整体原位杂交法初步研究MMP11b在斑马鱼胚胎发育过程中的表达
两个Sox9基因在斑马鱼胚胎发育和成体性腺中的动态表达特征
两个Sox9基因在斑马鱼胚胎发育和成体性腺中的动态表达特征作者：梁清仪王心仪孙冬捷等来源：《山东农业科学》2014年第07期摘要：通过整体原位杂交和切片原位杂交技术系统全面地比较分析了斑马鱼胚胎四个发育时期（12、24、48 hpf和4 dpf）和成熟性腺中Sox9a和Sox9b基因的表达模式。
结果显示，两个Sox9基因在脑和眼中持续表达，但在耳囊、头部软骨、胸鳍芽和体节中差异性表达。
Sox9a 特异性地在侧线、尾部神经嵴、原肾管和精巢支持细胞中表达，而Sox9b在卵巢的卵黄颗粒中大量表达。
与已发表的研究结果相比，本研究更广泛地揭示了Sox9a和Sox9b的动态差异表达模式，且更清楚地显示了其在性腺中的表达特征。
关键词：Sox9a；Sox9b；斑马鱼；胚胎发育；成体性腺中图分类号：Q959.46+8∶Q786文献标识号：A文章编号：1001-4942（2014）07-0020-05AbstractUsing whole mount and tissue section in situ hybridization techniques， the expression patterns of two Sox9 homologues genes，Sox9a and Sox9b，were comprehensively compared and analyzed in four stages of developing embryo （12， 24， 48 hpf and 4 dpf） and mature gonads of zebrafish （Danio rerio）. The two genes were persistently expressed in brain and eyes，but differentially expressed in otic vesicle， head cartilage， pectoral fin buds and somites. Distinct from high expression of Sox9b in the yolk granules of oocytes， Sox9a was specifically expressed in lateral line， tail neural crest， primary renal tubular and Sertoli cells in testis. Compared with other published results， the present data revealed a more extensive differential expression profile of two Sox9 genes in the developing embryo and gonads of zebrafish.Key wordsSox9a； Sox9b；Zebrafish（Danio rerio）； Embryonic development； GonadSox9被普遍认为是雄性睾丸决定必须基因，但其功能并不局限于性腺。
镉胁迫下斑马鱼(Danio rerio)的行为响应研究
镉胁迫下斑马鱼(Danio rerio)的行为响应研究刘琪;任宗明【期刊名称】《海洋与湖沼》【年(卷),期】2024(55)3【摘要】在线生物监测技术可有效评估水质变化,研究基于实验室研发的鱼类行为在线监测系统,探究0.001 mg/L和0.01 mg/L镉胁迫下15 d内斑马鱼(Danio rerio)的行为响应,分析环境污染物胁迫下斑马鱼的行为响应规律。
实验采用斑马鱼综合行为强度来反映镉胁迫下的行为变化,并对实验数据进行差异性分析、自相关分析(Autocorrelation)和自组织神经网络(SOM)分析,研究结果:(1)对照组斑马鱼行为强度平均值为0.68±0.14,0.001和0.01 mg/L镉胁迫下斑马鱼行为强度平均值分别为0.65±0.15和0.56±0.13,说明镉胁迫会导致斑马鱼行为抑制,且抑制程度随浓度升高而显著提升(P<0.001);(2)对照组光周期行为强度(0.75±0.14)显著高于暗周期(0.61±0.13;P<0.001);镉胁迫下0.001和0.01 mg/L的光周期行为强度(0.69±0.15和0.60±0.13)分别高于暗周期(0.56±0.16和0.48±0.13;P<0.001),说明斑马鱼具有昼夜节律性;(3)通过SOM分析,行为响应表现出明显的24 h节律。
研究表明镉胁迫会导致斑马鱼行为抑制,且抑制程度随浓度升高而显著提升;斑马鱼行为响应表现出明显的24 h节律,光周期行为强度高于暗周期。
研究通过鱼类行为在线监测系统分析斑马鱼镉胁迫下的行为响应规律,实现在线监测水质和评估污染状况的目标,为生物在线监测系统在水质监测和评估污染状况方面提供数据支持。
