Hesperos创建用于药物测试人体芯片模型
pdx模型
PDX模型
PDX模型是一种常用于癌症研究的实验模型，其全称是Patient-Derived Xenograft Model。
这种模型通常通过将患有癌症的患者的癌细胞移植到实验动物
中来研究癌症的发病机制，药物治疗效果等问题。
PDX模型的建立通常包括以下
几个步骤：
1.样本采集：首先，需要从癌症患者身上获取癌细胞或肿瘤组织样本。
这通常需要经过严格的伦理审批，并确保样本的获取方式对患者没有额外的伤害。
2.移植：将采集到的样本移植到实验动物中，常用的实验动物包括小
鼠、裸鼠等，这些动物具有较高的移植成功率。
3.培养维持：移植成功后，需要对动物进行适当的养护与观察，确保
移植的细胞或组织得以生长与扩增。
4.实验研究：建立好PDX模型后，科研人员可以进行各种实验研究，
包括癌症的发病机制研究、药物筛选以及药物疗效评估等。
PDX模型在癌症研究中具有重要的应用价值，因为它能更好地模拟人类体内的
癌症情况，能够更准确地预测药物的疗效以及个体化治疗方案。
此外，PDX模型
还可以为临床医生提供更多信息，帮助他们做出更好的治疗决策，促进精准医疗的发展。
总的来说，PDX模型是当前癌症研究中一种重要的实验模型，其建立需要严谨
的操作与细致的观察，但可以为科研人员提供更多有益的信息，为癌症的治疗与研究带来希望。
芯片良率模型
芯片良率模型全文共四篇示例，供读者参考第一篇示例：芯片制造是现代技术行业中的一个重要领域，芯片良率是评定芯片生产质量的重要指标。
芯片良率模型是用来预测芯片产量中不良产品的模型，通过对芯片生产过程的各种参数进行统计分析和建模，可以有效地提前发现潜在的生产问题，从而提高产品质量和减少生产成本。
芯片良率模型的建立过程通常分为数据采集、特征提取、模型训练和模型评估四个阶段。
在数据采集阶段，会收集各种与芯片生产相关的数据，如生产设备的运行情况、材料使用情况、环境条件等。
在特征提取阶段，会对采集到的数据进行处理，提取出对芯片良率影响较大的特征。
然后，利用机器学习、统计分析等方法对这些特征进行建模和训练，得到芯片良率模型。
需要对模型进行评估，验证其有效性和准确性。
芯片良率模型的建立需要考虑到多个因素。
需要选取合适的数据采集手段和设备，以确保采集到的数据具有代表性和可靠性。
需要选择适合的特征提取方法和建模算法，以提高建模的准确性和泛化能力。
还需要考虑到实际生产环境中可能存在的各种不确定性因素，如设备故障、人为操作失误等，以保证模型的稳健性和鲁棒性。
芯片良率模型的应用可以带来多方面的好处。
通过芯片良率模型的预测，生产企业可以及时发现生产过程中的问题，采取相应的措施进行调整和改进，从而提高产品质量和生产效率。
芯片良率模型可以帮助企业降低生产成本，避免不良产品的产生和浪费。
芯片良率模型还可以帮助企业制定更加合理的生产计划和生产调度，提高生产整体运营效率。
在未来，随着大数据、人工智能等新技术的不断发展和应用，芯片良率模型也将得到进一步的提升和完善。
通过更加精细化和智能化的数据分析和建模方法，可以更准确地预测和控制芯片生产过程中的各种不良因素，从而实现追求更高品质和更高效率的生产目标。
芯片良率模型的不断优化和升级，将进一步推动芯片制造产业的发展和进步，为科技领域的发展提供更为可靠的支撑。
第二篇示例：芯片是现代电子产品中不可或缺的部件，而芯片良率则是衡量一个芯片生产过程中质量的重要指标。
小鼠乳腺癌4T1luc细胞实验性肺转移模型的建立及其评价
小鼠乳腺癌4T1luc细胞实验性肺转移模型的建立及其评价一、引言乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一，其转移是导致患者死亡的主要原因。
了解乳腺癌的转移机制对于开发有效的治疗策略至关重要。
实验性肺转移模型是一种重要的研究工具，可以用于研究乳腺癌的转移过程以及评估潜在的治疗方法。
本研究旨在建立小鼠乳腺癌4T1luc细胞实验性肺转移模型，并对其进行评价。
二、材料与方法1. 细胞系：使用4T1luc细胞系，该细胞系是小鼠乳腺癌细胞系，并稳定表达荧光素酶基因。
2. 动物模型：选择雌性BALB/c小鼠作为实验动物，实验前适应性饲养一周。
3. 细胞接种：将4T1luc细胞悬浮液通过尾静脉注射到小鼠体内。
4. 成像与检测：使用生物发光成像系统对小鼠进行成像，以检测肺转移灶的形成。
5. 组织学分析：在实验结束后，对小鼠进行解剖，取肺组织进行组织学分析，包括HE染色和免疫组化染色。
三、结果1. 肺转移灶的形成：通过生物发光成像系统，我们观察到在细胞接种后第14天，小鼠肺组织中出现明显的荧光信号，表明肺转移灶的形成。
2. 组织学分析：HE染色结果显示，肺组织中存在大量肿瘤细胞浸润，形成转移灶。
