稳定同位素分析软件IsoSource软件的学习
MixSIAR和IsoSource模型解析植物水分来源的比较研究

第40卷第16期2020年8月生态学报ACTAECOLOGICASINICAVol.40,No.16Aug.,2020基金项目:国家自然科学基金项目(41571130073);中国科学院创新交叉团队收稿日期:2019⁃10⁃30;㊀㊀网络出版日期:2020⁃06⁃08∗通讯作者Correspondingauthor.E⁃mail:xuxianliww@gmail.comDOI:10.5846/stxb201910302294曾祥明,徐宪立,钟飞霞,易汝舟,徐超昊,张耀华.MixSIAR和IsoSource模型解析植物水分来源的比较研究.生态学报,2020,40(16):5611⁃5619.ZengXM,XuXL,ZhongFX,YiRZ,XuCH,ZhangYH.ComparativestudyofMixSIARandIsoSourcemodelsintheanalysisofplantwatersources.ActaEcologicaSinica,2020,40(16):5611⁃5619.MixSIAR和IsoSource模型解析植物水分来源的比较研究曾祥明1,2,3,徐宪立1,3,∗,钟飞霞1,3,易汝舟1,2,3,徐超昊1,2,3,张耀华1,2,31中国科学院亚热带农业生态研究所,长沙㊀4101252中国科学院大学,北京㊀1000493中国科学院环江喀斯特生态系统观测研究站,环江㊀547100摘要:选取西南喀斯特地区次生林中主要优势植物刺楸(Kalopanaxseptemlobus(Thunb.)Koidz.)㊁香椿(Toonasinensis)和化香(PlatycaryastrobilaceaSieb.etZucc.)为研究对象,通过对不同土壤深度的土壤水㊁泉水㊁雨水和植物采样,利用氢氧稳定同位素技术,借助IsoSource和MixSIAR两种模型分析植物水分来源,通过直接相关法判断植物主要吸水源来衡量两种模型的适用性㊂结果表明,降雨δ18O值在3月 6月偏正,在6月 8月数据偏负,存在明显的季节变化㊂在春季不同土壤层土壤水δ18O值土壤深度增加而降低,夏季呈现相反的规律㊂基于IsoSource和MixSIAR模型计算植物不同水分来源比例时存在一定差异㊂基于直接相关法定性分析植物水分来源表明MixSIAR模型计算结果可靠性高于IsoSource模型㊂基于均方根误差(RootMeanSquareError,RMSE)进行模型评价,结果显示出MixSIAR模型的RMSE结果小于IsoSource模型,表明利用MixSIAR模型计算植物对各水源的利用比例适用性高于IsoSource模型㊂本文结果有助于在解析植物水分来源时为模型的选择提供参考㊂关键词:喀斯特;氢氧稳定同位素;水分来源;IsoSource模型;MixSIAR模型;生态水文ComparativestudyofMixSIARandIsoSourcemodelsintheanalysisofplantwatersourcesZENGXiangming1,2,3,XUXianli1,3,∗,ZHONGFeixia1,3,YIRuzhou1,2,3,XUChaohao1,2,3,ZHANGYaohua1,2,31InstituteofSubtropicalAgriculture,ChineseAcademyofScience,Changsha410125,China2UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing100049,China3HuanjiangObservationandResearchStationforKarstEcosystem,ChineseAcademyofSciences,Huanjiang547100,ChinaAbstract:Plantwatersourceisaprerequisiteforresearchandmanagementofagricultureandecology.EspeciallyinKarstareas,duetothespecialgeologicalconditions,plantsarepronetogenerallysufferinseverewaterdeficit.Understandingtheplantwatersourcesisthereforeimportantforecologicalrestoration.Inthisstudy,themaindominantplantsinthesecondaryforestofsouthwestkarstregions,Kalopanaxseptemlobus(Thunb.)Koidz.,ToonasinensisandPlatycaryastrobilaceaSieb.etZucc.wereselected.Isotopicsamplesofsoilmoistureatdifferentsoildepth,springwater,rainwaterandplantswerecollected.WeanalyzedtheplantswatersourcesbyIsoSourceandMixSIARmodels,andtheperformanceofthetwomodelswerecompared.Theresultsshowedthattheδ18OvaluesofrainfallwerepositiveduringMarchtoJune,whilethesevalueswerenegativeduringJunetoSeptember,2017.Thus,theδ18Oofrainfallexhibitedthesignificantlytemporalorseasonalvariations.Theδ18Ovaluesofsoilmoistureatdifferentsoillayersdecreasedwiththeincreaseofsoildepthinspring,while2165㊀生㊀态㊀学㊀报㊀㊀㊀40卷㊀thiscircumstancewascontraryinsummer.ThereweresignificantdifferencesincalculatingtheproportionofplantswatersourcesbetweenIsoSourceandMixSIARmodels.TheanalysisofplantwatersourcesbasedonthedirectinferenceapproachshowedthattheperformanceofMixSIARmodelwasbetterthanthatofIsoSourcemodel.TheperformanceofMixSIARmodel(RootMeanSquareError(RMSE),0.61inspringand0.59insummer)outperformedtheIsoSourcemodel(RMSE,0.84inspringand0.74insummer)inestimatingtheplantswatersources.Theresultsofthestudycanprovideabeneficialguideinmodeldecisionforthefutureresearchersinplantwatersources.KeyWords:karst;hydrogenandoxygenstableisotopes;plantwatersources;IsoSourcemodel;MixSIARmodel;ecohydrology水作为生态系统中物质循环和能量流动的重要载体,在保障