生物信息学课程题目20161217
小学生物生物信息学小测验
- A. GenBank
- B. RefSeq
- C. Ensembl
- D. UniProt
7.生物信息学中，将大量生物数据进行比较分析，以寻找生物学规律的方法称为____。
- A.数据挖掘
- B.统计分析
- C.机器学习
- D.比较基因组学
8.生物信息学中的生物标记物主要应用于____。
- A.疾病诊断
- B.疾病治疗
- C.疾病预防
- D.药物研发
9.生物信息学中的模式识别主要基于____。
- A.机器学习
- B.统计学
- C.计算机视觉
- D.人工智能
10.生物信息学中的数据标准化主要是为了解决____问题。
- A.数据质量
- B.数据重复
- C.数据异构
- D.数据缺失
##二、判断题（每题2分，共10分）
- B.疾病治疗
- C.疾病预防
- D.药物研发
8.生物信息学中的数据标准化主要是为了解决____问题。
- A.数据质量
- B.数据重复
- C.数据异构
- D.数据缺失
9.生物信息学中的同义词消歧主要是为了____。
- A.提高数据一致性
- B.提高数据多样性
- C.降低数据冗余
- D.增加数据噪声
小学生物生物信息学小测验
#小学生物信息学小测验
##一、选择题（每题2分，共20分）
1.生物信息学的定义是利用计算机技术对生物信息进行____。
- A.采集
- B.存储
- C.分析
- D.传播
2.下列哪个不属于生物信息学的研究领域？
生物信息学课后习题
绪论1、生物信息学的概念及其组成部分生物信息学（Bioinformatics）：是一门交叉学科，包含了生物信息的获取、处理、储存、分析、解释和应用在内的所有方面，它综合运用了生物学、计算机科学和数学等多方面的知识和方法，来阐述和理解大量生物学数据所包含的生物学意义，并应用于解决生命科学研究和生物技术相关产业中的各种问题。
生物信息学的三个组成部分:①建立可以存放和管理大量生物信息学数据的数据库②研究开发可用于有效分析与挖掘生物学数据的方法、算法和软件工具③使用这些工具去分析和解释不同类型的生物学数据2、生物信息学的主要研究领域①生物数据的建立与搜索②序列比较与相似性搜索③基因组结构注释④蛋白质结构与功能的预测⑤基因组数据分析⑥比较基因组合系统发生遗传学分析⑦功能基因组和蛋白质组学数据分析⑧信号传导、代谢和基因调节途径的构建与描述3、初级数据库二级数据库的概念说出几个数据并说明包含什么数据一级数据库（primary database）：数据直接来源于实验获得原始数据，只经过简单的归类、整理和注释。
例如GenBank、EMBL、DDBJ、SWISSPORT、PDB二级数据库（secondary database）：在一级数据库、实验数据和理解分析的基础上针对特定的目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步整理。
例如human genome databases GDB转录因子数据库等4、简述核酸序列的测序①DNA测序一般原理DNA测序一般采用全自动的荧光标记链终止反应完成，该法利用了DNA聚合酶能从脱氧核糖核苷酸（dNTP）延伸但不能从双脱氧核糖核苷酸（ddNTP）延伸的特性，通过加入限量的荧光标记过的双脱氧核苷酸来产生有特定终止碱基的嵌套DNA片段，然后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）分离并通过扫描仪读取序列（300-800bp）②基因组测序策略—分而治之---shortgun因为测序反应每次只能测300-800bp故先将基因组分割成一定大小的片段，然后对这些片段分别测序，测完后再将这些片段拼接起来—鸟枪法（shortgun）③一次性测序例如：表达序列标签（EST）是其中的代表，它对随机挑选的cDNA克隆进行两端一次测序得到300-500bp的片段，代表cDNA的一部分。
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案生物信息学是一门结合生物学、计算机科学、信息技术和数学的交叉学科，它利用计算机技术来分析和解释生物数据。
以下是一份生物信息学考试题及答案的示例。
生物信息学考试题一、选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学中，用于存储DNA序列的文件格式是：A. FASTAB. JPEGC. MP3D. DOCX2. 以下哪项不是生物信息学分析的基本步骤？A. 数据收集B. 数据预处理C. 数据解释D. 数据存储3. 在蛋白质序列分析中，BLAST工具用于：A. 序列比对B. 序列组装C. 序列克隆D. 序列合成4. 以下哪个数据库不是用于存储基因表达数据的？A. NCBIB. GEOC. PDBD. ArrayExpress5. 以下哪个算法不是用于基因预测的？A. GeneMarkB. BLASTC. GlimmerD. Fgenesh二、简答题（每题10分，共30分）6. 简述生物信息学在现代生物学研究中的重要性。
