高通量测序实验室配置(发布版)
高通量测序NGS文库构建技术盘点及难点解析
高通量测序NGS文库构建技术盘点及难点解析目录01020304基因测序发展概述NGS常用建库方法建库注意事项NGS文库质控基因测序发展概述基因测序发展概述Ø基因测序的本质Ø测序技术的发展及应用Ø三大测序平台及其原理测序技术DNA芯片qPCR质谱光学图谱一代测序：Sanger测序二代测序：大规模平行测序三代测序：实时单分子测序四代测序：纳米孔测序基因测序：分子遗传学实验室技术的一种，检测核酸的碱基序列，解读生命密码。
组织解剖细胞显微镜DNA碱基测序仪基因测序发展概述-测序发展及应用195319771980198319862002200520062007200820102011201220142015201620172018沃森克里克提出DNA 双螺旋结构鸟枪法测序Nanopore 发布手持测序仪Minlon桑格等发明了双脱氧链末端终止法Illumina推出HiSeq2500单分子实时测序边连接边测序Solexa 发布GA测序仪DNA簇、桥式PCR和可逆阻断等核心技术焦磷酸测序原理穆利斯发明PCR法BGI推出高通量台式测序系统BGISEQ-50Illumina发布iSeq100系统ABI推出了首台商用化基因测序仪Prism370A一代测序三代测序ABI发布3730xl测序仪毛细血管电泳和荧光标记技术454 Life Science推出Genome Sequencer 20二代测序ABI 公司发布SOLIDABI公司发布SOLID测序仪Illumina发布NovoSeq BGI发布MGISEQ-2000及MGISEQ-200BGI发布桌面化测序系统BGISEQ-500边合成边测序PacBio 发布PacBio RS Illumina 推出HiSeq2000Roche 发布GS Junior Ion Torrent 发布Ion PGM联合探针锚定聚合技术（cPAS）和DNA纳米球（DNB）技术基因测序发展概述-测序发展及应用摩尔定律：当价格不变时，集成电路上可容纳的元器件的数目，约每隔18-24个月便会增加一倍，性能也将提升一倍。
高通量基因测序产前筛查技术管理规范(修改稿).doc
高通量基因测序产前筛查技术管理规范(修改稿)【参加由卫生部临检中心组织的室间质量评价活动，室间质量评估结果不合格的应当分析原因，并采取相应的预防/纠正措施。
第四部分高通量测序产前筛查实验室工作流程及质量控制要求一、标本的接收与拒收标准检测实验室应制定本实验室的样本接受和拒收标准，可对不符合检测要求的样本拒绝接受，并将拒收原因书面反馈给临床科室，具体拒收标准包括:（一）样本采集或运输不当的样本，如抗凝剂使用不正确、严重溶血或有血凝块、采血管破裂及开盖、样本标示不清。
（二）没有按照规定保存及运输的样本。
（三）影响检测结果的重要信息不完善。
二、血浆分离血浆分离操作应在标本制备区按照SOP进行操作并符合说明书要求。
普通EDTA管应从采血时起8小时内完成血浆分离，专用血浆保存管从采血时起96小时内完成血浆分离。
本操作环节需双人复核。
三、血浆DNA的提取血浆DNA提取应在标本制备区按照SOP进行操作并符合说明书要求，DNA抽提完成后浓度及体积应符合试剂说明书的要求，否则应重新提取DNA，如二次提取仍不符合质量标准，应与临床进行沟通以决定后续处理。
每3个月应安排空白对照实验以检测实验室环境条件并记录结果。
四、文库构建与质量评估无PCR过程的文库流程和上机文库质量评估应在标本制备区按照SOP进行标准化操作。
文库荧光定量检测浓度应符合试剂说明书的要求，阴性质控品无扩增。
荧光定量PCR检测显示溶解曲线峰图单一，无杂峰。
五、高通量基因测序与数据分析高通量基因测序应在扩增产物分析区按照SOP进行标准化操作。
扩增产物分析区温湿度要求应符合设备说明书的要求。
每个样本有效数据量、每个样本唯一比对序列数目均应符合试剂说明书的要求。
数据分析严格按照生产厂商产品说明书的具体要求进行。
六、数据分析与结果判断（一）分析质控合格的样本按照生产厂商产品说明书进行实验室结果判断，分质控不合格的样本需重提DNA进行二次实验。
（二）若最终结果根据Z值进行判读，则Z值≥3，报告阳性结果：Z值≤3，报告阴性结果。
实验室基因测序实验报告(3篇)
第1篇一、实验背景随着分子生物学技术的不断发展，基因测序技术在生命科学领域发挥着越来越重要的作用。
基因测序技术能够快速、准确地测定生物体基因组的DNA序列，为基因功能研究、疾病诊断和治疗提供了有力支持。
本实验旨在利用高通量测序技术对某生物样本进行基因测序，并分析其基因表达情况。
二、实验材料与仪器1. 实验材料：某生物样本、DNA提取试剂盒、PCR扩增试剂盒、测序文库构建试剂盒等。
2. 实验仪器：PCR仪、荧光定量PCR仪、测序仪、离心机、PCR仪、凝胶成像系统、超净工作台等。
