环介导等温扩增技术快速检测犬细小病毒方法的建立

合集下载

环介导等温扩增技术在兽医中的应用

环介导等温扩增技术在兽医中的应用
于常 规 P C R, L AMP检 测不 需要 DN A的纯化 , 能大 大
提高 疾 病检 测 的效 率和 有效 地控 制疾病 的传 播 。
5 胚 胎 的性 别 鉴 定
基 于 Y染 色体 上 特 异序 列 的检 测 , Hi r a y a ma等
利用 L A MP检 测 牛胚 胎 的性 别 ,显微 切 割 胚胎 活 检
4 在寄 生虫检测 中的应 用
L i a n g 等同 建立 了溶组 织 内 阿米 巴 L A MP检 测法 ,
检 出 限达 到每 个 反 应 管 1 个 寄生 虫 ,与传 统 的 巢 式 P C R 比较 ,该 L A MP法灵 敏度 9 2 % ,特异 性 1 0 0 %。 P o o n等[ 8 1 建立 了恶性 疟 原虫 的 L A MP检测 方 法 , 相 比
[ 1 1 N o t o m i T , O k a y a ma H , M a s u b u c h i H, e t 1. a L o o p - me d i a t e d i s o t h e r m a l a n ' l — p l fe i a t i o n o f D N A[ J 】 . N u c l e i c a c i d s r e s e a r c h , 2 0 0 0 , 2 8 , 1 2 : E 6 3 .
2在 细菌检测 中的应用
冯瑜菲等嘲 建立 的产志贺毒素 Ⅱ型变异体 大肠 杆菌 ( S t x 2 e 大肠 杆菌 ) L A MP检测 方 法对 S t x 2 e大 肠杆菌 的最低检出量为 3 8 C F U / 管( C F U是菌落形成 单位 ) ,敏感 性 高 于 P C R方 法 ( 3 . 8 X 1 0 s C F U / 管) 。 L A M P和 P C R对 模 拟 样 品检 测 结 果 的符 合 率 为 1 0 0 %。可 以检测 出不 同来 源 的 S t x 2 e 大 肠杆 菌 , 而 对 不耐热肠毒素、 耐热性肠毒素 、 S t x 2 e 和大肠杆菌 的检 测 结 果 均为 阴性 。张 静 等【 3 ] 利用 L A MP法快 速 检测 致 病 性 哈维 氏弧 菌方 法 , 对 哈 维 氏弧 菌 D N A 的最 小 检 出 量为 1 飞克 , 比P C R法灵 敏 度高 3 个 数量 级 。 选 择 哈 维 氏弧菌 、 副溶 血 弧菌 、 费 氏 弧菌 、 创伤弧菌 、 溶 藻

环介导等温扩增技术(LAMP)检测棘球绦虫感染犬粪DNA的研究Ⅱ

环介导等温扩增技术(LAMP)检测棘球绦虫感染犬粪DNA的研究Ⅱ

环介导等温扩增技术(LAMP)检测棘球绦虫感染犬粪DNA的研究Ⅱ陈璐;吾拉木·马木提;张德亭;金一帮【期刊名称】《中国人兽共患病学报》【年(卷),期】2014(000)007【摘要】目的:为有效地控制预防流行区犬科动物的棘球绦虫感染情况,建立一种快速检测棘球绦虫感染犬的粪便DNA检测方法-环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification .LAMP)。

方法针对细粒棘球绦虫线粒体DNA ND2基因6个位点特异性的设计4条LAMP引物,利用LAMP法和普通PCR方法同时检测棘球绦虫、肥胖带绦虫以及犬肠道内的其它寄生虫DNA来验证LAMP方法的特异性;将转入ND2基因片段的质粒作为标准阳性对照,并做梯度稀释后同时用 LAMP和 PCR方法进行检测比较两者的敏感性。

此外,将采集的46份犬粪便标本提取DNA ,分别运用LAMP和犬尸体剖检进行感染犬的初步检测评估。

结果 E .g mtDNA ND2基因的LAMP引物能够鉴别多房棘球绦虫和细粒棘球绦虫这两个相近的种属,并不与其它待检寄生虫发生交叉反应,且最低检测限度为4×101拷贝(灵敏度比普通PCR高出103倍)。

