比较基因组学与分子进化

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遗传基因组与生物进化之间的关系

遗传基因组与生物进化之间的关系

遗传基因组与生物进化之间的关系引言:生物进化是生物多样性产生和维持的重要机制,而基因组是生物进化的基础。

基因组可被视为生物体遗传信息的储存库,其中包含了决定生物形态、功能和行为特征的基因序列。

通过研究基因组的结构和功能,我们可以更好地理解生物进化的主要驱动力及其对物种形成和适应的影响。

一、基因组的结构与生物体的遗传特征基因组是由基因和非编码DNA序列组成的。

基因是DNA的一个部分,其中包含了编码蛋白质所需的信息。

基因决定了生物体的遗传特征,如外貌、身体构造和代谢功能等。

因此,基因组的结构与生物体的遗传特征密切相关。

基因组的结构也决定了遗传信息的传递方式。

在有性生物中,基因组由双亲遗传给后代。

遗传信息的传递过程中,基因组会发生变异,这是生物进化的重要驱动力之一。

基因组的变异可以通过基因重组、基因突变和染色体结构改变等方式产生,从而使物种获得新的遗传特征,进化成适应不同环境的生物体。

二、自然选择与基因组的演化自然选择是指环境中对个体适应度更高的特征更有可能传递给下一代的选择过程。

自然选择是生物进化的主要驱动力之一,它直接作用于个体的基因组。

自然选择通过对适应性特征的筛选,从而改变物种的基因组组成和频率。

当环境条件变化时,个体在生存和繁殖方面的差异会导致基因组在物种群体中的分布发生变化。

适应性特征将越来越常见,而不适应性特征将逐渐消失。

这种基因组的演化可以使物种更好地适应环境,并在漫长的进化过程中产生新的物种。

三、基因组的比较揭示了生物进化的关键点通过比较不同物种的基因组,我们可以揭示生物进化的关键点。

相对于基因组的相似性,基因组的差异更能说明物种之间的远近亲缘关系。

物种间的基因组差异反映了它们在演化历程中的分支点和进化速度。

基因组的比较还可以揭示遗传信息的分子机制,使我们更好地理解基因之间的相互作用、基因调控网络以及基因和环境之间的相互作用。

这些研究不仅提供了基因组演化的重要线索,也为疾病诊断、治疗和基因编辑等应用领域提供了潜在的机会。

分子生物学名词解释

分子生物学名词解释

弱化子是指原核生物操纵子中能显著减弱甚至终止转录作用的一段核苷酸序列,该区域能形成不同的二级结构,利用原核生物转录与翻译的偶联机制对转录进行调节。

分子伴侣是一类序列上没有相关性担忧共同功能的保守性蛋白质,它们在细胞内能帮助其他多肽进行正确的折叠、组装、运转和降解基因家族在基因进化过程中一个基因通过基因重复产生两个或更多的拷贝,这些基因构成一个基因家族,是具有显著性的一组基因,编码相似的蛋白质的产物。

操纵子是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元。

重叠基因具有部分公用核苷酸序列的基因,即同一段DNA携带了不同蛋白质的编码信息。

重叠的序列可以是调控基因,也可以是结构基因的部分。

基因重排是指将一个基因从远离启动子的地方移到距启动子很近的地方从而启动转录的方式。

看家基因(管家基因)在个体的所有细胞中持续表达的基因。

复制子单独复制的一个DNA单元被称为一个复制子,它是一个可移动的单位。

一个复制子在任何一个细胞周期只复制一次。

逆转录以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。

此过程中,核酸合成与转录过程与遗传信息的流动方向相反,故称为逆转录。

逆转录过程是RNA 病毒的复制形式之一,需逆转录酶的催化。

沉默突变(同义突变)是指碱基的改变不引起氨基酸改变的突变。

同工tRNA指几个代表相同的氨基酸,能够被一个特殊的氨酰—tRNA合成酶识别的tRNA.无义突变在DNA序列中任何导致编码氨基酸的三联密码子转变为终止密码子的突变,它使蛋白质合成提前终止,合成无功能的或无意义的多肽。

