中国6个鲤群体的mtDNA D-loop序列遗传变异分析
基于分子标记的鲤鱼品种分类及遗传多样性分析
基于分子标记的鲤鱼品种分类及遗传多样性分析鲤鱼是一种广泛分布于全球的淡水鱼类，是许多人们重要的食品来源之一。
同时，鲤鱼还在经济、生态方面扮演着重要的角色。
在许多国家和地区，人们已经开始研究鲤鱼品种分类和遗传多样性等方面的问题，以便更好地管理和保护这种鱼类资源。
本文将从分子标记角度入手，对鲤鱼品种分类及遗传多样性分析进行探讨。
一、分子标记在鲤鱼品种分类中的应用分子标记是指利用特定的分子生物学技术检测特定的DNA或RNA序列，以达到分类和鉴定的目的。
分子标记技术应用广泛，具有高可重复性、高可靠性、高检测敏感性等优点。
鲤鱼是家庭鱼类中应用最广泛的种类之一，分子标记技术在其品种分类中也得到了广泛应用。
1. DNA分子标记DNA分子标记技术主要有PCR-RFLP、AFLP、SSR等。
其中，PCR-RFLP是一种基于PCR扩增DNA片段并利用限制性内切酶切割的技术，可以将某些基因型分成不同的基因型；AFLP技术可以同时检测可靠性和扩增性，适用于检测不同的鲤鱼种类；SSR技术则由于其简单、稳定、灵敏等优点而得到广泛应用。
2. RNA分子标记RNA分子标记技术主要有EST、SNP等。
其中，EST技术是建立在信使RNA转录本的基础上，利用cDNA库或RNA序列、PCR技术等，获得完整的EST序列，从而实现鲤鱼基因的启动子和起始密码子的鉴定；SNP技术可以用于快速鉴定和评估鲤鱼的遗传多样性和品种分类等。
二、基于分子标记的鲤鱼遗传多样性分析鲤鱼的遗传多样性是指在不同品种、不同地域鲤鱼个体之间发现的遗传差异。
这是非常重要的，因为遗传多样性是物种适应环境变化和进化的基础。
同时，了解鲤鱼的遗传多样性有助于人们评估鲤鱼资源的现状，以制定和实施更好的保护和管理措施。
分子标记技术可以用于对鲤鱼基因型的鉴定和遗传多样性的评估。
利用分子标记技术，可以分析鲤鱼的DNA序列、基因和染色体等信息，从而评价鲤鱼的遗传多样性。
多样性指数是衡量遗传多样性的一个基本参数，包括多态性信息、杂合度、分子方差等。
基于线粒体D-loop_区序列的4_个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
广东农业科学 2023，50（11）：139-145Guangdong Agricultural Sciences DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2023.11.014刘士力，陈大伟，郑建波，程顺，蒋文枰，迟美丽，夏冯博，李飞. 基于线粒体D-loop区序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析［J］. 广东农业科学，2023，50（11）：139-145.基于线粒体D-loop区序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析刘士力1，陈大伟1,2，郑建波1，程 顺1，蒋文枰1，迟美丽1，夏冯博3，李 飞1（1. 浙江省淡水水产研究所/农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室，浙江 湖州 313001；2. 上海海洋大学水产与生命学院/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306；3. 湖州师范学院生命科学学院，浙江 湖州 313001）摘 要：【目的】黄尾鲴（Xenocypris davidi）是以腐殖质、有机碎屑为饵料，兼食浮游生物和底栖动物的的淡水经济鱼类，是浙江省自然水域鱼类增殖放流的主要品种之一。
