菌种的来源
发酵工程菌种的来源及选育

细菌分离:以乳酸菌为例
放线菌的分离
(一)采样
菜园土或林地土
土壤中放线菌最丰富,品种齐全。 可以筛选新的放线菌。
从堆肥或过热的材料中如干 草或蔗渣中可分离到大量的嗜热 放线菌,从淡水和海洋环境中分 离到嗜碱性的和嗜酸性的菌种。
自然风干,备用
气生孢子能耐干燥,耐湿热能力 高于营养体,室温保存20天, 放线菌的数量和组成变化不大, 细菌大部分死亡。
(二)生态学参数及培养基的组成原则
1、加入培养基中的天然提取物种类和用量、环境生物物 理学参数以及用于平板涂布分离样本的溶剂都会影响 实验中所要分离的细菌的数量和种类。
2、就分离培养基的组成而言,部分培养基中必须含有 10-50%的天然提取物。加入培养基中的天然提取物, 部分培养基中则应含有多种碳、氮源,如几丁质、纤 维素或果胶。
随机分离原理与技术
从产物入手,通过设计高产培养基和建立快速 灵敏专一的筛选方法,从随机分离的菌落中筛 选出所需的目的菌。
技术关键:产物合成条件的选择与控制及相应 筛选方法的确定。
随机分离技术举例
药理活性化合物产生菌的筛选
药理活性化合物是指能抑制人类代谢中某一 个关键酶的微生物产物即酶抑制剂,从而达到 治疗的目的。
样本采集时所需的工具通常有无菌刮铲、土样采集器、 镊子、解剖刀、手套、无菌小塑料袋和塑料瓶等。
采样的注意事项
1、采样时应尽可能保持相对无菌; 2、所采集的样本必须具有某种代表性; 3、采好的样必须完整地标上样本的种类及采集日期、
地点以及采集地点的地理、生态参数等; 4、应充分考虑采样的季节性和时间因素,因为真正的
(2)化学法
通过培养基中添加某些化学成分来增加微生物的数量。 如:用添加CaCO3稳定培养基的PH来分离嗜碱性的放线菌。
微生物遗传育种的 第三章——菌种的分离筛选

第三章菌种的分离筛选● 1.菌种来源● 2.分离方法● 3.菌种保藏● 4. 菌种复壮典型的微生物新种分离筛选过程第一节菌种来源1.向菌种保藏机构索取有关菌株,从中筛选所需菌株。
国内主要菌种保藏机构:●AS—中国科学院微生物研究所●CMCC—中国医学细菌保藏管理中心●CVCC—兽医微生物菌种保藏管理中心●IA—中国医学科学院抗菌素研究所●IANP—华北制药厂抗菌素研究所●ID—中国医学科学院皮肤病防治研究所、●CAMS—中国医学科学院流行病学微生物研究所●IFFI—轻工业部食品发酵工业科学研究所等。
国外主要的菌种保藏机构●ATCC—美国标准菌种收藏所●NIH—美国国立卫生研究院●NRRL—美国农业部北方开发利用研究所●CMI—英联邦真菌研究所,CSH—美国冷泉港实验室●IAM—日本东京大学应用微生物研究所,IFO—日本大阪发酵研究所,KCC—日本科研化学有限公司,●NCTC—英国国立标准菌种收藏所●WB—美国威斯康星大学细菌学系等。
2.由自然界(土样、水、动植物体等)采集样品,从中进行分离筛选。
不可培养微生物是指目前尚不能实现人工培养的微生物。
原因可能为尚不了解该类微生物的营养需求和生长需要的理化环境。
目前人类认识和培养的微生物还不到其存在种类的1%。
3.从发酵制品中分离目的菌株。
如从酱油中分离蛋白酶产生菌,从酒醪中分离淀粉酶或糖化酶产生菌等。
采样过程(一)从土壤中采样要考虑土壤的有机质含量和通气状况、酸碱度和植被状况、地理条件和季节条件。
用采样铲采集5-25cm(北方干燥的土壤,采集10-30cm)土样10-25g,装入事先准备好的塑料袋内扎好,并编号,记录采集地点、土壤质地、植被名称、采集时间等。
土样采集后要尽快分离,否则可取3-4g撒到事先准备好的选择性培养基试管斜面,避免菌株因不能及时分离而死亡。