在初步对46份犬粪便DNA检测结果中 ND2 LAMP引物显示出较好的灵敏度和特异度,χ2检验结果该方法与犬尸体剖检方法的诊断效果无统计学差异。

结论本研究初步建立了LAM P 技术检测细粒棘球绦虫感染犬的新方法,在各项特异度、灵敏度和样本检测中展现出较好的效果。

该方法不需要昂贵的仪器设备和繁琐的电泳分析过程,有望成为流行区和基层兽医站细粒棘球绦虫感染犬检测的新方法。

%To control and prevent the Echinococcus in the place ,we established a loop-mediated isothermalamplification (LAMP) assay for rapid detection of Echinococcus species specific DNA from dog faeces .Four primers which recognizing 6 dis-tinct regions on the NADH dehydrogenase subunit 2 (ND2) gene of Echinococcus granulosus were designed and used for LAMP assay .The specificity of LAMP assay was evaluated using DNA extracted from Echinococcus granulosus , Taenia saginata , and other dog intestinal parasites .In addition ,the sensitivity of LAMP assay was compared with that of conventional PCR using recombinant plasmid carrying Echinococcus granulosus ND2 gene fragment as standard template DNA after 10-fold serial dilution .Furthermore ,we extracted DNA from 46 canine fecal samples collected from endemic areas ,and tested the copro-DNA samples using LAMP and necropsy method .Results showed that E .g ND2 primer sets could differentiate Echinococcus granulosus from Echinococcus multilocularis without cross reaction among other parasites detected .Furthermore ,the LAMP assay with primer sets to the ND2 gene could detect 4 × 101 copies of target gene ,demonstrating 103 times higher sensitivity than that of conventional PCR methods .The LAMP assay with primer set to ND2 gene showed good sensitivity and specificity to detect copro-DNA samples extracted from fecal samples of 46 dogs tested in endemic areas .There was no statistically signifi-cant difference among LAMP and necropsy .In this study ,a sensitive ,specific and rapid copro-DNA detection LAMP assay was developed successfully for diagnosis of dogs infected with Echinococcus granulosus .Due to itsrapidity ,simplicity ,speci-ficity and sensitivity ,the LAMP assay is apromising new tool for rapid detection of dogs infected with Echinococcus spp .dur-ing the field survey or in poor-equipped laboratories .【总页数】5页(P718-722)【作者】陈璐;吾拉木·马木提;张德亭;金一帮【作者单位】温州市人民医院检验科,温州 326000; 新疆医科大学基础医学院自治区病原生物学重点实验室,乌鲁木齐 830054;新疆医科大学基础医学院自治区病原生物学重点实验室,乌鲁木齐 830054;温州市人民医院检验科,温州 326000;温州市人民医院检验科,温州 326000【正文语种】中文【中图分类】R383.3【相关文献】1.环介导等温扩增技术(LAMP)检测棘球绦虫感染犬粪DNA的研究 [J], 陈璐;吾拉木·马木提;陈洁;古力帕丽·麦曼提依明2.环介导等温扩增(LAMP)试剂盒检测石蜡包埋肝组织中乙型肝炎病毒(HBV)共价闭合环状DNA(cccDNA) [J], 周冬青;刘成永;王骥;王春颖;张克球;刘加彬;黄海滨;候远沛;成松3.环介导等温扩增(LAMP)技术检测东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae的研究[J], 席伟军;陈大福;郭睿;李江红;梁勤;苏晓玲;赵东绪;华启云4.环介导等温扩增(LAMP)技术及其在鸭病病原检测中的应用研究进展 [J], 于新友;李天芝;苗立中5.环介导等温扩增(LAMP)技术及其在鸭病病原检测中的应用研究进展 [J], 于新友;李天芝;苗立中因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

