11个石蛃样本的线粒体基因组研究
基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构
基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构鲁翠云;孙志鹏;曹顶臣;耿龙武;那荣滨;吴学工;郑先虎【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2024(48)1【摘要】为了解梭鲈种群的遗传结构,实验利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因部分序列分析了中国6个和中亚2个群体的遗传差异,并与欧洲群体的单倍型序列进行了比较。
结果在640 bp的COⅠ基因序列中检测到5个变异位点,定义了7种单倍型,发现Hap1为8个梭鲈群体的共享单倍型,且与欧洲群体的HapA相同,在中国群体所占比例(93.36%)高于中亚群体(72.58%)和欧洲群体(53.85%);Hap2和Hap3是中国群体的特异单倍型,而Hap4~Hap7为中亚群体的特异单倍型。
单倍型序列的聚类图和网络图均显示Hap1/A为梭鲈群体的原始单倍型,中国和中亚群体的特异单倍型相对于原始单倍型仅有1~2个位点的变异,属于Hap1/A的亚型,与欧洲群体的特异单倍型具有较大的差异。
每个群体检测到1~4种单倍型,斋桑湖(ZS)群体单倍型最多,而中国的腾格里湖(NX)、兴凯湖(XK)和鸭绿江(YJ)群体仅有1个单倍型(Hap1);塔什干(TS)群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)最高(Hd=0.514±0.069;π=0.00079±0.00011),其次是ZS群体,而中国梭鲈群体的多样性参数较低。
AMOVA分析结果显示,梭鲈群体间遗传变异占20.74%,群体间遗传分化程度较高(0.15≤F_(st)=0.20736<0.25),TS群体与ZS群体和中国群体间的遗传分化极大(F_(st)>0.25),中国群体中仅黑河(HH)群体与其他群体的遗传分化较大,而中国其他5个群体间无遗传分化。
基于群体间遗传距离的系统进化树显示,来自中国的6个梭鲈群体与哈萨克斯坦的ZS群体聚为一支,而乌兹别克斯坦的TS群体独立为一支。
研究结果为梭鲈群体的繁殖及放流管理提供了参考。
龟瓢虫（鞘翅目：瓢虫科）线粒体基因组全序列测定与分析
·1317·龟瓢虫（鞘翅目：瓢虫科）线粒体基因组全序列测定与分析张永科1，2，张利娟3，卢迎春4，何霞红1，5，张宏瑞1*（1云南农业大学植物保护学院，云南昆明650201；2云南省热带作物科学研究所，云南景洪666100；3河南农业大学植物保护学院，河南郑州450002；4云南农业大学继续教育学院，云南昆明650201；5西南林业大学/西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室，云南昆明650224）摘要：【目的】明确龟瓢虫［Epiverta chelonia（Mader，1933）］线粒体基因组结构特征，分析其系统发育关系，为龟瓢虫的起源、分化和遗传多样性研究提供数据支持。
【方法】利用Illumina二代测序技术测定龟瓢虫线粒体基因组，对基因组序列进行注释和分析；基于瓢虫科（Coccinellidae）3亚科［食植瓢虫亚科（Epilachninae）、瓢虫亚科（Coccinelli-nae）和小毛瓢虫亚科（Scymninae）］11种昆虫的线粒体基因组13个蛋白编码基因（Protein-coding genes，PCGs），采用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育进化树。
【结果】龟瓢虫线粒体基因组全长17347bp，包含37个基因（13个PCGs、22个tRNA基因和2个rRNA基因）和1个非编码的控制区，基因重叠区域共11处，间隔区域共9处。
基因组拥有鞘翅目昆虫典型线粒体基因组的基因组成和排列顺序，AT含量为75.77%，表现明显的AT偏向性。