根据微生物生理特点采样1.根据微生物营养类型采样(1)微生物的营养要求和代谢类型与其生长环境有很大的相关性森林土壤富含纤维素,可分离纤维素酶产生菌;肉类加工厂附近和饭店排水沟的污水、污泥中,能分离到蛋白酶和脂肪酶产生菌;面粉加工厂、糕点厂、酒厂及淀粉加工厂等,容易分离到产生淀粉酶和糖化酶的菌株;从果园土和腐烂的柑橘、草莓及山芋中,容易分离到果胶酶产生菌。
第二章菌种选育3

基同步培养离心洗涤玻璃珠震荡分散过滤
单细胞或孢子悬浮液
诱
活菌计数
诱变处理 诱变处理预备实验
变
处理液活菌计数 平板分离
育
形态变异并计算其变异率
种
斜面培养
初筛、复筛 自然分离和再复筛
保藏及扩大试验
• 出发菌株的选择 • 诱变剂的选择 • 诱变操作(包括诱变剂量的选择) • 突变株的筛选 • 突变高产菌的表现及筛选条件的配合
步骤七
由第五步骤的第一区中划出第二区,如右上 图。
步骤八
重复第六以及第七步骤,由第七步骤的第二区中 划出第三区,如右上图。
步骤九
重复第六以及第七步骤,由第八步骤的第三区 中划出第四区,划满剩下的空间。完成后的营 养平板,如右上图。
步骤十
在营养平板上贴好标签, 标示好接种日期、操作者 姓名、菌种学名以及培养 基名称。
初筛:以量为主 复筛:以质为主
二、诱变育种
用各种物理、化学的因素人工诱发基因突 变。 诱变剂:能够提高生物体突变频率的物质。
诱变剂
物理:紫外线,快中子 化学:硫酸二乙酯,亚硝基胍 生物:噬菌体
诱变育种的主要环节 (1)以合适的诱变剂处理细胞悬浮液
——诱变 (2)用合适的方法淘汰负效应变异株,
选出性能优良的正变异株——筛选
变异株 代谢控制育种
基因工程定向育种
微生物工业对大规模生产用菌的要求原则:
(1)所需培养基易得,价格低廉; (2)培养和发酵条件温和(糖浓度、温度、pH、
溶解氧、渗透压等) (3)生长速度和反应速度较快,发酵周期短 (4)单产高 (选择野生型、营养缺陷型或调节
突变株)
(5)抗病毒能力强 (6)菌种纯粹,不易变异退化,稳定性好 (7)菌体不是病源菌,不产生任何有害的生
第二章生产菌种的来源

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工业发酵菌种必须具备的基本特征
能在廉价原料制成的培养基上迅速生长,并能生成较 多的发酵产物; 培养条件如温度、渗透压等易于控制; 抗杂菌和抗噬菌体能力较强; 遗传稳定性高、不易退化; 不产生有害的生理活性物质或毒素(食品或医药微生 物菌株)
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4、性能测定(毒性试验)
自然界的一些微生物在一定条件下会产毒; 除啤酒酵母、脆壁酵母、黑曲霉、米曲霉和枯草杆菌作 为食用无须作毒性试验外,其他均需 2年以上的毒性试 验; 医药卫生上的产品,还须通过安全试验和临床试验,获 得国家的药品生产许可证,方能使用; 生产性能测定; 生理生化特性、发酵周期、产品品种和产量、温度、 pH值、提取工艺等; 经自然界分离筛选获得的有价值的菌种进一步进行人工 选育。
具体方法: 在固体选择培养基中加入酶作用的底物培养微生物,能够 利用此底物的酶产生菌得以生长,并且往往会在其菌落周 围形成一透明圈。 透明圈的大小与酶活力的高低成正相关,可以作为菌种初 筛的判断标准。 如:蛋白酶、脂肪酶、果胶酶、甘露聚糖酶、淀粉酶、纤 维素酶等
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目的微生物筛选方法的研究进展 目前土壤中能够培养的微生物不到总数的1%。 微生物的多样性及资源的开发仍然是今后若干 年的研究重点。 --陈文新院士 分子生物学的实验手段,在微生物鉴别及特定 目标产物的筛选方面发挥了着越来越重要的作 用。如 :16SRNA同源性分析,基因序列分析及 DNA/DNA杂交技术等。