7. 解释什么是基因组学，并说明其在医学研究中的应用。
8. 描述序列比对的基本原理及其在生物信息学中的作用。
三、计算题（每题15分，共30分）9. 假设你有一个DNA序列，其组成为：ATCGTA。
请计算其互补序列。
10. 给定两个蛋白质序列，序列A：A-B-C-D-E，序列B：A-C-E-B-D。
请使用Needleman-Wunsch算法计算它们的全局比对得分。
四、论述题（每题20分，共20分）11. 论述生物信息学在新药开发中的作用及其面临的挑战。
答案一、选择题1. A2. C3. A4. C5. B二、简答题6. 生物信息学在现代生物学研究中的重要性体现在它能够处理和分析大量的生物数据，如基因组序列、蛋白质结构等，帮助科学家快速发现生物现象的规律，推动生物学的发展。
7. 基因组学是研究生物基因组的结构、功能和演化的科学。
在医学研究中，基因组学可以帮助我们了解疾病的遗传基础，为个性化医疗提供理论基础。
生物信息学试题
生物信息学试题一、选择题1. 生物信息学主要研究的是：A. 生物实验技术B. 生物统计学C. 生物大数据分析与计算D. 生物体内生化反应2. 在生物信息学中，常用的序列比对工具是：A. BLASTB. PCRC. ELISAD. SDS-PAGE3. 下列哪个数据库主要用于存储核酸序列信息？A. PDBB. GenBankC. UniProtD. KEGG4. 以下哪种方法不是用于蛋白质结构预测的？A. 同源建模B. 折叠识别C. 从头预测D. 实验测定5. 生物信息学中的“基因家族”是指：A. 一组具有相似序列和功能的基因B. 一组来自同一物种的基因C. 一组通过基因复制产生的基因D. 一组控制同一生物过程的基因二、简答题1. 简述生物信息学在现代医学研究中的应用。
2. 描述PCR技术的原理及其在分子生物学中的重要性。
3. 解释什么是基因编辑技术，以及CRISPR-Cas9系统是如何工作的。
三、论述题1. 论述生物信息学在新药发现和开发中的作用。
2. 分析比较RNA测序技术与DNA测序技术的优势和局限性。
四、计算题1. 给定一个DNA序列：“ATGCGATACCTGAGCTG”，计算其碱基组成的比例。
2. 假设某种生物的基因组大小为200 Mb，每个碱基对的平均质量为650 Da，计算该基因组的大致质量。
五、案例分析题1. 根据给定的某种疾病的基因组数据，分析可能的致病基因，并讨论其可能的生物机制。
2. 通过分析某物种的转录组数据，探讨其在特定环境下的适应性变化。
请注意，以上试题仅供参考，具体题目应根据实际教学大纲和考试要求进行调整。
在实际考试中，题目可能会包含更多的细节和复杂性，要求考生具备扎实的生物信息学知识和分析能力。
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案一、单项选择题（每题2分，共20分）1. DNA双螺旋结构是由哪位科学家提出的？A. 孟德尔B. 达尔文C. 沃森和克里克D. 爱因斯坦答案：C2. 下列哪种生物信息学数据库主要用于存储蛋白质序列信息？A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. KEGG答案：C3. 以下哪个选项不是生物信息学的主要研究领域？A. 基因组学B. 蛋白质组学C. 系统生物学D. 量子物理学答案：D4. 在生物信息学中，BLAST是一种用于什么目的的算法？A. 序列比对B. 蛋白质结构预测C. 基因表达分析D. 代谢途径重建5. 以下哪种生物信息学工具用于基因预测？A. ClustalWB. BLASTC. GeneScanD. FASTA答案：C6. 以下哪个选项是生物信息学中用于描述基因表达模式的术语？A. SNPB. GOC. microRNAD. EST答案：D7. 以下哪种生物信息学数据库主要用于存储基因表达数据？A. GenBankB. GEOC. PDBD. Swiss-Prot答案：B8. 以下哪个选项不是生物信息学中用于蛋白质功能预测的方法？A. 同源性搜索B. 蛋白质结构预测C. 蛋白质家族分类D. 基因组测序答案：D9. 在生物信息学中，以下哪个选项是用于描述基因组中非编码区域的A. IntronB. ExonC. Intergenic regionD. Promoter答案：C10. 下列哪种生物信息学工具用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析？A. STRINGB. ClustalWC. MEGAD. BLAST答案：A二、多项选择题（每题3分，共15分）1. 以下哪些是生物信息学中常用的序列比对工具？A. BLASTB. ClustalWC. FASTAD. MEGA答案：ABCD2. 以下哪些数据库是生物信息学中常用的？