异源蛋白诱导方法

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蛋白质的体外定向进化

蛋白质的体外定向进化

蛋白质的体外定向进化概述蛋白质是生物体中起着重要作用的大分子有机化合物,具有广泛的生物功能。

研究人员通过对蛋白质结构与功能的深入探索,不仅能够揭示生命的奥秘,还能够为药物设计和工业生产等领域提供重要的指导。

然而,天然界中存在的蛋白质种类有限,无法满足人们日益增长的需求。

因此,开发新型蛋白质成为现代生物科学的热点之一。

蛋白质的设计与进化是一项关键性的工作。

体外定向进化是一种重要的蛋白质工程技术,通过在体外模拟自然界的进化过程,使蛋白质的性质得以改良和优化,以满足特定的应用需求。

蛋白质的体外定向进化流程蛋白质的体外定向进化通常包括以下步骤:1.库构建:首先,需要构建一个包含大量变异蛋白质的基因库。

这可以通过人工合成DNA序列、使用随机突变或利用现有的蛋白质序列进行改造等方式实现。

2.库筛选:将基因库中的变异蛋白质表达出来,并通过适当的筛选方法对其进行选择。

常见的筛选方法包括亲和层析、抗体标记、酶活性测定等。

3.评估鉴定:对筛选出的蛋白质进行鉴定,包括测定其结构、功能和稳定性等性质,并与天然蛋白质进行比较分析。

需要特别注意的是,鉴定过程中需要采用一系列的生物化学和生物物理方法,如质谱、光谱和动力学分析等。

4.优化进化:基于初步筛选和评估鉴定的结果,对筛选出的蛋白质进行进一步的优化和进化。

这可以通过遗传算法、DNA重组技术、蛋白质工程等手段实现。

5.验证应用:最后,对优化后的蛋白质进行进一步的验证和应用,包括在生物医学研究、产业生产以及药物设计等领域的应用。

蛋白质的体外定向进化方法和技术蛋白质的体外定向进化涉及到多种方法和技术,以下是其中的一些常用手段:1.串联重组:将不同的蛋白质片段通过连接肽链的方式进行重组,生成具有新功能的蛋白质。

2.随机突变:利用化学方法或遗传方法对蛋白质的氨基酸序列进行随机改造,产生大量的变异蛋白质。

3.异源进化:将蛋白质序列从一个物种转移到另一个物种,通过适应新的环境条件,使其获得新的功能。

丝状真菌高效表达异源蛋白的研究进展

丝状真菌高效表达异源蛋白的研究进展

丝状真菌高效表达异源蛋白的研究进展
刘瑞
【期刊名称】《生物技术世界》
【年(卷),期】2015(000)006
【摘要】丝状真菌是一种具有高效分泌蛋白质潜力的真核表达系统,在工业生产中常被用于生产多种生物酶和有机酸.本文综述了当前国内外对于丝状真菌作为细胞工厂生产异源蛋白的最新探索与进展, 其中包括功能基因组学在蛋白表达与分泌研究中的应用, 同时探讨了异源蛋白表达和生产的改进策略.
【总页数】1页(P26-26)
【作者】刘瑞
【作者单位】东北农业大学生命科学学院生物工程专业,黑龙江哈尔滨150030【正文语种】中文
【中图分类】Q949.32
【相关文献】
1.异源蛋白在丝状真菌中高效表达策略研究进展
2.低温菌启动子分析及异源蛋白高效表达
3.丝状真菌高效表达异源蛋白研究进展
4.丝状真菌异源蛋白表达系统研究进展
5.异源基因在丝状真菌系统中的克隆表达
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蛋白质表达和重组技术的研究进展

