贵州黑山羊和黔北麻羊MSTN基因DraI酶切多态性分析

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贵州地方山羊CPT-1A基因在不同品种和组织中的表达差异

贵州地方山羊CPT-1A基因在不同品种和组织中的表达差异
浙江农业学 报 A c t a A g r i c u l t u r a e Z h e j i a n g e n s i s , 2 0 1 5 , 2 7 ( 6 ) : 9 2 1— 9 2 6
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杨 家大.贵州地方 山羊 C P T - 1 A基 因在不 同品种 和组织 中的表达差异 [ J ] . 浙江农业学报 , 2 0 1 5 , 2 7 ( 6 ) : 9 2 1 — 9 2 6 .
h e a r t s , l u n g s , l o n g i s s i mu s mu s c l e , a m n i o n m u s c l e a n d s u b c u t a n e o u s a d i p o s e w e r e d e t e c t e d b y r e  ̄, t i m e f l u o r e s c e n c e
A bs t r a c t:I n o r d e r t o r e v e a l b r e e d di f f e r e n c e s a n d t i s s ue di f f e r e n c e s o f C PT - 1 A m RNA l e v e l s i n Gui z ho u n a t i v e g o a t s
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YANG J i a . d a
( C o l l e g e o f E n v i r o n m e n t a l a n d L i f e S c i e n c e s , K a i l i U n i v e r s i t y , K a i l i 5 5 6 0 1 1 ,C h i n a )

贵州4个山羊群体mtDNACytb基因多态性研究

贵州4个山羊群体mtDNACytb基因多态性研究

贵州 山羊 是 我 国优 良地 方 品 种 ,具有 肉质 好 ,
板 皮 张 幅 大 , 应 性 、 病 性 强 , 殖 性 能 好 等 特 适 抗 繁
Ge tc Di e st nei v r iy Ana y i - l ssof A
Ge nd Is Co r l to ne a t r e a i n t ik Pe f r a e i o h r h M l r o m nc n S ut e n Chi e e Ho se n n s lt i
g n x n 2 x n 4,e o 6 x n 3 n Ch n s lti o u ain wa ee td u ig P e e e o ,e o x n 2 ,e o 4 i ie e Hosen p p lt s d tc e sn CR —S CP i h s su y o S n ti td .
2S a g a B g t l enC .t, h n h i2 0 7 , hn ) .h n h i r h s i oLd S a g a 0 0 2C ia i Ho t
A sr c: a y c n ae(A N p y e pr n l i m m aa ty t s . h o m rhs f A N bta t Ft i s t s F S ) l s r i o ato a m l nf n ei T e l o i o F S ta d y h a v y m t ren i as h s py p m
片段进行 测序分析和 比较 。结果表 明:5条 山羊的 C t 基 因序列均为 110 p的 同源基 因序列 ; 5 yb 4 b 总共发现 1 个 1
变异住 点, 观察到 1 0种单倍型 ; 4个山羊群体 中单倍型 多样性 为 04 2,89 核 苷酸 多样度 为 00 15'02 。 . ,. , 4' 8 - 0 . 4 - . 5 贵 0 - 0 0 州山羊的遗传 多样性处 于中等水 平 ; 州山羊可分为两大类群 , 贵 即贵州黑 山羊和贵 州麻 羊 2个群体 为一类 ; 州 贵

山羊MSTN基因研究进展及其在甘肃本地山羊上的应用,检测报告

山羊MSTN基因研究进展及其在甘肃本地山羊上的应用,检测报告

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山羊MSTN基因研究进展及其在甘肃本地山羊上的应用杨军祥(甘肃省畜牧兽医研究所,甘肃平凉744000)251345991摘要:肌肉生长抑制素(MSTN),又被称为生长分化因子8(GDF-8),是转化生长因子β超家族成员之一,广泛分布于脊椎动物体内,在维持动物机体组织稳态、胚胎发育、骨骼肌生长发育等方面发挥重要的调控作用,该基因的变异、缺失或抑制其表达量等可能会导致肌肉的过度肥大。

本文主要通过对M STN基因的结构和特征,生物学功能、多态性信息及调控机制等方面的研究进展进行简单综述,探讨MS TN基因与山羊生长性状的关系及其在经济性状标记辅助选择方面的应用前景,为相关领域的科研工作者提供参考。

