土壤微生物多样性
微生物多样性对土壤质量的影响
微生物多样性对土壤质量的影响1. 引言微生物是土壤中不可或缺的组成部分，其多样性对土壤质量具有重要的影响。
本文将探讨微生物多样性对土壤质量的具体影响及其机制。
2. 微生物多样性与土壤功能微生物多样性直接关系到土壤的各项功能，包括养分循环、有机物分解、植物生长促进等。
不同类型的微生物在土壤中扮演不同的角色，共同维持土壤的良好状态。
3. 微生物多样性与养分循环微生物多样性对土壤的养分循环过程起到重要调控作用。
一方面，不同微生物种类对不同养分有不同的利用能力，确保了有效养分的循环和利用；另一方面，微生物可以分解有机质，使其转化为可供植物利用的营养物质。
4. 微生物多样性与有机物分解土壤中的有机物分解主要依赖于微生物的参与。
微生物在有机质的降解过程中产生酶，通过分解有机物质，将其转化为简单的有机酸、二氧化碳等物质，并释放出能量。
微生物多样性的增加可以促进有机物分解的速率和效率。
5. 微生物多样性与植物生长促进微生物在土壤中与植物形成共生关系，通过与植物根系相互作用，促进植物的生长发育。
微生物可以分解土壤中的矿质，释放出营养元素供植物吸收；同时，微生物可以产生植物生长的激素物质，促进植物根系的发育。
6. 微生物多样性与土壤质量评价微生物多样性常常被作为评价土壤质量的重要指标之一。
一个具有高度多样性的微生物群落往往代表了土壤质量的良好和健康。
通过测定微生物多样性的指标，可以更准确地评估土壤的肥力、健康状况和生态功能。
7. 微生物多样性维持的机制微生物多样性在土壤中的维持往往依赖于多种因素，包括土壤pH值、湿度、养分状况等。
研究表明，土壤中的养分丰富度和多样性是维持微生物多样性的重要因素，而土壤酸碱度、湿度等也会对微生物群落的组成和多样性产生影响。
8. 微生物多样性维护与管理保护和维护土壤中的微生物多样性对土壤质量的改善至关重要。
合理施用有机肥料、避免过度耕作和化学物质的使用等措施可以减少对微生物群落的负面影响。
农田土壤的微生物多样性
农田土壤的微生物多样性农田土壤的微生物多样性农田土壤是农作物生长的重要基质，其中包含着丰富的微生物群落。
微生物多样性是指土壤中微生物的种类丰富程度和相对丰度的指标。
农田土壤的微生物多样性对农作物生长、土壤养分循环以及土壤生态系统的稳定性具有重要影响。
一、微生物多样性的重要性农田土壤的微生物多样性对土壤健康和农作物生长具有重要意义。
首先，微生物多样性可以维持土壤的生态平衡。
不同种类的微生物具有不同的功能，包括有益微生物（如氮固定菌、磷溶解菌等）和有害微生物（如土传病原微生物）。
微生物多样性的存在可以抑制有害微生物的繁殖，减少病害发生的概率。
其次，微生物多样性对土壤养分的循环起到重要作用。
土壤中微生物通过分解有机物、矿化养分等途径将有机物转化为植物可吸收的形态，促进土壤养分的释放和吸收。
最后，微生物多样性对土壤生态系统的稳定性至关重要。
微生物群落的丰富性可以提高土壤的抗干旱、抗病虫害的能力，保持土壤的结构和功能完整。
二、影响微生物多样性的因素农田土壤的微生物多样性受到多种因素的影响。
首先，农业经营方式对微生物多样性具有重要影响。
常规的农业生产方式，如大面积的化肥使用、农药施用等，会影响土壤微生物的组成和多样性。
有机农业、生态农业等环境友好的农业经营方式可以提高农田土壤的微生物多样性。
其次，农作物类型和轮作方式对微生物多样性产生影响。
不同类型的农作物对微生物的吸引力不同，有些农作物可以促进某些有益微生物的繁殖，从而增加微生物的多样性。
此外，土壤环境因素如pH 值、温度、湿度等也对微生物多样性产生重要影响。
不同环境条件下，微生物的组成和相对丰度会发生变化。