蛋白质表达和重组技术的研究进展

蛋白质表达和重组技术的研究进展近年来,随着生物技术的快速发展,蛋白质表达和重组技术在生命科学领域逐渐成为研究的热点。

蛋白质是生命体系中至关重要的分子,具有多种生物学功能。

研究蛋白质的表达和重组技术,对于深入了解蛋白质的结构和功能,以及开发新的药物和治疗方案具有重要意义。

本文将探讨蛋白质表达和重组技术的研究进展。

一、蛋白质表达技术1.1 原核表达系统原核表达系统是最简单直接的表达蛋白质的方式,其依赖于大肠杆菌等细菌对异源蛋白质的转录和翻译。

然而,原核表达系统存在缺点,如对毒性蛋白质的表达效率低、容易出现蛋白质降解和无法产生复杂的多肽等。

这些限制问题在一定程度上阻碍了蛋白质表达的广泛应用。

1.2 真核表达系统真核表达系统来源于真核生物细胞对RNA翻译的机制,包括CHO、293、HeLa等细胞。

真核表达系统不仅能够处理复杂的蛋白质结构,还可以避免对细菌产生的内毒素的依赖,提高表达效率。

但是,真核表达系统明显比原核表达系统更昂贵,并需要更多的时间和精力。

1.3 内含子释放策略内含子释放策略是实现高效蛋白质表达的新方法之一,它允许对特定蛋白质编码基因中的内含子进行剪切,以提高转录效率。

这种方法在真核表达系统中使用,可以在多种细胞系中表达高效的蛋白质。

二、蛋白质重组技术2.1 大肠杆菌表达系统大肠杆菌表达系统是最广泛使用的重组蛋白质表达系统之一。

该系统具有简单高效、价格低廉、容易操作和产量高等优点。

大肠杆菌表达系统借助贝塞尔表达和双重放大策略,可实现大量的蛋白质表达。

此外,大肠杆菌表达系统还可以通过调整分子量,实现对蛋白质结构和活性的改变,使得其在生物学和医学实验中被广泛应用。

2.2 昆虫细胞表达系统昆虫细胞表达系统即利用昆虫细胞(浮游细胞或培养细胞)作为重组蛋白质的宿主。

昆虫细胞表达系统具有产量高、保真度高等优点,而且方法简单,易于进行大规模生产。

不过,昆虫细胞表达系统的缺点是成本较高,而且目前开发出的细胞系较为有限。

梯度透析法及稀释法蛋白的复性

梯度透析法及稀释法蛋白的复性

蛋白的复性重组基因在表达宿主中表达量过高或合成速度过快,以至于没有足够的时间进行折叠,二硫键不能正确配对,导致蛋白以包涵体的形式存在。

导致包涵体形成的主要原因有以下几点:⑴重组蛋白的氨基酸组成,一般说来含硫氨基酸越多越容易形成包涵体。

⑵重组蛋白所处的环境:诱导温度高或胞内pH接近蛋白的等电点时容易形成包涵体。

⑶重组蛋白是大肠杆菌(Escherichia coli)的异源蛋白,由于缺少真核生物中翻译后修饰所需酶类,致使中间体大量积累,容易形成包涵体沉淀。

⑷有报道认为,丰富的培养基有利于活性蛋白质的表达,当培养条件不佳时,容易形成包涵体。

包涵体内的蛋白是非折叠状态的聚集体,不具有生物学活性,因此要获得具有生物学活性的蛋白质必须将包涵体溶解,释放出其中的蛋白质,并进行蛋白质的复性。

包涵体复性在世界范围内都是个难题,最好的复性方法也不会超过20%。

目前大家在这方面研究也比较多,有研究证明一些分子伴侣有助于蛋白的复性;同时稀释、透析、渗透是最经典的蛋白复性的方法;另外氨基酸如精氨酸、糖类、醇类、表面活性剂对蛋白的复性都有辅助作用,还有很多的表达系统可以助复性。

本公司主要通过梯度透析和稀释的方法对变性蛋白进行复性。

梯度透析法梯度透析缓冲液配方:PBS(1L):8.0NaCl、28.65gNa2HPO4·12H2O、0.234gNaH2PO4·2H2O缓冲液A:50mM Tris-HCl (pH8.5)、1mM EDTA、100mM NaCl、1%Triton-X-100 缓冲液B:50mM Tris-HCl (pH8.5)、1mM EDTA、100mM NaCl、1%Triton X-100、2M脲素缓冲液C:50mM Tris-HCl (pH8.5)、1mM EDTA、100mM NaCl、1%Triton-X-100、2M盐酸胍溶解缓冲液D:50mM Tris-HCl (pH8.5)、1mM EDTA、100mM NaCl、10mM β-巯基/乙醇/DTT、2mM脱氧胆酸钠、8M脲素复性缓冲液Ⅰ:50mM Tris-HCl (pH8.5)、100mM NaCl、6M/4M/2M脲素、1%甘氨酸、5%甘油、0.2%PEG、1mM氧化型谷胱甘肽、1mM还原型谷胱甘肽包涵体纯化及复性操作步骤:若蛋白以包涵体的形式纯在,则需要从包涵体中纯化出目的蛋白:1、大量诱导表达菌液,5000g离心10min,弃上清,用缓冲液A重悬,超声波破碎,功率45%,工作2s,暂停2s,破碎10min,,10,000g离心10min。

