抗生素抗性基因芯片检测全面介绍

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抗生素耐药性相关基因识别方法与策略

抗生素耐药性相关基因识别方法与策略

抗生素耐药性相关基因识别方法与策略抗生素耐药性是当今世界面临的医疗挑战之一。

随着抗生素使用的广泛和滥用,许多微生物已经进化出耐受各种抗生素的能力,导致难以治疗的细菌感染的出现。

因此,开发准确的方法来识别抗生素耐药性相关基因是至关重要的。

本文将介绍一些常用的抗生素耐药性相关基因识别方法和策略。

一、基因组测序和比对方法基因组测序技术的发展为抗生素耐药性相关基因的识别提供了强有力的工具。

基因组测序可以获取细菌的完整基因组序列,从而准确地鉴定抗生素耐药性相关基因。

其中,全基因组测序可以提供详细的基因组信息,帮助鉴定各种耐药性相关基因。

而目标基因组测序则可以有选择地鉴定特定的抗生素耐药性相关基因。

基因组比对是一种常用的基因识别方法。

通过将受检样品的基因组序列与已知的抗生素耐药性相关基因序列进行比对,可以发现可能存在的耐药性相关基因。

这种方法可以快速有效地检测多个基因,并且可以对已有的数据库进行实时更新,增加了检测的准确性和敏感性。

二、PCR和RT-PCR方法聚合酶链式反应(PCR)和逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)是常用的基因识别方法。

这两种方法可以在短时间内扩增和检测特定的基因序列。

PCR方法通过特异的引物和DNA聚合酶对DNA模板进行扩增,可以快速鉴定特定的抗生素耐药性相关基因。

RT-PCR方法则可以将RNA转录成cDNA,从而对转录后的基因进行检测和定量。

三、测序技术结合PCR测序技术的不断发展为PCR方法提供了更加准确和高通量的检测手段。

现代测序技术可以对PCR扩增的目标序列进行高效、高通量的测序,从而提高抗生素耐药性相关基因的检测灵敏度和准确性。

此外,测序技术结合PCR方法还可以对抗生素耐药性相关基因进行复杂的分型和定量分析。

四、质谱方法质谱技术是一种高效、高分辨率的蛋白质分析方法,可以用于鉴定抗生素耐药性相关基因编码的蛋白质产物。

质谱技术可以检测并分析蛋白质质量、结构和功能信息,从而判断其是否与抗生素耐药性相关。

抗生素检测原理

抗生素检测原理

抗生素检测原理抗生素是指一类用于抵抗细菌、真菌、寄生虫等病原微生物所产生的药物。

通过与病原体的特异性化学反应,使得病原体无法正常生长、繁殖,从而起到抑制病原体的作用,从而有效杀灭微生物,达到解除病痛、治愈疾病的目的。

抗生素检测是一种衡量抗生素用药效果的重要方法,它可以帮助医生更好地评估患者的药物使用情况和抗生素疗效,同时也可以提高抗生素的药物使用率,减少抗生素的浪费,进而实现安全、有效的抗生素使用。

抗生素检测的原理大致分为两类:一类是基于药效学的检测,这类检测通过测量抗生素在人体内浓度、清除速率、动力学及代谢反应等参数,来对抗生素的用药和疗效进行评价;另一类是基于微生物学的检测,包括菌株分离、抗药性鉴定、微生物相关分子结构分析和抗生素耐药基因转录研究等,检测病原体对具体抗生素的抗药性及抗药基因的表达情况,从而确定抗生素的疗效情况。

基于药效学的抗生素检测,主要采用耐药状态的动态监测,包括抗生素的血清浓度、清除率、动力学及代谢反应等参数的测量,可以为抗生素使用提供综合评估和理论指导,从而调整药物的用量和药物的应用周期,以确保药物的正确使用。

抗生素清除率测定是耐药状态监测的重要指标,它用于评价抗生素清除情况和药物抗菌效果,也是药物调整的基础。

基于微生物学的抗生素检测,主要用于病原体抗药性的检测,该检测方法可以基于细菌的菌株分离、抗药性鉴定、微生物相关分子结构分析和抗生素耐药基因转录研究等,从而确定病原体对抗生素的耐药性,或通过检测病原体抗药基因的表达情况来诊断抗生素耐药性。

