酵母双杂交
酵母双杂交

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酵母双杂交
酵母双杂交是一种实验技术,用于研究酵母菌的互作关系和蛋白质相互作用。
该技术基于酵母菌的能力,通过融合两个不同的酵母菌菌株,实现蛋白质的相互作用检测。
酵母双杂交的原理是利用一对可活化转录因子的融合蛋白,一个与实验蛋白A结合,另一个与实验蛋白B结合。
当A和B结合时,转录因子活化,启动报告基因的表达。
这种实验设置允许检测蛋白质A和B之间的相互作用。
通过酵母双杂交实验,可以筛查大量的蛋白质相互作用,从而揭示酵母菌细胞中复杂的信号传导网络。
这种技术被广泛应用于研究酵母菌的生物学过程、蛋白质功能以及疾病机制等方面。
它为揭示蛋白质相互作用网络提供了一种系统的方法。
1。
酵母双杂交

X DBD-X 融合蛋白 DBD Y
Y
AD-Y AD 融合蛋白
AD
报告基因产物 激活转录 构建 表达
UAS 上游激活序列
报告基因 即:DBD-X为诱饵蛋白,AD-Y为猎物蛋白
一般步骤
1.改造酵母
使用特定的营养缺陷型菌株 例:Trp与Leu缺陷型,即酵母菌自身不能合成Trp和Leu,需 要从培养基中吸收Trp和Leu。
酵母双杂交系统的优点
•根据目标蛋白的基因序列 即可筛选与其作用的目的蛋白, 不需分离靶蛋白 •蛋白质在真核细胞内,处于天然状态,蛋白质之间的相 互作用符合细胞内情况,即使是两种蛋白质的瞬时结合 也可被检测出来,真实反应体内蛋白质间相互作用情况
•可以直接获得目的蛋白的基因序列,从而可以初步判断 目的蛋白的结的足够丰富的多样性 提供尽可能多地与AD连接位点 插入片段不能过大,否则因为非特异结合所导致的假阳性增多 选用更适宜的限制性内切酶以构建适用于双杂交体系的是综 合提高双杂交技术的一个重要方面。
改进
•4.利用酵母交配(yeast mating)可以很方便地将两种不 同的质粒转入同一酵母菌株。据此已发展出一套快速鉴 定假阳性的方法。 •5.体内进行的双杂交检测往往需要体外的其他方法来验 证。
常见问题
•2.如果诱饵蛋白DBD-X能直接激活报告基因的表达,该如 何处理? •该蛋白很可能有转录激活域,是个转录因子。可以通过 基因重组切掉转录激活域,然后重新检测其是否自激活, 但要注意重组也有可能破坏蛋白之间的互作。
常见问题
•3.转化效率太低怎么办? •可以采用以下方法解决: 1) 检测一下DNA的纯度,如果可以的话,重新用乙醇纯 化。 2) DNA-BD很可能是有毒的。 3) 不适当的培养基,重新配制培养基,并做对照转化。 4) 共转化或者单独转化
酵母双杂交酵母单杂交酵母三杂交课件

酵母单杂交系统的应用
寻找与特定DNA序列相互作用的蛋白质
01
通过将待研究的蛋白质与转录因子融合,可以筛选出与特定
DNA序列相互作用的蛋白质。
研究蛋白质的功能
02
通过分析蛋白质与DNA的相互作用,可以深入了解蛋白质的功
酵母杂交技术的发展趋势
操作简便化
随着技术的发展,酵母杂交技术 的操作将越来越简便,使得更多 的实验室和研究人员能够利用该
技术进行研究。
应用广泛化
随着研究的深入,酵母杂交技术 的应用范围将越来越广泛,不仅 局限于蛋白质之间的相互作用研 究,还可以应用于转录因子活性
等方面的研究。
系统化与自动化
未来,随着技术的发展,酵母杂 交技术将逐渐实现系统化和自动 化,进一步提高实验的准确性和
该方法基于真核生物的转录调控机制,通过将两个蛋白质的 编码基因分别与酵母的转录激活因子基因GAL4的N端和C端 融合,形成两个融合蛋白,再观察这两个融合蛋白在酵母细 胞中的相互作用对转录的影响。
酵母双杂交系统的应用
基因表达调控研究
药物筛选
通过分析不同条件下蛋白质之间的相 互作用,了解相关基因的表达调控机 制。
酵母三杂交系统
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酵母单Байду номын сангаас交
酵母双杂交的原理及其应用

