利用免疫共沉淀技术研究RSVCP_SP和NSvc4蛋白的互作
蛋白质免疫共沉淀原理

蛋白质免疫共沉淀原理蛋白质免疫共沉淀(protein immunoprecipitation)是一种常用的实验技术,用于从混合样品中选择性地富集、分离和纯化特定的蛋白质。
该技术基于抗体与特定蛋白质之间的高度特异性结合,通过将抗体与相应的抗原结合,然后利用抗体-抗原复合物对目标蛋白质进行富集和纯化。
以下将详细介绍蛋白质免疫共沉淀的原理和应用。
蛋白质免疫共沉淀的原理基于免疫学的基本原理。
当宿主动物(如小鼠、兔子)接种抗原后,免疫系统会产生抗体来特异性识别和结合抗原。
抗体是能够与抗原特异性结合的分子,它通常由两个重链和两个轻链组成。
抗体的抗原结合位点位于其变量区域,这个区域具有高度特异性,能够识别并结合特定的抗原。
1.制备抗体:首先,需要获得特定蛋白质的抗体。
这可以通过免疫动物(如小鼠或兔子)来实现。
将目标蛋白质注射入宿主动物体内,触发免疫反应,产生特异性的抗体。
2.抗体固定:将抗体固定在适当的固相介质上,如磁珠、琼脂糖或微孔板等。
固相抗体通常被共价地连接到固相介质上,以增加固定的稳定性和特异性。
3.样品孵育:将包含目标蛋白质的混合样品与固相抗体孵育。
在这个过程中,抗体会特异性地结合目标蛋白质,形成抗原-抗体复合物。
4.共沉淀:通过离心或其他分离方法,将抗原-抗体复合物与固相结合的抗体一起沉淀下来,从而将目标蛋白质分离和富集出来。
5.洗涤:对沉淀物进行多次洗涤,以去除非特异性结合的蛋白质和其他污染物。
洗涤的过程中,使用不同的缓冲液和洗涤条件,可以有效地去除非特异性结合的物质。
6.洗脱和纯化:通过改变盐浓度、pH值或其他条件,将目标蛋白质从抗体上洗脱下来。
洗脱的条件要使目标蛋白质脱离抗体而不破坏其结构和功能。
7.分析:对纯化的目标蛋白质进行进一步的分析,如免疫印迹、质谱分析、酶活测定等,以确定蛋白质的身份和活性。
1.蛋白质互作研究:通过免疫共沉淀,可以捕获目标蛋白质与其相互作用的互作蛋白质。
这可以帮助研究蛋白质相互作用网络、信号传导通路等。
《免疫共沉淀》课件

检查所需的仪器设备是否齐全和正常 工作,如离心机、摇床、离心管等。
实验操作流程
抗体与蛋白质样品的结合
将抗体与蛋白质样品混合,确保抗体与目标 蛋白质充分结合。
共沉淀物的分离
通过离心或过滤等方法将共沉淀物与溶液分 离。
清洗非特异性结合
通过洗涤去除未结合的蛋白质和其他杂质。
结果分析方法
统计学分析
采用t检验或方差分析等统计学方法,对实验数据进行处理和分析,以确定共沉淀物之间的相互作用 是否具有统计学显著性。
生物信息学分析
利用在线生物信息学工具对共沉淀物进行功能注释、基因本体论(GO)分类和蛋白质相互作用网络 分析,以深入了解共沉淀物的生物学功能和相互作用关系。
结果解读与讨论
值的实验数据和结论。
未来可以对这些蛋白质复合物的 功能进行深入研究,探讨其在生 物学和医学中的意义和作用机制
。
同时,随着技术的不断进步和应 用领域的拓展,免疫共沉淀技术 还有望在更多领域发挥重要作用
。
未来研究方向与建议
1
进一步优化免疫共沉淀实验条件和方法,提高实 验的特异性和灵敏度,以分离和鉴定更多蛋白质 复合物。
结果解读
根据实验结果,分析共沉淀物的生物学 意义和功能,探讨它们与目标蛋白的相 互作用机制。
VS
结果讨论
结合已有研究,对实验结果进行深入讨论 ,提出可能的生物学模型或假设,为后续 研究提供思路和方向。同时,对实验的局 限性进行说明,并提出改进方向。
05
结论与展望
结论总结
免疫共沉淀技术是研究蛋白质相互作用的经典方法之一,在生物学和医学 研究中具有广泛应用。
பைடு நூலகம்
免疫共沉淀串联蛋白质谱coip-ms

免疫共沉淀串联蛋白质谱(CoIP-MS)是一种用于研究蛋白质相互作用的重要技术。
