单核苷酸多态性芯片与染色体核型分析在唐氏筛查高风险孕妇产前诊断中的比较研究
761例中期唐氏综合征筛查高风险孕妇的羊水染色体核型分析
761例中期唐氏综合征筛查高风险孕妇的羊水染色体核型分析发表时间：2013-11-18T14:41:49.373Z 来源：《医药前沿》2013年第30期供稿作者：黄少琼[导读] 选择在我院产前筛查的761例中期唐氏综合征筛查高风险孕妇。
唐氏综合征筛查高风险的切割值为1:250，≥1:250为高风险。
黄少琼（广东省惠州市中心人民医院广东惠州 516008）【摘要】目的分析探讨中期唐氏综合征筛查高风险孕妇的羊水染色体核型。
方法采用羊膜腔穿刺术，取羊水细胞进行培养，分析染色体核型。
结果 761例中期筛查高风险孕妇中检出异常核型31例，异常率为4.07%，其中数目异常13例，臂间倒位17例，平衡易位1例。
检出多态性变异17例，占全部被检者2.23%。
结论唐氏综合征筛查作为常规产前检查项目之一，高风险者需通过产前诊断技术进行确诊。
【关键词】唐氏综合征筛查高风险羊水染色体核型【中图分类号】R714 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752（2013）30-0211-01随着产前辅助检查技术的不断发展，唐氏综合征筛查已成为常规产检项目之一，孕中期检测指标有AFP/FreehCGβ、uE3，但是该筛查技术的假阳性率较高，所以对于那些检测结果为高风险的孕妇建议其进行羊水细胞染色体核型分析，以明确是否存在异常染色体核型。
1 资料与方法1.1 资料选择在我院产前筛查的761例中期唐氏综合征筛查高风险孕妇。
唐氏综合征筛查高风险的切割值为1:250，≥1:250为高风险。
1.2 方法采用知情同意的原则，孕16-22周时，在B型超声监测下行羊膜腔穿刺术，取20ml羊水进行细胞培养，制作玻片，G显带分析染色体核型，每例计数20个中期分裂相，分析5个核型，嵌合体者计数50个中期分裂相，每种核型分析5个核型。
根据人类遗传学国际命名体制（ISCN）对染色体命名。
2 结果761例孕妇中检出异常核型31例，异常率为4.07%，其中数目异常13例，臂间倒位17例，平衡易位1例，分别占总检查人数的1.71%、2.23%、0.13%。
单核苷酸多态性微阵列芯片技术检测Prader-Willi综合征患儿染色体微缺失
父 源性 １５ｑｌ１．２－ｑ１３．１区段 ２３６９９７０１—２８５２５４６０缺 失 了 ４．８２６ Ｍｂ，该 缺 失 区段 与 Ｐｒａｄｅｒ—Ｗｉｌｌｉ综 合 征 相 关 。 结 论 ＳＮＰ—ａｒｒａｙ技
术 可 以 明 确 诊 断 Ｐｒａｄｅｒ—ＷｉｌＪｉ综 合 征 。
关键 词 ：单核 苷酸 多态性芯 片；Ｐｒａｄｅｒ—Ｗｉｌｌｉ综合征 ；染色体 ；微缺 失
孔京 慧 ，章 波 ，葛丽 丽 ，陈重 芬 ，郭鹏 波 ，刘磊 ，宋银 森 （郑 州 大学 附属 儿童 医院 ＆ 河 南省 儿童 医院 ＆ 郑 州儿 童 医院 河 南省 遗传 代谢 性 疾病 重 点 实验 室 郑 州 ４５００００）
摘要 ：目的 采用单核苷 酸 多态性微 阵列 芯片（ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｒｒａｙ，ＳＮＰ—ａｒｒａｙ）分析 ｌ例 因生 长发 育迟缓 而诊
制 ，以期能 提高 临 床 医师对 此病 的认 识 。
１ 临 床 资料
１．１ 一 般 资料 患 儿 ，男 ，３岁 ，因 “生 长迟 缓 ３年 ” 于 ２０１８年 １月 收入我 院内分泌遗 传代谢科 。３年 前 因 喂养 困难 ，生 长 发 育迟 缓 ，在 当地 医院 以 “脑损 伤 ”住 院治 疗 ，疗 效 差 。后 因 “中度 营 养 不 良”在 另 一 三 甲 医院 诊 断 “先 天 愚 型？”疗 效 差 ，家 长 要 求 主 动 出 院 。１岁 后食 欲 亢进 ，为 求 进 一 步 治疗 ，收 入本 院。患 儿 系 Ｇ１Ｐ１，足月 顺 产 ，生 后无 窒 息抢 救史 ，出 生体重 ２．６ ｋｇ，出生身长不详。母孕期体健 ，家族 中 无 遗传 疾 病史 。 １．２ 体格 检查 神 志 清 ，身材 匀 称 ，生 长迟 缓 ，身 高 ９６．８ ｅｍ，体 重 ｌ８．５ ｋｇ。体 态 稍 胖 ，面 容 特 殊 ，皮 肤
胎儿右锁骨下动脉迷走应用单核苷酸多态性微阵列技术检查的价值
㊃论著㊃D O I:10.3969/j.i s s n.1672-9455.2024.04.007胎儿右锁骨下动脉迷走应用单核苷酸多态性微阵列技术检查的价值*陈耿波,江矞颖,傅婉玉,王元白,庄建龙,李燕青ә福建省泉州市妇幼保健院儿童医院产前诊断中心,福建泉州362000摘要:目的探讨单核苷酸多态性微阵列(S N P-a r r a y)检查对胎儿右锁骨下动脉迷走(A R S A)的临床意义㊂方法选取2018年1月1日至2022年7月31日于该院进行产检的75例孕妇的胎儿为研究对象,所有胎儿Ⅱ~Ⅲ级彩超检查提示A R S A,且所有孕妇均在该院产前诊断中心进行羊水/脐血染色体核型分析及S N P-a r r a y检查,总结分析其染色体检查结果㊁临床表型及妊娠结局㊂结果染色体核型分析检出4例染色体结构异常,包含2例致病性变异和2例46,X N,i n v(9)(p11q13),致病性变异检出率为2.67%(2/75);S N P-a r r a y检出12例异常,包含5例致病性变异(p C N V s)㊁2例存在杂合性缺失(L O H)㊁5例临床意义尚不明确(V O U S),致病性变异检出率为6.67%(5/75)㊂合并心脏其他结构畸形的A R S A胎儿染色体p C N V s检出率最高(33.33%),其次为孤立性A R S A胎儿(10.71%)㊂结论 A R S A胎儿建议进行染色体S N P-a r r a y检查排除染色体微小病变㊂关键词:右锁骨下动脉迷走;单核苷酸多态性微阵列;胎儿;染色体异常;致病性变异中图法分类号:R446.9;R714.55文献标志码:A文章编号:1672-9455(2024)04-0463-04C l i n i c a l v a l u e f o r f e t a l r i g h t s u b c l a v i a n a r t e r y v a g u s b y s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m a r r a y t e c h n i q u e*C H E N G e n g b o,J I A N G Y u y i n g,F U W a n y u,WA N G Y u a n b a i,Z HU A N G J i a n l o n g,L I Y a n q i n gәP r e n a t a l