三、实验方法1. DNA提取：采用DNA提取试剂盒提取某生物样本的总DNA。
2. PCR扩增：根据基因序列设计特异性引物，利用PCR扩增试剂盒进行目的基因的扩增。
3. 测序文库构建：将PCR扩增产物进行纯化、连接等操作，构建测序文库。
4. 测序：将测序文库上机进行高通量测序。
5. 数据分析：利用生物信息学软件对测序数据进行质量评估、比对、组装、注释等分析。
四、实验结果1. DNA提取：成功提取某生物样本的总DNA，A260/A280值在1.8-2.0之间，符合实验要求。
2. PCR扩增：扩增得到目的基因片段，大小约为500bp，符合预期。
3. 测序文库构建：成功构建测序文库，文库浓度和插入片段大小符合实验要求。
4. 测序：测序仪成功完成测序，得到大量原始数据。
5. 数据分析：（1）数据质量评估：原始数据经过质量评估，去除低质量序列，保留高质量序列。
（2）比对：将高质量序列与参考基因组进行比对，确定基因位置。
（3）组装：对比对结果进行组装，得到基因结构。
（4）注释：对组装得到的基因结构进行功能注释，包括基因名称、基因家族、功能注释等。
五、实验结论1. 成功提取某生物样本的总DNA，并进行PCR扩增和测序文库构建。
2. 利用高通量测序技术成功获得某生物样本的基因序列，并进行了数据分析和注释。
3. 通过基因测序，揭示了某生物样本基因表达情况，为进一步研究基因功能、疾病诊断和治疗提供了重要依据。
二代测序(NGS)实验方案设计和应用
这里为您介绍二代测序的相关流程和应用。
随着人类基因组工程的完成，对于低花费的测序技术的需求促进了高通量二代测序技术的发展。
这些新的测序平台允许进行高通量测序，具有广泛的应用：∙全基因组从头测序或者重测序∙目标序列重测序∙转录组分析∙微生物组研究∙基因调控研究NGS 序列二代测序仪器有很多种组合，在通量、片段长度、准确度、每一轮测序成本、每百万碱基对测序成本、初始成本、规格和技术方面存在存在差异。
从规格和初始成本的角度而言，二代测序仪器可轻松地分类为更窄的范围，也就是所谓的“台式测序仪”和高通量仪器。
台式测序仪使得任何实验室都可以像使用real-time PCR一样，自己进行测序。
这些仪器可以和一些靶标序列富集技术相结合，用在一些临床的应用中，其中：选定的靶标基因用于深度分析，以检测稀有的突变，或者检测多样样本中（比如癌症样本）中的突变。
目前，这些仪器的通量在10 Mb到7.5 Gb之间，但是随着硬件，软件和试剂的持续改善，通量也在稳步增加。
高通量测序仪非常适合于大量的，基因组范围的研究，每次测序能测定600 Gb的序列。
一些这样的高通量和高精度的平台，能测定的片段长度相对较短，这对于高重复性的序列和未知基因组的从头测序就可能成为问题。
与此相反，也有一些仪器能测序的片段较长（达到2500 bp），但是其精度和测序能力（90 Mb）要低很多。
还有一些测序能力位于两者之间的仪器（~800 bp，700 Mb）。
因此，应用决定了哪一种仪器是最合适的。
有一种新的方法被称作“纳米孔测序”。
这种技术中，根据一个DNA链通过一个合成的或者蛋白纳米孔道所引起的电流的改变，可以确定通过这个孔道的碱基。
这理论上可以仅用一步就测序一个完整的染色体，而不需要生成新的DNA链。
DNA测序二代DNA测序的工作流程如下：∙DNA样本制备∙文库构建和验证∙文库分子大规模平行克隆扩增∙测序二代测序DNA样本的质量控制首先，评价基因组DNA的质量是非常必要的（完整性和纯度）。
2020版：高通量测序技术临床规范化应用北京专家共识(遗传病部分)
2020版：高通量测序技术临床规范化应用北京专家共识（遗传病部分）遗传病是指由于基因突变或染色体数目或结构变异导致的疾病。
根据遗传物质的改变情况，可分为单基因病、多基因病、染色体病、线粒体遗传病和体细胞遗传病[1]。
目前，人类在线孟德尔遗传数据库（OMIM）已经收录了6 000多种分子基础已知的遗传病[2]。
因为遗传异质性和表型多样性，以往的检测方法例如Sanger测序和染色体芯片分析（CMA）等在成本、通量和诊断敏感性等方面难以满足临床应用需求。
近年来，高通量测序即下一代测序（NGS）技术因其可同时对多个基因，甚至全外显子组和全基因组进行测序，现已被广泛应用于遗传病诊断领域，极大地提高了遗传病诊断的预期[3]。
但与以往技术相比，基于NGS技术的检测操作步骤多，对人员能力要求高，不规范使用或过度使用都有可能给受检者及其家庭造成不可预期的困扰和伤害，为保障高通量测序技术在遗传病临床检测中的规范应用，在借鉴国内外相关指南、标准、规范和权威发表的文献，以及《高通量测序技术临床检测规范化应用北京专家共识（第一版通用部分）》[4] （以下简称"通用共识"）的基础上，北京市临床检验中心、北京医学会检验医学分会、首都医科大学临床检验诊断学系、北京市医学检验质量控制和改进中心牵头起草了《高通量测序技术临床规范化应用北京专家共识（第一版遗传病部分）》。
