药物基因组学中的VIPs和CYP2D6基因介绍

个功能正常和一个无功能等位基因
携带*10和另一个功能降低的等位基因
携带一个功能降低（不含*10）和一个无功能的等 位基因；或携带2个*10等位基因
携带*10和一个无功能的等位基因
PTGS2, SCN5A, SLC22A1, SULT1A1, VDR
癌症基因 组
9 ABL1, ALK, BCR, BRAF, EGFR, ERBB2, KIT, KRAS, NRAS
https:///vips#tier0
CYP2D6酶简介
⚫ CYP2D6是细胞色素P450系的重要成员（细胞色素P450，家族2，亚家族D， 多肽6），是参与I相代谢和消除许多内源性底物和多种药物的酶。
CYP2D 6抑制
剂
• •
•
他汀类 抗抑郁药（氯丙嗪、氟伏沙明、氟西丁、舍曲林、文拉法辛等）对CYP2D6 均有不同程度的抑制作用 奎尼丁，其中奎尼丁是CYP2D6 最强的抑制剂
CYP2D6基因简介
⚫ CYP2D6基因位于22号常染色体长臂1区3带1亚带上（22q.13.1），含有9个外 显子和8个内含子，总长达7kb，编码区有1521个碱基。
⚫ CYP2D6具有高度的多态性且存在种族差异，截止2020年5月30日更新的数据显 示，已知有超过139种等位基因变体，其中包括：
✓ 功能增强型等位基因（*1xN（ N≥2 ）、*2xN（ N≥2 ）…） ✓ 功能性（功能正常型）等位基因（*1、*2、*9×2、*33、*34、*35…） ✓ 功能降低型等位基因（*9、*10、*41…） ✓ 无功能型等位基因（*3、*4、*5、*6、*7、*8、*11、*21…） ✓ 功能不确定的等位基因和功能未知的等位基因（*58、*61、*63~*65…）
一级
二级 癌症基因组
有大量证据支持其在药物基因组学中的重要性的基因。当一个新基 因与CPIC临床指南的建议相关联时，它们将被添加到一级VIPs中。
在药物基因组学中支持其重要性的证据有限的基因。
肿瘤药物基因组学中重要的基因。随着新的证据和癌症治疗手段的 出现，新的基因可能会被添加到癌症基因组列表中。
https:///vips#tier0
注释：等位基因中包含的变种基于PharmVar核心等位基因4.0版本，最后更 新于2019年5月7日。
CYP2D6 功能正常的等位基因
CYP2D6等位基因
Activity Value (Optional)
Allele Clinical Function Status (Required)*
*1
1.0
*62
0
*11
0
No function
*68
0
*12
0
No function
*69
0
*13
0
No function
*81
0
*15
0
No function
*92
0
*18
0
No function
*96
0
*19
0
No function
*99
0
*20
0
No function
*100
0
*21
0
No function
注释：等位基因中包含的变种基于PharmVar核心等位基因4.0版本，最后更 新于2019年5月7日。
CYP2D6 无功能的等位基因
CYP2D6等位 基因
Activity Value (Optional)
Allele Clinical Function Status (Required)*
*3
0
No function
Activity Value (Optional)
2.0 ≥3.0
2.0
≥3.0 2.0 2.0
Allele Clinical Function Status (Required)*
Increased function Increased function Increased function Increased function Increased function Increased function
• 抗精神病药（氯丙嗪、氯氮平、氟哌啶醇、奋乃静、利培酮、甲硫哒嗪、珠 氯噻醇）
CYP2D • 抗心律失常药（氟卡尼，美西律，普罗帕酮） 6底物 • β受体阻滞剂（卡维地洛，美托洛尔，育亨宾，噻吗洛尔）
• 阿片类镇痛药（可待因，二氢可待因，吗啡，曲马多） • 抗癌药（异喹胍，吉非替尼，司巴丁，他莫西芬） • 其他药物(托莫西汀、右美沙芬、透己灵、托特罗定、氯苯那敏)
Normal function
*53
1.0
Normal function
注释：等位基因中包含的变种基于PharmVar核心等位基因4.0版本，最后更