D i a g n o s i s C e n t e r,C h i l d r e n's H o s p i t a l,Q u a n z h o u M a t e r n a l a n dC h i l d H e a l t h H o s p i t a l,Q u a n z h o u,F u j i a n362000,C h i n aA b s t r a c t:O b j e c t i v e T o i n v e s t i g a t e t h e c l i n i c a l s i g n i f i c a n c e o f s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m a r r a y (S N P-a r r a y)i n t h e t r e a t m e n t o f f e t a l a b e r r a n t r i g h t s u b c l a v i a n a r t e r y v a g u s(A R S A).M e t h o d s T h e f e t u s e s o f75p r e g n a n t w o m e n w h o u n d e r w e n t a n t e n a t a l e x a m i n a t i o n i n Q u a n z h o u M a t e r n a l a n d C h i l d H e a l t h H o s p i-t a l f r o m J a n u a r y1,2018t o J u l y31,2022w e r e s e l e c t e d a s t h e s t u d y o b j e c t s.A l l f e t u s e s o f g r a d eⅡt oⅢc o l o r u l t r a s o u n d i n d i c a t e d A R S A,a n d a l l p r e g n a n t w o m e n u n d e r w e n t c h r o m o s o m e k a r y o t y p e a n a l y s i s o f a m n i o t i c f l u i d/u m b i l i c a l b l o o d a n d S N P-a r r a y t e c h n o l o g y e x a m i n a t i o n i n o u r p r e n a t a l d i a g n o s t i c c e n t e r.T h e r e s u l t s o f c h r o m o s o m e e x a m i n a t i o n,c l i n i c a l p h e n o t y p e a n d p r e g n a n c y o u t c o m e w e r e s u m m a r i z e d a n d a n a l y z e d.R e s u l t s C h r o-m o s o m e k a r y o t y p e a n a l y s i s d e t e c t e d4c a s e s o f c h r o m o s o m e s t r u c t u r a l a b n o r m a l i t i e s,i n c l u d i n g2c a s e s o f p a t h o g e n i c v a r i a t i o n a n d2c a s e s o f46,X N,i n v(9)(p11q13),t h e d e t e c t i o n r a t e o f p a t h o g e n i c v a r i a t i o n w a s 2.67%(2/75).S N P-a r r a y d e t e c t e d12a b n o r m a l i t i e s,i n c l u d i n g5c a s e s o f p a t h o g e n i c v a r i a t i o n(p C N V s),2c a-s e s o f h e t e r o z y g o s i t y l o s s(L O H),a n d5c a s e s o f c l i n i c a l s i g n i f i c a n c e u n k n o w n(V O U S).T h e d e t e c t i o n r a t e o f p a t h o g e n i c v a r i a t i o n w a s6.67%(5/75).T h e d e t e c t i o n r a t e o f p C N V s i n A R S A f e t u s e s w i t h c a r d i a c m a l f o r-m a t i o n s w a s t h e h i g h e s t,f o l l o w e d b y i s o l a t e d A R S A f e t u s e s.C o n c l u s i o n F e t a l A R S A r e l a t e s c l o s e l y t o c h r o-m o s o m a l l e s i o n s,a n d S N P-a r r a y d e t e c t i o n i s r e c o mm e n d e d t o i m p r o v e t h e d e t e c t i o n r a t e.K e y w o r d s:r i g h t s u b c l a v i a n a r t e r y v a g u s;s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m a r r a y;f e t u s;c h r o m o s o m-a l a b n o r m a l i t i e s;p a t h o g e n i c v a r i a t i o n胎儿右锁骨下动脉迷走(A R S A)是主动脉弓最常见的先天异常,正常情况下,右锁骨下动脉起源于头臂干,而A R S A直接起源于主动脉弓,位于左锁骨下动脉的远端,通常绕气管和食管后方向右肩部走行,临床上多无明显症状㊂健康人群中A R S A的发生率为1.0%~1.5%,在非整倍体人群尸检中检出率为19%~36%,提示A