了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响，可为自然水域黄尾鲴的增殖放流策略设计和实施提供参考。
【方法】对浙江长兴、八里店、双浦和湖南醴陵4个黄尾鲴养殖群体的线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列进行PCR扩增和测序，通过序列分析研究4个群体的遗传多样性。
【结果】黄尾鲴线粒体D-loop序列长度为1 038~1 093 bp，碱基A+T含量（65.3%）显著高于C+G 含量（34.7%），平均转换/颠换比值（TS/TV）为4.6。
在128条黄尾鲴的D-loop序列中共检测到101个变异位点，包括97个简约信息位点；界定了19种单倍型，其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为5、12、4和2；单倍型多样性（h）介于0.226~0.915之间，核苷酸多样性（π）介于0.00640~0.01433之间。
濒危鱼类稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列多态性
濒危鱼类稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列多态性彭珊;代应贵【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2009(033)002【摘要】采用PCR、克隆结合DNA测序技术对分布于贵州清水江的30尾稀有白甲鱼个体mtDNA D-loop 3′端共计478 bp的碱基序列进行了测定分析.该序列共发现了25个多态位点,约占其核苷酸总数的5.23%.其中23个为转换位点(A-G,C-T),2个为转换与颠换同时存在的位点.30尾个体分属18种单倍型.稀有白甲鱼mtDNA核苷酸多样性(π)为0.010 7,平均核苷酸差异数(K)为5.092.单倍型多样度(H)为0.940,单倍型间平均遗传距离(P)为0.014.用单倍型间遗传距离构建的NJ系统树由2个支系组成.稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列存在着丰富的多态性,表明该种群具有丰富的遗传多样性.【总页数】5页(P196-200)【作者】彭珊;代应贵【作者单位】贵州大学动物科学学院,贵州大学特种水产研究所,贵州,贵阳,550025;贵州大学动物科学学院,贵州大学特种水产研究所,贵州,贵阳,550025【正文语种】中文【中图分类】Q959.4【相关文献】1.长鳍鲤mtDNA D-loop区序列结构和多态性分析 [J], 邹芝英;杨弘;罗永巨;吴长敬;李大宇;祝璟琳;肖炜2.陕西省林麝mtDNA D-loop区序列结构和种群遗传多样性 [J], 冯慧;黄原;任轶;冯成利;刘晓农3.新疆三种雅罗鱼属鱼类mtDNA D-loop多态性及起源分化分析 [J], 胡文革;王金富;盛金良;段子渊;马润林4.新疆艾比湖鹅喉羚mtDNA D-Loop区序列多态性研究 [J], 塔吉古丽·吐热甫;艾孜孜江·乃比;宁礼群;马合木提·哈力克5.珠江水系光唇裂腹鱼可渡河种群mtDNA D-loop序列多态性分析 [J], 韩虎峰;代应贵因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
中国地方黄牛线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析
中国地方黄牛线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析线粒体DNA(mtDNA)具有突变率高、非重组、母系遗传等特点,已广泛应用于动物遗传多样性和起源进化研究。
中国黄牛品种十分丰富,具有明显不同于国外牛品种的地理谱系结构和种质特征。