三、保护和提高农田土壤的微生物多样性保护和提高农田土壤的微生物多样性对于农业的可持续发展至关重要。
首先，合理施肥是保护微生物多样性的重要措施之一。
减少化肥的使用量、采用有机肥料和绿肥等施肥方式，可以减少对微生物的不良影响，增加有益微生物的繁殖。
其次，合理利用农药也是重要的措施。
土壤微生物群落的多样性和功能
土壤微生物群落的多样性和功能土壤微生物群落是指生活在土壤中的微生物种类和数量的总称。
土壤微生物是土壤生态系统中最为重要的组成部分之一，它们通过各种代谢和分解作用，促进有机物的分解和循环，增加土壤质量，对环境的保护和维护起着重要的作用。
土壤微生物的多样性土壤微生物的种类众多，据估计，每一克土壤中就有几千种微生物群落，包括细菌、真菌、放线菌、原生动物和线虫等多种生物。
它们在土壤中分布广泛，各自占据不同的生态位。
土壤微生物的多样性是土壤生态系统的重要组成部分，它能反映土壤的生物学多样性。
微生物的多样性受到许多因素的影响，如土壤温度、湿度、氧气含量、有机质含量、土壤pH值等因素。
在相同的环境条件下，土壤微生物的组成和数量也会随着区域的不同而产生很大的差异。
土壤微生物的功能土壤微生物在土壤生态系统中的功能非常重要，它们通过代谢、分解和循环作用，维持着土壤的健康与稳定性。
土壤微生物的主要功能可以分为以下几个方面：1. 分解和转化有机质：土壤微生物通过吸收有机质、分泌酶类等方式将有机物转化为无机物，促进有机物的分解和循环。
2. 改善土壤结构：土壤微生物可以通过分泌胶质和胞外聚合物等物质，来促进土壤结构的改善和稳定，提高土壤的透气性和保水性，有利于水分和养分的流通和利用。
3. 保护环境：土壤微生物可以产生对酸、碱、盐和有毒物质具有净化作用的物质，对环境的保护和维护起着重要的作用。
4. 促进植物生长：土壤微生物可以通过固氮、产生各种生长因子和维生素、分泌酶类等多种方式，促进植物的生长和发育。
土壤微生物的多样性和功能对生态系统的影响土壤微生物的多样性和功能直接影响着土壤生态系统的稳定性和可持续性。
微生物的多样性越丰富，土壤生态系统的稳定性就越高，土壤养分的循环和利用效率也越高。
而生态系统的稳定性和适应性高，则意味着它具有更强的耐性和适应性，更容易对抗外部环境的变化和干扰。
另外，土壤微生物的功能也影响着植被的生长和发育。
土壤微生物多样性
土壤微生物多样性
土壤微生物多样性是指土壤中各种微生物的多样性。
这种多样性有助于维持土壤的生态系统、生物的平衡，并在土壤内部创造出一个有利的生长环境。
从土壤的细微生物多样性中可以看出土壤的质量、生态环境的特征和植被的状况。
土壤的微生物多样性是取决于气候、土壤性质、植物的参与等因素的综合体现。
土壤中的
微生物多样性是众多微生物相互作用的结果，这种相互作用是以竞争和协同为特征的，可
以有效地改善土壤肥力和环境适宜性。
土壤微生物多样性被广泛应用于农业，如病原菌的抗药性，可以抑制有害的昆虫和真菌；
在农林土壤，可以抑制杂草的生长并促进作物的生长；还可以改善植物对养分的吸收；有
助于改善植物病虫害鉴定，及早控制除虫菊等植物病害；有助于植物应激能力提高，增加
养分吸收；有助于防止酸雨对土壤的危害，促进土壤有机质和营养元素的稳定；还可以使
土壤保持结构稳定，防止水土流失等问题。
土壤微生物多样性的保护和维持不仅有助于增加土壤的肥力，而且能够增加土壤的稳定性
和活力，确保它能够为植物提供充足的养分和原料进行合成，而且有助于确保农林生态系统正常运行。
然而，由于土壤微生物多样性的保护工作比较困难，技术还有待进一步完善。
还应该采取有效措施来加强我们对土壤微生物的认识，增强环境保护意识，从而提高土壤微生物多样性的保护水平。
微生物在土壤生态系统中的多样性与功能研究
微生物在土壤生态系统中的多样性与功能研究土壤，这个我们脚下看似平凡的物质，实际上是一个充满生机和活力的生态系统。