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几种重要生物活性物质产生菌的分离方法 抗病毒药物产生菌:用小平板测定由病毒引起的细胞 变性效果,是一种有用的筛选方法;检测病毒复制中 特有的DNA复制酶和核酸合成酶的酶抑制剂,是另一 种选择性更高的筛选方法。
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生长因子产生菌:通过观察分离菌能否促进营养 缺陷型菌株的生长来检出。 免疫激活剂产生菌:可以用细胞表面酶的抑制法, 筛选免疫激活剂产生菌; 多糖产生菌:可以通过菌落外观的观察来识别 (黏稠)
怎样种植菌类

怎样种植菌类种植菌类需要准备好适当的菌种,合适的培养基和相应的培养条件。
下面将详细介绍种植菌类的步骤和注意事项。
一、选择适当的菌种1. 菌种来源:可以选择自然界中的菌株、购买商业菌种或从其他实验室获取。
2. 菌株纯化:从菌落或分生孢子开始,通过无菌操作将单株菌落转接到新的培养基上,得到纯化的单菌落。
二、制备培养基1. 培养基种类:常用的培养基有琼脂培养基、液体培养基和固体培养基等。
根据不同的菌种选择合适的培养基。
2. 培养基成分:培养基成分包括碳源、氮源、矿物元素和生长因子等。
可以根据菌种要求进行配方调整。
三、接种方式1. 空气接种:将菌株培养在固体培养基上,利用空气中的孢子或菌丝将菌种传播到新的培养基上。
2. 液体接种:将菌株培养在液体培养基中,通过种子液或发酵液将菌种移植到新的液体培养基中。
四、培养条件1. 温度:不同菌种对温度的要求不同,一般培养温度为20-30。
可以根据菌株的生长速度和适应环境进行调节。
2. pH值:不同菌种对pH值的要求也不同,一般在5-8之间。
需要根据菌株的要求进行调节。
3. 湿度:菌类需要一定的湿度才能正常生长,可以通过添加适量的水分或在培养箱中使用湿度调节器来保持适当的湿度。
4. 光照:大部分菌类对光照要求不高,可以保持适度的暗光环境。
但也有一些菌种对光照有一定的需求,需要根据菌株的要求进行调节。
五、培养器具和消毒1. 培养器具:常用的培养器具包括培养皿、试管、瓶子、无菌棉签、无菌注射器等。
需要使用无菌器皿和无菌操作工具,避免微生物的污染。
2. 消毒:培养器具在使用前需要进行消毒处理,常用的消毒方法有高温蒸汽灭菌、化学消毒和紫外线照射等。
六、菌落观察与保存1. 菌落观察:菌株生长一段时间后,可以观察其在培养基上的菌落形态、颜色等特征,以及菌丝的生长情况。
观察菌落可以对菌株进行鉴定和分类。
2. 菌株保存:可以通过冷冻保存、干燥保存或分生孢子保存等方法对菌株进行长期保存,以备后续使用。
《菌种的来源》PPT课件 (2)

代谢控制发酵:用人工诱变的方法,有意识地改变微生 物的代谢途径,最大限度地积累产物,这种发酵形象地 称为代谢控制发酵,最早在氨基酸发酵中得到成功应用。
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菌种的来源
❖ 已工业化产品生产菌的介绍
AK:天冬氨酸激酶
HD:高丝氨酸脱氢酶 HT:高丝氨酸转乙酰酶
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菌种的来源
❖ 菌株选育、分子改造
自然选育在工业生产上的意义
问题: 高产菌株是正突变高,还是负突变高?