与中国黄牛丰富的遗传资源相比,以前的研究不足以表征所有中国黄牛的遗传多样性和母系起源情况。
因此,本研究采集了14个中国地方黄牛品种/群体(蒙古牛、岭南牛、大别山牛、夷陵牛、黄陂牛、三江牛、湘西牛、广丰牛、吉安牛、锦江牛、威宁牛、滇中牛、文山牛和西藏牛)共计459个样本,采用PCR扩增、测序和生物信息学的方法,对其进行遗传多样性与起源进化分析;同时,从GenBank数据库下载646条中国黄牛mtDNA D-loop序列,综合分析中国黄牛57个品种/群体共计1105头牛的mtDNA D-loop区的遗传多样性与母系起源,以期为中国黄牛的遗传资源保护与利用提供科学依据。
本研究得到以下主要结果:(1)中国黄牛mtDNA遗传多样性非常丰富,为普通牛和瘤牛起源,西藏牛主要为普通牛起源,伴有牦牛基因渗入。
(2)牛的T1a支系主要集中分布在亚洲的东北地区(中国东北、韩国和日本);I2支系只分布在中国西南地区(云贵高原和西藏)和新疆地区。
(3)在蒙古牛中发现了5种普通牛的单倍型组(T1a、T2、T3、T4和T5)和2种瘤牛的单倍型组(I1和I2)。
本研究综合分析了中国黄牛mtDNA的遗传多样性,对全面了解中国黄牛品种/群体的遗传多样性、遗传结构和母系起源提供了理论依据。
【国家自然科学基金】_线粒体d-loop_基金支持热词逐年推荐_【万方软件创新助手】_20140731
科研热词 线粒体基因组 遗传多态性 起源 线粒体d-loop 系统发育 序列分析 多结节肝癌 克隆起源 黄鳝 鸭 鳙鱼 高变ⅱ区 高变ⅰ区 遗传背景 遗传差异 遗传多样性 遗传变异 西藏僜人 草鱼 绿头鸭 线粒体序列 线粒体dna d-loop 线粒体dna 系统进化 系统发育分析 系统发生 系统分析 移居群体 海南坡鹿 泥鳅 樱桃谷鸭 杂交起源 文山黄牛 家鸭 孟加拉笛鲷 大额牛 多指标 基因排列 土著群体 变异 单倍型 全序列 保护 临床意义 东方鲀属 sry基因 rrna基因 mtdna d-环区 d-loop区基因 d-loop区 d-loop
2008年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52
2013年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48
2010年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44
科研热词 线粒体基因组 序列分析 遗传多样性 线粒体dna 黄渤海群体 鳅超科 预后 遗传多态性 遗传分化 进化速率 进化 褐马鸡 肺癌 线粒体控制区结构 线粒体基因 线粒体d-loop 紫貂 系统发育 突变 福安水牛 砷剂 癌,肝细胞 滇金丝猴 武昌罗索线虫 松江鲈鱼 昆虫病原线虫 控制区 微卫星不稳定性 建昌鸭 太湖新银鱼 多结节性肝癌 古dna 单倍型 动物毛皮 克隆起源 保护 snps nd4/nd5基因 mtdna控制区 mtdna d-loop dna抽提 d-loop区 d-loop cytb
中国9个家驴品种mtDNA D-loop部分序列分析与系统进化研究
１ 材 料 与方法
１１ 材 料 ．
系和群 体遗 传 结构 研究 Ｉ １ 。传统 观点 认 为 ， 国家驴 中
的祖先 是 亚洲 野 驴 （ ｕｓｓｎ ） 踟 ｕａｉｕ 的亚 种 ——骞 驴 （ － Ｅ ｑ ｕａｉｕｓｅ ｉｎｓ ， ｕ ｓｓ ｈｍ ｏ ｕ ） 主要依 据 是史 料记 载及 形态 体 ｎ 貌 特征 推 断 ； 代 观点认 为 ， 国家 驴 的祖先 是非 洲 现 中 野驴， 驯化后 经阿拉伯 地 区进 入 中国。ｖｎ ｏｉ等 ｌ Ｉ ｋｖ ａ ｃ ２ ＿ 首 次 研 究 了克 罗 地 亚 地 区 ３个 家 驴 品 种 的 ｍ Ｄ Ａ遗 ｔＮ 传 多样 性 ， 共发 现 ３个单 倍 型组 ， 属于 ２个母 系 起 分