酵母双杂交的原理及其应用1. 引言酵母双杂交是一种常用的分子生物学技术,可以用于研究蛋白质相互作用、识别蛋白质结构域、筛选靶蛋白等。
本文将介绍酵母双杂交的原理及其在科研和药物研发领域的应用。
2. 酵母双杂交的原理酵母双杂交利用酵母细胞中的转录激活因子(TF)和DNA结合域(DBD)的相互作用来探测蛋白质的相互作用。
该技术主要包括两个重要组成部分:诱饵(bait)与猎物(prey)。
2.1 诱饵(bait)诱饵通常是感兴趣蛋白质的DNA结合域(DBD),可以通过基因工程方法将其与转录激活因子(TF)融合,并构建到酵母细胞中。
2.2 猎物(prey)猎物是待测蛋白质,可以将其与激活域融合,并构建到酵母细胞中。
2.3 相互作用检测当诱饵与猎物相互作用时,其融合蛋白质能够形成转录激活复合物。
该复合物能够通过激活报告基因(如LacZ或荧光蛋白)的表达来检测相互作用的发生。
3. 酵母双杂交的应用酵母双杂交技术在科研和药物研发领域有广泛的应用。
3.1 蛋白质相互作用的研究酵母双杂交技术可以用于筛选和验证蛋白质相互作用的目标。
通过构建不同的诱饵和猎物,可以识别和验证蛋白质相互作用的蛋白质。
3.2 靶蛋白筛选酵母双杂交技术可以用于筛选潜在的靶向蛋白质。
通过将蛋白质库(library)与诱饵进行组合,可以筛选出与诱饵相互作用的猎物,进而识别潜在的靶向蛋白质。
3.3 药物研发酵母双杂交技术可以用于药物研发的初步筛选。
通过将化合物库与诱饵进行组合,可以筛选出与诱饵相互作用的化合物,进而确定潜在的药物候选物。
3.4 蛋白质结构域识别酵母双杂交技术可以用于识别蛋白质的结构域。
通过将蛋白质的不同结构域与诱饵进行组合,可以确定某个结构域的相互作用蛋白质。
4. 结论酵母双杂交是一种有效的蛋白质相互作用研究方法,广泛应用于科研和药物研发领域。
通过酵母双杂交技术,可以识别蛋白质相互作用、筛选靶蛋白等,为蛋白质相关研究和药物研发提供了有力的工具。
酵母双杂交技术流程

酵母双杂交技术流程
酵母双杂交技术是一种用于鉴定蛋白质相互作用的实验方法,它可以识别某个蛋白质与其他蛋白质之间的相互作用关系。
以下是酵母双杂交技术的流程:
1. 构建酵母菌株:将感兴趣的两个蛋白质编码序列分别克隆至酵母表达载体中,并插入适当的启动子和终止子后,将其转化至酵母细胞中,并筛选出正确的菌株。
2. 转化酵母菌株:将构建好的酵母菌株分别转化至两个含有互补杂交部位的酵母菌株中,使其产生可杂交的菌株。
3. 筛选正面杂交菌株:通过选择菌株在适当培养基中的生长情况或染色体特征,筛选出正面杂交的菌株。
4. 验证杂交结果:通过进一步实验验证杂交结果的准确性,例如,利用质粒转染或重组DNA重组实验等方法。
5. 鉴定蛋白质相互作用:最终确定两个蛋白质之间的相互作用关系,并进一步研究其生物学意义。
- 1 -。
酵母双杂交系统步骤