R S A与胎儿非整倍体异常关系密切[1]㊂本研究回顾分析通过单核苷酸多态性微阵列(S N P-a r r a y)技术联合染色体核型分析产前诊断为A R S A的75例胎儿,对其染色体异常检出情况进行总结,以期为产前遗传咨询提供参考㊂1资料与方法1.1一般资料选取2018年1月1日至2022年7月31日于本院进行产检的75例孕妇的胎儿为研究㊃364㊃检验医学与临床2024年2月第21卷第4期 L a b M e d C l i n,F e b r u a r y2024,V o l.21,N o.4*基金项目:福建省卫生健康重大科研专项资助项目[闽卫科教函(2021)905号];福建省科技重大专项[闽财指(2021)741号]㊂作者简介:陈耿波,男,副主任医师,主要从事优生优育及计划生育研究㊂ә通信作者,E-m a i l:l i y a n q i n g.v i p@f o x m a i l.c o m㊂对象,所有胎儿Ⅱ~Ⅲ级彩超检查提示A R S A ,且所有孕妇均在本院产前诊断中心接受羊水/脐血染色体核型分析及S N P -a r r a y 检查㊂根据有无合并其他高危因素将75例胎儿分为孤立性A R S A 胎儿组及非孤立性A R S A 胎儿组,非孤立性A R S A 胎儿组高危因素包括胎儿超声结构异常㊁超声软指标异常㊁孕妇高龄㊁唐氏筛查高风险㊁不良孕产史等㊂所有接受介入性产前诊断的孕妇在检查前均充分知情,并签署知情同意书㊂本研究经本院医学伦理委员会批准(2020N O.31)㊂1.2 细胞培养及染色体核型分析 采用超声引导进行羊膜腔穿刺术或脐血穿刺术,抽取30m L 羊水或2m L 脐血用于染色体核型分析和S N P -a r r a y 检查㊂20m L 用于羊水细胞培养,羊水培养后收获细胞,制备染色体并染色后进行核型分析㊂羊水细胞共计数可分析核型30个,分析5个核型㊂1m L 脐血用于脐血细胞培养,计数可分析核型20个,分析5个核型㊂染色体的命名参照人类细胞遗传学国际命名体制标准(I S C N 2020)㊂1.3 S N P -a r r a y 检查 将10m L 羊水或1m L 脐血标本送至第三方检查公司(北京贝康医学检验所)采用A f f y m e t r i x C y t o S c a n 750K 芯片进行S N P -a r r a y 检查㊂按照试剂盒说明书,提取羊水细胞基因组D N A ,经稀释㊁消化㊁扩增㊁纯化后,将芯片上的探针与生物素标记的相应待测片段进行杂交㊁洗涤㊁结合染色后放入G e n e C h i p 扫描仪(A f f ym e t r i x 公司)扫描,采用C h r o m o s o m e A n a l ys i s S u i t e (C h A S )v 4.0软件对荧光信号进行分析㊂根据美国医学遗传学与基因组学学会(A C MG )指南,通过查询D G V ㊁OM I M ㊁P u b m e d ㊁D E C I P H E R 及加州大学圣克鲁斯分校(U C S C )数据库对拷贝数变异的临床意义进行分析㊂2 结 果2.1 染色体核型分析结果 共纳入75例产前超声提示A R S A 胎儿,染色体核型分析检出4例染色体结构异常,包括2例致病性变异(分别为47,X N ,+21和嵌合型T u r n e r 综合征)和2例46,X N ,i n v (9)(p 11q13),总检出率为5.33%(4/75),致病性变异检出率为2.67%㊂2.2 S N P -a r r a y 检查结果 S N P -a r r a y 技术共检出12例异常,包括5例致病性变异㊁2例存在杂合性缺失(L O H )㊁5例临床意义尚不明确(V O U S ),检出率为16.00%(12/75),致病性变异检出率为6.67%㊂见表1㊂S N P -a r r a y 技术对AR S A 胎儿染色体异常的致病性变异检出率比传统染色体核型分析检出率提高4%㊂孤立性A R S A 胎儿组㊁非孤立性A R S A 胎儿组染色体异常检出率比较见表2㊂表1 A R S A 胎儿S N P -a r r a y 异常检出情况及妊娠结局随访序号产前诊断指征S N P -a r r a y 检查结果父母验证临床意义核型分析妊娠结局1A R S A22q11.21重复3.3m b -致病性变异未见异常终止妊娠2N T :5.1m m ;静脉导管a 波反向;室间隔缺损,永存左上腔静脉;A R S Aa r r (21)x 3致病性变异47,X N ,+21终止妊娠3心脏强回声;A R S A3p 22.1p 14.3杂合性缺失13.0m bL O H 未见异常活产4A R S A 4q 31.23q 34.1杂合性缺失21.5m bL O H未见异常活产5A R S A22q11.21重复2.5m b致病性变异46,X N ,i n v (9)(p 11q13)活产6D S 1/200;先天性心脏病:法洛四联症,肺动脉闭锁,A R S A ,左上腔静脉存在并引流入左房可能4q 21.22q 22.2缺失11.5m b 致病性变异未见异常终止妊娠7A R S A ;羊水过多;鼻骨发育不良;中筛m o m 异常;2q12.3缺失0.59m b ;17q11.2重复0.464m b V O U S 未见异常活产8A R S A ;肠道强回声4q27缺失0.17m b 遗传自母亲V O U S 未见异常活产9A R S A10q22.1缺失0.18m b 遗传自母亲V O U S 未见异常出生后失访10A R S A ;心脏强回声;肠道强回声;11p14.3重复1.0m b 新发突变V O U S 未见异常活产11A R S A ;心脏强回声;侧脑室增宽;肾盂扩张;18p11.21重复0.48m bV O U S未见异常活产12A R S A45,X [22%]/46,X X [78%],或X X X /X /X X ,或X X X /X 等形式异常嵌合新发突变致病性变异45,X [47]/47,X X X [3]终止妊娠 注: 表示未验证;D S 为唐氏综合征㊂㊃464㊃检验医学与临床2024年2月第21卷第4期 L a b M e d C l i n ,F e b r u a r y 2024,V o l .21,N o .4表2 A R S A 胎儿具体分组及染色体异常检出情况组别nS N P -a r r a y 检出情况检出异常(n )总检出率(%)致病性变异检出率(%)染色体核型检出情况核型异常(n )总检出率(%)致病性变异检出率(%)孤立性A R S A 胎儿组28517.8610.71310.713.57 心脏其他畸形6233.3333.33116.6716.67超声软指标异常33515.150.0000.000.00非孤立性A R S A 胎儿组 