在这个系统中，微生物扮演着至关重要的角色。
它们数量庞大、种类繁多，其多样性和功能对土壤的健康、生态平衡以及农业生产等方面都有着深远的影响。
微生物的多样性在土壤中可谓令人惊叹。
从细菌到真菌，从放线菌到原生动物，每一种微生物都有着独特的形态和生理特性。
细菌是土壤微生物中数量最多的类群之一，它们形态各异，有的呈球状，有的呈杆状，还有的呈螺旋状。
真菌则以菌丝的形式在土壤中生长，形成复杂的网络结构。
放线菌具有独特的菌丝体结构，能够产生多种抗生素。
原生动物则在土壤中扮演着消费者的角色，它们以细菌和其他微生物为食，维持着土壤生态系统的平衡。
这些微生物在土壤中的分布也不是随机的，而是受到多种因素的影响。
土壤的质地、酸碱度、水分含量、温度以及有机物质的含量等都会影响微生物的种类和数量。
例如，在肥沃的黑土中，微生物的多样性通常较高，因为丰富的有机物质为它们提供了充足的营养来源。
而在贫瘠的沙地中，微生物的种类和数量则相对较少。
微生物在土壤生态系统中具有多种重要的功能。
首先，它们在土壤的物质循环中起着关键作用。
例如，微生物能够分解有机物质，将其转化为植物可以吸收利用的养分。
在这个过程中，细菌和真菌协同工作，将复杂的有机物分解为简单的无机物，如二氧化碳、水和各种矿物质。
这不仅为植物提供了营养，还有助于维持土壤的肥力。
其次，微生物能够促进土壤结构的形成和稳定。
一些微生物可以分泌粘性物质，将土壤颗粒粘结在一起，形成团粒结构。
这种结构有利于土壤通气、保水和保肥，为植物的生长创造了良好的条件。
同时，微生物的活动还能够改善土壤的孔隙度，增加土壤的透气性，促进根系的生长和发育。
再者，微生物在土壤的生物防治方面也发挥着重要作用。
一些有益微生物可以产生抗菌物质，抑制病原菌的生长和繁殖，从而减少植物病害的发生。
例如，某些芽孢杆菌能够产生抗生素，对多种植物病原菌具有拮抗作用。
土壤生态系统的微生物多样性和富集调控
土壤生态系统的微生物多样性和富集调控土壤是地球上最复杂的自然系统之一，人类的生存和发展与土壤密不可分，而土壤的微生物多样性及其富集调控则是土壤生态系统中最为关键的环节之一。
一、土壤微生物多样性的意义土壤微生物多样性是指土壤中的各种微生物种类和数量。
微生物在土壤生态系统中的生物量和生化过程中起着至关重要的作用。
它们是土壤养分循环的主要推动力，能够分解和转化有机物质，还能促进植物生长和抵御病害虫害。
土壤微生物的多样性直接影响着各种生态系统功能的维持和稳定，以及土地肥沃、协同、干燥和寒冷等不同环境下生物多样性维持。
土壤微生物多样性的丧失或退化会使土地生态功能失调、减少植物产量等不利影响。
因此，了解土壤微生物的多样性及其富集调控至关重要。
二、土壤微生物多样性的影响因素土壤微生物多样性的影响因素很多，主要有以下几个方面：1. 生境因素：土壤pH值、有机质含量、水分、通气性等都会影响土壤微生物的多样性。
各种微生物对于不同的生境条件有不同的适应能力。
2. 植被因素：植物根系分泌物可以滋养微生物，不同的植物种类和密度对于微生物多样性具有不同的影响。
3. 氮素和磷素的施加：巨量的氮和磷肥料对于土壤微生物的生长发育有明显的影响，田间喷洒末数据析剂的效果也经过了实践的证明。
三、土壤微生物的富集调控1. 通过施用菌剂来调控微生物多样性。
施用菌剂可以增加土壤中有益微生物的数量，来增强土壤抗病、抗旱和抗盐碱的能力。
2. 植物的根际调控作用。
适宜的农作环境的管理可以通过植物的根际调控作用来减轻土壤重金属污染和其他化学物质危害，减少生物和植物受到的损害和压力。
3. 通过肥料的正确使用来控制微生物种群和数量。
例如，施加一定量的磷肥可以促进微生物生长发育，而过多的氮肥则会抑制微生物的生长发育。