回复突变:高产菌株在传代的过程中,由于自然突变导致 高产性状的丢失,生产性能下降,这种情况我们称为回复 突变 自然选育虽然突变率很低,但却是工厂保证稳产高产的 重要措施。
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菌种的来源
❖ 菌株选育、分子改造
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菌种的来源
❖ 菌株选育、分子改造
DNA shuffling
Fragment
Reassemble
Select best
with DNAseI
X
X
XXX
XX
X
XX
fragments
XXX
X
X
XX
recombinants
XXX
X
XXX X
XXX X
XXX X
XX XXX X X X X X
XX X
X
自然选育操作步骤: 一般习惯上将自然选育称为菌种的分离纯化。 单细胞(孢子)悬液的制备 平板分离
挑选单菌落(注意形态的观察)
发酵试验
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菌种的来源
❖ 菌株选育、分子改造
二、诱变育种
用各种物理、化学的因素人工诱发基因突变进行的筛选, 称为诱变育种
菌种来源

2.1.1.2 待筛选样品的性质
2.l.1.3 筛选方案的设计 基本上可利用以下三种不同的筛选方法 1)整体生物; 2)完整细胞; 3)亚细胞制剂。
2..1.2微生物选择性分离的原理和发展
在过去40年间曾筛选出许多产生新的有用的次级 代谢物的菌种。这些菌种多半是以经验式的筛选方法 获得的。大多数的抗生素均由放线菌纲产生。下面介 绍放线菌纲为主的分离方法原理和发展。 选择性分离方法大致可分为五个步骤: 含微生物材料的选择;材料的预处理;所需菌种的 分离;培养;菌落的选择和纯化。以上任何一个阶段 都可引入选择压力。
通常采用膜过滤法浓缩水中的细胞。然后将滤膜 置于培养基的表面,放置乃个小时后移去,或一直留 在上面。滤膜的品种对收集菌的类型有重要的影响, 如处理放线菌繁殖体含量很低的海水,有人先将样品 离心然后才过滤。
收集在腐烂的稻草和其它植物材料中的嗜热放线 菌孢子可在空气搅动下进行。并可用-风筒或一简单 的沉淀室收集孢子。然后,用Anderson取样器将空气 撞击在培养基的平板上。这样可以减少分离平板中的 细菌数目。
2.1.3.l 施加选择压力的分离方法
A 富集液体培养 富集培养是指能增加混合菌群中所需菌株的数量 的一种技术。方法的要领是给混合菌群提供一些有利 于所需菌株生长或不利于其他菌型生长的条件。通过 把富集培养物接种到新鲜的同一种培养基可以重新建 立选择压力。重复移植几次后接种少量已富集的培养 物到固体培养基上。这里,移种的时间是关键,应在 所需菌种占优势的情况下移种。
产生菌及其产物的毒性必须考虑(在分类学上最好与致病 菌无关) 生产特性要符合工艺要求
2.1菌种的来源 2.1.1 生物物质产生菌的筛选 2.1.l.1 微生物——生物产物的来源 微生物现在和将来都是具有各种生物活性的 新产物的丰富资源。这一章的目的是要研究如 何才能筛选到具有所需生物特性的新产物。除 了初级代谢产物,如氨基酸和维生素外,微生 物还用于生产许多次级代谢产物。筛选这类产 物的两个成功要素在于 1)产生菌的选择; 2)采用什么样的筛选方案(检测系统)。 选择筛选方法有两个要点即选择性和灵敏度。
第二章 生产菌种的来源

4、其他防线菌生产的抗生素
其他生产的抗生素的防线菌有: 诺卡氏 其他生产的抗生素的防线菌有 : 菌 形 放 线 菌 ( Nocardioform Actinomycetes ) 、 游 动 放 线 菌 ( Actinoplanetes ) 及 足 分 枝 菌 (Maduromyetes)。
5、青霉属(Penicillum) 青霉属(
6、粘细菌(Myxobacteria) 粘细菌(
粘细菌次级代谢产物中抗菌活性物质的检 出率非常高,并且许多都是新发现的抗生素。 出率非常高 , 并且许多都是新发现的抗生素 。 如纤维素堆囊菌( 如纤维素堆囊菌 ( Sorangium cellulosum ) 产 生的大环内酯类抗生素堆囊菌素、 生的大环内酯类抗生素堆囊菌素、
四、有机酸
