【地球生物全系列——从单细胞到人类】细菌界—变形菌门
(精选)生物的分类
一、生物的分界（一）、两界说（1753年瑞典林奈）一、植物界：进行光合作用，不能自由运动；二、动物界：能自由运动，以植物或其它有机物为食。
（二）、五界说（1969年由惠特克提出的对细胞生物的分界）一、原核生物界：细菌、蓝藻等，DNA袒露，裂殖。
二、原生生物界：单细胞真核生物（甲藻、金藻、裸藻、粘菌和原生动物），有真正的染色体，进行有丝和减数割裂。
[酵母菌、衣藻等例外]3、真菌界：酵母菌、霉菌和大型真菌，生活方式为腐生和寄生。
4、植物界：藻类、苔藓、蕨类和种子植物，进行光合作用。
五、动物界：多细胞动物，包括无脊椎动物和脊椎动物。
附：加病毒界为六界。
二、生物分类与物种命名（一）、生物分类阶梯：界、门、纲、目、科、属、种（二）、“双名法”（林奈）：用拉丁文给植物的种定名属名（字头大写，多为名词）+种加词（多为形容词）+定名人姓名（多用缩写）[+变种名+定名人]微生物学一、病毒一、概念：病毒是超显微的、无细胞结构、专性活细胞寄生的大分子微生物。
二、种类：植物病毒、动物病毒和噬菌体（细菌病毒）3、特性：⑴个体极小（纳米）⑵专性寄生：无独立代谢活动，只在特定宿主中繁衍，在宿主体外不进行任何形式的代谢，不具有任何生命特点。
⑶无细胞结构，化学组成与繁衍方式简单：①化学组成：蛋白质+核酸蛋白质：爱惜、特异亲和力、抗原性核酸（含单一类型的DNA和RNA）动物病毒（DNA、RNA、单链、双链）植物病毒（RNA、单链、双链）噬菌体（DNA、单链、双链）②繁衍方式：为仰赖于宿主细胞进行复制繁衍[讲解噬菌体侵染细菌实验]吸附—侵入—复制—合成—组装—释放附：类病毒（游离的核酸致病体）二原核生物界《一》、细菌（根瘤菌）一、形态（个体微小、形态多样）⑴、球菌（单球菌、双球菌、链球菌、葡萄球菌）⑵、杆菌⑶、螺旋菌二、结构⑴、常规结构：由细胞壁（肽聚糖）、细胞膜、细胞质（核糖体）、核区（DNA 袒露）⑵、附属结构：荚膜（多糖或多肽，有爱惜作用）、鞭毛（蛋白质，协助运动）、芽孢（细菌生长一按时期后形成的休眠体，含水量低、耐热性强，对不良环境有极强的抗性）3、营养方式同化作用方面⑴、多数为异养①腐生细菌（枯草杆菌）②寄生细菌（痢疾杆菌）⑵、少数自养①光合细菌绿硫细菌：6CO2+12H2S→C6H12O6+6H2O+12S（光能+细菌叶绿素）②化能合成细菌（利用无机物氧化提供的能量，将CO2合成有机物）硝化细菌（氨→亚硝酸）硫细菌（硫化物→硫→硫酸）铁细菌（亚铁→高铁）⑶、兼性自养（氢细菌：氢→水）异化作用方面⑴、多数为宜氧细菌⑵、厌氧细菌（乳酸菌发酵）⑶、兼性厌氧细菌：硝酸盐还原细菌⑷、微量好氧细菌：拟杆菌属中的个别种4、二分割裂生殖，繁衍能力强核割裂→形成横隔壁→子细胞分离五、研究方式⑴、显微镜⑵、培育基⑶、革兰氏染色[染色（草酸铵+碘）→脱色（乙醇）→再染色（蕃红）]阳性：不脱色阴性：脱色并染上蕃红的颜色《二》、蓝藻（最先的原核蓝藻显现于35—33亿年前）[念珠藻（地木耳、发菜）、]一、形态结构⑴、单细胞、群体。
细菌科普知识-概述说明以及解释
细菌科普知识-概述说明以及解释1.引言1.1 概述细菌是一类微生物，其体型微小，只能在显微镜下观察到。
它们存在于自然界的各个角落，包括土壤、水体、空气中以及其他生物体内。
细菌广泛存在于地球上几乎所有的生态系统中，并且对地球生态系统的运转起着至关重要的作用。
细菌的体型和形态各异，有些是球形，有些是杆状，还有些则呈螺旋状。
它们的大小通常在微米级别，比如直径只有几微米的球形细菌，或者长达几十微米的杆状细菌。
尽管它们在形态上存在差异，但它们都是由单一的细胞组成，相较于动植物等多细胞生命体，细菌的结构较为简单。
细菌具有很强的适应性，可以在各种极端环境下生存，比如高温、高压、酸碱度极端等等。
这些特点使得细菌能够在地球上各种恶劣的环境中存活下来。
此外，细菌的繁殖速度也非常快，它们可以通过分裂的方式迅速增殖，有些细菌甚至可以在短短几小时内繁衍成上千万个。