环介导等温扩增技术原理

环介导等温扩增技术原理
荧光检测:LAMP有极高的扩增效率,可在一小时内将靶 序列扩增至109~l010倍,所以当反应液中加入核酸染料 SYBR Green I后,在紫外灯或日光下通过肉眼即可进行判 定,如果含有扩增产物,反应混合物变绿;反之,则保持 SYBR Green I的橙色不变。
高灵敏度,对于病毒扩增模板可达几个拷贝,比PCR高出数 量级的差异。
缺点:由于LAMP扩增是链置换合成,靶序列长度最好在 300 bp以内。>500 bp则较难扩增。故不能进行长链DNA的 扩增。灵敏度高易造成假阳性结果。
环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification ,简称LAMP)是利用4个特殊设计 的引物和具有链置换活性的Bst DNA聚合酶,在 恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA的新 技术。
温度 ℃ 引物 模板
NASBA 42
需要2条 RNA
SPIA 42
1条
RNA
HDA
37/65 需要2条 DNA
SDA LAMP RCA Qβ
37/65 63 37-65 37
不需要 4条 需要 不需要
DNA DNA DNA RNA
其他 反转录酶,RNA酶 H,T7RNA聚合酶 反转录酶,T7RNA 聚合酶 解旋酶,扩增片段 小
以F3为起始合成的新链与模板链形成双链。而原合成的以FIP 为起始的DNA单链被置换而脱离产生一单链DNA,其在5’末端 F1c和F1区发生自我碱基配对,形成茎环状结构。
引物BIP的B2与模板链B2c区互补配对,合成以BIP为起始的新链, 并与模板链互补形成DNA双链。同时,F端的环状结构将被打开, 外引物B3与模板上B3c杂交后,以其3’末端为起点也开始合成新链, 并使以BIP为起始的DNA单链从模板链上脱离下来,形成以FIP和 BIP为两端的单链。因为B1C与B1互补,F1C与F1互补,两端自然 发生碱基配对,这条游离于液体中的DNA单链分别在F和B末端形成 两个茎环状结构,于是整条链呈现哑铃状结构,此结构即为LAMP 的基础结构。

犬细小病毒胶体金免疫层析检测法的建立

犬细小病毒胶体金免疫层析检测法的建立

犬细小病毒胶体金免疫层析检测法的建立犬细小病毒病(Canine parvovirus disease,CPVD)是上世纪七八十年代所发现的急性传染病,是由犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)感染所诱发的,临床上主要有出血性肠炎型和心肌炎型2种。

该病传播速度快,发病率和死亡率高,四季均可发生,以春夏居多,给犬业发展造成了巨大的危害,因此,快速、准确的诊断对CPVD的防治至关重要。

本研究旨在建立CPV双抗体夹心ELISA检测和胶体金免疫层析试纸条检测方法,并尝试将生物素-亲和素系统的信号放大作用应用到胶体金免疫层析试纸条上,以提高试纸条检测的灵敏度,为临床快速准确检测和诊断CPV提供依据。

本研究包括以下3个部分内容:一、犬细小病毒单克隆抗体ELISA检测法的建立将实验室制备的4株单克隆抗体进行两两配对,选取读值最高的一对,即包被单克隆抗体3A5(mAb-3A5),用辣根过氧化物酶(HRP)标记mAb-3A5作为酶标二抗建立单克隆抗体夹心ELISA检测法以检测CPV抗原。

优化试验的反应条件:mAb-3A5的最佳包被浓度为4μg/mL,4 ℃被过夜,最佳封闭条件为10%胎牛血清PBS(含0.05%Tween-20)于37。

℃孵育2 h,CPV最佳孵育条件为37 ℃作用1 h,检测抗体HRP-3A5的最佳稀释度为1:2000。

所建立的ELISA检测法特异性试验表明,该法与F81细胞上清、犬腺病毒1型(CAV-1)、犬瘟热病毒(CDV)和犬冠状病毒(CCV)均不发生阳性反应;敏感性试验表明该法可检测到的CPV含量最低限度为102TCID50/mL;重复性试验所获批内和批间变异系数分别为2.7%~6.5%和1%~5%。

