LncRNA案例国自然基金标书写作

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国自然万能模板参考范例

国自然万能模板参考范例

国自然万能模板参考范例报告正文(一)立项依据与研究内容1、项目的立项依据XXX疾病及其研究进展XXXX疾病(XXXXXX,XXX英文名称)是XXX系统(消化、呼吸、神经等等)常见的一种疾病类型,多数是由于XXXX出现功能紊乱以及XXXX功能失调等所诱发,主要表现为XXXX(临床症状或者临床特征),致使XXX组织或者器官发生XXXX等症状,可以引起XXXX、XXXX以及XXXX等严重后果。

同时,XXXX(该疾病)也是导致其他类XXXX相关疾病的主要原因之一。

目前的研究表明,XXX疾病主要是由于XXXX所引起的(或者说跟XXX有关,也可以说关于该疾病的发病机制还没有研究清楚),对于该疾病的治疗,目前尚没有有效的治疗方法或者药物(或者目前已有药物有哪些不足,存在哪些问题)。

近年来,随着xxxx的改变,我国XXX疾病的发病率呈现逐年上升且年轻化的趋势。

大量的基础和临床研究表明,导致XXX疾病的危险因素主要包括:XXXXXX等。

其中XXX的失调/XXX功能紊乱/XXXX异常等是引起该疾病的主要原因所在。

所以,调节XXXX方面的功能是目前治疗和预防XXXX疾病发生和发展的主要关注途径。

如针对XXX疾病主要动因的药物羟XXXX、XXXX以及XXXX等已经逐渐成为该疾病的主要药物。

但是该类药物目前存在XXXX方面的缺点(成本高、副作用大等等),所以开发新的治疗该类疾病的靶向药物显得至关重要。

注:该部分主要内容是提出临床问题,可以是某一个疾病、或者某一个疾病过程中的一个问题等等,所以该段最好按照以下顺序来写:1、临床现象某某疾病是怎么回事(疾病简介),或者在某疾病的治疗或者发生、发展过程中观察到的某个临床现象。

2、该临床现象的症状、危害及严重性主要描述该临床现象(一般是某种疾病)的临床症状、严重程度、危害性或严重性等。

3、提出临床问题即在目前某种临床现象(疾病)存在哪些不足或者未解决的问题急需解决。

XXXX分子及其介导的信号通路在XXX疾病中的作用已有的研究的发现,XXXXX分子及其所介导的XXX信号通路在XXX疾病发生和发展的过程中发挥着非常关键的作用。

国自然申请:lncRNA常见作用机制

国自然申请:lncRNA常见作用机制

国自然申请:lncRNA常见作用机制相信通过前面文章的介绍,大家都已经了解到在国自然申请中,lncRNA所占的地位有多么的重要。

那么,当我们在写具体的研究内容时,可以从哪些角度去设计lncRNA的功能机制研究线路呢?这里,小编把最常见的lncRNA作用机制方式和大家道来。

1. lncRNA在染色质层面调控基因表达当我们想进行深入的lncRNA功能研究时,第一步肯定会看看lncRNA的细胞定位。

如果我们发现lncRNA定位于细胞核,那就要考虑它是否会在染色质层面起调控作用。

那么,你所要做的工作包括以下:(1)确认lncRNA是否能与染色质结合;(2)染色质状态是否受lncRNA影响;(3)具体的调控区域是什么;(4)lncRNA结合蛋白鉴定(很多时候是需要一些蛋白参与);(5)靶基因表达是否受lncRNA影响。

如果这些问题您都能很好的回答,那么该研究的发表文章水平肯定不会低的(Atianand et al., 2016, Cell 165, 1672–1685。

)。

2. lncRNA cis调控机制根据lncRNA在基因组上的位置,我们会发现很多lncRNA的前后左右会有mRNA存在。

很多研究就发现,这类lncRNA会调控其附近mRNA的表达(Wang et al., 2015, Cell Stem Cell 16, 413–425)。

在这种情况下,首先需要确认lncRNA与cis靶基因之间是否有表达相关性,把lncRNA干预表达后,mRNA表达是否受影响;另外,后续的研究也需要看看该lncRNA是否会招募一些蛋白或复合体,再去结合到mRNA的启动子区去实现调控功能的。