酵母双杂交系统的步骤酵母双杂交法的原理:典型的真核生物转录因子,如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域:DNA结合结构域和转录激活结构域。
前者可识别DNA上的特异序列,并使转录激活结构域定位于所调节的基因的上游,转录激活结构域可同转录复合体的其他成分作用,启动它所调节的基因的转录。
酵母双杂交法的步骤:1. 阳性克隆的筛选2. 用质粒自然分选法筛除只含有AD-文库杂合子的克隆3. 酵母杂合试验确定真阳性克隆4. 阳性克隆的进一步筛选和确证5. 对双杂交系统阳性结果的进一步研究6. 阳性克隆的筛选7. 用质粒自然分选法(Natural Segregation)筛除只含有AD-文库杂合子的克隆8. 酵母杂合试验(Yeast Mating)确定真阳性克隆9. 阳性克隆的进一步筛选和确证扩展资料:酵母双杂交系统能在体内测定蛋白质的结合作用,具有高度敏感性。
主要是由于:1、采用高拷贝和强启动子的表达载体使杂合蛋白过量表达。
2、信号测定是在自然平衡浓度条件下进行,而如免疫共沉淀等物理方法为达到此条件需进行多次洗涤,降低了信号强度。
3、杂交蛋白间稳定度可被激活结构域和结合结构域结合形成转录起始复合物而增强,后者又与启动子DNA结合,此三元复合体使其中各组分的结合趋于稳定。
4、通过mRNA产生多种稳定的酶使信号放大。
同时,酵母表型,X-Gal及HIS3蛋白表达等检测方法均很敏感。
在研究蛋白质的结构功能特点、作用方式过程中,有时还要通过突变、加抑制剂等手段破坏蛋白质间的相互作用。
针对实际工作中的这种需要,Vidal等人发展了所谓的逆双杂交系统(reverse two-hybrid system)。
这项技术的关键是报道基因URA3的引入。
URA3基因在这里起到了反选择的作用,它编码的酶是尿嘧啶合成的关键酶。
酵母双杂交

酵母双杂交随着分子生物学研究的迅猛发展与人类基因组计划的完成, 基因工程领域的研究已从结构基因组时代走进了功能基因组时代。
功能基因组学的主要任务就是对生物基因组中包含的全部基因及其所翻译的蛋白质的功能加以解读和描述, 尤其是大量未知基因的功能及其相应蛋白质产物的功能。
系统综合分析蛋白- 蛋白相互作用将为了解蛋白质的功能提供重要的信息。
酵母双杂交是目前研究蛋白-蛋白相互作用的所有方法中较为简便、灵敏和高效的一种方法。
它是利用酵母遗传学方法在真核细胞体内研究蛋白质之间相互作用的非常有效的分子生物学技术, 可有效地用来分离能与一种已知的靶蛋白相互作用的蛋白质的编码基因。
酵母双杂交技术的可行性和有效性在验证已知蛋白质之间的相互作用或筛选与靶蛋白特异作用的诱饵蛋白的研究中已被广泛的得到证实。
随着人类、水稻和拟南芥等模式生物基因组测序的完成, 酵母双杂交及其衍生的相关技术将在蛋白质组学、细胞周期调控、细胞信号转导和肿瘤基因表达等领域的研究中发挥着越来越重要的作用。
一、酵母双杂交原理蛋白的酵母双杂交实验是以酵母的遗传分析为基础,研究反式作用因子之间的相互作用对真核基因转录调控影响的实验。
很早就已知道,转录活化蛋白可以和DNA上特异的序列结合而启动相应基因的转录反应。
这种DNA结合与转录激活的功能是由转录活化蛋白上两个相互独立的结构域即DNA结合结构域(Binding Domain, BD)和转录活化结构域(Activation Domain, AD)分别来完成的,并且这两个结构域对于基因的转录活化都是必须的。
二、酵母双杂交的系统酵母双杂交常用的有两种系统,第一种为LexA系统:DNA结合结构域由一个完整的原核蛋白LexA构成,转录活化结构域则由一个88个氨基酸的酸性的大肠杆菌多肽B42构成,它在酵母中可以活化基因的转录; 第二种为Gal4系统:BD和AD分别由Gal4蛋白上不同的两个结构域(1-147aa与768-881aa)构成。
酵母双杂交