13个PCGs中除cox1基因以TTG为起始密码子外，其余均以ATN为起始密码子；nad1和nad3基因以TAG为终止密码子，其余11个基因以TAA为终止密码子。
除trnS1基因外，其余21个tRNA的二级结构均为典型的三叶草结构，二级结构中出现少量的G-U碱基错配现象。
系统发育进化分析结果表明，龟瓢虫与苜蓿瓢虫（Subcoccinella vigintiquatuorpunctata）处于同一分支上。
广西片形吸虫中间宿主-小土窝螺线粒体rrnL基因遗传多态性研究
广西片形吸虫中间宿主-小土窝螺线粒体rrnL基因遗传多态性研究王树艳;李鑫;李娟;沈前程;朱兴全;黄维义【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2011(38)1【摘要】为研究广西小土窝螺不同地理株线粒体大亚基(large subunit ribosomal rRNA,rrnL)基因的遗传多态性,对广西大片吸虫6个流行地区96个小土窝螺样品的rrnL基因进行PCR扩增,通过单链构象多态性(single strand conformation poly-Morphism,SSCP)技术筛选出具有代表性的样品进行克隆、测序,并用DNAStar 5.0及MEGA 4.0软件以比对分析.结果显示,6个地区小土窝螺rrnL基因PCR扩增长度约500 bp,在长度为273 bp的序列中检测到15个变异位点,占核苷酸总数的5.49%.百色、南宁和桂林3个地区相同地理株间存在较大的遗传差异.种系发育分析表明,线粒体rrnL基因在一定程度上不是研究小土窝螺种群遗传变异的良好分子标记.本研究为阐明片形吸虫中间宿主-小土窝螺的种群遗传关系提供了基础数据.%In order to analyze sequence variation in the partial mitochondrial large subunit ribosomal rRNA gene (rrnL) of Galba pervia from different geographical locations in Guangxi, rrnL genes were amplified from G.pervia isolates obtained from 6 endemic origins.After screening by SSCP technique, representative samples with variable banding patterns were selected for sequencing.DNAStar 5.0 and MEGA 4.0 were used to analyze the sequences subsequently.The results showed that a fragment of the rrnL approximately 500 bp in length was amplified byPCR and a total of 15 variable sites (5.49％) were detected within a 273 bp sequence in 6 endemic origins.There was a notable sequence variation among isolates from same geographical origin in Baise, Nanning and Guilin.Phylogenetic analysis revealed that mitochondrial rrnL was not a good molecular marker for population genetic study of G.pervia to some extent.These results provided novel data for elucidating the genetic variation of G.pervia, the intermediate host of Fasciola in China.