生态系统正常运作中起着至关重要的作用,同时也是植物正常生长发育所必须的,因此在缺水区极易成为植物生长的限制因子㊂在南方喀斯特地区,降水丰沛,但年降雨分配不均,存在明显的季节变化[1],同时喀斯特地区土壤浅薄且不连续,土壤保水蓄水能力差,易形成干旱[2],因此植物容易因缺水而导致死亡,对当地生态环境造成重大影响㊂植物水分来源是植被耗水的重要组成部分,对植物水分来源的解析有助于理解植被耗水规律,进而为喀斯特石漠化地区植被重建和生态恢复提供相关知识,因此研究喀斯特地区植物水分来源对于恢复和重建当地生态系统有着重要的意义㊂研究植物水分来源方法有很多且存在较大差异㊂主要包括根系挖掘法[3⁃4]㊁连续监测各潜在水分来源的含水量变化[5]㊁监测植物黎明前水势[6]和直接相关法[7⁃11]㊂根系挖掘法能够根据有无根系分布来确定植物可能利用水源,但不能确定植物对各个水源的吸收比例同时也容易对植物生长环境造成极大的破坏[12]㊂连续监测各潜在水分来源的含水量变化能够分析植物水源的季节变化,然而只适用于风化程度较高的地区㊂监测植物黎明前水势的方法不受植物所处环境的影响,适应范围广,但无法确定植物对各个水源的吸收比例㊂直接相关法的优势在于操作简单,但亦无法确定植物对各个水源的吸收比例㊂因此,这四种方法都存在不足,或者无法准确的分析出植物对不同水源的利用比例,或者适用范围小㊂随着光谱测定稳定同位素技术的发展,同时植物(除少数盐生和旱生植物)根系吸收水在运输到未栓化茎秆之前,其同位素比率不会发生变化[13],各水源之间氢氧稳定同位素存在显著差异[14],因此氢氧稳定同位素已被广泛用于植物水分来源研究[9,15⁃17]㊂量化植物水分来源模型主要有IsoSource[18]㊁MixSIR[19]㊁SIAR[20]和MixSIAR[21],然而各种方法定量区分的结果尚值得商榷㊂IsoSource模型在计算植物水分来源中运用最广泛,但它只是基于简单的质量守恒,并未考虑随机测量误差与同位素分馏等不确定性对模型的影响[22],而MixSIAR不仅融合了MixSIR和SIAR模型优势又加入源数据输入形式和分类变量等模块,能有效提高模型计算精度[21]㊂Evaristo等[23]在比较二源质量守恒和贝叶斯混合模型计算植物水分来源时发现,贝叶斯混合模型能够更有效的评估植物水分来源的利用比例,Wang等[24]在研究半干旱区植物水分来源时发现MixSIAR和SIAR模型植物水分来源溯源效果优于IsoSource和MixSIR模型㊂因此在研究植物水分来源时,应该选择何种方法,研究者对该问题易产生困惑㊂同时MixSIAR是融合MixSIR和SIAR模型中的优势,所以有必要研究IsoSource和MixSIAR模型在计算植物水分来源时存在的差异及模型适用性㊂为此本文利用氢氧稳定同位素技术,研究喀斯特地区次生林3种植物(刺楸㊁香椿和化香)在春夏两季水分来源利用情况,通过IsoSource和MixSIAR模型量化不同水源对植物茎杆水的贡献比例,评估两种模型在计算植物水分来源的表现并探索造成两者模型计算结果差异的潜在原因,希望能为以后研究者在研究喀斯特地区植物水分来源时应选择何种模型来解析水源对植物的贡献比例提供参考㊂1㊀材料和方法1.1㊀研究区概况㊀㊀研究区位于贵州省普定县的陈旗流域(图1)(105ʎ42ᶄ 105ʎ43ᶄE,26ʎ14ᶄ 26ʎ15ᶄN),该区域属于典型的亚热带季风湿润气候,年平均降雨量1336mm,年均温度为14.2ħ㊂植被覆盖率和覆盖度较高,次生林主要物种有香椿(Toonasinensis)㊁化香(PlatycaryastrobilaceaSieb.etZucc.)和刺楸(Kalopanaxseptemlobus(Thunb.)Koidz.)等优势乔木,偶见合欢(AlbiziajulibrissinDurazz.)和白栎(QuercusfabriHance)等乔木;下层偶见小叶冻绿(Rhamnusutilis)㊁小果蔷薇(RosacymosaTratt.)等小型灌木㊂陈旗流域岩石主要包括白云岩和石灰岩,降雨主要集中在5月 10月份[25],研究区地形崎岖且土壤浅薄不连续[26],保水蓄水能力差,同时由于山地被过度开垦,土壤结构出现严重破坏,导致严重的石漠化现象㊂图1㊀样点分布图Fig.1㊀Locationofthestudysites1.2㊀研究方法选取次生林中优势物种:刺楸(K.septemlobus(Thunb.)Koidz.)㊁香椿(T.sinensis)和化香(P.strobilaceaSieb.etZucc.)为研究对象㊂并在春季2017年4月24日 27日,夏季2017年7月8日 10日分别对不同土层土壤水㊁植物木质部水㊁泉水和降雨进行采样㊂植物样品采集:每种植物选择大小相似位置相近的3棵植物分别采样,每棵植物采集一个样品㊂选择每棵植物茎杆直径为0.1 0.3cm,长度4 5cm的枝条[27],将树皮削去,取植物木质部放入采样瓶中㊂土壤样品采集:在采样植物旁边选择挖掘一个土壤剖面,分别采集10㊁20㊁30㊁40cm土壤层的土壤样品,每层土壤采集3个重复,此外在采样前剖面外5cm的垂直面移除以防止蒸发对同位素产生影响,将采样土壤装入采样瓶中[28]㊂雨水和泉水样品采集:采样时间2017年3月 8月㊂当样地单次降雨量可被收集时,用塑料容器采集以防止蒸发,当雨量足够多时,将降雨倒入采样瓶中㊂同时对山坡下方存在的两个泉眼进行水样采集,采集频率每5天1次㊂将装有样品的所有采样瓶用封口膜密封,迅速放入带有冰盒的保温盒中,带回实验室后储存于-20ħ的冰箱中㊂1.3㊀实验分析植物和土壤样品在低温真空条件下,利用VacuumCondensationExtractionSystem(LI⁃2000,LICA,China)在700Pa压强下抽提植物木质部水和土壤水,样品中不同的水分含量影响植物抽提速度,一般抽提时间为1.5 3h,抽提效率超过98%㊂植物木质部在经过低温真空抽提之后,将所抽提的水经过MCM(Micro⁃CombusionModule)设备去除可能含有的有机物质,再用液态水同位素分析仪(L2120-I,picarro,USA)测定各水体的氢氧稳定同位素比率,其中氢稳定同位素比率精度为1.5ɢ,氧稳定同位素比率精度为0.2ɢ㊂根据同位素表达式计算δ2H和δ18O值:δɢ()=Rsample-RstandardRstandardˑ1000,其中δɢ()为植物㊁土壤㊁雨水和泉水的氢3165㊀16期㊀㊀㊀曾祥明㊀等:MixSIAR和IsoSource模型解析植物水分来源的比较研究㊀氧稳定同位素值,Rsample和Rstandard分别为样品中2H/H和18O/16O以及国际通用标准物中2H/H和18O/16O㊂氢氧稳定同位素计算结果以标准平均海水为标准㊂1.4㊀数据分析利用IsoSource和MixSIAR模型分别计算植物利用各水分来源比例,其中在利用IsoSource模型计算植物水分来源过程中,Increment为1%,Tolerance设定值一般不小于Increment增量与各水源同位素比率之间最大差值的乘积的一半[18]㊂MixSIAR模型输入的原始数据使用均值和标准差,Errorstructure选择Resid∗Process, MCMC 的运行长度选择 Verylong ㊂通过模型评价指标均方根误差(RootMeanSquareError,RMSE)来衡量两模型计算结果的适用性㊂由于目前植物对不同水源的实际利用值无法直接观测[29],因此本研究将测得的植物木质部同位素比率作为观测值(oi),预测值(pi)通过以下公式计算[24,30]:pi=ðni=1fiδA(1)式中,n是植物水源个数,fi是MixSIAR和IsoSource模型计算植物对第i个水源的利用比例,δA是不同水源的同位素比率㊂模型效果评价指标RMSE计算公式:RMSE=[1nðni=1(pi-oi)2]1/2(2)所有计算结果用Origin2018作图㊂2㊀结果与分析图2㊀研究期降雨量及雨水δ18O值分布特征Fig.2㊀Distributioncharacteristicsofrainfallandδ18Oduringthestudyperiod2.1㊀降水及雨水同位素季节动态在研究区内2017全年降雨为996.7mm,其中3月 