转录组相关的自然科学基金申请书摘要
自然基金面上项目申请书（精选14篇）
自然基金面上项目申请书（精选14篇）自然基金面上项目篇1尊敬的xx学校领导:您好!我来自中国湖北省十堰市陨县的一个偏僻的农村。
家中的劳动力只有父亲和母亲，父母亲均是农民，因为没有文化、没有本钱，只好在家务农以种田为生，且母亲一直有病在身，全家的开支几乎由父亲一个人承担。
为了能让我上学，父母亲日夜劳碌奔波，可收入仅仅是维持家庭最基本的生活需要，几十年来一直过着贫苦的生活。
尽管家庭贫困，经济捉襟见肘，但我并不因此而放弃我的大学梦，经过我的奋斗努力，终于圆了我的大学梦，但是高昂的学费，让全家在高兴之余，也随之多了一份负担。
每当开学时父母亲便愁容满面。
几经周折，父母终于向亲戚朋友借来了我的学费，但现在我们家早已是负债累累。
我并没有被家庭情况所困扰，始终坚持学习，没有把自己的情况当成一种负担，在校期间我曾获得一次二等学习奖学金和一次三等奖学金。
在学习上，我努力刻苦，还参加了国家计算机等级考试和全国计算机技术与软件专业技术资格(水平)考试。
在生活上，为了尽量减少家庭负担，在空闲和休息期间，在不影响自己学业和学习的同时，我还参加了图书馆里面勤工俭学，这不仅减轻了家庭的生活负担，还学会了一些书本上不曾有的知识。
在大一署假期间我到天津去做过短工，大二时在学校图书馆里找了份工作。
对于之后的生活我有了更明确的目标和追求，积极参加社会实践活动，保持共青团员的先进性思想，为加入共产党做好准备，作一名合格的大学生。
为了能给父母减轻负担，解决我的后顾之忧，遂向学校申请贫困助学金，希望各位老师能给予批准。
谢谢!此致敬礼申请人：日期：XX年XX月XX日自然基金面上项目申请书篇2尊敬的校领导老师：您好!我是XX班的。
很荣幸的成为我校的一名新生，满怀着对学校无比感激地心情，在激动与兴奋的心情中开始了这里的学习生活，在这里我始终保持着积极向上的心态，时时以“礼德勤诚”的校训要求自己，努力做到全面发展。
本人认为在各方面均符合优秀学生的评选条件，故提出该份申请书。
单细胞多组学申请国家自然科学基金思路
单细胞多组学申请国家自然科学基金思路一、引言：单细胞多组学在国家自然科学基金申请中的重要性近年来，单细胞多组学技术的发展为生命科学研究带来了革命性的变革。
通过单细胞水平上的全面分析，我们可以更好地理解细胞之间的差异，并深入探究疾病发生发展的机制。
在国家自然科学基金的申请中，如何合理地运用单细胞多组学技术，成为了研究者们关注的焦点。
本文将围绕单细胞多组学申请国家自然科学基金的思路展开探讨，并结合具体案例，帮助您更好地把握申请要点。
二、单细胞多组学的概念和技术原理单细胞多组学是指对单个细胞进行全面多方面的组学分析，主要包括转录组学、蛋白质组学、代谢组学等。
通过这些技术的应用，我们可以深入研究单个细胞的生物学特征，探究细胞间的异质性和多样性。
在国家自然科学基金的申请中，合理地运用单细胞多组学技术，可以为课题的深入开展提供有力支持。
三、单细胞多组学在特定领域的应用案例分析以癌症研究为例，单细胞多组学技术的应用可以帮助我们更好地理解肿瘤细胞的异质性和进化过程。
通过分析不同肿瘤细胞的转录组学、蛋白质组学以及代谢组学数据，我们可以揭示肿瘤发展的分子机制，为临床治疗提供精准化的靶向方案。
在国家自然科学基金的申请中，结合具体的研究案例，展示单细胞多组学在特定领域的价值和应用前景，对于申请的成功至关重要。
四、如何在申请中合理地运用单细胞多组学技术在国家自然科学基金的申请中，我们需要清晰地描述课题的研究背景和意义，提出明确的研究问题，设计合理的研究方案，并展望研究成果的应用前景。
在这个过程中，单细胞多组学技术应该被合理地融入到研究方案之中，以解决特定领域的科学问题。
另外，我们还需要充分展示实验技术和数据分析的可行性，并明确研究团队的实力和优势。
只有这样，才能使评审专家充分认识到单细胞多组学技术在课题中的不可替代性，从而增加课题申请的成功率。
五、总结与展望通过本文的阐述，我们对单细胞多组学在国家自然科学基金申请中的重要性有了更加深入的理解。