【总页数】11页(P566-576)【作者】刘琪;任宗明【作者单位】山东师范大学环境与生态研究院【正文语种】中文【中图分类】Q958.11;Q957;S965【相关文献】1.斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育分子调节机制研究进展2.整体原位杂交法研究斑马鱼(Danio rerio)胚胎发育过程中胸苷酸合成酶(TS)的表达3.斑马鱼(Danio rerio)mapk1基因对tp53基因调控研究4.化合物萘对斑马鱼(Danio rerio)发育毒性及基因组DNA甲基化影响的研究5.氨基脲急性暴露对雄性斑马鱼(Danio rerio)的内分泌干扰效应研究因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
许氏平鲉Myomaker通过调控成肌细胞融合促进肌肉肥大生长的调控机制
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斑马鱼早期胚胎发育过程中IL-10表达的特点
斑马鱼早期胚胎发育过程中IL-10表达的特点赵砚驰;李化;李丹;孔鹏;张乙进;吴洁玲;莫大双;舒莉萍【期刊名称】《贵州医科大学学报》【年(卷),期】2022(47)9【摘要】目的探讨野生型斑马鱼白细胞介素10(IL-10)在胚胎早期发育过程中的表达特点。
方法在美国国家生物信息技术中心(NCBI)数据库中分别查询人类、小鼠及斑马鱼染色体中IL-10的基因位置,与Ensemble数据库中的数据进行比对,采用软件分子进化遗传分析软件(MEGA X)绘制系统进化树;收集3组72受精后小时(hpf)斑马鱼胚胎、30枚/组,提取总RNA(Total RNA)及合成互补脱氧核糖核酸(cDNA),构建斑马鱼重组质粒pCS^(2+)-IL-10,体外转录合成地高辛标记的IL-10反义RNA探针;分别收集4、6、9、12、18、24、48及72 hpf的斑马鱼胚胎75枚(25枚/组、3组),采用全胚胎原位杂交技术检测斑马鱼胚胎不同发育时间点IL-10表达及分布情况。
结果野生型斑马鱼IL-10基因与人类IL-10基因相似度较高,且在进化过程中相对保守;限制性内切酶双酶切重组质粒及测序结果显示,重组质粒构建无误;全胚胎原位杂交结果显示,4~12 hpf野生型斑马鱼胚胎中未观察到阳性杂交信号,18 hpf野生型斑马鱼胚胎中后部中间细胞群观察到IL-10阳性杂交信号,24~72 hpf野生型斑马鱼胚胎胚胎头部区域IL-10广泛表达,头部背侧、心脏、眼眶以及卵黄囊背侧部位的信号尤为明显。
结论斑马鱼IL-10在进化过程中具有相对保守性,在早期胚胎发育过程中IL-10有不同程度的表达,提示IL-10在斑马鱼胚胎早期发育中发挥重要作用。
【总页数】8页(P1000-1006)【作者】赵砚驰;李化;李丹;孔鹏;张乙进;吴洁玲;莫大双;舒莉萍【作者单位】贵州医科大学基础医学院免疫学教研室;中国医学科学院成体干细胞转化研究重点实验室【正文语种】中文【中图分类】R392.1【相关文献】1.Rap1基因在斑马鱼胚胎早期发育过程中的时空表达谱研究2.COX基因在斑马鱼胚胎早期发育过程中的表达3.微小染色体维系蛋白3基因在斑马鱼早期胚胎发育过程中的表达4.干扰素调节因子2结合蛋白2在斑马鱼胚胎早期发育过程中的表达谱分析5.斑马鱼早期胚胎发育过程中IL-1β表达的特点因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
小鼠胚胎原位杂交
醇的稀释。此外，接触标本以及标本有关的空中的洗涤也需DEPC水洗涤。
但DEPC能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。Tris 溶液可用DEPC处理的水配制然后高压灭菌。配制的溶液如不能高压灭菌, 可用DEPC处理水配制,并尽可能用未曾开封的试剂。除DEPC外,也可用异硫 氰酸胍、钒氧核苷酸复合物、RNA酶抑制蛋白等。此外,为了避免mRNA或 cDNA吸附在玻璃或塑料器皿管壁上,所有器皿一律需经硅烷化处理。
体的稀释（用2%的封闭剂/TBST稀释，每次漂洗约
1.7毫升），10%的封闭剂用 TBST配制。
探针的制备
一 探针的分类
DNA探针 cDNA探针 RNA探针(包括正义探针和反义探针） cRNA探针 寡合苷酸探针 二 探针的标记类型 放射性探针标记(如：同位素)，非放射性探针标记(生物素，荧光标记，地高辛标记) 三 RNA探针的得到：
RNA探针的合成及纯化步骤
1 反应混合物的主要组成： 含有目的片段的线性化载体，线性化载体浓度最好达到０.２－ １.０微克／微升.SP6聚合酶，T7聚合酶，地高辛标记的NTP， 2 RNA 酶抑制剂等。 合成条件： 37度反应1-2小时，反应时间的延长并不能增加RNA的量。
注意：SP6聚合酶在40度的条件下活性最好，因此也可以在该温度下进行合成。
PBT: 1X PBS plus 0.1% or 1% Tween -20
NOTE: For mouse embryos, it is recommended that all solutions with Tween contain 1%, rather than 0.1%. Tween is routinely used at 0.1% in he chick protocol.