8月总降雨为657.2mm,占全年降雨量的65.9%,降雨相对集中㊂数据结果显示,在3月 6月,δ18O同位素为-2.39ɢʃ1.92ɢ,数据偏正,在6月 8月,δ18O同位4165㊀生㊀态㊀学㊀报㊀㊀㊀40卷㊀素为-10.12ɢʃ3.12ɢ,数据偏负,表现为明显的季节变化㊂根据当地降水同位素,线性拟合出当地大气降水线方程δ2H=8.50δ18O+12.29(R2=0.97,P=0.001),而全球大气降水线方程:δ2H=8δ18O+10㊂从方程可以看出当地大气降水线方程在截距和斜率都高于全球大气降水线方程,表明当地降水的蒸发富集现象并不明显㊂2.2㊀植物水分来源定性分析图3结果显示,在春季采样时间(4月24日 27日)土壤水δ18O值在表层土壤中最大,并随着土壤深度(0 40cm)的增加而下降,并且此时的泉水δ18O值略高于40cm土壤处δ18O值㊂植物木质部水δ18O值中刺楸值最小,同时香椿和化香的δ18O值相近,表明当利用模型计算香椿和化香植物水分来源利用比例时各水源结果应该相近㊂图3表明在夏季采样时间内(7月8日 10日)土壤水δ18O值在表层土壤中最小,并且随着土壤深度(0 40cm)增加而增加,与春季δ18O值变化规律相反,并且此时的泉水的δ18O值最高㊂植物木质部水δ18O值中香椿高于化香和刺楸,且夏季香椿和化香的δ18O值相差比春季大,表明当利用模型计算香椿和化香植物水分来源比例时各水源利用比例值存在一定差异㊂根据图中植物水δ18O值所在的直线与不同源δ18O值所在的线的交点所处的位置,初步判断在春季香椿和化香主要利用20cm土层土壤水分,而刺楸主要利用30cm土层土壤水分㊂在夏季,香椿主要利用40cm土层土壤水分,而化香主要利用30cm土层土壤水分,刺楸主要利用10cm土层土壤水分㊂图3㊀春夏季CQ㊁HX㊁XC和不同水源的δ18O值变化特征Fig.3㊀Variationcharacteristicsofδ18OamongCQ,HX,XCanddifferentwatersourcesinspringandsummerseasonsCQ:刺楸Kalopanaxseptemlobus(Thunb.)Koidz.;HX:化香PlatycaryastrobilaceaSieb.etZucc.;HX:香椿Toonasinensis2.3㊀基于MixSIAR和IsoSource模型对植物水分来源定量分析直接相关法只能判断植物水分的大致来源,然而确定植物对各个水源的吸收比例在实际应用中更重要,运用MixSIAR和IsoSource模型来分析植物对不同土层土壤水(10㊁20㊁30㊁40cm)和泉水的利用比例,计算结果存在一定差异㊂图4结果显示,在春季,利用MixSIAR模型对植物水分来源分析结果表明,香椿对10㊁20㊁30㊁40cm土层土壤水和泉水的利用比例分别是27%㊁25%㊁21%㊁13%㊁14%与化香的结果(27%㊁28%㊁22%㊁11%㊁12%)相近,这与直接相关法定性判断结果相近㊂然而利用IsoSource模型对植物水分来源分析显示,香椿对10㊁20㊁30㊁40cm土层土壤水和泉水的利用比例分别是28%㊁27%㊁10%㊁21%㊁13%与化香的结果(23%㊁25%㊁25%㊁13%㊁14%)存在较大差异,这个结果与直接相关法分析的结果差别较大㊂MixSIAR模型的计算表明刺楸主要利用5165㊀16期㊀㊀㊀曾祥明㊀等:MixSIAR和IsoSource模型解析植物水分来源的比较研究㊀10 30cm土层土壤水,与直接相关法分析的结果相近㊂直接相关法分析表明刺楸主要利用20 30cm土层土壤水并且对10 30cm土层土壤水的利用比例大于对40cm土层土壤水和泉水的利用比例㊂而IsoSource模型计算结果表明刺楸主要利用30 40cm土层土壤水和泉水,与直接相关法判断结果存在很大偏差㊂在夏季,MixSIAR模型计算结果表明化香对20㊁30㊁40cm土层土壤水的总利用比例为58%,IsoSource模型计算结果表明化香对20㊁30㊁40cm土层土壤水总利用比例为21%,而通过直接相关法显示化香对20㊁30㊁40cm土层土壤水吸收比例高于10cm土层土壤水和泉水,只有MixSIAR模型计算结果满足要求㊂因此MixSIAR模型计算结果比IsoSource模型计算结果可靠性要高㊂MixSIAR模型计算结果表明香椿对30㊁40cm土层土壤水和泉水总利用比例为50%,IsoSource模型计算结果表明香椿对30㊁40cm土层土壤水和泉水总利用比例为13%,而直接相关法分析表明香椿对30㊁40cm土层土壤水和泉水水源吸收比例高于10cm和20cm土层土壤水,结果同样表明只有MixSIAR计算结果满足要求㊂MixSIAR和IsoSource模型计算刺楸水分来源的结果表明:刺楸主要利用10cm土层土壤水,利用比例分别为59%和96%,这与直接相关法得出的结果一致㊂图4㊀IsoSource和MixSIAR模型计算植物水分来源比例结果Fig.4㊀TheresultsoftheproportionofplantwatersourcefromIsoSourceandMixSIARmodels图a,b分别是MixSIAR模型计算春夏季比例结果;图c,d分别是IsoSource模型计算春夏季比例结果2.4㊀模型的总体评价图5显示在春季,MixSIAR模型计算的RMSE值0.61,而IsoSource模型计算的RMSE是0.84㊂在夏季MixSIAR模型计算的RMSE值是0.59,而IsoSource模型计算的RMSE是0.74㊂上述结果表明,MixSIAR模型结算结果的RMSE值小于IsoSource模型计算结果㊂因此利用MixSIAR模型计算植物水分来源结果误差小于IsoSource模型计算结果,在喀斯特地区更适合利用MixSIAR模型解析植物水分来源㊂6165㊀生㊀态㊀学㊀报㊀㊀㊀40卷㊀图5㊀MixSIAR和IsoSource模型评价指标结果Fig.5㊀TheperformanceofplantwatersourcebyusingMixSIARandIsoSourcemodels3㊀讨论MixSIAR和IsoSource模型是量化植物水分来源比例的重要方法㊂本文研究结果显示这两种模型在量化植物水分来源上存在一定差异㊂以量化次生林刺楸㊁香椿和化香3种植物水分来源为例,借助直接相关法的分析结果,衡量哪种方法更适合解析喀斯特地区植物对不同水分来源利的利用比例㊂在春季,MixSIAR模型分析结果显示香椿和化香对不同的水分来源利用比例很接近,与直接相关法分析的结果相一致㊂而IsoSource模型计算结果显示香椿和化香对各水源的利用比例存在一定的差异,尤其是植物对30 40cm土层土壤水利用存在很大的差异,然而直接相关法分析显示香椿㊁化香δ18O值与水源线的交点相近,这表明,香椿和化香在对30 40cm土层土壤水的利用比例应该相近而不应出现较大差异,这与MixSIAR模型计算的植水分来源结果较一致㊂同时MixSIAR模型计算刺楸植物水分来源结果显示刺楸主要利用10 30cm土层土壤水,并对10 30cm土层土壤水吸收大于泉水和40cm土层土壤水,而IsoSource模型计算结果显示,刺楸主要吸收30 40cm土层土壤水和泉水的水源㊂这两者的计算结果中植物的主要水源都有30cm土层土壤水,与直接相关法分析结果近乎一致,但是刺楸δ18O值对于10 20cm土壤δ18O值较40cm土壤和泉水值更接近,因此刺楸应该对10 