标准的PCR反应体系

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PCR反应体系

PCR反应体系

反 应 体 系
PCR
镁离子
引物及探针 模板
06
PCR buffer
PCR反应缓冲液的目的是给Taq DNA聚合酶提供一 个最适酶催反应条件。
成分 Tris-HCl KCl NH4+ 小牛血清白蛋白 明胶 Tween 20 二硫苏糖醇(DTT) 浓度 10-50mmol/L ≤50mmol/L 16.6mmol/L 100μg/ml 0.01% 0.05% ~0.1% 5mmol/l 有助于酶的稳定,提高试 剂的稳定性。 作用 平衡ph值 利于引物的退火(产率比 较高) 特异性比较好
的提高了扩增的准确性内参基因是为了平衡不同模板之
间的差异。加入浓度50μ L体系加入0.1μ L 25μ M ROX, 终浓度为versetranscripatase)是以RNA为模板指
导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。 ROX(ROX Reference Dye)一般用于ABI、 Stratagene等公司的Real Time PCR扩增仪上。用于消 除信号本底以及效正孔之间产生的荧光信号,最大限度
Taq酶
Taq酶是从水生栖热菌 Thermus Aquaticus ( Taq )中分 离出的具有热稳定性的DNA聚合酶。
5'到 3'合成 DNA能力 普通Taq酶 有 5'到 3'外 切酶活性 有 3'到 5'外 切酶活性 无 3'端加A
延伸速度

2000base/min
热启动Taq酶




2000base/min
P C R 反 应 体 系
PCR 原理
PCR(Polymerase Chain Reaction)是指在DNA聚合酶催化下, 以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等 步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。

PCR的反应体系主要包括哪些

PCR的反应体系主要包括哪些

PCR的反应体系主要包括哪些PCR(聚合酶链式反应)是一种在分子生物学和遗传学研究中广泛应用的技术。

它是通过扩增DNA片段的方法,使得微量的DNA能够在体外得到大量复制。

PCR的反应体系主要包括以下几个关键组分:引物、DNA模板、聚合酶、缓冲溶液和dNTP。

引物PCR反应需要两种引物,称为前向引物和反向引物。

它们是用来定位要扩增的DNA 区域的短链RNA或DNA片段。

引物的设计是PCR反应中非常关键的一步,需要根据DNA序列的特点来选择适当的引物。

合理的引物设计可以提高扩增效率和特异性。

DNA模板PCR反应的DNA模板通常是从细胞或组织中提取出来的DNA。

模板可以是基因组DNA、cDNA或已知序列的DNA片段。

PCR通过基本的核酸配对准则,利用引物将所需的DNA片段扩增出来。

聚合酶PCR反应中所使用的聚合酶是一种特殊的酶,称为DNA聚合酶。

常用的DNA聚合酶有Taq聚合酶和Pfu聚合酶等。

聚合酶能够识别DNA模板上的引物结合位点,并在这个基础上合成新的DNA链。

它具有高度稳定的酶活性和较高的耐热性,使得PCR反应可以在高温条件下进行。

缓冲溶液缓冲溶液是PCR反应中的重要组分之一,它提供了适当的pH值和离子平衡条件,使反应能够在适宜的环境中进行。

缓冲溶液通常含有Tris-HCl、KCl等成分,以维持反应的稳定性和效率。

dNTPPCR反应需要四种脱氧核苷酸三磷酸盐(dNTPs)作为合成新DNA链的原料。

这四种成分分别是脱氧腺嘌呤核苷酸(dATP)、脱氧鸟嘌呤核苷酸(dGTP)、脱氧胸腺嘧啶核苷酸(dTTP)和脱氧胞嘧啶核苷酸(dCTP)。

它们提供了构建新DNA链所需要的碱基。

反应条件PCR反应还需要适当的温度条件下进行。

常见的PCR反应温度是95°C的高温变性步骤、50-60°C的引物结合步骤和72°C的DNA链合成步骤。

这些温度可以使PCR反应能够在合理的时间内完成扩增。

pcr原理,反应体系和基本过程

pcr原理,反应体系和基本过程

PCR(聚合酶链式反应)是一种广泛应用于分子生物学和遗传学研究的技术,用于扩增DNA 序列。

PCR基于DNA的复制原理,在体外模拟DNA的自然复制过程,通过酶和适当的反应体系,使特定DNA序列在反应中进行指数级扩增。

以下是PCR的基本原理、反应体系和过程:原理:PCR反应基于DNA的双链结构。

通过加热将DNA双链分离为两条单链,然后通过引物(primer)与目标DNA序列的特定区域结合,然后在适当的温度下,DNA聚合酶(DNA polymerase)催化合成新的DNA链,形成两条新的双链DNA。