收稿 日期 ：０ ９ ０ — ３； 回 日期 ：０ ９ ０ — ２ ２０— １１ 修 ２ ０ — ５ １
发表 的欧 洲驴 线粒 体 Ｄ Ａ全序 列 进行 设计 ， Ｎ 正链 引
物 为 ５一 Ｇ Ｃ Ｃ Ｃ Ａ Ｃ Ａ Ａ Ｃ Ａ Ａ Ｃ ３ ， Ａ Ｔ Ｔ Ａ Ｃ Ｃ Ａ Ｃ Ｃ Ｃ Ａ Ｇ 一 反链 引物 为 ５ 一 Ｃ Ｇ Ａ Ｔ Ｇ Ａ 一 Ｃ Ｔ Ａ Ｇ Ａ Ｇ Ａ ３ ，由上海 生工 生 物
文 章 编 号 ： ２ ８ ７ ３ （ ０ ０）３０ ０— ５ ０ ５ — ０ ３ ２ １ ０ — ０ １０
中 国养驴 历史 悠久 ， 品种 资源 丰 富 ， 生态 类 型多 样 ，拥 有 ２ ３个 地 方 品 种 。线 粒 体 Ｄ Ａ （ ｔＮ Ｎ ｍ Ｄ Ａ） Ｄ ｌ ｐ序列 已被 广泛 用 于家 畜 的起 源进 化 、亲缘 关 —ｏ ｏ
低 温条 件下 带 回实验 室 ，７ ℃保存 备 用 。 一０
表 １ 实 验 用 驴 品 种 、 量 、 集 地 数 采
基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析
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江苏农业科学 ２０２４年第 ５２卷第 ３期
性较低（Ｈｄ：０．６０４８，Ｐｉ：０．００１６３）［１７］。伊西庆基于 ＮＤ２序列探究了我国东部 ６个湖泊翘嘴遗传多 样性和遗传结构，结果表明部分群体间出现高度遗 传分化 ［１８］。江淮 下 游 是 我 国 淡 水 湖 泊 的 集 中 分 布
群体 太湖 蟢湖 长荡湖 高邮湖 白马湖 洪泽湖 总体
样本数 ４８ ３１ ３９ ４７ ４７ ５０ ２６２
表 １ 翘嘴群体的遗传多样性参数
多态位点数 ２２ １７ ２１ １９ １９ １８ ４２
单倍型数 ２０ １４ １８ １７ １５ １４ ４６
单倍型多样性 ０．９２７±０．０１９ ０．８６０±０．０５３ ０．９０１±０．０３２ ０．７９２±０．０５９ ０．８６１±０．０３６ ０．８１６±０．０４８ ０．９１５±０．０１０
由表 １可知，２６２条 Ｃｙｔｂ序列检出 ４２个变异位 点，其中，有 ３３个简约信息位点和 ９个单一信息位 点，没有插入或缺失位点。２６２条序列定义 ４６种单 倍型，整个群体的单倍型多样性和核苷酸多样性分 别为 ０．９１５±０．０１０和 ０．００２５４±０．００００８；６个群 体的单倍型 多 样 性 为 （０．７９２±０．０５９）～（０．９２７± ００１９），核苷 酸 多 样 性 为 （０．００２２０±０．０００２１）～ （０００２８５±０．０００１８），其中，太湖群体的单倍型多 样性和核苷酸多样性最大，高邮湖群体的单倍型多 样性最小，蟢湖群体的核苷酸多样性最小。
翘 嘴 （Ｃｕｌｔｅｒａｌｂｕｒｎｕｓ）俗 称 白 鱼、翘 嘴 白 丝、 大 白 鱼，隶 属 鲤 形 目 （Ｃｙｐｒｉｎｉｆｏｒｍｅｓ） 鲤 科 （Ｃｙｐｒｉｎｉｄａｅ）亚科（Ｃｕｌｔｅｒｉｎａｅ）属（Ｃｕｌｔｅｒ），广泛 分布于我 国 各 江 河 湖 泊［１］。 翘 嘴 为 凶 猛 肉 食 性 鱼类，它能 有 效 控 制 小 型 鱼 类 种 群 数 量，减 轻 小 型 鱼类对浮游生物的压力，在优化鱼类群落机构及维 持水域生 态 系 统 稳 定 方 面 发 挥 了 重 要 作 用［２］。 翘 嘴肉味鲜美、肉质细嫩洁白、营养丰富、经济价值 高，且生 长 迅 速，是 我 国 常 见 的 淡 水 养 殖 品 种 之 一［３］。多年来，由 于 过 度 捕 捞、生 态 环 境 污 染 及 栖 息地破坏多种因素的影响，翘嘴野生资源遭到严 重破坏，种群数量急剧衰退，遗传多样性下降，个体 小型化、低 龄 化 趋 势 严 重，因 此 加 强 翘 嘴 种 质 资 源保护成为亟待解决的问题［４］。