20cm土壤水吸收高于40cm和泉水,与MixSIAR模型计算出的结果一致,而与IsoSource模型计算结果存在较大差异㊂结果显示,MixSIAR模型解析植物水分来源可靠性高于IsoSource模型㊂同时根据模型评价指标RMSE显示,在春夏季,MixSIAR模型评价指标RMSE都小于IsoSource模型㊂因此,MixSIAR模型对量化植物水分来源适用性高于IsoSource模型㊂氢氧稳定同位素在植物(除少数耐盐和旱生植物外)吸水过程中并不发生分馏,同时各种水源氢氧稳定同位素值存在较大的差异[13],这为氢氧稳定同位素研究植物水分来源提供了理论基础[31]㊂PhillipsandGregg[18]和Phillips[32]基于质量守恒方程,利用线性混合模型得出当n+1的水源能够被n个示踪元素精准的分析出㊂以一个稳定性同位素值和两个源为例,引入fA和fB作为利用A㊁B源的利用比例,δA和δB为源同位素值,δM为混合物同位素值,得出方程组:δM=fAδA+fBδB,1=fA+fB,进而解析出方程中的fA和fB值㊂然而,准确计算混合物源的比例需要满足一定条件,只有当源的数量少于或者等于同位素数量+1时,这些方程才能精准的解析出不同源的利用比例[19]㊂同时,随机测量误差㊁同位素分馏都会导致这些比例估计值的不确定7165㊀16期㊀㊀㊀曾祥明㊀等:MixSIAR和IsoSource模型解析植物水分来源的比较研究㊀性[22]㊂然而,IsoSource模型在实际应用的过程中源的数量往往都会高于同位素的数量+1,因此在利用上述方程求解时,方程将会呈现多解情况,方程的不确定增加,结果就会更加不可靠,同时也没有考虑到同位素在混合物与源之间的分馏,这样使得计算的结果更加不可靠㊂因此,导致本研究中利用IsoSource模型计算植物水分来源结果可靠性低于MixSIAR模型㊂为了进一步提高解析混合物与源之间的准确度,解决IsoSource模型存在的问题,MooreandSemmens[19]提出了基于MATLAB开发的MixSIR计算模型,该模型提出源对混合物贡献的概论分布,明确指出不确定性与源㊁分馏和同位素特征关系,同时在分析的过程中也可以加入先验信息㊂Parnell等[20]基于贝叶斯同位素混合模型,并进一步发布一个新的开源R包SIAR㊂SIAR与MixSIR模型有很大的相似处,然而SIAR模型包含残差而MixSIR模型没有㊂根据SIAR模型计算公式:Xij=ðKk=1pkqjk(sjk+cjk)ðKk=1pkqjk+εij(3)式中,Xij是第i个混合物中同位素j的值,pk是由模型计算出第k个源对混合物的贡献率,qjk是第k个源中同位素j的浓度,sjk是第k个源中同位素j的值,cjk是第k个源中同位素j的分馏系数,εij是残差㊂当SIAR模型加入残差εij后,能够降低模型的不确定,从而提高模型的准确性[33]㊂MixSIAR模型是基于R语言包并结合MixSIR和SIAR模型的优点所做的改进,通过考虑源值㊁分类和连续协变量和先验信息中的不确定性来改进更简单的线性混合模型,以提高模型结果的准确性㊂图5结果显示,MixSIAR模型计算的RMSE值(春季0.61,夏季0.59)低于IsoSource模型计算的RMSE值(春季0.84,夏季0.74)证实了MixSIAR模型解析植物水分来源利用比例误差更小并且可靠性更高㊂然而,在喀斯特地区IsoSource模型被广泛运用于解析植物水分来源㊂丁亚丽等[34]利用IsoSource模型研究尾巨桉水分利用特征,Nie等[35]利用IsoSource模型研究木本植物水分来源季节变化,Deng等[36]利用IsoSource模型研究青冈(Cyclobalanopsisglauca)植物水分来源利用情况㊂在喀斯特地区很少有研究者利用MixSIAR模型解析植物水分来源,MixSIAR模型多数被用于非喀斯地区,如杜俊杉等[37]利用MixSIAR模型分析冬小麦植物水分来源,MaandSong等[38]利用MixSIAR模型研究玉米水分来源季节变化㊂但本研究表明在喀斯特地区更适合利用MixSIAR模型解析植物水分来源㊂4㊀结论雨水δ18O值存在明显的季节变化特征,在3月 6月偏正,在6月 8月数据偏负㊂在喀斯特地区利用MixSIAR和IsoSource模型解析植物对不同水源的利用比例结果存在差异㊂基于直接相关法结果显示,MixSIAR模型计算植物水分来源优于IsoSource模型计算结果㊂基于MixSIAR和IsoSource模型计算结果总体评价的结果显示,在春夏季,MixSIAR和IsoSource模型计算植物水分来源的RMSE值分别为0.61(0.59)和0.84(0.74),因此MixSIAR模型在计算植物水分来源时可靠性高于IsoSource模型㊂所以在喀斯特地区利用MixSIAR模型解析植物水分来源比IsoSource模型更适合㊂参考文献(References):[1]㊀LiuMX,XuXL,SunAY,WangKL,LiuW,ZhangXY.IssouthwesternChinaexperiencingmorefrequentprecipitationextremes?EnvironmentalResearchLetters,2014,9(6):064002.[2]㊀彭晚霞,王克林,宋同清,曾馥平,王久荣.喀斯特脆弱生态系统复合退化控制与重建模式.生态学报,2008,28(2):811⁃820.[3]㊀DahlmanRC,KuceraCL.Rootproductivityandturnoverinnativeprairie.Ecology,1965,46(1/2):84⁃89.[4]㊀ZhangXY,PeiD,ChenSY.RootgrowthandsoilwaterutilizationofwinterwheatintheNorthChinaPlain.HydrologicalProcesses,2004,18(12):2275⁃2287.[5]㊀聂云鹏,陈洪松,王克林.土层浅薄地区植物水分来源研究方法.应用生态学报,2010,21(9):2427⁃2433.[6]㊀TurnerNC,JonesMM.Turgormaintenancebyosmoticadjustment:areviewandevaluation//TurnerNC,KramerPJ,eds.AdaptationofPlantstoWaterandHighTemperatureStress.NewYork:JohnWiley&Sons,1980:87⁃103.8165㊀生㊀态㊀学㊀报㊀㊀㊀40卷㊀[7]㊀AsbjornsenH,MoraG,HelmersMJ.VariationinwateruptakedynamicsamongcontrastingagriculturalandnativeplantcommunitiesintheMidwesternU.S.Agriculture,Ecosystems&Environment,2007,121(4):343⁃356.[8]㊀邓文平,余新晓,贾国栋,李亚军,刘玉洁,白艳婧.利用稳定氢氧同位素定量区分栓皮栎旱季水分来源的方法比较.应用基础与工程科学学报,2013,21(3):412⁃422.[9]㊀付青云,刘廷玺,段利民,王冠丽,曹文梅,黄天宇.基于稳定性氧同位素分析不同树龄小叶锦鸡儿用水策略.生态学杂志,2019,38(5):1570⁃1579.[10]㊀李雪松,贾德彬,钱龙娇,冯蕴.基于同位素技术分析不同生长季节杨树水分利用.生态学杂志,2018,37(3):840⁃846.[11]㊀张景文,陈报章.基于同位素分析研究山东禹城夏玉米水分来源.水土保持学报,2017,31(4):99⁃104.