎬAt代表拟南芥ꎬOs代表水稻ꎮ71㊀第10期㊀㊀㊀㊀㊀曾坚ꎬ等:香蕉中ABA醛氧化酶基因家族的鉴定及其表达分析图1㊀AAO家族蛋白系统进化树2.2㊀MaAAOs基因家族的结构域和基因结构分析利用MEME数据库从MaAAOs基因中鉴定得到10个保守结构域ꎬ并用InterPro数据库进行了注释ꎮ由结果(图2㊁表2)可见ꎬ3个MaAAOs基因表现出类似的结构域组成ꎬ仅MaAAO1缺少了Motif8ꎻ除了Motif7ꎬ其余9个Motif都含有结构域IPR016208ꎬ其功能被注释为醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶ꎮ随后对MaAAOs基因结构进行分析ꎬMaAAO2和MaAAO3有类似的基因结构ꎬ都有10个内含子ꎻ而MaAAO1的内含子则是14个(图3)ꎮ表明相同聚类有类似的结构域组成和基因结构ꎬ与系统发育树的分析结果相一致ꎮ图2㊀MaAAOs基因结构域㊀㊀表2㊀MaAAOs基因结构域的注释编号序列结构域(注释)Motif1CLTLLCSINFCSVITSEGLGNSKDGFHPIHERFAGFHASQCGFCTPGMCMIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif2LRRPVRMYLDRKTDMIMTGGRHPMKINYSVGFKSDGKITALHVDIFINAGIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif3EVEVDVLTGGTIILRTDLIYDCGQSLNPAVDLGQIEGAFVQGIGFFMLEEIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif4AIPDEDNCILVYSSTQCPEIAQGVIAKCLGIPDHNVRVITRRVGGGFGGKIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif5NSDGLVISDGTWTYKIPTIDBIPKQFNVKLLKSGHHEKRVLSSKASGEPPIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif6KITKFEAEKAIAGNLCRCTGYRPIVDVCKSFAABVDLIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif7GDAPEYTLPAJIDELASSADYLDRLEIIRHFNSCNKWRKRGISLVPVVY无Motif8ELHSNERLVFSKIADHMDKVASPFIRNMASLGGNLIMAQRSQFASDVATIIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif9YNWGALSFDARICKTNFPTKSAMRGPGDVQGSFIAESVIEHIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)Motif10FTGPKLGCGEGGCGACVVLLSTYDPVSGQVKEFIPR016208(醛氧化酶/黄嘌呤脱氢酶)81㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀山东农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀第55卷㊀图3㊀MaAAOs基因的结构分析2.3㊀MaAAOs在粉蕉不同组织中的表达如图4A所示ꎬ粉蕉根中MaAAO1和MaAAO3基因高表达(FPKM>5)ꎬ叶中3个MaAAOs基因都表现出高表达ꎬ而果实(80DAF)中则只有MaAAO1表现出高表达ꎮ3个MaAAOs基因中ꎬ只有MaAAO1在粉蕉根㊁叶和果实中都呈现出高表达ꎮ图4㊀MaAAOs基因在香蕉不同组织(A)㊁果实不同发育阶段(B)㊁不同逆境处理(C)中的表达分析2.4㊀MaAAOs在粉蕉果实不同发育阶段中的表达为明确MaAAOs基因在香蕉果实发育过程中的功能ꎬ对其在不同发育阶段果实中的表达情况进行了分析ꎬ结果(图4B)显示ꎬ只有MaAAO1在果实发育早期(0DAF和20DAF)和后期(80DAF㊁3DPH)中表现出高表达(FPKM>5)ꎬ且以3DPH果实中的表达量最高ꎻMaAAO2在果实发育整个阶段的表达都极低ꎻMaAAO3在果实各发育阶段的表达水平相比MaAAO2要高ꎬ但除20DAF外均没有达到高表达ꎮ因此推测MaAAO1可能在果实发育过程中发挥着重要作用ꎮ2.5㊀MaAAOs在不同逆境处理下的表达为分析MaAAOs基因在粉蕉应对逆境胁迫中的功能ꎬ设置生物和非生物胁迫处理ꎬ分析3个MaAAOs基因在粉蕉植株根中的表达情况ꎬ结果(图4C)显示ꎬ在Foc4