东海野生灰鲳mtDNA D-loop序列遗传变异分析
ｗ ｒ ．Ｔ ｅ ＭＰ ａ ｄ ＮＪ ｐ ｙｏ ｅ ｅｉ ｒ ｅ ｅ ｅ ｏ ｔｉ ｅ ｈ ｏ ｇ ｈ ｌ ｓｅ ｎ ｌ ｓｓ ｏ ｅ ｈ ａｒ ｉｅ ｇ ｎ ｔ ａ ｅ ｈ ｎ ｈ ｌ ｇ ｎ ｔ ｔ ｓ ｗ ｒ ｂ ａ ｎ ｄ ｔ ｒ ｕ ｈ ｔ ｅ ｃｕ ｔ ｒ ａ ａ ｙ ｉ ｖ ｒ ｔ ｅ ｐ ｉ ｓ ｅ ｅ ｉ ｃ ｅ ｗ ｃ
Ｔ ｅＰ Ｒ ｐｏ ｕ ｔ ｗ ｒ ｅ ｕ ｎｅ ｎ ７ ｐｓｇ ｎ ａ ｔｅ５ ｅ ｄｏ ｏ ｔ ｌ ｅｉｎｗ ｒ ｂａ ｅ Ｒ ｍ ｖ ｈ Ｃ ｒｄ ｃｓ ｅｅｓｑ ｅ ｃｄａｄ４ ｂ ｅｍｅ ｔ ｔ ｈ ｎ ｆ ｎ ｏ ｒｇ ｅｅｏ ｔ ｎ ｄ（ｅ ｏ ｅ １ ｃ ｒ ｏ ｉ
ｔｅ ｅ ７ ｉｄｖｄ ａｓｗｉ ａ ｈ ｏｈ ｒ ｔｅ ｉ ｅ ｔ ｙ ｏ —ｏ ｐ ｐ ｉｗ ｓ ｅ ｕ ｎ ｅ ｓ ９ ．８ ％ ａ ｄ ｂ ｓ ｇ ｈ ｓ ｎ ｉｉｕ ｌ ｔ ｅ ｃ ｔｅ ，ｈ ｄ ｎ ｉ ｆＤ ｌｏ ａｒ ｉｅ ｓｑ ｅ ｃ ｓ ｗａ ９４ ｈ ｔ ｎ ｙｕ ｉ ｎ
收 稿 日期 ： ０ ０ ０ — ０ ２ １— ９ ３
基金项 目：
人才资助计戈 （０ ８ ２ ０ ４ ；国家科技 支撑计划（０７ Ａ ４ Ｂ １；国家科技支撑计划（０ ７ Ａ ４ Ｂ ２ ； Ｊ ￣２ ０ Ｒ ０ ０ ） ２ ｏＢ Ｄ ３ Ｏ ） ２０ Ｂ Ｄ ３ ０ ）
海 洋 公 益 性 行 业 科研 专 项 经 费 项 目（０ ９ ５ １— ２ ０ ０ ０ ９ ４）
作者简介：李鹏飞（ ９ ８ ） １７ 一 ，女，山东莱西人 ，硕士，研究方向 ：海水鱼类 种质资源． — ｉ ｐ ｎ ｉＩ６ ６ ． ｒ Ｅ ｍａｌ ｅ ５ １ ＠１ ３ ｏ ： ｃｎ
第 １ 期
部分中国鲤科(鲃亚科及野鲮亚科)的DNA条形码分析
部分中国鲤科（鲃亚科及野鲮亚科）的DNA条形码分析鲤科(Cyprinidae)隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)辐鳍亚纲(Actinopterygii)鲤形目(Cypriniformes)鲤亚目(Cyprinoidei),广泛分布于亚欧大陆、日本、东印度群岛、非洲以及北美洲,在全球淡水捕捞业及养殖业中均占着较大比重,具有可观的经济价值。
近年内,受环境污染、生境破坏和不适当的鱼类资源利用等因素影响,中国鲤科鱼类面临着低龄化、个体小型化及种群规模减少等问题,亟待相关的种质资源保护工作的开展。
其中,作为鲤科的2类代表鱼类,鲃亚科(Barbinae)及野鲮亚科(Labeoninae)的部分物种种间形态相似,缺乏明显的分类特征,其物种鉴定容易发生错误。
为探讨中国鲃亚科、野鲮亚科鱼类的分类地位,本研究测定了采自13省46种共计377尾样本的COI序列并结合从Genbank数据库下载的6属8种共计27条序列进行相关的DNA条形码分析,结果如下。
鲃亚科在基于k2p模型的邻接树上形成31个明显分支,分支间平均遗传距离(14.20%)约为分支内平均遗传距离(0.5%)的28.40倍。
其中,北江光唇鱼(Acrossocheilus beijiangensis)、侧条光唇鱼(Acrossocheilus parallens)、带光唇鱼(Acrossocheilus cinctus)、光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)、温州光唇鱼(Acrossocheilus wenchowensis)、吉首光唇鱼(Acrossocheilus jishouensis)、南方白甲鱼(Onychostoma gerlachi)、细尾白甲鱼(Onychostoma lepturum)、白甲鱼(Onychostoma