关键词:肌肉生长抑制素(MSTN);生物学特征;调控机制;研究进展[中图分类号] S827[文献标识码] AAbstract: MSTN gene, also known as growth differentiation factor 8 (GDF-8),is the member oftran sforming growth factorbeta superfamily (TGF-βs), which widely distributes in vertebrates and plays the mp ortant regulatory roles in maintainingsteady state of animals, embryo development, skeletal muscle growth and development, etc.The mutation, deficiency and abnormal expression of MSTN gene may lead to hyp ertrophy of muscles. This study mainly summarizes the structure, characteristic, biology characteristic, pol ymorphism and regulatory mechanism of MSTN gene, to evaluate the relationship between MSTN genean dgrowth trait of goat, and the application prospect in marker assisted selection of economic trait, this stu dy may provide some foundation for researchers in related field.Keywords: MSTN gene; biology characteristic; regulatory mechanism; research progres肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN),又被称为生长分化因子8(growth differentiation factor 8,GDF-8),是转化生长因子β (transforming growthfactor-β,TGF-β)超家族成员之一,于1997年首次被发现。

麻城黑山羊微卫星标记多态性分析

麻城黑山羊微卫星标记多态性分析

麻城黑山羊微卫星标记多态性分析摘要:为了解麻城黑山羊群体的遗传多样性,选择了位于不同染色体上、具有较高多态性的10个微卫星标记,对麻城黑山羊群体进行研究。

结果表明,BM1329等10个微卫星标记共检测到171个等位基因,每个标记都检测到9个以上(平均为17.1个)的等位基因,有效等位基因数为7.1~18.1个,基因频率最高的是OarAE101标记的100 bp片段(0.239 1);10个微卫星标记多态信息含量(PIC)都在0.95以上,均为高度多态标记,遗传多样性丰富,其中BMS1591标记的多态信息含量(PIC)最高,为0.996 9,各标记的平均杂合度在0.707 4~0.976 5之间,遗传杂合度在0.859 0~0.944 6之间,平均遗传杂合度为0.906 7,属于高度杂合标记和高度杂合品种,遗传变异大。

关键词:微卫星标记;遗传多态性;麻城黑山羊麻城黑山羊产于大别山及其周边的广大地区,主产区在湖北麻城市,是优良的黑色地方品种资源。

对于麻城黑山羊的相关研究,过去多限于体型外貌、体尺测量、生产性能测定等方面,很少在分子水平上开展研究,品种的选育尚停留在常规育种领域,严重阻碍了该品种的选育提高和进一步发展。

微卫星(Microsatellite)是广泛分布于生物基因组中的简单重复序列,20世纪80年代,Miesfeld等[1]在人类基因组的研究中首先发现了微卫星DNA,它一般由2~6个碱基组成核心单元,重复几次至几十次不等,数量庞大且分布均匀,在染色体上平均每10kb就出现一个,同时具备保守性、等显性遗传、多态性丰富、易被检测、进化所受选择压力小等特点,在物种遗传图谱构建、品种遗传多样性分析、种间遗传距离估测、亲子鉴定、数量性状基因座(QTL)的检测与定位、杂交优势预测等方面具有很大的应用价值,也使之成为继RFLP之后的第二代分子标记技术,被广泛应用于羊的遗传育种领域,为羊育种开辟了一条新的途径。

会理黑山羊肌肉生长抑制素基因编码序列的克隆与多样性分析

会理黑山羊肌肉生长抑制素基因编码序列的克隆与多样性分析

会理黑山羊肌肉生长抑制素基因编码序列的克隆与多样性分析张文丽【摘要】为探究会理黑山羊遗传分化状况,试验参考普通山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因设计引物,采用PCR方法扩增、克隆会理黑山羊MSTN基因编码区,并与其他物种相应基因编码区核苷酸序列进行比对分析.结果表明,会理黑山羊MSTN 基因完整编码序列长度为1128 bp,由外显子1(372 bp)、外显子2(375 bp)和外显子3(381 bp)组成;会理黑山羊与建昌黑山羊、黔北麻羊同源性最高,均达97.4%,聚为一簇,亲缘关系最近,与牛、恒河猴、狗等物种的同源性最低,亲缘关系远;会理黑山羊MSTN基因编码区共编码375个氨基酸,会理黑山羊MSTN基因编码的各种氨基酸含量相差较大,其中以亮氨酸含量最丰富,达8.80%.本研究为会理黑山羊的遗传资源保护、开发与利用提供了分子遗传学研究基础.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2013(040)012【总页数】5页(P146-150)【关键词】会理黑山羊;肌肉生长抑制素基因;多样性分析【作者】张文丽【作者单位】西昌学院动物科学学院,四川西昌 615013【正文语种】中文【中图分类】S827.9+2肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)又称为生长分化因子8(growth differentiation factor-8,GDF8),是转化生长因子(transforming growth factor beta,TGF-β)超家族成员。