它通过将特定抗体与靶蛋白质结合,然后利用质谱技术鉴定和分析与该蛋白质相互作用的其他蛋白质,从而揭示细胞内复杂的信号传导网络和蛋白质功能。
在本篇文章中,我们将深入探讨CoIP-MS技术的原理、应用和局限性,以及个人对这一技术的理解和看法。
一、CoIP-MS技术原理1. CoIP原理免疫共沉淀(Co-IP)是一种将特定抗体与靶蛋白质结合的技术。
通过免疫沉淀的方式,来极大程度地富集我们需要的蛋白质。
2. 质谱技术原理质谱技术是一种通过离子化和加速来测定分子质量的技术。
在CoIP-MS中,利用质谱技术鉴定和分析与靶蛋白质相互作用的其他蛋白质。
二、CoIP-MS技术应用1. 蛋白质相互作用研究CoIP-MS技术被广泛应用于蛋白质相互作用的研究中。
通过对一种蛋白质进行免疫共沉淀,然后利用质谱技术鉴定与其相互作用的其他蛋白质,可以揭示信号传导、细胞周期、转录调控等生命活动的分子机制。
2. 蛋白质功能验证CoIP-MS技术也可以用于验证蛋白质的功能。
通过鉴定与某一特定蛋白质相互作用的其他蛋白质,可以初步推测该蛋白质在细胞内的功能和通路位置。
三、CoIP-MS技术局限性1. 验证性由于CoIP-MS技术对蛋白质相互作用的鉴定依赖于抗体的质量和特异性,因此在实际应用中需要进行多次重复实验来验证结果的可靠性。
2. 数据解析CoIP-MS生成的数据量庞大,需要借助生物信息学和统计学的方法来进行数据解析和筛选,因此在数据分析的过程中存在一定的复杂性和技术门槛。
四、个人理解和看法对于CoIP-MS技术,我个人认为它是一种非常有价值的蛋白质相互作用研究技术。
通过CoIP-MS技术,我们可以全面了解蛋白质的相互作用网络和功能,为生命科学领域的研究提供了强有力的工具。
然而,在实际操作中需要注意抗体的选择和数据的解析,以确保结果的可靠性和准确性。
总结回顾:通过本文的详细介绍,我们对免疫共沉淀串联蛋白质谱(CoIP-MS)技术有了更深入的了解。
免疫共沉淀质谱

免疫共沉淀质谱免疫共沉淀质谱(immunoprecipitation-massspectrometry,简称IP-MS)是一种常用的蛋白质相互作用分析技术。
该技术结合了免疫沉淀和质谱分析,能够鉴定蛋白质相互作用和识别蛋白质复合物的成员,广泛应用于生命科学、疾病诊断和治疗等领域。
一、IP-MS 的基本原理IP-MS 技术的基本原理是利用特异性抗体将目标蛋白质从混合物中沉淀下来,然后用质谱分析鉴定沉淀物中的蛋白质。
该技术主要包括以下步骤:1. 样品制备:将需要分析的生物样品(如细胞、组织、血清等)进行处理,如细胞裂解、组织切片等,得到蛋白质混合物。
2. 免疫沉淀:将特异性抗体与目标蛋白质结合,形成抗原抗体复合物。
然后将混合物与抗原抗体复合物一起孵育,使复合物形成。
接着用亲和树脂或磁珠等材料将复合物捕获下来,得到免疫沉淀物。
3. 洗涤:用缓冲液对免疫沉淀物进行多次洗涤,去除非特异性结合的蛋白质和杂质。
4. 质谱分析:将免疫沉淀物用电泳或染色分析等方法进行分离,然后用质谱分析仪器对分离后的蛋白质进行鉴定和定量。
二、IP-MS 的应用1. 鉴定蛋白质相互作用:利用 IP-MS 技术可以鉴定蛋白质相互作用,例如鉴定蛋白质与核酸、蛋白质与蛋白质、蛋白质与小分子等的相互作用。
这些相互作用对于细胞信号转导、代谢途径、基因表达等生命过程起着重要作用。
2. 识别蛋白质复合物的成员:许多生物过程涉及到蛋白质复合物的形成,如核糖体、酶复合物等。
利用 IP-MS 技术可以识别蛋白质复合物的成员,进而揭示其功能和调控机制。
3. 疾病诊断和治疗:许多疾病的发生和发展都与蛋白质相互作用和复合物形成有关。
利用 IP-MS 技术可以鉴定疾病相关的蛋白质相互作用和复合物,从而为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。
三、IP-MS 的优缺点IP-MS 技术具有以下优点:1. 特异性高:利用特异性抗体进行免疫沉淀,可以选择性地捕获目标蛋白质。