免疫组化染色进一步证实了这些细胞为4T1luc细胞。
四、讨论本研究成功建立了小鼠乳腺癌4T1luc细胞实验性肺转移模型，并通过生物发光成像和组织学分析对其进行了评价。
该模型能够有效地模拟乳腺癌的肺转移过程，为研究乳腺癌的转移机制和评估潜在的治疗方法提供了有力的工具。
五、结论小鼠乳腺癌4T1luc细胞实验性肺转移模型的建立及其评价六、模型的应用前景本研究所建立的小鼠乳腺癌4T1luc细胞实验性肺转移模型具有广泛的应用前景。
该模型可以用于研究乳腺癌的转移机制，包括肿瘤细胞如何侵入血管、如何在循环系统中存活、如何逃避免疫系统的清除以及如何在远端器官形成转移灶等。
通过深入研究这些过程，我们可以找到干预转移的关键点，为开发新的治疗策略提供理论依据。
Discovery Studio官方教程--基于MODELER构建抗体模型
抗体3D结构的预测（MODEL ANTIBODIES）教程介绍抗体分子是生物学和医学领域用途最为广泛的蛋白分子。
以肿瘤特异性抗原或肿瘤相关性抗原、抗原独特型决定簇、细胞因子及其受体、激素及一些癌基因产物作为靶分子，利用传统的免疫方法或通过细胞工程、基因工程等技术制备的多克隆抗体、单克隆抗体、基因工程抗体广泛应用于疾病诊断、治疗及科学研究等领域，并以其毒副作用小、天然和高度特异性的疗效，创造出了巨大的社会效益和经济效益。
抗体和抗体-抗原复合物的结构通常被用于了解基于抗体的药物的作用机制,在抗体工程上提供帮助。
X射线晶体学方法有助于抗体结构的解析，但是与计算模拟相比，耗费的经济成本和时间成本太高。
本教程中使用DS基于一个合成人类Fv区域的序列构建3D抗体模型，相对于X射线晶体结构选择性评估模型的质量。
随着大量的抗体Fv区域、Fab区域和高度保守区的结构被解析出来，使用同源模建的方法构建抗体结构成为可能。
构建一个抗体Fv或Fab区域结构模型的一个典型的流程是首先根据已知抗体模板结构构建框架结构，然后必要的时候使用额外的模板优化互补决定区。
在本教程中的任务包括以下几个步骤：♦结构模板的识别♦抗体Framework区模型的构建♦构建抗体Loop区♦模型可靠性的评估抗体序列的分析和识别载入序列。
在本教程中对于序列的分析这一步对于构建抗体结构不是必须的，但是对于序列上述两个序列依次分别为抗体MA5的重链（H）序列和轻链（L）序列。
计算完成之后会自动打开一个序列注释结果窗口（如上图），蓝色的表示轻链可变区，粉红色的表示CDR loop区，同样的结构域在序列注释窗口显示同样的颜色。
如果你在序列注释窗口中选择一段loop区，相应的氨基酸会在下方的序列窗口中以同样的颜色显示出来。
小技巧：鼠标右键点击序列窗口的标尺工具可以选择Residue ID，显示出每个氨基酸的残基号。
同理，可以用同样的方法把重链的序列分析注释显示出来。
基于CRISPRCas9技术的TRPS1基因敲除小鼠模型的构建
38基于CRISPR/Cas9技术的TRPS1基因敲除小鼠模型的构建李腾雁，刘文杰，赵宏，蔡建强*（国家癌症中心/ 国家肿瘤临床医学研究中心/ 中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肝胆外科，北京 100021）李腾雁 博士研究生中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肝胆外科目的:基于CRISPR/Cas9技术构建敲除TRPS1基因的杂合子小鼠，并进行鉴定。
方法: C57BL/6N小鼠自行交配后，使用Cas9/sgRNA注射受精卵的方法构建基因敲除小鼠，对可遗传的小鼠基因型进行鼠尾检测，TRPS1杂合子敲除小鼠分别与野生型小鼠交配，获得具有稳定基因型的小鼠。
结果:本实验通过使用Cas9/sgRNA注射受精卵的方法，所有繁殖小鼠经鼠尾基因型鉴定，证实成功构建了18只TRPS1基因敲除的杂合子小鼠。
结论:基于CRISPR/Cas9技术成功构建了敲除TRPS1基因的杂合子小鼠。
关键词：CRISPR/Cas9；TRPS1；结直肠癌；基因敲除小鼠摘要基金支持：国家自然科学基金(81672461) ；国家自然科学基金(81972311) ；深圳市“医疗卫生三名工程”（SZSM202011010）首都卫生发展科研专项项目(2018-1-4021)；中国医学科学院医学与健康科技创新工程(2016-I2M-1-001,2017-12M-4-002) *通信作者：蔡建强************************Generation of TRPS1 knockout mice by CRISPR/Cas9-mediated gene targetingAbstractObjectives: This study aimed to construct and identify