4. 主体干预。
通过抑制土壤中的有害微生物的生长，来增加有益微生物的数量。
例如，在蚯蚓降解能力较强的土壤中增加蚯蚓的数量，就可以有效地降低土壤中的病害菌的数量。
土壤微生物的多样性与功能
土壤微生物的多样性与功能土壤微生物是生物圈中最丰富的微生物群落之一，其生态系统功能与生物多样性密切相关。
土壤微生物群落具有极高的多样性，它们可以完成物质循环和能量转换，对生态系统的健康和稳定发挥着至关重要的作用。
然而，随着全球土壤退化和污染的日益加剧，保护和促进土壤微生物的多样性和功能成为了一个急需解决的问题。
1. 土壤微生物的多样性土壤微生物包括细菌、真菌、原生动物和病毒等多种微生物群落。
这些微生物在土壤中发挥着重要的生态功能，包括有机物分解、养分循环、土壤固结和植物生长促进等。
研究表明，土壤微生物多样性对于生态系统的健康和稳定至关重要。
土壤微生物的多样性不仅能够增加土壤中的生态系统功能和抗御力，同时也有助于保持土壤环境的稳定性，减缓全球气候变化对土地的影响。
2. 土壤微生物的功能土壤微生物对于植物和动物生态健康有着非常重要的作用。
它们可以直接或间接地参与生态系统的多种功能，如营养物质的转换、氮素循环和水循环等。
此外，土壤微生物还可以参与抗生素和酶的合成、产生重要的土壤催化剂和抗菌剂等。
这些功能对于维持土壤生态平衡和生物地球系统的长期健康至关重要。
3. 土壤微生物与生态系统健康土壤微生物不仅对人类的生物健康有着影响，同时也对生态系统健康起到了至关重要的作用。
随着全球气候变化和土地退化的不断加剧，土壤微生物的多样性和生态功能也面临着不断的挑战。
因此，保护和促进土壤微生物的多样性和功能已经成为了一项重要的环保任务。
4. 保护土壤微生物的方法为了保护和促进土壤微生物的多样性和功能，有一些行动可以采取。
首先，应该限制对生态系统的人类干预和压力，尤其是土地的过度利用和土地生态系统破坏的行为。
其次，应该加强土地的管理和保护，保证生态环境的稳定和土地生态系统的健康；同时，要加强对于土壤生态系统的监测和管理，提高对土壤微生物多样性和功能的保护能力。
总之，土壤微生物多样性和功能对于人类和生态系统健康具有非常重要的影响。
土壤微生物的功能和多样性研究
土壤微生物的功能和多样性研究土壤是地球上最为基本的生态系统之一，其中微生物在土壤生态系统中起着重要的作用。
土壤微生物可分为细菌、真菌、放线菌、蓝藻等多种类型。
这些微生物既有好菌也有坏菌，有益菌则可以分解有机物、固定氮、增加土壤肥力，帮助作物生长。
一、土壤微生物的功能1. 分解有机物土壤的有机物质主要由植物残体、动物残体和微生物体细胞等构成。
而土壤中有机物的分解则归功于微生物的功能。
细菌和真菌通过分泌酶分解土壤中的有机物质，从而降解成较小的有机分子、无机盐和水；放线菌则能通过产生大量的酶类分解纤维素和淀粉等。
这样一来，土壤中的养料就得到了加速分解，有机物的分解速度得以加快。
2. 固定氮固定氮又称为氮素固定，指将空气中无机氮转化为可被植物吸收的氮素的过程。
土壤微生物中一些细菌可通过合成酶固定氮，从而将空气中的氮气转化为氨化合物，利用这些氨化合物可为植物提供生长所需的氮素物质，进而促进植物生长发育。
3. 提高土壤肥力土壤微生物是土壤中最有益的组成成分之一，它们通过分解有机物、固定氮、分解无机矿物质等，保持土壤肥力和生态环境的稳定性。
土壤中的细菌、真菌和放线菌和动物、植物及微生物形成了一个完整的生态系统。
其中，土壤微生物的功能起到了稳定这一土壤生态系统的重要作用。
二、土壤微生物的多样性1. 细菌多样性土壤中的细菌数量极其繁盛，其数量可能高达每克土壤数百万个，因此细菌是土壤微生物中的主要组成部分。