植物免疫共沉淀coip流程

植物免疫共沉淀coip流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!并且,本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料,如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等,如想了解不同资料格式和写法,敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor.I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!植物免疫共沉淀(CoIP)流程详解植物免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,简称CoIP)是一种广泛应用于研究蛋白质相互作用的技术。
免疫共沉淀-质谱联用技术

免疫共沉淀-质谱联用技术免疫共沉淀-质谱联用技术是一种重要的分析技术,它将免疫共沉淀与质谱分析相结合,可以用于研究蛋白质相互作用、信号传导、酶反应等生物学过程中的分子机理及其相关信号路径。
该技术的应用越来越广泛,已成为分子生物学和蛋白质组学研究中常用的工具之一。
免疫共沉淀-质谱联用技术基于免疫学的原理,即利用特异性抗体与靶分子结合形成复合物,从而寻找它的内在结构和功能。
与传统的免疫共沉淀技术相比,免疫共沉淀-质谱联用技术可以对复合物进行更准确更全面的鉴定,可鉴定中小分子的低丰度蛋白质,可以同时定位蛋白质间的交互作用位点,还可以鉴定非蛋白质结合的水平等。
在免疫共沉淀过程中,首先选择具有高度特异性和亲和力的抗体,将其结合到磁珠、琼脂或凝胶上,然后在固相处将蛋白质样品加入,与其形成复合物。
随后,采取磁分离或离心沉淀的方法,将复合物分离出来,并用冲洗液彻底清除杂质物。
最终,将复合物洗脱,进行蛋白质鉴定和分析。
质谱分析是在该技术中不可或缺的部分,它可为免疫共沉淀提供有关复合物的定量和定性信息。
与传统的海绵声压提示法不同,免疫共沉淀-质谱联用技术使用质谱仪可以利用靶蛋白质的特定段序列进行定量和高效蛋白质鉴定。
最常用的质谱技术包括MALDI-TOF/TOF-MS和LC-MS/MS两种。
MALDI-TOF/TOF-MS技术是一种高定量、高灵敏度的质谱技术,可以用于鉴定复合物中的大部分蛋白质,并可以提供与上下游交互蛋白质的定位。
同时,它具有较高的通量和分析速率,可以在短时间内处理大量样品。
LC-MS/MS技术具有高通量、高灵敏度和高分辨率的优点,因此是鉴定复杂蛋白质混合物的理想选择。
在免疫共沉淀-质谱联用技术中,LC-MS/MS通常与反向相色谱技术结合,以进一步提高检测灵敏度和分辨率。
总的来说,免疫共沉淀-质谱联用技术是一种用于鉴定蛋白质相互作用的非常有效的技术,可以提供有关蛋白质的定量和定性信息,广泛应用于分子生物学、蛋白质组学、药理学等领域。
质谱分析蛋白质的相互作用
蛋白质间的相互作用存在于生物体每个细胞的生命活动过程中,互交叉形成网络,成细胞中一系列重要生理活动的基础。
其中,多数蛋白质是通过与配体分子结合或者是作为1个大的生物复合体的一部分,与细胞完整性维持、遗传物质复制、基因表达调控、信号转导、免疫应答等一系列生命过程。
研究蛋白质间相互作用的方式和程度,将有助于蛋白质功能的分析、疾病致病机理的阐明和治疗和新型药物的开发等众多难题的解决。
因此,确定蛋白质间相互作用关系、绘制相互作用图谱已成为蛋白质组学研究的热点。
近年来有许多方法被用于蛋白质相互作用的研究,酵母双杂交技术,免疫共沉淀技术,串联亲和纯化技术,化学交联技术,蛋白质芯片技术,荧光共振能量转移技术,噬菌体展示技术等。