【总页数】6页(P165-170)【作者】王树艳;李鑫;李娟;沈前程;朱兴全;黄维义【作者单位】广西大学动物科技学院,广西南宁,530005;华南农业大学兽医学院,广东广州,510642;华南农业大学兽医学院,广东广州,510642;华南农业大学兽医学院,广东广州,510642;广西大学动物科技学院,广西南宁,530005;中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室,甘肃兰州,730046;广西大学动物科技学院,广西南宁,530005【正文语种】中文【中图分类】Q78【相关文献】1.耳萝卜螺捕食华支睾吸虫第一中间宿主纹沼螺的实验研究 [J], 邓立君2.斑点杂交试验检测小土窝螺的肝片吸虫感染 [J], 张洪英;F.Kraeme3.基于线粒体rrnS和rrnL序列探讨宫川棘口吸虫的分子进化地位 [J], 李烨; 马晓晓; 吕庆博; 胡阳; 邱宏宇; 常巧呈; 王春仁4.斑点杂交试验检测小土窝螺的肝片吸虫感染 [J], 张洪英;F.Kraemer;沈永林;顾有方;沈涛;王丙云;毛鑫智;T.Schnieder5.古丈县再次发现肺吸虫第一中间宿主新螺种—有齿秋吉螺和格来德拟钉螺 [J], 冯兴才;张开仁;周武和;陈绍振;李志坚;张世德;张寿季因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
基于线粒体和初级共生菌基因序列的荻草谷网蚜6个地理种群的遗传多样性研究
基于线粒体和初级共生菌基因序列的荻草谷网蚜6个地理种群的遗传多样性研究作者：孙靖轩李迁谭晓玲范佳张勇陈巨莲来源：《植物保护》2022年第06期关键词获草谷网蚜；种群遗传结构；线粒体基因；初级共生菌基因；遗传分化荻草谷网蚜Sitobion rnzscanthi（Takahashi）是我国一种严重为害小麦的害虫，在我国一直被广泛误用为麦长管蚜，1999年由我国知名蚜虫分类专家张广学主编的《西北农林蚜虫志》在中国环境科学出版社正式发表，对该蚜虫学名进行勘误校正。
麦长管蚜在我国境内仅存在于新疆伊犁等少数地区，其腹管长度和触角节次生感觉圈分布位置与荻草谷网蚜存在一定差异。
本课题组通过对基因组研究也验证了我国麦蚜优势种为荻草谷网蚜。
荻草谷网蚜原产于亚洲，主要分布于中国、印度以及太平洋地区，每年暴发，对小麦的安全生产造成严重威胁。
目前，我国研究报道中，包括本文引用的参考文献中“麦长管蚜”即为“荻草谷网蚜”。
该蚜虫在南方和北方均具有一定迁飞性。
了解其种群遗传多样性和相关因素有助于推测其迁飞路径并为害虫防治提供理论基础。
早期的迁飞研究以传统的越冬调查、灯光诱集、雷达监测等测报方法来预报虫情。
张向才等依据越冬调查的结果推测麦长管蚜在5月份可以随西南气流由豫西、晋南、关中、陇南、陇东和延安等北方冬麦区迁往银川、内蒙古、张家口、承德等春麦区。
国伟等推测荻草谷网蚜种群南北向的交流要强于东西向。
董庆周等认为宁夏银川存在外来蚜源远距离迁入的现象，且外来蚜源可以成为春季田间荻草谷网蚜种群的主体。
了解麦蚜虫源及迁飞路径是准确预测预报和有效防治的基础。
然而，由于蚜虫个体小，缺少合适研究技术方法，因此荻草谷网蚜的迁飞路径及迁飞规律的研究一直进展缓慢。
近年来分子生物学技术高速发展为蚜虫迁飞研究提供了新的技术手段。
研究蚜虫群体遗传变异的地理分布可以推断不同地區蚜虫的遗传多样性和可能的迁飞路线，为研究蚜虫的迁飞扩散等提供分子遗传学证据。
其中线粒体DNA以进化速率快，遗传多样性丰富等特点，在昆虫近缘种和地理种群进化研究中得到广泛应用。
访花昆虫野蚜蝇线粒体基因组结构分析
环境昆虫学报 2021, 43 (4)： 992 - 1002Journal of Eiwironmental Entomologydoi ： 10. 3969/j.闫艳，程梦迪，曹春桥，李虎.访花昆虫野酚蝇线粒体基因组结构分析[J].环境昆虫学报，2021, 43 (4)： 992-1002.