simaum)、高体白甲鱼(Onychostoma alticorpus)、卵形白甲鱼(Onychostoma ovalis)、云南光唇鱼(Acrossocheilus yunnanensis)、中华倒刺鲃(Spinibarbus sinensis)、云南倒刺鲃(Spinibarbus yunnanensis)、倒刺鲃(Spinibarbus denticulatus)、鲈鲤(Percocypris pingi)、少鳞舟齿鱼(Scaphiodonichthys acanthopterus)、金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)、黑脊倒刺鲃(Spinibarbus caldwelli)、光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)、大鳞四须鲃(Barbodes vernayi)、细尾长臀鲃(Mystacoleucus lepturus)、长臀鲃(Mystacoleucus marginatus)、斑尾小鲃(Puntius sophore)、中国结鱼(Tor sinensis)、异斑小鲃(Puntius ticto)、史尼氏小鲃(Puntius snyderi)等27种鱼类均独立形成单个分支,支持其分类有效性。
中国四个地方驴品种mtDNA D-Loop部分序列分析与系统进化研究
中国四个地方驴品种mtDNA D-Loop部分序列分析与系统进化研究孙伟丽;杨博辉;曹学亮;孙永峰;梁春年;刘建斌【期刊名称】《中国草食动物科学》【年(卷),期】2007(027)002【摘要】对中国4个家驴品种95个个体的mtDNA D-loop部分序列进行测序.用clustalX软件进行同源序列比对. Dnasp 4.10软件用于遗传多样性分析,计算单倍型多样度、核苷酸多样度、平均核苷酸差异.MEGA3.1软件采用邻接法构建系统进化树并进行系统发生分析.以欧洲驴线粒体基因组为对照 (Genbank登录号为X97337),中国家驴4个品种95个个体385bp序列共检测到核苷酸多态位点33个,其中31个位点为转换,1个位点为颠换,1个位点有插入现象.95个序列由31个单倍型组成,单倍型比例为32.6%.德州驴单倍型比例最高为100%,凉州驴单倍型比例最低为42.42%.31个单倍型与引用Genbank已登录的13条序列构建系统发育树,发现31个单倍型聚为两支,说明中国家驴可能有两个母系起源.以欧洲野驴线粒体D-loop为对照(登录号为AF403063、AF403063、AF403065),揭示本研究涉及的中国家驴品种与非洲野驴的进化亲缘关系较亚洲野驴近, 并且从分子水平证明中国家驴可能起源于非洲野驴中的索马里野驴分支.【总页数】4页(P7-10)【作者】孙伟丽;杨博辉;曹学亮;孙永峰;梁春年;刘建斌【作者单位】中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,730050;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,730050;山东德州学院农学系牧医实验室;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,730050;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,730050;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,730050【正文语种】中文【中图分类】S8【相关文献】1.山东省地方绵羊品种的mtDNA D-loop序列多态性及系统进化研究 [J], 黄庆华;张果平;王金文;崔绪奎;王建英;王可2.