以上就是抗生素检测原理的基本内容。

抗生素检测是评价抗生素用药效果及抗击病原体抗药性情况的重要方法,可以提高抗生素的药物使用率,减少抗生素的浪费,实现安全、有效的抗生素使用。

通过抗生素检测的支持,可以针对不同的病原体类型,选择最有效的抗生素,最大程度地提高抗生素治疗的成功率。

宏基因组学在微生物抗生素抗性基因检测中的应用

宏基因组学在微生物抗生素抗性基因检测中的应用

宏基因组学在微⽣物抗⽣素抗性基因检测中的应⽤抗⽣素的使⽤已经成为全球⼴泛关注的热点,抗⽣素的⼴泛使⽤以及滥⽤造成了抗⽣素耐药性在微⽣物中的发展和传播[1],并且加速了全球多重耐药细菌和抗⽣素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的出现和传播[2]。

在医疗和农业中对抗⽣素的需求⽇益增加,这使得环境中细菌耐药性⽔平⽇益加剧,并且破坏了微⽣物和抗⽣素之间的⾃然平衡[3]。

ARGs作为⼀种新型的环境污染物[4],⼴泛存在于⼈类、动物体内以及复杂的环境中。

ARGs起源早于⼈类使⽤抗⽣素,抗⽣素耐药性是⼀种存在于环境中的古⽼的、⾃然发⽣的现象,从晚更新世(Late pleistocene)永久冻⼟沉积物中回收的DNA序列,确定存在四环素类(tetM)、万古霉素(vanX)以及β-内酰胺酶类(bla)抗性基因[5]。

⼈和动物会将未代谢完的抗⽣素及ARGs通过粪便和肠道细菌排放到环境中,环境中的耐药细菌会在抗⽣素选择压⼒下获得富集[6],或通过⽔平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)的⽅式将它们携带的ARGs传播到⽔原微⽣物中[7],造成ARGs在不同菌之间的传播,这些原因共同促成了ARGs在畜禽养殖废⽔、医院废⽔和⽣活污⽔中的聚集。

然⽽⾷物链富集代表了⼀种特殊情况,在⾁类⽣产和⽔产养殖过程中,可能会造成抗⽣素在组织细胞的富集,产⽣含有短暂⽽⾼浓度抗⽣素的细菌[8]。

⾃1991年Pace⾸次提出环境基因组学(也称微⽣物环境基因组学、宏基因组学、⽣态组学)的概念,并在同年构建了第⼀个通过克隆环境样品中DNA的噬菌体⽂库以来[9-10],发现ARGs在⼟壤[11]、废⽔[12-13]、河⽔[14]、饮⽤⽔[15]、海⽔[16]、沉积物[17]等环境中⼴泛存在,尤其是⽔⽣⽣态系统(例如城市和医院废⽔),是获取和传播ARGs的理想环境,甚⾄在动物源性⾷品[18-19]以及⼈体(例如肠道[20-21])中也检测到丰富的ARGs。