这个过程包括三个基本步骤:变性(Denaturation)、退火(Annealing)和延伸(Extension)。

反应体系:PCR反应通常包含以下组分:模板DNA:要扩增的DNA样本。

引物(primer):短的DNA序列,与目标DNA序列的两端相互补,作为起始合成新DNA链的起点。

DNA聚合酶:如Taq聚合酶,用于合成新的DNA链。

dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐):包括A、T、C和G四种碱基的单元,供DNA聚合酶使用。

缓冲液:维持反应体系的pH和离子浓度,提供适宜的环境供DNA聚合酶催化反应。

基本过程:PCR反应通常涉及以下的循环步骤,每个循环依次进行变性、退火和延伸:变性(Denaturation):将PCR反应管中的混合物加热至94-98摄氏度,使DNA双链解离为两条单链。

退火(Annealing):将反应温度降低至45-68摄氏度,使引物与目标DNA序列的特定区域结合。

延伸(Extension):将温度提高至72摄氏度,DNA聚合酶催化新的DNA链的合成。

DNA 聚合酶使用dNTPs作为碱基单元,延伸引物,合成新的DNA链。

这个循环步骤会重复多次(通常为20-40次),每次循环都会使目标DNA序列扩增约一倍,最终产生大量目标序列的DNA。

通过PCR,可以在短时间内从少量的起始DNA模板扩增出大量的目标DNA序列,为分子生物学、基因组学研究以及遗传疾病诊断等提供了强大的工具。

简述PCR反应所需要的体系及简要过程

简述PCR反应所需要的体系及简要过程

简述PCR反应所需要的体系及简要过程引言PCR(聚合酶链式反应)是一种重要的分子生物学技术,可以在体外快速扩增DNA 序列。

它的广泛应用使得PCR成为现代生物科学研究的重要工具。

本文将简要介绍PCR 反应所需的体系以及整个过程。

PCR反应体系PCR反应体系由以下几个关键组分组成:模板DNA模板DNA是PCR反应中的起始物质,它含有我们想要扩增的DNA序列。

模板DNA可以来自多种来源,如基因组DNA、cDNA、病毒DNA等。

引物引物是PCR反应中的两个短寡核苷酸序列,它们与目标DNA序列的两端互补。

引物的设计非常重要,需要确保引物能够特异性地结合目标DNA序列,并且不能与其他非目标DNA序列结合。

反应缓冲液反应缓冲液提供了适宜的环境条件,使PCR反应能够顺利进行。

缓冲液中通常包含一定浓度的镁离子(Mg2+),以促进DNA聚合酶的活性。

dNTPsdNTPs是反应中所需的四种脱氧核苷酸,即dATP、dCTP、dGTP和dTTP。

它们作为DNA合成的原料,与模板DNA中的单链碱基互补结合,参与新DNA链的合成。

DNA聚合酶DNA聚合酶是PCR反应的关键酶类,它负责在反应过程中合成新的DNA链。

常用的PCR反应酶包括Taq DNA聚合酶和Pfu DNA聚合酶等。

PCR反应过程PCR反应经历三个主要的循环步骤:变性、扩增和延伸。

变性反应开始时,PCR反应体系中的DNA双链结构被加热至高温,使其变性成两条单链DNA。

这一步又称为变性步骤,其目的是使DNA解开双链结构,使得引物能够结合到目标序列的起始位点。

扩增在变性步骤之后,PCR反应体系中的温度被降低,使引物能够与目标DNA序列的两端互补结合。

DNA聚合酶沿着引物向3’方向合成新的DNA链,每一个引物结合位点都会产生两条新的DNA链。

这一步又称为扩增步骤,其结果是将目标DNA序列扩增为双数目标序列。

延伸在扩增步骤之后,PCR反应体系中的温度再次升高,以使未完成的DNA链得以延伸。

标准的pcr反应体系

标准的pcr反应体系

标准的pcr反应体系PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种分子生物学技术,它可以在体外大量复制DNA片段。