报告基因
LacZ
reporter - Blue/White Screening HIS3 reporter - Screen on His+ media (usually need to add 3AT to increase selectivity) LEU2 reporter - Screen on Leu+ media ADE2 reporter - Screen on Ade+ media URA3 reporter - Screen on Ura+ media (can do negative selection by adding FOA)
酵母双杂交模型
Bait Protein Prey Protein DNA-Binding Domain DNA-Binding Site
Transcription Activating Region
Reporter Gene
酵母双杂交系统的实验基本过程筛选的步骤 将待测基因与Gal4或LexA或其他合适蛋白
参考文献
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X-gal
blue color
We'll start by making transformed yeast expressing X
Fishing with the yeast two-hybrid system
b a it
p r o t e in X
c D N A f o r X
DNAbinding domain
W e w i l l u s e X a s b a i t . . . . t o t r y t o c a t c h Y .
As reference in this description, here is how the yeast two-hybrid expression system works.
Fishing with the yeast two-hybrid system
in other words is there a protein Y?
bait
X
p r e d a to r
Y
d o e s X b in d w ith a p ro te in ?
To find out we are going to go fishing with the two-hybrid system.
y e a s t p la s m id e x p r e s s io n v e c to r
p re d a to r
u n k n o w
tis s u e
bait
X
p r e d a to r
Y
d o e s X b in d w ith a p ro te in ?
t r a n s f e c t i o n t o t a l m R N A
t r a n s f e c t i o n
activation dom ain
Now we'll make transformed yeast expressing Y, if Y
does indeed exist.
Fishing with the yeast two-hybrid system
猎物或靶蛋白 (prey or target
protein)
这个被激活的、能显示“诱饵”和“猎 物”相互作用的基因称为报道基因 (reporter gene)
X
Ga14 的DB
Y
Ga14 的AD 猎物(prey)
诱饵(bait)
报道基因
表达
报道基因的 基因产物
通过对报道基因表达产物的检测,反过来可判别作为“诱 饵”和“猎物”的两个蛋白之间是否可存在相互作用。
酵母双杂交技术
主要内容
一 酵母双杂交技术的基本原理 二 酵母双杂交技术的应用 三 酵母双杂交技术的改造 四 结束语
一 酵母双杂交技术的基本原理
酵母双杂交系统的建立基于“真核生物调控转录起始”。
酵母转录子Gal4分子由一条多肽链组成,含有881个氨 基酸。它有两个结构域: 1、 DNA结合结构域(DNA binding domain, DB )由位于 N-末端1~147个氨基酸构成,能识别位于Gal 1基因的上游激 活序列(UAS, upstream activating sequence),此外, 在其N-端还具有一段核定位序列; 2、转录激活结构域(activation domain, AD)由位于C-末 端的768~881位氨基酸构成。
Fishing with the yeast two-hybrid system
b a it
p r o t e in X
c D N A f o r X
bait
X
p r e d a to r
Y
d o e s X b in d w ith a p ro te in ?
DNAbinding domain
X
y e a s t p la s m id e x p r e s s io n v e c to r
bait
XY
prey
t r a n s f e c t i o n
tra n s fo rm e d y e a s t
transcription machinery
lac 2
-galactosidase
r e v e r s e t r a n s c r i p t a s e
X
tra n s fo rm e d
y e a s t
c D N A
tra n s fo rm e d y e a s t
?Y
y e a s t p l a s m i d e x p r e s s i o n v e c t o r
他们以与调控SUC2基因有关的两个蛋白质Snf1和Snf2为模型, 将前者与Ga14的DB结构域融合,另一个与Ga14的AD结构域的酸性区 域结合。(形成融合蛋白)
Snf1
Ga14 的DB
诱饵 (bait)
Snf2
Ga14 的AD
如果Snf1和Snf2之间存在相互作用, 那么分别位于这两个融合蛋白上的DB和 AD就能重新形成有活性的转录激活因子, 从而激活相应基因的转录与表达。
C N
UAS
768~881 AD
Gal 1基因
激活转录
不同转录激活因子的DB和AD形成的杂合蛋白仍然具有正 常的激活转录的功能。
融合
结合到 Ga14结合
位点
DB
酵母细胞的 Ga14蛋白的DB
AD
大肠杆菌的一 个酸性激活结
构域B42
激活转录
DB AD
DB ADUASG源自l 1基因激活转录Fields等人的工作标志双杂交系统的正式建立
b a it
p r o t e in X
常用的报告基因有:HIS3,URA3,LacZ 和ADE等。如HIS3,可以通过该基因是否 表达在选择性培养基上筛选含有相互作 用蛋白的酵母;LacZ基因(β-半乳糖苷 酶基因),在X-Gal存在时利用它的颜色 反应对选择培养筛出来的阳性克隆作进 一步筛选。并可通过测定颜色反应的强 弱,分析蛋白X、Y间的相互作用的强弱 。
当Gal4 的两个结构域位于不同肽链上,只要它们在空 间上充分接近,则能够恢复Gal4作为转录因子的活性.
酵母转录子Gal4分子
DB(DNA binding domain ) 1-147
768~881
C
AD (activation domain)
N
UAS(上游激活序列G) al 1基因
DB 1~147