3. lncRNA trans调控机制如果该lncRNA附近有功能基因表达的改变,该lncRNA可能是通过cis调控实现。

但如果没有,可以考虑trans靶基因调控。

在这种情况下,可以先通过实验去筛选和该lncRNA可能结合的蛋白,或者通过trans靶基因预测,来寻找可能下游靶向mRNA;然后去分析lncRNA和靶基因的表达相关性。

(文章篇)S3E7:一文掌握lncRNA研究的套路和创新点

(文章篇)S3E7:一文掌握lncRNA研究的套路和创新点

(文章篇)S3E7:一文掌握lncRNA研究的套路和创新点大家好,在上期的文章中,我们分享了lincRNA-P21通过结合翻译调节蛋白Rck从而阻断CTNNB1和JUNB mRNA翻译,下调β-catenin和JunB表达水平的文章,今天继续分享一篇文章:Chenguang Gong,Zhizhong Li,Krishnan Ramanujan,Ieuan Clay,Yunyu Zhang,SophieLemire-Brachat,and David J. Glass. A Long Non-coding RNA, LncMyoD, Regulates Skeletal Muscle Differentiationby Blocking IMP2-Mediated mRNA Translation. Developmental Cell. (July 27, 2015) (IF9.7) 我们从换个角度看同样是参与蛋白的翻译,本文的主角LncMyoD 与lincRNA-P21的作用机制有何不同。

首先上机制图:吕小布LncMyoD是一条由MyoD临近基因编码的霸王lncRNA,在成肌细胞分化时直接由MyoD基因激活。

原本貂小蝉IMP2(IGF2-mRNA-binding protein 2)与增殖基因董大卓(N-Ras、c-Myc)愉快地结合在一起,激活增殖基因转录,导致细胞增殖。

而小霸王吕小布LncMyoD来了之后,发现貂小蝉IMP2蛮不错,直接抢先与之竞争性结合,打压貂小蝉IMP2之前介导的董大卓增殖基因的转录,使得细胞增殖受到抑制,促使细胞分化。

这篇文章的研究内容主要包括以下几点:1. 发现和鉴定LncMyoD,这一点我们看鉴定一条新的lncRNA,有哪些工作要做;2. LncMyoD促进成肌细胞分化,这部分简单说明;3. LncMyoD上调表达机制:被蛋白MyoD转录激活,这部分是蛋白与DNA作用的常见实验,前面已有文章涉及;4. LncMyoD下游抑制蛋白翻译机制,这点我们重点来看。

lncRNA国自然标书1

lncRNA国自然标书1

lncRNA国自然标书1报告正文(一)立项依据与研究内容(4000-8000字):1.项目的立项依据(研究意义、国内外研究现状及发展动态分析,需结合科学研究发展趋势来论述科学意义;或结合国民经济和社会发展中迫切需要解决的关键科技问题来论述其应用前景。

附主要参考文献目录);在现代社会中,由于工业化程度的提高和环境污染的加重,不孕不育发病率显著增加,生殖健康成为人类社会所面临的一个严重问题。

据报道,高达10-15%的育龄期夫妇出现了不孕不育,而由男方因素引起的约占50%,其中多数男性不育的病因或发病机制不明[1]。

世界卫生组织人类生殖规划署(WHO-HRP)已将不育症和肿瘤、心脑血管疾病共同列为本世纪严重影响人类健康的三大疾病,男性不育是生殖健康研究领域一个亟待解决的重大科学问题。

虽然2010年的诺贝尔奖获得者Robert Edwards发明的体外受精技术(俗称试管婴儿)可使不育患者获得自己的后代,开辟了生殖医学的新时代,但这些助孕技术绕过了受精过程中对异常精子的自然选择机制,有传递遗传缺陷的风险[2]。