用该法同PCR法同时检测52份临床样品,结果具有高度一致性,符和率达100%。

说明本试验建立的单克隆抗体ELISA检测法可用于CPV的临床检测。

二、犬细小病毒单克隆抗体免疫层析试纸条制备在已建立的CPV单克隆抗体夹心ELISA 方法的基础上,用胶体金标记纯化的mAb-3A5,捕获CPV抗原,将纯化的mAb-3A5作为检测抗体,羊抗鼠IgG抗体作为质控抗体,分别包被于硝酸纤维素膜(NC膜)制备犬细小病毒胶体金免疫层析试纸条。

检测鹅细小病毒环介导等温扩增方法的建立及结果判定方法改进

检测鹅细小病毒环介导等温扩增方法的建立及结果判定方法改进
Fu j i a n 3 5 0 0 1 2。C h i n a )
Ab s t r a c t :A n o v e l s p e e d L AM P a s s a y f o r GP V wa s e x p l o r e d wi t h L o o p — me d i a t e d a mp l i f i c a t i o n ( LAM P) . Wi t h t wo p a i r s o f i d e n t i f y s i x p o s i t i o n s i n VP3 g e n e ,a LAM P a s s a y wa s d e v e l o p e d f o r t h e r a p i d d e t e c t i o n GPV.Th e r e s u l t s i n d i c a t e d t h a t GP V wa s d e t e c t e d b y LAM P a s s a y a t 6 5 ℃ a s e a r l y a s 5 0 mi n o f i n c u b a t i o n i n a s i mp l e wa t e r b a t h .Th e d e t e c t i o n l i mi t o f t h e LAM P a s s a y wa s 1 5 0 P g・“ L o f GPV g e n o me . An d n o a mp l i f i c a t i o n wa s f o u n d wi t h t h e s a mp l e s o f o t h e r v i r u s e s .A mi x t u r e o f c a l c e i n a n d Mn wa s u s e d a s f l u o r e s c e n t r e a g e n t t o ma k e t h e r e s u l t

环介导等温扩增技术快速检测猪细小病毒的试验

环介导等温扩增技术快速检测猪细小病毒的试验

环介导等温扩增技术快速检测猪细小病毒的试验黄书林;付萍;李佳禾;张跃伟;蒋菲;张侃;陈会玲;吴文学【摘要】利用环介导等温核酸扩增技术(LAMP),建立了一种灵敏、特异、快速的猪细小病毒(PPV)检测方法.该方法针对猪细小病毒非结构蛋白(NS-1)基因保守区域设计6条特异引物,在63℃的等温条件下45 min即可完成反应.最低检测限量为10拷贝的PPV目的基因,比常规聚合酶链式反应(PCR)方法敏感100倍,并具有良好的特异性.以钙黄绿素和Mn2+作为荧光指示剂,可快速、直观判定反应结果.通过对149份临床样品进行检测比较,LAMP与PCR检出阳性样本数分别为33份和27份,表明LAMP方法阳性检出率高于PCR.【期刊名称】《中国兽医杂志》【年(卷),期】2011(047)010【总页数】4页(P3-6)【关键词】环介导等温扩增(LAMP);猪细小病毒(PPV);PCR;荧光指示剂【作者】黄书林;付萍;李佳禾;张跃伟;蒋菲;张侃;陈会玲;吴文学【作者单位】中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国牧工商(集团)总公司中牧研究院,北京丰台100070;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193;中国农业大学动物医学院,北京海淀100193【正文语种】中文【中图分类】S852.65+9.2猪细小病毒病是由猪细小病毒(PPV)感染引起母猪繁殖障碍的重要病原体之一,主要引起母猪发生流产、死胎、畸形胎、木乃伊胎及不孕等。

近年来,猪细小病毒病有上升的趋势,并且该病常常与猪圆环病毒2型、猪繁殖与呼吸综合征病毒,伪狂犬病病毒等发生混合感染,给养猪业造成巨大的损失[1-2]。

环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)作为一种新兴的核酸扩增技术[3],具有高特异性、高敏感性、快速、简便等优点[4-6]。