柠檬酸 :黑曲霉 ,酵母 (解脂假丝酵母 、解脂 复膜孢酵母季也蒙假丝酵母 ) 乳酸 :德氏乳杆菌 、赖氏乳杆菌 、植物乳杆 菌 、米根霉 苹果酸 :黄曲霉 、米曲霉 、寄生曲霉 、华根 无根根霉、 霉 、无根根霉、膜醭毕赤酵母 衣康酸 :土曲霉 、衣康酸曲霉、假丝酵母S-10 衣康酸曲霉、假丝酵母S
青霉菌属于腐生菌, 青霉菌属于腐生菌,广泛生存于土壤和 腐败的水果和蔬菜中。 腐败的水果和蔬菜中。 由于第一个工业化生产的抗生素青霉素是 中发现的, 由青霉属中的Penicillum notatum中发现的, 至今青霉素极其半合成抗生素仍是产量最大、 至今青霉素极其半合成抗生素仍是产量最大、 用途最广的抗生素, 用途最广的抗生素,因此青霉素在抗生素工 业中具有特别重要的地位。 业中具有特别重要的地位。
纤维素酶
纤维素酶是降解纤维素生成葡萄糖的一组酶的 总称。它不是单种酶, 总称。它不是单种酶,而是起协同作用的多组分 酶系。 酶系。 纤维素酶是由绿色木霉、康氏木霉、黑曲霉、 纤维素酶是由绿色木霉、康氏木霉、黑曲霉、 青霉和根霉等菌株经深层发酵制成的酶制剂产品。 青霉和根霉等菌株经深层发酵制成的酶制剂产品。 此外,漆斑霉、反刍动物瘤胃菌、嗜纤维菌、 此外,漆斑霉、反刍动物瘤胃菌、嗜纤维菌、产 黄纤维单孢菌、侧孢菌、黏细菌、 黄纤维单孢菌、侧孢菌、黏细菌、梭状芽孢杆菌 等也能产生纤维素酶。 等也能产生纤维素酶。
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BCRC 台湾生物资源保藏研究中心,台湾新竹
长江大学生科院生物工程系
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国外菌种保藏机构
ATCC(American Type Culture Collection)美 国典型菌种保藏中心 NBRC (NITE Biological Resource Center)日本 技术评价研究所生物资源中心 NRRL (Agricultural Research Service Culture Collection) 美国农业研究菌种保藏中心 CBS (Centraalbureauvoor Schimmelcultures) 荷兰微生物菌种保藏中心 UKNCC (The United Kingdom National Culture Collection ) 英国国家菌种保藏中心
2018年10月18日星期四
ISF 中国农业科学院土壤肥料研究所 CACC 抗菌素菌种保藏管理中心 SIA 四川抗菌素工业研究所 AS 中国科学院微生物研究所 CFCC 林业微生物菌种保藏管理中心 CICC 工业微生物菌种保藏管理中心 CMCC 医学微生物菌种保藏管理中心 NICPB 卫生部药品生物制品监察所 CVCC 兽医微生物菌种保藏管理中心 YM 云南省微生物研究所 CCTCC 中国典型培养物保藏中心 CMBGCAS 海洋微生物中心 CUHK 香港中文大学保藏中心
国内菌种保藏机构27
ACCC 中国农业微生物菌种保藏管理中心 SH 上海市农业科学院食用菌研究所 IA 中国医学科学院抗菌素研究所 CGMCC 普通微生物菌种保藏管理中心 AS-IV 中国科学院武汉病毒研究所 CAF 中国林业科学院菌种保藏管理中心 IFFI 轻工业部食品发酵工业科学研究所 ID 中国医学科学院皮肤病研究所 IV 中国医学科学院病毒研究所 CIVBP 中国兽医药品监察所 GIMCC 广东省微生物研究所微生物菌种保藏中心 CCDM 华中农业大学菌种保藏中心 HKUCC 香港大学保藏中心
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人工诱变 的菌株不 能合成 反 馈 抑
高丝氨酸脱氢酶
不能合成
可以大量 积累
制
2018年10月18日星期四
人工诱变控制黄色短杆菌 长江大学生科院生物工程系 的代谢过程生产赖氨酸P459
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氨基酸生产菌的要求: 代谢途径比较清楚; 代谢途径比较简单。 谷氨酸发酵的菌种: 棒杆菌属,短杆菌属、节杆菌属或小 杆菌属的棒型细菌。 其它氨基酸生产菌:常规菌种一般是以谷氨酸生产菌选 育而成;大肠杆菌,枯草芽孢杆菌, 工程菌。
初级代谢和次级代谢异同?
