反转录PCR-步骤和方法
RT-PCR的具体步骤

RT-PCR的具体步骤RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)是一种常见的分子生物学技术,用于检测RNA分子。
在本文中,我们将介绍RT-PCR的具体步骤,以便您更加全面地了解这种技术。
1.总RNA提取首先需要从细胞中提取RNA。
这可以通过商用试剂盒或手工方法实现。
如果使用试剂盒,则遵循其说明书中的步骤。
如果手工提取RNA,则需要使用三个基本试剂:细胞裂解缓冲液、氯仿和异丙醇。
步骤如下:•将细胞收集在管中,加入裂解缓冲液。
•冷冻-解冻样品3次,使细胞壁破裂并释放RNA。
•加入氯仿并混合。
•离心样品,使沉淀分离出来。
•将上层溶液转移到另一个管中,加入异丙醇。
•冷藏或冷冻,然后离心。
•去除上层液体,并在无水酒精中对RNA进行洗涤和沉淀。
2.反转录在提取出RNA后,需要将其转录为DNA,即逆转录。
这可以通过使用反转录酶(RT)实现。
在反转录步骤中,会加入反转录引物和其他试剂来增强逆转录效果。
这些引物是由需要扩增的RNA序列的反向互补核酸序列构成的。
这些步骤如下:•将RNA加入反转录反应混合物中,该混合物包含反转录酶、引物和其他必要试剂。
•反转录混合物通常通过加热来促进逆转录引物结合到RNA模板上,并形成RNA-DNA杂交链。
随后,反转录酶在杂交链上寻找RNA模板,并通过降低杂交链的熔点来将反转录引物延伸为cDNA链。
3.PCR扩增完成逆转录后,需要进行PCR扩增以增加cDNA的数量。
PCR是一种将 DNA 扩增到数以百万计的技术,能够扩增非常小的DNA模板。
PCR的步骤如下:•在PCR反应混合物中加入适当的引物和其他必要试剂。
•该反应混合物包括DNA聚合酶、模板DNA、引物和核苷酸。
•反应混合物被放入PCR机器中,按照特定的程序进行加热和冷却,使DNA链复制为两条新的DNA链。
•扩增程度由PCR反应的周期数决定。
4.分析最后,将扩增的DNA分离并分析它们的大小、类型和量。
这可以通过游离电泳或毛细管电泳等技术实现。
反转录实验步骤总结

反转录实验步骤总结1.提取RNA:首先,需要从样品中提取RNA。
可以使用RNA提取试剂盒,根据其说明书的步骤进行操作。
通常的步骤包括细胞裂解、蛋白酶处理、RNA结合到提取柱、洗涤和Elution等。
提取后的RNA需保存在无RNase的条件下,并进行浓度和纯度的检测。
2. DNase I处理:为了去除可能存在的DNA污染,可以使用DNase I酶进行处理。
将适量的RNA加入DNase I反应体系中,通过高温和低温循环加快DNase I的酶解作用。
反应结束后用酶停止反应,并进行热灭活。
3.反转录反应体系的准备:准备一个反转录反应管,添加适量的RNA、随机引物或专一引物、逆转录酶、逆转录酶缓冲液、dNTPs和RNase抑制剂等。
反应体系的组成和用量需根据实验要求进行调整。
4.反转录反应:将反转录反应管置于反应仪中,按照指定的温度和时间进行反应。
反应温度一般在42-55℃之间,反应时间根据RNA的长度和逆转录酶的特性而不同。
一般来说,较长的RNA需要较长的反应时间。
5.反应后的处理:反应结束后,可以对反应产物进行一系列处理。
首先,需要进行RNase H酶的处理,以去除RNA-DNA杂交体。
接着,进行PCR放大或其他下游应用前的处理,如纯化、测序等。
6.实时荧光PCR:可以使用实时荧光PCR技术来检测反转录产物的相对定量。
通过设计特异性的引物和探针,可以准确地检测目标DNA的数量。
反转录产物可以作为模板进行PCR扩增,实时监测PCR信号的变化,并用计算机软件进行计算和分析。
7.凝胶电泳:可以使用凝胶电泳技术来检测反转录产物的大小和纯度。
将PCR产物加入琼脂糖凝胶中,加上电场进行电泳,然后用紫外线照射检测凝胶上的条带。
根据条带的大小和强度,可以判断反转录反应的质量和产物的纯度。
8.序列验证:最后,可以使用测序技术对反转录产物进行验证。
将PCR产物纯化后送测序,通过测序结果验证目标序列是否被成功反转录成DNA。
反转录pcr操作步骤

反转录pcr操作步骤嘿,朋友们!今天咱就来讲讲反转录 PCR 操作步骤。
这可是个很厉害的技术呢!首先呢,你得把要研究的 RNA 样本准备好。
这就好比要烹饪一道美味佳肴,食材可得精挑细选呀!然后把 RNA 模板、反转录酶、引物、dNTP 等这些家伙都按比例放在一起。
这就像是把各种调料恰到好处地混合在一起,才能做出完美的味道。