访花昆虫野妍蝇线粒体基因组结构分析闫艳，程梦迪，曹春桥，李虎**基金项目：陕西省科技厅自然科学基础研究计划(2020JQ-869)；陕西理工大学开放课题研究基金(SLGPT2019KF03 -01)；陕西理工大学研究生创新基金项目(SLGYCX2015)；中国博士后科学基金(2016M590968)作者简介：闫艳，女，1996年生，河南省三门峡人，硕士研究生，研究方向为动物系统与进化，E-mail ： 187****2013® 163. com* 通讯作者 Author for correspondence :李虎，男，博士，E - mail : lihu@ snut. edu. cn 收稿日期 Received : 2021 -01 -30；接受日期 Accepted : 2021 -05-13(陕西理工大学生物科学与工程学院，陕西汉中723000)摘要：野酚蝇Sgp 血s towiAS ( Oslen-Sacken)成虫具访花习性，是重要的传粉昆虫；幼虫捕食酚虫，是蜗虫重要天敌之一。
本研究通过高通量测序、组装拼接获得了完整的野蜗蝇线粒体基因组全序列(GenBank 登录号:MW074962),其序列全长为16 444 bp,包含13个蛋白编码基因(PCGs)、22个tRNAs 、2个rRNAs 和D-loop 区。
野酚蝇线粒体全序列A + T 含量为80. 6%, G + C 含量为19.4% ,表现出明显的A+T 偏斜。
除了 COX/、ATP8、ATP6和ND1的起始密码子为TTG,其它9个PCGs 以ATN 为起始密码子；COXI 的终止密码子为不完整的T--, ATP6为TAG,其余11个PCGs 的终止子为TAA O 22个tRNAs 的二级结构均为典型的三叶草结构，并预测了野妍蝇rRNAs 的二级结构。
基于线粒体cox1、nad1和rrn L基因探讨马圆线科线虫间的亲缘关系
基于线粒体cox1、nad1和rrn L基因探讨马圆线科线虫间的亲缘关系张中怀;高远;兰卓;邱阳元;邱鸿宇;安琪;高俊峰;王春仁【期刊名称】《黑龙江八一农垦大学学报》【年(卷),期】2024(36)1【摘要】为探讨马圆线科线虫(圆线亚科和盅口亚科)间的亲缘关系,对长伞杯冠线虫(Cylicostephanus longibursatum)、冠状冠环线虫(Coronocyclus coronatus)、细口杯环线虫(Cylicocyclus leptostomus)、拉氏杯口线虫(Poteriostomum ratzii)、麦氏副杯口线虫(Parapoteriostomum mettami)和无齿圆形线虫(Strongylus edentatus)6种线虫的线粒体cox1、nad1和rrnL基因进行扩增,与同科相关线虫进行比较分析。
然后以线粒体cox1、nad1和rrnL串联序列为标记基因,采用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建进化树来探讨圆线科线虫间的亲缘关系。
结果显示,研究中6种线虫的cox1序列长度均为1578 bp,nad1的序列长度除无齿圆形线虫为879 bp外,其余均为873 bp,rrnL序列长度均不同,大小为959~980 bp。
6种线虫的cox1、nad1和rrnL的AT含量分别为67.55%~69.71%、71.36%~73.83%和80.88%~82.59%。
圆线科线虫间cox1、nad1和rrnL基因的相似性分别为83.4%~97.9%、79.0%~98.4%和78.8%~98.9%。
值得注意的是,圆线亚科的三齿属线虫与盅口亚科的相似性总体要高于同亚科的圆线属。
进化分析显示,三齿属并没有与同亚科的圆线属形成独立分支,而是与盅口亚科线虫聚集在一起。
在盅口亚科分支中,并非每一属单独形成一独立分支,冠环属和杯冠属最为明显,为复系。
基于马圆线虫线粒体cox1、nad1和rrnL的序列和进化分析表明,三齿属线虫与盅口亚科的关系较圆线亚科更近,支持三齿属应隶属于盅口亚科这一假说。
新疆北鲵线粒体dnad-loop区序列测定及遗传多样性分析
中山大学硕士学位论文新疆北鲵线粒体DNA D-loop区序列测定及遗传多样性分析姓名：***申请学位级别：硕士专业：生物化学与分子生物学指导教师：***20070607地活动。
非繁殖期成体及亚成体夜晚爬上草地觅食、活动，有的成体在陆上爬行离水源最远的距离有ｌｌ米。
幼体多藏匿在浅水小石块下，在水中觅食、活动。
有冬眠习性，每年１１月中，下旬进入冬眠期，次年４月份左右逐渐解除冬眠（王秀玲等，２００６）。
