materials studio操作手册
计算机材料设计materialsstudio教程
计算机材料设计materialsstudio教程1. 介绍材料科学与工程是一门跨学科领域，涉及到物理、化学、工程等多个学科的知识。
在材料研究中，计算机模拟和设计已经成为一种常见的方法。
材料Studio是一款用于材料设计和模拟的软件，广泛应用于材料科学领域。
本教程将介绍材料Studio的基本使用方法，以及在材料设计方面的应用。
2. 安装和启动在开始使用材料Studio之前，首先需要进行软件的安装。
可以通过官方全球信息湾下载安装包，根据指示进行安装。
安装完成后，双击图标启动软件。
3. 界面介绍材料Studio的界面分为多个模块，如建模模块、分子动力学模块等。
用户可以根据需要选择不同的模块进行操作。
在界面的顶部是菜单栏和工具栏，通过菜单栏可以打开新的文件、保存文件、进行模拟等操作。
在界面的中部是主要的视图区域，用户可以在这里进行模拟的展示和操作。
在界面的底部是状态栏，显示了当前软件的状态信息。
4. 材料建模材料Studio提供了丰富的建模功能，用户可以通过拖拽、旋转等操作来建立各种不同的材料模型。
在建模过程中，可以选择不同的原子结构、周期表元素等，还可以进行原子的排列和连接。
建模完成后，可以对材料进行优化，并进行力场计算等操作。
5. 分子动力学模拟分子动力学模拟是材料研究中常用的方法，可以模拟材料的微观结构和动力学行为。
材料Studio提供了强大的分子动力学模拟功能，用户可以在软件中设置模拟的参数，进行分子动力学的模拟。
在模拟过程中，可以观察材料的变化，了解材料的热力学和力学性质。
6. 导入和导出数据在材料研究中，通常需要对模拟的数据进行分析和处理。
材料Studio 可以方便地导入和导出数据，用户可以将模拟结果导出为文本文件、图像文件等格式，方便后续的数据分析。
还可以导入实验数据进行对比分析，帮助验证模拟的结果。
7. 实例分析为了更好地理解材料Studio的使用方法和应用，下面我们以某一具体材料的模拟和分析为例，进行实例分析。
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目的: 介绍CASTEP中的构造优化， 使用立体可视化工具显示等值面 模块: Materials Visualizer, CASTEP 前提: 使用晶体建模工具
背景 密度泛函理论 (DFT)在周期性大尺度材料上应用的进展，对材料设计和加工
越来越重要。该理论使得研究者能对实验数据进展解释；并从未知晶体的构造性 质、结合能和外表分子的活动性确定材料的本征性质。这些理论工具可用于指导 新材料的设计，帮助研究者了解内在的化学和物理过程。
典型的应用包括外表化学，键构造，态密度和光学性质等研究， CASTAP也可用于研究体系的电荷密度和波函数的3D形式。此 外， CASTAP可用于有效研究点缺陷〔空位，间隙和置换杂质〕 和扩展缺陷〔如晶界和位错〕的性质。
Material Studio使用组件对话框中的CASTAP选项允许准备， 启动，分析和监测CASTAP服役工作。
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CASTEP概述
关于CASTAP
中科大MaterialsStudio培训教程4
如果动画(Animation)工具条 是不可见的，
则按右侧的操作，使用观看 (View)菜单让它显示。
设置显示方式，按播放键 。 B-O近似，体系的电子能量是核构型的函数。
在继续工作之前，需要关闭Materials Visualizer 中的所有文件。 关闭DMol3 计算对话框。选择File\Save Project，然后Window\Close All。 双击几何优化子文件夹中的reactant.xsd 和product.xsd。 现在工作区域中只有两个优化了的结构。
运用DMol3的 LST/QST功能来搜索过渡态，需要 在反应物和产物之间创建一条通道，这也是DMol3 计 算时所要求的输入文件。
在反应预览(Reaction Preview)对话框中，把桢数 提高到100；勾选上Superimpose structures；单击 Preview按钮，关闭反应预览(Reaction Preview)对话 框。
电子Hamiltonian 的设置与几何优化计 算的设置一样。
这次需要计算频率(Frequency)相关的性质。 点击Properties 标签栏，勾选上Frequency。
最后，需要对工作描述(Job Description)加以设 置。
点击Job Control 标签，确认Automatic 没有被勾 选上；在Job Description 一栏里打上TS。
点击Set Match，还剩下5H、7H未匹配。重复这个过程，继续点击Set Match来匹配 剩下的没有配对的原子。
反应物、产物的原子已配对。现在可以预览一下反应物和产物之间原子的匹配 情况。
点击反应物或者产物栏中列表里的任意一个原子，可以看到匹配的另一原子。 考察匹配情况，直到满意为止。关闭Find Equivalent Atoms 对话框。
手把手教你用Materials studio
手把手教你用Materials Studio计算碳纳米管的能带结构Materials Studio是Accelrys专为材料科学领域开发的可运行于PC机上的新一代材料计算软件，可帮助研究人员解决当今化学及材料工业中的许多重要问题。
Material s Studio软件采用Client/Server结构，使得任何的材料研究人员可以轻易获得与世界一流研究机构相一致的材料模拟能力。