PCR反应是在一定的条件下,通过DNA引物和DNA聚合酶,使目标DNA片段在体外迅速扩增,是分子生物学研究中常用的技术手段之一。

标准的PCR反应体系包括以下几个方面:1. DNA模板,PCR反应的第一步是添加待扩增的DNA模板。

这可以是从细胞中提取的基因组DNA,也可以是经过纯化的质粒DNA或PCR产物。

DNA模板的质量和纯度对PCR反应的效果有很大影响,因此在使用之前需要进行质检和定量。

2. 引物,PCR反应需要两个引物,它们分别位于待扩增DNA片段的两端。

引物的设计需要考虑到目标DNA的序列,确保引物能够特异性地结合到目标DNA 上。

此外,引物的长度和碱基组成也需要符合一定的要求,以保证PCR反应的效率和特异性。

3. DNA聚合酶,PCR反应中使用的DNA聚合酶通常是热稳定的,能够在高温下保持活性。

常用的DNA聚合酶有Taq聚合酶和Pfu聚合酶等。

在PCR反应中,DNA聚合酶起着复制DNA的作用,能够在高温下将引物结合到DNA模板上,并在适当的条件下合成新的DNA链。

4. 缓冲液,PCR反应需要在特定的pH和离子浓度条件下进行,因此需要添加合适的缓冲液来维持反应体系的稳定性。

常用的PCR缓冲液包括Tris-HCl缓冲液和KCl缓冲液等。

5. 脱氧核苷酸(dNTPs),PCR反应需要四种脱氧核苷酸作为DNA合成的原料,它们分别是脱氧腺苷酸(dATP)、脱氧鸟苷酸(dGTP)、脱氧胸苷酸(dCTP)和脱氧胸嘧啶酸(dTTP)。

在PCR反应中,这些脱氧核苷酸会被DNA聚合酶利用,与引物结合到DNA模板上,合成新的DNA链。

6. 离子,PCR反应中需要适当的离子浓度来维持DNA聚合酶的活性,通常通过添加Mg2+离子来实现。

Mg2+离子的浓度对PCR反应的效果有很大影响,需要根据具体的引物和DNA模板来进行优化。

标准的PCR反应体系

标准的PCR反应体系

标准的PCR反应体系PCR反应体系与反应条件标准的PCR反应体系:10X扩增缓冲液10ul4种dNTP混合物各200umolL引物各10〜100mol模板DNA01 〜2ugTqDNA聚合酶25ug2+15mmolL加双或三蒸水至100ulPCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTR模板和g2+引物:引物是PCR寺异性反应的关键,PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。

理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。

设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30b ,常用为20b 左右。

②引物扩增跨度:以200-500b为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。

③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。

ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。

⑤引物3' 端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCF失败。

⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。

⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。

引物量:每条引物的浓度01〜lumol或10〜100mol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。

酶及其浓度目前有两种TqDNA聚合酶供应,一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。

催化一典型的PCR反应约需酶量2。

5U(指总反应体积为100ul 时),浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。

pcr反应体系的基本构成

pcr反应体系的基本构成

pcr反应体系的基本构成PCR(聚合酶链反应)是一种重要的分子生物学技术,它能够在体外迅速扩增特定DNA片段。

PCR反应体系的基本构成包括引物、DNA模板、dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)、聚合酶、缓冲液和水。