食性：新疆北鲵主要以活体动物性饵料为食，食性广，夏季食量大。
主要以毛翅目石蛾幼虫——石蚕、祓翅目石蝇幼体为食，还捕食草地活动的甲虫，双翅昆虫和幼虫，小蝗虫、蜘蛛、蚯蚓等；幼体以水中微型甲壳类——腺状介虫和小石蚕为食。
成体一般每年繁殖一次，体外受精，繁殖期为５月初左右至８月中下旬。
卵均产于水中石块底面，雄性先将精包产于石块底面并牢固粘着，雌性再以泄殖腔孔对接于精包粘紧后，缓慢向前爬行中产出一对卵胶囊，悬挂于石块下呈倒“矿”字形，精子游入卵胶囊内受精，产卵量为３０—９８粒不等，初产卵胶囊呈半透明乳白色，略显淡灰兰，卵粒直径２．８哪，卵胶囊长度与卵粒数呈正相关，一般长度为３５－４０岫左右，后随胶囊吸水膨胀及胚胎发育变粗变长，更透明，自然孵化期一般为５０天左右：孵化出膜幼体体长１８—２０ｉｂｍ左右，形态似小鱼，体前无平衡器，体侧有侧线，有明显不规则的黑色素斑（王秀玲等，２００６）。
该种初产卵粒在胶囊内以螺旋形排列成４行，此排列形式不同于小鲵科其他任何种。
（见图１－１）图１－１新疆北鲵（图中所示依次为；卵胶囊、幼体，成体；卵胶囊和幼体图片来自互联网）Ｆｉｇｕｒｅ１－１ＰｈｏｔｏｓｏｆＲ．ｓｉｂｉｒｕｃｕｓ（ｓｐａｗｎｃａｐｓｕｌｅ，ｌａｒｖａｅａｎｄａｄｕｌｔ，ｐｉｃｔｕｒｅｓｏｆｓｐａｗｎｃａｐｓｕｌｅａｎｄｌａｒｖａｅｗｅｒｅｆｒｏｍｔｎｔｅｒｎｅｔ）１．３新疆北鲵生存现状由于生活范围狭窄、不耐干燥等原因，两栖动物比其它高等脊椎动物一一如鸟类和哺乳动物更脆弱。
2024年全国中学生生物学联赛四川省赛区初赛试题及答案解析
１０．在有丝分裂中期，若出现单附着染色体（染色体的着丝粒只与一侧的纺锤丝相连，如下 图所示）细胞将延缓后期的起始，直至该染色体与另一极的纺锤丝相连，并正确排列在赤道 板上。此过程受位于前期和错误排列的中期染色体上的ＭＡＤ？蛋白的监控，正确排列的中 期染色体上没有ＭＡＤ？蛋白。用玻璃微针勾住单附着染色体，模拟施加来自对极的正常拉 力时，细胞会进入分裂后期。下列说法正确的是（ ）
掉ＴｄＲ，重新更换培养液，第二次加入 ＴｄＲ培养一段时间，可使所有细胞都处于Ｇ？／Ｓ交界
处，完成同步化。已知其细胞周期的Ｇ？期、Ｓ期、Ｇ２期、Ｍ期分别为８ｈ，６ｈ，５ｈ、１ｈ。下
列说法错误的是（ ）
Ａ．开始培养时，处于Ｇ？期的细胞约占１／４
Ｂ．第１次加入ＴｄＲ 处理１４ｈ，可使所有细胞都处于Ｇ？／Ｓ交界处或Ｓ期
Ｃ．有些植物的叶片生有茸毛，会增强植物的蒸腾作用，有利于植物对无机盐的运输
Ｄ．在流动空气中，为了减少蒸腾作用，有些植物可能会调节叶片的方向与日光平行
６．高等生物的细胞周期依次为ＤＮＡ合成前期（Ｇ？期）、ＤＮＡ合成期（Ｓ期）、ＤＮＡ合成后
期（Ｇ？期）、分裂期（Ｍ期）。利用人工诱导可以使处于不同分裂时期的细胞处于细胞周期
强度，然后将长势一致的棉花植株随机均分为 Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ四组，通过不同遮光处理一周 后，测得结果如下表所示。下列分析正确的是（ ）
处理
光照强度（μｍｏｌ／ｍ２－ｓ） 叶绿素含量（ＳＰＡＤ） 净光合作用（ｍｇ．ｇ－１）
无遮光处理（Ａ组）
１２９２．７
４０． ９
２５． ４
红色透光膜（Ｂ组）
４１０．３
４０． ０
ＭＡＰＫＫＫ
宁乡猪线粒体DNA全基因组研究
26 | 2019年第39卷第02期 总第265期 |宁乡猪线粒体DNA 全基因组研究许 栋1,4，曾勇波2，曾青华3，杨一帆1，马海明1*(1 湖南农业大学动物科学技术学院，湖南 长沙 410128；2 宁乡县畜牧兽医水产局，湖南 宁乡 410600；3 宁乡大龙畜牧科技有限公司，湖南 宁乡 410600；4 岳阳职业技术学院，湖南 岳阳 414000)宁乡猪是我国著名的四大地方品种之一，原产于湖南省宁乡县的流沙河及草冲一带，原名为流沙河猪或草冲猪。
宁乡猪的形成历史悠久，宁乡猪的特征是“丝颈葫芦肚，耳薄嘴筒齐，稀毛现薄皮，鱼尾后脚直，奶子一斩齐，四脚要撒蹄”、“乌云盖雪银颈圈”。
其体型中等，体质疏松细致，体躯呈圆筒状，毛色为黑白花，四肢、肋腹及颈下部为白色，头和臀部呈黑色。