正是由于细菌的高繁殖速度，它们在生态系统中起着举足轻重的作用。
细菌在生态系统中扮演着极其重要的角色。
它们是分解有机物的主要力量，通过分解死物并将其转化为无机物质，细菌对循环物质的转化起着关键作用。
同时，细菌也在氮循环、硫循环等方面发挥着重要的作用，促进了生态系统中的能量流动和物质循环。
此外，细菌也是一些生物体的共生体。
它们与我们人类的身体也有着密切的关系。
我们的肠道中存在大量的有益细菌，它们帮助我们消化食物、抵御病原微生物入侵，并产生有益的代谢产物。
同时，细菌还被广泛应用于医药、食品工业以及环境修复等领域，为人类社会的发展做出了巨大贡献。
综上所述，细菌是地球上最为广泛存在的微生物之一，对于生态系统的运转至关重要。
通过了解细菌的定义、分类以及其在生态系统中的重要性，我们能够更好地认识和利用细菌，促进人类社会的可持续发展。
1.2文章结构1.2 文章结构本文将分为引言、正文和结论三个部分，用以介绍细菌的科普知识。
在引言部分，我们将概述细菌的基本概念和特点。
通过介绍细菌的定义、分类以及其在自然界的分布情况，读者可以初步了解细菌的普遍存在性和多样性。
界门纲目科属种
生物分类学是研究生物分类的方法和原理的生物学分支。
分类就是遵循分类学原理和方法，对生物的各种类群进行命名和等级划分。
瑞典生物学家林奈将生物命名后，而后的生物学家才用域、界( Kingdom）、门( Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科( Family)、属( Genus)、种(Species)加以分类。
最上层的界，由怀塔克所提出的五界，比较多人接受，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。
从最上层的“界”开始到“种”，愈往下层则被归属的生物之间特征愈相近。
人类属于：界：动物界门：脊索动物门亚门：脊椎动物亚门纲：哺乳纲亚纲：真兽亚纲目：灵长目科：人科属：人属种：智人种在八年级生物-下人教版中出现中文名界（域）、门、纲、目、科、属、种外文名Kingdom、Phylum、Class、Order、Family、Genus、Species隶属生物分类学界有两界、三界、四界、五界之分门门隶于界纲纲隶于门目目隶于纲科科隶于目，近缘的属归合为科属属隶于科，近缘的种归合为属种种（物种）是基本单元目录1基本介绍2分类系统▪两界▪三界▪四界▪五界▪两总界五界▪六界3生命历史4具体分类▪藻类植物（Algae）▪地衣植物门（Lichenes）▪3苔藓植物门（Bryophyta）▪蕨类植物门(Pteridophyta)▪种子植物门（Spemaiophyla）1基本介绍编辑当前最流行的分类是一种五界系统，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。
五界系统反映了生物进化的三个阶段和多细胞阶段的三个分支，是有纵有横的分类。
它没有包括非细胞形态的病毒在内，也许是因为病毒系统地位不明之故。
它的原生生物界内容庞杂，包括全部原生动物和红藻、褐藻、绿藻以外的其他真核藻类，包括了不同的动物和植物。
例举：斑马鱼的界门纲目科属种：动物界，脊椎动物门，硬骨鱼纲，鲤形目，鲤科，短担尼鱼属。
2分类系统编辑两界瑞典生物学家林奈(1707～1778），注意到周围的生物有固着不动和自养型的植物，也有自由瑞典植物学家林奈瑞典植物学家林奈行动和异养型的动物。
人类起源的进化之谜从单细胞到现代人类的演化过程
人类起源的进化之谜从单细胞到现代人类的演化过程人类的起源是生物学中一个重要的议题，其进化之谜一直引发人们的关注。
从单细胞到现代人类的演化过程，涉及了数亿年的时间和无数个环境变迁，是一段令人惊叹的旅程。
一、单细胞生物的起源在距今约40亿年前，地球上出现了第一种生命形式，那就是单细胞生物。
单细胞生物具备基本的生命特征，如自我复制、代谢功能等。