接下来,把它们放在一个合适的温度下,让反转录酶这个小能手开始工作啦!它就像一个勤劳的小蜜蜂,努力地把RNA 反转录成cDNA。
你想想,这是不是很神奇呀!等反转录完成后,就要进入PCR 阶段啦。
把cDNA、DNA 聚合酶、引物、dNTP 等再次聚在一起,然后设置好温度循环。
这就像一场热闹的舞会,各种分子在不同的温度下欢快地跳动。
在 PCR 过程中,温度的变化可重要啦!就像跳舞的节奏,一会儿高一会儿低。
高温让 DNA 变性,就像把扭在一起的绳子解开;低温让引物结合,就像找到了合适的伙伴牵手;适中的温度让 DNA 聚合酶发挥作用,把新的核苷酸连接上去,就像盖房子一样,一砖一瓦地搭建起来。
每一轮循环结束后,cDNA 的数量就会翻倍呢!就像滚雪球一样,越来越多。
最后呀,等 PCR 反应结束,就可以检测产物啦。
看看我们努力的成果是不是符合预期。
哎呀,反转录 PCR 是不是很有趣呀!它能帮助我们了解那些看不见摸不着的基因信息呢!虽然过程有点复杂,但只要我们认真对待,就一定能掌握好这个技术。
就像学骑自行车一样,一开始可能会摇摇晃晃,但多练习几次就会稳稳当当啦!大家加油哦,相信你们一定能在反转录 PCR 的世界里畅游无阻!。
反转录荧光定量pcr

反转录荧光定量pcr反转录荧光定量PCR(qRT-PCR)是一种广泛应用于生物学实验室的技术,用于快速、准确地检测和量化RNA的表达水平。
它结合了反转录和聚合酶链式反应(PCR)的过程,使研究人员能够测量目标基因的mRNA含量并进行定量分析。
本文将分步骤介绍反转录荧光定量PCR的原理、方法和应用。
1. 反转录RNA反转录是将RNA转化成DNA的过程。
反转录荧光定量PCR需要先用逆转录酶反转录RNA。
将RNA和逆转录酶一起处理,产生与RNA相对应的DNA互补物(cDNA)。
cDNA是qRT-PCR的起始材料。
2. 选择探针和引物选择适当的探针和引物可以确保qRT-PCR测量目标RNA序列的准确度和灵敏度。
探针是一种DNA片段,可以与目标RNA序列互补并标记荧光。
引物是一对短DNA片段,用于扩增目标RNA序列,并且必须具有一定的特异性,以确保只扩增目标序列而不影响其他RNA。
3.PCR扩增PCR扩增是qRT-PCR的最后一步。
将反转录后的cDNA与选择好的引物和探针混合,并加入PCR反应液,触发PCR扩增反应。
PCR扩增反应产生的PCR产物量与cDNA中的目标RNA含量成比例。
4. 数据分析最后一步是数据分析。
qRT-PCR产生的数据通常是光信号的定量值,需要进行标准化,以便比较目标RNA在不同样本之间的表达水平。
标准化通常使用一个参考基因作为内部对照。
对标准化后的数据进行分析,可以研究目标基因在不同生理状态下的表达量的变化,并确定其功能。
反转录荧光定量PCR在生物学研究中的应用越来越广泛。
它可以帮助研究人员了解许多生物过程,包括发育、免疫应答和疾病机理等。
它还被广泛用于药物筛选,毒性测试和诊断测试。
总之,反转录荧光定量PCR是一个强大的工具,可以为许多生命科学领域的研究提供解决方案。
反转录37度反应和85度反应原理

反转录37度反应和85度反应原理一、引言反转录37度反应和85度反应是两种常用的反转录PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)方法。
本文将对这两种反应原理进行全面、详细和深入的探讨。
二、反转录37度反应原理1. 反转录37度反应的背景介绍反转录37度反应是一种用于将RNA转录成cDNA(complementary DNA)的方法,是PCR的前体步骤。
2. 反转录37度反应的步骤以下是反转录37度反应的步骤: 1. 将RNA样本加入反应体中。
2. 加入逆转录酶(Reverse Transcriptase)和逆转录引物。
3. 反应体温度调节为37度,反应一段时间,通常为1小时。
4. 反应结束后,通过加热(一般为95度)失活逆转录酶。
3. 反转录37度反应的原理解释反转录37度反应利用逆转录酶的逆转录酶活性:逆转录酶能够将RNA模板上的核酸序列转录成互补的cDNA。
逆转录引物提供互补序列用于逆转录酶的引物依赖性合成反应。
通过维持适宜的反应温度(37度),逆转录酶能够在该温度下高效工作。
三、反转录85度反应原理1. 反转录85度反应的背景介绍反转录85度反应是一种常用的反转录PCR方法,与反转录37度反应不同,它在转录RNA为cDNA的过程中使用了另一种逆转录酶。
2. 反转录85度反应的步骤以下是反转录85度反应的步骤: 1. 将RNA样本加入反应体中。
2. 加入热稳定的逆转录酶和逆转录引物。