端粒是存在于真核细胞线状染色体末端的一小段DNA-蛋白质复合体,它与端粒结合蛋白一起构成了特殊的“帽子”结构,作用是保持染色体的完整性和控制细胞分裂周期。

核心启动子是指保证RNA聚合酶II转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点上游 -25 ~ -30bp处的TATA区。

切除修复DNA损伤的一种修复机制,直接切除受损伤的一条DNA片段,以其互补链为模板新合成DNA来取代切除的受损片段。

人类基因组的比较分析

人类基因组的比较分析

人类基因组的比较分析随着科技的不断进步,人类基因组的比较分析已经成为了当今生物医学研究中的一个重要领域。

通过比较不同物种基因组之间的异同,能够帮助我们更好地理解生命的本质,研究疾病的发生机制以及探索生命的起源和进化过程。

本文将探讨人类基因组的比较分析及其应用,从不同的角度探讨这个令人着迷的领域。

1. 基因组的比较分析方法基因组的比较分析主要是通过对不同生物个体基因组的序列进行比较,找出其之间的相似性和差异性。

常用的比较方法包括:(1)比较序列的相似性。

这是最基本的比较方法,可以用来确定两个不同个体之间基因序列的相似性程度。

通过比较相同区域的序列长度、碱基类型、序列位置等指标,可以评估它们的相似性。

(2)比较基因的结构。

除了看基因序列相似性之外,还可以比较基因的结构和功能。

可以通过比较两个基因的外显子、内含子、剪接位点等来评估它们的相似性和差异性。

(3)比较基因组的组成。

不同基因组的组成会存在很大差异,比如基因数目、基因密度、转座子数目等。

通过比较不同基因组之间的组成和结构,可以进一步探索不同物种生命的起源和进化。

2. 人类基因组的比较分析(1)人类基因组与猿类基因组的比较人类与猿类之间的亲缘关系一直是研究者关注的焦点。

通过对人类基因组与猿类基因组的比较,我们可以更好地理解人的起源和进化历程。

近年来,研究者通过对人类、黑猩猩等灵长类动物的基因组进行比较,发现他们之间的基因序列相似度超过99%。

其中,绝大部分变异都出现在非编码区域或者浅层的单核苷酸多态性(SNP)。

虽然人类与猩猩之间基因组序列的差异很小,但正是这些差异使得人类与其他猿类有了不同的性状和生理结构。

(2)人类基因组的功能注释与比较分析目前,人类基因组的大小估计约为3.2亿个碱基对,含有20,000-25,000个基因。

其中,只有2%的DNA序列编码蛋白质,其余则包括内含子、转录调节元件和重复序列等非编码区域。

随着对人类基因组的深入研究,越来越多的研究者开始注重其非编码区域的研究。

基因组学中的比较基因组学方法

基因组学中的比较基因组学方法

基因组学中的比较基因组学方法基因组学是研究生物体的基因组结构、功能、组成及其相互作用的一门科学,其研究对象广泛,涉及到生命科学、医学、生态学等多个领域。

而比较基因组学则是基因组学中的一个分支,它通过比较各物种的基因组序列,揭示各种生物之间的基因演化及其遗传规律,并且研究各种基因的功能、表达、调控等问题。

在这篇文章中,我们将探讨基因组学中的比较基因组学方法。

一、基因组序列比较基因组序列比较是比较基因组学的基础,其主要作用是把不同物种的基因组序列进行比较,找出相同的序列,并且对相同的序列进行分析,从而揭示物种种类关系,共同祖先及其遗传变化等问题。