A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. PubMed答案：ABCD3. 以下哪些是生物信息学中用于基因表达分析的方法？A. qRT-PCRB. MicroarrayC. RNA-seqD. Mass spectrometry答案：ABC4. 以下哪些是生物信息学中用于蛋白质结构预测的方法？A. Homology modelingB. Ab initio modelingC. ThreadingD. Docking答案：ABC5. 以下哪些是生物信息学中用于系统生物学分析的工具？A. BioCycB. KEGGC. ReactomeD. STRING答案：ABCD三、简答题（每题5分，共20分）1. 描述基因组学和蛋白质组学的主要区别。
生物信息技术考试试题
生物信息技术考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪个不是生物信息学的主要研究内容？（）A 基因组学B 蛋白质组学C 细胞学D 代谢组学2、生物信息学中用于序列比对的常用算法是（）A 动态规划算法B 贪心算法C 分治算法D 回溯算法3、在基因表达数据分析中，常用的标准化方法是（）A RPKMB TPMC FPKMD 以上都是4、以下哪种数据库主要用于存储蛋白质结构信息？（）A GenBankB PDBC UniProtD Ensembl5、进行系统发育分析时，常用的构建进化树的方法是（）A 邻接法B 最大简约法C 最大似然法D 以上都是6、以下哪个软件不是用于基因序列分析的？（）A Primer PremierB SPSSC DNAStarD Vector NTI7、生物信息学中，预测蛋白质二级结构的方法不包括（）A 基于同源建模B 基于机器学习C 基于物理化学原理D 基于经验规则8、在生物信息学中，BLAST 程序主要用于（）A 序列比对B 进化分析C 基因预测D 蛋白质结构预测9、以下哪种编程语言在生物信息学中应用较为广泛？（）A JavaB PythonC C+＋D Fortran10、用于分析基因芯片数据的软件包是（）A R 语言中的 BioconductorB MATLABC StataD SAS二、填空题（每题 3 分，共 30 分）1、生物信息学中的三大核心数据库是_____、＿____、＿____。
2、基因序列的相似性搜索常用的工具是_____。
3、蛋白质的一级结构是指_____。
4、常见的基因注释数据库有_____、＿____等。
5、系统发育树的构建基于_____的原理。
6、生物信息学中常用的数据格式有_____、＿____等。
7、预测蛋白质三级结构的方法主要有_____、＿____。
8、基因表达数据的差异分析常用的方法有_____、＿____。
9、用于分析高通量测序数据的软件有_____、＿____。
生物信息学试题及答案
广东海洋大学 2013—— 2014 学年第 一 学期《生物信息学 》课程试题答案课程号： 13432210 √ 考试 √ A 卷 √ 闭卷 □ 考查□ B 卷□ 开卷一、 简答题(一) 生物信息学及主要内容？(3)生物信息学是生物和信息技术的结合，这一学科包括了用来管理、分析和操作大量生物数据集的任何计算工具和方法。
(二) 生物信息学主要由哪三个组成部分？(6)1、 建立可以存放和管理大量生物信息学数据集的数据库；2、 开发确定大数据集中各成员关系的算法和统计方法；3、 使用这些工具来分析和解释不同类型的生物数据，包括DNA ，RNA 和蛋白质序列、蛋白质结构、基因表达以及生化途径。
(三) 存储在GenBank 中DNA 序列的类型？(6) 1、基因组DNA 2、cDNA 3、重组DNA(四) 解释下图说明基因组测序的策略？(6)1、霰弹测序法(shot gun sequencing)：随机打碎大DNA 分子，通过很多测序反应来覆盖整个分子，完整的序列通过使用计算机搜索重叠区来重新拼接。
2、克隆重叠群(clone contig)的方法中，DNA 片段用推理的方法亚克隆，并且进行系统的测序直到整个序列完成。
(五) 按制备方式分DNA 芯片的主要类型？(6)1、 原位合成芯片：采用显微光蚀刻等技术在特定部位原位合成寡核苷酸而制备的芯片。
探针较短；2、 DNA 微集阵列：将预先制备的DNA 片段以显微打印的方式有序地固化于支持物表面而制成的芯班级：姓名：学号：试题共页加白纸 2张密封线GDOU-B-11-302片。
探针的来源较灵活。
(六) 解释下图说明用芯片如何测定不同组织中基因表达的差异？(8)1、将要检测的基因用芯片点样仪芯片上2、提取待测样品和对照样品的RNA，分别用用Cy3标定一种RNA，而用Cy5标定另一种RNA。
Cy3发红色荧光，Cy5发绿色荧光。
3、用不同的激发光照射，测定两种样品中DNA的表达量。
生物信息学题库