heterozygous mice knocked out of TRPS1 gene based on CRISPR/ Cas9 technology.Methods: After self-mating of C57BL/6N mice, TRPS1 knockout mice were constructed by injecting fertilized eggs with Cas9/sgRNA, and the mouse genotypes of heritable mice were detected by tail. TRPS1 heterozygous knockout mice were mated with wild-type mice to obtain mice with stable genotypes.Results: In this experiment, the fertilized eggs were injected with cas9 / sgRNA, all breeding mice were identified by tail genotype, 18 TRPS1 knockout heterozygous mice were successfully constructed.Conclusion: In this study, we successfully constructed TRPS1 knockout heterozygous mice based on CRISPR / cas9 technology, which provided a research platform for further research on the role of TRPS1 in the occurrence, development and possible liver metastasis of colorectal cancer at the animal level.Keywords: CRISPR/Cas9; TRPS1; Colorectal cancer; Gene knockout mouseLi Tengyan, Liu Wenjie, Zhao Hong, Cai Jianqiang*(National Department of Hepatobiliary Surgery, National Cancer Center/National Clinical Research Center for Cancer/ Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100021, China)我国结直肠癌（colorectal cancer，CRC）的发病率和死亡率均保持上升趋势。
靶向SF3B1突变型葡萄膜黑色素瘤的药物筛选
葡萄膜黑色素瘤（UM ）起源于眼部葡萄膜的黑色素细胞。
目前，放射疗法和手术切除是治疗原发性葡萄膜黑色素瘤的有效手段。
但是，超过一半的患者会发展成为转移性葡萄膜黑色素瘤，对于转移性的葡萄膜黑色素瘤患者，化疗和免疫疗法效果并不理想，患者的中位生存期只有6~12月［1,2］。
SF3B1基因编码小核糖核蛋白snRNP 的一个重要亚基，参与mRNA 剪接的早期阶段。
SF3B1突变蛋白识别异常的分支位点，导致异常的可变剪接模式［3,4］。
SF3B1基因在葡萄膜黑色素瘤中的突变率高达20%［5］，并且与中等程度的恶性转移相关［6,7］。
SF3B1突变相关的异常剪接模式提示剪切体有可能成为肿瘤治疗的靶标［8］，与正常细胞相比，携带SF3B1突变的肿瘤细胞有可能对剪接体抑制剂更为敏感［9-12］。
已有研究发现靶向SF3B1的剪切体抑制剂E7107和H3B-8800对携带剪切因子突变的髓系血液病有更强的的抑制作用［11,13］。
但是，E7107的一期临床试验因存在视觉毒性而中止［13-15］。
目前还没有安全有效的药物靶向SF3B1基因发生突变的肿瘤，包括葡萄膜黑色素瘤。
本研究通过CRISPR-Cas9构建SF3B1突变等位基因敲除的葡萄膜黑色素瘤细胞Mel202SF3B1mut-KO#1Screening of drugs that selectively inhibit uveal melanoma cells with SF3B1mutationsLUO Xin 1,REN Chonglu 2,LIU Xiaolian 3,ZHANG Guiming 3,HUANG Sisi 3,YU Le 3,LI Yilei 11Department of Pharmacy,Nanfang Hospital,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China;2College of Medical Information Engineering,Guangdong Pharmaceutical University,Guangzhou 510006,China;3School of Pharmaceutical Sciences,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China摘要：目的构建SF3B1突变等位基因敲除的人葡萄膜黑色素瘤细胞模型，筛选靶向抑制SF3B1突变型葡萄膜黑色素瘤的药物。