它们在海洋环境中繁衍生息，演化出多样的形态和功能。
二、多细胞生物的诞生大约在距今20亿年前，一些单细胞生物开始形成多细胞体。
这种合作形式的出现，带来了细胞分工和组织化的特点，为后来生物体复杂性的提升铺平了道路。
这一阶段的生命形式还十分简单，远未达到现代动植物的复杂程度。
三、生命的陆地征服距今约6亿年前，生命首次从海洋进化到陆地上。
陆地的环境对生物体提出了全新的挑战，如重力、气候等。
为了适应陆地环境，生物体进一步演化，建立了各种适应措施，如四肢、呼吸系统的改变等。
这一阶段的进化还包括了昆虫和植物的分化。
四、动物界的出现距今约5亿年前，动物界开始出现，并迅速分化。
从最早的无脊椎动物到后来的脊椎动物，生物体的复杂性不断提升。
脊椎动物分为鱼类、两栖动物和爬行动物等，其中爬行动物向恒温动物的过渡成为后来身体结构更加复杂的哺乳动物和鸟类的祖先。
五、哺乳动物的进化哺乳动物的进化是人类起源的重要一环。
在距今约2.6亿年前，哺乳动物开始出现，并逐渐占据了地球上的生态位。
哺乳动物具备乳腺和恒温动物的特点，这使得它们能更好地适应各种环境。
进一步的演化导致了现代哺乳动物的多样性，分为了食肉动物、鲸类、飞行动物等。
六、灵长类的繁衍距今约6500万年前，灵长类动物开始出现。
灵长类动物具备拇指与其他手指的对立性，这使得它们能更好地抓握物体。
随着时间的推移，灵长类进一步分化为类人猿和古猿。
类人猿逐渐演化出直立行走和大脑容量的增加等特征，这对于后来人类的形成具有重要意义。
七、现代人类的演化距今约300万年前，露西（Lucy）化石被发现，这是迄今为止人类起源研究中的重要突破。
第三节 生物六界分类系统
的孔，是不同硅藻分类的主要依据。硅藻繁殖快；原生质中有核及色素体，
硅 藻
硅藻原生质如 同装在透明，雕 花的盒子里。
裸藻 原始的真核生物，介于动物和植物之间 的类群 原始性表现在： 1、细胞核：环形的DNA，无组蛋白； 2、兼有动植物的特性，表现在营养方 式上，既能自养，又能异养。
运动鞭毛
感应鞭毛
（四）植 物 界
自然界中植物大约有40万种，其中种子植物在植物 界中是最高等的一个类群，约为20万种。
真菌属于真核微生物,其 细胞结构由细胞壁、细胞 膜、细胞质、细胞核、细 胞器（线粒体、内质网、 核糖体）等组成。
（三）真菌界 1.真菌的主要特征
营养体——由多细胞分支或不分支的 丝状体构成
（三）真菌界 1.真菌的主要特征
营养体——由多细胞分支或不分支的 丝状体构成 细胞壁——厚而坚硬的细胞壁 低等——纤维素，高等——几丁质
壳状地衣
茶渍属Lecanora
紧贴于树皮或岩石上 于基质相连
壳状地衣
茶渍属Lecanora
叶状地衣
扁平叶状，边缘卷曲 假根状菌丝附着于基质上 易于剥离
叶状地衣
枝状地衣
生于树枝上，下垂如须 岩石或土壤表面 基质上呈直立状
枝状地衣
枝状地衣
石蕊
石蕊
（三）真菌界 1.真菌的主要特征
营养体——由多细胞分支或不分支的 丝状体构成 细胞壁——厚而坚硬的细胞壁 低等——纤维素，高等——几丁质 细胞器——细胞核，线粒体、内质网、 液泡，无光合色素和叶绿体
（三）真菌界 1.真菌的主要特征
营养体——由多细胞分支或不分支的 丝状体构成 细胞壁——厚而坚硬的细胞壁 低等——纤维素，高等——几丁质 细胞器——细胞核，线粒体、内质网、 液泡，无光合色素和叶绿体
细菌的分类
放线菌、酵母菌与真菌的分类与特点
• 放线菌（Actinomycetes） • 分类：属于放线菌门（Actinomycetes），放线菌纲（Actinomycetales） • 特点：具有分支状菌丝体，需用显微镜观察，具有多种代谢途径，部分放线菌具有致病性，如结核分枝杆菌（ Mycobacterium tuberculosis）
生长环境
• 厌氧细菌主要分布在缺氧环境中，如肠道、沼泽、土壤 等 • 厌氧细菌可与其他细菌共生，形成复杂的微生物生态系 统
厌氧细菌的主要类群与代表物种