■一、选择题:1.以下哪一个是mRNA条目序列号： A. J01536■. NM_15392 C. NP_52280 D. AAB1345062.确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是：■. Unigene B. Entrez C. LocusLink D. PCR3.一个基因可能对应两个Unigene簇吗？■可能 B. 不可能4.下面哪种数据库源于mRNA信息：■dbEST B. PDB C. OMIM D. HTGS5.下面哪个数据库面向人类疾病构建： A. EST B. PDB ■. OMIM D. HTGS6.Refseq和GenBank有什么区别： A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列B. GenBank提供的是非冗余序列■. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D. GenBank源于Refseq7.如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择： A. OMIM B. Entrez ■PubMed D. PROSITE8.比较从Entrez和ExPASy中提取有关蛋白质序列信息的方法，下列哪种说法正确：A. 因为GenBank的数据比EMBL更多，Entrez给出的搜索结果将更多B. 搜索结果很可能一样，因为GenBank和EMBL的序列数据实际一样■搜索结果应该相当，但是ExPASy中的SwissProt记录的输出格式不同9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于：■N/W/Y B. Q/W/Y C. F/W/Y D. Q/N/W10.直系同源定义为：■不同物种中具有共同祖先的同源序列B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列11.下列那个氨基酸最不容易突变： A. 丙氨酸B. 谷氨酰胺 C. 甲硫氨酸■半胱氨酸12.PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变： A. 1% B. 20%■. 80% D. 250%13.下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同：A. 全局比对通常用于比对DNA序列，而局部比对通常用于比对蛋白质序列B. 全局比对允许间隙，而局部比对不允许C. 全局比对寻找全局最大化，而局部比对寻找局部最大化■全局比对比对整体序列，而局部比对寻找最佳匹配子序列14.假设你有两条远源相关蛋白质序列。
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生物信息学课程作业
运用所学的生物信息学知识，结合本研究领域，进行分析。
要求：
一：一定要结合本研究领域，写一个5000字左右的研究报告，包括插图、表格和文字等。
二：分析中使用的软件要写明版本号。
三：报告内容：
Title page: 文章题目（中文题目），字体二黑，同时注明学号，姓名，所属学院，专业，电子邮箱（小四宋体）
研究报告正文部分：
1：文章题目（中文题目），字体二黑；
2：中英文摘要：250字左右，字体5号楷体，英文用Arial；3：关键词：3－5个，字体5号黑体；
4：正文部分研究背景，材料与方法，结果与讨论部分全文用小四号宋体，英文用Arial字体, double间距，文中图采用5号字体；5：参考文献，格式请参考Bioinformatics。
四：提交时间：报告最后生成pdf格式文件，于2016年12月31日前将报告同时发给以下邮箱：tottyhy@
邮件主题请标注生物信息学题目2
题目1：结合自己的研究领域中的一种疾病，比如肿瘤，神经退行性疾病、心血管疾病、精神性疾病、代谢疾病以及其它疾病进行识别疾病发展过程中的关键基因或蛋白或通路。
基因芯片号访问号：
ＧＳＥ２２２５５
ＧＳＥ３８７９２
ＧＳＥ４１８８３
（1）从GEO或ArrayExpress等数据库中下载微阵列数据。
结果包括：
①下载的基因芯片访问号要写出来。
②对具体的疾病条件要能简单描述。
（2）对下载的数据进行预处理（可忽略）
（3）对疾病在不同条件下(比如癌组织和癌旁组织，野生型和突变型，以及不同的时间点)进行差异基因表达分析，筛选出差异基因。
结果包括：
①差异基因（选取前50个）
②差异基因的heatmap图
③对差异基因进行可视化，比如火山图等。
4）使用DAVID和WebGestalt等软件，对差异基因进行富集和通路分析。
5）对差异基因进行PPI(蛋白-蛋白互相作用)分析。
2：结合本研究领域，利用核酸(ncbi、embl和ddbj)和蛋白质数据库(SwissProt)找出你所感兴趣的基因或蛋白，找出与其它物种的同源基因或蛋白，并分析其可能的进化历史。