酵母双杂交技术Fields和song等首先在研究真核基因转录调控中建立起来的,是在真核细胞中检测蛋白质与蛋白质之间的相互作用的方法。
该系统是通过两个分别称之为“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”的融合蛋白形成一个完整的转录激活因子,从而激活报告基因的表达,通过在营养缺陷型培养基上生长或呈现显色反应来检测系统的功能。
酵母双杂交系统可在全基因组规模上进行蛋白质一蛋白质相互作用高通量的研究。
免疫共沉淀技术免疫共沉淀是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的Protein A或G特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的现象开发出来的方法。
其基本原理是,在细胞裂解液中加入抗兴趣蛋白的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Agarose珠上的Protein A或G,若细胞中有与兴趣蛋白结合的目的蛋白,就可以形成这样一种复合物:“目的蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—Protein A或G”,经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物又被分开。
然后经免疫印迹或质谱检测目的蛋白。
这种方法得到的目的蛋白是在细胞内与兴趣蛋白天然结合的,符合体内实际情况,得到的结果可信度高。
这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合;也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。
免疫共沉淀实验目的及原理
免疫共沉淀实验目的及原理
研究蛋白之间相互作用必不可少的实验是免疫共沉淀(CoIP),常被用于鉴定特定蛋白复合物的中未知蛋白组分,因其具有可信度高的优点,在现在基础医学研究中广泛应用,本文将为您详解CoIP的实验原理和操作步骤,实验刚入门的同学必看哦。
一、实验目的
1)检测两种目标蛋白是否在体内相互作用;
2)找到与目标蛋白在体内存在相互作用的新蛋白。
运用这项技术,说不定你会有新的发现哦!
二、实验原理
CoIP是利用抗原蛋白和抗体的特异性结合、以及“Protein A/G"特异性地结合抗体(免疫球蛋白)FC段的现象开发出来的方法。
目前多用Protein A/G预先结合在Argarose Beads上,使之与含有抗原蛋白的溶液(如细胞裂解液)及抗体(诱饵蛋白X抗体)反应后,Beads上的Prorein A/G就能通过抗体吸附诱饵蛋白X,诱饵蛋白X 通过与靶蛋白Y相互作用将其从细胞裂解液中分离出来,从而达到免疫共沉淀的目的。
如果还是不懂,看图就知道啦!。
研究蛋白与RNA互作的经典技术总结——RIP,还不赶快收藏?
研究蛋白与RNA互作的经典技术总结——RIP,还不赶快收藏?基于免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)的技术是我们研究蛋白与其它大分子类分子互作的关键技术之一,比如研究蛋白与蛋白互作的Co-IP,蛋白与RNA互作的RIP,蛋白与DNA互作的ChIP,其基本原理就是通过要研究目的蛋白的抗体进行免疫共沉淀,接下来根据要检测的分子类型通过各种方法进行检测。
根据检测的目的,也可以分为寻找和确认两种。
为了寻找哪些分子与目的蛋白结合,一般通过高通量组学的方法进行,比如芯片、测序和质谱等等,在所有鉴定到的分子中挑选可能的候选分子;为了验证哪些分子与目的蛋白结合,这时候因为已经有“怀疑”的分子了(比如文章已经报道过或者预测发现的),一般我们可以直接通过WB、qPCR等方法来检测。