费尔干猪毛菜病程相关蛋白SfPR1a基因的异源表达增强了烟草对干旱、盐及叶斑病的抗性

费尔干猪毛菜病程相关蛋白SfPR1a基因的异源表达增强了烟草对干旱、盐及叶斑病的抗性

作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2020, 46(4): 503 512 / ISSN 0496-3490; CN 11-1809/S; CODEN TSHPA9E-mail: zwxb301@DOI: 10.3724/SP.J.1006.2020.94082费尔干猪毛菜病程相关蛋白SfPR1a基因的异源表达增强了烟草对干旱、盐及叶斑病的抗性衡友强游西龙王艳*新疆大学生命科学与技术学院 / 新疆生物资源与基因工程重点实验室, 新疆乌鲁木齐 830046摘要: 为明确一年生草本盐生植物费尔干猪毛菜(Salsola ferganica Drob.)病程相关蛋白基因SfPR1a (GenBank登录号为JQ670917)是否参与了植物对逆境胁迫的响应, 采用qRT-PCR检测了该基因在不同组织部位和脱落酸(ABA)、茉莉酸(JAs)、乙烯合成直接前体(ACC)等相关激素胁迫及NaCl处理下的表达规律, 同时对转基因烟草在盐、旱及丁香假单胞菌等胁迫下的抗性进行了鉴定。

结果显示, SfPR1a基因在费尔干猪毛菜根中的表达量显著高于茎叶中, 且受到ABA、JAs、ACC、NaCl的积极诱导; 干旱胁迫下, 转基因烟草的丙二醛(MDA)含量显著低于野生型烟草, 显示出较强的抗旱表型; 盐胁迫下, 异源表达SfPR1a的转基因烟草幼苗生长显著优于野生型烟草; 丁香假单胞菌攻毒后的转基因烟草叶片呈现严重的坏死反应, 但植株的整体抗性表型显著优于野生型烟草; 亚细胞定位结果显示该蛋白定位于植物细胞质外体空间。

以上结果表明, 费尔干猪毛菜病程相关蛋白SfPR1a基因参与了植物对非生物及生物胁迫的抗性。

关键词:病程相关蛋白基因SfPR1a; 表达规律; 转基因烟草; 抗性功能; 亚细胞定位Pathogenesis-related protein gene SfPR1a from Salsola ferganica enhances theresistances to drought, salt and leaf spot disease in transgenic tobaccoHENG You-Qiang, YOU Xi-Long, and WANG Yan*Xinjiang Key Laboratory of Biological resources and Genetic Engineering / College of Life Science and Technology, Xinjiang University, Urumqi830046, Xinjiang, ChinaAbstract: In order to investigate whether SfPR1a, a pathogenesis-related protein gene from an annual halophytic species Salsolaferganica Drob., was involved in the response to plant defense, qRT-PCR was employed to detect its expression patterns underabscisic acid (ABA), jasmonic acid (JAs), ethylene synthesis direct precursor (ACC), and NaCl treatments. We also identifiedresistances to salt, drought and Pseudomonas syringae tomato (Ps tDC3000) of transgenic tobacco were identified. The expressionof SfPR1a gene in roots was significantly higher than that in shoots, and positively induced by ABA, JAs, ACC, and NaCl treat-ments. The malondialdehyde (MDA) content of transgenic tobacco was significantly lower than that of wild-type tobacco, show-ing a strong resistance to drought. The ectopic expression of SfPR1a gene improved plant growth under salt stress. After infectionof P. syringae, transgenic tobacco leaves showed serious necrosis reaction, but the overall resistance phenotype of the plants wassignificantly better than that of WT. Subcellular localization analysis showed SfPR1a was localized in the plant cell apoplasticspace. The above results indicated that the SfPR1a gene is involved in plant resistance to abiotic and biotic stresses.Keywords: pathogenesis-related protein gene SfPR1a; expression pattern; transgenic tobacco; resistance function; subcel-lular localization盐、碱、干旱和病原微生物等外界胁迫已经成为影响农作物产量的关键因素。