处理下ꎬMaAAO2基因表现出上调(log2-basedfoldchange>1)ꎻ在渗透胁迫下ꎬMaAAO1和MaAAO2基因表现出上调ꎻ在冷和盐胁迫下ꎬ3个基因均未表现出明显的上调表达ꎻMaAAO3基因在所有逆境处理中都没有表现出显著变化ꎮ3㊀讨论香蕉既是一种重要的热带和亚热带水果ꎬ也是全球130多个国家的主粮ꎬ但其研究进展相比其它作物要慢[20]ꎮABA在植物的生长发育和生物/非生物胁迫响应中起着重要作用[21]ꎬ而AAO是ABA合成途径中的重要合成酶ꎬ但香蕉AAO基因家族的情况仍不清楚ꎮ本研究从香蕉A基因组中鉴定出3个MaAAOs基因ꎬ保守结构域分析证明这3个基因属于AAO家族ꎬ并根据系统发育树将其分为两个亚类ꎬ其中MaAAO2和MaAAO3聚为一类ꎮ拟南芥的AAO基因数量是4个[9]ꎬ水稻中可能是5个[10]ꎬ小麦中是3个[11]ꎬ数量均较少ꎬ表明AAO蛋白可能属于小基因家族编码的蛋白质ꎮ91㊀第10期㊀㊀㊀㊀㊀曾坚ꎬ等:香蕉中ABA醛氧化酶基因家族的鉴定及其表达分析香蕉果实的发育和成熟过程决定着果实的品质和产量[14]ꎮ研究表明ꎬABA信号参与了果实的生长发育并影响着果实的成熟过程和最终品质ꎻ未成熟水果中的内源ABA含量通常较低ꎬ施加外源ABA能促进果实成熟及果肉软化ꎻ果实成熟过程中ABA合成相关基因的表达上调导致内源ABA大量积累[22]ꎮ这些结果表明ABA在水果成熟过程中发挥着重要作用ꎮ在本研究中ꎬ不同MaAAOs基因在粉蕉果实不同发育阶段表现出不同的表达模式ꎬMaAAO1基因在早期和晚期都表现出高表达ꎬ而MaAAO2和MaAAO3几乎不表达ꎻ此外ꎬMaAAO1在粉蕉叶㊁根㊁果实中均表现出高表达ꎬ推测MaAAO1基因在香蕉果实发育和成熟过程中可能具有重要作用ꎮ香蕉生长过程中常会遇到干旱㊁盐㊁寒冷以及枯萎病菌感染等非生物和生物逆境ꎬ对果实品质及产量造成影响[15-16]ꎮ在拟南芥中ꎬAtAAO3和AtAAO1基因表达明显受到干旱胁迫的诱导[9ꎬ23]ꎻ在拟南芥中过表达花生AhAAO2基因也能显著提高植株抵抗干旱胁迫的能力[24]ꎮ本研究发现ꎬMaAAO1和MaAAO2基因受渗透胁迫诱导上调表达ꎬ但受冷和盐胁迫的影响很小ꎻMaAAO3基因的表达在3种胁迫下均无显著变化ꎮ表明MaAAO1和MaAAO2基因可能在香蕉响应干旱胁迫中发挥作用ꎮ香蕉的种植生产也受到香蕉枯萎病的严重影响ꎮ有研究表明ABA能负向调控水杨酸(SA)介导的病原体反应ꎬ例如ꎬ提高植株中ABA的含量ꎬ会显著促进细菌的生长[25]ꎮ在本研究中ꎬ仅MaAAO2基因的表达显著受到Foc4处理的诱导ꎬ表明这个基因可能参与了响应Foc4侵染的过程ꎮ4㊀结论本研究从香蕉A基因组中鉴定得到了3个MaAAOs基因ꎬ经系统发育分析㊁蛋白结构域和基因结构分析ꎬ确定属于AAO基因家族ꎮMaAAOs基因参与了香蕉的生长发育㊁果实成熟和对生物/非生物胁迫的响应等过程ꎮ其中ꎬMaAAO1基因在果实发育早期和成熟阶段都表现出高表达ꎻMaAAO1和MaAAO2基因对渗透胁迫有响应ꎻMaAAO2基因的表达被Foc4诱导ꎬ可能响应该病菌的侵染ꎮ参㊀考㊀文㊀献:[1]㊀EaglesCFꎬWareingPF.DormancyRegulatorsinwoodyplants:experimentalinductionofdormancyinBetulapubescens[J].Natureꎬ1963ꎬ199(4896):874-875.[2]㊀ChernysJTꎬZeevaartJA.Characterizationofthe9 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酶基因表达
酶是一种特殊的蛋白质,能够加速生物化学反应的速率。

而酶的产生则是通过基因表达来完成的。

基因表达指基因活性的表现形式,是一个动态的过程。

在细胞中,基因的DNA序列通过转录被转化为RNA分子,然后通过翻译被转化为蛋白质,进而实现对生物体内各种复杂反应的调节。

酶的基因表达是动态的,包括调节基因表达的信号,基因的转录、翻译过程以及蛋白质的合成。

在这个过程中,许多细胞外环境因素能够影响基因和蛋白质的表达,从而影响酶的产生。

例如,在细胞内部的信号通路,如细胞因子和细胞间信号分子,能够影响酶的产生。

这些信号在转录和翻译过程中调节基因表达。

此外,组蛋白修饰、DNA甲基化等表观遗传机制也能够影响基因表达。

除了细胞内环境,一些环境刺激也会影响酶的基因表达。

例如,恶劣的环境条件(如缺氧环境、致病微生物等)能够刺激基因表达,进而影响酶的合成。

总之,酶基因表达是一种复杂的过程,受到多种因素的影响。

通过了
解这些因素,人们能够更好地了解酶的产生和生长过程,为实现一系列生物化学反应打下基础。

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