2015年,国家计划生育政策做出了重大调整,全面实施二孩政策,为不育症的诊治带来新挑战、新机遇。

精子发生及成熟是一个受到精细调控的、连续的过程,而精子发生障碍或成熟停滞是导致男性不育的主要病因。

精子发生和成熟分为三个阶段,包括精原细胞有丝分裂、精母细胞减数分裂和精子细胞变态。

在这三个阶段中,按时依序发生了一系列的分子和细胞学事件:第一阶段是精原干细胞自我更新和分化;第二阶段是精母细胞的减数分裂,涉及同源染色体的相互识别、配对、联会和遗传重组等;第三阶段是精子细胞变态,包括核变形、染色质凝缩、精子特异性鱼精蛋白替代组蛋白、顶体形成、鞭毛形成等。

这些重要事件的异常均可引起减数分裂停滞、精子发生异常并最终导致不育[3]。

我们与其它研究组均发现,在最常见的非梗阻性无精子症(non-obstructive azoospermia,NOA) 患者中易出现精原细胞增殖凋亡失衡[4]及初级精母细胞同源重组缺陷[5, 6],少精症(oligozoospermia)则与精子细胞变态、染色质凝缩相关[7]。

国自然lncRNA 在肿瘤中的研究现状

国自然lncRNA 在肿瘤中的研究现状

lncRNA 在肿瘤中的研究现状长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA,这类RNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,2007年Hotair功能鉴定以来,lncRNA的功能渐渐明晰。

据计算,约有93%的转录本为lncRNA,lncRNA通常位于细胞核和细胞质1。

但是lncRNA的基因转录水平一般低于蛋白质编码基因,序列保守性差,承受的进化压力小,但启动子序列通常比较保守。

lncRNA与小分子RNA相比,序列更长、空间结构也较为复杂,参与表达调控的机制更加多样和复杂。

捕获测序技术(RNA capture long seq, CLS)能够以更高精度分析基因组,从而深入了解lncRNA2。

lncRNA能在表观遗传3、转录4及转录后5水平调控基因表达,参与发育、分化、代谢、X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活与抑制、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系。

研究表明, lncRNA的异常表达与肿瘤的诊断、复发及转移相关6, 7。

lncRNA以外泌体的形式分泌到细胞外,体液中的lncRNA具有作为生物标志物的潜能,指示肿瘤的进展与恶性程度,指导个性化治疗。

PCA3是一个前列腺癌特异表达lncRNA,在前列腺癌患者尿液中异常升高,已经用于临床前列腺癌诊断8。

血浆中稳定存在的lncRNA也有作为生物标志物的潜能,比如胃癌患者血浆中lncRNA H19显著升高9。

在临床,同一癌种的肿瘤患者接受相同的治疗方式,但临床疗效不尽相同,lncRNA的差异表达是造成这一现象的原因之一10。

癌组织中lncRNA的异常表达通常与转移及预后较差相关。

在胰腺癌中lncRNA HULC表达异常升高,其高表达与肿瘤体积、高级别的淋巴结转移与血管浸润显著相关,HULC水平与患者的总体生存率相关11。

Hotair在乳腺癌、结直肠癌、宫颈癌、肝癌等多种癌症中表达升高;在宫颈癌中,Hotair的高表达与淋巴结转移相关,且总体生存率较低;敲减Hotair能够显著抑制宫颈癌细胞的增殖、迁移与侵袭,过表达能引起EMT相关表型12。