此外,基因组序列比较还可以为基因组结构和功能阐明提供重要的信息。

基因组序列比较具有以下几个特点:首先,基因组序列比较的算法不断更新,现代的比对算法比以前的更高效和准确,如MAFFT,MUSCLE等。

同时,基于多序列比对的算法也越来越成熟,如PhyML,RAxML等。

其次,基因组序列比较也需要考虑不同物种之间的基因数目和基因的排列顺序的变化,比如基因重复、基因家族和基因结构的演变等问题。

这些问题可以通过整个基因组序列的比较和基因组控制区的分析得到解决。

最后,基因组序列比较还需要考虑序列保守性和易变性的问题,这也是基因组序列比较的难点之一。

在快速进化的物种中,内含子和基因区之间的序列变异率可能非常大,这也需要采用相应的算法和策略来解决。

二、基于基因家族的比较基因组学方法基因家族是指在不同物种中存在多个拥有同样结构或功能的基因,如酪蛋白基因家族和S100基因家族等。

在基因组中,基因家族在不同物种中的数量和序列有所不同,这反映了基因家族的演化过程,因此可以通过研究基因家族的变化来推测基因的演化和基因家族的起源。

基因家族比较的方法有:1. 基因簇的比较:基因簇是指在染色体上连续排列的基因序列,通常由一系列同源基因组成。

基因簇的比较可以揭示同源基因的演化,还可以发现基因家族的新增和丢失等信息。

生物进化中的进化生物学方法

生物进化中的进化生物学方法

生物进化中的进化生物学方法在生物学中,进化生物学是研究生物进化原理和机制的学科。

通过理解生物进化的过程和规律,进化生物学可以揭示物种多样性的形成和演化,并为物种的适应性与存续性提供理论依据。

在生物进化研究中,有多种方法和技术被广泛应用,本文将介绍其中一些重要的进化生物学方法。

1. 系统发育分析系统发育分析是进化生物学的基础方法之一,通过构建生物分类学上的系统发育树,揭示不同物种之间的进化关系。

在系统发育分析中,研究者会收集物种的形态特征、遗传信息或其他相关数据,并使用进化模型和计算方法来推断各个物种之间的亲缘关系。

这些分析结果可以揭示物种的起源、演化路径以及物种之间的共同祖先等关键信息。

2. 比较基因组学比较基因组学研究通过比较不同物种的基因组结构和功能,揭示物种之间的遗传差异和相似性。

在进化生物学研究中,比较基因组学可以帮助我们理解基因在进化过程中的改变和演化,以及这些基因改变如何影响物种的适应性和进化速率等重要问题。

3. 蛋白质结构和功能比较蛋白质是生物体内广泛存在的重要分子,其结构和功能的比较可以揭示物种之间的进化关系。

通过比较不同物种的蛋白质序列以及三维结构,研究者可以了解蛋白质在进化过程中的变化,并推断不同物种之间的功能相似性或差异性。

这种方法通常用于揭示蛋白质功能的起源和适应性进化等问题。

4. 实验进化实验进化是通过在实验室中人为控制环境条件和选择压力,模拟和研究生物在自然环境中的进化过程。

通过实验进化,研究者可以观察和分析不同基因型在不同环境下的适应性和存活能力的变化,进而揭示物种在面对环境改变时的进化机制和适应策略。

5. 比较发育生物学比较发育生物学研究生物个体从受精卵到成体的发育过程中的形态和结构变化,通过比较不同物种的胚胎发育模式和遗传调控机制,揭示物种进化过程中的形态演化和发育调控的改变。