2023年国家自然 申请书
2023年国家自然申请书尊敬的国家自然基金委员会：您好！我谨代表我们团队向您提交一份关于“XXX项目”的申请书。
本项目旨在通过XXX方法，解决XXX问题，为XXX领域的发展做出贡献。
一、项目简介本项目旨在通过XXX方法，针对XXX问题进行研究，旨在为XXX领域的发展做出贡献。
项目的研究内容包括XXX、XXX和XXX等方面，预期将取得以下成果：XXX、XXX和XXX。
二、研究计划与时间表本项目的具体研究计划如下：1. 研究背景与意义2. 研究目标与内容3. 研究方法与技术路线4. 研究计划与时间表5. 预期成果与价值本项目的实施时间将从XXXX年XX月开始，预计将于XXXX年XX月完成。
在项目实施过程中，我们将严格按照研究计划进行，确保项目的顺利进行。
三、研究团队与分工本项目的研究团队由XXX人组成，包括XXX、XXX和XXX等。
团队成员具有丰富的科研经验和专业背景，能够保证项目的顺利实施。
具体分工如下：1. XXX负责研究计划的制定与实施；2. XXX负责实验设计与数据分析；3. XXX负责文献综述与资料整理；4. XXX负责项目经费管理。
四、经费预算与来源本项目的经费预算为XX万元，其中XX万元来自国家自然基金委的资助，XX万元来自其他渠道的资助。
经费将主要用于实验材料、设备购买、人员工资等方面。
我们将严格按照国家自然基金委的经费管理规定使用经费，确保项目的顺利实施。
五、风险评估与应对措施本项目在实施过程中可能会遇到以下风险：XXX、XXX和XXX等。
为了应对这些风险，我们将采取以下措施：XXX、XXX和XXX等。
我们将密切关注项目进展情况，及时调整研究计划和应对措施，确保项目的顺利进行。
六、附件材料为了证明本项目的可行性和价值，我们提供了以下附件材料：XXX、XXX和XXX等。
这些材料详细介绍了本项目的背景、意义、研究内容和方法等方面的情况，为评审专家提供了全面的参考信息。
国家自然科学基金申请书模板
国家自然科学基金申请书模板
尊敬的评审专家：
首先，我要表达我对贵委员会提供资金支持给我这个课题的深深的感谢。
以下是我的申请书。
一、项目的背景和意义
自然科学基金的资助对于我开展这个课题非常关键。
我的研究方向是XXX，并且我已经做过XXX方面的一些研究，取得
了XXX的成果。
本项目的研究对象XXX，这个课题对于推
动我国XXX的发展非常重要。
二、研究方案
在本项目中，我将采用XXX方法，结合XXX技术，对XXX
进行深入研究。
我将依托实验室先进的设备和专业的技术团队，不断完善实验设计，并为实验结果的准确性与可靠性提供充分的保障。
三、预期成果
本项目的预期成果是XXX。
通过这个项目的研究，我将对
XXX有更深入的认识，为我国XXX的发展提供有力支持。
四、研究团队
我是本项目的项目负责人，同时我还有一支富有经验的研究团队与我一起合作完成这项研究。
五、经费预算
根据本研究的具体需求，我计划向自然科学基金申请XXX元的经费支持。
最后，我再次衷心感谢评审专家对我的关注和支持。
我相信只有通过您的认可和资助，我才能顺利进行这个课题的研究。
如果有任何问题或建议，欢迎随时与我联系。
谢谢！
此致
敬礼
XXX。
自然基金申请书模板(3篇)
第1篇一、基本信息项目名称：（此处填写项目名称，应简洁、准确反映项目内容）申请人基本信息：1. 姓名：2. 性别：3. 出生年月：4. 职称：5. 职务：6. 学位：7. 依托单位：8. 通讯地址：9. 邮编：10. 电话：11. 电子邮箱：项目基本信息：1. 项目类别：2. 项目来源：3. 项目起止时间：4. 项目经费总额：5. 项目资助方式：6. 项目资助机构：二、立项依据与意义1. 立项依据：（此处阐述项目立项的依据，包括但不限于以下内容：）- 国内外研究现状分析- 项目研究领域的创新性、前沿性- 项目研究内容的重要性和必要性- 项目研究目标的明确性和可实现性2. 研究意义：（此处阐述项目的研究意义，包括但不限于以下内容：）- 学术价值：对学科发展、理论创新等方面的贡献- 实践价值：对国民经济、社会发展和科技进步等方面的贡献- 应用前景：项目成果的可转化性和推广价值三、研究内容与目标1. 