中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究 [J], 齐国强;昝林森;张桂香;王志刚;王均辉;韩旭3.中国9个家驴品种mtDNA D-loop部分序列分析与系统进化研究 [J], 刘建斌;杨博辉;郎侠;孙晓萍;郭健;程胜利4.晋南驴mtDNA D-loop区部分序列系统进化分析与体型测定 [J], 李慧锋;赵婧微;陈员玉;程俐芬;曹宁贤;解建平;靳鲁柱;李武峰5.中国部分地方牛种mtDNA D-loop区全序列的遗传多样性与系统进化分析 [J], 马云;于波;徐永杰;吴海港;梁小娟;付蕾;李芬因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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中国6个鲤群体的mtDNA D-loop序列遗传变异分析
刘念;傅建军;董在杰;朱文彬;王兰梅;苏胜彦;宋飞彪;陈兴婷
【期刊名称】《水生态学杂志》
【年(卷),期】2017(38)3
【摘要】探讨当前中国鲤(Cyprinus carpio)野生群体和育成品种的遗传结构及变异情况,以期丰富鲤种质资源的研究数据,为后期鲤的种质挖掘和遗传育种提供更多参考。
收集了鲤的4个野生群体(清水江鲤、太湖鲤、黄河鲤和黑龙江鲤)和2个育成品种(福瑞鲤和松浦鲤)共计185尾个体,进行mtDNA D-loop序列测序分析。
全长927~930 bp的D-loop序列有36个变异位点。
所有个体呈27个单倍型,其中清水江鲤和太湖鲤的单倍型数量较多(分别为18和9个),而福瑞鲤和松浦鲤各存在1个优势单倍型(占有率分别为93%和80%)。
F_(ST)值检验发现,松浦鲤与黑龙江鲤间遗传分化不显著(P>0.05),其余群体间均呈极显著遗传分化(P<0.01)。
基于群体间K2P遗传距离(0.005~0.013)的NJ树显示,福瑞鲤和黄河鲤首先聚类,然后依次与清水江鲤和太湖鲤聚类;最后与松浦鲤和黑龙江鲤所在的另一支聚类。
分子方差分析显示,群体间遗传变异极显著(P<0.01),占总变异的35.59%。
研究表明,鲤的野生群体(清水江鲤和太湖鲤)存在较高的遗传多样性,具有进一步选育利用的潜力;而2个育成品种(福瑞鲤和松浦鲤)在选育过程中积累了较高的遗传纯度。
【总页数】8页(P75-82)
【关键词】鲤;群体;线粒体DNA;D-环序列;遗传变异
【作者】刘念;傅建军;董在杰;朱文彬;王兰梅;苏胜彦;宋飞彪;陈兴婷
【作者单位】上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,无锡214081;南京农业大学无锡渔业学院,无锡214081
【正文语种】中文
【中图分类】Q31;S917
【相关文献】
1.3种中国鲤mtDNA D-Loop序列的多态性与系统进化研究 [J], 梁宏伟;邹桂伟;罗相忠;王长忠;呼光富;李忠
2.长鳍鲤mtDNA D-loop区序列结构和多态性分析 [J], 邹芝英;杨弘;罗永巨;吴长敬;李大宇;祝璟琳;肖炜
3.东海野生灰鲳mtDNA D-loop序列遗传变异分析 [J], 李鹏飞;贺舟挺;徐开达;朱文斌;薛利建;张洪亮
4.基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)基因序列分析钦州尖鳍鲤的遗传多样性 [J], 王超;麦炜;姚东林;谢少林
5.基于线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop）基因序列分析钦州尖鳍鲤的遗传多样性 [J], 王超;麦炜;姚东林;谢少林;;;;
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