这种方法可以帮助我们理解生物体形态多样性的形成和演化原因。

总结:生物进化中的进化生物学方法涉及到系统发育分析、比较基因组学、蛋白质结构和功能比较、实验进化和比较发育生物学等多个领域。

基因组学的进化研究

基因组学的进化研究

基因组学的进化研究近年来,随着科技的不断进步,基因组学的研究正迅速崛起为生物学领域的热点之一。

基因组学的进化研究,作为其中的重要分支,致力于探究物种之间基因组的演化规律以及相关的生物学意义。

本文将重点探讨基因组学的进化研究的主要内容和方法,并展示了其在生物学领域中的重要意义。

一、基因组学的进化研究内容1. 基因组演化分析基因组演化分析是基因组学的进化研究中的重要内容之一。

通过比较不同物种的基因组序列,在分子水平上研究基因的进化历史,揭示物种之间的亲缘关系以及遗传变异的模式和机制。

这项研究的成果不仅可以帮助我们更好地了解物种的起源和演化过程,还对于研究物种适应环境变化的机制、遗传疾病的发生和进化等方面有着重要意义。

2. 基因组结构和功能研究基因组结构和功能研究是基因组学的进化研究的另一个重要方向。

该研究旨在分析基因组中基因的分布和排列方式,研究基因组中的功能非编码区域,探究这些非编码区域在演化过程中的保守性和功能。

通过这个研究,我们可以了解到不同物种之间的基因组结构的差异和相似性,揭示基因与表型之间的关联性。

二、基因组学的进化研究方法1. 基因组测序技术基因组学的进化研究依赖于高通量测序技术的发展。

通过对不同物种的基因组进行测序,我们可以获取它们的基因组序列信息,为基因组演化以及结构和功能的研究提供数据基础。

目前,常用的测序技术包括Sanger测序、高通量测序和第三代DNA测序等。

2. 生物信息学分析生物信息学分析是基因组学的进化研究中必不可少的方法之一。

通过利用计算机技术进行基因组数据的存储、管理、处理和分析,可以发现隐藏在基因组中的重要信息。

常用的生物信息学工具包括基因组注释工具、序列比对工具、进化树构建工具等。

三、基因组学的进化研究的意义1. 深化对物种起源和演化的认识通过基因组学的进化研究,我们可以揭示不同物种之间的亲缘关系,推断物种起源和演化的历史,从而深化我们对生命起源和演化的认识。