它与杜洛克猪等其他外来品种相比，具有抗逆性强和肉质优良等特点。
本研究首次测定了宁乡猪的线粒体DNA 全基因组序列，旨在为其种质特性研究积累基础资料，并为进一步研究奠定坚实基础。
1 材料与方法1.1 样品采集宁乡猪采自湖南省宁乡大龙畜牧科技有限公司，剪少量耳组织－20 ℃保存。
1.2 基因组DNA 提取及序列分析软件基因组DNA 提取按常规酚-氯仿法进行，用24对引物进行聚合酶链式反应扩增线粒体的完整基因组，DNA 序列采用sergene.v7.1软件分析，利用tRNA scan-se1.21 Search Server 软件(lowe 和eddy 1997)和DOGMA 软件(/) (Wyman 等，2004)分析了线粒体DNA 的基本组成和分布。
2 结果与分析宁乡猪线粒体全基因组总长度为16 690 bp，基本组成为34.70％A、25.81％T、26.18％C、13.30％G 和A ＋T(60.52％)，包含了典型线粒体DNA 结构，包括2个核糖体RNA 基因、13个蛋白质编码基因、22个tRNA 基因和1个非编码控制区域(D-loop 区域)。
某理工大学《微生物学教程》考试试卷(1040)
某理工大学《微生物学教程》课程试卷（含答案）__________学年第___学期考试类型：（闭卷）考试考试时间：90 分钟年级专业_____________学号_____________ 姓名_____________1、判断题（230分，每题5分）1. 有些假单胞菌可以利用多达90种以上的碳源物质。
（）答案：正确解析：假单胞菌广泛分布于自然界，如土壤、水、食物和空气中。
有荚膜、鞭毛和菌毛。
营养要求不高，种类多，可以利用多达90种以上的碳源物质。
2. 大多数真菌需要高碳氮比的营养物，而动物致病细菌需要低碳氮比的营养物。
（）答案：正确解析：不同生物的碳氮比不同，故所需营养物的碳氮比也不同，具有高碳氮比的生物需要碳氮比的营养物，反则反之。
真菌的碳氮比大于动物致病细菌，故真菌所需营养物的碳氮比高于动物致病菌。
3. 链激酶又称血纤维蛋白溶酶，可直接把血浆中的纤维蛋白凝块水解。
（）答案：错误解析：链激酶能激活血纤维中蛋白溶酶原，使之变成血纤维蛋白溶酶，再由后者把血浆中的纤维蛋白凝块水解，从而有利于病原体在组织中扩散。
4. 根据16S和18S rRNA测序和统计结果所提出的三域学说来看，真核生物域与古生菌域更为接近。
（）答案：正确解析：三域学说是Woese等人对大量微生物进行16S和18S rRNA核苷酸顺序的同源性测定并比较其同源性水平后提出的。
三个域指细菌域、古生菌域和真核生物域。
古生菌在分类地位上与真细菌和真核生物并列，并且在进化谱系上更接近真核生物。
5. 一个酵母菌细胞上，只可能有一个蒂痕，但芽痕则可以有多个。
（）答案：正确解析：酵母细胞最常见的繁殖方式是出芽繁殖，芽体与母细胞分离时，会在母细胞上留下一个芽痕，相应的在子细胞上留下蒂痕。
故一个酵母菌细胞上只有一个蒂痕，但多次出芽后会形成多个芽痕。
6. 青霉素是肽聚糖单体五肽尾末端的D丙氨酰D丙氨酸的结构类似物，故可与后者相互竞争转肽酶的活性中心。
（）[华中农业大学2017研；南开大学2012研]答案：正确解析：7. 无氧呼吸是一类在无氧条件下进行的、产能效率较低的特殊呼吸。
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11个石蛃样本的线粒体基因组研究
石炳目在昆虫纲的系统发生关系分析中处于基部,是最早分支出来的原始类群,是一种不被人们熟知的无翅类昆虫。
目前,关于石蛃目的系统发生地位及单系性已经得到普遍证实,但是关于石蛃目昆虫内部各科、各亚科、各属之间的系统
发生关系及系统地理研究一直存在着争议,有待更多的分子数据对其进行深入的研究。
因此本研究是在本实验室原有研究的基础上通过增加石蛃目昆虫样本数量,对其内部系统发生关系进行更深入地研究并对中国石蛃目昆虫的扩散机制进行
初步探讨。
本研究包括石蛃目昆虫中的2亚科4属的11个样本,分别是:石蛃亚科(Machilinae)中的辽宁弓长岭的高丽韩蛃Coreamachiliscoreanus、山西衡山的高丽韩蛃 Coreamachiliscoreanu、新疆喀纳斯异蛃