以前我们已经介绍了DNA-RNA-蛋白互作的研究方法(文章篇)S3E5:一文掌握LncRNA—蛋白—DNA互作研究方法),今天我们就来单独拿出RIP(RNA Binding Protein Immunoprecipitation)实验来说一下这个技术的应用场景和技术细节。
需要注意的是:很多人常把RIP当作RNA pulldown,原因可能是RIP中的R(NA),实际上RNA Binding Protein Immunoprecipitation在缩写的时候直接把中间的Binding Protein省略了,所以如果缩写为RBPIP会更合适一些。
RIP 技术(RNA Binding ProteinImmunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白免疫沉淀)与ChIP实验很相似,主要侧重于蛋白质- RNA相互作用。
主要是运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA 进行q-PCR验证或者测序分析。
RIP 是研究细胞内RNA 与蛋白结合情况的技术,应用领域包括转录后调控研究、表观遗传调控。
蛋白质免疫共沉淀
蛋白质免疫共沉淀蛋白质免疫共沉淀(Immunoprecipitation,简称IP)是一种生物学技术,可以用来研究蛋白质的相互作用,也可以用于蛋白质的纯化,它包括了细胞提取物的制备,免疫反应以及免疫复合物的纯化等一系列操作步骤。
普遍认为,蛋白免疫共沉淀是一种有效、灵活性强的细胞提取物测定蛋白质相互作用的技术。
蛋白质免疫共沉淀主要利用特异的抗体对特定的蛋白质或者抗原实现特异性结合,进而达到从细胞提取物中纯化某一种蛋白质的目的。
当抗体与特定的抗原结合时,会形成一个抗原抗体免疫复合物,这时这个复合物又可以与细胞内这种蛋白质及其它抗原结合,从而形成一个具有特定抗原的复合物。
这些复合物在细胞提取物中会形成一个可沉淀物,可以通过提取物中的抗原抗体免疫复合物进行纯化。
蛋白质免疫共沉淀有很多优势,首先,它是一种灵活性非常强的技术,可以检测出与某一种蛋白质可能存在的其他蛋白质。
其次,蛋白质免疫共沉淀也是一种比较快速的技术,即使作用的蛋白质叠加,也可以在正常情况下完成。
此外,它也是一种非常精细的技术,可以在大量的细胞提取物中纯化出很多特定的蛋白质。
蛋白质免疫共沉淀技术的基本步骤包括:细胞提取物的制备、抗体的选择和生产、抗体和细胞提取物的结合、抗原抗体复合物的纯化等。
首先,在细胞提取物制备过程中,要将细胞悬液细胞悬液过滤后收集,然后再进行超声处理,使细胞分解,以获得细胞提取物。
其次,在抗体的选择和生产过程中,要选择和生产一种能够与目标蛋白质或者抗原特异性结合的抗体。
紧接着,进行抗体与细胞提取物的结合,将抗体与细胞提取物混和,使它们能够溶解,形成免疫复合物。
最后,进行免疫复合物的纯化,将复合物从细胞提取物中沉淀出来,这时复合物中有特定抗原的蛋白质或者抗体,可以被完全纯化。
蛋白质免疫共沉淀技术的应用非常广泛,它不但可以用于研究蛋白质的相互作用,还可以用于研究蛋白质的结构和功能,检测特定蛋白质的表达水平,以及检测免疫反应等。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2008,16(5):891 ̄897*基金项目:国家重点基础研究发展规划(973)项目(No.2006CB100203)、教育部博士点专项科研基金(No.20040389002,20050389006)和国家自然科学基金(No.30671357)资助。
**通讯作者。Authorforcorrespondence.谢联辉,教授,主要从事植物病毒学研究。E-mail:<fjxlh@126.com>;
吴祖建,副研究员,主要从事植物病毒学研究。
E-mail:<wuzujian@126.com>.