3. 反应体温度调节为85度,反应一段时间,通常为15-30分钟。
4. 反应结束后,通过加热失活逆转录酶。
3. 反转录85度反应的原理解释反转录85度反应利用具有热稳定性的逆转录酶在高温条件下进行反应。
该逆转录酶能够在高温下保持活性,因此使用85度的反应温度可以加速反转录过程。
逆转录引物提供互补序列以便逆转录酶的引物依赖性合成反应。
四、37度反应和85度反应的比较为了更好地理解反转录37度反应和85度反应,下面对这两种方法进行比较: 1. 37度反应相对较慢,一般需要1小时以上,而85度反应一般只需要15-30分钟。
rtpcr步骤及原理

rtpcr步骤及原理RTPCR步骤及原理摘要:反转录聚合酶链反应(RTPCR)是一种常用的分子生物学技术,用于定量检测RNA或DNA中特定序列的数量。
本文将介绍RTPCR的步骤和原理,包括反转录、PCR扩增和结果分析等方面。
同时也会讨论RTPCR的优点、限制和在科研和临床中的应用。
引言在生物医学研究和临床实践中,准确测定RNA或DNA中特定基因或序列的表达水平或存在数量是非常重要的。
反转录聚合酶链反应(RTPCR)是一种被广泛应用的技术,能够对目标序列进行定量和扩增。
一、反转录反转录是RTPCR的第一步,也是从RNA到cDNA的转录过程。
这一步骤利用反转录酶将RNA模板转录成互补的cDNA。
反转录的关键是一条RNA模板和逆转录酶的结合,逆转录酶能够将RNA依据其互补碱基配对的原则合成cDNA。
反转录需要一些关键的试剂,如RNA模板、逆转录酶、引物和dNTPs等。
RNA模板是目标序列的来源,逆转录酶则是反转录的关键酶。
引物是用于使逆转录酶能够开始合成cDNA运输链的小片段,而dNTPs则是逆转录酶用来合成cDNA的原料。
二、PCR扩增PCR扩增是RTPCR的第二步,也是从cDNA扩增目标序列的过程。
PCR扩增是利用聚合酶将靶DNA序列经过多次循环扩增成数量可检测的水平。
PCR扩增需要两个引物,一个用于标记出序列的起始点,一个用于标记出序列的终止点。
PCR扩增需要通过一系列的循环反应来不断扩增目标序列。
每个循环有三个关键步骤:变性、退火和延伸。
变性是通过高温来使DNA 的两个链分离,退火是通过低温使引物与靶序列结合,延伸则是通过温度合适的聚合酶来合成新的DNA链。
三、结果分析RTPCR的结果分析可以通过几种不同的方法进行,最常见的是凝胶电泳和实时定量PCR。
凝胶电泳是一种常见的分离DNA片段的方法,可以将PCR扩增的产物根据大小分离成不同的带状,在凝胶上的迁移速率还可以推测出片段的大小,并对扩增的特定基因进行定性和定量分析。
反转录实验步骤总结

反转录实验步骤总结反转录是一种重要的遗传学技术,它可以将RNA转录成DNA。
本文将总结反转录实验的基本步骤。
1. RNA提取:首先,需要从细胞或组织中提取RNA。
可以使用商业RNA提取试剂盒,按照说明书中的步骤进行操作。
基本步骤包括细胞破碎、溶解RNA结合蛋白、加入酒精沉淀RNA等。
最后将提取得的RNA溶于适量的RNase-free水中。
2. 反转录反应:反转录反应是将RNA转录成DNA的关键步骤。
反转录反应需要反转录酶、RNase抑制剂、dNTPs和引物。
引物根据需要选择合适的引物,比如Oligo(dT)或随机引物。
将RNA和反转录酶混合,加入适量的RNase抑制剂和引物,反应体系中加入dNTPs。
根据反转录酶的特点,反转录反应通常在37°C至42°C的温度下进行。
3.热变性反应:将反转录反应体系加热至95°C,反应5分钟,以破坏反转录酶的活性。
这一步骤可以确保在下一步PCR反应中不会有反转录酶的干扰。
4. cDNA纯化:为了获得纯净的cDNA产物,需要将反转录反应体系纯化。
可以使用商业PCR纯化试剂盒进行纯化,按照说明书中的步骤进行操作。
基本步骤包括样品加入DNA结合柱、洗涤和洗脱。
最后,将纯化得到的cDNA溶于适量的RNase-free水中。
5.PCR扩增:可以使用cDNA作为模板进行PCR扩增,以扩增目标基因的DNA片段。
选择适当的引物,根据需要进行PCR反应体系的设计。
通常包括反转录基因的引物和内参基因或参比基因的引物。
根据反转录酶的特点,PCR反应通常在94°C至98°C的温度下进行。
可以根据需要进行多轮扩增,每轮扩增的周期数根据实验需求设置。
6.PCR产物分析:对PCR反应产物进行分析,通常可以使用琼脂糖凝胶电泳或质粒测序等方法。
琼脂糖凝胶电泳可以用于判断PCR产物的大小、纯度和浓度。
质粒测序可以用于验证PCR产物的序列。
总之,反转录实验是一种重要的遗传学技术,可以将RNA转录成DNA,进一步进行分析。