梭菌科（Clostridiaceae）
• 代表物种：梭状芽孢杆菌（Clostridium）、肉毒梭菌（Clostridium botulinum） 等 • 生理特性：严格厌氧，可产生多种毒素，如肉毒毒素、破伤风毒素等
02 弧菌科（Vibrionaceae）
• 代表物种：霍乱弧菌（Vibrio cholerae）、副溶血性弧 菌（Vibrio parahaemolyticus）等 • 生理特性：好氧或兼性厌氧，代谢多样性，可产生多种 酶和毒素，部分菌种具有致病性
03 嗜血杆菌科（Haemophilusaceae）
生长繁殖方式： 革兰氏阳性细 菌主要通过二 分裂方式进行 生长繁殖，生 长速度较快
革兰氏阳性细菌的主要类群与代表物种
01 链球菌科（Streptococcaceae）
• 代表物种：链球菌（Streptococcus）、乳球菌 （Lactococcus）等 • 生理特性：嗜氧或兼性厌氧，代谢多样性，可产生多种 酶和毒素
【地球生物全系列——从单细胞到人类】古细菌界（上）
【地球生物全系列——从单细胞到人类】古细菌界（上）古细菌界（上）所谓古细菌就是远古时代特殊生态环境下生活的细菌，其生活习性和化学组成都很特殊。
它适合生活于高温、高盐和缺氧的环境。
细胞壁不含肽聚糖；细胞膜的脂类与其他任何生物都不一样；RNA聚合酶和核糖体中的一种蛋白质都和真核细胞相似而和原核细胞不同。
它们可能是地球形成初期古老细菌的代表，保持了古老的形态，很早就和其他细菌分道扬镳。
所以，有人主张把古细菌从原核生物中划出来另立一个古细菌界，与原核生物、真核生物并列为界。
人类在发现和研究微生物之前，把一切生物分成截然不同的两大界——动物界和植物界。
随着人们对微生物认识的逐步深化，从两界系统经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，直到70年代后期，发现了地球上的第三生命形式－古菌，才导致了生命三域学说的诞生。
该学说认为生命是由古菌域（Archaea）、细菌域（Bacteria）和真核生物域（Eucarya）所构成。
“古细菌”这个概念第一次出现是在1977年，由卡尔·乌斯和乔治·福克斯提出的，原因是它们在16S核糖体RNA的系统发生树上和其它原核生物的区别。
这两组原核生物起初被定为古细菌和真细菌两个界或亚界（当时乌斯与福克斯更倾向于用“总界”一词）。
后来乌斯认为它们是两支根本不同的生物，于是在1990年重新命名其为古菌和细菌，并将这两支和真核生物划为域这一新建立的分类阶元，一起构成了生物的三域系统。
起初只有一些产甲烷菌（英语：methanogen）属于这个新域，这些古菌以一些极端环境为栖息地，比如温泉和盐湖。
到20世纪末，微生物学家意识到古菌是一个庞大而多元化的群体，不只局限于极端环境，而是广泛存在于自然界中，如土壤和海洋里。
由于聚合酶链式反应（PCR）被大量用于探测采样土壤或水中的原核生物的核酸，古菌的重要性和独特性得到新的重视。
PCR方法可以不经细菌培养（英语：microbiological culture）而直接探测和鉴别微生物。
3-分类-菌物界各门
三、真菌门Eumycota
6、真菌门的生态习性 真菌的异养方式主要为寄生和腐生。
l 寄生(parasitism): 凡从活的动植物体吸取养分的称为寄生。 l 腐生(saprophytism): 从动植物死体以及无生命的有机物质吸取养
子实体, 能产生孢子的 菌物结构。
二、卵菌门 Oomycota
1、卵菌门的主要形态结构特征 卵菌门是一群很特别的类群, 除具有菌物界的
基本特征外, 还有一些特殊性。
l (1) 卵菌几乎都有一个明确的菌丝体型的原植体。 细胞壁完全或大部分由纤维素组成。
l (2) 无性生殖, 产生游动孢子。 游动孢子双鞭毛，二型，即茸鞭型和尾鞭型
l (3) 无性生殖。游动孢子具有等长的双鞭毛，茸鞭在 前，尾鞭在后。