关于异源二聚体

关于异源二聚体

二聚体是蛋白质-蛋白质相互作用的一种形式,它可以定义为两个有关的亚单元组成一个蛋白质-蛋白质复合物.如果组成二聚体的两个有关的亚单元是相同的则为同源二聚体,反之为异源二聚体.二聚作用是调节信号转导的一种常见形式.发生二聚作用的蛋白质彼此接近,使得它们可以相互作.二聚作用还有另外一个重要意义,即它不仅仅是简单地将相互作用的分子拉近,而且它还能使底物与酶的活性位点以更适合催化作用的方位相互楔合,这就大大增加了反应速度.配体诱导受体二聚作用的机制有多种,有的配体本身就是二聚体,它们含有两个结合受体的表面.比如,PDGF是以二硫键连接的二聚体,有三种不同的异构体:A链同源二聚体,B链同源二聚体和AB异源二聚体.A链以高亲和力与PDGF受体a 亚基结合;B链以相同的亲和力与 a 和b 亚基结合.因此,AA产生a -a 受体同源二聚体,AB产生a -a受体同源二聚体和a -b异源二聚体,BB则产生所有可能的组合.这里所说的是亚单元,即组成某一整体的其中一个部分,该部分单独存在时可能是一个具有独立功能的单位,而不是亚基.当然由一个亚基组成的蛋白质就等同于这里所说的是亚单元.二聚作用是蛋白质-蛋白质相互作用的一种形式.在调节信号转导方面,二聚作用一般具有一下作用或功能: 1 接近和定向:发生二聚作用的蛋白质彼此接近,使得它们可以相互作用.最普通的例子就是下面将论述的细胞表面受体的二聚作用,它激活了细胞内信号转导通路.不仅如此,受体二聚作用还能够将与受体结合的蛋白质拉近.比如,有一些激酶与细胞因子受体的胞内域非共价地结合,受体二聚就激活了它们的磷酸化作用.胰岛素就是一二聚体,以用胰岛素受体信号的激活为例,在与配体结合前,胰岛素受体的两条链都有不同的,很高的局部浓度;但是,它们都只有低效的体积摩尔浓度,因此不足以发信号.因此,在结合配体并发信号时,它们之间需要重新定位,这可以通过两条链在细胞膜上以二硫键连接,形成二聚体来实现.所以,二聚作用既改变了胰岛素受体的局部浓度,又改变了它们之间的方位.2异源二聚的差示调节作用:二聚蛋白质通常隶属于其成员能够交互二聚的蛋白质家族.如果一个蛋白质有许多个二聚搭档,则所形成的各种二聚体将会有完全不同的功能.此时,在细胞内这些蛋白质的相对浓度,和它们之间相互作用的相对强度将决定谁是最主要的二聚体品种,当然,这也决定了它们产生的生物学的结果将会如何.这就是二聚作用的差示调节.3增强专一性相对于单体而言,二聚作用的结果一般会形成更大的蛋白质相互作用表面。

蛋白相互作用

蛋白相互作用

一、技术简介BiFC是由Hu 等在2002 年最先报道的一种直观、快速地判断目标蛋白在活细胞中的定位和相互作用的新技术[1]. 有报道在GFP 的两个β片层之间的环结构(loop)上有许多特异位点可以插入外源蛋白而不影响GFP的荧光活性,BiFC技术正是利用该荧光蛋白家族的这一特性,将荧光蛋白分割成两个不具有荧光活性的分子片段,再分别与目标蛋白连接。

如果两个目标蛋白因为有相互作用而接近,就使得荧光蛋白的两个分子片段在空间上相互靠近,重新形成活性的荧光基因而发出荧光。

在荧光显微镜下,就能直接观察到两目标蛋白是否具有相互作用,并且在最接近活细胞生理状态的条件下观察到其相互作用发生的时间、位置、强弱、所形成蛋白复合物的稳定性,以及细胞信号分子对其相互作用的影响等,这些信息对研究蛋白质相互作用有重要意义。

其后发展出的多色荧光互补技(multicolor BiFC),不仅能同时检测到多种蛋白质复合体的形成,还能够对不同蛋白质间产生相互作用的强弱进行比较.这项技术不需要特殊的设备,相互作用的蛋白也不需要特别的理论配比。

因此,BiFC 技术已被国际上众多实验室采用,在活细胞内证明蛋白质的相互作用。

BiFC技术以下几个特点使其对于研究蛋白质相互作用具有独特的优势:1、能在显微镜下直接观察到蛋白相互作用而且不依赖于其它次级效应;2、该相互作用可以在活细胞中进行观察,排除了由于细胞裂解或固定可能带来的假阳性结果;3、蛋白质在近似生理条件的环境下表达,表达水平及特性如翻译后修饰极大地接近于内源蛋白;4、不需要蛋白质有特别的理论配比,能检测到不同亚群蛋白质间的相互作用;5、多色BiFC技术不仅能同时检测到多种蛋白质复合体的形成,还能够对不同蛋白质间产生相互作用的强弱进行比较;6、BiFC技术除了荧光倒置显微镜外,不要求特殊的设备。