研究结果表明,肌肉生长抑制素是一种分泌蛋白,作为负调节骨骼肌生长的活性因子,直接或间接控制肌细胞生长发育且能控制肌肉量的增长(Gay等,2012)。

科学家对小鼠、猪、牛、鸡、鸭及鹅的MSTN基因做了大量研究(李聚才等,2012;李帅等,2011),一致认为该基因的多态性与生长发育相关,且负调控肌细胞生长发育,在MSTN基因缺失的动物模型中除影响骨骼肌发育外,还对脂肪沉积起抑制作用,因此,MSTN基因的多态性可作为选择肌肉性状和胴体性状的分子标记(Bellinge等,2005)。

贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析

贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析
中图分类号: Q811. 4 ; Q343. 1 + 12 ; Q343. 1 + 7 文献标识码: A doi: 10. 3969 / j. issn. 1004 - 311X. 2014. 04. 0087
Bioinformatics Analysis on the SNP of Promoter Region of TFB1 M Gene in Local Goat in Guizhou Province
贵州本地山羊 TFB1 M 基因启动子区多态性生物信息学分析
孙岩岩, 罗卫星, 谢海强, 宋桃伟, 刘彬, 蔡惠芬
*
( 贵州大学动物科学学院 / 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室 , 贵州 贵阳 550025 ) 摘要: 目的: 采用 DNA 池结合 PCR 技术, 筛选 TFB1 M 基因启动子区 SNP 位点, 并分析其对启动子区的影响 。 方法: 利用多 CpG 岛。结果: TFB1 M 基因启动子区发现 1 个 SNP 位 转录因子结合位点、 种生物信息学软件预测 TFB1 M 基因核心启动子范围、 点 G - 234A。TFSEARCH 软件预测结果显示 TFB1M 基因启动子区转录因子 ADR1 与 Sp1 位置调换, 且 ADR1 位置的提前导致 TFB1 M 基因转录效率增高。结论: G - 234A 位点可能影响 TFB1 M 基因转录, 试验结果为进一步分析 TFB1 M 基因启动子区功能 奠定基础。 关键词: TFB1 M; SNP; 启动子
J] . Nucleic Acids Research, rapid annotation of ribosomal RNA genes [ 2007 , 35 ( 9 ) : 3100 - 3108. [ 11]Rttig M, Medema MH, Blin K, et al. NRPSpredictor2 - a web server J] . Nucleic Acids Refor predicting NRPS adenylation domain specificity [ search, 2011 , 39 ( suppl 2 ) : W362 - W367. [ 12]Tamura K, Stecher G, Peterson D, et al. MEGA6 : Molecular EvolutionJ] . Molecular Biology and Evoluary Genetics Analysis Version 6. 0 [ tion, 2013 , 30 ( 12 ) : 2725 - 2729. [ 13]Han D, Hu Z. Mutations stabilize small subunit ribosomal RNA in des. Current Microbiology, 2007 , iccation - tolerant cyanobacteria Nostoc [J] 54 ( 4 ) : 254 - 259. [ 14]Cai F, Axen SD, Kerfeld CA. Evidence for the widespread distribution of CRISPR - Cas system in the Phylum Cyanobacteria [J] . RNA Biology, 2013 , 10 ( 5 ) : 687 - 693. [ 15]Delaye L, Moya A. Abundance and distribution of the highly iterated palindrome 1 ( HIP1 ) among prokaryotes [ J] . Mobile Genetic Elements, 2011 , 1 ( 3 ) : 159 - 168. [ 16]Griffiths - Jones S, Moxon S, Marshall M, et al. Rfam: annotating non J] . Nucleic Acids Research, 2005 , - coding RNAs in complete genomes [ 33 ( suppl 1 ) : D121 - D124. [ 17]Shih PM, Wu D, Latifi A, et al. Improving the coverage of the cya. Pronobacterial phylum using diversity - driven genome sequencing [J] 2013 , 110 ( 3 ) : 1053 ceedings of the National Academy of Sciences, - 1058. [ 18]Cao H, Shimura Y, Masanobu K, et al. Draft genome sequence of the toxic bloom - forming cyanobacterium Aphanizomenon flos - aquae NIES - 81 [ J] . Genome Announcements, 2014 , 2 ( 1 ) : e00044 - 00014. [ 19]Stolyar S, Liu Z, Thiel V, et al. Genome sequence of the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus sp. strain NK55a [ J] . Genome An2014 , 2 ( 1 ) : e01060 - 01013. nouncements, [ 20]Morris J, Crawford T, Jeffs A, et al. Whole genome re - sequencing of two ‘wild - type’ strains of the model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC J] . New Zealand Journal of Botany, 2014 , 52 ( 1 ) : 36 - 47. 6803 [ [ 21]Fujisawa T, Okamoto S, Katayama T, et al. CyanoBase and RhizoBase: databases of manually curated annotations for cyanobacterial and rhizobial . Nucleic Acids Research, 2014 , 42 ( D1 ) : D666 - D670. genomes [J]

贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异

贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异

贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异杨家大【摘要】[目的]揭示贵州地方山羊瘦素基因(Leptin)表达水平的组织分布规律及品种差异,为研究Leptin基因与山羊肉质的关系提供参考依据.[方法]以黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊4个贵州地方山羊为研究对象,南江黄羊为对照,采用TaqMan实时荧光定量PCR对其肝脏、肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中的Leptin基因表达水平进行测定.[结果]Lptin基因在不同山羊品种的肝脏、肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中呈高表达,均以皮下脂肪的Leptin基因表达水平最高,且在黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊4个贵州地方山羊品种中,皮下脂肪中的表达水平显著高于心脏、肺脏、背最长肌和半膜肌(P<0.05).除肝脏内Leptin基因表达水平在各品种间无显著差异(P>0.05)外,在肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌、皮下脂肪中的表达水平均存在品种差异,且以贵州白山羊最高.[结论]贵州地方山羊品种Leptin基因表达的组织分布规律相似,均以皮下脂肪最高,在品种方面则以贵州白山羊的整体表达水平较高.【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2015(046)005【总页数】6页(P876-881)【关键词】贵州地方山羊;Leptin基因;组织分布;品种差异【作者】杨家大【作者单位】凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里556011【正文语种】中文【中图分类】S827.890 引言【研究意义】贵州地方山羊品种资源丰富,如贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、黔东南小香羊等。

这些山羊品种适宜山地放牧、抗逆性强、繁殖力高、育肥性能好、肉质优良,在我国山羊品种资源中占据重要位置,尤其是黔东南小香羊膻味轻、肉质细嫩多汁,是山羊肉产品之上品(陈祥等,2004)。

因此,研究贵州地方山羊品种的肉质形成机制对大力发展贵州生态养羊业具有重要意义。

我国主要地方山羊品种MSTN基因的MnlⅠ酶切多态性分析

我国主要地方山羊品种MSTN基因的MnlⅠ酶切多态性分析
在编码区发现了1个ct的沉默突变并没有导致氨基酸的变化810j而驴g虽是沉默突变但其与猪的背膘厚呈显著相关11在羊的研究中marcq等16j分析了比利时texel双肌绵羊的可能遗传机制与普通绵羊romanov相比双肌羊的mstn基因的编码区虽然没有碱基的差异但采用该基因侧翼序列的微卫星标记进行连锁分析表明在绵羊染色体2q远端区存在1个对肌肉发育产生效应的qtl数量性状遗传位点该基因座可能就是mstn基因据此推断影响该基因表达的区域很可能在c端或n端的非翻译区域或内含子部分
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河 南农 业科 学
我 国 主 要地 方 山羊 品种 MS N 基 因的 T M 工酶 切 多 态 性 分 析 n l
刘铮铸 1 , 祥龙 , ,李 2 , 巩元 芳 李 金泉 ,
(. 1 河北科技 师范学院动物科学系 , 河北 昌黎 0 6 0 ;2 内蒙古农业大学动物科 学与医学学院 , 660 . 内蒙古 呼和浩特 0 0 1 ; 10 8 3河北农 业大学动物科技学院 , . 河北 保定 0 10 ) 7 0 1
fam e twe eco e n e u n e .Th e ut h we h ti 7 b B g n t p a n u si — rg n r ln da dsq e c d ers l s o d t a n3 9 p, B e oy eh do es b tt u
r go so S e in fM TN e e gn .
Ke od :G a;M S yw rs ot N:G n t l rhs ; F P; n e ei p y p i c o mo m R L M l I
肌 肉抑 制 素基 因 ( ott , T 又 称 生 长 Mys i MS N) an
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对该序列进行 多态性分析。结果表 明:E P R扩增 片段 2 7b 处存在 唧 0 p
合野生型 ( ) 从 为优势基 因型, 杂合型 ( B 和纯 合突 变型( B 为非优 势基 因型, A ) B ) A等位基 因为优 势基 因; 黔北麻 羊 纯合 野生 型 ( c 为优势基 因型, c ) 杂合 型( D 和纯合突变型( D 为非优势基 因型, C ) D ) c等位基 因为优势基 因。 关键 词 : 贵州黑 山羊 ; 黔北麻羊 ; S N基因; C —F P 多态性 MT P RR L ;
自从 M hr n等 首 次在 小 鼠骨 骼 肌 中发 现 了 cP e o r MS N基 因并 确 定其 表达 产 物 具有 特 异 的抑制 骨 骼 T 肌生长发育的功能 以来… , 已有众多 国内外 学者对 猪 、 ’ 、 牛 一 羊 ’ 鸡 ’l 、 。 和鱼 的 MS N基 因 T 做 了大量研究 , 并发现其多态性与动物生长 发育有 极 显著 相 关性 。但 到 目前 为止 , 贵 州黑 山羊 和 黔 对 北麻 羊 MS N基 因 D a 酶 切 多态 性 的研 究 未 见 报 T rI
西