研究内容：（此处详细阐述项目的研究内容，包括但不限于以下方面：）- 研究背景和问题提出- 研究方法和技术路线- 研究步骤和实施方案- 研究成果和创新点2. 研究目标：（此处明确项目的研究目标，包括但不限于以下内容：）- 短期目标：项目实施期间要达到的具体目标- 中期目标：项目实施一段时间后要达到的目标- 长期目标：项目完成后要达到的目标四、研究方法与技术路线1. 研究方法：（此处介绍项目所采用的研究方法，包括但不限于以下内容：）- 定性研究方法：文献综述、案例分析、专家访谈等- 定量研究方法：统计分析、模型构建、实验研究等- 跨学科研究方法：结合多个学科的理论和方法2. 技术路线：（此处描述项目的技术路线，包括但不限于以下内容：）- 研究阶段划分- 各阶段研究任务和实施步骤- 技术手段和工具五、研究方案与进度安排1. 研究方案：（此处详细阐述项目的研究方案，包括但不限于以下内容：）- 研究对象和样本选择- 数据收集和分析方法- 研究结果的处理和解释2. 进度安排：（此处制定项目的研究进度安排，包括但不限于以下内容：）- 各阶段研究任务的起止时间- 各阶段研究成果的预期- 风险评估和应对措施六、预期成果与效益1. 预期成果：（此处列出项目预期取得的成果，包括但不限于以下内容：）- 学术论文- 科研报告- 知识产权- 学术专著2. 效益分析：（此处分析项目预期产生的效益，包括但不限于以下内容：）- 学术效益：对学科发展和理论创新的贡献- 经济效益：对国民经济和社会发展的贡献- 社会效益：对人民群众生活质量的提升七、经费预算1. 经费预算表：（此处填写项目经费预算表，包括但不限于以下内容：）- 设备费- 材料费- 人工费- 差旅费- 会议费- 其他费用2. 经费预算说明：（此处对经费预算进行说明，包括但不限于以下内容：）- 经费预算的依据和合理性- 经费使用的规范性和透明度八、研究基础与条件1. 研究基础：（此处介绍项目团队的研究基础，包括但不限于以下内容：）- 项目组成员的学术背景和研究经验- 项目依托单位的科研实力和条件- 已有的研究成果和专利2. 研究条件：（此处介绍项目的研究条件，包括但不限于以下内容：）- 实验室、设备等硬件设施- 数据资源、文献资料等软件资源- 项目团队的合作与分工九、项目组织与管理1. 项目组织：（此处介绍项目组织架构，包括但不限于以下内容：）- 项目负责人- 项目组成员- 项目协调人2. 项目管理：（此处介绍项目管理制度，包括但不限于以下内容：）- 项目进度管理- 项目质量管理- 项目经费管理十、项目预期风险与应对措施1. 预期风险：（此处列出项目预期可能遇到的风险，包括但不限于以下内容：）- 研究方法和技术路线的风险- 数据收集和分析的风险- 项目进度和经费的风险2. 应对措施：（此处针对预期风险提出应对措施，包括但不限于以下内容：）- 技术改进和优化- 数据补充和修正- 项目调整和优化十一、总结（此处对项目进行总结，包括但不限于以下内容：）- 项目的研究意义和价值- 项目的研究内容和目标- 项目的研究方法和技术路线- 项目的预期成果和效益十二、附件（此处附上相关附件，如项目组成员简历、依托单位证明、相关研究成果等）请注意，以上模板仅供参考，具体内容需根据实际情况进行调整和完善。
自然科学基金申请书
自然科学基金申请书尊敬的自然科学基金委员会：我怀着对科学研究的热忱和执着，提交这份申请书，希望能获得贵委员会的支持，开展一项具有重要意义的自然科学研究项目。
一、项目名称本项目名称为“＿____对_____的影响及机制研究”。
二、研究背景在当今社会，＿____领域的发展备受关注。
随着科技的进步和社会的发展，＿____相关的问题日益凸显。
然而，目前对于_____对_____的影响及作用机制，尚存在许多未知之处。
因此，深入研究这一课题具有重要的理论和实践意义。
三、研究目的本研究旨在揭示_____对_____的具体影响，并深入探讨其背后的作用机制。
通过系统的实验和分析，为相关领域的理论发展提供新的见解，同时为解决实际问题提供科学依据和可行的方案。