孕妇高龄500.000.0000.000.00 唐氏筛查高风险100.000.0000.000.00 不良孕产史100.000.0000.000.00 伴骨骼发育异常100.000.0000.000.00合计751216.006.6745.332.672.3 妊娠结局随访情况 经遗传咨询后,12例合并染色体异常A R S A 胎儿中例1㊁2㊁6㊁12家属选择终止妊娠;其余8例胎儿家属选择继续妊娠:7例出生后随访家属均自述出生后未见明显异常,1例出生后失访㊂63例染色体核型分析及S N P -a r r a y 检查未发现异常的A R S A 胎儿中1例于羊水穿刺术后1周自然流产(男性无生机儿,外观未见明显异常);1例因超声提示胎儿小头畸形可能,于孕26周5d 在外院引产(无生机儿,性别及外观不祥);57例出生后随访均未见明显异常;4例失访㊂1例超声检查提示A R S A 的胎儿染色体核型分析及S N P -a r r a y 检查均未发现异常,彩超随访发现小头畸形,家属选择终止妊娠㊂3 讨 论染色体微阵列分析(C MA )技术又被称为 分子核型分析 ,目前已广泛应用于产前诊断,能检查出10m b 以下的染色体小片段拷贝数变异[2-4],与传统染色体核型分析相比,不仅能减少检查时间,同时能提高诊断率[5]㊂本研究中S N P -a r r a y 技术对AR S A 胎儿染色体致病性变异检出率为6.67%,与染色体核型分析相比,检出率提高了4%㊂A R S A 与胎儿染色体异常之间存在明显关联[6]㊂目前的研究认为非孤立性的A R S A 会增加胎儿染色体异常的风险,主要是21-三体和22q11微缺失[7-8]㊂本研究中例2胎儿合并心脏其他结构畸形,检出21-三体综合征㊂本研究检出2例22号染色体22q11.21区段存在微重复(分别为3.3/2.5m b ),该片段位于22q11.2缺失/重复疾病的关键区域,已有研究报道22q11.2区段重复可导致不同程度的智力障碍,学习障碍,生长迟滞,肌张力减退等[9],但22q11.21重复与A R S A 的关系鲜有报道,例5作为存活案例,有待继续随访以充实临床数据㊂有研究报道A R S A 可能是T u r n e r 综合征等染色体异常的产前超声表现[10],本研究例12胎儿羊水染色体核型分析及S N P -a r r a y 检出嵌合型T u r n e r 综合征伴X 染色体微重复㊂T u r n e r 综合征是常见的染色体异常疾病之一,也是人类能生存的唯一单体综合征,T u r n e r 综合征典型临床表现为第二性征发育不全㊁原发性闭经㊁身材矮小㊁躯体畸形㊁不能生育等,还可伴发一系列内分泌异常,如糖代谢紊乱㊁甲状腺疾病等[11]㊂例6胎儿超声提示复杂先天性心脏病,羊水S N P -a r r a y 技术检查提示4号染色体4q 21.22q22.2区段存在11.5m b 片段的缺失,内含H N R N P D L ㊁D S P P ㊁P K D 2等46个OM I M 基因,已有小于和相似片段缺失与脑病(n s v 533949,杂合缺失,P a t h o ge n i c )㊁巨头畸形㊁肌张力减退(n s v 3110060,杂合缺失,P a t h o g e n i c )㊁发育迟缓(n s v 993537,杂合缺失,P a t h o g e n i c )㊁视力异常㊁隐睾症㊁癫痫痉挛㊁全面发展迟缓㊁心室肥大㊁腕骨骨化延迟㊁大头畸形(P a t i e n t :306769,P a t h o ge n i c )等临床表型相关的病例报道㊂已有研究报道在智力障碍㊁低眼压㊁矮小等临床表型相关的患者中检查到4q21.3区段的缺失[12],例6胎儿超声表型与既往报道不相符,但本研究只关注染色体微小病变,不排除基因突变㊁环境因素㊁病毒感染等因素引起例6胎儿的超声表型㊂有研究报道L O H 可能与胎儿A R S A 有关,但其机制尚不清楚[7]㊂本研究中例3㊁4分别发现染色体3p 22.1p 14.3及4q 31.23q34.1区段存在L O H ,包含多个常染色体隐性遗传疾病相关的基因,胎儿A R S A 是否与染色体L O H 的发生有关还有待更多的病例被识别和进一步的深入研究㊂孤立性A R S A 通常被认为是一种正常血管变异,大多预后良好㊂对于孤立性A R S A 胎儿是否需要进行介入性产前诊断目前仍没有较一致的观点,部分观点甚至存在冲突㊂有研究报道孤立性A R S A 胎儿预后良好,如果无创产前基因检查(N I P T )结果为低风险,则不需要进行羊水或脐血等介入性检查[13-14]㊂但B E H R AM 等[10]研究发现孤立性的A R S A 可能是21三体综合征㊁D i G e o r ge 综合征等染色体异常的唯一产前预测因子,建议应进行染色体基因组疾病筛查㊂本研究中孤立性A R S A 胎儿组染色体异常检出率为17.86%(5/28),包括3例致㊃564㊃检验医学与临床2024年2月第21卷第4期 L a b M e d C l i n ,F e b r u a r y 2024,V o l .21,N o .4病性的拷贝数变异㊁1例染色体10q22.1区段存在0.18m b片段缺失㊁1例4号染色体L O H,以上5例均不能被传统染色体核型分析技术检出,鉴于孤立性A R S A与染色体微小病变关系密切,建议进行染色体S N P-a r r a y检查以提高检出率,减少因染色体核型分析技术分辨率低而导致漏诊㊂虽然C MA对胎儿染色体疾病的诊断能力很强,但该技术常常发现许多与临床表型相关性不明确的拷贝数改变,给产前临床遗传咨询及家属带来很大的困扰[15]㊂本研究共检出5例V O U S,变异检出率为6.67%(5/75),与文献[16]报道一致㊂部分变异是健康人群的多态性表现,不具有致病性,当检出V O U S 时,建议进行亲本来源验证[17]㊂本研究中共3例V O U S进行父母验证,2例遗传自表型正常的亲代,1例为新发突变;大多数情况下,来源于父母的V O U S 倾向于可能良性[18]㊂若胎儿V O U S为新发突变,则需要结合其所涉及的基因㊁片段大小㊁胎儿影像学检查结果㊁家族史等综合评估胎儿预后[19]㊂5例V O U S 均选择继续妊娠,除1例出生后失访外,其余4例出生后电话随访家属均自述发育良好㊂本研究尚存在一定的局限性:样本量小,可能导致数据分析出现偏差;方法不够完善,基因突变导致的综合征可能出现胎儿A R S A,本研究中1例超声检查提示A R S A的胎儿,两种检测方法检查均未见异常,导致胎儿小头畸形的病因未明确,新一代测序技术能为胎儿发育异常提供更多的有用信息[20],有希望为A R S A胎儿预后的判断提供更全面的依据㊂综上所述,本研究认为A R S A(包括孤立性与非孤立性)与胎儿染色体病变(包括染色体非整倍体和微缺失微重复)关系密切,建议进行介入性产前诊断; S N P-a r r a y技术可以有效提高A R S A胎儿染色体异常的检出率,建议进行介入性产前诊断对胎儿染色体核型分析的同时进行胎儿S N P-a r r a y检查㊂参考文献[1]肖珍,尚宁,冯景煦,等.103例胎儿孤立性迷走右锁骨下动脉的染色体分析[J].