实验简单、快捷、直观,并适用于原核、真菌、植物、动物等多种组织、细胞. 该技术的完善与发展必然会为蛋白质组学、蛋白质相互作用连锁图的建立带来福音. 但是,该技术与大多检测蛋白质相互作用的技术一样,也存在着假阴性和假阳性的问题,需要在实验中仔细验证。

8基因表达,大肠杆菌基因工程

8基因表达,大肠杆菌基因工程

核糖体结合位点
核糖体结合位点的结构
大肠杆菌核糖体结合位点包括下列四个特征结构要素:
位于翻译起始密码子上游的6-8个核苷酸序列5’ UAAGGAGG 3’
,即Shine-Dalgarno(SD)序列,它通过识别大肠杆菌核糖体小 亚基中的16S rRNA 3’端区域3’ AUUCCUCC 5’并与之专一性结合, 将mRNA定位于核糖体上,从而启动翻译; 翻译起始密码子:以AUG;GUG或UUG作为翻译起始密码子; SD序列与翻译起始密码子之间的距离及碱基组成; 基因编码区5’ 端若干密码子的碱基序列。
C末端的丙氨酸交换下来,所形成的人胰岛素叔丁酯再用三氯乙酸脱
去叔丁酯基团,最终获得人胰岛素。该过程的总转化率为60%,工 艺路线耗时,分离纯化操作复杂,产品的价格不菲。
人胰岛素的生产方法
利用基因工程菌发酵生产人胰岛素
1982年,美国Ely LiLi公司首先使用重组大肠杆菌生产人胰岛素, 成为世界上第一个上市的基因工程药物;1987年,Novo公司又推出
A链和B链分别表达法
基因工程菌的构建战略: 化学合成A链 和B链的编码
Apr
tac
Met b-Gal Met A peptide Apr
tac
Met b-Gal Met B peptide
序列
ori
ori
M
M
M
M
N
C
N
C
重组人胰岛素的大肠杆菌工程菌的构建
A链和B链分别表达法
表达产物的后处理路线:
b-Gal
外源基因在原核细胞中的表达
现将真核基因在原核细胞中表达: 1、外源基因克隆在表达载体并导人宿主菌。
2、外源基因不能有间隔序列(内含子),因而必须用cDNA或全
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异源蛋白诱导方法
异源蛋白诱导技术(Heterologous protein induction)是一种常用的生物工程技术,可以用于大量生产和纯化需要的蛋白质。

这种技术可以在细胞内产生被表达的异源蛋白质,这些蛋白质都可以通过特定的培养条件来诱导表达。

本文将介绍一些异源蛋白诱导方法。

1. 培养条件调节法
培养条件调节法是最常用的异源蛋白诱导方法之一。

通常,通过调整培养条件,如温度,pH、营养元素、气体浓度等,来诱导表达异源蛋白质。

这种方法适用于小规模生产。

2. 转录调节法
转录调节法是一种通过调节基因表达的方法,从而实现异源蛋白的诱导表达。

例如,利用诱导剂如IPTG引导外源基因在表达载体中发挥作用,从而实现异源蛋白的诱导表达。

3. 转化机制调节法
转化机制调节法是一种使用化合物调节细胞自身的代谢机制,并促进表达异源蛋白的方法。

例如,静态和销售搅拌的菌落液培养技术可以在发酵过程中提高细胞产量,并促进异源蛋白的表达。

4. 特定细胞系的选择
特定细胞系的选择是一个重要的异源蛋白表达方法。

同样的异源蛋白质在不同的宿主细胞中表达可以带来不同的结果。

选择最适合宿主细胞的细胞系能够提高表达效率。

5. 蛋白修饰及纯化
蛋白质修饰和纯化是特定的工艺flow,在异源蛋白表达中起着至关重要的作用,不同的蛋白质通常需要不同的纯化流程。

因此,在诱导表达的同时,也需要特别重视蛋白质的纯化。

总结
异源蛋白诱导技术是制造高质量蛋白质的重要步骤,同时还需要仔细控制温度、pH、营养元素、气体浓度等条件,采取合理的转录调节、转化机制调节、特定细胞系的选择和蛋白质修饰等方法。

这可以提高蛋白质的表达效率,并使纯化工艺得以成功。

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