l (4) 有性生殖。为卵式生殖，产生的合子称卵孢子， 卵菌因而得名。
l (5) 在核循环、赖氨酸生物合成途径、色氨酸合成酶 沉 降 图 型 、 DNA 的 GC( 鸟 嘌 呤 、 胞 嘧 啶 ) 百 分 比 ， 25s RNA分子量、细微形态结构特征等方面，卵菌与真菌有 本质的区别。亦即在“生理学、生物化学、细胞学、分 子生物学”等方面不同于真菌。
l 子实体, 能产生孢子的菌物结构。
l (1) 发网菌的营养体为裸露的原生质团，称变形体, 多核体，呈 不规则网状，直径数厘米，在阴湿处的腐木或枯叶上缓缓爬行。
l (2) 无性生殖。繁殖时，变形体爬到干燥光亮的地方，形成很多 的发状突起，每个突起发育成1个具柄的孢子囊(子实体)。孢子囊 通常长筒形，紫灰色，外有包被(peridium)。
各1条。 l (3) 有性生殖, 产生静配子, 卵配。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
【地球生物全系列——从单细胞到人类】细菌界—变形菌门细菌界—变形菌门变形菌门（Proteobacteria）是细菌中主要的一门，包括很多病原菌，如大肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、绿脓杆菌、霍乱弧菌、鼠疫杆菌、脑膜炎双球菌、淋球菌、空肠弯曲菌、幽门螺杆菌等著名的属。
也有自由生活（非寄生）的种类，包括很多可以进行固氮的细菌。
卡尔·乌斯于1987年建立这个群组，非正式的称这是“紫细菌及其亲属”。
变形菌门主要是由核糖体RNA序列定义的，名称取自希腊神话中能够变形的神普罗透斯（这同时也是变形菌门中变形杆菌属的名字），因为该门细菌的形状具有极为多样的形状。
1.特性所有的变形菌门细菌都是革兰氏阴性菌，其外膜主要由脂多糖组成。
很多种类利用鞭毛运动，但有一些非运动性的种类，或者依靠滑行来运动。
此外还有一类独特的粘细菌，可以聚集形成多细胞的子实体。
变形菌门包含多种代谢种类。
大多数细菌营兼性或者专性厌氧及异养或者自养化能生物生活，但有很多例外。
很多并非紧密相关的属可以利用光合作用储存能量。
因其多数具有紫红色的色素，被称为紫细菌。
2.分类变形菌门根据rRNA序列被分为五类（通常作为五个纲），用希腊字母α、β、γ、δ和ε命名。
其中有的类别可能是并系的。
α-变形菌除包括光合的种类外，还有代谢C1化合物的种类、和植物共生的细菌（如根瘤菌属）、与动物共生的细菌和一类危险的致病菌立克次体目。
此外真核生物的线粒体的前身也很可能属于这一类。
β-变形菌包括很多好氧或兼性细菌，通常其降解能力可变，但也有一些无机化能种类（如可以氧化氨的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)）和光合种类（红环菌属(Rhodocyclus)和红长命菌属(Rubrivivax)）。
很多种类可以在环境样品中发现，如废水或土壤中。
该纲的致病菌有奈氏球菌目(Neisseriales)的中一些细菌（可导致淋病和脑膜炎）和伯克氏菌属(Burkholderia)。
在海洋中很少能发现β-变形菌。
γ-变形菌包括一些医学上和科学研究中很重要的类群，如肠杆菌科(Enterobacteraceae)、弧菌科(Vibrionaceae)和假单胞菌科(Pseudomonadaceae)。
很多重要的病原菌属于这个纲，如沙门氏菌属(Salmonella)（肠炎和伤寒）、耶尔辛氏菌属(Yersinia)（鼠疫）、弧菌属(Vibrio)（霍乱）、绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)（就医时引发的肺部感染或者囊性纤维化）。
重要的模式生物大肠杆菌也属于此纲。