反转录pcrct值的概念

反转录pcrct值的概念标题:反转录PCR Ct值的概念解析一、引言反转录PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,简称RT-PCR)是一种用于检测和定量RNA的分子生物学技术。
其主要步骤包括RNA的反转录以及cDNA的PCR扩增。
在RT-PCR中,Ct值是一个关键参数,它反映了目标RNA的初始浓度。
本文将详细介绍反转录PCR Ct值的概念。
二、反转录PCR的过程反转录PCR主要包括两个步骤:反转录和PCR扩增。
1. 反转录:在这个过程中,RNA被逆转录酶转化为cDNA。
2. PCR扩增:cDNA随后被PCR扩增,生成大量的目标序列。
三、Ct值的概念Ct值(Cycle Threshold),又称为循环阈值,是RT-PCR反应中的一个重要参数。
它是PCR扩增过程中,荧光信号首次超过背景噪音的循环数。
Ct值越小,表示样品中的目标RNA初始浓度越高;反之,Ct值越大,则表示样品中的目标RNA初始浓度越低。
四、Ct值的应用Ct值在RT-PCR中的应用主要体现在以下几个方面:1. 定量分析:通过比较不同样本的Ct值,可以定量分析它们之间的RNA表达差异。
2. 目标RNA的初步定性:通过观察Ct值是否在可接受范围内,可以判断是否存在目标RNA。
3. 评估PCR效率:Ct值也可以作为评估PCR扩增效率的一个指标。
五、结论综上所述,反转录PCR Ct值是衡量样品中目标RNA初始浓度的重要参数,对于理解和解释实验结果具有重要意义。
理解并掌握Ct值的概念,可以帮助我们更好地运用RT-PCR技术进行科研工作。
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反转录PCR
科技名词定义
中文名称:反转录PCR
英文名称:reverse transcription PCR;RT-PCR
定义:扩增mRNA的一种实验技术。
先将mRNA反转录成cDNA,然后再以cDNA为模板,用
PCR方法加以扩增。
应用学科:遗传学(一级学科);基因组学(二级学科)
以上内容由全国科学技术名词审定委员会审定公布
目录
四、注意事项
RT-PCR反应原理
[1]
反转录PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)又称为逆转录PCR。
其原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。
再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。
该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、
合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。
RT- PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)即逆转录PCR,是将RNA的逆转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增反应(PCR)相结合的技术。
RT-PCR 技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞/组织中基因表达水平,细胞中RNA 病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列等。
编辑本段一、反转录酶的选择
1. Money 鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA 酶H活性相对较弱。
最适作用温度为37℃。
2.禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。
最适作用温度为42℃。
3.Thermus thermophilus、Thermus flavus等嗜热微生物的热稳定性反转录酶:在Mn2 存在下,允许高温反转录RNA,以消除RNA模板的二级结构。
4.MMLV反转录酶的RNase H-突变体:商品名为SuperScript 和SuperScriptⅡ。
此种酶较其它酶能多将更大部分的RNA转换成cDNA,这一特性允许从含二级结构的、低温反转录很困难的mRNA模板合成较长cDNA。
编辑本段二、合成cDNA引物的选择