蛋白修饰类型的国自然基金标书写作

蛋白修饰类型的国自然基金标书写作

1 文献案例分析
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FIG. 6. Acetylated PGK1 was more potent at promoting cell metabolism, glucose uptake, and tumorigenesis.
1 文献案例分析
逻辑思路:
A PGK1 临床意义 B PGK1 的表型研究 C PGK1 K323乙酰化的临床意义 D PCAF 是乙酰化酶 E SIRT7 是去乙酰化酶 D 乙酰化的PGK1表型研究
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Figure 2. NFAT3 has an oncogenic role in skin cancer cells.
1 文献案例分析
Figure 2. NFAT3 has an oncogenic role in skin cancer cells.
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2D culture
3D culture
NSFC案例精讲班(六)
2017
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老谈
0 课程内容
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1
文献案例分析
研究模式总结
2
3
相关技术介绍
1 文献案例分析
甲基化 乙酰化 磷酸化 泛素化
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1 文献案例分析
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1 文献案例分析
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NLT:normal liver tissue; PT:peritumoral liver tissue. MFH:metastasis-free HCC EHMH:HCC with extrahepatic metastasis
1 文献案例分析
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FIG. 2. PGK1 contributed to liver cancer cell proliferation, glycolysis, and tumorigenesis.

国自然标书填写模版范本

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国内外研究现状及发展动态分析
国内外动向与发展趋势: 本课题中尚未解决的问题 分析本领域的研究动向及空白点
立题的科学依据: 说明课题的起点 论证立题的必要性、 可行性和科学依据 分析估计现有基础和实力
段末参考文献: 列出近3~5年内的国内外期刊 一般控制在10篇之内。
立项依据的撰写
以自己提出的问题和思路为主线展开论述 讲清楚自己的思路和想法、与以往别人的工作
③重视中医及民族医学治疗优势病种(如某些功能性疾病、 免疫性疾病、病毒感染性疾病等)的临床学十处
根据中医药现代研究的发展情况,本科学处继续重视支持 以下方面的研究: 藏象理论,中医证候,病因病机,治则治法,经典方药与 病症相关性,中医药治疗优势病种及防治重大疑难疾病的 基础,中医临床疗效评价方法学,经络腧穴理论与针灸防 治疾病的基础 中西医结合基础理论与临床基础,中医药创新性研究技术 与方法 中药资源,中药鉴定,中药炮制与制剂,中药药性,中药 药效物质、体内过程及作用机制,中药毒性、毒理与毒–效 相关性,民族医药等。
报告正文
(一)立项依据与研究内容 (4000-8000字):
1.项目的立项依据 研究意义 国内外研究现状及发展动态分析,需结合科学研究
发展趋势来论述科学意义 或结合国民经济和社会发展中迫切需要解决的关键
科技问题来论述其应用前景 附主要参考文献目录
(一)立项依据与研究内容
(4000-8000字)
1 项目的立项依据
项目的立项依据 研究意义 国内外研究现状及发展动态分析,需结合科学
研究发展趋势来论述科学意义 或结合国民经济和社会发展中迫切需要解决的
关键科技问题来论述其应用前景。 附主要参考文献目录
研究的科学意义
理论意义:新理论、新观点 学术价值:提高学术水平,对科学进步的贡献 应用价值:新技术、新方案、新方法

(完整版)国家自然科学基金标书写作全攻略+成功范例1份

(完整版)国家自然科学基金标书写作全攻略+成功范例1份

国家自然科学基金标书写作全攻略+成功范例1份指导思想篇1、追求卓越,在知识上要绝对专业,坚决反对侥幸心理。

2、相信NSFC申请是公平的,大家靠实力竞争,必须花大力气写标书;如果你认为NSFC 只有关系,你就不用继续往下看了。

3、NSFC是一个系统工程,需要花很多时间和精力,而不仅仅是几页标书,是智慧沉淀的结晶。

4、不要把NSFC看的高不可及,你要相信自己的创意,哪怕你只是一名一年级硕士5、机会主义是有的,但我们没有什麽其它的资本,只能消灭标书里一切可能的失败因素,加上完美的选题和课题设计,彻底征服评委,不给评委任何黑掉你的机会。