在这里，我们将介绍如何用Materials Studio 中的Dmol模块计算碳纳米管的能带结构。
Dmol是Materials Studio中自带的密度泛函（DFT）量子力学程序，可计算能带结构、态密度。
基于内坐标的算法强健高效，支持并行计算。
MS4.0版本中加入了更方便的自旋极化设置，可用于计算磁性体系。
4.0版本起还可以进行动力学计算。
碳纳米管是1991年发现的一种新型碳结构,它是由碳原子形成的石磨烯片层卷成的无缝、中空的管体。
一般可分为单壁纳米碳管和多壁纳米碳管。
纳米碳管作为新型的碳材料，其应用具有越来越广阔的天地。
比如说由碳纳米管组成的纤维，具有一般材料所不具有抗拉升能力；金属的碳纳米管，可以被用来作为场效应管之间的连接电路；碳纳米管还可以用来做场效应发射的电极等。
所有的这些应用，都基于对碳纳米管本身的力学和电学性质的了解。
下面的例子介绍如何用Materials Studio 4.0构造不同性质的碳纳米管，以及如何用Dmol模块计算碳纳米管的能带结构。
形象地说，碳纳米管可以想象为将一个石墨层按照一定的法则卷曲后得到。
下图中的OA是碳纳米管的Chiral Vector,也就是将石墨层沿着OA方向卷曲，将O点和A点重叠。
OB是碳纳米管沿轴向的平移矢量。
碳纳米管通常由(n,m)来表征，其意义就是OA=n a1+m a2。
下图是个(4,1)的碳纳米管，图中的θ是碳纳米管的chiral angle，其取值范围在0到30度之间。
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None
PPT文档演模板
Dashed line
Line
Stick
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Lighting
在TON.xsd 的 3D Viewer 上单 击右键，选择 Lighting 选项，该选 项将指定加光情况。在此选项卡内 可以设定三个光源，并改变光源的 照射位置（照射位置用箭头显示）。
msi ?
PPT文档演模板
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2.调整显示方式 在 3D Viewer 上按右键，出右键菜单，选 Display Style ，Display Style 对话
框中的各选项的意义如下：
Atom 栏： Display Style: Line：线状模型。 Stick：棍状模型。 Ball and stick：球棍模型。 CPK：球堆砌模型。 Polyhedron：多面体堆积模型（晶体）。
Materials Studio 使用了多种类型的文件，如3D Atomistic and Mesoscale、 text、chart、 HTML、 study table、grid、script、 和 forcefield documents。在 后面进行计算时，这些文件将逐个显示在projects中，反映了计算的过程。 现在 的教学中, 主要出现的是 3D Atomistic 类型的文件。
3. 改变3D结构的视图
可以使用3D Viewer 工具栏上的工具来改变3D 视图。
3D Viewer工具栏
通过选择相应的工具并在3D 结构上拖动来改变结构视图。
Rotate:旋转结构视图。使用三键鼠标，右键是旋转操作。 Zoom:向上或者右侧拖动可以增大所选结构的视图；向下或者向左侧拖动会缩小所 选结构的视图。使用三键鼠标，也可用鼠标上的滚轮进行3D结构的放大、缩小。 Translation:将结构沿着不同的方向平移。 对于三键鼠标来说，左键执行所选操作，右键则是旋转操作，同时按下左健和右键 则会完成缩放操作。此外还可以将键盘和鼠标联用来完成上述操作。
materials studio算吸附能 -回复
materials studio算吸附能-回复Materials Studio是一个强大的计算材料科学软件包，其中包含了多种模块和工具，用于分子模拟、材料建模和计算分析等方面的研究。
其中一个重要的应用就是计算吸附能。
本文将通过一步一步的方式介绍如何使用Materials Studio对吸附能进行计算。
第一步：材料建模和几何优化在开始计算吸附能之前，首先需要建立吸附材料的分子模型，并对其进行几何优化。
Materials Studio提供了一系列的建模和几何优化工具，可以帮助用户快速而准确地完成这一步骤。
首先，我们需选择一个合适的吸附材料的分子结构。
可以从Materials Studio的数据库中选择已有的分子模型，或者通过建模工具手动构建一个分子结构。
如果所需材料不存在于数据库中，在手动建模时需要合理考虑材料的晶胞结构和原子排列等因素。
接下来，将分子模型输入到几何优化工具中，通过分子动力学或者能量最小化等方法进行几何优化。
几何优化的目的是寻找系统的能量最低点，并使得分子结构达到最稳定和合理的状态。
Materials Studio提供了不同的优化算法和参数选择，用户可以根据材料特性和研究目的进行调整和优化。
第二步：吸附位点和适宜吸附物的确定在材料结构优化完成后，我们需要确定吸附位点和适宜吸附物。
吸附位点是指吸附分子在材料表面或孔隙中的位置，而适宜吸附物则是指能够与材料表面产生相互作用的分子。
Materials Studio提供了一系列的分子对接和表面分析工具，可以帮助用户确定合适的吸附位点和适宜吸附物。
通过分子对接工具，我们可以将吸附分子与材料结构进行模拟，观察它们之间的相互作用。