四、研究内容1、详细分析_____在不同条件下对_____的直接影响。
2、探索_____与_____之间的相互作用关系。
3、研究_____在_____过程中的动态变化规律。
4、揭示_____影响_____的内在机制，包括分子水平、细胞水平等方面的作用途径。
五、研究方法1、采用先进的实验技术，如_____技术、＿____技术等，对研究对象进行精确的测量和分析。
2、建立数学模型，对实验数据进行模拟和预测，以深入理解研究对象的内在规律。
3、结合实地观察和样本采集，获取真实可靠的数据。
六、研究计划本项目计划在_____年内完成，具体分为以下几个阶段：第一年：完成实验设备的搭建和调试，开展初步实验，收集基础数据。
第二年：深入进行各项实验研究，对数据进行初步分析和整理。
第三年：对实验结果进行综合分析，撰写研究论文，总结研究成果。
七、预期成果1、发表高水平的学术论文若干篇，在国内外相关领域产生一定的影响力。
2、形成一套完整的研究报告，为后续研究和实际应用提供参考。
3、培养一批具有创新思维和实践能力的科研人才。
八、研究团队本研究团队由具有丰富科研经验的专家学者组成，包括：1、项目负责人_____，在_____领域具有深厚的学术造诣和丰富的研究经验。
自然科学基金 申报书
自然科学基金申报书尊敬的自然科学基金评审专家：我是XXXX（申请人姓名），现就我所申请的自然科学基金项目向您呈上我的申报书。
我在此感谢您抽出宝贵时间评审我的申请，我将努力做到最好。
项目简介：本项目旨在研究XXXXX（具体研究主题）。
通过XXXXX（研究方法和实验设计），我们将探索XXXXX（预期结果）。
该研究对解决XXXXX（相关领域或问题）具有重要意义，并有望为XXXXX（学科领域）的发展和相关应用提供新的理论和实证依据，具有较高的原创性和创新性。
研究背景和意义：在我们深入了解现有研究的基础上，我们发现XXX（现状或问题）。
然而，目前对于XXX（研究对象）的研究仍存在较多争议和不明确之处。
因此，我们希望通过本项目的研究，揭示并解决这些问题，为学术界和实践应用提供新的视角和解决方案。
研究目标和内容：本项目的主要目标是XXXX（主要目标）。
为实现这个目标，我们将围绕以下几个方面开展研究：XXX（具体研究内容和方法）。
通过这些研究内容，我们希望达到以下几个方面的目标：（列出具体的研究目标）。
研究计划与预期成果：本项目将分为XXXXX个阶段进行研究，每个阶段都有具体的计划和时间表。
我们将采取综合的研究方法，包括文献综述、实验设计、数据收集与分析等手段。
预期的研究成果包括但不限于XXX（列出具体的预期成果）。
研究团队和条件：我作为项目的负责人，具备较丰富的研究经验和实践能力，并希望能够得到您的认可和支持。
此外，我们的团队成员也都具备相应的研究背景和技能，能够保证项目的顺利进行。
我们有充足的研究条件和实验设备，能够满足项目的研究需求。
经费预算：本项目的经费预算主要用于XXXX（列出具体的经费用途）。
我们已经做了充分的预算规划，确保经费使用合理、高效，并且符合基金的要求，同时充分利用已有资源，提高经费利用效率。
在此，我再次衷心感谢您的评审和支持。
我期待着与您的交流和讨论，如有任何疑问或需要更多信息，请随时与我联系。
自然基金申报材料范文
自然基金申报材料范文Applying for a grant from a nature fund is an important and exciting opportunity for our organization. 申请自然基金的资助对我们的组织来说是一个重要且令人兴奋的机会。
First and foremost, our organization is committed to protecting the environment and preserving natural habitats for future generations.首先，我们的组织致力于保护环境，为子孙后代保留自然栖息地。