肌间刺缺失突变对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育的影响
中国水产科学 2019年3月, 26(2): 296-303 Journal of Fishery Sciences of China研究论文收稿日期: 2018-04-09; 修订日期: 2018-07-22.基金项目: 中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2016HY-ZD0301).作者简介: 杨建(1987‒), 男, 博士研究生, 主要从事鱼类遗传育种的研究. E-mail: last0templar@ 通信作者: 匡友谊, 副研究员, 主要从事鱼类基因组与分子育种研究. E-mail: kuangyouyi@DOI: 10.3724/SP.J.1118.2019.18119肌间刺缺失突变对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育的影响杨建1, 2, 佟广香2, 郑先虎2, 孙志鹏2, 吕伟华2, 孙效文2, 匡友谊21. 上海海洋大学, 水产科学国家级实验教学示范中心, 上海 201306;2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 黑龙江 哈尔滨 150070摘要: 为阐明肌间刺缺失对斑马鱼(Danio rerio )胚胎发育时期肌肉发育的影响, 采用qRT-PCR 的方法, 检测分析了斑马鱼不同肌间刺表型间5个肌肉特异性基因(mef2、myf5、myod 、myog 和sox6)在囊胚期(3 hpf, hours post fertilization)、原肠胚期 (6 hpf)、体节期(12 hpf)、咽囊期(24 hpf)和孵化期(72 hpf)5个发育时期的表达情况, 对比分析了肌间刺缺失对斑马鱼胚胎发育过程中肌肉发育特异性基因的时序表达差异和肌肉发育的影响, 以及对受精率、孵化率和畸形率的影响。
结果显示, 5个特异性基因在肌间刺缺失突变型与野生型斑马鱼各发育时期的表达量无显著性差异(P >0.05)。
其中, myf5、myod 基因在原肠胚期表达量升高, 在体节期和咽囊期开始逐步下降; mef2、myog 和sox6基因在囊胚期和原肠胚期表达量很低, 在体节期和咽囊期表达量迅速升高, 并在孵化期开始下降。
麦考酚酸对斑马鱼胚胎颅面部发育的影响
麦考酚酸对斑马鱼胚胎颅面部发育的影响杨迷芳;马兰;严冬琳;蒋玲玲【摘要】Objective To explore the toxicity of Mycophenolic acid (MPA) on the craniofacial development of zebrafish embryos.Methods The zebrafish embryos were treated with MPA to observe the craniofacial malformation at different stages. In 72 hpf, cartilage staining was used to observe the development of craniofacial cartilage. Q-PCR was used to detect the expression level of IMPDH genes. The guanosine was added to examine its rescue of MPA-treated malformation in morphological and genetic aspects. Results MPA caused severe craniofacial malformation in zebrafish embryos. The staining results showed delayed craniofacial development and abnormal phenotype in treated embryos. Gene detection showed that the expression levels of impdh1 b and impdh2 were significantly down-regulated by MPA acid. Guanosine could rescue malformation caused by MPA. Conclusion MPA can cause the craniofacial development malformation in zebrafish embryos by down-regulating the IMPDH genes, which inhibits the activity of IMPDH.%目的研究麦考酚酸对斑马鱼胚胎的颅面部发育毒性.方法对斑马鱼胚胎进行麦考酚酸加药,观察不同时期麦考酚酸对胚胎造成的颅面部发育畸形.胚胎发育至72 h,软骨染色观察颅面部软骨的发育状况.Q-PCR方法检测次黄嘌呤核苷酸脱氢酶(IMPDH)基因的表达水平.同时鸟苷酸加药,从表型和基因层面考察鸟苷酸对麦考酚酸造成畸形的挽救情况.结果麦考酚酸可以造成斑马鱼胚胎严重的颅面部畸形,染色结果显示颅面部软骨发育延迟,形态异常.基因检测发现麦考酚酸能够明显下调impdh1b和impdh2的表达水平.鸟苷酸可以挽救麦考酚酸造成的胚胎畸形.结论麦考酚酸通过下调IMPDH基因,抑制了IMPDH活性,从而造成了斑马鱼胚胎的颅面部发育畸形.【期刊名称】《口腔医学》【年(卷),期】2019(039)002【总页数】5页(P103-107)【关键词】麦考酚酸;颅面部发育;斑马鱼;IMPDH通路【作者】杨迷芳;马兰;严冬琳;蒋玲玲【作者单位】南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室, 江苏南京 210029;南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室, 江苏南京 210029;南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室, 江苏南京 210029;南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室, 江苏南京 210029【正文语种】中文【中图分类】R722.23颅面部发育畸形是人类最常见的一种出生畸形，在我国高发的出生缺陷中始终排名前列[1]。
hand2基因对斑马鱼胚胎发育影响的实验研究
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生 物 学 杂 志
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在斑马鱼胚胎的表达 。ＭＭ １ｂ基 因在胚胎受精后一 个细胞 时期 就开始 表达 ， Ｐ１ 并且一 直持续到 ９ ｈ 从 受精后 ２ ｈ ６， ４ 起， 在耳 囊处表达 明显 ， 在受精 后 ４ ｈ时期在胸鳍和肛 门处也有特异性表达 。ＭＭＰ ｌ ８ １ｂ在 斑马鱼胚胎 发育不 同时期 表达明显 ， 且在耳 囊处有持续表达。
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整 体 原 位 杂 交 法 初 步 研 究 ＭＭＰ １ １ ｂ 在 斑 马 鱼 胚 胎 发 育 过 程 中 的 表 达
李艳欢 ，吴新荣
（广 州军 区广 州总 医院 ， 州 ５ ０ １ ） 广 １０ ０
摘 要： 克隆斑 马鱼基质金属蛋 白酶 １ｂ ＭＭ １ｂ 基 因，并研究其在斑马鱼胚胎早期发育 中的时空表达状 况。收 １（ Ｐ １ ）
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