通过表面分析工具，我们可以定量地分析材料表面的性质和化学活性。
这些工具可以帮助确定吸附位点和适宜吸附物，并为后续的吸附能计算提供必要的信息。
第三步：吸附能计算一旦确定了吸附位点和适宜吸附物，我们就可以通过Materials Studio进行吸附能的计算。
material_studio中文教程
欢迎欢迎使用Materials StudioMaterials Studio是一个采用服务器/客户机模式的软件环境，它为你的PC机带来世界最先进的材料模拟和建模技术。
Materials Studio使你能够容易地创建并研究分子模型或材料结构，使用极好的制图能力来显示结果。
与其它标准PC软件整合的工具使得容易共享这些数据。
Materials Studio的服务器/客户机结构使得你的Windows NT/2000/XP，Linux和UNIX服务器可以运行复杂的计算，并把结果直接返回你的桌面。
Materials Studio采用材料模拟中领先的十分有效并广泛应用的模拟方法。
Accelry’s的多范围的软件结合成一个集量子力学、分子力学、介观模型、分析工具模拟和统计相关为一体容易使用的建模环境。
卓越的建立结构和可视化能力和分析、显示科学数据的工具支持了这些技术。
无论是使用高级的运算方法，还是简单地利用Materials Studio增强你的报告或演讲，你都可以感到自己是在用的一个优秀的世界级材料科学与化学计算软件系统。
易用性与灵活性Materials Studio可以在Windows 98,Me，NT，2000和XP下运行。
用户界面符合微软标准，你可以交互控制三维图形模型、通过简单的对话框建立运算任务并分析结果，这一切对Windows用户都很熟悉。
Materials Studio的中心模块是Materials Visualizer。
它可以容易地建立和处理图形模型，包括有机无机晶体、高聚物、非晶态材料、表面和层状结构。
Materials Visualizer 也管理、显示并分析文本、图形和表格格式的数据，支持与其它字处理、电子表格和演示软件的数据交换。
Materials Studio是一个模块化的环境。
每种模块提供不同的结构确定、性质预测或模拟方法。
你可以选择符合你要求的模块与Materials Visualizer组成一个无缝的环境。
MaterialsStudio5安装及使用教学
MaterialsStudio5安装及使用教学Materials Studio 5.0 安裝OS:Sles10sp1 x64Materials Studio 5.0安裝說明可參考安裝光碟內的README_Materials_Studio 及Info目錄內的文件.安裝前準備：1.請先將基本的cluster環境建置完成2.掛載安裝光碟至/mnt3.新建一新帳號”msi”，使用該帳號安裝Materials Studio 5.04.安裝目錄為/opt/app/MS_5.0開始安裝：1.請先手動安裝HPMPI (請選擇適合的版本)/mnt/UNIX/Linux/hpmpi/ hpmpi-2.03.01.00-20090402r.i386.rpm (x86)/mnt/UNIX/Linux_IA64/hpmpi/ hpmpi-2.03.01.00-20090402r.ia64.rpm (IA64)/mnt/UNIX/Linux_x86_64/hpmpi/ hpmpi-2.03.01.00-20090402r.x86_64.rpm (x64)rpm -ivh /mnt/UNIX/Linux_x86_64/hpmpi/hpmpi-2.02.05.01-20070708r.x86_64.rpm 將會安裝HPMPI於/opt/hpmpi若cluster 有將/opt分享出去，則只須安裝於cluster 上。
若否，請每台節點安裝。
2.安裝Materials Studio 5.0*使用一般user權限安裝,不建議使用root權限安裝使用msi 權限安裝,並將MS 5.0安裝於/opt/app/MS_5.0 的家目錄下$cd /mnt/UNIX$./Install --type cluster (Installing Materials Studio on a Linux cluster)1. Please specify an absolute destination path[/home/paul/Accelrys/MaterialsStudio43] /opt/app/MS_5.02. 29. Everything (選29 完全安裝)會依序安裝1.Accelrys License Pack2.Accelrys Materials Studio 4.31.Accelrys License PackDestination Directory [/home/paul/Accelrys] /opt/app/MS_5.0安裝完會檢測系統是否有安裝HPMPIChecking for dependencies for SharedSetup:4Checking for dependencies for IntelRuntime: None Checking for dependencies for HPMPI:1Do HP-MPI Installation -- MesoDyn server selected.Should HPMPI use SSH? [Y/n]:選Yaffect performance [/tmp] :按Enter不變更If you would like the Gateway at /opt/app/MS_5.0/etcto