本共识中的声明内容为专家讨论并推荐的要点。
遗传病高通量测序实验室建设的总体要求遗传病高通量测序实验室建设时，在实验室环境条件（通风、温湿度、洁净和防震等）、仪器设备配备及日常维护与定期校准和人员专业知识及能力要求等总体上应满足"通用共识"的要求[4]，实验室分区设计则在遵循"通用共识"中所阐述的"32字原则"上，同时要考虑遗传变异检测的特点。
实验室应根据不同的遗传检测项目、检测流程、测序平台、建库策略及工作量大小制订切实可行的分区方案。
高通量基因测序植入前胚胎遗传学诊断和筛查技术规范
一、适应证和禁忌证
１．适应证：（１）高通量测序PGD的适应证：包括多种遗传疾病如基因性疾病、非平衡的染色体结构异常、染色体数目异常，以及染色体微小片段插入、缺失与重复等；（２）高通量测序PGS的适应证：自然流产≥3次、或2次自然流产且其中至少１次流产物检查证实存在病理意义的染色体或基因异常的患者，反复种植失败（移植优质胚胎３次及以上，或移植不少于10个可移植胚胎）的患者，也可用于>38岁的高龄且需要采用辅助生殖技术的患者。
４．机构可根据自身条件独立开展本项检测，也可择优与经卫生行政管理部门批准的高通量测序技术临床应用于胚胎植入前遗传学诊断的试点或正式运行的医学检验机构签订合作进行本项检测的服务协议，将测序交由对方进行。
（１）独立开展本项检测的机构，必须采取必要措施保证本项技术的质量并定期进行评价，按本规范开展工作。
（２）与上述合作医学检验机构在本机构内共建联合实验室或交由上述合作方进行本项检测的医疗机构，由双方合作开展本项技术。医疗机构与合作方须签订合作协议，明确双方权责：
二、设备条件
机构须具备细胞遗传学实验诊断的设备和上述第一部分第一条第３款所要求的相应设备。在此基础上，机构应同时具备专业的高通量测序技术相应的核心设备（如与第三方合作可由第三方提供），该设备由经卫生行政管理部门批准试点或正式开展高通量测序技术临床应用的单位生产。各种设备的种类、数量须与实际开展的项目及工作规模相匹配。
①对外合作的医疗机构必须是符合本规范第一部分基本要求所规定的医疗机构；
②医疗机构负责临床医疗行为，包括病例的筛选、PGD/PGS方案的确定、检测前的咨询、签署知情同意书、样本采集、报告签署和发放、结果解释、临床处理、质量评价、医疗风险管理等；
第七章 高通量基因组测序技术介绍11-25(1)
SOLiD 5500xl
• ABI SOLiD测序前期制备
A 样品片段化 磁珠连接
B 乳化PCR 3‘末端修饰
C 磁珠富集 转到测序玻片
• ABI SOLiD测序原理
• ABI SOLiD荧光结合和结果示例
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扩增反应完成后，每个磁珠上的DNA片段拥有了成千上万个相同 的拷贝。经过富集以后，这些片段仍然和磁珠结合在一起，随后就可以 放入到PicoTiterPlate板（一种光纤载板）的样品孔内供后继测序使用了。 在光纤PicoTiter Plate板样品孔内还有测序过程所需的酶类及引 物（引物与DNA片段末端的接头序列互补），当未经荧光标记的核 苷酸流经过样品孔时，每次只允许一个互补dNTP接入，进行互补 新链的合成。
每当一个核苷酸连接到新链上时，就会释放一分子的焦磷酸
盐（PPi），而后PPi与相应底物反应形成1分子ATP，ATP再驱
动荧光素酶转变为氧化荧光素酶，而氧化荧光素酶可以发出可见 光，可被检测仪器捕获，形成峰图。该技术的序列阅读长度介于
测序仪高通量基因分析安全操作及保养规程
测序仪高通量基因分析安全操作及保养规程1. 引言测序仪是一种用于高通量基因分析的重要设备，能够快速、准确地测序DNA或RNA样本。
为了确保测序仪的正常运行，保障实验室安全以及减少设备的故障率，本文档将介绍测序仪的安全操作规程以及保养维护规程。
2. 测序仪的安全操作规程为了确保实验室人员的安全以及设备的正常运行，需要遵守以下操作规程：2.1 实验室安全准备在使用测序仪前，必须确保实验室具备以下安全条件：•实验室空间应符合相关规定，并具备良好的通风系统；•实验室内应设置紧急停止按钮，并确保实验人员熟悉其位置和使用方法；•实验人员应佩戴适当的个人防护装备，如实验手套、护目镜等；•实验人员应接受相关安全操作培训，熟悉相关的应急处理措施。
2.2 测序仪操作步骤在操作测序仪时，应按照以下步骤进行：1.打开测序仪前，确保电源已经接好，且地线连接良好；2.检查设备外观，确保没有损坏或异物进入；3.打开设备电源，并按照设备说明书的要求进行初始化设置；4.准备样品，并按照测序仪的要求装载样品；5.设置测序参数，包括测序模式、测序深度等；6.启动测序仪，并耐心等待测序结束；7.测序结束后，关闭测序仪电源，并进行必要的数据处理和分析。