2. 拓展对基因功能的理解基因组结构和功能研究可以帮助我们了解基因的功能性区域和非编码区域的作用,进一步认识基因表达调控和基因功能的机制。

进化生物学研究方法

进化生物学研究方法

进化生物学研究方法进化生物学是研究物种如何逐渐变化和适应环境的科学领域。

为了深入了解生物进化的过程和机制,科学家们开发了各种研究方法和技术。

这些方法从分子水平到群体水平,从实验室到自然环境,提供了多样化的途径来探索生物进化的奥秘。

1. 遗传学研究方法遗传学是进化生物学的基础。

通过研究遗传物质的传递和变异,我们可以了解物种如何通过基因变化来适应环境。

主要的遗传学研究方法包括:(a) 人工选择:科学家可以通过选择某些具有特定性状的个体进行繁育,加速基因变异和进化的过程。

例如,人工选择可以被用来培育更具抗病性或更高产量的植物品种。

(b) 突变分析:突变是基因组中发生的随机变异。

通过分析突变体,我们可以研究不同基因的功能和相互作用。

突变分析为我们揭示了生物进化的基本原理。

(c) 比较基因组学:通过比较不同物种基因组中的差异,我们可以了解物种之间的进化关系和共同祖先。

比较基因组学可以揭示物种间的遗传联系,并为进化树的构建提供信息。

2. 生态学研究方法生态学关注物种与环境的相互作用和适应。

生态学研究方法有助于我们了解生物进化的驱动力和适应机制。

其中一些重要的方法包括:(a) 环境调查:通过对自然环境的调查和研究,我们可以了解物种在不同环境条件下的分布、数量和适应性。

环境调查提供了大量的数据,帮助我们理解物种如何适应不同的生境。

(b) 形态测量和比较:通过测量和比较物种的形态特征,我们可以了解物种之间的相似性和差异。

形态测量和比较揭示了物种适应环境变化的经过,并为物种分类提供了线索。

(c) 行为观察:行为观察研究动物和植物在特定环境条件下的行为模式和适应策略。

行为观察帮助我们了解物种如何利用环境资源、进行繁殖和避免捕食,在进化中发展出的各种行为。

3. 分子生物学研究方法分子生物学技术的发展为我们深入研究生物进化提供了强有力的工具。

以下是一些常用的分子生物学研究方法:(a) 基因测序:通过测定物种基因组中的DNA序列,我们可以揭示不同物种的遗传信息和进化关系。

比较基因组学与分子进化(1)