基于重组酶聚合酶扩增技术的犬细小病毒快速检测方法的建立

基于重组酶聚合酶扩增技术的犬细小病毒快速检测方法的建立

基于重组酶聚合酶扩增技术的犬细小病毒快速检测方法的建立姜一曈;王昭华;鑫婷;贾红;郭晓宇;朱鸿飞;侯绍华【期刊名称】《中国预防兽医学报》【年(卷),期】2018(040)010【摘要】为建立一种快速、简便检测犬细小病毒(CPV)的方法,本研究基于CPV VP2基因的保守序列,设计合成引物,通过对反应条件的优化,建立了CPV的重组酶聚合酶(RPA)检测方法.该方法在38℃恒温反应15min即可快速、特异性的检测出CPV.特异性试验结果显示,除CPV (BJ-2b株、BJ-2c株)外,犬瘟热病毒、犬冠状病毒、犬腺病毒、犬副流感病毒等检测均为阴性;敏感性试验结果显示,以重组质粒pEASY-CPV-VP2为模板,RPA的检测下限为1×101拷贝/μL,其敏感度比普通PCR方法高10倍.利用建立的RPA方法对疑似CPV感染的临床样品的阳性检出率为88%,高于普通PCR的检出率(82%)和胶体金的检出率(76%).本研究建立的CPV RPA检测方法操作简单,反应灵敏,结果确实可靠,适用于CPV的快速检测.【总页数】4页(P926-929)【作者】姜一曈;王昭华;鑫婷;贾红;郭晓宇;朱鸿飞;侯绍华【作者单位】中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100081【正文语种】中文【中图分类】S852.65【相关文献】1.猪细小病毒重组酶聚合酶扩增快速检测方法的建立 [J], 刘立兵;王建昌;经美;王金凤;袁万哲2.基于重组酶聚合酶扩增技术的犬冠状病毒快速检测方法的建立 [J], 陈坚;张丹琳;马磊;伍妙梨3.单核细胞增生李斯特菌重组酶聚合酶恒温扩增快速检测方法的建立 [J], 周红蕾;程淑琴;胡永青;刘静4.副溶血弧菌重组酶聚合酶扩增快速检测方法的建立及初步应用 [J], 马超;杨潇含;杨乾坤;杨海涛;张佳;董井泉;高嵩5.基于逆转录重组酶聚合酶扩增技术的苹果病毒新型快速检测方法 [J], 焦健;郑先波;夏炎;武雪莉;王苗苗;宋春晖;庞宏光;白团辉;宋尚伟;黄松因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

犬细小病毒病PCR检测方法的建立及应用

犬细小病毒病PCR检测方法的建立及应用

犬细小病毒病PCR检测方法的建立及应用陶明江;张祥华;孙明;余恩超;陆家卿;王萍;何后军;邬向东;戴益民【期刊名称】《生物灾害科学》【年(卷),期】2013(036)004【摘要】犬细小病毒病感染是由犬细小病毒(cPv)引起犬只死亡的最重要传染病之一,目前诊断该病的方法主要是胶体金快速检测试板法,虽然检测方法较简便快速,但其敏感性较差。

通过对NCBI网站GenBank发表的CPV-2基因组序列的分析,选择该病毒VP2基因保守序列设计引物,通过对阳性病料扩增及扩增产物测序,与NCBI发表的相关基因对比,同源性在99.8%-100%,成功建立了特异性、灵敏度高的PCR方法,最低只需2.5PgDNA模板。

在对28例可疑CPV 病例检测中,本方法检出25例阳性、3例阴性,阳性率为89.28%;胶体金检测板检测出20例阳性、8例阴性,阳性率为71.42%,证实PCR方法比胶体金检测更敏感。