而细菌的多样性程度比较高，根据不同的生态环境，还可分成许多不同的类别，如硝化细菌、生物甲烷微生物、厌氧细菌等。
土壤中的细菌多样性对于保持土壤生态系统的稳定性非常重要。
2. 真菌多样性真菌也是土壤微生物中比较重要的一部分，代表了土壤中真菌的多样性。
真菌对于土壤有机物质的降解非常重要，同时也是许多植物的共生伙伴。
例如蘑菇、神经菌等，这些是土壤真菌中比较著名的代表。
土壤真菌的多样性对于维持土壤的生态环境和生态安全都有很大的意义。
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土壤微生物多样性的研究进展摘要：土壤微生物是土壤的重要组成部分，是土壤有机质和土壤养分转化和循环的主要动力，它参与土壤有机质的分解、腐殖质的形成等生化过程，在土壤生态系统中起着非常重要的作用。
本文从土壤微生物多样性的定义、研究层次、研究方法和其影响因素来阐述目前国内外土壤微生物多样性的研究进展，并对目前存在的问题和今后面临的挑战提出几点看法。
关键词：土壤微生物；多样性；PCR-DGGEAdvances of studies on soil microbial diversity Abstract:Soil microorganism, one of the important components of soil, is the main power of soil organic matter and soil nutrients transformation and circulation, and participates in the forming of its resolving, humus of participating in soil organic matter, etc. It plays a very important role in the soil ecosystem. This paper surveyed advances of bio-diversity of soil from the definition of soil microbial diversity, research levels, effect factors and research approaches. Furthermore, some problems and suggestions were put forward for the further study of soil microbial diversity.Key words: soil microorganism; diversity; PCR-DGGE土壤中含有各种各样的有机和无机营养物，它是微生物生长和繁殖的天然培养基。
土壤的条件也是十分复杂的，而且多变。
土壤微生物是指土壤中借助光学显微镜才能看到的微小生物，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物，以及真核生物如真菌、藻类（蓝藻除外）、地衣和原生动物等。
微生物积极参与土壤物质转化过程，在土壤形成、肥力演变、植物养分有效化和土壤结构的形成与改良、有毒物质降解及净化等方面起着重要作用。
数量庞大、种类繁多的土壤微生物是丰富的生物资源库[1]。
土壤微生物多样性是指生命体在遗传、种类和生态系统层次上的变化。
它代表着微生物群落的稳定性，也反映土壤生态机制和土壤胁迫对群落的影响。
土壤微生物多样性还可以定义为微生物生命的丰富性，通常以土壤生物区系的变化和生物化学过程间的相互关系来反映。
目前在地上部植物和动物的多样性方面开展了大量的研究，但对土壤生物多样性，特别是在土壤微生物多样性方面的研究仍较薄弱。