1.随机六聚体引物:当特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。
用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。
通常用此引物合成的cDNA 中96%来源于rRNA。
2. Oligo(dT):是一种对mRNA特异的方法。
因绝大多数真核细胞mRNA 具有3’端Poly(A )尾,此引物与其配对,仅mRNA可被转录。
由于
Poly(A )RNA仅占总RNA的1-4%,故此种引物合成的cDNA比随机六聚体作为引物和得到的cDNA在数量和复杂性方面均要小。
3.特异性引物:最特异的引发方法是用含目标RNA的互补序列的寡核苷酸作为引物,若PCR反应用二种特异性引物,第一条链的合成可由与mRNA 3’端最靠近的配对引物起始。
用此类引物仅产生所需要的cDNA,导致更为特异的PCR扩增。
编辑本段三、操作步骤
1. 总RNA的提取。
2. cDNA第一链的合成(Reverse Transcription):目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。
现以
GIBICOL公司提供的SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
(1)在0.5ml微量离心管中,加入总RNA 1-5μg,补充适量的DEPC H2O 使总体积达11μl。
在管中加10μM Oligo(dT)12-18 1μl,轻轻混匀、离心。
(2)70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。
然后加入下列试剂的混合物:
10×PCR buffer 2μl
25mM MgCl2 2μl
10mM dNTPmix 1μl
0.1M DTT 2μl
轻轻混匀,离心。
42℃孵育2-5min。
(3)加入SuperscriptⅡ1μl ,在42℃水浴中孵育50min。
(4)于70℃加热15min以终止反应。
(5)将管插入冰中,加入RNase H 1μl ,37℃孵育20min,降解残留的RNA。
-20℃保存备用。
3.PCR:
(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:
第一链cDNA 2μl
上游引物(10pM)2μl
下游引物(10pM)2μl
dNTP(2mM) 4μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl)1μl
(2)加入适量的ddH2O,使总体积达50μl。
轻轻混匀,离心。
(3)设定PCR程序。
在适当的温度参数下扩增28-32个循环。
为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。
(4)电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。
(5)密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。
编辑本段四、注意事项
1.在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。
在总RNA
的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。
2.为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。
3.内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。
常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。
其目的在于避免RNA
定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差。
4. PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。
故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定。
5.防止DNA的污染:
(1)采用DNA酶处理RNA样品。
(2)在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。