抗生素耐药基因检出方法改进和准确度评价

抗生素耐药基因检出方法改进和准确度评价

抗生素耐药基因检出方法改进和准确度评价抗生素耐药是当今世界所面临的一大挑战,导致了许多以往可以轻松治疗的感染性疾病重新变得具有致命性。

因此,提高抗生素耐药基因检出方法的准确度和效率对于控制和预防细菌耐药至关重要。

本文将讨论目前存在的抗生素耐药基因检出方法的改进以及评估其准确度的方法。

目前常用的抗生素耐药基因检出方法包括聚合酶链反应(PCR)和基因测序。

PCR是一种快速且灵敏的检测方法,能够定量检测耐药基因的存在。

但是,PCR方法在特异性和准确性方面存在一定的局限性。

由于细菌基因组的多样性,PCR方法可能会产生假阳性或假阴性结果。

为了解决这个问题,科学家们提出了一些改进方法。

首先,引入了新的引物设计策略。

在设计引物时,应尽量选择高度特异的引物序列,避免与非目标基因的互补,以降低假阳性率。

此外,引物的长度和GC含量也是影响特异性和准确性的重要因素。

较长的引物序列和适宜的GC含量有助于提高特异性。

其次,在PCR反应后引入了核酸杂交技术。

核酸杂交可以通过使耐药基因和标签探针序列互补结合来检测目标基因的存在。

这种方法能够进一步提高特异性,并减少假阳性和假阴性结果。

此外,引入了下一代测序技术在抗生素耐药基因检测中的应用。

相比传统的Sanger测序,下一代测序具有更高的测序深度和覆盖率,能够检测到低频突变和新的耐药突变。

同时,下一代测序还可以实现多样性的全基因组测序,提供更全面的信息,有助于确定耐药基因的种类和变异。

除了改进抗生素耐药基因检出方法,准确性的评价也是十分重要的。

评估抗生素耐药基因检测方法的准确度可以通过对已知阳性和阴性样本进行比较来完成。

在评估过程中需要考虑以下几个因素:首先,样本的选择和处理需要符合实际情况,以保证结果的真实性。

其次,样本的数量和种类应足够多样化,以确保方法的适应性和准确性。

最后,比较结果需要使用准确的统计学方法进行分析,以得出可靠的结论。

此外,使用外部质量控制体系也是验证抗生素耐药基因检测方法准确度的重要方式。

抗生素耐药性基因的检测与监测方法探索

抗生素耐药性基因的检测与监测方法探索

抗生素耐药性基因的检测与监测方法探索抗生素耐药性是当今全球医疗领域面临的一大挑战。

随着过度使用和滥用抗生素,耐药菌株的出现日益普遍,已成为公共卫生领域的一种全球性威胁。

因此,开发有效的抗生素耐药性基因检测与监测方法成为了当前科研工作者关注的焦点。

一、抗生素耐药性基因检测技术1.1 PCR技术聚合酶链反应(PCR)是最常用的无标记方法来进行抗生素耐药性基因检测。

通过设计特异引物,可以扩增目标基因片段,并通过电泳等手段判断阳性样品。

1.2 DNA芯片技术DNA芯片技术是近年来快速发展的高通量平行分析方法之一,可实现对多个基因和目标序列同时进行筛查。

这种技术能够准确鉴定不同类型的抗生素耐药性相关基因。

1.3 循环延伸反应(CET)循环延伸反应(CET)通过将靶向DNA引物连续循环和鉴定分子结构中可变区域组合起来进行多重分析,可快速而准确地检测抗生素耐药性基因。

二、抗生素耐药性基因监测方法2.1 宏基因组学宏基因组学是通过构建宏基因组图谱以鉴定和比较个体或环境中微生物及其功能基因的一个高通量技术。

利用这种方法,研究人员可以检测和监测不同样本中抗生素耐药性相关基因的存在和表达。

2.2 PCR扩增与限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)PCR-RFLP结合了两种技术的优点,不仅可以扩增目标序列,还可以通过限制酶切产物的长度差异来区分不同的抗生素耐药性基因。

2.3 基于下一代测序技术的元转录组学研究利用下一代测序技术(NGS)对元转录组进行全面分析,并结合计算机算法将获得的数据进行筛选和分类,可以确定与抗生素耐药性相关的新型基因。

三、未来发展方向随着科学技术的进步和世界范围内对抗生素耐药性问题的关注日益加深,对于抗生素耐药性基因的检测和监测方法也将不断改进和发展。

3.1 快速便携式设备未来研究人员希望开发出手持式、快速便捷的抗生素耐药基因检测设备,使得在实验室以外的环境中也能进行检测,加快诊断和治疗的速度。

畜禽粪便中典型抗生素抗性基因的检测和分析

畜禽粪便中典型抗生素抗性基因的检测和分析

14
四川环境
40卷
基因 16S eRNA
tetA tetO AtM qnrA qnrS
表2抗生素抗性基因引物序列 Tab. 2 Aneobooeoce;soseanc;g;n;peom;es;qu;nc;s
正向引物(5'!30 5o CGGTGAATACGTTCYCGG - 3’ 5o GCTACATCCTGCTTGCCTTC - 3’ 5o GATGGCATACAGGCACAGACC - 3’ 5o ACAGAAAGCTTATTATATAAC - 3’ 5o ATTTCTCACGCCAGGATTTG - 3’ 5’ GTATAGAGTTCCGTGCGTGTGA - 3’
53. 8% (28/52) in aninial manure. In addition, the ARGs in livestock and poultry manure of diferent farms were absolutelu
quantified by QPCR Uchnology, and the concentration of ARGs was normalized with the concentration of the inUrnai referencc
(北京市畜牧业环境监测站,北京102200)
摘要:为研究畜禽粪便中抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Genes, ARGs) 3染水平和分布特征,采集26家规模
化养殖场畜禽粪便,利用荧光定量PCR技术检测四环素类抗性基因和/诺酮类抗性基因及表达丰度。结果发现,畜禽
粪便中四环素类抗性基因平均检出率为78.2% (61/78),/诺酮类抗性基因平均检出率为53.8% (28/52)。另外,