be started automatically when the system is restartedyou will need to get your administrator to place a copy of/opt/app/MS_5.0/etc/Gateway/msgateway_control_18888 in /etc/rc.d/init.d/msgateway_control_18888and run:/sbin/chkconfig --add msgateway_control_18888Would you like to start the Gateway service now? [Y/n]:選Y1) Enter temporary license password2) Set connection to license server3) List command line license administration tools99) Finished with license configurationChoose one of the above options:選99我是使用試用版的license,稍後再設定.安裝完成將license file放到/opt/app/MS_5.0/LicensePack/Licenses/root:#cp/home/paul/Accelrys/MaterialsStudio43/etc/Gateway/msga teway_control_18888 /etc/init.d/#insserv msgateway_control_18888 on#/etc/init.d/msgateway_control_18888 start此時便可瀏覽器連到Gate way server使用瀏覽器連到Gateway介面作修改Gateway Data ->edit (預設密碼為gatekeeper)1.cpucorestotal 數量設為所有計算節點的cpu數量加總save 儲存設定vi /opt/app/MS_5.0/share/data/machines.LINUX為mpirun的machinefile請修改為"可用節點:CPU數"cn1:8cn2:8設定可用的queuecd/opt/app/MS_5.0/etc/Gateway/root_default/dsd/commands/qu eues/Torque vi qstat.outorqstat -Qf >qstat.out (將系統可用的queue name都加入) Windows client完全安裝,但不安裝license,不啟動Gateway功能開始-> Accelrys Materials Studio 5.0 ->Server Console 在Server Gateways新增GatewayURL http://xxx.xxx.xxx.xxx:port number:18888新增完後在新增的gateway上點選Test Gateway 測試(兩項測試都應該要通過)啓動主程式開始-> Accelrys Materials Studio 5.0 ->Materials StudioFile ->Import-> C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio 5.0\share\Structures\catalysts\heterogeneous\beta-A.msisample檔目錄C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio4.3\share\Structures\catalysts\heterogeneous\使用beta-A.msi測試在視窗左邊點選beta-A.xsd選擇要用的”queue”及CPU個數，按Run開始執行。
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materials studio操作手册
摘要：
1.Materials Studio 操作手册概述
2.操作手册的内容
3.如何使用操作手册
4.操作手册的优点和局限性
正文：
Materials Studio 操作手册是一本针对Materials Studio 软件使用的指南，该软件是一款广泛应用于材料科学领域的第一性原理软件。
操作手册内容全面，涵盖了软件的各个方面，从基础操作到高级技巧，以及常见问题和解决方案，帮助用户更好地理解和使用该软件。
操作手册的内容主要包括以下几个方面：软件的安装和配置，基础的操作方法，如创建、编辑和删除晶体结构等，高级技巧，如优化算法和模拟方法等，以及常见问题和解决方案。
此外，手册还包括了一些案例分析，帮助用户更好地理解软件的使用。
使用操作手册的好处是显而易见的。
首先，手册内容全面，可以帮助用户系统地学习和掌握软件的使用。
其次，手册中的案例分析可以帮助用户更好地理解软件的使用，提高用户的使用效率和效果。
最后，手册中列出了许多常见问题和解决方案，可以帮助用户在遇到问题时快速找到解决方案。
然而，操作手册也存在一些局限性。
首先，手册的内容可能过于专业，对于初学者来说可能难以理解。
其次，手册中的案例分析可能过于简单，对于进
阶用户来说可能无法满足其需求。
最后，手册的更新速度可能无法跟上软件的更新速度，这可能会导致手册中的内容与软件的实际使用情况不符。
总的来说，Materials Studio 操作手册是一款非常有用的软件使用指南，可以帮助用户更好地理解和使用该软件。