国际医药卫生导报,2022,28(4): 529-531.[2]染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用协作组.染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识[J].中华妇产科杂志,2014,49(8):570-572.[3]孙丹,王小艳,罗曼曼,等.应用单核苷酸多态性微阵列芯片及核型分析检查7例21q部分三体的产前遗传学诊断[J].生殖医学杂志,2022,31(6):834-837.[4]胡仲任,陈敏,张宇,等.染色体微阵列分析技术在产前遗传性疾病诊断中的价值研究[J].中国现代医生,2017,55(30):1-3.[5]B E R I S HA S Z,S H E T T Y S,P R I O R T W,e t a l.C y t o g e-n e t i c a n d m o l e c u l a r d i a g n o s t i c t e s t i n g a s s o c i a t e d w i t h p r e-n a t a l a n d p o s t n a t a l b i r t h d e f e c t s[J].B i r t h D e f e c t s R e s, 2020,112(4):293-306.[6]A T A N A S O V A D,MA R K O V D,P A V L O V A E.A b e r-r a n t r i g h t s u b c l a v i a n a r t e r y(A R S A):a n e w u l t r a s o u n d m a r k e r f o r c h r o m o s o m a l f e t a l a b n o r m a l i t i e s[J].A k u s hG i n e k o l(S o f i i a),2015,54(4):12-17.[7]C A I M,L I N N,F A N X,e t a l.F e t a l a b e r r a n t r i g h t s u b c l a-v i a n a r t e r y:a s s o c i a t e d a n o 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95例中期唐氏筛查高风险的分析与临床策略
95例中期唐氏筛查高风险的分析与临床策略目的探讨唐氏筛查高风险病例的遗传咨询策略。
方法通过对我院2013年1月～2014年1月产前咨询的中孕期1045例孕妇进行唐氏筛查，测定中孕期孕妇血清绒毛膜促性腺激素（β-HCG）、甲胎蛋白（AFP）、非结合雌三醇（FE3）指标结合中孕期孕周、体重和年龄、病史等因素，通过免疫荧光技术及产前筛查风险评估软件进行风险评估。
结果孕中期筛查孕妇筛查出高风险95例，占唐氏筛查总例数的9.1 %。
其中唐氏综征高风险75例；18-三体综征4例；单项MOM 值异常16例。
通过在我医院筛查唐氏筛查高风险病例。
最终建议到上级医院通过选择羊膜腔穿刺术抽取羊水，进行羊水细胞培养和染色体核型分析，跟踪随访得知检出异常核型2例：46，XY，inv（Y）（P11；q12），46，XY，del（13）（p11）。
羊水细胞染色体核型多态性2例。
20～24周Ⅲ级超声发现胎儿异常3例，如无脑儿、脑积水或脊柱裂。
此外跟踪随访结果流失。
结论唐氏筛查临界风险病例的染色体异常核型以嵌合体，倒位或缺失为主，Ⅲ级超声诊断能为临床遗传咨询提供重要价值的信息。
标签：唐氏综合征；产前诊断；临床咨询唐氏综合征即21-三体综合征，又称先天愚型或Down综合征，是由染色体异常（多了一条21号染色体）而导致的疾病。
我国发病率在1/600～1/700。
唐氏综合征60%患儿在胎内早期即流产，存活者有明显的智能落后、特殊面容、生长发育障碍和多发畸形。
通过简便、经济和较少创伤的产前筛查的检测方法，从孕妇群体中发现某些有先天缺陷和遗传性疾病胎儿高风险孕妇。
检测出高风险孕妇，细胞遗传学研究发现[1]，在21号染色体长臂21q22区带为三体时，该个体具有完全类似唐氏综合征的临床表现，相反，该区带为非三体的个体则无此典型症状。
由此推论，21q22区可能是唐氏综合征的基因关键区带，又称为唐氏综合征区。
采用测定孕妇血清绒毛膜促性腺激素（β-HCG）、甲胎蛋白（AFP）、游离雌三醇（FE3）进行唐氏综合征筛查的探索已有多年，这是一种怀孕中期指标（13w 以后）[1] 。
基于单核苷酸多态性微阵列分析技术对染色体片段缺失孕妇引产选择的指导价值分析
基于单核苷酸多态性微阵列分析技术对染色体片段缺失孕妇引产选择的指导价值分析钟丽群;欧阳宁【期刊名称】《中国当代医药》【年(卷),期】2024(31)5【摘要】目的分析单核苷酸多态性微阵列(SNP-array)技术诊断胎儿染色体缺失的敏感性与准确性,探讨其在孕妇引产选择上的临床指导价值。
方法回顾性选取萍乡市妇幼保健院2020年1月至2022年5月接受孕检的有产前诊断指征如高龄、不良妊娠史、超声检查异常的1007例孕妇的临床资料,所有孕妇均行染色体核型检测,同时进行SNP-array技术完成胎儿产前遗传学诊断,根据诊断结果为孕妇提供染色体缺失对子女成长发育的危害的相关知识,由父母进行引产或继续妊娠选择。
以染色体核型检测结果为金标准,计算SNP-array技术诊断胎儿染色体异常的敏感度与准确度,分析SNP-array技术对染色体片段缺失诊断的临床价值和孕妇引产选择的指导价值。
结果经染色体核型检测共73例(7.25%)胎儿检测出染色体异常。
SNP-array技术诊断确认共108例(10.72%)胎儿检测出染色体异常,其中26例(2.58%)为染色体片段缺失。
26例染色体片段缺失案例中引产15例,继续妊娠并产出子女11例。
SNP-array检测染色体异常准确度为91.36%、敏感度为64.38%、特异度为93.47%,Kappa值=0.474。
在染色体片段缺失的诊断上,SNP-array技术检测准确度为97.91%、敏感度为100.00%、特异度为97.90%,Kappa值=0.317。
结论SNP-array技术产前遗传学诊断胎儿染色体片段缺失,指导孕妇引产结局较传统染色体核型检测良好,在提高妊娠结局上具有较高临床价值,但一致性和敏感性较差,无法单独替代染色体核型检测,临床上宜将两种检查方法联合使用以提高诊断质量。