By receiving funding from the nature fund, we will be able to implement critical conservation projects that will have a lasting impact on the local ecosystem. 通过从自然基金获得资助，我们将能够实施关键的保护项目，对当地生态系统产生持久的影响。
These projects may include reforestation efforts, wildlife conservation initiatives, and sustainable land management practices. 这些项目可能包括植树造林工程、野生动物保护计划和可持续土地管理实践。
Furthermore, the grant will enable us to collaborate with other organizations and experts in the field, fostering a sense ofcommunity and shared purpose in our conservation efforts. 此外，这笔资助将使我们能够与其他组织和专家合作，在我们的保护工作中培养社区意识和共同目标。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
“寒淫”轻重强度致病及转归的转录组与代谢组整合研究白斑病毒感染凡纳滨对虾的高通量转录组测序及分析珍稀濒危药用植物台湾金线莲菌根差异表达的转录组研究白桦雄花早期发育转录组分析及重要基因功能鉴定柑橘不同抗性品种被黄龙病菌侵染后体内转录组变化的比较分析鸡生长轴全转录组SNP关联分析及调控生长的作用机制研究基于转录组测序筛选马铃薯块茎休眠与发芽相关基因及功能鉴定基于转录组数据的芒属植物分子标记挖掘及分子图谱构建基于转录组学的茶树冷驯化诱导抗寒性的分子机制研究利用转录组测序挖掘甘蓝菌核病抗病相关基因苜蓿共生结瘤体系响应重金属铜胁迫的转录组研究坛紫菜应答高温胁迫分子机制的转录组学分析及相关候选基因克隆摘要的编号:30873212项目名称:“寒淫”轻重强度致病及转归的转录组与代谢组整合研究项目类型:面上项目在前期转录组研究搭建的技术平台上，寒证-基因组研究结果发现三羧酸循环（TCA Cycle）通路及相关基因显著表达，这与本课题合作单位之一（上海交大）得到的冷应激的代谢谱特征（TCA Circle通路异常）一致。
提示若两个"组学"整合，可优势互补，在寒邪的研究上出现新突破。
本计划设计冷暴露模拟"寒淫"强度，将大鼠分为6组，其中4个冷冻组分别置于2℃、-10℃、-20℃、-25℃冷库中，每天6-8小时；中药组-25℃冷库加每日麻黄附子细辛汤灌胃，各组均连续4-6周。
研究从宏观至微观分三个层次：①行为、耳络、舌象等寒热纲领性量表评价；②寒淫作用随时间、强度动态的转录谱及代谢谱的信息特征；③温热药的转录谱、代谢谱网络修复作用。
本研究以基因芯片和代谢组学互补技术，整合二者信息，重点定位于TCA代谢通路和与之相匹配基因(SDHC、DLD、IDH3B等)为组学交叉点，深化寒淫致病病因病机的科学内涵。
白斑病毒感染凡纳滨对虾的高通量转录组测序及分析申请书摘要转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，Roche 454高通量测序技术一次运行可以获得上百万个读长片段，平均读长400bp以上，为转录组的测定与定量提供了快速简便的新方法。
抗病毒研究的策略之一是抑制宿主细胞中与病毒入侵或复制密切相关的蛋白功能，或者提高宿主细胞中抗病毒相关的免疫蛋白的表达。
本项目拟利用Roche 454高通量测序技术，对白斑病毒感染及对照的凡纳滨对虾样品进行转录组测序，研究病毒感染及对照的凡纳滨对虾的mRNA表达谱差异，寻找病毒感染对虾差异表达基因，为筛选对虾抗病毒药物的分子靶标或研制对虾免疫增强药物提供依据，并可望发现一批凡纳滨对虾新基因，这对于我国积极参与国际上对虾基因知识产权的争夺有积极作用，转录组测序数据可供国内相关单位共享，对于加快我国的凡纳滨对虾病害防治和分子遗传育种研究进展有重要意义。