随着现代生物学尤其是多聚酶链反应（PCR）、核酸测序等分子生物学技术的迅速发展，人们对土壤微生物多样性有了更深入的了解。
1 土壤微生物分布及其群落分布1.1土壤中微生物的分布土壤中的微生物种类是及其丰富的，据文献记载，1g干重农田土壤就含有几百万个细菌，数十万个真菌孢子和数万个原生动物和藻类。
生境的物理化学特征可以影响在这一区域中生活的微生物生长、代谢活力、生物与生物之间的相互作用和微生物的生存。
土壤中的微生物既有土著微生物又有外来微生物，其中土著微生物是指在一个给定的生境中那些能生存、生长和进行活跃代谢的微生物，并且这些微生物能与来自于其他群落的微生物进行有效的竞争。
土著微生物从生理方面完全适应了这一生境的物化环境。
而外来微生物则是指来自于其他生态系统的微生物，所以这些微生物不能在这一生境长期生活下去。
在土壤中，一般情况下真菌的生物量和细菌的生物量几乎是相等的，而原生动物和藻类的生物量与真菌和细菌生物量相比，会少一个数量级。
如表1所示。
表1农田上表层（15cm）处微生物数目和生物量[2]微生物数量/（个细胞/g）生物量/（g/m2）真菌105200放线菌105~106160藻类104~10532当然，这些数据不一定与其他类型的土壤情况相一致。
但是在任何情况下，与农田或森林中的高等植物生物量相比，微生物生物量还是很小的。
然而，与土壤中其他生物量相比，微生物生物量还是相当可观的，例如，在草地里微生物生物量可以超过其中的所有原生动物生物量。
所以，微生物在土壤生态系统中的作用无疑是很大的。
1.2土壤中的微生物群落在土壤中存在的大部分细菌为G+细菌，并且G+细菌的数目要比淡水和海洋生境中的G+细菌数目高。
土壤中能利用糖类的土著细菌数目要比水圈中的多。
在土壤中常见的细菌属包括：不动杆菌属（Acinetobacter）、农杆菌属（Agrobacterium）、产碱杆菌属（Alcaligenes）、节杆菌属（Arthrobacter）、芽孢杆菌属（Bacillus）、短杆菌属（Brevibacterium）、柄杆菌属（Caulobacter）、纤维单胞菌属（Cellulomonas）、梭状芽孢杆菌属（Clostridium）、棒杆菌属（Corynebacterium）、黄杆菌属（Flavobacterium）、微球菌属（Micrococcus）、分支杆菌属Mycobacterium）、假单胞菌属（Pseudomonas）、葡萄球菌属（Staphylcoccus）、黄单胞菌属（Xanthomonas）。
但是在不同的土壤中它们的相对比例有很大的不同。
放线菌占土壤细菌群体的10%～33%，其中，链霉菌属（Streptomyces）和诺卡氏菌属（Nocardia）在土壤放线菌中占的比例最大，其次是微单胞菌属（Micromonas），放线菌属（Actinomyces）和其他放线菌，它们是土壤中的土著微生物，但是它们的数量是很少的。
放线菌对干燥条件抗性比较大，并能在沙漠土壤中生存，它们比较适合在碱性或中性条件下生长，并对酸性条件敏感。
土壤中主要的光合自养细菌群体是蓝细菌种，包括鱼腥藻属（Anabaena）、眉藻属（Calothrix）、色球藻属（Chroococcus）、筒孢藻属（Cylindrospermum）、鞘丝藻属（Lyngbya）、小枝藻属（Microcoleus）、节球藻属（Nodularia）、念珠藻属（Nostoc）、颤藻属（Oscillatoria）、席藻属（Phormidium）、织线藻属（Plectonema）、裂须藻属（Schizothrix）、伪枝藻属（Scytonema）、单歧藻属（Tolypothrix）。
在这些蓝细菌中，某些蓝细菌，如念珠藻在某些土壤环境中既能固氮气，又能通过光合作用合成有机物。