2.3 测序仪日常维护为延长测序仪的使用寿命，减少故障发生率，需要进行日常的维护工作：•定期清洁测序仪外壳和内部各个部件，注意避免使用含有腐蚀性或破坏性的溶剂；•定期检查和更换测序仪的滤芯和过滤器，确保流体系统正常运行；•定期校准测序仪的温度、湿度等参数，确保测序结果的准确性；•定期备份重要数据，并妥善存放以防丢失。
3. 结论本文档介绍了测序仪高通量基因分析的安全操作规程和保养维护规程。
通过遵守这些规程，可以保障实验室人员的安全，减少设备的故障发生率，提高测序结果的准确性和可靠性。
实验室人员在使用测序仪时必须严格遵守相关规程，确保实验的顺利进行。
高通量测序技术简介共31页文档
Reversible Terminator Chemistry 可逆终止反应
• All 4 labelled nucleotides in 1 reaction
O HN
ON
PPP
O
cleavage site fluor
O
X
5’
HN
DNA O N
O
O
3’
block
Incorporation Detection Deblock; fluor removal
Methy-seq（1）： 肿瘤和MCF7细胞系中 BRCA!启动子区域的甲基化差异
Methy-seq（2）：
Some highlights:
Correlation between ChIP-Seq and his prior SAGE-like method (called GMAT) has r=0.906
Digital expression profiling & microRNA re-sequencing：
hESC： human embryonic stem cells EB： embryoid bodies
ChIP-seq（1）： 人一号染色体DNA-蛋白相互作用
ChIP-seq（2）：
Cycle 2-n: Add sequencing reagents and repeat
1、每轮测序反应加入四种带有荧光标记的dNTP，末端带有可 以被去除的阻断基团 2、每轮反应只能整合一个核苷酸，仪器读取相应的荧光信号 3、信号读取结束，用化学方法去除阻断基团，进行下一轮测序 反应
Base calling from the raw data T G C TAC GAT …
NextSeq 500测序系统
NextSeq TM500测序系统快速、灵活、可调整数据量的高通量桌面式测序平台，采用精确的 SBS 测序技术，具有广泛的应用范围。
* 时间可能据不同实验和试剂类型而不同。
这里展示的是一个假定在仪器上进行的测序长度为2 X 75 bp 的mRNA 表达谱实验，数据分析包括差异表达和识别剪切转录本。
简介源自行业领先的Illumina 新一代测序（NGS ）产品线，NextSeq 500系统可同时提供高通量的测序能力，以及桌面式测序系统的操作便捷性（图1）。
它的快速、一体化、从样本到结果的便捷流程，可以在一次运行中实现快速的外显子组、全基因组和转录组测序，同时还可以根据需要调节到较低的测序通量。
此系统无需其他特定的配套设备，即可整合入研究实验室，Illumina 的科学家可在全过程的每一步提供支持，使得研究者可以专注于获得突破性的发现。
促生新的发现NextSeq 500系统帮助研究者紧跟技术的发展，并将新技术应用于测序项目中。
此可靠、可调整通量的系统，可以将广泛的、高通量的应用成为可承受的日常研究工具。
NextSeq 500系统的灵活性可帮助研究者快速地在不同的应用之间切换，并且根据样本量和覆盖度调整产出的数据量。
现在，即使很小的实验室都可以采用不同的测序应用组合推动研究，以更快的获得有价值的研究结果。
快速、简单的流程NextSeq 500系统直观的用户界面，以及上机后无需人员看管的实验流程，可以帮助研究者实现更多样本的更多测序应用，并且获得最高的测序深度和分辨率。
只需不到10分钟的时间，即可完成在NextSeq 500系统上加样和设定步骤。
不同于其他平台需要多种额外的特定设备，NextSeq 500系统在一台仪器上整合了簇生成和测序功能，并且可以在系统上或云端进行流畅的数据分析。
样本准备可以选择简单、便捷的Illumina TruSeq ®或Nextera ®样本准备试剂盒，然后上样到NextSeq 500上进行快速的自动化测序。
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AMP, ACMG, ASCO & CAP
AMP & CAP 中华医学会呼吸病学分会感染学组 宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用专家共识组 宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用共识专家组