【总页数】5页(P103-106)【作者】钟丽群;欧阳宁【作者单位】江西省萍乡市妇幼保健院产前诊断科;江西省萍乡市妇幼保健院遗传咨询科【正文语种】中文【中图分类】R714.21【相关文献】1.单核苷酸多态性微阵列芯片技术检测Prader-Willi综合征患儿染色体微缺失2.应用单核苷酸多态性微阵列技术检测胎儿染色体6p25缺失综合征3.单核苷酸多态性微阵列芯片在分析流产或死胎染色体中的应用4.染色体核型分析与单核苷酸多态性微阵列芯片技术在新生儿畸形遗传学诊断中的应用价值5.染色体微阵列分析检测不同产前诊断指征孕妇染色体微缺失/微重复的临床价值因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
高龄与血清学筛查高风险孕妇产前胎儿染色体异常及亚显微不平衡状态的比较分析
高龄与血清学筛查高风险孕妇产前胎儿染色体异常及亚显微不平衡状态的比较分析周颖;徐玲玲;张莉超;施丹华;李海波【期刊名称】《现代实用医学》【年(卷),期】2024(36)2【摘要】目的比较分析高龄与血清学筛查高风险孕妇产前胎儿染色体异常及亚显微不平衡状态。
方法收集2020年1月至2022年12月在宁波市妇女儿童医院接受羊水穿刺,并同时进行羊水染色体核型分析和染色体微阵列分析(CMA)的孕妇,其中2497例高龄孕妇和1891例血清学筛查高风险孕妇,比较分析两者产前胎儿的染色体异常及亚显微不平衡状态。
结果2497例高龄孕妇羊水染色体核型分析和CMA共检测出各种异常211例(8.45%),其中数目异常32例(1.28%),结构异常12例(0.48%),嵌合体7例(0.28%)。
10例平衡易位和5例嵌合体CMA均未见异常。
CMA提示染色体拷贝数异常(CNV)160例,36例胎儿携带致病性(P)变异或可能致病性(LP)变异(1.44%),124例胎儿携带临床意义不明性(VUS)变异(4.97%)。
1891例血清学筛查高风险孕妇羊水染色体核型分析及CMA检测共检出各种异常178例(9.41%)。
其中数目异常50例(2.64%),结构异常6例(0.32%),嵌合体5例(0.26%)。
3例平衡易位CMA均未见异常。
CMA提示CNV 117例,36例胎儿携带P CNV或LP CNV(1.90%),81例胎儿评估为VUS变异(4.23%)。
核型检出的多态性变异为正常变异,两组均未计入异常。
两组数目异常、P或LP差异均有统计学意义(均P<0.05)。
结论推荐血清学筛查高风险孕妇行羊水穿刺做染色体核型分析及CMA检测,提高胎儿染色体异常的诊断率,为临床遗传咨询提供更多、更重要的信息。
【总页数】5页(P174-177)【作者】周颖;徐玲玲;张莉超;施丹华;李海波【作者单位】宁波市妇女儿童医院【正文语种】中文【中图分类】R714.55【相关文献】1.高龄妊娠与唐氏筛查高风险的产前诊断染色体异常分析2.孕中期产前筛查高风险的胎儿染色体异常核型分析3.阳江地区产前血清学筛查高风险孕妇的羊水细胞染色体核型分析的研究4.超声NT、血清学筛查与无创产前基因检测联合筛查高危孕妇胎儿染色体非整倍体580例分析5.孕15~20＋6周产前超声筛查联合孕妇血清学筛查提高胎儿染色体异常检出率的临床研究因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
产前诊断发现孕妇自身２２ｑ１１．２缺失综合征
产前诊断发现孕妇自身２２ｑ１１．２缺失综合征谢梅花 李博洁 陈静怡 向阳海 龚燕飞 （岳阳市中心医院，湖南岳阳 ４１４０２０）【摘要】 目的 对１例无创产前检测提示２２ｑ１１．２１存在２．４Ｍｂ缺失的胎儿进行产前诊断，确定缺失来源，为其家系提供遗传咨询。
方法 行羊水穿刺术后，通过常规染色体核型分析和基因组拷贝数变异测序（ｃｏｐｙｎｕｍｂｅｒｖａｒｉａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，ＣＮＶ ｓｅｑ）对胎儿进行产前诊断，应用ＣＮＶ Ｓｅｑ技术对母亲外周血进行比对分析。
以明确无创提示的高风险的来源。
结果 无创补充报告提示２２ｑ１１．２缺失综合征高风险；胎儿羊水染色体核型：４６，ＸＮ，２１Ｐｈ＋，胎儿羊水ＣＮＶ Ｓｅｑ结果：Ｓｅｑ（１ ２２）ｘ２，（Ｘ，Ｎ）ｘ１；孕妇外周血ＣＮＶ Ｓｅｑ结果：ｓｅｑ［ｈｇ１９］２２ｑ１１．２１（１８，９５４，４５２ ２１，４４９，６０６）ｘ１，即母亲２２ｑ１１．２１区域存在片段大小约２．４Ｍｂ的拷贝数缺失，为致病性拷贝数变异。
考虑之前无创结果２２ｑ１１．２缺失综合征高风险是因为母亲本身为该疾病的患者。
结论 无创提示２２ｑ１１．２缺失综合征高风险为母亲本身为该疾病的患者，胎儿未遗传。
【关键词】 ＣＮＶ Ｓｅｑ；产前诊断；２２ｑ１１．２微缺失综合征；胎儿未遗传【中图分类号】 Ｒ７１４．５５ 【文献标识码】 Ａ犇犗犐：１０．１３４７０／ｊ．ｃｎｋｉ．ｃｊｐｄ．２０２２．０２．００５ 通信作者：龚燕飞，Ｅ ｍａｉｌ：１６６３１２０４１７＠ｑｑ．ｃｏｍ犃犿犪狋犲狉狀犪犾２２狇１１．２犱犲犾犲狋犻狅狀狊狔狀犱狉狅犿犲狑犪狊犱犲狋犲犮狋犲犱犫狔狆狉犲狀犪狋犪犾犱犻犪犵狀狅狊犻狊犡犻犲犕犲犻犺狌犪，犔犻犅狅犼犻犲，犆犺犲狀犑犻狀犵狔犻，犡犻犪狀犵犢犪狀犵犺犪犻，犌狅狀犵犢犪狀犳犲犻 犢狌犲狔犪狀犵犆犲狀狋狉犪犾犎狅狊狆犻狋犪犾，犢狌犲狔犪狀犵４１４００，犎狌狀犪狀，犆犺犻狀犪 犆狅狉狉犲狊狆狅狀犱犻狀犵犪狌狋犺狅狉：犌狅狀犵犢犪狀犳犲犻，犈 犿犪犻犾：１６６３１２０４１７＠狇狇．犮狅犿【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Ｔｏｐｅｒｆｏｒｍｐｒｅｎａｔａｌｄｉａｇｎｏｓｉｓｆｏｒａｆｅｔｕｓｗｉｔｈ２２ｑ１１．２ｄｅｌｅｔｉｏｎｆｏｒ２．４ＭｂａｆｔｅｒＮＩＰＴｔｅｓｔ．犕犲狋犺狅犱狊 Ｇ ｂａｎｄｅｄｋａｒｙｏｔｙｐｉｎｇ，ｇｅｎｏｍｅｃｏｐｙｎｕｍｂｅｒｖａｒｉａｔｉｏｎｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ（ＣＮＶ ｓｅｑ）ｗｅｒｅｐｅｒｆｏｒｍｅｄｆｏｒｔｈｅｆｅｔｕｓ．ＴｈｅｐｅｒｉｐｈｅｒａｌｂｌｏｏｄｏｆｍｏｔｈｅｒｗａｓａｎａｌｙｚｅｄｂｙＣＮＶ ｓｅｑｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙｔｈｅｓｏｕｒｃｅｏｆｇｅｎｏｍｉｃｖａｒｉａｔｉｏｎｓ．犚犲狊狌犾狋狊 Ｔｈｅｆｅｔｕｓｓｈｏｗｅｄａｎｏｒｍａｌｋａｒｙｏｔｙｐｅｏｆ４６，ＸＮ，２１Ｐｈ＋．ＣＮＶ ｓｅｑａｎａｌｙｓｉｓｃｏｎｆｉｒｍｅｄｔｈａｔｔｈｅｐｅｒｉｐｈｅｒａｌｂｌｏｏｄｏｆｍｏｔｈｅｒｈａｓａ２．４Ｍｂｄｅｌｅｔｉｏｎ（１８，９５４，４５２ ２１，４４９，６０６）ａｔ２２ｑ１１．