合成的含氮物质可以给其他微生物和高等植物提供氮源，有时这些含氮物质甚至可以成为这些微生物生长的限制因子。
蓝细菌在没有植物生长的土壤表面上形成表面壳，这对土壤具有稳定作用。
固氮菌是土壤中的自生固氮菌，能把大气中的氮气转化成氮化合物。
土壤中的某些厌氧梭状芽孢杆菌也能固定氮气。
根瘤菌和某些植物通过共生进行固氮。
在土壤中还有许多化能异养菌能对无机物进行转化，这对于维持土壤肥力是必要的。
在土壤生境中可以发现许多外来微生物，它们是来自于空气、水圈或者由植物或动物带入到土壤中，例如，某些植物致病菌就可以由有病植物组织带入土壤中，如农杆菌属、棒杆菌属、欧文氏菌属（Erwinia）、假单胞菌属和黄单胞菌属。
进入土壤生态系统的外来微生物一般很快死亡，但在某些情况下，某些外来微生物在土壤中可以生存很长时间，能形成芽孢和其他抗性状态的微生物可以在土壤中存在很长时间。
在土壤中真菌的生物量相当大，在土壤中可以找到大部分的真菌，土壤真菌可以以游离的状态存在或与植物根形成菌根关系。
真菌主要存在于土壤上表面10cm处，在30cm以下很难找到真菌。
如果土壤含有大量的氧气，那么真菌的量就很大。
在土壤中常见的真菌主要是半知菌，如曲霉属（Aspergillus）、地霉属（Geotrichum）、青霉属（Penicillum）和木霉属（Trichoderma），但也可以找到大量的子囊菌和担子菌。
土壤中的土著酵母主要是半知菌，如假丝酵母属（Candida）、红酵母属（Rhodotorula）和隐球酵母属（Cryptococcus）。
油脂酵母属（Lipomyces）、施万酵母属（Schwanniomyces）、克鲁氏酵母属（Kluyveromyces）、裂芽酵母属（Schizoblastosporion）、汉逊氏酵母属（Hansenula）、假丝酵母属和隐球酵母属只能在土壤中分离到，这说明土壤是它们的天然环境。
大量的藻类可以生活在土壤中，大部分藻类是生活在土壤表面或土壤上表层的数毫米处。
在土壤表层的土著藻类可以进入土壤的亚皮层，这时这些藻类又成为外来藻类，并且有可能被其他微生物吞噬。
大部分原生动物往往只存在于土壤的表层15cm处，因为它们需要相对高浓度的氧气，这些原生动物是土壤细菌和藻类的捕食者。
细菌病毒在土壤中是广泛分布的，但数量不是很多。
如果有关的细菌数目增加，那么相关的病毒数目也在增加。
根瘤菌及其噬菌体与形成根瘤和固氮的关系引起许多研究者的注意。
但是，现在发现对噬菌体产生抗性的根瘤菌却不能进行固氮，这是一个奇怪的现象。
能引起高等植物产生病变的某些病毒通常也可以存在于土壤中，但有些植物病毒在土壤中仅能生存很短时间。
某些能感染植物根的病毒可以被某些线虫和真菌携带并进行传播。
2土壤微生物多样性研究层次长期以来，微生物多样性的研究层次一直是众说纷纭。
DeLong[3]认为生物多样性应从物种多样性、遗传（基因）多样性和生态系统多样性三个层次上综合表述。
马克平[4]等认为生物多样性可分为物种多样性、基因多样性、生态系统多样性和景观多样性四个层次。
Solbrig[5]对微生物群落多样性进行剖析后提出3个组成要素：物种多样性、遗传多样性和功能多样性。
而Watve等[6]则认为，微生物多样性可细致划分为生活环境多样性、生长繁殖速度多样性、营养和代谢类型多样性、生活方式多样性、基因多样性和微生物资源开发利用多样性等。
但不论如何划分，如果将土壤微生物的多样性与整个生态系统联系起来，都可以从物种多样性、遗传多样性、结构多样性和功能多样性4个方面全面的概括土壤微生物多样性的基本特征[7]。
2.1土壤微生物的物种多样性土壤微生物的物种多样性是指土壤生态系统中微生物的物种丰富度和均一度，这是微生物多样性的最直接表现形式，也是多样性研究中最基本的内容。