收稿日期:2008-01-23接受日期:
2008-02-27
·研究论文·利用免疫共沉淀技术研究RSVCP、
SP和NSvc4蛋白的互作*
鹿连明,秦梅玲,王萍,兰汉红,牛晓庆,谢荔岩,吴祖建**,谢联辉**(福建农林大学植物病毒研究所,福建省植物病毒学重点实验室,福州350002)
摘要:为了检测水稻条纹病毒(Ricestripevirus,RSV)外壳蛋白(coatprotein,CP)、病害特异蛋白(disease-specialprotein,SP)和可能的运动蛋白NSvc4自身和两两之间的互作关系,首先通过PCR扩增获得了分别融合有HA或c-Myc标签的RSVCP、
SP和NSvc4基因,并将其插入到植物表达载体pEGAD或pKYLX71:35S2中。重组质粒转化根癌农杆菌(Agrobacteriumtume-faciens)EHA105后,将含有不同重组质粒的根癌农杆菌菌液混合后注射烟草(Nicotianabenthamiana)
叶片。提取烟草中瞬时表
达的蛋白,以HA或c-Myc抗体进行免疫共沉淀试验,最后免疫混合物通过c-Myc抗体或HA抗体进行Westernblot检测,确定蛋白的互作情况。结果表明,RSVCP蛋白自身能够发生互作,而CP与SP,CP与NSvc4,SP与SP,SP与NSvc4,及NSvc4与NSvc4蛋白之间均未有检测到互作现象
。
关键词:水稻条纹病毒;免疫共沉淀;蛋白互作中图分类号:S188文献标识码:A文章编号:
1006-1304(2008)05-0891-07
StudiesontheInteractionsbetweenRSVCP,SPandNSvc4ProteinsUsingCo-immunoprecipitationTechnology
LULian-ming,QINMei-ling,WANGPing,LANHan-hong,NIUXiao-qing,XIELi-yan,WUZu-jian**,XIELian-hui**(InstituteofPlantVirology,KeyLaboratoryofPlantVirologyofFujianProvince,FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou350002,China)
Abstract:InordertodetecttheinteractionbetweenRicestripevirus(RSV)coatprotein(CP),disease-specialprotein(SP)and
NSvc4,theHA-taggedorc-Myc-taggedCP,SPandNSvc4ofRSVwereamplifiedbyPCR,andtheninsertedintoplantexpressionvectorpEGADorpKYLX71:35S2.TherecombinantplasmidsweretransformedintoAgrobacteriumtumefaciensEHA105,andtheEHA105containingdifferentrecombinantwasinjectedintoNicotianabenthamiana.ThetotalproteinswereisolatedfromAgrobacterium-infiltratedN.benthamianaleaves,andco-immunoprecipitatedwithHAorc-Mycantibody.Theimmunocomplexes
weredetectedbyWesternblotwithc-MycorHAantibodytoidentifytheinteractionbetweentheseproteins.TheresultsshowedthatRSVCPcouldinteractwithitself,butnointeractionofCPwithSP,CPwithNSvc4,SPwithSP,SPwithNSvc4,andNSvc4withNSvc4wasdetected.Keywords:Ricestripevirus;co-immunoprecipitation;proteininteraction