２，ｗｈｉｌｅＣＮＶ ｓｅｑａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅｆｅｔｕｓｗａｓｎｏｒｍａｌ．犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Ｔｈｅｍｏｔｈｅｒｗａｓｃｏｎｓｉｄｅｒｅｄａｓａｐａｔｉｅｎｔｗｉｔｈ２２ｑ１１．２ｄｅｌｅｔｉｏｎｓｙｎｄｒｏｍｅ，ｔｈｅｆｅｔｕｓｄｉｄｎｏｔｉｎｈｅｒｉｔ２２ｑ１１．２ｄｅｌｅｔｉｏｎｓｙｎｄｒｏｍｅｆｒｏｍｔｈｅｍｏｔｈｅｒ．【犓犲狔狑狅狉犱狊】 ＣＮＶ Ｓｅｑ；Ｐｒｅｎａｔａｌｄｉａｇｎｏｓｉｓ；２２ｑ１１．２ｄｅｌｅｔｉｏｎｓｙｎｄｒｏｍｅ；Ｎｏｒｍａｌｆｅｔａｌ ２２ｑ１１．２缺失综合征由２２号染色体长臂发生１．５～３Ｍｂ微缺失引起，总体发生率占活产儿的１／６０００～１／４０００，表型谱表现出广泛的变异性，可出现在任何年龄，典型的临床特征：心脏缺陷、免疫缺陷、短暂性新生儿低血钙症、腭咽功能不全和独特的面部外观、精神行为异常和智力落后等［１，２］。
74例NIPT高风险孕妇的羊水产前诊断结果分析
74例NIPT高风险孕妇的羊水产前诊断结果分析发布时间：2021-04-02T13:53:25.497Z 来源：《医师在线》2020年11月22期作者：何芳[导读] 探讨NIPT技术对筛查胎儿染色体异常的应用价值。
何芳（广西玉林市妇幼保健院检验科；广西玉林537000 ）摘要：目的探讨NIPT技术对筛查胎儿染色体异常的应用价值。
方法回顾性分析2019年1月-12月在玉林市妇幼保健院优生遗传科就诊的74例NIPT高风险孕妇行羊膜腔穿刺羊水染色体核型及CMA检测数据分析。
结果：在74例无创高风险中，检出染色体异常31例，检出率41.89%。
其中无创21三体的阳性预测值为84.21%，18三体的阳性预测值为66.67%，13三体的阳性预测值为33.33%，性染色体异常的阳性预测值为37.04%，其他染色体的微缺失或微重复的阳性预测值为9.09%，结论：NIPT 可应用于胎儿染色体非整倍体异常及胎儿CNVs，以达到早发现、早诊断，减少出生缺陷。
关键词：产前诊断；羊水穿刺；染色体核型分析中图分类号：R714.53? 文献标识码：A 无创产前检测(non-invasive prenatal testing， NIPT)是指通过扩增孕妇外周血中的胎儿细胞特别是游离胎儿DNA片段，采用高通量测序技术对其进行测序，判断胎儿是否存在染色体异常的方法。
NIPT具有简便、无创、特异性高，检测快速等优点，是一种接近诊断的高级筛查方法。
本文对74例NIPT高风险孕妇的羊水产前诊断结果分析，探讨NIPT技术对筛查胎儿染色体异常的应用价值。
1 资料与方法1.1临床资料2019年1月-12月在玉林市妇幼保健院优生遗传科就诊的74例NIPT高风险孕妇行羊水染色体核型及CMA检测，孕妇年龄21-38岁，孕周18-24周。
所有研究对象均签署知情同意书并获得医院医学伦理委员会批准。
1.2方法1.2.1 G带核型分析在无菌条件下，经B超引导定位抽取羊水24ml，分3支15ml无菌离心管盛装（2支用于细胞培养，另一支用于DNA检测）送检。
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单核苷酸多态性芯片与染色体核型分析在唐氏筛查高风险孕妇产前诊断中的比较研究白小艺;章钧;田琪;林俊伟;侯红瑛【摘要】[ ABSTRACT] AIM:To evaluate the clinical application of single nucleotide polymorphism array ( SNP array) in prenatal diagnosis for screening the abnormality of women with Down’ s syndrome( DS) .METHODS:The amniotic fluid samples ( n=312) collected by amniocentesis for the DS screening abnormality women were tested by karyotyping and SNP array analysis, respectively.The findings of karyotyping and SNP array analysis were compared.RESULTS:Two cases of trisomy 21 were identified by karyotyping and SNP array analysis, but SNP array analysis failed to identify 6 cases of chro-mosome balanced structural rearrangement.SNP detected 176 cases copy number variants ( CNVs) in 303 cases normal karyotype were detected by SNP, including 106 benign CNVs, 61 variants of unknown significance (VOUS), 9 de novo CNVs, and none of them was pathogenic.The distribution difference of CNVs in DS screening positive group and DS screening positive plus advanced maternal age group was not statistically significant( P>0.05) .Furthermore, we reported 14 kinds of CNVs for the first time in population.CONCLUSION:SNP array can further assure chromosome microdupli-cation/microdeletion.In normal karyotype fetus of prenatal diagnosis, SNP can detect some clinical significant CNVs.%目的：探讨单核苷酸多态性芯片（ SNP array）在唐氏筛查高风险孕妇胎儿染色体分析中的应用价值。
方法：选取312例因唐氏筛查高风险的孕妇，行羊膜腔穿刺术后获得羊水，对羊水进行G显带核型分析和SNP array检测，比较核型分析与SNP array检测结果，并按年龄分组比较拷贝数变异（ CNVs）的发生率差别。