【总页数】5页(P399-402,416)【作者】陶明江;张祥华;孙明;余恩超;陆家卿;王萍;何后军;邬向东;戴益民【作者单位】江西农业大学动物科学技术学院,江西南昌330045【正文语种】中文【中图分类】S852.655【相关文献】1.犬博卡病毒PCR检测方法的建立及其应用 [J], 陈意伟;温肖会;朱学良;吕殿红;翟少伦;魏文康2.犬细小病毒病PCR检测方法的建立及应用 [J], 陶明江;张祥华;孙明;余恩超;陆家卿;王萍;何后军;邬向东;戴益民3.猪细小病毒病PCR检测方法的建立及应用 [J], 赵灵燕;徐辉;陈伟杰;王勇;倪柏锋;周彩琴;吴赞;4.猪细小病毒病PCR检测方法的建立及应用 [J], 赵灵燕;徐辉;陈伟杰;王勇;倪柏锋;周彩琴;吴赟竑5.犬诺如病毒RT-PCR检测方法的建立及应用 [J], 马会强;岳华;汤承因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

动物医学进展,2012,33(2):9-13 Progress in Veterinary Medicine 

环介导等温扩增技术快速检测犬细小病毒方法的建立 温 海 ,秦海斌 ,朱 骞 ,贺星亮 ,陆承平 ,张汇东h (1.公安部南京警犬研究所,江苏南京210012;2.南京农业大学预防兽医学重点实验室,江苏南京210095) 

摘 要:旨在建立一种利用环介导等温扩增技术(LAMP)检测犬细小病毒感染的新方法。根据Gen— Bank中犬细小病毒(CPV)VP2基因序列,设计4条LAMP特异性引物,对反应条件、特异性、敏感性、可视 化效果和应用效果进行研究。结果显示,在65℃等温条件下、1 h内可完成LAMP扩增过程;病毒的最低检 出限量为10 个TCID 。/mL;特异性和可视效果良好;对36份临床标本进行检测,阳性检出率为80.5 (29/36),检出率高于普通PCR 72.2 (26/36)。建立的LAMP检测方法,显示了较高的特异性和敏感性, 而且兼具高效、快捷、可视化的优势,为临床检测犬细小病毒感染提供了一种快速简便的新方法。 关键词:环介导等温扩增;犬细小病毒;快速检测 

中图分类号:¥852.655;¥858.292 文献标识码:A 文章编号:1007 5038(2012)02—0009—05 犬细小病毒病(Canine parvovirus disease)是一 种以肠炎综合征为特征的犬类、猫科和鼬科动物的 急性传染病,由犬细小病毒(Canine parvovirus, CPV)引起,其较高的发病率和病死率在经济动物、 伴侣动物及军犬和警犬的饲养中造成很大的经济损 失l_】]。该病主要经由粪便向外排毒,犬感染CPV后 4 d~7 d粪便中病毒滴度即达10。TCID 。/g[2],病 毒在粪便或固体污染物中可存活数月乃至数年,极 易造成该病的群体性暴发。因此,该病的快速诊断对 于及时采取综合防治措施、避免该病的流行至关重要。 环介导等温扩增技术(1oop—mediated isother— real amplification,LAMP)是一种新的核酸扩增方 法l_3j,可在15 min 60 min内将DNA扩增10。倍 

~10 倍,效率极高,已建立的不同病原的LAMP方 法 。 都证明了其敏感性为常规PCR的1O倍~100 倍,且所需设备简单、反应结果具备良好的可视化效 果,目前已成为病原临床快速诊断的一种新思路。 本文利用环介导等温扩增技术,以粪便作为检测材 料,建立了一种新的诊断犬细小病毒感染的方法,兼具 操作简单、高特异性、高敏感性和高时效性的优势,为 CPV的临床诊断提供了一种新颖有效的手段。 1材料与方法 1.1 材料 1.1.1 毒株与细胞 犬细小病毒(CPV)GN标准 株、CAV I型GN株及其细胞培养物,由南京警犬研 