指南名称
Assuring the quality of next-generation sequencing in clinical laboratory practice ACMG clinical laboratory standards for next-generation sequencing Nucleic Acid Sequencing Methods in Diagnostic Laboratory Medicine; Approved Guideline-Second Edition Practice guidelines for targeted Next generation sequencing analysis and interpretation Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology “Next Generation” Sequencing (NGS) guidelines for somatic genetic variant detection College of American Pathologists’ laboratory standards for next-generation sequencing clinical tests 测序技术的个体化医学检测应用技术指南（试行）
震动 测序仪应独立放于一个台面并远离人员活动高频区，周围应尽量减少震动； 片段分析仪运行过程中，台面不可震动。
9
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注：此配置仅用于成熟项目，不建议用于研发。
必备仪器设备概览
快速离心机 PCR仪，具有等温降速
功能 测序仪 移液器 磁力架 Qubit或其他定量仪
11拓展仪器设备概览制备与测序流程图 8各分区通风及温湿度要求
通风 ＞10次/小时（有助于减少前一次检测的遗留和污染）
温度 遵照仪器说明书的温度要求； 测序室：18~22℃，温度波动＜20%； 高海拔和干燥地区，涉及干燥的实验步骤要相应优化。
5
理想的分区设计——肿瘤检测
扩增子法建 库
杂交捕获法 建库
注：i—多R和纯化；病原体qPCR定量。
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各分区功能简介——NIPT实验室为例
Infectious Disease Next Generation Sequencing Based Diagnostic Devices: Microbial Identification and Detection of Antimicrobial Resistance and Virulence Markers. Guidelines for diagnostic next-generation sequencing Guidelines for Validation of Next-Generation Sequencing-Based Oncology Panels: A Joint Consensus Recommendation of the Association for Molecular Pathology and College of American Pathologists Standards and Guidelines for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants in Cancer Standards and Guidelines for Validating Next-Generation Sequencing Bioinformatics Pipelines: A Joint Recommendation of the Association for Molecular Pathology and the College of American Pathologists 中国成人医院获得性肺炎与呼吸机相关性肺炎诊断和治疗指南 宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识 宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用专家共识（第一版）
高通量测序实验室配置
（参考李金明主任主编的高通量测序技术）
概要
高通量测序实验室设计 高通量测序仪器设备配来自 高通量测序临床应用的质量保证
2
3
高通量测序实验室设计基本思路
现有高通量测序实验室的普遍问题：
实验室各区域面积过小； 区域设计与所开展或拟开展的项目不匹配； 建设规划时，未充分考虑通风和温湿度要求； 过渡追求实验室洁净； 分区正方向不明原因的压力梯度递减。
