质粒载体介绍

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质粒载体介绍(质粒基本特性和种类及标记基因)

一、质粒的基本特性

1.质粒的复制

通常一个质粒含有一个与相应的顺式作用控制要素结合在一起的复制起始区(整个遗传单位定义为复制子)。在不同的质粒中,复制起始区的组成方式是不同的,有的可决定复制的方式,如滚环复制和θ 复制。在大肠杆菌中使用的大多数载体都带有一个来源于pMB1 质粒或ColE1 质粒的复制起始位点。图3-1 是其复制其始示意图。

在复制时,首先合成前RNAⅡ,即前引物,并与DNA 形成杂交体;而后RNase H 切割前RNAⅡ,使之成为成熟的RNAⅡ,并形成三叶草二级结构,该引物引导质粒的复制。形成的RNAⅠ可控制RNAⅡ形成二级结构,同时Rop 增强RNAⅠ的作用,从而控制质粒的拷贝数。削弱RNAⅠ和RNAⅡ之间相互作用的突变,将增加带有pMB1 或(ColE1)复制子的拷贝数。

图3-1 带pMB1(或ColE1)复制起点的质粒在复

制起始阶段所产生的转录的方向及其粗略大小。

2.质粒的拷贝数

质粒拷贝数分为严谨型与松驰型。严谨型质粒每个细胞中拷贝数有限,大约 1 ~几个;松驰型质粒拷贝数较多,可达几百。表5-1 就是不同类的质粒与复制子及拷贝数的大致关系。

表3-1:质粒载体及其拷贝数

pUC 系列质粒的复制单位来自质粒pMB1 ,但其拷贝数较高。pMB1 质粒的复制并不需要质粒编码的功能蛋白,而是完全依靠宿主提

续复制,最后每个细胞中可积聚2~3 千个质粒。

3.质粒的不相容性

两个质粒在同一宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性,它是指在第二个质粒导入后,在不涉及DNA 限制系统时出现的现象。不相容的质粒一般都利用同一复制系统,从而导致不能共存于同一宿主中。两个不相容性质粒在同一个细胞中复制时,在分配到子细胞的过程中会竞争,随机挑选,微小的差异最终被放大,从而导致在子细胞中只含有其中一种质粒。而不相容群指那些具有不相容性的质粒组成的一个群体,一般具有相同的复制子。在大肠杆菌中现已发现30 多个不相容群,如ColE1 和pMB1 ,pSC101 和p15A。

4.转移性

质粒具转移性。它是指在自然条件下,很多质粒可以通过称为细菌接合的作用转移到新宿主内。它需要移动基因mob,转移基因tra,顺式因子bom及其内部的转移缺口位点nic。

二、标记基因

按其用途可将标记基因分为选择标记基因和筛选标记基因。选择标记用于鉴别目标DNA (载体)的存在,将成功转化了载体的宿主挑选出来,筛选标记可用于将特殊表型的重组子挑选出来。

(一)选择标记

1.氨苄青霉素抗性基因(Ampicillin resistance gene, amp r)

氨苄青霉素抗性基因是基因操作中使用最广泛的选择标记,绝大多数在大肠杆菌中克隆的质粒载体带有该基因。青霉素可抑制细胞壁肽聚糖的合成,与有关的酶结合并抑制其活性,抑制转肽反应。氨苄青霉素抗性基因编码一个酶,该酶可分泌进入细菌的周质区,抑制转肽反应并催化β-内酰胺环水解,从而解除了氨苄青霉素的毒性。青霉素是一类化合物的总称,其分子结构由侧链R-CO- 和主核6-氨基青霉烷酸(6-APA)两部分组成。在6-APA 中有一个饱和的噻唑环(A)和一个β-内酰胺环,6-APA 为由L- 半脱氨酸和缬氨酸缩合成的二肽。

2.四环素抗性基因(Tetracycline resistance gene,tet r)