究所分离鉴定、培养、保存;36份粪便或肠内容物等 检测材料,采集自南京及周边地区疑似CPV感染 犬;猫肾细胞(F81)购自中国兽药监察所。 1.1.2 试剂 10×ThermoPol反应缓冲液为New England BioLabs公司产品;5.0 mmol/L Betaine为 Sigma—Aldrich公司产品;dNTP mixture、Taq酶为 宝生物工程(大连)有限公司产品。 1.2 方法 1.2.1 引物的设计与合成 PCR引物根据 GenBank参考序列设计,上游引物为P1:5,_ATG— TACTTTGCGGGACTTGG一3 ,下游引物为P2:5,_ AACCAAAGTCTCCTGGAAG C一3 ,由南京百龙 基因公司合成,扩增CPV VP2高度保守区域718 bp 的片段。LAMP引物的设计,根据CPV VP2 (M38245)基因序列,应用在线软件Primer Explorer V3(NetLaboratory;Fujitsu,Tokyo,Japan)设计 能扩增VP2高度保守区域的引物,引物位置和序列 见表1。 1.2.2 LAMP检测方法的建立 组织样品及细胞 培养物中病毒的DNA模板制备按Trizol法进行。 LAMP反应总体积25 L:内含引物CPV—BIP和一 FIP各1 L(40 pmo1)、CPV—F3和一B3各0.5 L (10 pmo1)、2.5 L 10×Thermo Pol反应缓冲液 [200 mmol/L Tris—HC1, 100 mmol/L KC1, 2O mmol/L M.gSO4,100 mmol/L(NH4)2 SO4, 10 mL/L Tween 20 l、4.0“L 5.0 mmol/L Betaine、 

收稿日期:2011-10—20 。 基金项目:公安部应用创新计划(2007YYCXNJJQS161) 作者简介:温 海(1961一),男,吉林四平人,副研究员,主要从事动物疫病防控工作。*通讯作者 10 动物医学进展2012年第33卷第2期(总第224期) CPV—FIP CPV—BIP CP、,_F3 CP、 B3 5'-GTAGAAATCCCCACACCCCC-CTACAGGATCTGGGAACG一3 (F1c—F2) 5'-GGAAAACGGATGGGTGGAAA-TGGCATATTTAAATGTACAAGTCTG一3 (BIc—B2) 5 CCTGCTGTCAGAAATGAAAG一3 5 CCATATTATTTACAACCACTCTTCT一3 

4.0 uL 2.5 mmol/LdNTPs mixture、8 U Bst DNA polymerise、2 L模板DNA。引物和模板在60、 63、65℃孵育3O、45、6O min,孵育反应结束后,再在 80℃作用10 min终止反应。根据反应结果选择合 适的扩增条件。 1.2.3 LAMP特异性鉴定 犬传染性肝炎(CAV I型)是犬的另一种主要病毒性传染病,利用CAV I 型GN株和CPV GN株细胞培养产物的DNA进行 LAMP特异性鉴定,于适宜循环参数下进行LAMP 扩增,判断其特异性。 1.2.4 LAMP敏感性试验 将CPV GN株F81 细胞养产物(病毒含量为TCID 。一10/0.1 mL)进 行1O倍系列稀释,获得含有1O。、10 、1O 、100、 10~、10_。、10一、10 个TCID 。病毒量的样本,各 取0.1 mL提取病毒DNA作为PCR反应和LAMP 反应的模板,按1.2.2选择的循环参数下进行扩增, 比较PCR反应和LAMP反应的敏感性差异。PCR 反应总体积2O L:25 mmol/L MgCI2 2.0 L,10 ×RNA PCR buffer 2.0 uL,2.5 mmol/L dNTP mixture 1.6 L,DEPC—H20 11.5 L,Taq酶 0.5 L,样品1.6 L,10 nmol/L P1和P2各 0.4 L。PCR的反应程序为:96℃预变性5 min; 94℃45 S,55℃45 S,72。C 45 S,35个循环;72℃ 10 min,4℃保存备用。 1.2.5 LAMP结果可视化效果检测 分别以 CPV GN株和蒸馏水作为阳性和阴性对照,对36份 临床样本在最佳LAMP条件下进行检测,以琼脂糖 凝胶电泳结果为参照,观察SYBR Green I染色的 可视化效果。琼脂糖凝胶电泳:4 L LAMP产物, 以15 g/L浓度的琼脂糖凝胶电泳,成像、观察。 SYBR Green I染色,按照1:100的比例向LAMP 反应管中加入SYBR Green I,静置观察。 1.2.6 LAMP诊断方法的应用 对36份疑似 CPV感染的病料应用LAMP、PCR方法进行检测, 比较两者的符合率和检出率的高低,初步判定LAMP 