氨苄青霉素抗性基因

氨苄青霉素抗性基因简介氨苄青霉素是一种广谱β-内酰胺类抗生素,广泛应用于临床治疗病原体感染。

然而,近年来,氨苄青霉素的抗性问题逐渐凸显,抵抗力强的细菌株对该药物表现出高度的耐药性。

这种抗性主要是由一系列氨苄青霉素抗性基因的突变导致的。

本文将重点介绍氨苄青霉素抗性基因的种类、作用机制以及检测方法,旨在加深对氨苄青霉素抗性基因的认识,为抗生素的合理使用提供参考。

氨苄青霉素抗性基因种类TEM基因家族TEM基因家族是氨苄青霉素抗性基因中最常见的一类,属于β-内酰胺酶基因。

该基因家族包含多个突变亚型,在细菌中可以引起多种抗性表型。

例如,TEM-1是最早发现的TEM 基因,它突变导致的酶活性升高,从而降低了氨苄青霉素对细菌的抑制作用。

SHV基因家族SHV基因家族也是氨苄青霉素抗性基因的重要成员,与TEM基因家族类似,SHV基因也是β-内酰胺酶基因。

不同于TEM基因的是,SHV基因的突变主要发生在基因的启动子区域,从而导致抗生素的降解酶水平升高,细菌变得对氨苄青霉素的抗性增加。

CTX-M基因家族CTX-M基因家族是近年来发现的一类氨苄青霉素抗性基因,属于分泌型β-内酰胺酶基因。

这些基因主要通过活性泵的增强或者酶水平的上调来提高细菌对氨苄青霉素的耐药性。

氨苄青霉素抗性基因的作用机制氨苄青霉素抗性基因主要通过改变细菌的靶标酶或者增加抗药物代谢酶的水平来降低抗生素的抑制作用。

一方面,某些抗性基因所编码的酶通过突变导致其结构发生改变,从而抑制氨苄青霉素与靶标酶的结合,使药物对细菌的抑制作用降低。

另一方面,某些抗性基因所产生的酶能够降解氨苄青霉素,减少其在细菌内的浓度,从而细菌对抗生素产生抗性。

氨苄青霉素抗性基因的检测方法基因测序法基因测序法是目前最常用的检测氨苄青霉素抗性基因的方法。

该方法利用高通量测序技术,通过对细菌基因组进行测序分析,识别与氨苄青霉素抗性相关的基因。

基因测序法的优势在于能够全面地检测氨苄青霉素抗性基因,并且可以确定其具体的突变位点。

抗体芯片的原理及应用

抗体芯片的原理及应用1. 引言抗体芯片是一种新型的生物芯片技术,基于抗体的高度特异性和亲和力,可以在微小的芯片上同时检测多种目标物质。

本文将介绍抗体芯片的原理以及其在医学、生物学和食品安全等领域的应用。

2. 抗体芯片的原理抗体芯片的原理基于抗体与抗原的特异性结合。

通常,抗体会与抗原结合形成抗原-抗体复合物。

抗体芯片利用这一原理,将抗体固定在芯片表面的特定区域上,形成具有高度特异性的免疫识别区域。

2.1 制备抗体芯片制备抗体芯片需要经过以下步骤: - 抗体的纯化:从免疫动物的血清中分离纯化抗体。

- 抗体的定向固定:将纯化得到的抗体定向地固定在芯片表面的特定区域上。

- 表面修饰:对芯片表面进行化学修饰,增强抗体与抗原的结合能力。

- 质检:对抗体芯片进行质检,确保芯片上抗体的质量和稳定性。

2.2 抗体芯片的工作原理抗体芯片的工作原理可分为以下几个步骤: 1. 样本处理:将待检测的样本与标记物标记的抗体进行反应。

2. 样本加载:将处理后的样本加载到抗体芯片上,使样本中的目标物质与芯片上的抗体发生特异性的结合。

3. 洗涤:使用缓冲液洗去非特异性结合的样本成分,以减少干扰信号。

4. 信号产生:使用荧光物质或酶标记等方法产生信号,表征目标物质的存在程度。

5. 信号检测:使用相应的检测设备对芯片上的信号进行检测和分析。

6. 数据分析:根据信号的强度和分布情况,对样本中的目标物质进行定量或定性分析。

3. 抗体芯片的应用抗体芯片广泛应用于医学、生物学和食品安全等领域。

下面分别介绍其在这些领域的应用情况。

3.1 医学应用抗体芯片在医学领域的应用主要涉及以下方面: - 肿瘤标志物检测:利用抗体芯片可同时检测多种肿瘤标志物的水平,对肿瘤的早期诊断和治疗具有重要意义。

- 药物筛选:通过抗体芯片可以高通量地筛选出与特定药物相互作用的目标蛋白,为新药的研发提供重要信息。

- 个体化医疗:抗体芯片可以实现对个体化医疗的支持,通过检测患者体内的抗体水平,辅助医生为患者选择最佳治疗方案。

微流控芯片技术及质谱技术用于细菌耐药性检测及耐药机制研究

Journal of China Pharmaceutical University 2023,54(6):695 - 705学 报微流控芯片技术及质谱技术用于细菌耐药性检测及耐药机制研究张冬雪,乔亮*(复旦大学化学系,复旦大学生物医学研究院,上海 200433)摘 要 细菌耐药性严重影响全球公共卫生安全。

抗生素错用和滥用不仅没有达到治疗细菌感染性疾病的效果,反而会刺激细菌发生DNA损伤修复反应(SOS反应),加剧细菌耐药性的进化和耐药菌的传播。