四环素可与核糖体30S 亚基的一种蛋白质结合,从而抑制核糖体的转位。四环素抗性基因编码一个由399 个氨基酸组成的膜结合蛋白,可阻止四环素进入细胞。pBR322 质粒除了带有氨苄青霉素抗性基因外,还带有四环素抗性基因。

3.氯霉素抗性基因(chloramphenicol resistance gene, Cm r, cat)

氯霉素可与核糖体50S 亚基结合并抑制蛋白质合成。目前使用的氯霉素抗性基因来源于转导性P1 噬菌体(也携带Tn9)。cat基因编

酰氧基衍生物,使之不能与核糖体结合。

4.卡那霉素和新霉素抗性基因(kanamycin/neomycin resistance gene, kan r, neo r)

卡那霉素和新霉素是一种脱氧链霉胺氮基糖苷,都可与核糖体结合并抑制蛋白质合成。卡那霉素和新霉素抗性基因实际就是一种编码氨

移。在细胞中合成的这种酶可以分泌至外周质腔,保护宿主不受这些抗生素的影响。

5.琥珀突变抑制基因supF

在基因的编码区中,若某个密码子发生突变后变成终止密码子,则称这样的突变为赭石突变(突变为UAA),或琥珀突变(突变为UAG),或乳白突变(突变为UGA)。supF基因编码细菌的抑制性tRNA ,可在UAG 密码子上编译酪氨酸。如果在某一宿主中含具琥珀突变的tetr 基因和ampr 基因,只有当宿主含有supF基因时才会对Amp 和Tet 具有抗性。相应的,supE基因在UAG 密码子上编译谷氨酰氨。由于目前所用的标记基因使用方便,因此用这类标记的载体较少。

6.其它

还有一些正向选择标记,表达一种使某些宿主菌致死的基因产物,而含有外源基因片段插入后,该基因便失活。如蔗糖致死基因SacB,来自淀粉水解芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens),编码果聚糖蔗糖酶。在含蔗糖的培养基上sacB基因的表达对大肠杆菌来说是致死的,因此该基因可用于插入失活筛选重组子。

(二)筛选标记

筛选标记主要用来区别重组质粒与非重组质粒,当一个外源DNA 片段插入到一个质粒载体上时,可通过该标记来筛选插入了外源片段的质粒,即重组质粒。

1.α-互补(α-complementation)

糖lac操纵子中的lacZ基因编码β-半乳糖苷酶,如果lacZ基因发生突变,则不能合成有活性的β-半乳糖苷酶。例如,lacZ△M15 基因是缺失了编码β-半乳糖苷酶中第11-41 个氨基酸的lacZ基因,无酶学活性。对于只编码N-端140 个氨基酸的lacZ基因(称为lacZ'),其产物也没有酶学活性。但这两个无酶学活性的产物混合在一起时,可恢复β-半乳糖苷酶的活性,实现基因内互补。

在lacZ'编码区上游插入一小段DNA 片段(如51 个碱基对的多克隆位点),不影响β-半乳糖苷酶的功能内互补。但是,若在该DNA 小片段中再插入一个片段,将几乎不可避免地导致产生无α-互补能力的β-半乳糖苷酶片段。利用这一互补性质,可用于筛选在载体上插入了外源片段的重组质粒。在相应的载体系统中,lacZ△M15 放在 F 质粒上, 随宿主传代;lacZ' 放在载体上, 作为筛选标记(图3-2)。相应的受体菌有JM 系列、TG1 和XL1-Blue ,前二者均带有 D (lac - proAB)F'[ proAB + lac Iq lacZ D M15] 基因型。其中lac I 为lac阻抑物的编码基因,lac Iq 突变使阻抑物产量增加,防止lacZ基因渗漏表达。

lacZ基因是乳糖lac操纵子中编码β-半乳糖苷酶的基因,乳糖及其衍生物可诱导其表达。乳糖既是lac操纵子的诱导物,也是作用的底物。异丙基-β-D- 硫代半乳糖苷(IPTG)是乳糖的衍生物,可作为lac操纵子的诱导物,但不能作为反应的底物;5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-

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