6、基金申请不同于实际研究课题设计,必须把个人兴趣与NSFC兴趣结合一致,投其所好。

选题立项篇1、基金成败关键还是选题要好,提前半年,刚入行的提前一年进行课题搜索2、老板指定的题未必是好题,最好自己选题,如何立项应该是研究生学习最重要的一课,毕业后你会发现,没有人会指点你什麽课题有价值了,在中国学术的沙漠里,只剩下你自己了。

3、好课题是对学科深刻理解的条件下产生的,大量翻阅文献吧,汲取知识的同时千万别忘了思考,你发现别人存在漏洞的时候,好课题就离你不远了。

4、选题最好以问题为导向,不要以技术为导向,找到问题了,课题就找到了。

而拿着新技术去找能解决的问题,效果多数不好,但还是大有人在,比如RNAi。

5、解放思想,发散思维,多方法多学科交叉,一般都会比较受人青睐,容易申请到基金,但不能为了交叉而强行交叉。

6、创新性新技术、新理论的课题要有一定的理论与技术基础,最好有工作基础,没有你也要东拼西凑,这是在中国,NSFC似乎讨厌空中楼阁7、临床课题研究最好别选临床应用方向,而选应用基础研究。

8、选择自己熟悉,有工作基础的领域,别跨越太远。

你是在谝钱,记住了,你不装的象个行家,NSFC是不会给钱的。

9、重要科学问题的切入点准确,切忌过宽、过大,只要体现一定的新意和研究价值就行了,能得诺贝尔奖的课题NSFC是不给钱的。

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NSFC案例精讲班(一)
2017
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酸菜
0 课程内容
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1
文献案例分析
科学假设模式
2
3
标书写作讲解
1 文献案例分析
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1 文献案例分析
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图1. lncRNA MVIH在40例HCC中 高表达,表达框定位于RPS24基因,
但与该基因表达没有相关性
表1. 在215例HCC组织样本中 lncRNA MVIH表达与其他临床
1 文献案例分析
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已 知 癌 基 因
图4. RNA pulldown+MS鉴定筛选到与 LncRNA AF147447相互作用的蛋白MUC2
图5. MUC2表达与幽门螺杆菌表达正相关, 且与LncRNA AF147447表达负相关(组织)
1 文献案例分析
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图6. LncRNA AF147447与MUC2可竞争性 地与miR-34c结合,发挥ceRNA功能
Fig.2,3
C lncRNA AF147447
MUC2 Fig.4
D lncRNA AF147447
MUC2
幽门螺杆菌
Fig.5
E lncRNA AF147447
miR-34c
MUC2
Fig.6
F E2F1
lncRNA AF147447
miR-34c
MUC2
Fig.7
2 科学假设模式
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疾病
1 体外结合体内研究明
确lncRNA MALAT1
影响肠癌放疗敏感性 的功能作用
2 理解MALAT1对靶基
因ANKHD1调节的
分子机制,以及其对 Hippo通路的影响
3 证实MALAT1在临床
上作为大肠癌新辅助
放疗抵抗分子标志物 的转化应用价值
3 标书写作讲解
案例(一) 5) 研究创新点
1
MALAT1能够调节肠 癌细胞放疗敏感性
临床意义 Fig.1,2 Tab.1
血管形成
临床意义
Fig.3
PGK1
Fig.4
PGK1
血管形成
Fig.5
PGK1
血管形成
临床意义
Fig.6
1 文献案例分析
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1 文献案例分析
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图1. LncRNA AF147447表达与 幽门螺杆菌感染相关
图2. 抑制LncRNA AF147447在体外、体内促进胃癌细胞增殖和迁移 图3. 过表达LncRNA AF147447在体外、体内抑制胃癌细胞增殖和迁移
2) 假设:
大肠癌 放射敏感性
MALAT1
ANKHD1 Hippo通路
3) 立项依据:
1