δ-变形菌包括基本好氧的形成子实体的粘细菌和严格厌氧的一些种类，如硫酸盐还原菌（脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、脱硫菌属(Desulfobacter)、脱硫球菌属(Desulfococcus)、脱硫线菌属(Desulfonema)等）和硫还原菌（如除硫单胞菌属(Desulfuromonas)），以及具有其它生理特征的厌氧细菌，如还原三价铁的地杆菌属(Geobacter)和共生的暗杆菌属(Pelobacter)和互营菌属(Syntrophus)。
ε-变形菌只有少数几个属，多数是弯曲或螺旋形的细菌，如沃林氏菌属(Wolinella)、螺杆菌属(Helicobacter)和弯曲菌属(Campylobacter)。
它们都生活在动物或人的消化道中，为共生菌（沃林氏菌在牛中）或致病菌（螺杆菌在胃中或弯曲菌在十二指肠中）。
3.β-变形菌纲β-变形菌纲（学名：Betaproteobacteria）是变形菌门中的一纲，与γ-变形菌关系最近。
（1）伯克氏菌目伯克氏菌目（学名：Burkholderiales）是变形菌门β-变形菌纲的一个目，跟其他变形菌一样，都是革兰氏阴性菌。
本目包含了许多致病性病原菌如伯克氏菌属（Burkholderia）和博德氏菌属（Bordetella）等，还有像是草酸杆菌属（Oxalobacter）这类使用草酸作为碳源的特殊菌种。
①伯克氏菌属伯克氏菌属，或伯克氏菌，又译伯克霍尔德菌（学名：Burkholderia），是伯克氏菌科的一个属，这个属下最出名的有鼻疽伯克氏菌（B. mallei），是一种会在马或其他相关动物身上引起马鼻疽的病菌；属下亦有引起类鼻疽的类鼻疽伯克氏菌（B. pseudomallei）及引起人类肺部囊肿性纤维化感染的洋葱伯克氏菌（B. cepacia）。
伯克氏菌属（以前被认为是假单胞菌属的一部分）是一种好氧，能运动，棒状的革兰氏阴性菌。
这一属中包括一些植物和动物的病原菌以及一些重要的环境微生物。
其中B. xenovorans是著名的杀虫剂及多氯联苯的生物降解者。
伯克氏菌可用于生物降解、农业中的生物控制及促进植物生长的根圈微生物等。
但由于有可能对人类造成的潜在危害，这些用途仍然处在商讨之中。
由于伯克氏菌具有相对较高的抗生素的抗药性及高运动性，鼻疽伯克氏菌及类鼻疽伯克氏菌有时会被认为是针对家畜及人类的生物战潜在媒介。
②博德特氏菌属博德特氏菌属（学名：Bordetella）为生丝微菌目硝化杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。
微小的球杆菌。
为哺乳动物的寄生菌和致病菌，在呼吸道上皮纤毛间定居和繁殖。
此属的模式种为百日咳博德特氏菌(Bordetella pertussis)。
③草酸杆菌属草酸杆菌属（学名：Oxalobacter）为草酸杆菌目草酸杆菌科的一属厌氧革兰氏阴性菌。
直杆或微弯杆。
分离于瘤胃或人和动物的大肠，也曾分离于湖底沉积物。
此属的模式种为产甲酸草酸杆菌(Oxalobacter formigenes)。
4.δ-变形菌δ-变形菌是变形菌中的一类，与ε-变形菌关系最近。
下属：硫还原菌目 Desulfurellales脱硫弧菌目 Desulfovibrionales脱硫菌目 Desulfobacterales除硫单胞菌目 Desulfuromonadales互营杆菌目 Syntrophobacterales蛭弧菌目 Bdellovibrionales黏球菌目 Myxococcales（1）核衣细菌目（互营杆菌目）核衣细菌目（Caryophanales），也称显核菌目，是芽孢杆菌纲的一目细菌。
属于革兰氏阳性菌。
该目下有代表的属有芽孢杆菌属、李斯特菌属（英语：Listeria）、葡萄球菌属。
该目的模式属为显核菌属（Caryophanon）。
