高斯软件基础教程

GaussView 界面教程【1】

界面介绍

Gview 是一个专门设计于高斯配套使用的软件， 其主要用途有两个：构建高斯的输入文 件；以图的形式显示高斯计算的结果。 除了可以自己构建输入文件外，Gview 还可读入 Chem3DHyperChen O 晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连用， 大大拓宽了使用范围。

开启GaussView 会看到一大一小两个窗口，后面灰色背景的窗口为选择窗口，在里面 选择要输入的分子或基团；前面紫色的窗口为绘图窗口，使用鼠标绘制想要绘制的图 形。 菜单栏

【File 】主要功能是建立，打开，保存和打印当前的文件

【Edit 】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等

【View 】与显示分子相关的都在这个菜单下，如显示氢原子、键、元 坐

标等

【Calculate 】直接向 Gaussian 提交计算

【Results 】接收并显示 Gaussian 计算后的结果

【Windows i 控制窗体，如关闭、恢复等

【 Help 】帮助

快速工具栏

【左面第一个】 选择元素与价键 ，单击打开会看到一个元素周期表，通过它可以选择 需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】 环工具 ，作用与上一个差不多，只是这里提供的都是环状化合物残基；

【左面第三个】提供常用的R 基团模板，其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等

【左面第四个】 氨基酸残基 ，使用它可以迅速绘制氨基酸

【左面第五个】用户 自定义基团 ，您可以将常用的基团存放到此处

这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】 |【键角调整】 | 【二面角调整】 |【查询 已有结构】 | 【增加化学键】 | 【删除化学键】 |【翻转原子】 | 【单个选择】 |【框选】 |

【去除选择】 | 【全选】 这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到

3、常用工具栏

这两条条工具栏是最常用的，几乎所有软件都有的新建打开等工具

a

号

GaussView教程【2】 --- 构建分子

这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

1、开启Gview

2、双击按钮，选择苯基（第一个），会看到主程序框体中出现苯环

在工作窗口单击，可以看到工作窗口也出现了一个苯环。

单击左键，可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口；

按上下左右键，或者左键单击不放移动鼠标，可以调节分子的角度；

滚动鼠标滚轮，可以放大缩小分子；

按住shift键，左键单击不放移动鼠标，可以移动分子；

当工作窗口内有多个分子时（在构建大的分子时，这种情况很容易出现）

用Shift+Alt+鼠标左键组合，移动想要移动的分子；

用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度；

双击'眩I图标（或者左键不放），在元素周期表中选择【F】元素，回到工作窗口在苯

的任意一个【H】上单击，使之变成【F】

双击R图标，从链烃库中选择【乙基】（第一个），然后点击间位上的【H】即可

至此，分子式已经构建完成，Gview存储个人常用分子的功能，双击view上的图标，在下面的对话框中键入相关项目，保存即可。

（注：我的程序此项功能不行，用户自定义基团）

查看分子坐标：单击Gview界面的图标，查看分子的坐标。

至此，我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子，在绘图界面右键单击【File 】——【Save］然后选择保存路径即可。

GaussView教程【3］----- 向Gaussian提交计算

上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子，现在打开间氟苯乙烷分子。

点击Gview 界面上的【Calculate ］ ------ 【Gaussian Calculate Setup ］

从对话框中我们可以选择许多参数，下面依次选择一下

【Job Type 】工作类型：

【Energy 能量］|【Optimization 优化］|【Frequency 频率］|【Opt+Freq 优化+频率］|【Scan扫描］|【Stability 稳定性］|【NMR核磁］,

这里我们选择【NMR核磁

【Method］方法：每种计算模式都提供了若干种方法，这里选择默认值即可

【Title 】题目：这项可以根据自己的项目自行命名

【Link 0 】给检查点文件命名

其它选择默认即可

选好后点击【Submit ］提交至Gaussian，并保存。（最好存到安装文件所在磁盘）

系统会询问是否提交至Gaussian，选择【OK, Gaussia n会自动开启并计算，计算时间因硬件配置而异

计算完毕后系统会提示关闭Gaussian，点击【是］计算完毕后会生成两个文件，.log 的

是系统日志，便于查看计算结果。这里我们选

择.chk文件【Ok

接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子，表面上没什么不同，但这次我们可以

预言它的许多性质了，在GView的主界面点击【Results ］-------- 【Summary可以看到

刚才的计算总结，点击【View File 】可以看到日志文件。

因为我们刚才选择计算模式是【NMR核磁，所以我们点击【Results ］――【NMR，随即我们看到了很熟悉的核磁图谱，但似乎很乱，因为这是所有元素的核磁谱图，在

左下方【Element】右方选择【H】,即H谱，旁边【Referenee】选择【TMSHF/6-31G(d)】, 这次我们就可以看到间氟苯乙烷分子理论计算的核磁谱图了。

在绘图界面右击【View】 ---- 【Labels】可以看到每个H原子对应场中的位置。