emulate 类器官芯片
emulate 类器官芯片仿生学是一门研究生物系统并借鉴其原理进行模仿的学科。
近年来，随着科技的不断进步，人们开始尝试将仿生学的原理应用到技术领域。
其中，仿生电子学是仿生学的一个重要分支，它利用电子元件模拟和模仿生物系统的功能。
而仿生类器官芯片作为仿生电子学的重要应用，正逐渐引起人们的关注。
仿生类器官芯片是一种通过模拟人体器官的功能来实现相关生理功能的微型芯片。
它可以模拟人体的某个器官，如心脏、肝脏、肺部等，并通过电子元件来模拟和控制器官的功能。
仿生类器官芯片的研究和应用，可以为疾病治疗、药物筛选、毒性测试等领域带来许多重要的进展。
仿生类器官芯片在疾病治疗方面具有巨大的潜力。
例如，对于心脏病患者，可以利用仿生类心脏芯片来模拟和调节心脏的跳动节奏，帮助患者恢复正常的心脏功能。
而对于肝脏疾病患者，仿生类肝脏芯片可以模拟肝脏的代谢功能，帮助患者排毒和恢复肝脏功能。
这些仿生类器官芯片的应用，可以大大提高疾病治疗的效果，减少患者的痛苦和疾病的复发率。
仿生类器官芯片在药物筛选方面也具有重要的作用。
传统的药物筛选方法需要动物试验，耗时耗力且存在伦理争议。
而仿生类器官芯片可以模拟人体器官的功能，使药物筛选更加快速和准确。
研究人员可以将待测试的药物添加到仿生类器官芯片中，观察其对器官功能的影响，从而评估药物的疗效和副作用。
这种方法不仅节省了时间和资源，还能更好地预测药物在人体内的反应。
仿生类器官芯片在毒性测试方面也具有重要的应用价值。
传统的毒性测试方法往往需要动物试验，而且存在伦理问题。
而仿生类器官芯片可以模拟人体器官的功能，使毒物的作用更加清晰和可控。
研究人员可以将待测试的毒物添加到仿生类器官芯片中，观察其对器官功能的影响，并评估毒物的毒性程度。
这种方法不仅能够更准确地评估毒物的危害程度，还能够避免对动物进行不必要的实验。
除了以上应用，仿生类器官芯片还有许多其他潜在的应用领域。
例如，它可以用于研究人体器官的发育过程，帮助科学家更好地理解人体的生长和发育。
医疗行业-代谢型谷氨酸受体4亚型mGluR4高通量药物筛选模型的建 精品
代谢型谷氨酸受体4亚型(mGluR4)高通量药物筛选模型的建立张娅玲1,2, 白艳秋1,21 中国科学院北京基因组研究所, 北京1013002 中国科学院研究生院, 北京100039摘要:为发现代谢型谷氨酸受体4亚型(mGluR4)的调节剂, 通过荧光检测胞内钙浓度的方法, 建立一个基于细胞功能性检测的高通量筛选(HTS)系统。
将人mGluR4基因转染稳定表达Gα15蛋白的人胚肾细胞(HEK-293), 用Zeocin筛选获得稳定表达mGluR4的细胞株, 并通过钙流检测试验证实该细胞系的生物学功能。
优化了实验系统中荧光染料的孵育时间, 溶剂二甲基亚砜(DMSO)耐受性, 以及溶剂氢氧化钠(NaOH)耐受性, 建立了可靠稳定的筛选系统。
钙流检测试验数据表明, mGluR4细胞系对其激动剂的活性程度排序是: L-(+)-2-Amino-4-phosphonobutyric acid (L-AP4)> L-Serine-O-phosphate (L-SOP)>L-Glutamic acid (L-Glu); 拮抗剂是: (RS)-α-Methylserine-O-phosphate (MSOP)> (RS)-α-Methyl-4-phosphonophenylglycine (MPPG)。
在96和384细胞微孔培养板中, 得到该筛选系统Z’因子分别是0.80和0.65。
结果表明, 该稳定细胞系拥有一个稳定的检测系统, 适合于mGluR4激动剂/拮抗剂的筛选。