下属物种脂环酸杆菌科 Alicyclobacillaceae daCosta and Rainey 2010芽孢杆菌科 Bacillaceae Fischer1895核衣细菌科 Caryophanaceae Peshkoff1939，显核菌科李斯特菌科 Listeriaceae Ludwiget al. 2010类芽孢杆菌科 Paenibacillaceae DeVos et al. 2010巴斯德氏菌科 Pasteuriaceae Laurent1890，巴氏柄菌科芽孢乳杆菌科 Sporolactobacillaceae Ludwiget al. 2010葡萄球菌科 Staphylococcaceae Schleiferand Bell 2010热放线菌科 Thermoactinomycetaceae Matsuoet al. 2006（2）芽孢杆菌属芽孢杆菌属（Bacillus）属于革兰氏阳性菌，包括模式生物枯草芽孢杆菌和著名的致病菌炭疽杆菌等。
此属细菌中有专性需氧菌或兼性厌氧菌，他们遍布于各种环境，有些独立存在亦有些会寄生于其他生物。
在不适合生存的情况下，此属细菌可以转化为内生孢子以进入休眠状态，此休眠状态可以持续很久。
在芽孢杆菌属中，其中枯草杆菌可以作为科学研究用的模式生物，还有可致病的炭疽杆菌和蜡样芽孢杆菌。
①枯草杆菌枯草杆菌（学名：Bacillussubtilis），是芽孢杆菌属的一种细菌，为革兰氏阳性的好氧性菌，普遍存在于土壤及植物体表，在人体亦可发现在肠道内共生的枯草杆菌。
型态上的主要特征是菌体表面生有鞭毛，体内形成的内生孢子可抵抗恶劣的外在环境而存活。
最近的研究显示，枯草杆菌其实并不全然是好气性的。
枯草杆菌在食品和饲料添加剂上广泛使用，如日本人使用该菌的纳豆亚种（var. natto）将黄豆发酵成为纳豆和韩国料理中的清麹酱，近年来使用在种子保护及生物防治上，也经常被拿来应用。
临床医学上是属于安全性的有益微生物。
②炭疽杆菌炭疽杆菌是一种棒状的革兰氏阳性菌，长约1至6微米，这种细菌通常以内孢子之型态出现在土壤中，并可借此状态存活数十年之久，一旦由牲畜摄入，孢子便开始在动物体内大量复制，最后造成死亡，随后于尸体中仍能继续繁殖，而当细菌将宿主养分用尽，又将重回睡眠态的孢子。
德国医师兼科学家罗伯·柯霍（HeinrichHermann Robert Koch）首先于1870年分离出造成炭疽病的细菌。
当时科学界针对生命的来源，在自然发生论和细胞理论两种学说之间争论不已，而此项研究首度证明微生物具有造成疾病的能力，在一系列开创性的实验中，揭开炭疽杆菌的生活史和传播途径，不仅增进医学对炭疽的认识，更阐明微生物在疾病中所扮演的重要角色。
柯霍进一步研究其他疾病致病机转，于1905年因研究结核杆菌获得诺贝尔生理学或医学奖，因此今日生物相关学科将罗伯·柯霍视为细菌学之父。
炭疽孢子先被局限并且受到免疫系统专门用来对付侵入者的吞噬作用吞食，在吞噬细胞内，孢子转变为杆菌，开始大量复制并且最后胀破被寄生的细胞，释放大量细菌进入血液循环，并释放具有三部分的毒素，包括保护细菌的荚膜成分、炭疽毒素、水肿因子及致死因子，攻击许多特定的细胞和组织。
研究者认为致死因子可能造成巨噬细胞制造过多的肿瘤坏死因子α和第一介白质β，这两种免疫系统经常用来引发发炎反应的介质，最终导致败血性休克、甚或死亡；然而近年研究证据指出，炭疽杆菌也会针对血管最内层的内皮细胞，造成类似出血的血管细缝，将可进一步成为缺血性休克，而非败血性休克。
③蜡样芽孢杆菌蜡样芽孢杆菌（学名：Bacilluscereus），又称仙人掌杆菌，是一种革兰氏阳性菌，β溶血性的杆状细菌。
经常在土壤和食物中被发现，有些菌株会引起食物中毒，例如炒饭综合症（Fried Rice Syndrome）；另外一些菌株则对其他动物有益。
蜡样芽孢杆菌是兼性厌氧菌。
与其他芽孢杆菌相同，它会产生防御性的内生孢子。
它的致病因子包括施普善（cereolysin）和磷脂酶C（Phospholipase C）。
蜡样芽孢杆菌与少数食物中毒有关(约2–5％)，包括一些严重的恶心、呕吐以及腹痛。
大概来说，杆菌性食物中毒是由于错误的烹调方法造成细菌孢子残留在食物上，更糟糕的是食物被不当冷冻反复解冻而让孢子发芽。