结果：核型分析和SNP array均准确发现2例21三体（0.64％），6例核型分析提示染色体平衡重组（1.92％）的样本经SNP array分析证实不存在重排片段重复或缺失。
在303例核型正常的胎儿羊水细胞中， SNP array检测发现176例CNVs，其中良性CNVs 106例，临床意义不明确的CNVs（VOUS）61例，新发CNVs（de novo CNVs）9例，未发现已知的致病性CNVs。
唐氏筛查高风险组与唐氏筛查高风险合并高龄组CNVs的分布差别无统计学意义（ P＞0.05）。
此外，本研究中首次报道14种CNVs。
结论： SNP array 可进一步确定核型分析的平衡易位是否存在染色体微缺失／重复。
在核型正常的胎儿中，SNP array可检测出大量拷贝数异常，发现14种新的CNVs但现有数据库无法判断其临床意义，需进一步研究确认。
此外，孕妇年龄对胎儿基因组中新发CNVs的发生率无明显影响。
【期刊名称】《中国病理生理杂志》【年(卷),期】2015(000)004【总页数】6页(P707-712)【关键词】单核苷酸多态性芯片;染色体核型分析;拷贝数变异;产前诊断【作者】白小艺;章钧;田琪;林俊伟;侯红瑛【作者单位】中山大学附属第三医院产科，广东广州 510630;中山大学附属第三医院产科实验室，广东广州 510630;中山大学附属第三医院产科实验室，广东广州 510630;中山大学附属第三医院产科实验室，广东广州 510630;中山大学附属第三医院产科，广东广州 510630【正文语种】中文【中图分类】R71420世纪70年代,以G显带技术为主的染色体核型分析在产前诊断中开始应用,可减少染色体数目和结构异常的胎儿出生的数量, 提高人口出生素质。
但每年仍有0.65%新出生人口存在染色体异常导致先天性疾病的发生，0.2%新出生人口存在染色体重排并影响其生殖功能[1-2]。
核型分析能检测出染色体数目异常，不平衡结构畸形，明显的平衡结构异常等染色体畸变，但核型分析存在检测深度低、耗时长、培养失败率较高、判读结果主观及易发生人为错误等缺点，使它在产前诊断的应用存在一定的局限性[3]。
近年来，以微阵列-比较基因组杂交(array comparative genomic hybridisation,aCGH)和单核苷酸多态性芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP array)为平台的染色体微阵列技术(chromosome microarray analysis,CMA)用于临床细胞遗传学领域及染色体病的研究，可对染色体亚微结构异常进行诊断定位。
CMA在产后发育迟缓/智力障碍、自闭症谱系障碍和多发性先天畸形疾病中检测出比核型分析高15%～20%检出率，可取代G显带分析技术，成为一线检测手段[4-6]。
但其在产前诊断中，特别是对于唐氏筛查高风险的孕妇进行产前诊断的应用价值尚不明确。
为了研究SNP array是否比传统核型分析对遗传物质的异常具有更高检出率，我们对312例因唐氏筛查高风险而行产前诊断的孕妇胎儿样本进行了核型分析和SNP array检测，探讨SNP array在唐氏筛查高风险孕妇人群中的应用价值。
1 研究对象2013年3月～2014年8月在中山大学附属第三医院因唐氏筛查高风险(早孕或中孕唐氏筛查21三体风险值≥1∶270)行羊膜腔穿刺术进行产前诊断的孕妇，排除染色体培养失败和(或)SNP array分析失败以及拒绝行SNP array检测的病例，共收集312例孕妇的羊水标本成功进行核型分析及SNP array检测。
312例孕妇的一般情况如表1所示。
2 核型分析实验步骤行羊膜腔穿刺术抽取羊水20 mL，分离后加入Gibco羊水培养基，置于37 ℃、5% CO2中培养10～14 d，收获羊水细胞经过消化、固定、制片、烤片、显带与染色制得玻片。
最后在油镜下计数分析细胞核型。
每1标本计数20个核型，至少分析3个核型，记录核型分析结果。
3 SNP array检测过程2013年3月1日～2013年6月5日共有50例孕妇羊水细胞SNP array采用Illumina Human Cyto SNP12芯片(含30万个遗传标记探针)进行分析，2013年6月6日～2014年8月31日共有262例孕妇羊水细胞SNP array采用OmniZhongHua-8(含90万个遗传标记探针)进行分析。
基本步骤包括提取羊水细胞DNA,DNA扩增、片段化、沉淀、重悬、与芯片杂交、芯片的延伸、染色及包被、芯片扫描及数据分析等。
SNP array发现的拷贝数变异(copy number variants,CNVs)>100 kb则通过实时荧光PCR、多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)或高通量测序进行确定。
对CNVs的性质和判读参考实验室内部数据库、在线公共数据库DECIPHER、ISCA、DGV和Pubmed。
根据检索的结果及父母的比对，将CNVs分为良性(benign)CNVs、致病性(pathogenicity)CNVs、不明意义的CNVs(variants of unknown significance，VOUS)、未包含基因片段的无义(no significance)CNVs 及新发现(de novo)CNVs[5]。
4 统计学处理采用统计软件SPSS 19.0处理,定量资料的描述性分析以均数±标准差(mean±SD)表示,两组间分类资料的比较使用2检验，以P<0.05为差异有统计学意义。
1 核型分析结果312例孕妇羊水细胞经过培养后均成功进行核型分析，303例胎儿核型呈正常核型，占所有孕妇97.12%； 21三体综合征的胎儿2例，占0.64%；染色体臂间倒位5例，占1.60%，其中发生在5号染色体1例，9号染色体4例；嵌合型染色体易位1例，是发生在8号和11号染色体之间的易位；嵌合型marker染色体1例，见表2。
2 SNP array结果分类在312例孕妇的羊水细胞进行SNP array检测,排除<100 kb的检测结果，归纳相同种类的CNVs后，共检测出325种≥100 kb的CNVs,其中87种CNVs内未包含或覆盖基因,即为无义CNVs，占26.77%；在238种包含基因的CNVs中，其中良性CNVs有179种，占55.08%； VOUS有45种，占13.84%;未发现明确致病性CNVs。
在检测出的CNVs中，良性和无义的CNVs占多数，为81.85%(266/325)。
上述CNVs中未在数据库中有报道我们新发现的CNVs有14种，占4.31%，见表3。
3 对染色体畸变检测结果比较染色体畸变，即染色体数目和结构异常，核型分析检出率为2.88%(9/312),包括数目异常3例(2例为21三体和1例marker染色体)和结构异常(染色体臂间倒位5例和易位1例)，见表2。