水稻条纹叶枯病是我国水稻产区广泛分布的重要病毒病害之一,给水稻生产带来了严重的危害。该病病原为水稻条纹病毒(Ricestripevirus,RSV),是纤细病毒属(Tenuivirus)的代表成员,由昆虫介体灰飞虱(Laodelphaxstriatellus)以持久方式经卵传播(谢联辉,2001),具有很广的寄主范围,可以侵染16个属80多种的禾本科植物(阮义理等,1984)。RSV是一种多组分RNA病毒,其基因组由4种单链RNA农业生物技术学报2008年组成,分别编码RNA聚合酶、P23(NS2)蛋白、NSvc2、NS3、外壳蛋白(coatprotein,CP)、病害特异蛋白(disease-specialprotein,SP)和NSvc4等7种蛋白。其中CP为外壳蛋白,由RNA3负链编码。免疫胶体金技术研究发现,CP在寄主组织细胞中广泛存在,不仅存在于叶绿体和细胞质中,在细胞核中也有分布(刘利华等,1999,2000)。Westernblot检测发现该蛋白在带毒介体灰飞虱体内也有存在(曲志才等,1999)。这些表明RSVCP极有可能是该病毒重要的致病性蛋白。SP是一种非结构性蛋白,由RNA4编码。RSV侵染寄主后的各个时期内都能检测到SP的存在,它在病叶中大量积累,形成形态各异的内含体,且其含量的高低与水稻品种的抗性和症状表现有着密切的关系(林奇田等,1998)。对RSV在灰飞虱体内的亚细胞定位的研究表明,SP蛋白可分布在卵巢、卵壳表面、中肠内腔和柱形细胞等多个器官中(吴爱忠等,2001)。Ramirez和Haenni(1994)在对纤细病毒属的SP和烟草脉斑驳病毒(Tobaccoveinmottlingvirus,TVMV)编码的蚜虫传播辅助因子的氨基酸序列比对后推测,SP可能参与了介体昆虫的传毒过程。Stewart和Banerjee(1999)认为SP可能在病毒与昆虫介体最初的识别过程中起作用。NSvc4蛋白由病毒的RNA4负链编码,与30kD运动蛋白大家族的结构具有相似性(Melcher,2000),利用Westernblot技术均可以在病叶和带毒虫体内检测到这个蛋白(曲志才等,1999),因此现有研究推测NSvc4蛋白有可能是RSV的运动蛋白。RSVCP和SP均存在于RSV侵染的水稻细胞质和叶绿体中,且叶绿体中CP和SP的含量同植株褪绿花叶症状的严重度密切相关(刘利华等,1999;林奇田等,2000)。因此推测,RSVCP和SP作为病毒致病相关蛋白,能侵染水稻叶绿体,从而引发寄主产生褪绿条纹症状。但是目前尚不清楚RSV侵染后所引起的寄主病害症状是由CP或SP单独作用所致,还是两者共同作用抑或与其它核酸或蛋白协同作用的结果。另外,RSV抗血清免疫胶体金标记显示,在水稻叶肉组织细胞壁的胞间连丝中存在CP(刘利华等,1999,2000),据此推测CP也可能与病毒的运输有关,RSVMP极有可能是和CP协同起作用的。而NSvc4是否是RSV的运动蛋白,及其与CP和SP之间的关系是怎样,尚需要深入研究。免疫共沉淀(co-immunoprecipitation)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。本研究利用免疫共沉淀技术,初步检测了植物细胞内RSVCP、SP和NSvc4蛋白自身和两两之间的互作情况,为建立病毒编码蛋白的关系图谱及深入研究这3个蛋白在灰飞虱传毒及RSV致病过程中的作用提供了依据
。
1材料和方法
1.1材料1.1.1菌株和质粒大肠杆菌(Escherichiacoli)DH5α和根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)EHA105为本实验室保存。克隆载体pMD18-T购自
大连TaKaRa公司。植物表达载体pKYLX71:35S2为本实验室保存,pEGAD载体由福建农林大学真菌实验室王宗华研究员惠赠。重组载体pGBK-CP、
pGAD-CP、pGBK-SP、pGAD-SP、pGBK-NSnv4和
pGAD-NSnv4由本实验室构建(鹿连明等,2007)并
保存。
1.1.2PCR引物根据pGADT7和pGBKT7载体
序列,设计用于扩增带有HA或c-Myc标签的RSVCP、SP和NSvc4基因的特异引物
:
P1:5'-GGAATTCAAGCTTATGGAGTACCCATACGACG-3'EcoRⅠ和Hind
Ⅲ
P2:5'-CGGGATCCTCTAGATTTCAGTATCTACGATTCAT-3'BamHⅠ和XbaⅠ
P3:5'-GGAATTCAAGCTTATCATGGAGGAGCAGAAGCTG-3'EcoRⅠ和Hind
Ⅲ
P4:5'-GGGATCCTCTAGAAGGGGTTATGCTAGTTATGC-3'BamHⅠ和XbaⅠ
P5:5'-GGATCCGAGCTCAGGGGTTATGCTAGTTATG-3'BamHⅠ和SacⅠ
设计的引物送宝生物(大连)工程有限公司合成。
1.1.3主要试剂Ex-TaqDNA聚合酶和T4DNA连接酶购自大连TaKaRa公司;各种限制性内切酶及NBT和BCIP购自Promega公司(Madison,USA);HA和c-Myc单克隆抗体及proteinGplus-agaroseimmunoprecipitationreagent均购自
SantaCruz公司(SantaCruz,USA);PVDF膜购自
Millipore公司(Boston,USA);碱性磷酸酶标记的羊
抗鼠IgG购自Sigma公司(SaintLouis,USA)。
1.2方法1.2.1目的基因的扩增和克隆分别以重组子pGAD-CP、pGAD-SP和pGAD-NSnv4为模板,以