[12]㊀ZhangYC,ShenYJ,SunHY,GatesJB.Evapotranspirationanditspartitioninginanirrigatedwinterwheatfield:acombinedisotopicandmicrometeorologicapproach.JournalofHydrology,2011,408(3/4):203⁃211.[13]㊀聂云鹏,陈洪松,王克林,SusanneS.采用稳定同位素技术判定喀斯特地区植物水分来源的挑战与可能应对方案.应用生态学报,2017,28(7):2361⁃2368.[14]㊀BrunelJP,WalkerGR,DightonJC,MontenyB.Useofstableisotopesofwatertodeterminetheoriginofwaterusedbythevegetationandtopartitionevapotranspiration.AcasestudyfromHAPEX⁃Sahel.JournalofHydrology,1997,188⁃189:466⁃481.[15]㊀DawsonTE,EhleringerJR.Isotopicenrichmentofwaterinthe 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稳定同位素分析操作规程

IsoPrime Ltd编号:SOP No.:名称1.0 目的PURPOSE建立Isoprime同位素质谱系统的操作与维护规程,确保仪器的准确操作与使用。
2.0 适用范围SCOPE适用于Isoprime同位素质谱系统,带元素分析仪 (Vario EL cube)。
3.0 定义DEFINITIONSN/A4.0 职责RESPONSIBILITIES4.1 分析员4.1.1分析员应严格按照本规程执行。
4.1.2分析员应在使用仪器设备前检查仪器的状态。
如果发现异常应及时通知其主管或联系维修工程师。
4.2 主管4.2.1确保分析员接受本规程培训。
4.2.2督促分析员严格按照本规程执行操作。
4.2.3负责实验室仪器设备异常现象的处理。
5.0 程序PROCEDURE5.1 同位素质谱系统的组成5.1.1 Isoprime 同位素质谱仪,由离子源,飞行管,电磁体,信号放大器,外置真空泵,分子涡轮泵及控制器等模块组成。
5.1.2 参考气体进样器。
5.1.3 样品稀释器。
5.1.4元素分析仪 (Vario EL cube )。
5.2操作方法5.2.1 开机 开气。
接通主机及机械泵电源。
开电脑,打开软件,Tune Page 界面,下拉 Instrument 菜单,点击Pumping on (分子涡轮泵), IonVantage > Isoprime Tune page > Instrument > P umping开隔离阀(Speedivalve ),MS 主机后大旋纽,逆时针,当外置真空泵使系统压力降至适当状态时,分子涡轮泵将自动运行。
S peed i valve 在主机后部当IP high Vac.显示4E10-6mbar 左右时,即两个压力显示条为绿色,开蓝色的隔离阀(主机面板顶上),此时压力会上升,当压力再次降至4E10-6mbar 左右时,即压力显示由黄色再变为绿色时,开离子源。
Isoprime Tune page > I nstrument > S ource on注意:在每次打开黄色隔离阀之前,一定要先关闭离子源,这样做用以保护离子源灯丝。
生命科学中的稳定同位素技术研究

生命科学中的稳定同位素技术研究近年来,随着科技的不断进步,生命科学中的稳定同位素技术也逐渐得到了广泛的应用。
稳定同位素是指具有相同原子序数但质量数不同的同位素,与放射性同位素相比,稳定同位素不会发出放射性衰变,因此对环境与人体健康没有放射性污染危害。
稳定同位素技术的研究已然成为现代生命科学研究中不可或缺的一部分,本文将探究稳定同位素技术的研究现状以及其在生命科学中的应用。
一、稳定同位素技术的研究现状稳定同位素技术是一种基于同位素质量效应(Isotope Effects)的研究方法,通过测量生物体内、外稳定同位素的相对丰度变化,可探究生命科学中的各种现象。
然而,稳定同位素技术的广泛使用并不是一蹴而就的,它需要复杂的仪器设备研制与精细的实验操作技巧。
在仪器方面,稳定同位素技术的核心之一是质谱仪。
目前市场上常见的质谱仪有气相色谱质谱仪(Gas Chromatography-Mass Spectrometry,GC-MS)和液相色谱质谱仪(Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,LC-MS)等。
这些仪器可以通过对稳定同位素标记的样品进行分离,再进行质谱分析,进而得到高精度的质量比丰度数据,从而揭示样品中分子的来源、转化和代谢过程。
在实验操作技巧方面,稳定同位素技术需要进行标记试剂的合成,并且需要进行样品制备与处理等。
相应的操作技巧需要多年的经验积累与实践,因此标记试剂与操作技巧的稳定性和可重复性是保证稳定同位素技术数据准确性的关键。
二、稳定同位素技术在生命科学中的应用稳定同位素技术可以用于研究各种生命科学现象,下面我们将以生物代谢为例进行探究。
生物代谢是指生物体内产生和消耗能量的过程,包括蛋白质、核酸和糖类等大分子化合物的合成和分解。
稳定同位素技术可以用来研究这些化合物合成和分解的速率、途径、来源和去向等信息,从而揭示生物代谢过程中各化合物之间的相互作用和相关性。
崇明东滩南部大弹涂鱼食源的稳定同位素分析

崇明东滩南部大弹涂鱼食源的稳定同位素分析马荣荣;宋超;王妤;王思凯;赵峰;裴倩倩;纪严;庄平【摘要】The food sources of Boleophthalmus pectinirostris collected from the south of Chongming Dongtan saltmarsh in April and May were analyzed with the stable isotope technique.The results showed that δ13C and δ15N range values of B.pectinirostris were from-19.28 ‰ to-14.59 ‰ and 7.96 ‰ to 10.13 ‰, respectively.IsoSource software was used to calculate the frequency and range of potential carbon source contribution (0 % to 100 %) from seven food sources, including Imperata cylindrical, Phragmites australis, Spartina alterniflora, Carex scabrifolia, benthic microalgae, particulate organic matter and sediment organic matter to Boleophthalmus pectinirostris.Analysis results indicated that the potential contribution ranges of Imperata cylindrical, Phragmites australis, Spartina alterniflora, Carex scabrifolia, benthic microalgae, particulate organic matter and sediment organic matter were 0 %-69 %, 0 %-30 %, 0 %-72 %, 0 %-30 %, 0 %-76 %, 0 %-44 %, and 0 %-47 %, respectively.Then, contributions of the primary producers with similar isotope values was pooled and the method of posteriori aggregation was used to obtain the potential contribution ranges of 3 groups (C3 plants, algae and organic matter, and C4 plants).Analysis results of posteriori aggregation indicated that the potential contribution rate of C3 plants (P.australis andC.scabrifolia),algae and organic matter (benthic microalgae, particulate organic matter and sediment organic matter), and C4 plants (I.cylindricaland S.alterniflora) were 0 %-30 %, 0 %-76 %, and 24 %-72 %, respectively, with the corresponding median values of 15 %, 38 %, and 48 %.Posteriori aggregation indicated that the possible contribution rate of C3 plants (P.australis and C.scabrifolia),algae and organic matter (benthic microalgae, particulate organic matter and sediment organic matter), and C4 plants (I.cylindrical and S.alterniflora) were 0-30%, 0-76%, and 24-72%, respectively, with the corresponding median values of 15%, 38%, and 48%.These findings suggested C4 plants constituted a larger fraction of their carbon source than C3 plants, and the C4 plants were an indispensable food source of B.pectinirostris located on the south of Chongming Dongtan saltmarsh.In addition, the B.pectinirostris was concluded to belong to the 2.07-2.65 trophic level based on the δ15N values of B.pectinirostris, suggesting that B.pectinirostris was subconsumer in the food chain of the ecosystem.%利用稳定同位素技术,对崇明东滩南部湿地4、5月份采集到的大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)的食源进行初步研究.结果显示,大弹涂鱼δ13C和δ15N值分别为-19.28‰~-14.59‰,7.96‰~10.13‰.利用同位素混合模型(IsoSource)计算包括白茅(Imperata cylindrical)、芦苇(Phragmites australis)、互花米草(Spartina alterniflora)、糙叶苔草(Carex scabrifolia)、底栖微藻、颗粒有机物和沉积质在内的7种初级生产者对大弹涂鱼碳源食源贡献的可能范围及分布频率,结果表明白茅、芦苇、互花米草、糙叶苔草、底栖微藻、颗粒有机物和沉积质对大弹涂鱼食源的可能贡献范围分别为0%~69%、0%~30%、0%~72%、0%~30%、0%~76%、0%~44%和0%~47%.利用后整合方法计算得到C3植物(芦苇和糙叶苔草)、藻类及有机质(底栖微藻、颗粒有机物和沉积质)和C4植物(白茅和互花米草)三大类生产者对大弹涂鱼食源的贡献情况,结果表明C3植物、藻类及有机质和C4植物对大弹涂鱼春季食物贡献范围分别为0%~30%、0%~76% 和 24%~72%,中值分别为15%、38%和48%,表明C4植物是大弹涂鱼不可缺少的食源.同时,根据大弹涂鱼的δ15N值,得出大弹涂鱼属于2.07~2.65级营养级,为次级消费者.【期刊名称】《海洋渔业》【年(卷),期】2017(039)004【总页数】8页(P419-426)【关键词】大弹涂鱼;崇明东滩;食源;δ13C;δ15N【作者】马荣荣;宋超;王妤;王思凯;赵峰;裴倩倩;纪严;庄平【作者单位】上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090;中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室,上海 200090【正文语种】中文【中图分类】S931大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)隶属于鲈形目(Perciformes),虾虎鱼科(Gobiidae),背眼虾虎鱼亚科(Oxudercinae),大弹涂鱼属[1],主要栖息于河口潮间带及红树林地区,善于跳跃爬行,是一类因拥有部分两栖特性而具有较强陆生能力的鱼类[2]。
稳定同位素分析技术的应用

稳定同位素分析技术的应用稳定同位素分析技术是一种重要的分析方法,它广泛应用于环境科学、地质学、生物学、医学等领域。
稳定同位素是指具有相同原子数但质量不同的同位素。
它们的存在可以提供有关地球、大气和生命系统中物质的循环过程的信息。
稳定同位素分析技术可以测量同位素比例,从而推断物质循环和转化的过程。
这篇文章将介绍稳定同位素分析技术的基本原理、常见的应用和未来的发展方向。
基本原理稳定同位素分析技术的基本原理是利用同位素分馏效应来测量同位素比例。
同位素分馏效应是指随着地球、大气和生物系统中物质循环和转化的过程,同位素之间的比例会发生变化。
这种变化可以刻画物理化学和生物学过程,从而得到关于这些过程的信息。
常见应用1.环境科学稳定同位素分析技术在环境科学领域中得到广泛应用。
例如,稳定同位素分析技术可以用于研究大气中二氧化碳、气态汞和碳氢化合物的来源和分布。
稳定同位素还可以用于检测污染物在水体中的来源和迁移。
2.地质学稳定同位素分析技术在地质学领域中也被广泛应用。
例如,它可以用于研究地球系统的演化以及大陆和海洋的形成。
稳定同位素还可以用于测量化石的年龄,从而推断生命演化的历史。
3.生物学稳定同位素分析技术在生物学领域中用于研究食物链和生态系统中能量和营养物质的流动。
稳定同位素比值可以用于确定食物链中各个层次之间的关系,以及不同食物来源对生物体中同位素组成的影响。
未来发展方向稳定同位素分析技术的发展方向是提高测量精度和降低成本。
新技术和新方法将被开发来提高稳定同位素的分辨率和准确度,以及缩短测试时间。
同时,新的即时检测技术将被应用于各种应用场景中,例如环境监测和医学检测。
总结稳定同位素分析技术是一项强大的分析方法,已经被广泛应用于环境科学、地质学、生物学和医学等领域。
稳定同位素分析技术基于同位素比例的变化探究物质循环和转化的过程,从而提供有关这些过程的信息。