新于2019年5月7日。
CYP2D6 功能降低的等位基因
CYP2D6等位基因
Activity Value (Optional)
Allele Clinical Function Status (Required)*
注释：等位基因中包含的变种基于PharmVar核心等位基因4.0版本，最后更新于2019年5月7日。
CYP2D6代谢类型
代谢类型 UM
超快代谢
NM 正常代谢
IM 中间代谢 PM 慢代谢
酶活评分
≥2.5
2.25
2 1.75 1.5 1.25
1 0.75 0.5 0.25
0
定义
携带2个功能增强等位基因；或携带一个功能正常 和一个功能增强的等位基因；或携带一个功能增强 等位基因（有3个或以上正常等位基因拷贝）和一 个功能降低或无功能等位基因；或携带一个功能增 强等位基因（有2个正常功能等位基因拷贝数）和 一个功能降低的等位基因
⚫ 人类CYP2D6主要在肝脏表达，在中枢神经系统中也有高度表达（包括黑 质），其次在心肌及小肠也有表达。虽然它在肝脏中的含量仅占2%，但其参 与多达25％的临床常用药物的代谢，其中包括抗抑郁药、抗精神病药、降压 药、抗心律失常药、他莫昔芬等。
https:///vip/PA166170264 董天崴, 王爽, 杨军, et al. CYP2D6基因多态性与药物基因组学研究的进展[J]. 心血管康复医学杂志, 2014(3).
注释： • 超快代谢型中的*1xN代表N（ N≥2 ）个拷贝数的*1等位基因（即*1等位基因发生了N次复制），
会导致酶活性的增强。 *2xN同理。
https:///page/cyp2d6RefMaterials
CYP2D6 功能增强的等位基因
CYP2D6等位基因
*1x2 *1≥3 *2x2 *2≥3 *35x2 *45x2
Normal function
*35
1.0
Normal function
*39
1.0
Normal function
*41x2
1.0
Normal function
*41x3
1.5
Normal function
*45
1.0
Normal function
*46
1.0
Normal function
*48
1.0
2. 到2020年6月，PharmGKB根据多个来源维护了一份VIPs名单，包括美 国食品和药物管理局(FDA)的生物标志物名单、临床药物遗传实施联盟 (CPIC)和药物基因组学研究网络(PGRN) 的名单。
3. 随着时间的推移，很明显，支持这些VIPs的证据有了很大的变化。2020 年6月，PharmGKB对其进行了证据评估，将VIP名单分为三级：
*9
0.5
*10
0.25
*10x2
0.5
*14
0.5
*17
0.5
*29
0.5
*41
0.5
*49
0.5
*50
0.5
*54
0.5
*55
0.5
*59
0.5
Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function Decreased function
⚫ 不同的等位基因变体可导致酶活性及数量的改变，是导致药物代谢差异的重要 原因。基于CYP2D6对其底物的代谢能力，分为四种代谢类型。按照代谢速率 由高到低依次是：超速代谢（UM），正常（广泛）代谢（NM），中间代谢 （IM）和弱代谢（PM）。药物基因组学指导的药物及其剂量的选择，可为临 床治疗提高疗效和减少毒副反应提供参考。
CYP2D6酶简介
⚫ 在所有参与药物代谢的细胞色素P450酶中，CYP2D6是唯一的非诱导酶（不 能被诱导的酶），这就导致遗传变异对酶活性的个体差异有很大贡献。
CYP2D6与药物的关系
• 抗抑郁药（阿米替林，西酞普兰，氯米帕明，地昔帕明，多塞平，氟伏沙明， 丙咪嗪，马普替林，米安色林，去甲替林，氟西汀，帕罗西汀）
VIPs名单
非常重要的药物基因（VIPs）分级及名单（2020年6月）
分级 一级
数量
基因
ABCB1, ABCG2, ACE, ADRB1, ADRB2, CACNA1S, CFTR,
COMT, CYP2A6, CYP2B6, CYP1C19, CYP2C8, CYP2C9,
34
CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, CYP4F2, DPYD, DRD2, F5, G6PD, GSTP1, HLA-B, MTHFR, MT-RNR1, NAT2, NUDT15,