关键词:代谢型谷氨酸受体4亚型(mGluR4), 高通量筛选(HTS), Gα15, 激动剂/拮抗剂Development of a functional cell-based HTS assay for the identification mGluR4 modulatorsYaling Zhang1,2, and Yanqiu Bai1,21 Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 101300, China2 Graduate University of the Chinese Academy of Sciences, Beijing 100039, ChinaAbstract: To identify metabotropic glutamate receptor 4 (mGluR4) modulators by Ca2+ influx assay, we developed the functional cell-based high throughput-screening (HTS) assay. The human mGluR4 cDNA was transfected into HEK-293 stably expressing promiscuous G-protein (Gα15) cells. Rebinant stable mGluR4 cell line was selected under Zeocin and validated by Ca2+ influx assay. The assay was optimized on loading time of Fluo Calcium Indicator, Dimethyl sulfoxide (DMSO) tolerance and sodium hydroxide (NaOH) tolerance using agonist (L-Glutamic acid (L-Glu)) of mGluR4. The rank order of the agonist potency for the stable human mGluR4 cell line was L-(+)-2-Amino-4-phosphonobutyric acid (L-AP4)>L-Serine-O-phosphate (L-SOP)>L-Glu, and of the antagonist potency was (RS)-α-Methylserine-O-phosphate (MSOP)>(RS)-α-Methyl-4-phosphonophenylglycine (MPPG). Z’ factor value of the cell line in 96- and 384-well plate format was 0.80 and 0.65. Our data indicate a successful development of functional human mGluR4 rebinant stable cell line that was suitable for high throughput screening to identify mGluR4 agonist/antagonist.Keywords: metabotropic glutamate receptor 4 (mGluR4), high throughput screening (HTS), Gα15, agonist/antagonist谷氨酸是公认的最重要的兴奋性神经递质之一, 其在众多的中枢神经功能方面发挥着重要的作用, 例如: 记忆的获取与学习, 癫痫、中风等功能紊乱, 神经退行性疾病等[1]。
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Hesperos 创建用于药物测试人体芯片模型
据麦姆斯咨询报道，Hesperos 公司于近日宣布收到来自美国国家卫生研究
院（National Institutes of Health, NIH）国家衰老研究所（National Institute on
Aging）资助的第一阶段小型企业创新研发计划（Small Business Innovation
Research, SBIR）基金，以帮助创建一个新的多器官“人体芯片”模型，它可以
逼真地模仿阿尔兹海默病（Alzheimer’s Disease，以下简称 AD）的生物学
及在真实人体生理条件下的潜在新疗法。
Hesperos 公司的创始人 Michael L. Shuler 博士和 James J. Hickman 博士都
是器官芯片技术领域的先驱，Hesperos 是第一家创建无泵驱动，全集成生理
功能，多器官微流控系统的公司，其创建的器官芯片系统包括血液循环和神
经连接。
Hesperos 设计的片上血脑屏障芯片
AD 模型将设计为一个三器官系统，包括脑细胞（皮质神经元）、功能肝
脏和血脑屏障结构体，以及再循环血液和脑脊髓液替代物。该模型将帮助科
学家研究身体对任意引进模型的化学物质的系统反应，包括它如何在肝脏中
代谢，以及如何通过血脑屏障渗透到大脑。