大肠癌新辅助放疗能
够显著改善治疗效果, 但存在敏感性问题
2
LncRNA MALAT1能
够调控大肠癌细胞的 放射敏感性
3
MALAT1能够靶向调
节ANKHD1的表达, 从而影响Hippo通路
4
Hippo信号通路异常
是肠癌细胞放疗抵抗 的重要分子机制
6) 拟解决关键科学问题
1
MALAT1在肠癌中影 响放疗敏感的功能
解螺旋课堂
2
MALAT1通过ANKHD1 影响Hippo信号通路
3
MALAT1作为肠癌新辅 助放疗的分子标志物
2
MALAT1在肠癌中影响 放疗敏感的分子机制
3
MALAT1能否在临床上 指导肠癌的放疗敏感性
3 标书写作讲解
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案例(二)
1
2
3
4
5
临床 科学 分子 机制 效应
问题 热点 (X) (Y) (Z)
延伸 机制
申请人方向
研究兴趣
前期工作
B 转录因子
lncRNA lncRNA
A 蛋白
C miRNA
功能 蛋白
3 标书写作讲解
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案例(一)
1) 题目: lncRNA-MALAT1靶向ANKHD1调控Hippo信号通路影响大肠癌放射敏感性的机制研究
2 分子水平
3 动物水平
阐明MALAT1靶向调节 ANKHD1表达的分子机制,
基于Hippo信号通路探讨 MALAT1下游分子途径
在体内动物模型中评估 MALAT1对放疗敏感性的
作用,并验证ANKHD1和 Hippo通路表达改变
4 临床水平
利用大规模的组织样品分 析MALAT1表达与肠癌患 者放疗抵抗之间的相关性, 揭示其临床意义
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图5. lncRNA MVIH通过抑制PGK1蛋白的分泌 影响HCC肿瘤血管形成表型
图6. lncRNA MVIH和PGK1的表达在组织 标本中呈负相关,且与MVD相关
1 文献案例分析
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科学假设: HCC 肿瘤血管生成
MVIH
PGK1分泌 生长,转移,血管生成
逻辑思路:
A lncRNA MVIH B lncRNA MVIH C lncRNA MVIH D lncRNA MVIH E lncRNA MVIH
1) 题目: 心肌纤维化新机制:LncRNA(n287665)-miRNA(let-7d)-PAFR/YAP1
2) 假设:
缺血性心肌病 心肌纤维化 n2877665 let-7d
PAFR/YAP1
3) 立项依据:
1
心肌纤维化是引发缺 血性心肌病的重要形 成机制
2
申请人前期筛选发现
LncRNA n287665 能够促进心肌纤维化
病理因素的多因素分析
图2. lncRNA MVIH是HCC中 独立的RFS与OS预测因子
1 文献案例分析
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图3. lncRNA MVIH在动物模型中具有促进HCC 肿瘤生长和肝内转移的功能作用
图4. RNA pulldown+MS鉴定筛选到与 lncRNA MVIH相互作用的蛋白PGK1
1 文献案例分析
3
n287665以内源性竞
争RNA的形式结合 miRNA let-7d
4
let-7d可调控PAFR
和YAP1,从而影响 心肌纤维化作用
5
本项目拟 开展工作
Mini-review
600-800 字
5
本项目拟 开展工作
Mini-review
600-800 字
Mini-review
Mini-review
800-1000 字 600-800 字
Mini-review
400-600 字
400 字
3 标书写作讲解
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案例(一) 4) 研究内容与研究目的:
1 细胞水平
在放疗耐受的肠癌细胞中 抑制MALAT1表达,观察 其对射线敏感性的影响, 检测细胞功能表型变化
图7. LncRNA AF147447启动子能够被 转录因子蛋白E2F1负向调控
1 文献案例分析
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科学假设:
GC
幽门螺杆菌
AF147447
MUC2
E2F1
增殖,迁移
逻辑思路:
A lncRNA AF147447
临床意义(幽门螺杆菌感染)
Fig.1
B lncRNA AF147447
增殖迁移
临床意义
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