本文聚焦于耐药菌,简明介绍细菌耐药性与SOS反应,系统概述了质谱技术、微流控技术及其联用技术在细菌检测及细菌耐药机制研究中的应用。

本文为细菌耐药性相关的药物靶点挖掘及新药开发提供理论参考,以期发展细菌耐药性快速检测新方法和抑菌新方法,推动临床细菌感染性疾病的诊断与治疗。

关键词细菌耐药;耐药机制;微流控技术;质谱检测;组学分析中图分类号O65;R318 文献标志码 A 文章编号1000 -5048(2023)06 -0695 -11doi:10.11665/j.issn.1000 -5048.2023060203引用本文张冬雪,乔亮.微流控芯片技术及质谱技术用于细菌耐药性检测及耐药机制研究[J].中国药科大学学报,2023,54(6):695–705.Cite this article as:ZHANG Dongxue,QIAO Liang. Microfluidic chip and mass spectrometry-based detection of bacterial antimicrobial resis⁃tance and study of antimicrobial resistance mechanism[J].J China Pharm Univ,2023,54(6):695–705.Microfluidic chip and mass spectrometry-based detection of bacterial antimi⁃crobial resistance and study of antimicrobial resistance mechanism ZHANG Dongxue, QIAO Liang*Department of Chemistry, and Institutes of Biomedical Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, ChinaAbstract Bacterial antimicrobial resistance (AMR) is a globally serious problem that threatens public health security.Misuse and abuse of antibiotics cannot achieve the effect of treating bacterial infectious diseases, but will trigger the SOS response of bacteria, exacerbating the evolution of bacterial AMR and the spread of resistant bacteria.This article focuses on antibiotic-resistant bacteria, briefly introduces the pathogenesis of bacterial AMR and SOS response, and systematically summarizes the determination and mechanism study of bacterial AMR based on microfluidics and mass spectrometry.This article provides theoretical basis for AMR-related drug target mining and new drug development, aiming to develop new methods for rapid detection of bacterial AMR and new methods for bacteria inhibition, and promote the diagnosis and treatment of clinical bacteria infectious diseases. Key words bacterial antimicrobial resistance; mechanism of antimicrobial resistance; microfluidics; mass spec⁃trometry detection; omics analysisThis study was supported by China Postdoctoral Science Foundation (No.2022M720806)细菌是最常见的病原微生物之一,是引起大部分感染性疾病的重要原因。