Allopsontus(Allopsontinus)kanasiensis、新疆新源异蛃
Allopsontus(Allopsontinus)xinyuanensis、新疆玛纳斯希蛃Silvestrichilis manasiensis;新蛃亚科(Petrobiinae)中的河北承德的希氏跳蛃Pedetontus silvstri、辽宁凤城的希氏跳蛃Pedetontussilvestri、太姥山跳蛃Pedetontustaimushanensis、霸王岭跳蛃Pedetontusbawanglingensis、大陈岛跳蛃Pedetontus dachendaoensis、重庆跳蛃Pedetontus chongqingensis。
11个石蛃样本的线粒体基因组信息全部成功获得,其基因组的长度分别是:高丽韩蛃(弓长岭)Coreamachilis coreanus 15579 bp、高丽韩蛃(衡
山)Coreamachilis coreanus 15574 bp、喀纳斯异蛃
Allopsontus(Allopsontinus)kanasiensis 15628 bp、新源异蛃
Allopsontus(Allopsontinus)xinyuanensis 15518 bp、玛纳斯希蛃
Silvestrichilis manasiensis 15542bp、希氏跳蛃(承德)Pedetontus silvestri 15747bp、希氏跳蛃(凤城)Pedetontussilvestri 15872 bp、太姥山跳蛃Pedetontus taimushanensis 15635 bp、霸王岭跳蛃Pedetontus bawanlingensis15826 bp、大陈岛跳蛃Pedetontus dachendaoensis15630 bp、重庆跳蛃Pedetontus chongqingensis 15806 bp。
11 个石蛃样本的线粒体基因组均具有明显的AT偏向性,其中A+T含量最高的是凤城的希氏跳蛃(Pedetontus silvestri),为75.2%;喀纳斯异炳(Allopsontus(Allopsontinus)kanasiensis)
的含量最低,为69.0%;其他石炳样本的AT含量均在这个范围内。
这11个样本的全序列中A、T、C、G 4种碱基含量均呈现出
A%>T%>C%>G%的现象。
11个样本序列G+C含量中,新疆玛纳斯、新疆喀纳斯、新疆新源三地样本的G+C碱基含量相对较高,分别为29.7%、31%和29.7%。
本研究11个样本的线粒体蛋白编码基因,多数是以ATN作为起始密码子,但也存在以TTG、GTG、TTA作为起始密码子的情况,如高丽韩蛃(2个)、喀纳斯异蛃、新源异蛃的ND2基因以TTG为起始密码子;承德的希氏跳蛃、霸王岭跳炳、
大陈岛跳炳的ND2基因以GTG为起始密码子,玛纳斯希蛃的ND2基因以TTA为起始密码子,这3种非常见情况在其他昆虫中也有报道。
11个样本的线粒体蛋白编码基因,一般以TAA终止,但也存在以TAG和不完全密码子TA、T终止的情况。
结合NCBI上公开发表(10条)及本实验室原有的石蛃线粒体基因组序列(10条)共31条数据,基于13个蛋白编码基因的核苷酸数据集(G33)和氨基酸数据集(A33),构建BI和ML系统发生树进行分析,支持石蛃科、石蛃亚科和新炳亚科的
并系性。
新蛃亚科中的跳炳属分为两个支系,海南跳蛃和重庆跳蛃聚为一支,在新蛃亚科中较早分支出来;其他地点的跳蛃属聚为一支,较跃蛃属后分支出来,因此
我们建议将海南跳蛃和重庆跳蛃划分为一个新属。
西藏异炳(Machilanus)亚属和哈拉乌异蛃(Kaplinilis)亚属没有和其他异蛃属聚在一起,而是分别和别的属形成姐妹群关系,因此我们建议将西藏异炳(Machilanus)亚属和哈拉乌异蛃(Kaplinilis)亚属分别提升为属级分类介元。
对中国石炳目昆虫的系统地理进行研究发现,跳蛃属的分布主要集中在沿海地区,扩散机制是从南向北;跃蛃属、异蛃属无明显的扩散特点;韩蛃属的扩散类型也是从南向北。
结合古蛃亚科分布于云南地区,因此本研究认为中国石蛃目昆虫的起源中心
是云南一带,各科属的扩散是从南向北。