1 概念不同 2 产物不同 3 存在范围不同 4 对微生物的作用不同 5 同微生物生长过程的关系 6 对环境条件的敏感性或遗传稳定性上明 显不同 7 相关酶的专一性不同 8 两者既有区别性又有连续性
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 5
2、氨基酸生产有关的微生物
50、60年代以氨基酸发酵为代表的代谢控制发酵, 是发酵工业发展历史上的一个转折点。
代谢控 制发酵
用人工诱变的方法,有意识地改变微生物 的代谢途径,最大限度地积累产物,这种发酵
形象地称为代谢控制发酵,最早在氨基酸发酵 中得到成功应用。
2018年10月18日星期四
长江大学生科院生物工程系
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二、微生物材料的标本采集
遵循原则:材料来源越广泛,越有可能获得新的菌种 一般通过以下途径获得菌种: ①向菌种保藏机构索取有关菌株; ②由自然界采集样品,如土壤、水、动植物体等; ③从一些发酵制品中分离目的菌株,如从酱油中分离 蛋白酶产生菌,从酒醪中分离淀粉酶或糖化酶的产生 菌。
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 12
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 8
3、酶制剂生产有关的微生物
利用微生物来进行酶制剂生产是19世纪日本人用曲霉 通过固体培养生产他卡淀粉酶,而大规模工业化生产则始 于20世纪40年代末日本用深层发酵法生产α —淀粉酶。
α—淀粉酶:黑曲霉、米曲霉、枯草芽孢杆菌 和地衣芽孢杆菌等; β-淀粉酶:米曲霉、巨大芽孢杆菌、腊状芽孢杆菌等; 纤维素酶:木霉、青霉; 蛋白酶:黑曲霉、米曲霉、枯草芽孢杆菌、灰色链霉菌等。
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 1
内容速览
2.2目的微生 物的分离 2.1工业化 菌种的要 求及介绍 1自然 选育
2.3菌 种选育 (链)
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系
2诱变 育种
2
§1 工业化菌种的要求及
已工业化产品生产菌介绍
一、工业化菌种的要求 P51
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 9
返回
§2 自然界程 二、微生物材料的标本采集 A、不同的土壤特点 B、地理和气候条件 C 、微生物的生理特性 D 、极端环境条件下采样分离 三、标本的预处理 四、目的微生物富集的一些基本方法
2018年10月18日星期四
二、已工业化产品生产菌介绍
1、抗生素生产有关的微生物
抗生素是次级代谢产物P40,需要生物体进行复杂的代 谢,目前发现的生物来源如下:
放线菌(链霉素、四 环素、红霉素等) 真菌(青霉素、头孢菌素等)
一些产芽孢的细菌(多 黏菌素、丁胺菌素等) 植物或动物来源(蒜素、番 茄素、鱼素等)
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 4
第二章 菌种的来源(4学时)
教学目的:了解工业化菌种的要求以及一些工业化生
产菌介绍;了解菌种分离的一般过程;掌握土样采集应注 意的问题,菌种的分离方法;掌握优良菌种应具备的基本 特性和菌种的选育。
教学重点、难点:土样采集应注意不同的土壤特点
、地理和气候条件,土样的采集方法; 生化反应分离法; 诱变育种。
能在廉价原料制成的培养基上生长,且大量高效地合成产物;
遗传性能要相对稳定;
菌种改造的可操作性要强;
抗噬菌体及杂菌污染能力强;
产生菌及其产物的毒性必须考虑(在分类学上最好 与致病菌无关);
发酵条件如温度、pH、溶解氧、泡沫等易控制。
2018年10月18日星期四 长江大学生科院生物工程系 3
五、菌种分离
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一、菌种分离的一般过程 P14
标本采集 → 预处理 → 富集培养 → 菌种分离(初筛、复筛) → 发酵性能鉴定 → 菌种保藏 目的:高效地获取一株高产目的产物的微生物 问题: 如何使样品中所含微生物的可能性大? 如何在后续的操作中使这种可能性实现?
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