抗生素检测原理

抗生素检测原理抗生素是一类抗菌剂,具有抗菌性和抗病毒性,能抑制细菌的生长和繁殖以及对抗病毒引起的疾病。

抗生素检测是一种细菌抗药性的检测,它可以发现不同的细菌对抗生素的耐药性。

抗生素检测的原理主要分为两种,一种是抑制法,一种是快速抗性检测(RTC)。

抑制法是一种抗生素检测原理,它是通过抗生素抑制细菌生长,测量细菌的对抗生素的耐药性。

在抑制法中,将细菌接种于含有抗生素的培养基中,然后观察其细菌生长及其对抗生素的耐药性。

当细菌生长受到抗生素的抑制时,研究者就可以确定抗生素的种类及其耐药性的程度。

另一种抗生素检测原理是快速抗性检测(RTC)。

这种检测方法是对生物样品中的抗生素检测的一种方法,用于确定细菌对抗生素的耐药性。

这种抗生素检测原理主要包括抗菌聚合酶链反应(PCR)、免疫发毒(ELISA)技术和荧光抗性检测(FRET)等抗生素检测技术。

PCR 技术可以检测出细菌中特异性基因,从而快速识别出具有抗药性的菌株。

ELISA方法则是通过诱导测定抗生素的特定抗原的特异性抗体,从而发现具有抗生素抗性的菌株。

FRET技术可以检测菌体中细菌的抗药性,而无需抑制细菌生长。

抗生素检测一直是医学发展中重要的一个方面,它是一种有效的诊断感染性疾病的手段。

抗生素检测不仅能快速发现细菌的抗药性,还可以快速区分出肠杆菌属细菌,提供有效的、精确的防护措施,为临床医学提供可靠的诊断和优化治疗提供了很好的支持。

随着抗菌药物的不断发展,抗生素的检测也发生了极大的变化,而抗生素检测的原理也被进一步研究和完善。

抑制法、快速抗性检测(RTC)和其他抗生素检测技术,都能提供诊断支持和精确治疗,为医疗保健工作提供技术手段。

未来,将会有更多抗生素检测技术不断推出,以加强抗药性易感菌的识别,以便有效的制定抗感染药物的应用,从而提高人们的健康水平和生活质量。

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抗生素抗性基因芯片检测全面介绍
1、什么是抗生素抗性基因芯片检测?
针对383个抗生素抗性基因设计的对应qPCR引物包装至薄层金属合金纳米孔芯片得到高通量qPCR芯片,基于SmartChip Real-Time PCR System可对多个样本进行高效性、高通量、高精确性和高灵敏度的目标基因检测和定量计算。

同时搭建高通量自动微量加样和基因定量分析平台,可一次性高速完成5184个反应和数据分析,规避了以往传统qPCR方法的基因检测单一化、费用成本高和效率低等等缺点。

2、抗生素抗性基因芯片检测的优势
●检测通量高,383个抗生素抗性基因同时检测;
●样本用量低,构建纳升级别反应体系;
●绝对定量,根据16S rRNA的绝对定量信息换算所有基因的绝对
定量信息;
●特异性高,对文献及数据库收录的引物反复实验获取高特异性引
物。

3、应用方向
●抗生素抗性基因分布特征;
●抗生素抗性基因传播机制研究。

4、实验流程
样本准备核酸提取qPCR芯片反应数据处理
5、分析流程
6、样本要求
土壤、淤泥、沉积物:≥ 3 g
粪便:≥ 1 g
水样滤膜:≥ 1 张
拭子样本:≥ 2 个
DNA:浓度≥ 20 ng/μL;总量≥ 2 ng
7、技术参数
生物学重复:微生物样本重复数≥3个;
检测系统:SmartChip Real-Time PCR System
项目周期:25个工作日
8、结果展示
基因检测统计
根据各基因在各样本中的Ct值统计出基因检测情况,其中在表格中标注“0”代表该基因在对应样本中未检出,在表格中标注“1”代表该基因在对应样本中检出。

而只有在三个技术重复中均被检出的基因,才会将该基因判定为阳性。

各基因检测统计(包括技术重复)
基因定量总表
根据SmartChip Real-Time PCR System和Canco软件给出的各基因在各样本中的Ct值,根据相对定量= 10^(31-Ct)/(10/3)公式,计算得出各基因在各样本中的相对定量信息。

而只有在三个技术重复中均被检出的基因,才会将该基因判定为阳性,并计算其平均值作为该基因在对应样本中相对定量。

其中在表格中标注“0”代表该基因在对应样本中未检出,而表格中的数值代表该基因在对应样本中的定量,数值越大意味着该基因在对应样本中的定量越高。

各基因定量总表(包括技术重复)
基因绝对定量
根据16S rRNA基因的绝对定量换算得到各基因在各样本中的绝对定量信息,公式如下:
16S相对定量/16绝对定量=基因相对定量/基因绝对定量表格中数值代表在对应样本中每微升的基因拷贝数量,而只有在三个技术重复中均被检出的基因,才会将该基因判定为阳性,并计算其平均值作为该基因在对应样本中绝对定量。

其中在表格中标注“0”代表该基因在对应样本中未检出,表格中的数值代表该基因在对应样本中的绝对定量,数值越大意味着该基因在对应样本中的绝对定量越高。

基因绝对定量结果(包括技术重复)。

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