申请书主题词凡纳滨对虾；转录组；高通量测序；白斑病毒珍稀濒危药用植物台湾金线莲菌根差异表达的转录组研究申请书摘要兰科菌根属于一种典型的共生体系，对兰科植物的生长繁育和系统进化是必须的。
兰科菌根共生分子机制目前仍不清楚，制约了兰科植物资源的合理开发、利用与保护。
课题组前期围绕珍稀濒危兰科药用植物台湾金线莲（Anoectochilus formosanus）与瘤菌根菌属真菌AR-18形成的菌根共生体，从细胞学、组织学、生长代谢及生理生化等方面开展了大量研究工作。
在此基础上，本项目拟以该菌根共生体为材料，通过数字表达谱分析，以454 GS FLX测序获得的未接种根全转录组数据为参比，明确菌根共生差异基因表达特征和网络；采用定量PCR和RNA原位杂交分析目标基因在菌根形成过程中的时空表达特征和作用位点，为揭示兰科菌根共生分子机制奠定基础，进而为兰科药用植物资源可持续发展提供理论指导。
白桦雄花早期发育转录组分析及重要基因功能鉴定负责人：刘雪梅参与人：刘雪梅, 宋福南, 戴超, 邢磊, 刘瀛, 张妍, 孙丰宾, 官民晓金额：23万申请时间：2011 学科代码：树木生长发育(C160501) 项目批准号：31100449 申请单位：东北林业大学研究类型：基础研究摘要白桦（Betula platyphylla Suk.）与模式树种杨树（雌雄异株）不同，为雌雄同株，是研究单性花发育机制的理想材料。
其雌雄花特异着生于枝条的不同部位，雌雄花均为轮次不全的不完全花，同年生的雌雄花存在严重的花期不遇现象，且雄花发育中途暂停，进行越冬休眠。
本项目以白桦早期发育阶段的正常雄花和雄花突变体为试材，利用RNA sequencing技术分析白桦雄花早期发育的转录组及差异表达基因，并通过拟南芥突变体和转基因拟南芥方法对重要的基因进行功能分析。
本项目将初步阐明白桦雄花早期发育中的基因调控网络及代谢途径，这将从分子水平上了解白桦雄花早期发育机制，对植物单性雄花发育的分子机理和生物化学研究有着非常重要的科学意义。
柑橘不同抗性品种被黄龙病菌侵染后体内转录组变化的比较分析负责人：蒋军喜参与人：蒋军喜, 刘冰, 谢科峰, 刘乔丽, 周泽科, 龙珑金额：56万申请时间：2011 学科代码：植物细菌病害(C140103) 项目批准号：31160358 申请单位：江西农业大学研究类型：基础研究关键词：柑橘黄龙病；亚洲韧皮部杆菌；基因芯片；转录组；抗病性差异柑橘黄龙病是世界柑橘生产上最具毁灭性的病害，也是我国包括江西柑橘产区在内的最重要的病害之一。
近年来,国内外对柑橘黄龙病进行了大量的病原检测鉴定和遗传变异性研究，但涉及黄龙病发生机理的研究很少。
在项目前期开展柑橘不同品种田间调查和室内抗性鉴定而获得高抗、中抗和高感品种的基础上，本申请拟采用目前基因表达研究中广泛使用和具有独特优势的高通量基因芯片表达技术，开展不同抗性柑橘品种被黄龙病菌侵染后体内转录组变化的比较分析，通过比较分析，将发现与特定抗感反应相连的、其转录水平发生显著变化的基因，这些基因将被定义为决定各自抗感表型的抗病或感病基因。
本项目的完成将从转录水平上为不同抗性柑橘品种对黄龙病的抗性差异提出一个合理的解释，同时，对阐明柑橘抗黄龙病的分子机制，指导柑橘黄龙病抗性的合理利用和品种抗性的遗传改良具有重要的理论意义和实践价值。
鸡生长轴全转录组SNP关联分析及调控生长的作用机制研究负责人：聂庆华参与人：聂庆华, 张细权, 梁少东, 许继国, 张成广, 胡永胜, 张伟, 何小梅金额：60万申请时间：2011 学科代码：家禽遗传育种学(C170103) 项目批准号：31172200 申请单位：华南农业大学研究类型：基础研究摘要：众所周知，神经内分泌生长轴在调控家鸡生长过程中发挥着重要作用。