比较基因组学与分子进化(1)
2021/3/7 The mechanisms of RNAi, RNA interference, RNAi 19
2021/3/7
20
2021/3/7
21
Genetic interference following ingestion of dsRNA-expressing bacteria by C.elegans
正确剪接位点
12
成熟 ( mRNA )结构
起始密码: ATG
N 5‘
外显子 64密码子
终止密码: TAA TAG TGA
C
3‘
蛋白质(20氨基酸)
2021/3/7
13
Promoter::GFP reporters reveal worm Cadherin gene expression
Worm cadherins: cdh-1, hmr-1a, hmr-1b, cdh-3, cdh-4, cdh-5, fmi-1, cdh-7, cdh-8, cdh-9, cdh-10, casy-1, cdh-12
1. Utilization of desirable regulatory sequence to drive the expression of your gene product
5’ control region protein coding region 3’ control region
2. Gene Silencing or Antisense approach to control the level of mRNA of a given gene
AT
genomic DNA PCR
G
GFP vector
3-5kb
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比较基因组学的应用???
第一章 剖析天才
第二章 躁狂抑郁症
第三章 牛顿
第四章 贝多芬
第五章 狄更斯
第六章 梵·高
第七章 减弱创造力
第八章 增强天才
朱立安·李布(Julian Lieb)医学博士,私人执业的精神病医师,艺术家和小说家。 D.杰布罗·赫士曼(D.Jablow Hershman)与朱立安·李布合著有《暴君的手足之情——躁狂抑 郁与绝对权力、《天才的奥秘——躁狂抑郁与富于创造力的生命》等书。
2 84
83
占常染色质 百分数/Mb 100 100 97 100 97 100 90
基因数 /Mb 483 197 117 221 16 7 12
99-93
15
比较基因组学的应用
1999年12月1日,人体第22对染色体的遗传密码破译, 人类首次成功完成人体染色体基因完整序列的测定,英 、美、日三国研究人员合作完成
比较基因组学 Comparative Genomics
比较基因组学
比较基因组学的基本概念 比较基因组学的应用 比较基因组学的研究方法 比较基因组学与进化 模式生物与比较基因组学研究
比较基因组学的基本概念
比较基因组学的基本概念
伴随着基因组的研究, 相关信息出现了爆炸性增长, 迫 切需要对大量基因组数据进行处理, 比较基因组学作为 一门重要的工具学科应运而生。
高度保守和高度变异
X染色体极为保守,人类和猫的X染色体具有纵贯全条的共线性; 在保守性较低的区段,基因进化速率快于整个基因组的平均进化
速率; 种间基因组中很少表现共线性;甚至在同一物种的不同生态型 之间这些区段也会发生较大变异;
当用基因共线性程度估算物种分化年代时,应当注意避免高度保 守和高度变异的区段。
化过程中更深层的秘密。
比较基因组学的应用
2000年5月 德国和日本科学家完成人体 第21对染色体测序
最小的一对:33Mb,人体全部的1%; 127个基因,估计还存在98个基因; 多种遗传疾病相关基因 白血病 唐氏综合症 阿尔茨海默症 躁郁症:《躁狂抑郁多才俊》 肌肉萎缩性侧索硬化症
其他严重疾患的方法,阻止甚至扭转一些疾病的遗传; 神经生物学、细胞生物学、发育生物学相关学科发展。
比较基因组学的应用
利用不同物种基因组之间功能区域序列上、组织结 构上的同源性:
对系统发育中的代表性物种之间的基因和基因家族的比较分 析;
构建系统发育的遗传图谱; 克隆新基因; 揭示基因与基因家族的起源、功能、进化过程中复杂化和多
源序列基因( Orthologous) 蛋白承担; 5 同线( synteny) 连锁的同源基因在不同物种基因组中有相同连锁关
系; 6 生物体的复杂性一般表现在“生物学”的复杂性,与基因组的C 值
大小及基因数量未必一定呈线性关系--C值悖论。
原核模式生物比较基因组学
尿殖道支原体--已知最小的基因组0.58Mb ,由此确 定能自我复制的细胞必需的一套最少的核心基因 流感嗜血杆菌的基因组为1.83Mb
比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之间 的全方位基因和基因家族的比较分析,构建系统发育 的遗传图谱, 来揭示基因、基因家族的起源和功能及其 在进化过程中复杂化和多样化的机制。
比较基因组学的应用
揭示非编码功能序列 发现新基因 发现功能性SNP 阐述物种间的进化史 阐明人类疾病过程的分子机制
体单倍型的详尽的图谱。 可将其6000 个基因中的任何一个用突变的等位基因替代或准确地从基
因组中缺失。
线虫
简单多细胞生物 减数分裂 细胞核外形 细胞分裂 胚胎形态的发育
模式生物基因组研究特点
1. “压缩”的基因组:基因组通常比较小,编码基因比例较高,重 复序列和非编码序列较少;
2. 模式生物基因组中G+ C%含量高,同时CpG岛的比例也比较高; 3. 在模式生物特别在人的基因组中发现了重复 duplication;
模式生物 model organism