引物是PCR反应中的关键组成部分,它是DNA的两条链的起始序列,能够指示扩增特定DNA片段的位置。

引物一般由合成寡核苷酸组成,长度通常为18-30个碱基。

在PCR反应中,引物与DNA模板的两个互补序列结合,作为DNA聚合酶的起始点。

DNA模板是PCR反应中的待扩增的DNA片段,可以是从细胞中提取的基因组DNA,也可以是经过特定方法提取和纯化的DNA片段。

DNA 模板的质量和纯度对PCR反应的结果有重要影响,因此在PCR反应前需要对DNA模板进行质检和纯化处理。

dNTPs是PCR反应中的四种脱氧核苷酸三磷酸盐,分别是dATP、dCTP、dGTP和dTTP。

它们是DNA合成的基本单元,在PCR反应中起到提供碱基的作用。

dNTPs的浓度需要适当控制,过高或过低都会影响PCR反应的效果。

聚合酶是PCR反应中的关键酶,它能够在适宜的温度下,在DNA模板和引物的指导下,合成新的DNA链。

常用的聚合酶有Taq聚合酶和Pfu聚合酶,它们具有高度的热稳定性和DNA聚合酶活性,适用于PCR反应的高温环境。

缓冲液是PCR反应中必不可少的成分,它可以维持PCR反应体系的pH值和离子浓度稳定,提供适宜的反应环境。

常用的PCR缓冲液包括Tris-HCl缓冲液和KCl缓冲液。

水是PCR反应体系中的溶剂,它起到稀释其他反应成分和提供体积的作用。

水的质量和纯度对PCR反应的结果有一定影响,因此需要使用去离子水或高纯水。

除了上述基本构成外,PCR反应中还可以添加其他辅助成分,如Mg2+离子、PCR增效剂和引物嵌合物等。

Mg2+离子是聚合酶活性的必需离子,能够稳定DNA双链结构和提供DNA结合的稳定性。

PCR 增效剂可以提高PCR反应的效率和特异性,减少非特异性扩增产物的生成。

(最新整理)PCR反应体系

(最新整理)PCR反应体系
➢ 探针的特异性及退火温度对反应体系影响很大。
模板
➢ 单、双链DNA均可。 ➢ 不能混有蛋白酶、核酸酶、DNA聚合酶抑制剂、
DNA结合蛋白类。 ➢ DNA模板使用量一般为20-200ng。 ➢ 模板浓度过高会导致反应的非特异性增加。 ➢ RNA模板注意保证其防止RNA降解。
其他成分
➢ RNasin(RNase Inhibitor)的作用:RNA酶 抑制剂,抑制RNA酶的活性。
➢ UNG酶的作用原理是选择性水解断裂含有dU 的双链或单链DNA中的尿嘧啶糖苷键,形成 的有缺失碱基的DNA链,在碱性介质以及高 温下会进一步水解断裂,从而被消除。UNG 酶的最佳活性温度为50℃,95℃灭活。
其他成分
➢ 反转录酶(Reversetranscripatase)是以RNA为模板指 导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。
PCR反应体系
PCR 原理
PCR(Polymerase Chain Reaction)是指在DNA聚合酶催化下, 以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等 步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。
01 PCR buffer
PCR
02 Taq酶
反 应
03 dNTPs
非特异性 产物减少 扩增
导致错配 产物减少
Mg2+可与负离子结合,所以反应体系中dNTP、EDTA等的 浓度影响反应中游离的Mg2+浓度。
引物及探针
➢ 引物是人工合成的一段寡核苷酸序列。一般为20 个碱基。
➢ 引物的序列与模板结合的特异性是决定PCR反应 结果的关键。
➢ 探针是人工合成的在两端分别标记荧光基团的一 段寡核苷酸序列。
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标准的PCR反应体系PCR的反应体积一般有:10、20、25、40、50、100μl(一般不要低于10μl,体积过少会影响扩增效率及产物得率)PCR反应体系与反应条件--------------------------------------------------------------------------------标准的PCR反应体系:10×扩增缓冲液10ul4种dNTP混合物各200umolL引物各10~100mol模板DNA 01~2ugTqDNA聚合酶25ug2+ 15mmolL加双或三蒸水至100ulPCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和g2+引物:引物是PCR特异性反应的关键,PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。

理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。

设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30b,常用为20b左右。

②引物扩增跨度:以200-500b为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。

③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。

ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。

⑤引物3'端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。

⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。

⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。

引物量:每条引物的浓度01~1umol或10~100mol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。

酶及其浓度目前有两种TqDNA聚合酶供应,一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。

催化一典型的PCR反应约需酶量2。

5U(指总反应体积为100ul时),浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。

dNTP的质量与浓度dNTP的质量与浓度和PCR扩增效率有密切关系,dNTP粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性。

dNTP溶液呈酸性,使用时应配成高浓度后,以1NH或1Tris。

HCL的缓冲液将其PH调节到70~75,小量分装,-20℃冰冻保存。

多次冻融会使dNTP降解。

在PCR反应中,dNTP应为50~200umolL,尤其是注意4种dNTP的浓度要相等(等摩尔配制),如其中任何一种浓度不同于其它几种时(偏高或偏低),就会引起错配。

浓度过低又会降低PCR产物的产量。

dNTP能与g2+结合,使游离的g2+浓度降低。

模板(靶基因)核酸模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一,传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K来消化处理标本。

SDS的主要功能是:溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS还能与蛋白质结合而沉淀;蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,再用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用乙醇或异丙醇沉淀核酸。

提取的核酸即可作为模板用于PCR反应。

一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接用于PCR扩增。

RNA模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNse降解RNA。

g2+浓度g2+对PCR扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的PCR反应中,各种dNTP浓度为200umolL时,g2+浓度为15~20mmolL为宜。

g2+浓度过高,反应特异性降低,出现非特异扩增,浓度过低会降低TqDNA聚合酶的活性,使反应产物减少。

PCR反应条件的选择PCR反应条件为温度、时间和循环次数。

温度与时间的设置:基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。

在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在TqDNA聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。

对于较短靶基因(长度为100~300b时)可采用二温度点法,除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸(此温度TqDNA酶仍有较高的催化活性)。