未来发展方向是提高测量精度和降低成本,以及开发新技术和应用场景。
地质流体稳定同位素示踪

二、同位素效应
由同位素质量差所引起的物理和化学性质上的差异。
第二节、同位素分析结果的表达和标准
正是由于同位素效应,造成了地质过程中,两相或多相共存时,不同相中同位素比值差异——使同位素示踪成为可能。
实测δ值
δA =1000 ×(RSa - RSt)/RSt (单位:‰)
第三节、同位素分馏 (isotope fractionation)
指在一系统中,某元素的同位素以不同的比值分配到两种物质或两相中的现象,是同位素效应的表现。
热力学平衡分馏 热力学平衡分馏可以有很多过程,但都达到平衡。 例如:化学反应、扩散交换
2
动力学非平衡分馏 交换时未达到平衡 后期平衡被破坏
共生顺序判别法(P117)
例如:氧同位素有:
石英>方解石> 碱性长石> 蓝晶石>多硅白云母 >钙长石 >白云母 >…….
另一种形式(书上): 由(1+10-3 δA)/(1+ 10-3δ0)=
(1 - f α)/ (1- f)
整理得:
1+10-3 δA= (1+ 10-3δ0)(1 - f α)/ (1- f) δA= (1000+ δ0)(1 - f α)/ (1- f) -1000
例子
书上P79
思考:地质应用
分离相A的δ(平均值)计算公式: 由质量平衡公式得: RB f+RA(1- f)=R0 RA =(R0 -RB f)/ (1- f) RB的计算公式代入得: RA =(R0 - R0f (αA-B-1 f)/ (1- f) =R0(1 - f α)/ (1- f) RA /R0=(1 - f α)/ (1- f) 换算成常用的δ表示:{利用 RA/R0 =(1+10-3 δA)/(1+ 10-3δ0)} ㏑[(1+10-3 δA)/(1+ 10-3δ0)]=㏑ [(1 - f α)/ (1- f)] 左边≈ 10-3 δA- 10-3δ0 δA= δ0 +103 ㏑ [(1 - f α)/ (1- f)]
稳定同位素质谱仪操作指南

稳定同位素质谱仪操作指南英文回答:Stable isotope mass spectrometry is a powerful analytical technique used in various fields such as environmental science, geology, biology, and forensic science. It allows for the precise measurement of isotopic ratios in samples, providing valuable information about their origin, composition, and processes involved.To operate a stable isotope mass spectrometer, there are several key steps and considerations to keep in mind:1. Sample preparation: Before analysis, samples need to be properly prepared to ensure accurate and reliable results. This may involve various procedures such as extraction, purification, and conversion into a suitable form for analysis. For example, in the case of analyzing carbon isotopes in organic matter, samples may need to be combusted to convert the carbon into carbon dioxide gas.2. Instrument calibration: Calibration is crucial to ensure accurate measurements. This involves running known standards with known isotopic compositions to establish a calibration curve or equation. The standards should cover the range of isotopic ratios expected in the samples. Regular calibration checks should be performed to maintain instrument accuracy.3. Sample introduction: The prepared samples are introduced into the mass spectrometer for analysis. This can be done through various methods such as gas injection, liquid injection, or solid sample introduction. The choice of method depends on the nature of the sample and the specific requirements of the analysis.4. Mass analysis: The mass spectrometer separates ions based on their mass-to-charge ratio (m/z). Stable isotopes of interest are typically measured at specific m/z values. The instrument settings, such as ionization mode and mass range, need to be optimized for the specific isotopes being analyzed.5. Data interpretation: Once the analysis is complete, the resulting data needs to be interpreted. This involves comparing the measured isotopic ratios with known standards or reference materials. Statistical analysis and data processing techniques may be used to extract meaningful information from the data.中文回答:稳定同位素质谱仪是一种在环境科学、地质学、生物学和法医学等领域中使用的强大分析技术。
稳定同位素教材质谱仪应用技术培训讲义

0.0112372
N δ15N 15N/14N
大气氮气
0.003676
O δ18O 18O/16O
标准平均大洋海水 (SMOW)
0.0020052
18O/16O
Pee Dee Belemnite (PDB)
[碳酸盐样品氧同位素分析]
0.0020672
18O/16O
标准南极轻降水(SLAP)
0.0018939
矿床学、矿物学、沉积学)――>其它各个学科(例如:海洋 学、水文学、冰川学、古气候学、天体化学、考古学、环境科 学、农林业等)甚至――>生态学、医学、食品安全等学科.