方法临床使用效果。 2 结果 2.1 LAMP检测方法的建立 以CPV GN株DNA为模板,分别以6O、63、 65℃反应60 min,15 g/L琼脂糖凝胶电泳,显示在 65℃时该实验的条带清晰、分辨率较高(图1)。在 65℃,分别反应30、45、60 min,以15 g/L琼脂糖凝 胶电泳,表明在45 min、60 min即可实现扩增,考虑 到产物量与时间的关系,本试验选择60 min以提高 反应的灵敏度(图2)。 2.2 LAMP反应特异性试验 分别以CPV GN株、犬传染性肝炎(CAV工型) GN株和蒸馏水对照DNA为模板,在65℃反应 60 min,产物以15 g/L琼脂糖凝胶电泳,CPV对照 的阳性条带明显,CAV工型GN株和蒸馏水对照均 未出现LAMP特异性条带,表明该方法只能特异检 出CPV,对其他犬DNA病毒不能检出(图3)。 

2 000 bp 1 000bp 750 bp 

500 bp 

M.DNA标准DL 2 000;1.65℃;2.63℃;3.60。C M.DNA Marker DL 2 000;1.65℃;2.63℃;3.60℃ 图1 CPV GN株的LAMP反应在 不同温度的扩增结果 Fig.1 LAMP products of CPV GN strain amplified in different temperatures 12 动物医学进展2012年第33卷第2期(总第224期) 表2 CPV LAMP方法和PCR方法的应用比较 Table 2 Comparison between LAMP method and PCR method in clinical diagnosis 

3讨论 目前对于CPD的诊断,已建立病毒分离培养、 电镜检查、胶乳凝集试验、免疫荧光技术、ELISA、 HA和PCRc 。 等多种检测CPV的方法,在一定程 度上满足了CPV实验室检测的需要,但在时效性、 灵敏性、便捷性上存在缺陷,有些方法容易出现假阳 性或假阴性结果,无法满足基层现场快速诊断的要 求。本研究建立的快速检测CPV病毒的LAMP方 法,可在65。C等温的条件下、1 h内完成扩增;与常 规pCR相比,检测灵敏度是PCR的100倍;对36 份可疑样本的检测证实LAMP阳性检出率高于 PCR方法,能有效防止假阴性结果的出现Ll ,证明 LAMP扩增技术比现有的检测方法更具临床应用 的前景。 LAMP方法的另一个优势是其结果的可视化, 反应产生的大量焦磷酸盐离子在产物中形成白色的 焦磷酸镁沉淀_1 ,可作为判断LAMP扩增是否发 生的标准;裸眼观察白色沉淀存在一定的误差,添加 溴化乙锭(EB)、SYBR Green I、钙黄绿素等染料进 行染色,能够增加可视化反应的灵敏度。本研究在 LAMP扩增产物中加入1 L SYBR GreenI,阳性产 物在自然光下由橙色转变为绿色,观察效果直观明 显,在临床检测中可替代凝胶电泳,大大增加操作便 捷性和当地操作的可行性。与LAMP方法的高灵 敏度对应,其假阳性是该方法的一个缺陷,尤其是频 繁检测时环境中产生气溶胶污染增加了假阳性的出 现,通过加强操作环境的控制、裸眼观察LAMP产 物的浑浊度进行判定结果、在反应体系中预加羟基 萘酚蓝(HNB)[1 ]可有效降低气溶胶污染。另有报 导应用Real—time Turbidimeter仪来实时监控分析 LAMP反应过程,可以直观、实时地观察反应情况, 能够减低污染因素的干扰l1引,但是仪器造价昂贵, 在当地检测中推广使用较为困难。通过规范操作过 程、增加通风操作、减少开盖检测次数仍然是控制污 染的主要措施。 

相关文档
最新文档