①变性温度与时间:变性温度低,解链不完全是导致PCR失败的最主要原因。

一般情况下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA变性,若低于93℃则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响。

此步若不能使靶基因模板或PCR产物完全变性,就会导致PCR失败。

②退火(复性)温度与时间:退火温度是影响PCR特异性的较重要因素。

变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物和模板发生结合。

由于模板DNA比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。

退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度。

对于20个核苷酸,G+C含量约50%的引物,55℃为选择最适退火温度的起点较为理想。

引物的复性温度可通过以下公式帮助选择合适的温度:Tm值(解链温度)=4(G+C)+2(A+T)复性温度=Tm值-(5~10℃)在Tm值允许围内,选择较高的复性温度可大大减少引物和模板间的非特异性结合,提高PCR反应的特异性。

复性时间一般为30~60se,足以使引物与模板之间完全结合。

③延伸温度与时间:TqDNA聚合酶的生物学活性:70~80℃150核苷酸S酶分子70℃60核苷酸S酶分子55℃24核苷酸S酶分子高于90℃时,DNA合成几乎不能进行。

PCR反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用温度为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。

PCR延伸反应的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一般1Kb 以内的DNA片段,延伸时间1min是足够的。

3~4kb的靶序列需3~4min;扩增10Kb需延伸至15min。

延伸进间过长会导致非特异性扩增带的出现。

对低浓度模板的扩增,延伸时间要稍长些。

循环次数循环次数决定PCR扩增程度。

PCR循环次数主要取决于模板DNA的浓度。

一般的循环次数选在30~40次之间,循环次数越多,非特异性产物的量亦随之增多。

PCR技术概论聚合酶链反应(PolymerseCinReion,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。

它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的DNA供分析研究和检测鉴定。

过去几天几星期才能做到的事情,用PCR几小时便可完成。

PCR技术是生物医学领域中的一项革命性创举和里程碑。

PCR技术简史PCR的最早设想核酸研究已有100多年的历史,本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术,Korn于1971年最早提出核酸体外扩增的设想:“经过DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆RNA基因”。

PCR的实现1985年美国PE-Ceus公司人类遗传研究室的ullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应。

其原理类似于DNA的体内复制,只是在试管中给DNA的体外合成提供以致一种合适的条件---摸板DNA,寡核苷酸引物,DNA聚合酶,合适的缓冲体系,DNA变性、复性及延伸的温度与时间。

PCR的改进与完善ullis最初使用的DNA聚合酶是大肠杆菌DNA聚合酶的Kleno片段,其缺点是:①Kleno酶不耐高温,90℃会变性失活,每次循环都要重新加。

②引物链延伸反应在37℃下进行,容易发生模板和引物之间的碱基错配,其PCR产物特异性较差,合成的DNA片段不均一。

此种以Kleno酶催化的PCR技术虽较传统的基因扩增具备许多突出的优点,但由于Kleno酶不耐热,在DNA模板进行热变性时,会导致此酶钝化,每加入一次酶只能完成一个扩增反应周期,给PCR技术操作程序添了不少困难。

这使得PCR技术在一段时间内没能引起生物医学界的足够重视。

1988年初,Keonog改用T4DNA聚合酶进行PCR,其扩增的DNA片段很均一,真实性也较高,只有所期望的一种DNA片段。

但每循环一次,仍需加入新酶。

1988年Siki等从温泉中分离的一株水生嗜热杆菌(ermusquius)中提取到一种耐热DNA 聚合酶。

此酶具有以下特点:①耐高温,在70℃下反应2后其残留活性大于原来的90%,在93℃下反应2后其残留活性是原来的60%,在95℃下反应2后其残留活性是原来的40%。

②在热变性时不会被钝化,不必在每次扩增反应后再加新酶。

③大大提高了扩增片段特异性和扩增效率,增加了扩增长度(20Kb)。

由于提高了扩增的特异性和效率,因而其灵敏性也大大提高。

为与大肠杆菌多聚酶Kleno片段区别,将此酶命名为TqDNA多聚酶(TqDNAPolymerse)。

此酶的发现使PCR广泛的被应用。

PCR技术基本原理PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。

PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。

每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。

到达平台期(Pleu)所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。

PCR的反应动力学PCR的三个反应步骤反复进行,使DNA扩增量呈指数上升。

反应最终的DNA扩增量可用Y=(1+X)n计算。

Y代表DNA片段扩增后的拷贝数,X表示平(Y)均每次的扩增效率,n代表循环次数。

平均扩增效率的理论值为100%,但在实际反应中平均效率达不到理论值。

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