模式生物基因组研究特点 4 在各种不同的物种中,大多数的重要生物学功能是由相当数量的同
第二小的染色体,34Mb,发现679个 基因,55%新发现; 先天性心脏病、免疫功能低下、 精神分裂症、智力低下、出生缺
陷以及许多恶性肿瘤(白血病); 679个基因中,545个是功能基因;134个是假基因,曾经发生过
作用,但现在已不再发挥功能; 200~300个功能和结构尚待确认的基因; 160个人体基因与小鼠基因遗传密码相似,找到人类和生物在进
宏观共线性:遗传连锁图上锚定标记排列次序的一致性; 微观共线性:物理图上基因序列的一致排列;
进化距离非常近的物种间保持很好的微观共线性; 在进化过程中,基因共线性被各种因素所破坏,进化距离越远的
物种之间基因共线性越差;
物种间共线性程度可作为衡量它们之间进化距离的尺度。
比较基因组学的研究方法
酿酒酵母--最小的真核基因组 裂殖酵母其次:密度是1/2.3kb,13.8Mb 线虫:简单多细胞生物,基因密度为1/30kb。 内含子:酿酒酵母4%的编码基因有内含子,裂殖酵母有40%编码基因 有内含子。
酵母---良好的实验系统
单细胞,可在特定的培养基上生长,能够完全控制其化学和物理环境。 酵母的生命周期也很适合被用来作遗传分析,可以构建一套16 条染色
样化的机制。
比较基因组学的研究方法
基因组比较作图Comparative mapping 基于基因组全序列的比较基因组学研究 基于DNA芯片技术的比较基因组学研究
比较基因组学的研究方法
1. 基因组比较作图Comparative mapping
利用共同的遗传标记(分子标记、cDNA克隆、基因克 隆)对相关物种进行遗传/物理作图;
比较遗传标记在相关物种基因组中的分布情况,揭示 物种间DNA或DNA片段上的同线性synteny、共线性 collinearity、微共线性microsynteny;
对相关物种的基因组结构、基因组进化历程进行精确 分析。
比较基因组学的研究方法
1. 基因组比较作图Comparative mapping
比较基因组学的研究方法
2. 基于基因组全序列的比较基因组学研究
完成全基因组测序, 针对全基因组序列进行比较分析, 可精确到单碱基差异;
比较已有的全基因组序列, 如拟南芥、水稻、杨树等, 进行系列研究,进展迅速;
全基因组测序工程浩大,耗费巨大,不可能对所有研究 的物种采用这种方式进行比较基因组研究。
他各种生物研究的步伐。
模式生物 model organism
模式生物具备的基本条件
容易培养,成本低廉,随时获取以供实验研究,繁殖周期短; 能在短时间内产生大量的后代,满足研究分析的需求; 十分方便地取得种内的遗传变异体; 已经过长期研究取得该物种的丰富背景信息。
模式生物 model organism
比较基因组学的研究方法
3. 基于芯片技术的比较基因组学研究
以已知序列基因组为参考,通过芯片技术,进行未测序 基因组与参考基因组间的比较基因组杂交分析;
检测待比较基因组中对应DNA区域的存在、缺失、变异;
成本较低,研究结果可靠性较高,应用前景广阔。
比较基因组学的研究方法
基因组成的相似性 基因共线性:基因排列顺序的一致性;
无需事先知道基因的DNA序列,无需了解基因的表达产物; 首先在拟南芥中取得成功,后来在番茄、大麦、小麦、甜菜、水稻,
理论上适用于一切基因
在水稻中运用该技术分离出抗白叶枯病基因Xa-21、Xa-1,抗稻瘟病 基因Pi-b和矮生突变基因D1。
在基因组较小的模式植物中,分离被精确定位在大基因组中的基因; 避免大量重复序列的干扰,减少染色体步移的次数。
比较尿殖道支原体与流感嗜血杆菌这两个亲缘关系较远的生物基因组,选取其共同的基 因(共240个);再加上一些其他基因,组成一套含256个基因的最小基因组。
酿酒酵母基因组—最简单的真核生物
基因组:12,068 kb,比单细胞的原核生物和古细菌大一个数量级; 基因数: ORF 5887,比原核生物和古细菌要多很多; 基因密度:1个基因/2kb,密度小于流感嗜血杆菌和尿殖道支原体。
2020/4/18
基本完成DNA序列分析的真核生物基因组比较
物种 酵母
完成 年份
1996
线虫
1998
果蝇
2000
拟南芥
2000
人类第22染色体 1999
人类第21染色体 2000
人类全基因组
2001
(Public Sequence)
人类全基因组
2001
(Celera Sequence)
总长度 Mb 12 96 116 115 34 33 2693
模式生物与比较基因组学研究
模式生物 原核生物 酵母 线虫 果蝇 小鼠、人类 拟南芥、水稻、玉米、小麦
模式生物 model organism
生物的一个物种species,在研究生命现象的过程中长期、反复地 被作为研究材料
其许多生命活动规律往往代表了许多物种共同的规律 对其形态、解剖、生理、生化、细胞及遗传进行全面分析和归纳 将对其研究中得出的规律,推演到相关的生物物种中,以加快其
比较基因组学的应用
Down综合征DS Down Syndrome 21三体综合征(唐氏综合征):染色体异 常,3条21号染色体、先天愚型
★妊娠前后,孕妇有病毒感染史,如流感、风 疹等; ★受孕时,夫妻一方染色体异常; ★夫妻一方年龄较大; ★妊娠前后,孕妇服用致畸药物,如四环素等; ★夫妻一方长期在放射性荧幕下工作或污染环 境下工作; ★习惯性流产史、早产或死胎的孕妇; ★长期饲养宠物者。
同线性synteny :相关物种间同源染色体或染色体片段上存在 共同的遗传标记,但这些标记间的相对顺序可能存在差异;
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