本项目在前期工作基础上，对生长轴重要组织开展RNA测序和全转录组SNP关联研究：首先选取生长性能差异明显的隐性白洛克肉鸡和清远麻鸡分别构建两尾样本的RNA池，对下丘脑、垂体、肝脏和肌肉等生长轴重要组织开展RNA测序研究（miRNA测序和转录组测序），结合RNA 测序常规分析重点筛查表达差异的miRNA、基因和转录组SNP，并通过定制SNP芯片对具备详细生长记录的参考家系群体和商业群体开展全转录组SNP关联研究，最后利用RNAi、荧光报告载体等对以上结果开展功能验证试验。
本项目旨在鉴定显著影响家鸡生长的miRNA、新基因（转录本）及转录组SNP，阐明它们之间的互作网络关系及调控生长的作用机制，以最终揭示家鸡生长性状的遗传基础和分子调控作用通路，本项目对家鸡生长性能的遗传改良乃至肉鸡产业优质高效可持续发展有积极意义。
基于转录组测序筛选马铃薯块茎休眠与发芽相关基因及功能鉴定负责人：司怀军参与人：司怀军, 张宁, 姜寒玉, 文义凯, 马骢毓, 尤佳, 刘金芝, 瞿韵金额：56万申请时间：2011 学科代码：薯类作物种质资源与遗传育种(C130407) 项目批准号：31160298申请单位：甘肃农业大学研究类型：应用基础研究关键词：马铃薯；块茎；休眠；发芽；转录组马铃薯块茎的休眠和发芽对于马铃薯栽培、贮藏保鲜和加工工业等具有十分重要的意义。
本研究将以马铃薯栽培品种的块茎为研究对象，采用高通量的转录组测序方法（RNA sequencing）进行马铃薯块茎休眠与发芽过程的转录组测序和对比分析，建立基因表达的转录谱。
经生物信息学和GenBank数据库检索分析获得差异片段ESTs可能的基因结构和功能，筛选出块茎休眠和发芽相关基因。
利用DNA末端快速扩增技术（RACE）克隆候选基因的全长cDNA，然后通过基因表达谱分析、转基因超量表达和抑制表达（RNAi）进行候选基因的功能验证，最终获得马铃薯块茎休眠和发芽相关基因，从而明确马铃薯块茎休眠和发芽的分子机理，为马铃薯块茎休眠和发芽的分子调控以及功能基因组学的研究提供理论基础。
基于转录组数据的芒属植物分子标记挖掘及分子图谱构建负责人：刁英参与人：刁英, 罗涛, 郑兴飞, 赵玲玲, 胡小虎, 胡珲金额：10万申请时间：2011 学科代码：草种质资源与育种(C170202) 项目批准号：31101758 申请单位：武汉大学研究类型：应用基础研究芒属植物俗称芒草，为禾本科的C4类多年生高大草本，主要分布东亚、东南亚和太平洋群岛等地区。
芒属植物具有生物质产量高、地下根状茎发达、抗逆性强、适应性广等特点，可用于造纸、饲料、水土保持和生态修复等。
近年来，芒属植物更作为一种具有重要开发利用前景的能源作物而倍受关注，可用于火力发电或生产燃料乙醇。
因此，开展芒草的分子育种工作具有重要的理论和应用意义。
在本实验室的前期研究中，通过高通量的RNA-Seq测序技术已经获得了芒属5种植物共计10Gb的转录组数据，在此基础上本项目提出：采用生物信息学方法从这些数据中挖掘批量的SSR和SNP标记，构建我国特有芒属植物南荻分子图谱，进而将其与近缘种属进行比较分析。
从而厘清芒属植物种间及其与禾本科其它植物间的亲缘关系，揭示芒属植物基因组的基本结构和组成规律，为后续的基因定位、基因克隆和分子标记辅助育种奠定基础。
基于转录组学的茶树冷驯化诱导抗寒性的分子机制研究负责人：王新超参与人：王新超, 杨亚军, 马春雷, 刘守安, 周天山, 马建强, 曹红利金额：61万申请时间：2011 学科代码：茶学(C161104) 项目批准号：31170650申请单位：中国农业科学院茶叶研究所研究类型：应用基础研究关键词：茶树；冷驯化；抗寒；转录组学；RNA-seq摘要低温是影响茶树正常生长的重要限制性环境因素之一。
在课题组前期研究工作的基础上，本项目引入转录组学的研究策略，从研究不同冷驯化阶段茶树基因表达的差异入手，提取不同驯化阶段（未驯化、通过驯化和脱驯化）样品的总RNA，进行RNA-seq测序和深度的生物信息学分析，系统研究冷驯化不同阶段茶树的转录组变化，通过比较不同样品的转录组数据，找出与茶树冷驯化（抗寒）有关的基因，构建相关基因的调控网络，分析冷驯化过程中相关基因在茶树诱导抗寒性形成中的作用，揭示茶树抗寒的分子机理，将茶树抗寒性机制的研究深入到分子水平。