农 2 5卷 1 期
V0 5 L2 No 1 .
S uh s iaJuna fAgiutrlS in e o twetChn o r lo r l a ce c s c u
文章编号 :0 1— 89 2 1 ) 1 2 2 4 10 4 2 (0 2 0 —08 一o
中图分类号 :8 7 S2 文献标识码 : A
Poy o p im a y i fM S lm r h s An lsso TN n g se t Ge e Die td wih
DrIo ih u B a kGo ta d Qin e a a f Guz o lc a n a b i MaGo t
ga W datg e o p hl e rzgu p A adhm zgu ua tye( B eedsdatg eoye. eew ga ot a a vnaegnt e i ht oyo sy e( B) o oy osm tn p B )w r i v aegnt s A gn a g y w e e t n t a n p
Abta tBakC a n ine ot eet e s tr l i i u y r rw sds ndbsdo ot MS N g nt e src: lc ot dQa bi G a w r k na e a t s ta ,ap me a ei e ae ngas ' e ec8- a Ma a ma i s n h s i g I i q ecs G n a krg t t nn m e:E 5 8 3 ) adP R R L ehdw gue oaayetesqe csp l rhs T ersl un e( e B n ir i u br F 8 0 5 ,n C ・ F Pm to a sdt nlz eu ne oy p i e sao h mo m. h ut e s
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Ke r s: a MS N e e;PC RFL y wo d Go t; T g n R・ P;P lmo p i m oy rh s
肌 肉生 长抑 制 素 ( ys t MS N) M ot i an, T 属于 转 化生
长 因 子一 ( rnf mi r t at e , G . ) 1 Ta s r n G o h F c rbt T F B 3 o g w o a
道 。为此 , 笔者 采 用 P RR L C —F P方 法 分 析 贵 州 黑 山
超 家族 成员 , 是一 种 在骨 骼 肌 中广 泛存 在 的糖蛋 白。
羊和黔北麻羊 M T S N基因 5侧翼 区的遗传多 态性 , 为研究 M T SN基因与山羊生长性 能相关 的多态性 位点 提供分子遗传学资料, 同时为其选育提供理论基础。
s o d h tte唧 h we ta h ^ isr xse n2 7 b 1d t e e re c a n y oy r hs st. moy o swi y fba k n et it i 0 p.e ot meg n eo a DrIe zmep lmop im i Ho zg u l tpeo lc e d h f e d
F NG H iiS I hoyn ,I N Xn -u‘, U Y exu Z igLU R oy E u- ,H a-ig TA igg i Q u -i,HU Xn 。I u -u l Z
( ol eo i a Si c , uzo nvrt, uzo uyn 505,hn ) C lg f m l ce e G i uU iesyG i uG iag50 2 C i e An n h i h a
贵 州黑 山羊和 黔北麻羊 M T S N基 因 Da 酶切 多态 性分析 rI
冯会 利 , 照应 , 石 田兴 贵 , 月 秀 , 曲 主 性 , 若余 刘
( 贵州大学动物科 学学 院, 贵州 贵阳 5 O 2 ) 5 0 5

要: 以贵州黑 山羊和黔北麻羊为材料 , 根据 山羊 M T S N基 因序列( n ak登录号 : F 80 5 设计 l对引物, P R I P法 o G Bn E 5 83 ) 用 C- L ^的插入 , 导致 出现 1 Da 酶切 多态性位 点, 个 r I 黑山羊纯
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