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年份 2012 2013 2014 2014 2015 2015 2015 2015 2016 2016 2017 2017 2018 2018 2019 2020
分析前质量控制
申请单：足够的信息，填写规范
患者信息 检测项目 样本信息 申请信息
知情同意 样本采集、运送、接收和保存的一般原则
自动化设备 自动化核酸提取仪
自动化建库工作站
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高通量测序实验室的政府监管依据
临床实验室监管
1988年，美国国会，《临床实验室改进法案修正案》（CLIA’88） 2006年，中国，卫生部，《医疗机构临床实验室管理办法》 2010年，中国，卫生部，《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》 2014年，中国，国家食药监&国家卫计委，《关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知》 2014年，中国，卫计委医政医管局，《关于开展高通量基因测序技术临床应用试点工作的通知》 2016年，中国，国家卫计委，《关于规范有序开展孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查与诊断工作的通知》
性能验证&性能确认 仪器设备的使用和维护
仪器安装确认 仪器操作确认 仪器性能确认 校准
人员培训及能力评估
参考物质 室内质控 室间质评
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检测结果的报告与解释
患者、样本、检测项目等基本信息 检测结果的报告 检测结果的解释 检测方法 实验室建议 实验室的信息：签字、日期、备注等
ACMG
Wadsworth Centre; New York State Department of Health College of American Pathologists (CAP) 国家卫生健康委员会
FDA
EuroGentest and the European Society of Human Generics
高通量测序实验室设计基本思路：
检测目标明确；
测序平台和检测技术流程明确；
日常工作量明确；
符合基本分区原则： 各区独立 注意风向 因地制宜 方便工作
4
理想的分区设计——NIPS/NIPT
小工作量设计， 二区使用1次/天
小工作量设计， 二区使用≥2次/天
注：i的保存和处理 报告时间的要求
分析后质量控制
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Q&A
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高通量测序检测试剂的监管
1976年，联邦食品、药品和化妆品医学产品法案修正案 《医疗器械监督管理条例》（国务院令第650号）
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高通量测序应用的相关指南
发布机构 US Centers for Disease Control and Prevention (CDC) American College of Medical Genetics (ACMG) Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) Association for Clinical Genetic Science (ACGS)
环节 核酸抽提 定量 建库质控测序 数据分析设备 手持自动研磨机（用于组织、粪便等样本） Qubit 8通或酶标仪（适用于大样本量） 金属浴（可调温、可制冷，用于杂交捕获建库） 真空浓缩仪（用于杂交捕获建库） Covaris打断仪（用于高GC基因组样本） Qubit 8通或酶标仪（适用于大样本量） 片段分析仪（agilent、Qseq、Labchip） qPCR仪（用于精准定量） 超纯水仪（可买成品超纯水代替） 个人电脑型服务器/大型服务器/云服务器
样本采集：患者准备工作、采集及运送容器、采集部位、样本类型及采集量 样本运送与保存：生物安全、运送温度和时间、保存温度和时间
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分析中质量控制
标准操作程序
建立标准操作程序：湿实验&干实验、质量标准 检测过程的详细记录 异常情况的记录和处理 确认实验：较高假阳性可能、检测指标对临床患者可能产生重大影响