稳定同位素的应用
===IA=E ===Ò==农==、=林==业=研==究=中==的=应==用=================
稳定同位素技术在农、林业研究中应用较早, 研究范围包括科学施肥、作物营养代谢、生物固 氮、生物工程、农用化学物质对农业环境的影响、 草场生产与管理、饲料配方、水产养殖、林木果 树、人参药材等,取得了很大成绩。
Ò R值和δ值 ===IA=E ==============(==同=位=素=组=成=的=表=示=方==法=)===基=本=概==念==
① R值 一般定义同位素比值R为某一元素的重同位素原子丰度与
轻同位素原子丰度之比. 例如 D/H、13C/12C、34S/32S等。
② δ值
样品(Sa)的同位素比值RSa与一标准物质(St)的同位素 比值(RSt)作比较,比较结果称为样品的δ值。其定义为:
元素 H
δ符 号
δD
测量比 率(R)
2H/1H
国际标准物质 标准平均大洋海水 (SMOW)
R值, 国际标 准
0.00015575
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如右图第1个柱子表示鮻的食物来源中 POM的贡献值,在所有可行解的组合 中处于0-2%之间的有11次。
• 查看数据
– View →确定→file → 目 标文件(鮻.out或者鮻.tot) – “.out”文件为原始输出 数据;“.tot”文件为统 计信息摘要 – View只能够现实前200行 的数据,要想看完整的全 部数据需用STATISTICA 或者Excel来打开
是可行的解。 • 在所有可行解中,对每种资源贡献百分比出现的频率进行分析,从而
得出图表
使用方法
• 操作界面及可以输入的部分
Source increment 资源增量参数,食 物网研究中一般输 入1-2(%) 输入标题 帮助里有详细的软件使用方法的介绍
同位素种 类,最多 五种 混合物(消 费者)中实 际测得的同 位素值
基本原理
• 基于稳定同位素的质量守恒
fA、fB表示两种资源A、B的比例(未知量);δA、δB分别表示A、B中同位素的值(已知量); δM表示混合物(消费者)的同位素值(已知量)。两个未知量两个方程,出方程组有唯一解。 对上面的方程组进一步扩展至三种或者更多资源,方程组的解也就不唯一
对于n个同位素种类,>n+1种资源的系统,也可以利用这种质量守恒来求解资源比例 的多种组合的可能解。
• 输入数据
– Mixtures 为实际 测得的消费者同 位素数据 – Sources 为各种 潜在的食物资源 类型 – 右下方空白区域 为实际测定的潜 在食物资源的同 位素值
小数点后最多只能输入6位
注意:如果在资源与混合物之间存在同位素分馏(如trophic fractionation” or “tissue-diet discrimination),同 位素信息必须在输入之前进行相应的调整。如N的分馏值在3.4左右,在输入时应该相应的把数值加3.4
• 后整合方法(以鮻为例)
用来合并具有相似δ13C值初级生产者的相对贡献。对于每一个单 个解,5种食源被合并成3个逻辑组,即C3维管植物(芦苇PA和海 三棱蔗草SM)、C4维管植物(互花米草)和微型藻类(POM和BMI)。 将IsoSource混合模型的输出文件(.out)读入统计软件SAS、
把所得数据拿到作图软件 SigmaPlot上作图
excel打开时数据格式不方便统计, 所以要先在STATISTICA中打开
频率
贡献率(%)
MI=POM+底栖藻类
频率
贡献率(%)
C3=海三棱+芦苇
频率
贡献率(%)
欢迎批评指正 Thanks!
稳定同位素分析软件IsoSource 的使用方法
汇报人:王思凯 导 师:吴纪华 2012.2.27-3.4
软件ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ绍
• 软件名称: IsoSource • 下载地址: /wed/pages/models.htm • 创始人: Donald L. Phillips
• 目的:估算出各类初级生产者对消费者相 对贡献率的可能范围及其平均值
Histogram data 直方图数据
Feasible output 可行解组合的输出数据 相加=1
贡 献 百 分 比
在对应的贡献百分比 上各资源出现的次数
“.tot”文件打开后的界面
“.out”文件打开后的界面
“.tot”文件打开后的界面
N = 观测值总数 平均值
“.out”文件打开后的界面
最小值
最大值
第1百分位
中位数 一共有83个观测值,与”.tot”文件中的N值一致 第99百分位
标准差
• 本幻灯片仅仅就δ 13C做了“一种同位素多种资源”的相关
分析,在实际操作中C、N同位素可以同时使用,只需要 把N数据添加相应的位置即可,但是要注意, δ 15 N要是 经过分馏值修正过的数据(一般对资源加上3.4‰左右) • 为了获取更具有解释性的结果,Phillips(2005)在IsoSource 的输出数据基础上又提出了后整合方法(Posteriori aggregation)
• 保存数据
– File→ – 在filename中输 入需要保存的 文件名→ – Save
• 打开数据
– File → – Data 找到要打 开的数据→ – Open
注意:右边的help,有每一步的相关介绍
• 运算
– Cale →Output → 在filename中输 入需要保存的文 件名 → Save – 现实程序运转 – 计算结束会显示 所花费的时间
• 按照指定的增量范围(increment)叠加运算出资源所有可能的百分比
组合(和为100%) 组合数量
i = increment (%) ;s = number of sources
• 每一个组合的加权平均值与混合物(消费者)实际测定的同位素值进行
比较,那些处于给定的忍受范围(tolerance)内( ± 0.1 ‰)的组合被认为
STATISTICA或者Excel程序中
将5个变量合并3个变量,即C4、MI=BMI+POM; C3=PA+SM。 重新计算这3个逻辑组对游泳动物食源贡献的分布频率。
• 操作步骤
– 打开STATISTICA软件 – 拖动”鮻.tot”至软件 界面中 – 把数据复制到Excel中进 行统计,把5个变量合 并3个变量 – 合并后按照2%的递差增 加对数据进行统计,得 到每种资源类型的贡献 分布频率 – 作图(见下页)
Mass balance tolerance 质量平衡忍受差参数, 一般输入0.01-0.05。 单位与同位素值的单位 一致,δ 单位为‰。 Tolerance越大,可接 受的值就越多
资源 种类 最多 10种
各资源实际测得的相 对应的同位素值
【file/save】保存,【file/open】打开文件,【calc】运行程序,【print】打印,【clear】清除 输入的数据 ,【view】查看运算结果数据,【graph】查看运算后频率分布直方图
• 如果出现右面无解的 情况,就要适当调整 increment或tolerance 的值 • 一般先调整tolerance, 把忍受差增加,得到 解的可能性也就增大
• 结果查看(图表)
– Graph →output → 鮻.tot
• 频率分布图
– Next :下一张 – Previous :上一张 – 直方图表示对应的贡献 百分比出现的频率